Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 2,407,208 | C→A | intergenic (‑567/‑353) | lrhA ← / → alaA | DNA‑binding transcriptional dual regulator LrhA/glutamate‑‑pyruvate aminotransferase AlaA |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,407,208 | 0 | C | A | 99.4% | 597.1 / ‑3.2 | 169 | intergenic (‑567/‑353) | lrhA/alaA | DNA‑binding transcriptional dual regulator LrhA/glutamate‑‑pyruvate aminotransferase AlaA |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base A (115/53); total (116/53) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.01e-01 |
Only 100 of 173 total aligned reads displayed.
CAAAGTTATGTTATGTTAGGCAAAGTAATCTTCTATTATTAATAAGCACATCAAAACCTTTTTGAATATTAAATAATAATTAATTAGCATCATCCTCATTCATTAATTCCGCTTAACAATAGTTTCACACCTTGCCCCCATTGCGACACCTCGGAAATCATCACGCAGTTAAACTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTAC > NC_000913/2407071‑2407343 | cAAAGTTATGTTATGTTAGGCAAAGTAATCTTCTATTATTAATAAGCACATCAAAACCTTTTTGAATATTAAATAATAATTAATTAGCATCATCCTCATTCATTAATTCCGCTTAACAATAGTTTCACACCTTGCCcaca < 2:1297458/140‑1 (MQ=255) atgttatgttAGGCAAAGTAATCTTCTATTATTAATAAGCACATCAAAACCTTTTTGAATATTAAATAATAATTAATTAGCATCATCCTCATTCATTAATTCCGCTTAACAATAGTTTCACACCTTGCCCACATTGCGac < 1:178755/140‑1 (MQ=255) tgttatgttaGGCAAAGTAATCTTCTATTATTAATAAGCACATCAAAACCTTTTTGAATATTAAATAATAATTAATTAGCATCATCCTCATTCATTAATTCCGCTTAACAATAGTTTCACACCTTGCCCACATTGCGaca > 1:1954999/1‑140 (MQ=255) tgttaGGCAAAGTAATCTTCTATTATTAATAAGCACATCAAAACCTTTTTGAATATTAAATAATAATTAATTAGCATCATCCTCATTCATTAATTCCGCTTAACAATAGTTTCACACCTTGCCCACATTGCGACACCTCg > 2:30920/1‑140 (MQ=255) ttaGGCAAAGTAATCTTCTATTATTAATAAGCACATCAAAACCTTTTTGAATATTAAATAATAATTAATTAGCATCATCCTCATTCATTAATTCCGCTTAACAATAGTTTCACACCTTGCCCACATTGCGACACCTCGGa > 1:832690/1‑140 (MQ=255) ttaGGCAAAGTAATCTTCTATTATTAATAAGCACATCAAAACCTTTTTGAATATTAAATAATAATTAATTAGCATCATCCTCATTCATTAATTCCGCTTAACAATAGTTTCACACCTTGCCCACATTGCGACACCTCGGa > 2:1422705/1‑140 (MQ=255) ggCAAAGTAATCTTCTATTATTAATAAGCACATCAAAACCTTTTTGAATATTAAATAATAATTAATTAGCATCATCCTCATTCATTAATTCCGCTTAACAATAGTTTCACACCTTGCCCACATTGCGACACCTCGGAAat > 2:2004644/1‑140 (MQ=255) aGTAATCTTCTATTATTAATAAGCACATCAAAACCTTTTTGAATATTAAATAATAATTAATTAGCATCATCCTCATTCATTAATTCCGCTTAACAATAGTTTCATACCTTGCCCACATTGCGACACCTCGGAAAtcatca > 2:1143763/1‑140 (MQ=255) aGTAATCTTCTATTATTAATAAGCACATCAAAACCTTTTTGAATATTAAATAATAATTAATTAGCATCATCCTCATTCATTAATTCCGCTTAACAATAGTTTCACACCTTGCCCACATTGCGACACCTCGGAAAtcatca < 1:1276064/140‑1 (MQ=255) aGTAATCTTCTATTATTAATAAGCACATCAAAACCTTTTTGAATATTAAATAATAATTAATTAGCATCATCCTCATTCATTAATTCCGCTTAACAATAGTTTCACACCTTGCCCACATTGCGACACCTCGGAAAtcatca > 2:1495461/1‑140 (MQ=255) aGTAATCTTCTATTATTAATAAGCACATCAAAACCTTTTTGAATATTAAATAATAATTAATTAGCATCATCCTCATTCATTAATTCCGCTTAACAATAGTTTCACACCTTGCCCACATTGCGACACCTCGGAAAtcatca > 1:21271/1‑140 (MQ=255) aGTAATCTTCTATTATTAATAAGCACATCAAAACCTTTTTGAATATTAAATAATAATTAATTAGCATCATCCTCATTCATTAATTCCGCTTAACAATAGTTTCACACCTTGCCCACATTGCGACACCTCGGAAAtcatca > 2:1698638/1‑140 (MQ=255) tAATCTTCTATTATTAATAAGCACATCAAAACCTTTTTGAATATTAAATAATAATTAATTAGCATCATCCTCATTCATTAATTCCGCTTAACAATAGTTTCACACCTTGCCCACATTGCGACACCTCGGAAATCATCACg < 2:2127468/140‑1 (MQ=255) tAATCTTCTATTATTAATAAGCACATCAAAACCTTTTTGAATATTAAATAATAATTAATTAGCATCATCCTCATTCATTAATTCCGCTTAACAATAGTTTCACACCTTGCCCACATTGCGACACCTCGGAAATCATCACg < 1:236496/140‑1 (MQ=255) tAATCTTCTATTATTAATAAGCACATCAAAACCTTTTTGAATATTAAATAATAATTAATTAGCATCATCCTCATTCATTAATTCCGCTTAACAATAGTTTCACACCTTGCCCACATTGCGACACCTCGGAAATCATCACg > 2:2224293/1‑140 (MQ=255) cttctATTATTAATAAGCACATCAAAACCTTTTTGAATATTAAATAATAATTAATTAGCATCATCCTCATTCATTAATTCCGCTTAACAATAGTTTCACACCTTGCCCACATTGCGACACCTCGGAAATCATCACGCAGt > 2:2035440/1‑140 (MQ=255) tattatTAATAAGCACATCAAAACCTTTTTGAATATTAAATAATAATTAATTAGCATCATCCTCATTCATTAATTCCGCTTAACAATAGTTTCACACCTTGCCCACATTGCGACACCTCGGAAATCATCACGCAGTTaaa > 1:1415051/1‑140 (MQ=255) tattatTAATAAGCACATCAAAACCTTTTTGAATATTAAATAATAATTAATTAGCATCATCCTCATTCATTAATTCCGCTTAACAATAGTTTCACACCTTGCCCACATTGCGACACCTCGGAAATCATCACGCAGTTaaa > 2:317304/1‑140 (MQ=255) attattAATAAGCACATCAAAACCTTTTTGAATATTAAATAATAATTAATTAGCATCATCCTCATTCATTAATTCCGCTTAACAATAGTTTCACACCTTGCCCACATTGCGACACCTCGGAAATCATCACGCAGTTAAAc < 1:1924517/140‑1 (MQ=255) ttattaATAAGCACATCAAAACCTTTTTGAATATTAAATAATAATTAATTAGCATCATCCTCATTCATTAATTCCGCTTAACAATAGTTTCACACCTTGCCCACATTGCGACACCTCGGAAATCATCACGCAGTTAAAct > 2:1848136/1‑140 (MQ=255) ttattaATAAGCACATCAAAACCTTTTTGAATATTAAATAATAATTAATTAGCATCATCCTCATTCATTAATTCCGCTTAACAATAGTTTCACACCTTGCCCACATTGCGACACCTCGGAAATCATCACGCAGTTAAAct < 1:1495461/140‑1 (MQ=255) ttattaATAAGCACATCAAAACCTTTTTGAATATTAAATAATAATTAATTAGCATCATCCTCATTCATTAATTCCGCTTAACAATAGTTTCACACCTTGCCCACATTGCGACACCTCGGAAATCATCACGCAGTTAAAct > 1:1082172/1‑140 (MQ=255) ttattaATAAGCACATCAAAACCTTTTTGAATATTAAATAATAATTAATTAGCATCATCCTCATTCATTAATTCCGCTTAACAATAGTTTCACACCTTGCCCACATTGCGACACCTCGGAAATCATCACGCAGTTAAAct > 1:1070791/1‑140 (MQ=255) ttattaATAAGCACATCAAAACCTTTTTGAATATTAAATAATAATTAATTAGCATCATCCTCATTCATTAATTACGCTTACCAATAGTTTCACACCTTGCCCACATTGCGACACCTCGGAAATCATCACGCAGTTAAAct > 1:1920335/1‑140 (MQ=255) ttaATAAGCACATCAAAACCTTTTTGAATATTAAATAATAATTAATTAGCATCATCCTCATTCATTAATTCCGCTTAACAATAGTTTCACACCTTGCCCACATTGCGACACCTCGGAAATCATCACGCAGTTAAACtctc > 1:738609/1‑140 (MQ=255) taaGCACATCAAAACCTTTTTGAATATTAAATAATAATTAATTAGCATCATCCTCATTCATTAATTCCGCTTAACAATAGTTTCACACCTTGCCCACATTGCGACACCTCGGAAATCATCACGCAGTTAAACTCTCCGTa > 2:2104128/1‑140 (MQ=255) aGCACATCAAAACCTTTTTGAATATTAAATAATAATTAATTAGCATCATCCTCATTCATTAATTCCGCTTAACAATAGTTTCACACCTTGCCCACATTGCGACACCTCGGAAATCATCACGCAGTTAAACTCTCCGTAAt < 2:1082172/140‑1 (MQ=255) acaTCAAAACCTTTTTGAATATTAAATAATAATTAATTAGCATCATCCTCATTCATTAATTCCGCTTAACAATAGTTTCACACCTTGCCCACATTGCGACACCTCGGAAATCATCACGCAGTTAAACTCTCCGTAATGAg < 1:325794/140‑1 (MQ=255) acaTCAAAACCTTTTTGAATATTAAATAATAATTAATTAGCATCATCCTCATTCATTAATTCCGCTTAACAATAGTTTCACACCTTGCCCACATTGCGACACCTCGGAAATCATCACGCAGTTAAACTCTCCGTAATGAg < 1:667041/140‑1 (MQ=255) caTCAAAACCTTTTTGAATATTAAATAATAATTAATTAGCATCATCCTCATTCATTAATTCCGCTTAACAATAGTTTCACACCTTGCCCACATTGCGACACCTCGGAAATCATCACGCAGTTAAACTCTCCGTAATGAgg > 1:179835/1‑140 (MQ=255) caTCAAAACCTTTTTGAATATTAAATAATAATTAATTAGCATCATCCTCATTCATTAATTCCGCTTAACAATAGTTTCACACCTTGCCCACATTGCGACACCTCGGAAATCATCACGCAGTTAAACTCTCCGTAATGAgg > 1:2023131/1‑140 (MQ=255) aaaCCTTTTTGAATATTAAATAATAATTAATTAGCATCATCCTCATTCATTAATTCCGCTTAACAATAGTTTCACACCTTGCCCACATTGCGACACCTCGGAAATCATCACGCAGTTAAACTCTCCGTAATGAGGAAata > 1:1861515/1‑140 (MQ=255) ccTTTTTGAATATTAAATAATAATTAATTAGCATCATCCTCATTCATTAATTCCGCTTAACAATAGTTTCACACCTTGCCCACATTGCGACCCCTCGGAAATCATCACGCAGTTAAACTCTCCGTAATGAGGAAATatca < 1:363256/140‑1 (MQ=255) ttttGAATATTAAATAATAATTAATTAGCATCATCCTCATTCATTAATTCCGCTTAACAATAGTTTCACACCTTGCCCACATTGCGACACCTCGGAAATCATCACGCAGTTAAACTCTCCGTAATGAGGAAATatcatca > 1:1839724/1‑140 (MQ=255) ttttGAATATTAAATAATAATTAATTAGCATCATCCTCATTCATTAATTCCGCTTAACAATAGTTTCACACCTTGCCCACATTGCGACACCTCGGAAATCATCACGCAGTTAAACTCTCCGTAATGAGGAAATatcatca > 2:277081/1‑140 (MQ=255) ttttGAATATTAAATAATAATTAATTAGCATCATCCTCATTCATTAATTCCGCTTAACAATAGTTTCACACCTTGCCCACATTGCGACACCTCGGAAATCATCACGCAGTTAAACTCTCCGTAATGAGGAAATatcatca > 1:1615450/1‑140 (MQ=255) ttttGAATATTAAATAATAATTAATTAGCATCATCCTCATTCATTAATTCCGCTTAACAATAGTTTCACACCTTGCCCACATTGCGACACCTCGGAAATCATCACGCAGTTAAACTCTCCGTAATGAGGAAATatcatca > 2:2088495/1‑140 (MQ=255) ttttGAATATTAAATAATAATTAATTAGCATCATCCTCATTCATTAATTCCGCTTAACAATAGTTTCACACCTTGCCCACATTGCGACACCTCGGAAATCATCACGCAGTTAAACTCTCCGTAATGAGGAAATatcatca > 2:1373519/1‑140 (MQ=255) tttGAATATTAAATAATAATTAATTAGCATCATCCTCATTCATTAATTCCGCTTAACAATAGTTTCACACCTTGCCCACATTGCGACACCTCGGAAATCATCACGCAGTTAAACTCTCCGTAATGAGGAAATatcatcat < 2:228433/140‑1 (MQ=255) aaTATTAAATAATAATTAATTAGCATCATCCTCATTCATTAATTCCGCTTAACAATAGTTTCACACCTTGCCCACATTGCGACACCTCGGAAATCATCACGCAGTTAAACTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATcgcg < 1:1934241/140‑1 (MQ=255) atTAAATAATAATTAATTAACATCATCCTCATTCATTAATTCCGCTTAACAATAGTTTCACACCTTGCCCACATTGCGACACCTCGGAAATCATCACGCAGTTAAACTCTCCGTAATGAGGAAAGATCATCATCGCGttt > 2:2104614/1‑140 (MQ=255) ataataatTAATTAGCATCATCCTCATTCATTAATTCCGCTTAACAATAGTTTCACACCTTGCCCACATTGCGACACCTCGGAAATCATCACGCAGTTAAACTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTa < 2:1415051/140‑1 (MQ=255) aataatTAATTAGCATCATCCTCATTCATTAATTCCGCTTAACAATAGTTTCACACCTTGCCCACATTGCGACACCTCGGAAATCATCACGCAGTTAAACTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGt < 1:1574735/140‑1 (MQ=255) aataatTAATTAGCATCATCCTCATTCATTAATTCCGCTTAACAATAGTTTCACACCTTGCCCACATTGCGACACCTCGGAAATCATCACGCAGTTAAACTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGt > 2:1355956/1‑140 (MQ=255) taattaatTAGCATCATCCTCATTCATTAATTCCGCTTAACAATAGTTTCACACCTTGCCCACATTGCGACACCTCGGAAATCATCACGCAGTTAAACTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGa > 1:786987/1‑140 (MQ=255) ttaattaGCATCATCCTCATTCATTAATTCCGCTTAACAATAGTTTCACACCTTGCCCACATTGTGACACCTCGGAAATCATCACGCAGTTAAACTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAAtt > 1:953307/1‑140 (MQ=255) ttaattaGCATCATCCTCATTCATTAATTCCGCTTAACAATAGTTTCACACCTTGCCCACATTGCGACACCTCGGAAATCATCACGCAGTTAAACTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAAtt > 1:2208369/1‑140 (MQ=255) ttaattaGCATCATCCTCATTCATTAATTCCGCTTAACAATAGTTTCACACCTTGCCCACATTGCGACACCTCGGAAATCATCACGCAGTTAAACTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAAtt < 2:1812103/140‑1 (MQ=255) taGCATCATCCTCATTCATTAATTCCGCTTAACAATAGTTTCACACCTTGCCCACATTGCGACACCTCGGAAATCATCACGCAGTTAAACTCTCCTTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTaa > 2:702465/1‑140 (MQ=255) gCATCATCCTCATTCATTAATTCCGCTTAACAATAGTTTCACACCTTGCCCACATTGCGACACCTCGGAAATCATCACGCAGTTAAACTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAAt > 1:1772800/1‑140 (MQ=255) gCATCATCCTCATTCATTAATTCCGCTTAACAATAGTTTCACACCTTGCCCACATTGCGACACCTCGGAAATCATCACGCAGTTAAACTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAAt > 2:491069/1‑140 (MQ=255) catcatCCTCATTCATTAATTCCGCTTAACAATAGTTTCACACCTTGCCCACATTGCGACACCTCGGAAATCATCACGCAGTTAAACTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATg > 2:1525692/1‑140 (MQ=255) catcatCCTCATTCATTAATTCCGCTTAACAATAGTTTCACACCTTGCCCACATTGCGACACCTCGGAAATCATCACGCAGTTAAACTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATg > 1:2100083/1‑140 (MQ=255) catcatCCTCATTCATTAATTCCGCTTAACAATAGTTTCACACCTTGCCCACATTGCGACACCTCGGAAATCATCACGCAGTTAAACTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATg > 2:526641/1‑140 (MQ=255) catcatCCTCATTCATTAATTCCGCTTAACAATAGTTTCACACCTTGCCCACATTGCGACACCTCGGAAATCATCACGCAGTTAAACTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATg > 2:1756126/1‑140 (MQ=255) catcCTCATTCATTAATTCCGCTTAACAATAGTTTCACACCTTGCCCACATTGCGACACCTCGGAAATCATCACGCAGTTAAACTCTCCGTAATGAGGAAATATGATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAgg < 2:1610308/140‑1 (MQ=255) catcCTCATTCATTAATTCCGCTTAACAATAGTTTCACACCTTGCCCACATTGCGACACCTCGGAAATCATCACGCAGTTAAACTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAgg < 2:1858646/140‑1 (MQ=255) catcCTCATTCATTAATTCCGCTTAACAATAGTTTCACACCTTGCCCACATTGCGACACCTCGGAAATCATCACGCAGTTAAACTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAgg < 2:1565549/140‑1 (MQ=255) tcCTCATTCATTAATTCCGCTTAACAATAGTTTCACACCTTGCCCACATTGCGACACCTCGGAAATCATCACGCAGTTAAACTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCa > 1:696634/1‑140 (MQ=255) tcCTCATTCATTAATTCCGCTTAACAATAGTTTCACACCTTGCCCACATTGCGACACCTCGGAAATCATCACGCAGTTAAACTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCa > 1:1230201/1‑140 (MQ=255) cattcattAATTCCGCTTAACAATAGTTTCACACCTTGCCCACATTGCGACACCTCGGAAATCATCACGCAGTTAAACTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCAtttt > 2:1084573/1‑140 (MQ=255) attcattAATTCCGCTTAACAATAGTTTCACACCTTGCCCACATTGCGACACCTCGGAAATCATCACGCAGTTAAACTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTc < 1:1698638/140‑1 (MQ=255) attcattAATTCCGCTTAACAATAGTTTCACACCTTGCCCACATTGCGACACCTCGGAAATCATCACGCAGTTAAACTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTc > 1:1295414/1‑140 (MQ=255) attcattAATTCCGCTTAACAATAGTTTCACACCTTGCCCACATTGCGACACCTCGGAAATCATCACGCAGTTAAACTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTc > 1:1880953/1‑140 (MQ=255) attcattAATTCCGCTTAACAATAGTTTCACACCTTGCCCACATTGCGACACCTCGGAAATCATCACGCAGTTAAACTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTc < 1:620259/140‑1 (MQ=255) tcattAATTCCGCTTAACAATAGTTTCACACCTTGCCCACATTGCGACACCTCGGAAATCATCACGCAGTTAAACTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTcac < 1:465329/140‑1 (MQ=255) attAATTCCGCTTAACAATAGTTTCATACCTTGCCCACATTGCGACACCTCGGAAATCATCACGCAGTTAAACTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTcacac < 1:1143763/140‑1 (MQ=255) attAATTCCGCTTAACAATAGTTTCACACCTTGCCCACATTGCGACACCTCGGAAATCATCACGCAGTTAAACTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTcacac < 1:1035619/140‑1 (MQ=255) attAATTCCGCTTAACAATAGTTTCACACCTTGCCCACATTGCGACACCTCGGAAATCATCACGCAGTTAAACTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTcacac < 2:826639/140‑1 (MQ=255) attAATTCCGCTTAACAATAGTTTCACACCTTGCCCACATTGCGACACCTCGGAAATCATCACGCAGTTAAACTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTcacac < 1:2004644/140‑1 (MQ=255) attAATTCCGCTTAACAATAGTTTCACACCTTGCCCACATTGCGACACCTCGGAAATCATCACGCAGTTAAACTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTcacac > 1:2192560/1‑140 (MQ=255) attAATTCCGCTTAACAATAGTTTCACACCTTGCCCACATTGCGACACCTCGGAAATCATCACGCAGTTAAACTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTcacac < 1:277081/140‑1 (MQ=255) ttAATTCCGCTTAACAATAGTTTCACACCTTGCCCACATTGCGACACCTCGGAAATCATCACGCAGTTAAACTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTcacaca > 1:41323/1‑140 (MQ=255) tAATTCCGCTTAACAATAGTTTCACACCTTGCCCACATTGCGACACCTCGGAAATCATCACGCAGTTAAACTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATTAGGCATTTTCACACaa < 2:1968239/140‑1 (MQ=255) tAATTCCGCTTAACAATAGTTTCACACCTTGCCCACATTGCGACACCTCGGAAATCATCACGCAGTTAAACTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACaa > 2:164657/1‑140 (MQ=255) tAATTCCGCTTAACAATAGTTTCACACCTTGCCCACATTGCGACACCTCGGAAATCATCACGCAGTTAAACTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACaa < 2:1351217/140‑1 (MQ=255) tAATTCCGCTTAACAATAGTTTCACACCTTGCCCACATTGCGACACCTCGGAAATCATCACGCAGCTAAACTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACaa < 2:597562/140‑1 (MQ=255) cGCTTAACAATAGTTTCACACCTTGCCCACATTGCGACACCTCGGAAATCATCACGCAGTTAAACTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCt > 1:1648445/1‑140 (MQ=255) cGCTTAACAATAGTTTCACACCTTGCCCACATTGCGACACCTCGGAAATCATCACGCAGTTAAACTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCt > 2:1669807/1‑140 (MQ=255) cGCTTAACAATAGTTTCACACCTTGCCCACATTGCGACACCTCGGAAATCATCACGCAGTTAAACTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCt > 2:23200/1‑140 (MQ=255) cGCTTAACAATAGTTTCACACCTTGCCCACATTGCGACACCTCGGAAATCATCACGCAGTTAAACTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTAATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCt > 1:719748/1‑140 (MQ=255) cTTAACAATAGTTTCACACCTTGCCCACATTGCGACACCTCGGAAATCATCACGCAGTTAAACTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTa > 1:41148/1‑140 (MQ=255) cTTAACAATAGTTTCACACCTTGCCCACATTGCGACACCTCGGAAATCATCACGCAGTTAAACTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTa > 1:999046/1‑140 (MQ=255) cTTAACAATAGTTTCACACCTTGCCCACATTGCGACACCTCGGAAATCATCACGCAGTTAAACTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTa > 2:1841157/1‑140 (MQ=255) cTTAACAATAGTTTCACACCTTGCCCACATTGCGACACCTCGGAAATCATCACGCAGTTAAACTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTa > 2:835049/1‑140 (MQ=255) cTTAACAATAGTTTCACACCTTGCCCACATTGCGACACCTCGGAAATCATCACGCAGTTAAACTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTa < 2:786987/140‑1 (MQ=255) tAACAATAGTTTCACACCTTGCCCACATTGCGACACCTCGGAAATCATCACGCAGTTAAACTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACa > 1:1489095/1‑140 (MQ=255) cAATAGTTTCACACCTTGCCCACATTGCGACACCTCGGAAATCATCACGCAGTTAAACTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGAt > 2:368960/1‑140 (MQ=255) tttCACACCTTGCCCACATTGCGACACCTCGGAAATCATCACGCAGTTAAACTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATaaaaaa > 1:63083/1‑140 (MQ=255) tCACACCTTGCCCACATTGCGACACCTCGGAAATCATCACGCAGTTAAACTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAAc < 1:526641/140‑1 (MQ=255) tCACACCTTGCCCACATTGCGACACCTCGGAAATCATCACGCAGTTAAACTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAAc < 1:835049/140‑1 (MQ=255) cacaCCTTGCCCACATTGCGACACCTCGGAAATCATCACGCAGTTAAACTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAAcc < 1:1366327/140‑1 (MQ=255) acacCTTGCCCACATTGCGACACCTCGGAAATCATCACGCAGTTAAACTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCa > 1:1022815/1‑140 (MQ=255) cacCTTGCCCACATTGCGACACCTCGGAAATCATCACGCAGTTAAACTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAg > 1:2029928/1‑140 (MQ=255) ccTTGCCCACATTGCGACACCTCGGAAATCATCACGCAGTTAAACTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTCTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGAc < 1:1096662/140‑1 (MQ=255) cTTGCCCCCATTGCGACACCTCGGAAATCATCACGCAGTTAAACTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACt > 1:329188/1‑140 (MQ=255) tGCCCACATTGCGACACCTCGGAAATCATCACGCAGTTAAACTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTa > 2:931598/1‑140 (MQ=255) gCCCACATTGCGACACCTCGGAAATCATCACGCAGTTAAACTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCGTTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAAc < 1:1880645/131‑1 (MQ=255) gCCCACATTGCGACACCTCGGAAATCATCACGCAGTTAAACTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCGTTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAAc > 2:1880645/1‑131 (MQ=255) gCCCACATTGCGACACCTCGGAAATCATCACGCAGTTAAACTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTAc > 2:437973/1‑140 (MQ=255) | CAAAGTTATGTTATGTTAGGCAAAGTAATCTTCTATTATTAATAAGCACATCAAAACCTTTTTGAATATTAAATAATAATTAATTAGCATCATCCTCATTCATTAATTCCGCTTAACAATAGTTTCACACCTTGCCCCCATTGCGACACCTCGGAAATCATCACGCAGTTAAACTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTAC > NC_000913/2407071‑2407343 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |