| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 656,302 | C→A | intergenic (‑334/‑255) | dcuC ← / → pagP | anaerobic C4‑dicarboxylate transporter DcuC/Lipid IVA palmitoyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 656,302 | 0 | C | A | 99.6% | 794.0 / ‑3.8 | 223 | intergenic (‑334/‑255) | dcuC/pagP | anaerobic C4‑dicarboxylate transporter DcuC/Lipid IVA palmitoyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base A (171/51); total (172/51) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 226 total aligned reads displayed.
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(MQ=255) ttgttgTATCTAGTTAAAAAATAAAATAATTTTTCCTTGATTGCATTTTGTCATCAAAAAAGACTTGGTTTTTCTTTTTTGACTATTCCCATCGCAGAAAACGACGCATCATCTTTAATCGATGCGCGGAAATATTTAAc < 2:2755421/140‑1 (MQ=255) tgttgtATCTAGTTAAAAAATAAAATAATTTTTCCTTGATTGCATTTTGTCATCAAAAAAGACTTGGTTTTTCTTTTTTGACTATTCCCATCGCAGAAAACGACGCATCATCTTTAATCGATGCGCGGAAATATTTAAc < 1:709716/139‑1 (MQ=255) tATCTAGTTAAAAAATAAAATAATTTTTCCTTGATTGCATTTTGTCATCAAAAAAGACTTGGTTTTTCTTTTTTGACTATTCCCATCGCAGAAAACGACGCATCATCTTTAATCGATGCGCGGAAATATTTAACTTGAAc > 2:2643816/1‑140 (MQ=255) | TGCAAATTGATGGTGGATTGATGCAAATTTGTTAATTGCAATGGTGTTAGCTGCGGCTGTGCGCTCAAAAAATAATCTAATATGAGCATAGGTTGACGATATATATTATATACTTCGTTAAGATGATTGTTGTATCTCGTTAAAAAATAAAATAATTTTTCCTTGATTGCATTTTGTCATCAAAAAAGACTTGGTTTTTCTTTTTTGACTATTCCCATCGCAGAAAACGACGCATCATCTTTAATCGATGCGCGGAAATATTTAACTTGAACAA > NC_000913/656165‑656438 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |