| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,720,688 | T→C | D46G (GAC→GGC) | slyA ← | DNA‑binding transcriptional dual regulator SlyA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,720,688 | 0 | T | C | 99.4% | 678.4 / NA | 174 | D46G (GAC→GGC) | slyA | DNA‑binding transcriptional dual regulator SlyA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (78/95); minor base A (0/1); total (78/96) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 174 total aligned reads displayed.
TTTAATACGTTTAGCCCGACGATCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATGGGTTTGTGTTAACTCCAGCGGTTTCAGGCGATGGTCTATCAGAGCACGCCATATGCGCACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAA > NC_000913/1720552‑1720824 | tttAATACGTTTAGCCCGACGATCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGCCTg < 2:296594/140‑1 (MQ=255) tACGTTTAGCCCGACGATCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGTTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGCCTGGAGGt < 1:1605562/140‑1 (MQ=255) tACGTTTAGCCCGACGATCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGCCTGGAGGt < 1:342718/140‑1 (MQ=255) tACGTTTAGCCCGACGATCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGCCTGGAGGt < 2:148669/140‑1 (MQ=255) tACGTTTAGCCCGACGATCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGCCTGGAGGt < 1:1491403/140‑1 (MQ=255) cGTTTAGCCCGACGATCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGATTGGCCTGGAGGTaa < 2:2465789/140‑1 (MQ=255) cGTTTAGCCCGACGATCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGCCTGGAGGTaa < 1:1666150/140‑1 (MQ=255) cGTTTAGCCCGACGATCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGCCTGGAGGTaa < 2:1509148/140‑1 (MQ=255) cGTTTAGCCCGACGATCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGCCTGGAGGTaa < 1:18258/140‑1 (MQ=255) cGTTTAGCCCGACGATCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGCCTGGAGGTaa < 1:165196/140‑1 (MQ=255) cGTTTAGCCCGACGATCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGCCTGGAGGTaa < 2:2663251/140‑1 (MQ=255) cGTTTAGCCCGACGATCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGCCTGGAGGTaa < 2:2766137/140‑1 (MQ=255) tttAGCCCGACGATCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGCCTGGAGGTAACt < 1:1577384/140‑1 (MQ=255) ttAGCCCGACGATCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGCCTGGAGGTAACTg > 1:43030/1‑140 (MQ=255) ttAGCCCGACGATCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGCCTGGAGGTAACTg > 2:210645/1‑140 (MQ=255) ttAGCCCGACGATCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGCCTGGAGGTAACTg > 2:1706536/1‑140 (MQ=255) ttAGCCCGACGATCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGCCTGGAGGTAACTg > 1:1953848/1‑140 (MQ=255) aGCTCGACGATCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAAGTTGCGACTGGACTGGAGGTAACTGAt < 2:2815149/140‑1 (MQ=255) aGCCCGACGATCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGCCTGGAGGTAACTGAt < 2:563102/140‑1 (MQ=255) aGCCCGACGATCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGCCTGGAGGTAACTGAt < 1:1129463/140‑1 (MQ=255) cccGACGATCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGCCTGGAGGTAACTGATgg < 1:210645/140‑1 (MQ=255) cccGACGATCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGCCTGGAGGTAACTGATgg > 2:2063322/1‑140 (MQ=255) ccGACGATCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGCCTGGAGGTAACTGATGGa < 1:25952/140‑1 (MQ=255) gacgaTCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGCCTGGAGGTAACTGATGGata < 2:1857226/140‑1 (MQ=255) gacgaTCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGCCTGGAGGTAACTGATGGata < 1:1429016/140‑1 (MQ=255) acgaTCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGCCTGGAGGTAACTGATGGatat > 2:1732819/1‑140 (MQ=255) acgaTCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGCCTGGAGGTAACTGATGGatat > 1:1650410/1‑140 (MQ=255) acgaTCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGCCTGGAGGTAACTGATGGata < 1:1055820/139‑1 (MQ=255) acgaTCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGCCTGGAGGTAACTGATGGata > 2:1055820/1‑139 (MQ=255) cgaTCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGCCTGGAGGTAACTGATGGATAtt > 1:643883/1‑140 (MQ=255) tCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGCCTGGAGGTAACTGATGGATATtgtg < 1:1972891/140‑1 (MQ=255) tCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGCCTGGAGGTAACTGATGGATATtgtg < 2:780909/140‑1 (MQ=255) gCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGCCTGGAGGTAACTGATGGata < 2:1181438/133‑1 (MQ=255) gCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGCCTGGGGGTAACTGATGGATATTGTgtaacgt < 1:2786850/140‑1 (MQ=255) aGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGCCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAAccc > 2:1428994/1‑140 (MQ=255) gTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGCCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCa > 2:1128311/1‑140 (MQ=255) tttGACGCGAAATTAACACTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGCCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCaa < 1:337313/140‑1 (MQ=255) gcgAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGCCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATGGGtt < 2:820531/140‑1 (MQ=255) aaaTTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGCCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATGGGTTtgt > 1:821074/1‑140 (MQ=255) aaaTTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGCCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATGGGTTtgt > 1:2800902/1‑140 (MQ=255) tttttCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGCCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATGGGTTTGTGTTAACTCCa < 2:473222/140‑1 (MQ=255) tttttCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGCCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATGGGTTTGTGTTAACTCCa < 2:1390728/140‑1 (MQ=255) ttttCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGCCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATGGGTTTGTGTTAACTCCAg > 2:2555340/1‑140 (MQ=255) ttcttcCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGCCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATGGGTTTGTGTTAACTCCAGCg > 2:2641599/1‑140 (MQ=255) tcCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGCCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATGGGTTTGTGTTAACTCCAGCGGttt < 2:572342/140‑1 (MQ=255) aGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGCCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATGGGTTTGTGTTAACTCCAGCGGTTTCAg > 1:1178826/1‑140 (MQ=255) gTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGCCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATGGGTTTGTGTTAACTCCAGCGGTTTCAgg > 1:554758/1‑140 (MQ=255) ggTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGCCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATGGGTTTGTGTTAACTCCAGCGGTTTCAGGCg > 1:969193/1‑139 (MQ=255) ggTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGCCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATGGGTTTGTGTTAACTCCAGCGGTTTCAGGCGa < 1:1428994/140‑1 (MQ=255) ggTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGCCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATGGGTTTGTGTTAACTCCAGCGGTTTCAGGCGa < 1:1848900/140‑1 (MQ=255) ggTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGCCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATGGGTTTGTGTTAACTCCAGCGGTTTCAGGCGa < 2:2712260/140‑1 (MQ=255) gTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGCCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATGGGTTTGTGTTAACTCCAGCGGTTTCAGGCGAt > 2:1240791/1‑140 (MQ=255) tCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGCCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATGGGTTTGTGTTAACTCCAGCGGTTTCAGGCGa > 2:467649/1‑138 (MQ=255) tCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGCCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATGGGTTTGTGTTAACTCCAGCGGTTTCAGGCGATg < 2:2800902/140‑1 (MQ=255) tCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGCCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATGGGTTTGTGTTAACTCCAGCGGTTTCAGGCGATg < 1:1316502/140‑1 (MQ=255) tCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGCCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATGGGTTTGTGTTAACTCCAGCGGTTTCAGGCGATg < 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2:1280387/1‑136 (MQ=255) ggACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGCCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATGGGTTTGTGTTAACTCCAGCGGTTTCAGGCGATGGTCTATCaga > 1:942735/1‑140 (MQ=255) ggACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGCCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATGGGTTTGTGTTAACTCCAGCGGTTTCAGGCGATGGTCTATCaga > 1:2858483/1‑140 (MQ=255) ggACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGCCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATGGGTTTGTGTTAACTCCAGCGGTTTCAGGCGATGGTCTATCaga > 2:241579/1‑140 (MQ=255) aGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGCCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATGGGTTTGTGTTAACTCCAGCGGTTTCAGGCGATGGTc > 2:899825/1‑128 (MQ=255) aGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGCCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATGGGTTTGTGTTAACTCCAGCGGTTTCAGGCGATGGTc < 1:899825/128‑1 (MQ=255) aGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGCCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATGGGTTTGTGTTAACTCCAGCGGTTTCAGGCGATGGTCTATCAGAGCACg > 2:1502286/1‑140 (MQ=255) aGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGCCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATGGGTTTGTGTTAACTCCAGCGGTTTCAGGCGATGGTCTATCAGAGCACg > 1:2394701/1‑140 (MQ=255) gTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGCCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATGGGTTTGTGTTAACTCCAGCGGTTTCAGGCGATGGTCTATCAGAGCACGc > 1:46618/1‑140 (MQ=255) gTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGCCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATGGGTTTGTGTTAACTCCAGCGGTTTCAGGCGATGGTCTATCAGAGCACGc > 1:2885272/1‑140 (MQ=255) tGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGCCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATGGGTTTGTGTTAACTCCAGCGGTTTCAGGCGATGGTCTATCAGAGCACGcc > 1:2067023/1‑140 (MQ=255) tGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGCCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATGGGTTTGTGTTAACTCCAGCGGTTTCAGGCGATGGTCTATCAGAGCACGcc > 2:2873761/1‑140 (MQ=255) tGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGCCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATGGGTTTGTGTTAACTCCAGCGGTTTCAGGCGATGGTCTATCAGAGCACGcc < 1:226241/140‑1 (MQ=255) tGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGCCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATGGGTTTGTGTTAACTCCAGCGGTTTCAGGCGATGGTCTATCAGAGCACGcc > 2:2365616/1‑140 (MQ=255) aTGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGCCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATGGGTTTGTGTTAACTCCAGCGGTTTCAGGCGATGGTCTATCAGAGCACGCCat > 2:1817546/1‑140 (MQ=255) aTGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGCCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATGGGTTTGTGTTAACTCCAGCGGTTTCAGGCGATGGTCTATCAGAGCACGCCat > 2:731559/1‑140 (MQ=255) gctgctCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGCCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATGGGTTTGTGTTAACTCCAGTGGTTTCAGGCGATGGTCTATCAGAGCACGCCATATg < 2:1300497/140‑1 (MQ=255) gctgctCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGCCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATGGGTTTGTGTTAACTCCAGCGGTTTCAGGCGATGGTCTATCAGAGCACGCCATATg > 1:2545931/1‑140 (MQ=255) gctgctCGATGCCAATCGCTTTCGCCAGTTGAATTTGCGACTGGCCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATGGGTTTGTGTTAACTCCAGCGGTTTCAGGCGATGGTCTATCAGAGCACGCCATATg > 1:2667995/1‑140 (MQ=255) tgctCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGCCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATGGGTTTGTGTTAACTCCAGCGGTTTCAGGCGATGGTCTATCAGAGCACGCCATATgcg > 2:1451323/1‑140 (MQ=255) aTGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGCCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATGGGTTTGTGTTAACTCCAGCGGTTTCAGGCGATGGTCTATCAGAGCACGCCATATGCGCACCaa > 2:1940971/1‑140 (MQ=255) tGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGCCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATGGGTTTGTGTTAACTCCAGCGGTTTCAGGCGATGGTCTATCAGAGCACGCCATATGCGCACCAAc < 1:1735459/140‑1 (MQ=255) tGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGCCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATGGGTTTGTGTTAACTCCAGCGGTTTCAGGCGATGGTCTATCAGAGCACGCCATATGCGCACCAAc > 2:135970/1‑140 (MQ=255) aTCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGCCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATGGGTTTGTGTTAACTCCAGCGGTTTCAGGCGATGGTCTATCAGAGCACGCCATATGCGCACCAACCGTGc < 1:731559/140‑1 (MQ=255) aTCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGCCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATGGGTTTGTGTTAACTCCAGCGGTTTCAGGCGATGGTCTATCAGAGCACGCCATATGCGCACCAACCGTGc > 2:1612766/1‑140 (MQ=255) aTCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGCCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATGGGTTTGTGTTAACTCCAGCGGTTTCAGGCGATGGTCTATCAGAGCACGCCATATGCGCACCAACCGTGc < 2:554758/140‑1 (MQ=255) cGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGCCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATGGGTTTGTGTTAACTCCAGCGGTTTCAGGCGATGGTCTATCAGAGCACGCCATATGCGCACCAACCGTGCCa < 2:833078/140‑1 (MQ=255) ttttGCCAGTTGAATTTGCGACTGGCCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATGGGTTTGTGTTAACTCCAGCGGTTTCAGGCGATGGTCTATCAGAGCACGCCATATGCGCACCAACCGTGCCAGAt > 1:470959/1‑140 (MQ=255) ttGCCAGTTGAATTTGCGACTGGCCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATGGGTTTGTGTTAACTCCAGCGGTTTCAGGCGATGGTCTATCAGAGCACGCCATATGCGCACCAACCGTGCCAGATCa > 1:953245/1‑140 (MQ=255) cAGTTGAATTTGCGACTGGCCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATGGGTTTGTGTTAACTCCAGCGGTTTCAGGCGATGGTCTATCAGAGCACGCCATATGCGCACCAACCGTGCCAGATCAGAAc < 1:101921/140‑1 (MQ=255) tGAATTTGCGACTGGCCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATGGGTTTGTGTTAACTCCAGCGGTTTCAGGCGATGGTCTATCAGAGCACGCCATATGCGCACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAg > 2:1373736/1‑140 (MQ=255) aTTTGCGACTGGCCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATGGGTTTGTGTTAACTCCAGCGGTTTCAGGCGATGGTCTATCAGAGCACGCCATATGCGCACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTgg < 2:643883/140‑1 (MQ=255) tttGCGACTGGCCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATGGGTTTGTGTTAACTCCAGCGGTTTCAGGCGATGGTCTATCAGAGCACGCTATATGCGCACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGc < 1:2363056/140‑1 (MQ=255) tttGCGACTGGCCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATGGGTTTGTGTTAACTCCAGCGGTTTCAGGCGATGGTCTATCAGAGCACGCCATATGCGCACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGc > 2:253835/1‑140 (MQ=255) ttGCGACTGGCCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCCAATGGGTTTGTGTTAACTCCAGCGGTTTCAGGCGATGGTCTATCAGAGCACGCCATATGCGCACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCg < 1:2735883/140‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |