| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,653,361 | C→A | pseudogene (126/478 nt) | yhiS → | putative uncharacterized protein YhiS |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,653,361 | 0 | C | A | 99.0% | 342.0 / ‑3.0 | 96 | pseudogene (126/478 nt) | yhiS | putative uncharacterized protein YhiS |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base A (55/40); total (56/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.08e-01 | |||||||||||
ACCTTCCTTAGGTGACACTATTTTTTTACATAAAGAACACCCTACCCCCAAATTATATAAAGATGGACAATATCTTGACAAACAAATCGAAGGTTTATTTTCAACATTATTAACCATTAATGACAACCTTTTACGAGCAAAAGCGGAAATTGCTTCGACAATAATTAAATTTTTAGAGGCCAGGATAACCAATCTTTCATACAATGACATATTAAAATATCAGCAAGAATTCCAAAGACAATGTTATAAGCAAGTTAAAGCCTTTACGACAC > NC_000913/3653224‑3653495 | aCCTTCCTTAGGTGACACTATTTTTTTACATAAAGAACACCCTACCCCCAAATTATATAAAGATGGACAATATCTTGACAAACAAATCGAAGGTTTATTTTCAACATTATTAACCATTAATGACAACCTTTTACGAGaaa > 2:87207/1‑140 (MQ=255)aCCTTCCTTAGGTGACACTATTTTTTTACATAAAGAACACCCTACCCCCAAATTATATAAAGATGGACAATATCTTGACAAACAAATCGAAGGTTTATTTTCAACATTATTAACCATTAATGACAACCTTTTACGAGaaa > 2:1260381/1‑140 (MQ=255) cttccttAGGTGACACTATTTTTTTACATAAAGAACACCCTACCCCCAAATTATATAAAGATGGACAATATCTTGACAAACAAATCGAAGGTTTATTTTCAACATTATTAACCATTAATGACAACCTTTTACGAGAaaaa < 1:1171485/140‑1 (MQ=255) ccttAGGTGACACTATTTTTTTACATAAAGAACACCCTACCCCCAAATTATATAAAGATGGACAATATCTTGACAAACAAATCGAAGGTTTATTTTCAACATTATTAACCATTAATGACAACCTTTTACGAGAAAAAGCg > 2:555973/1‑140 (MQ=255) acacTATTTTTTTACATAAAGAACACCCTACCCCCAAATTATATAAAGATGGACAATATCTTGACAAACAAATCGAAGGTTTATTTTCAACATTATTAACCATTAATGACAACCTTTTACGAGCAAAAGCGGAAATTGCt > 1:462129/1‑140 (MQ=255) acacTATTTTTTTACATAAAGAACACCCTACCCCCAAATTATATAAAGATGGACAATATCTTGACAAACAAATCGAAGGTTTATTTTCAACATTATTAACCATTAATGACAACCTTTTACGAGAAAAAGCGGAAATTGCt > 1:676704/1‑140 (MQ=255) acacTATTTTTTTACATAAAGAACACCCTACCCCCAAATTATATAAAGATGGACAATATCTTGACAAACAAATCGAAGGTTTATTTTCAACATTATTAACCATTAATGACAACCTTTTACGAGAAAAAGCGGAAATTGCt > 2:533457/1‑140 (MQ=255) acacTATTTTTTTACATAAAGAACACCCTACCCCCAAATTATATAAAGATGGACAATATCTTGACAAACAAATCGAAGGTTTATTTTCAACATTATTAACCATTAATGACAACCTTTTACGAGAAAAAGCGGAAATTGCt > 1:785595/1‑140 (MQ=255) acacTATTTTTTTACATAAAGAACACCCTACCCCCAAATTATATAAAGATGGACAATATCTTGACAAACAAATCGAAGGTTTATTTTCAACATTATTAACCATTAATGACAACCTTTTACGAGAAAAAGCGGAAATTGCt > 2:588436/1‑140 (MQ=255) cacTATTTTTTTACATAAAGAACACCCTACCCCCAAATTATATAAAGATGGACAATATCTTGACAAACAAATCGAAGGTTTATTTTCAACATTATTAACCATTAATGACAACCTTTTACGAGAAAAAGCGGAAATTGCtt > 2:379157/1‑140 (MQ=255) cacTATTTTTTTACATAAAGAACACCCTACCCCCAAATTATATAAAGATGGACAATATCTTGACAAACAAATCGAAGGTTTATTTTCAACATTATTAACCATTAATGACAACCTTTTACGAGAAAAAGCGGAAATTGCtt > 2:1244214/1‑140 (MQ=255) cATAAAGAACACCCTACCCCCAAATTATATAAAGATGGACAATATCTTGACAAACAAATCGAAGGTTTATTTTCAACATTATTAACCATTAATGACAACCTTTTACGAGAAAAAGCGGAAATTGCTTCGACAATAATTaa > 1:973231/1‑140 (MQ=255) tAAAGAACACCCTACCCCCAAATTATATAAAGATGGACAATATCTTGACAAACAAATCGAAGGTTTATTTTCAACATTATTAACCATTAATGACAACCTTTTACGAGAAAAAGCGGAAATTGCTTCGACAATAATTAAAt > 1:1027555/1‑140 (MQ=255) tAAAGAACACCCTACCCCCAAATTATATAAAGATGGACAATATCTTGACAAACAAATCGAAGGTTTATTTTCAACATTATTAACCATTAATGACAACCTTTTACGAGAAAAAGCGGAAATTGCTTCGACAATAATTAAAt > 1:1027556/1‑140 (MQ=255) aaCACCCTACCCCCAAATTATATAAAGATGGACAATATCTTGACAAACAAATCGAAGGTTTATTTTCAACATTATTAACCATTAATGACAACCTTTTACGAGAAAAAGCGGAAATTGCTTCGACAATAATTAAATTTTTa < 1:144841/140‑1 (MQ=255) aaCACCCTACCCCCAAATTATATAAAGATGGACAATATCTTGACAAACAAATCGAAGGTTTATTTTCAACATTATTAACCATTAATGACAACCTTTTACGAGAAAAAGCGGAAATTGCTTCGACAATAATTAAATTTTTa < 2:94788/140‑1 (MQ=255) cccTACCCCCAAATTATATAAAGATGGACAATATCTTGACAAACAAATCGAAGGTTTATTTTCAACATTATTAACCATTAATGACAACCTTTTACGAGAAAAAGCGGAAATTGCTTCGACAATAATTAAATTTTTAGAgg < 2:785595/140‑1 (MQ=255) ccTACCCCCAAATTATATAAAGATGGACAATATCTTGACAAACAAATCGAAGGTTTATTTTCAACATTATTAACCATTAATGACAGCCTTTTACGAGAAAAAGCGGAAATTGCTTCGACAATAATTAAATTTTTAGAGGc < 1:1260381/140‑1 (MQ=255) ccTACCCCCAAATTATATAAAGATGGACAATATCTTGACAAACAAATCGAAGGTTTATTTTCAACATTATTAACCATTAATGACAACCTTTTACGAGAAAAAGCGGAAATTGCTTCGACAATAATTAAATTTTTAGAGGc < 1:284361/140‑1 (MQ=255) ccTACCCCCAAATTATATAAAGATGGACAATATCTTGACAAACAAATCGAAGGTTTATTTTCAACATTATTAACCATTAATGACAACCTTTTACGAGAAAAAGCGGAAATTGCTTCGACAATAATTAAATTTTTAGAGGc < 1:87207/140‑1 (MQ=255) ccTACCCCCAAATTATATAAAGATGGACAATATCTTGACAAACAAATCGAAGGTTTATTTTCAACATTATTAACCATTAATGACAACCTTTTACGAGAAAAAGCGGAAATTGCTTCGACAATAATTAAATTTTTAGAGGc < 2:906189/140‑1 (MQ=255) cTACCCCCAAATTATATAAAGATGGACAATATCTTGACAAACAAATCGAAGGTTTATTTTCAACATTATTAACCATTAATGACAACCTTTTACGAGAAAAAGCGGAAATTGCTTCGACAATAATTAAATTTTTAGAGGcc > 2:519223/1‑140 (MQ=255) tACCCCCAAATTATATAAAGATGGACAATATCTTGACAAACAAATCGAAGGTTTATTTTCAACATTATTAACCATTAATGACAACCTTTTACGAGAAAAAGCGGAAATTGCTTCGACAATAATTAAATTTTTAGAGGCCa > 2:788183/1‑140 (MQ=255) aCCCCCAAATTATATAAAGATGGACAATATCTTGACAAACAAATCGAAGGTTTATTTTCAACATTATTAACCATTAATGACAACCTTTTACGAGAAAAAGCGGAAATTGCTTCGACAATAATTAAATTTTTAGAGGCCAg > 2:1314440/1‑140 (MQ=255) cccccAAATTATATAAAGATGGACAATATCTTGACAAACAAATCGAAGGTTTATTTTCAACATTATTAACCATTAATGACAACCTTTTACGAGAAAAAGCGGAAATTGCTTCGACAATAATTAAATTTTTAGAGGCCAgg < 1:1002905/140‑1 (MQ=255) aaTTATATAAAGATGGACAATATCTTGACAAACAAATCGAAGGTTTATTTTCAACATTATTAACCATTAATGACAACCTTTTACGAGAAAAAGCGGAAATTGCTTCGACTATAATTAAATTTTTAGAGGCCAGGATAAcc > 2:265201/1‑140 (MQ=255) aaTTATATAAAGATGGACAATATCTTGACAAACAAATCGAAGGTTTATTTTCAACATTATTAACCATTAATGACAACCTTTTACGAGAAAAAGCGGAAATTGCTTCGACAATAATTAAATTTTTAGAGGCCAGGATAAcc > 2:717719/1‑140 (MQ=255) aaTTATATAAAGATGGACAATATCTTGACAAACAAATCGAAGGTTTATTTTCAACATTATTAACCATTAATGACAACCTTTTACGAGAAAAAGCGGAAATTGCTTCGACAATAATTAAATTTTTAGAGGCCAGGATAAcc < 1:1244214/140‑1 (MQ=255) aaTTATATAAAGATGGACAATATCTTGACAAACAAATCGAAGGTTTATTTTCAACATTATTAACCATTAATGACAACCTTTTACGAGAAAAAGCGGAAATTGCTTCGACAATAATTAAATTTTTAGAGGCCAGGATAAcc > 1:881105/1‑140 (MQ=255) aTTATATAAAGATGGACAATATCTTGACAAACAAATCGAAGGTTTATTTTCAACATTATTAACCATTAATGACAACCTTTTACGAGAAAAAGCGGAAATTGCTTCGACAATAATTAAATTTTTAGAGGCCAGGATAACCa < 1:546671/140‑1 (MQ=255) aTTATATAAAGATGGACAATATCTTGACAAACAAATCGAAGGTTTATTTTCAACATTATTAACCATTAATGACAACCTTTTACGAGAAAAAGCGGAAATTGCTTCGACAATAATTAAATTTTTAGAGGCCAGGATAACCa < 1:666983/140‑1 (MQ=255) aTTATATAAAGATGGACAATATCTTGACAAACAAATCGAAGGTTTATTTTCAACATTATTAACCATTAATGACAACCTTTTACGAGAAAAAGCGGAAATTGCTTCGACAATAATTAAATTTTTAGAGGCCAGGATAACCa < 2:973231/140‑1 (MQ=255) aTTATATAAAGATGGACAATATCTTGACAAACAAATCGAAGGTTTATTTTCAACATTATTAACCATTAATGACAACCTTTTACGAGAAAAAGCGGAAATTGCTTCGACAATAATTAAATTTTTAGAGGCCAGGATAACCa < 1:533457/140‑1 (MQ=255) aTTATATAAAGATGGACAATATCTTGACAAACAAATCGAAGGTTTATTTTCAACATTATTAACCATTAATGACAACCTTTTACGAGAAAAAGCGGAAATTGCTTCGACAATAATTAAATTTTTAGAGGCCAGGATAACCa < 1:478329/140‑1 (MQ=255) aTTATATAAAGATGGACAATATCTTGACAAACAAATCGAAGGTTTATTTTCAACATTATTAACCATTAATGACAACCTTTTACGAGAAAAAGCGGAAATTGCTTCGACAATAATTAAATTTTTAGAGGCCAGGATAACCa < 1:1314440/140‑1 (MQ=255) tatataAAGATGGACAATATCTTGACAAACAAATCGAAGGTTTATTTTCAACATTATTAACCATTAATGACAACCTTTTACGAGAAAAAGCGGAAATTGCTTCGACAATAATTAAATTTTTAGAGGCCAGGATAACCAAt < 2:88792/140‑1 (MQ=255) atataAAGATGGACAATATCTTGACAAACAAATCGAAGGTTTATTTTCAACATTATTAACCATTAATGACAACCTTTTACGAGAAAAAGCGGAAATTGCTTCGACAATAATTAAATTTTTAGAGGCCAGGATAACCAATc > 1:587160/1‑140 (MQ=255) atataAAGATGGACAATATCTTGACAAACAAATCGAAGGTTTATTTTCAACATTATTAACCATTAATGACAACCTTTTACGAGAAAAAGCGGAAATTGCTTCGACAATAATTAAATTTTTAGAGGCCAGGATAACCAATc > 2:1038695/1‑140 (MQ=255) atataAAGATGGACAATATCTTGACAAACAAATCGAAGGTTTATTTTCAACATTATTAACCATTAATGACAACCTTTTACGAGAAAAAGCGGAAATTGCTTCGACAATAATTAAA‑TTTTAGAGGCCAGGATAACCAATCt > 1:205347/1‑140 (MQ=255) taAAGATGGACAATATCTTGACAAACAAATCGAAGGTTTATTTTCAACATTATTAACCATTAATGACAACCTTTTACGAGAAAAAGCGGAAATTGCTTCGACAATAATTAAATTTTTAGAGGCCAGGATAACCAATCttt < 1:1038695/140‑1 (MQ=255) aaGATGGACAATATCTTGACAAACAAATCGAAGGTTTATTTTCAACATTATTAACCATTAATGACAACCTTTTACGAGAAAAAGCGGAAATTGCTTCGACAATAATTAAATTTTTAGAGGCCAGGATAACCAATCTTTCa < 1:555973/140‑1 (MQ=255) aaGATGGACAATATCTTGACAAACAAATCGAAGGTTTATTTTCAACATTATTAACCATTAATGACAACCTTTTACGAGAAAAAGCGGAAATTGCTTCGACAATAATTAAATTTTTAGAGGCCAGGATAACCAATCTTTCa < 2:962638/140‑1 (MQ=255) aGATGGACAATATCTTGACAAACAAATCGAAGGTTTATTTTCAACATTATTAACCATTAATGACAACCTTTTACGAGAAAAAGCGGAAATTGCTTCGACAATAATTAAATTTTTAGAGGCCAGGATAACCAATCTTTCAt > 2:797105/1‑140 (MQ=255) aTGGACAATATCTTGACAAACAAATCGAAGGTTTATTTTCAACATTATTAACCATTAATGACAACCTTTTACGAGAAAAAGCGGAAATTGCTTCGACAATAATTAAATTTTTAGAGGCCAGGATAACCAATCTTTCATAc > 2:487201/1‑140 (MQ=255) aTGGACAATATCTTGACAAACAAATCGAAGGTTTATTTTCAACATTATTAACCATTAATGACAACCTTTTACGAGAAAAAGCGGAAATTGCTTCGACAATAATTAAATTTTTAGAGGCCAGGATAACCAATCTTTCATAc > 2:404499/1‑140 (MQ=255) tGGACAATATCTTGACAAACAAATCGAAGGTTTATTTTCAACATTATTAACCATTAATGACAACCTTTTACGAGAAAAAGCGGAAATTGCTTCGACAATAATTAAATTTTTAGAGGCCAGGATAACCAATCTTTCATACa > 2:387566/1‑140 (MQ=255) aCAATATCTTGACAAACAAATCGAAGGTTTATTTTCAACATTATTAACCATTAATGACAACCTTTTACGAGAAAAAGCGGAAATTGCTTCGACAATAATTAAATTTTTAGAGGCCAGGATAACCAATCTTTCATACAATg < 1:1262116/140‑1 (MQ=255) aCAATATCTTGACAAACAAATCGAAGGTTTATTTTCAACATTATTAACCATTAATGACAACCTTTTACGAGAAAAAGCGGAAATTGCTTCGACAATAATTAAATTTTTAGAGGCCAGGATAACCAATCTTTCATACAATg < 1:487201/140‑1 (MQ=255) aaTATCTTGACAAACAAATCGAAGGTTTATTTTCAACATTATTAACCATTAATGACAACCTTTTACGAGAAAAAGCGGAAATTGCTTCGACAATAATTAAATTTTTAGAGGCCAGGATAACCAATCTTTCATACAATGAc < 1:137199/140‑1 (MQ=255) cTTGACAAACAAATCGAAGGTTTATTTTCAACATTATTAACCATTAATGACAACCTTTTACGAGAAAAAGCGGAAATTGCTTCGACAATAATTAAATTTTTAGAGGCCAGGATAACCAATCTTTCATACAATGACATAtt > 2:584467/1‑140 (MQ=255) tGACAAACAAATCGAAGGTTTATTTTCAACATTATTAACCATTAATGACAACCTTTTACGAGAAAAAGCGGAAATTGCTTCGACAATAATTAAATTTTTAGAGGCCAGGATAACCAATCTTTCATACAATGACATATTaa > 2:747142/1‑140 (MQ=255) tGACAAACAAATCGAAGGTTTATTTTCAACATTATTAACCATTAATGACAACCTTTTACGAGAAAAAGCGGAAATTGCTTCGACAATAATTAAATTTTTAGAGGCCAGGATAACCAATCTTTCATACAATGACATATTaa > 2:628482/1‑140 (MQ=255) aacaaaTCGAAGGTTTATTTTCAACATTATTAACCATTAATGACAACCTTTTACGAGAAAAAGCGGAAATTGCTTCGACAATAATTAAATTTTTAGAGGCCAGGATAACCAATCTTTCATACAATGACATATTAAAatat > 2:471245/1‑140 (MQ=255) aacaaaTCGAAGGTTTATTTTCAACATTATTAACCATTAATGACAACCTTTTACGAGAAAAAGCGGAAATTGCTTCGACAATAATTAAATTTTTAGAGGCCAGGATAACCAATCTTTCATACAATGACATATTAAAatat > 2:618628/1‑140 (MQ=255) aacaaaTCGAAGGTTTATTTTCAACATTATTAACCATTAATGACAACCTTTTACGAGAAAAAGCGGAAATTGCTTCGACAATAATTAAATTTTTAGAGGCCAGGATAACCAATCTTTCATACAATGACATATTAAAatat > 1:192742/1‑140 (MQ=255) aacaaaTCGAAGGTTTATTTTCAACATTATTAACCATTAATGACAACCTTTTACGAGAAAAAGCGGAAATTGCTTCGACAATAATTAAATTTTTAGAGGCCAGGATAACCAATCTTTCATACAATGACATATTAAAatat > 1:359041/1‑140 (MQ=255) caaaTCGAAGGTTTATTTTCAACATTATTAACCATTAATGACAACCTTTTACGAGAAAAAGCGGAAATTGCTTCGACAATAATTAAATTTTTAGAGGCCAGGATAACCAATCTTTCATACAATGACATATTAAAATATCa > 1:1090370/1‑140 (MQ=255) aaTCGAAGGTTTATTTTCAACATTATTAACCATTAATGACAACCTTTTACGAGAAAAAGCGGAAATTGCTTCGACAATAATTAAATTTTTAGAGGCCAGGATAACCAATCTTTCATACAATGACATATTAAAATATCAGc > 1:449177/1‑140 (MQ=255) gAAGGTTTATTTTCAACATTATTAACCATTAATGACAACCTTTTACGAGAAAAAGCGGAAATTGCTTCGACAATAATTAAATTTTTAGAGGCCAGGATAACCAATCTTTCATACAATGACATATTAAAATATCAGCAAGa < 1:308009/140‑1 (MQ=255) tttATTTTCAACATTATTAACCATTAATGACAACCTTTTACGAGAAAAAGCGGAAATTGCTTCGACAATAATTAAATTTTTAGAGGCCAGGATAACCAATCTTTCATACAATGACATATTAAAATATCAGCAAGAATTcc > 2:1260254/1‑140 (MQ=255) tttATTTTCAACATTATTAACCATTAATGACAACCTTTTACGAGAAAAAGCGGAAATTGCTTCGACAATAATTAAATTTTTAGAGGCCAGGATAACCAATCTTTCATACAATGACATATTAAAATATCAGCAAGAATTcc < 2:1296516/140‑1 (MQ=255) tttATTTTCAACATTATTAACCATTAATGACAACCTTTTACGAGAAAAAGCGGAAATTGCTTCGACAATAATTAAATTTTTAGAGGCCAGGATAACCAATCTTTCATACAATGACATATTAAAATATCAGCAAGAATTcc < 2:881105/140‑1 (MQ=255) ttATTTTCAACATTATTAACCATTAATGACAACCTTTTACGAGAAAAAGCGGAAATTGCTTCGACAATAATTAAATTTTTAGAGGCCAGGATAACCAATCTTTCATACAATGACATATTAAAATATCAGCAAGAATTCCa < 1:265201/140‑1 (MQ=255) tATTTTCAACATTATTAACCATTAATGACAACCTTTTACGAGAAAAAGCGGAAATTGCTTCGACAATAATTAAATTTTTAGAGGCCAGGATAACCAATCTTTCATACAATGACATATTAAAATATCAGCAAGAATTCCaa > 2:892065/1‑140 (MQ=255) tATTTTCAACATTATTAACCATTAATGACAACCTTTTACGAGAAAAAGCGGAAATTGCTTCGACAATAATTAAATTTTTAGAGGCCAGGATAACCAATCTTTCATACAATGACATATTAAAATATCAGCAAGAATTCCaa > 1:877252/1‑140 (MQ=255) aTTTTCAACATTATTAACCATTAATGACAACCTTTTACGAGAAAAAGCGGAAATTGCTTCGACAATAATTAAATTTTTAGAGGCCAGGATAACCAATCTTTCATACAATGACATATTAAAATATCAGCAAGAATTCCaaa < 2:1044403/140‑1 (MQ=255) tCAACATTATTAACCATTAATGACAACCTTTTACGAGAAAAAGCGGAAATTGCTTCGACAATAATTAAATTTTTAGAGGCCAGGATAACCAATCTTTCATACAATGACATATTAAAATATCAGCAAGAATTCCAAAGACa < 2:192742/140‑1 (MQ=255) aaCATTATTAACCATTAATGACAACCTTTTACGAGAAAAAGCGGAAATTGCTTCGACAATAATTAAATTTTTAGAGGCCAGGATAACCAATCTTTCATACAATGACATATTAAAATATCAGCAAGAATTCCAAAGACAAt > 2:163322/1‑140 (MQ=255) aaCATTATTAACCATTAATGACAACCTTTTACGAGAAAAAGCGGAAATTGCTTCGACAACAATTAAATTTTTAGAGGCCAGGATAACCAATCTTTCATACAATGACATATTAAAATATCAGCAAGAATTCCAAAGACAAt > 1:1089388/1‑140 (MQ=255) aCATTATTAACCATTAATGACAACCTTTTACGAGAAAAAGCGGAAATTGCTTCGACAATAATTAAATTTTTAGAGGCCAGGATAACCAATCTTTCATACAATGACATATTAAAATATCAGCAAGAATTCCAAAGACAATg > 1:52229/1‑140 (MQ=255) aaCCATTAATGACAACCTTTTACGAGAAAAAGCGGAAATTGCTTCGACAATAATTAAATTTTTAGAGGCCAGGATAACCAATCTTTCATACAATGACATATTAAAATATCAGCAAGAATTCCAAAGACAATGTTATAAGc < 1:331376/140‑1 (MQ=255) aCCATTAATGACAACCTTTTACGAGAAAAAGCGGAAATTGCTTCGACAATAATTAAATTTTTAGAGGCCAGGATAACCAATCTTTCATACAATGACATATTAAAATATCAGCAAGAATTCCAAAGACAATGTTATAAGCa > 2:579216/1‑140 (MQ=255) aCCATTAATGACAACCTTTTACGAGAAAAAGCGGAAATTGCTTCGACAATAATTAAATTTTTAGAGGCCAGGATAACCAATCTTTCATACAATGACATATTAAAATATCAGCAAGAATTCCAAAGACAATGTTATAAGCa < 2:1027555/140‑1 (MQ=255) aCCATTAATGACAACCTTTTACGAGAAAAAGCGGAAATTGCTTCGACAATAATTAAATTTTTAGAGGCCAGGATAACCAATCTTTCATACAATGACATATTAAAATATCAGCAAGAATTCCAAAGACAATGTTATAAGCa < 2:1027556/140‑1 (MQ=255) aTTAATGACAACCTTTTACGAGAAAAAGCGGAAATTGCTTCGACAATAATTAAATTTTTAGAGGCCAGGATAACCAATCTTTCATACAATGACATATTAAAATATCAGCAAGAATTCCAAAGACAATGTTATAAGCAAGt > 1:348471/1‑140 (MQ=255) ttAATGACAACCTTTTACGAGAAAAAGCGGAAATTGCTTCGACAATAATTAAATTTTTAGAGGCCAGGATAACCAATCTTTCATACAATGACATATTAAAATATCAGCAAGAATTCCAAAGACAATGTTATAAGCAAGtt > 2:364767/1‑140 (MQ=255) ttAATGACAACCTTTTACGAGAAAAAGCGGAAATTGCTTCGACAATAATTAAATTTTTAGAGGCCAGGATAACCAATCTTTCATACAATGACATATTAAAATATCAGCAAGAATTCCAAAGACAATGTTATAAGCAAGtt > 2:213528/1‑140 (MQ=255) tAATGACAACCTTTTACGAGAAAAAGCGGAAATTGCTTCGACAATAATTAAATTTTTAGAGGCCAGGATAACCAATCTTTCATACAATGACATATTAAAATATCAGCAGGAATTCCAAAGACAATGTTATAAGCAAGTTa > 2:737502/1‑140 (MQ=255) tAATGACAACCTTTTACGAGAAAAAGCGGAAATTGCTTCGACAATAATTAAATTTTTAGAGGCCAGGATAACCAATCTTTCATACAATGACATATTAAAATATCAGCAAGAATTCCAAAGACAATGTTATAAGCAAGTTa > 2:162052/1‑140 (MQ=255) tAATGACAACCTTTTACGAGAAAAAGCGGAAATTGCTTCGACAATAATTAAATTTTTAGAGGCCAGGATAACCAATCTTTCATACAATGACATATTAAAATATCAGCAAGAATTCCAAAGACAATGTTATAAGCAAGTTa > 2:608164/1‑140 (MQ=255) tAATGACAACCTTTTACGAGAAAAAGCGGAAATTGCTTCGACAATAATTAAATTTTTAGAGGCCAGGATAACCAATCTTTCATACAATGACATATTAAAATATCAGCAAGAATTCCAAAGACAATGTTATAAGCAAGTTa > 2:608452/1‑140 (MQ=255) tAATGACAACCTTTTACGAGAAAAAGCGGAAATTGCTTCGACAATAATTAAATTTTTAGAGGCCAGGATAACCAATCTTTCATACAATGACATATTAAAATATCAGCAAGAATTCCAAAGACAATGTTATAAGCAAGTTa > 2:1009564/1‑140 (MQ=255) tAATGACAACCTTTTACGAGAAAAAGCGGAAATTGCTTCGACAATAATTAAATTTTTAGAGGCCAGGATAACCAATCTTTCATACAATGACATATTAAAATATCAGCAAGAATTCCAAAGACAATGTTATAAGCAAGTTa > 1:939819/1‑140 (MQ=255) aaTGACAACCTTTTACGAGAAAAAGCGGAAATTGCTTCGACAATAATTAAATTTTTAGAGGCCAGGATAACCAATCTTTCATACAATGACATATTAAAATATCAGCAAGAATTCCAAAGACAATGTTATAAGCAAGTTaa > 2:1085271/1‑140 (MQ=255) aTGACAACCTTTTACGAGAAAAAGCGGAAATTGCTTCGACAATAATTAAATTTTTAGAGGCCAGGATAACCAATCTTTCATACAATGACATATTAAAATATCAGCAAGAATTCCAAAGACAATGTTATAAGCAAGTTaaa < 2:1171437/140‑1 (MQ=255) aTGACAACCTTTTACGAGAAAAAGCGGAAATTGCTTCGACAATAATTAAATTTTTAGAGGCCAGGATAACCAATCTTTCATACAATGACATATTAAAATATCAGCAAGAATTCCAAAGACAATGTTATAAGCAAGTTaaa > 1:684436/1‑140 (MQ=255) aaCCTTTTACGAGAAAAAGCGGAAATTGCTTCGACAATAATTAAATTTTTAGAGGCCAGGATAACCAATCTTTCATACAATGACATATTAAAATATCAGCAAGAATTCCAAAGACAATGTTATAAGCTAGTTAAAGCCtt > 1:112117/1‑140 (MQ=255) aaCCTTTTACGAGAAAAAGCGGAAATTGCTTCGACAATAATTAAATTTTTAGAGGCCAGGATAACCAATCTTTCATACAATGACATATTAAAATATCAGCAAGAATTCCAAAGACAATGTTATAAGCAAGTTAAAGCCtt > 2:28605/1‑140 (MQ=255) aaCCTTTTACGAGAAAAAGCGGAAATTGCTTCGACAATAATTAAATTTTTAGAGGCCAGGATAACCAATCTTTCATACAATGACATATTAAAATATCAGCAAGAATTCCAAAGACAATGTTATAAGCAAGTTAAAGCCtt > 2:891089/1‑140 (MQ=255) aCCTTTTACGAGAAAAAGCGGAAATTGCTTCGACAATAATTAAATTTTTAGAGGCCAGGATAACCAATCTTTCATACAATGACATATTAAAATATCAGCAAGAATTCCAAAGACAATGTTATAAGCAAGTTAAAGCCttt > 1:1153931/1‑140 (MQ=255) ccTTTTACGAGAAAAAGCGGAAATTGCTTCGACAATAATTAAATTTTTAGAGGCCAGGATAACCAATCTTTCATACAATGACATATTAAAATATCAGCAAGAATTCCAAAGACAATGTTATAAGCAAGTTAAAGCCTTTa < 2:351927/140‑1 (MQ=255) ccTTTTACGAGAAAAAGCGGAAATTGCTTCGACAATAATTAAATTTTTAGAGGCCAGGATAACCAATCTTTCATACAATGACATATTAAAATATCAGCAAGAATTCCAAAGACAATGTTATAAGCAAGTTAAAGCCTTTa < 2:877252/140‑1 (MQ=255) ccTTTTACGAGAAAAAGCGGAAATTGCTTCGACAATAATTAAATTTTTAGAGGCCAGGATAACCAATCTTTCATACAATGACATATTAAAATATCAGCAAGAATTCCAAAGACAATGTTATAAGCAAGTTAAAGCCTTTa > 2:1020482/1‑140 (MQ=255) tttACGAGAAAAAGCGGAAATTGCTTCGACAATAATTAAATTTTTAGAGGCCAGGATAACCAATCTTTCATACAATGACATATTAAAATATCAGCAAGAATTCCAAAGACAATGTTATAAGCAAGTTAAAGCCTTTACGa < 1:788183/140‑1 (MQ=255) ttACGAGAAAAAGCGGAAATTGCTTCGACAATAATTAAATTTTTAGAGGCCAGGATAACCAATCTTTCATACAATGACATATTAAAATATCAGCAAGAATTCCAAAGACAATGTTATAAGCAAGTTAAAGCCTTTACGac < 1:28605/140‑1 (MQ=255) ttACGAGAAAAAGCGGAAATTGCTTCGACAATAATTAAATTTTTAGAGGCCAGGATAACCAATCTTTCATACAATGACATATTAAAATATCAGCAAGAATTCCAAAGACAATGTTATAAGCAAGTTAAAGCCTTTACGac > 1:1074870/1‑140 (MQ=255) ttACGAGAAAAAGCGGAAATTGCTTCGACAATAATTAAATTTTTAGAGGCCAGGATAACCAATCTTTCATACAATGACATATTAAAATATCAGCAAGAATTCCAAAGACAATGTTATAAGCAAGTTAAAGCCTTTACGac < 1:1009564/140‑1 (MQ=255) tACGAGAAAAAGCGGAAATTGCTTCGACAATAATTAAATTTTTAGAGGCCAGGATAACCAATCTTTCATACAATGACATATTAAAATATCAGCAAGAATTCCAAAGACAATGTTATAAGCAAGTTAAAGCCTTTACGaca < 1:797105/140‑1 (MQ=255) aCGAGAAAAAGCGGAAATTGCTTCGACAATAATTAAATTTTTAGAGGCCAGGATAACCAATCTTTCATACAATGACATATTAAAATATCAGCAAGAATTCCAAAGACAATGTTATAAGCAAGTTAAAGCCTTTACGacac < 1:891089/140‑1 (MQ=255) | ACCTTCCTTAGGTGACACTATTTTTTTACATAAAGAACACCCTACCCCCAAATTATATAAAGATGGACAATATCTTGACAAACAAATCGAAGGTTTATTTTCAACATTATTAACCATTAATGACAACCTTTTACGAGCAAAAGCGGAAATTGCTTCGACAATAATTAAATTTTTAGAGGCCAGGATAACCAATCTTTCATACAATGACATATTAAAATATCAGCAAGAATTCCAAAGACAATGTTATAAGCAAGTTAAAGCCTTTACGACAC > NC_000913/3653224‑3653495 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |