Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 4,547,373 | C→A | L760M (CTG→ATG) | fimD → | type I fimbriae usher protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 4,547,373 | 0 | C | A | 95.5% | 302.9 / 7.1 | 89 | L760M (CTG→ATG) | fimD | type I fimbriae usher protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (2/2); new base A (33/52); total (35/54) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.44e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.99e-01 |
AACGATACGGTGGTGCTTGTTAAAGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACT‑GAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGCTGGATACCAATACCCTGGCTGATAACGTCGATTTAGATAACGCGGTTGCTAACGTTGTTCCCACTCGTGGGGCGATCGTGCGAGCAGAGTTTAAAGCGCGCGTTGGGATAAAACTGCTCATGACGCTGACCCAC > NC_000913/4547238‑4547507 | aaCGATACGGTGGTGCTTGTTAAGGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACT‑GAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGATGGa < 2:923037/140‑1 (MQ=255) aaCGATACGGTGGTGCTTGTTAAAGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACT‑GAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGATGGa < 1:958428/140‑1 (MQ=255) aaCGATACGGTGGTGCTTGTTAAAGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACT‑GAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGATGGa < 2:118062/140‑1 (MQ=255) aaCGATACGGTGGTGCTTGTTAAAGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACT‑GAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGATGGa < 2:418833/140‑1 (MQ=255) aaCGATACGGTGGTGCTTGTTAAAGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACT‑GAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGATGGa < 1:23144/140‑1 (MQ=255) aaCGATACGGTGGTGCTTGTTAAAGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACT‑GAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGATGGa < 2:606695/140‑1 (MQ=255) aaCGATACGGTGGTGCTTGTTAAAGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACT‑GAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGATGGa < 1:1203439/140‑1 (MQ=255) aTACGGTGGTGCTTGTTAAAGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACT‑GAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGATGGATAcc > 1:920508/1‑140 (MQ=255) aCGGTGGTGCTTGTTAAAGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACT‑GAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGATGTATACCaa > 1:60822/1‑140 (MQ=255) cGGTGGTGCTTGTTAAAGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACT‑GAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGATGGATACCAAt > 2:242007/1‑140 (MQ=255) tggtgCTTGTTAAAGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCTCT‑GAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGATGGATACCAATGcc < 1:1113958/140‑1 (MQ=255) tggtgCTTGTTAAAGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACT‑GAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGATGGATACCAATAcc > 2:654794/1‑140 (MQ=255) tggtgCTTGTTAAAGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACT‑GAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGATGGATACCAATAcc < 1:467298/140‑1 (MQ=255) tggtgCTTGTTAAAGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACT‑GAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGATGGATACCAATAcc < 1:31761/140‑1 (MQ=255) gtgCTTGTTAAAGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACT‑GAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGATGGATACCAATACCCt > 1:676466/1‑140 (MQ=255) gtgCTTGTTAAAGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACT‑GAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGATGGATACCAATACCCt > 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cgcAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACT‑GAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGATGGATACCAATACCCTGGCTGATAACGTCGATTTAg > 2:182616/1‑140 (MQ=255) cgcAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACT‑GAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGATGGATACCAATACCCTGGCTGATAACGTCGATTTAg > 2:1236067/1‑140 (MQ=255) aTGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACT‑GAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGATGGATACCAATACCCTGGCTGATAACGTCGATTTAGATAAcgcg < 2:1005195/140‑1 (MQ=255) aaGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACT‑GAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGATGGATACCAATACCCTGGCTGATAACGTCGATTTAGATAACGCGGTTGCt < 2:330653/140‑1 (MQ=255) cGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACT‑GAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGATGGATACCAATTCCCTGGCTGATAACGTCGATTTAGATAACGCGGTTGCTAACg < 2:533100/140‑1 (MQ=255) cGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACT‑GAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGATGGATACCAATACCCTGGCTGATAACGTCGATTTAGATAACGCGGTTGCTAACg < 1:301198/140‑1 (MQ=255) cAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACT‑GAATTTCGGGAAAATAGAGTGGCGATGGATACCAATACCCTGGCTGATAACGTCGATTTAGATAACGCGGTTGCTAACGTTGTTcc < 1:1021934/140‑1 (MQ=255) cAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACT‑GAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGATGGATACCAATACCCTGGCTGATAACGTCGATTTAGATAACGCGGTTGCTAACGTTGTTcc < 1:999729/140‑1 (MQ=255) cAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACT‑GAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGATGGATACCAATACCCTGGCTGATAACGTCGATTTAGATAACGCGGTTGCTAACGTTGTTcc < 2:676466/140‑1 (MQ=255) cAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACT‑GAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGATGGATACCAATACCCTGGCTGATAACGTCGATTTAGATAACGCGGTTGCTAACGTTGTTcc < 1:527611/140‑1 (MQ=255) cAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACT‑GAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGATGGATACCAATACCCTGGCTGATAACGTCGATTTAGATAACGCGGTTGCTAACGTTGTTcc < 1:222170/140‑1 (MQ=255) cAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACT‑GAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGATGGATACCAATACCCTGGCTGATAACGTCGATTTAGATAACGCGGTTGCTAACGTTGTTcc < 1:1269294/140‑1 (MQ=255) ggTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACT‑GAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGATGGATACCAATACCCTGGCTGATAACGTCGATTTAGATAACGCGGTTGCTAACGTTGTTCCCACTCGTg < 1:1007848/140‑1 (MQ=255) gTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACT‑GAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGATGGATACCAATACCCTGGCTGATAACGTCGATTTAGATAACGCGGTTGCTAACGTTGTTCCCACTCGTGGGGCg < 1:888636/140‑1 (MQ=255) aCCGACTGGCGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACT‑GAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGATGGATACCAATACCCTGGCTGATAACGTCGATTTAGATAACGCGGTTGCTAACGTTGTTCCCACTCGTGGGGCGAt > 2:620614/1‑140 (MQ=255) aCCGACTGGCGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACT‑GAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGATGGATACCAATACCCTGGCTGATAACGTCGATTTAGATAACGCGGTTGCTAACGTTGTTCCCACTCGTGGGGCGAt < 2:1279992/140‑1 (MQ=255) cGACTGGCGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACT‑GAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGATGGATACCAATACCCTGGCTGATAACGTCGATTTAGATAACGCGGTTGCTAACGTTGTTCCCACTCGTGGGGCGATCg > 2:1167173/1‑140 (MQ=255) cGACTGGCGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACT‑GAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGATGGATACCAATACCCTGGCTGATAACGTCGATTTAGATAACGCGGTTGCTAACGTTGTTCCCACTCGTGGGGCGATCg > 2:201413/1‑140 (MQ=255) cGACTGGCGTGGTTATGCCGCGCTGCCCTATGCCACT‑GAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGATGGATACCAATACCCTGACTGATAACGCCGATTTAGATAACGCTGATGCTAAAGATGATCCCACTCGGGGGGCGATCg > 2:216024/1‑140 (MQ=255) gACTGGCGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACT‑GAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGATGGATACCAATACCCTGGCTGATAACGTCGATTTAGATAACGCGGTTGCTAACGTTGTTCCCACTCGTGGGGCGATCGt < 2:469776/140‑1 (MQ=255) aCTGGCGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACT‑GAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGATGGATACCAATACCCTGGCTGATAACGTCGATTTAGATAACGCGGTTGCTAACGTTGTTCCCACTCGTGGGGCGATCGTg > 2:1000769/1‑140 (MQ=255) aCTGGCGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACT‑GAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGATGGATACCAATACCCTGGCTGATAACGTCGATTTAGATAACGCGGTTGCTAACGTTGTTCCCACTCGTGGGGCGATCGTg > 1:205747/1‑140 (MQ=255) aCTGGCGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACT‑GAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGATGGATACCAATACCCTGGCTGATAACGTCGATTTAGATAACGCGGTTGCTAACGTTGTTCCCACTCGTGGGGCGATCGTg > 2:1113363/1‑140 (MQ=255) ggCGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACT‑GAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGATGTATACCAATACCCTGGCTGATAACGTCGATTTAGATAACGCGGTTGCTAACGTTGTTCCCACTCGTGGGGCGATCGTGCGa < 2:60822/140‑1 (MQ=255) cGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACT‑GAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGATGGATACCAATACCCTGGCTGATAACGTCGATTTAGATAACGCGGTTGCTAACGTTGTTCCCACTCGTGGGGCGATCGTGCGAGc < 2:490708/140‑1 (MQ=255) tGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACT‑GAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGATGGATACCAATACCCTGGCTGATAACGTCGATTTAGATAACGCGGTTGCTAACGTTGTTCCCACTCGTGGGGCGATCGTGCGAGCag < 1:344451/140‑1 (MQ=255) tgctgcCTTATGCCACT‑GAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGATGGATACCAATACCCTGGCTGATAACGTCGATTTAGATAACGCGGTTGCTAACGTTGTTCCCACTCGTGGGGCGATCGTGCGAGCAGAGTTTAAAgcg > 2:555518/1‑140 (MQ=255) tgctgcCTTATGCCACT‑GAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGATGGATACCAATACCCTGGCTGATAACGTCGATTTAGATAACGCGGTTGCTAACGTTGTTCCCACTCGTGGGGCGATCGTGCGAGCAGAGTTTAAAgcg > 2:404721/1‑140 (MQ=255) gctgcCTTATGCCACT‑GAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGATGGATACCAATACCCTGGCTGATAACGTCGATTTAGATAACGCGGTTGCTAACGTTGTTCCCACTCGTGGGGCGATCGTGCGAGCAGAGTTTAAAgcgc > 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ccTTATGCCACT‑GAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGATGGATACCAATACCCTGGCTGATAACGTCGATTTAGATAACGCGGTTGCTAACGTTGTTCCCACTCGTGGGGCGATCGTGCGAGCAGAGTTTAAAGCGCGCGt < 2:345091/140‑1 (MQ=255) ttATGCCACT‑GAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGATGGATACCAATACCCTGGCTGATAACGTCGATTTAGATAACGCGGTTGCTAACGTTGTTCCCACTCGTGGGGCGATCGTGCGAGCAGAGTTTAAAGCGCGCGTTg > 1:1169368/1‑140 (MQ=255) tGCCACT‑GAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGATGGATACCAATACCCTGGCTGATAACGTCGATTTAGATAACGCGGTTGCTAACGTTGTTCCCACTCGTGGGGCGATCGTGCGAGCAGAGTTTAAAGCGCGCGTTGGGa < 2:396874/140‑1 (MQ=255) tGCCACT‑GAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGATGGATACCAATACCCTGGCTGATAACGTCGATTTAGATAACGCGGTTGCTAACGTTGTTCCCACTCGTGGGGCGATCGTGCGAGCAGAGTTTAAAGCGCGCGTTGGGa < 1:242007/140‑1 (MQ=255) ccACT‑GAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGATGG‑TACCAATACCCTGGCTGATAACGTCGATTTAGATAACGCGGTTGCTAACGTTGTTCCCACTCGTGGGGCGATCGTGCGAGCAGAGTTTAAAGCGCGCGTTGGGATaa < 1:1250346/140‑1 (MQ=255) cT‑GAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGATGGATACCAATACCCTGGCTGATAACGTCGATTTAGATAACGCGGTTGCTAACGTTGTTCCCACTCGTGGGGCGATCGTGCGAGCAGAGTTTAAAGCGCGCGTTGGGATaaaa < 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tatCGGGAAAATAGAGTGGCGATGGATACCAATACCCTGGCTGATAACGTCGATTTAGATAACGCGGTTGCTAACGTTGTTCCCACTCGTGGGGCGATCGTGCGAGCAGAGTTTAAAGCGCGCGTTGGGATAAAACTGCt > 1:785978/1‑140 (MQ=255) tatCGGGAAAATAGAGTGGCGATGGATACCAATACCCTGGCTGATAACGTCGATTTAGATAACGCGGTTGCTAACGTTGTTCCCACTCGTGGGGCGATCGTGCGAGCAGAGTTTAAAGCGCGCGTTGGGATAAAACTGCt > 2:563500/1‑140 (MQ=255) tCGGGAAAATAGAGTGGCGATGGATACCAATACCCTGGCTGATAACGTCGATTTAGATAACGCGGTTGCTAACGTTGTTCCCACTCGTGGGGCGATCGTGCGAGCAGAGTTTAAAGCGCGCGTTGGGATAAAACTGCTCa < 2:716936/140‑1 (MQ=255) tCGGGAAAATAGAGTGGCGATGGATACCAATACCCTGGCTGATAACGTCGATTTAGATAACGCGGTTGCTAACGTTGTTCCCACTCGTGGGGCGATCGTGCGAGCAGAGTTTAAAGCGCGCGTTGGGATAAAACTGCTCa > 1:97872/1‑140 (MQ=255) aaaTAGAGTGGCGATGGATACCAATACCCTGGCTGATAACGTCGATTTAGATAACGCGGTTGCTAACGTTGTTCCCACTCGTGGGGCGATCGTGCGAGCAGAGTTTAAAGCGCGCGTTGGGATAAAACTGCTCATGACGc > 1:36625/1‑140 (MQ=255) aaTAGAGTGGCGATGGATACCAATACCCTGGCTGATAACGTCGATTTAGATAACGCGGTTGCTAACGTTGTTCCCACTCGTGGGGCGATCGTGCGAGCAGAGTTTAAAGCGCGCGTTGGGATAAAACTGCTCATGACGCt < 1:182616/140‑1 (MQ=255) aTAGAGTGGCGATGGATACCAATACCCTGGCTGATAACGTCGATTTAGATAACGCGGTTGCTAACGTTGTTCCCACTCGTGGGGCGATCGTGCGAGCAGAGTTTAAAGCGCGCGTTGGGATAAAACTGCTCATGACGCTg < 2:221210/140‑1 (MQ=255) tAGAGTGGCGATGGATACCAATACCCTGGCTGATAACGTCGATTTAGATAACGCGGTTGCTAACGTTGTTCCCACTCGTGGGGCGATCGTGCGAGCAGAGTTTAAAGCGCGCGTTGGGATAAAACTGCTCATGACGCTGa < 2:413822/140‑1 (MQ=255) gagTGGCGATGGATACCAATACCCTGGCTGATATCGTCGATTTAGATAACGCGGTTGCTAACGTTGTTCCCACTCGTGGGGCGATCGTGCGAGCAGAGTTTAAAGCGCGCGTTGGGATAAAACTGCTCATGACGCTGAcc < 2:1314677/140‑1 (MQ=255) gagTGGCGATGGATACCAATACCCTGGCTGATAACGTCGATTTAGATAACGCGGTTGCTAACGTTGTTCCCACTCGTGGGGCGATCGTGCGAGCAGAGTTTAAAGCGCGCGTTGGGATAAAACTGCTCATGACGCTGAcc < 1:1236067/140‑1 (MQ=255) gagTGGCGATGGATACCAATACCCTGGCTGATAACGTCGATTTAGATAACGCGGTTGCTAACGTTGTTCCCACTCGTGGGGCGATCGTGCGAGCAGAGTTTAAAGCGCGCGTTGGGATAAAACTGCTCATGACGCTGAcc < 1:788200/140‑1 (MQ=255) gagTGGCGATGGATACCAATACCCTGGCTGATAACGTCGATTTAGATAACGCGGTTGCTAACGTTGTTCCCACTCGTGGGGCGATCGTGCGAGCAGAGTTTAAAGCGCGCGTTGGGATAAAACTGCTCATGACGCTGAcc < 2:1093280/140‑1 (MQ=255) gagTGGCGATGGATACCAATACCCTGGCTGATAACGTCGATTTAGATAACGCGGTTGCTAACGTTGTTCCCACTCGTGGGGCGATCGTGCGAGCAGAGTTTAAAGCGCGCGTTGGGATAAAACTGCTCATGACGCTGAcc < 1:1000769/140‑1 (MQ=255) gTGGCGATGGATACCAATACCCTGGCTGATAACGTCGATTTAGATAACGCGGTTGCTAACGTTGTTCCCACTCGTGGGGCGATCGTGCGAGCAGAGTTTAAAGCGCGCGTTGGGATAAAACTGCTCATGACGCTGACCca < 2:920508/140‑1 (MQ=255) tGGCGCTGGATACCAATACCCTGGCTGATAACGTCGATTTAGATAACGCGGTTGCTAACGTTGTTCCCACTCGTGGGGCGATCGTGCGAGCAGAGTTTAAAGCGCGCGTTGGGATAAAACTGCTCATGACGCTGACCcac < 1:1106616/140‑1 (MQ=255) tGGCGATGGATACCAATACCCTGGCTGATAACGTCGATTTAGATAACGCGGTTGCTAACGTTGTTCCCACTCGTGGGGCGATCGTGCGAGCAGAGTTTAAAGCGCGCGTTGGGATAAAACTGCTCATGACGCTGACCcac > 2:587376/1‑140 (MQ=255) tGGCGATGGATACCAATACCCTGGCTGATAACGTCGATTTAGATAACGCGGTTGCTAACGTTGTTCCCACTCGTGGGGCGATCGTGCGAGCAGAGTTTAAAGCGCGCGTTGGGATAAAACTGCTCATGACGCTGACCcac < 2:176649/140‑1 (MQ=255) tGGCGATGGATACCAATACCCTGGCTGATAACGTCGATTTAGATAACGCGGTTGCTAACGTTGTTCCCACTCGTGGGGCGATCGTGCGAGCAGAGTTTAAAGCGCGCGTTGGGATAAAACTGCTCATGACGCTGACCca < 1:973456/139‑1 (MQ=255) tGGCGATGGATACCAATACCCTGGCTGATAACGTCGATTTAGATAACGCGGTTGCTAACGTTGTTCCCACTCGTGGGGCGATCGTGCGAGCAGAGTTTAAAGCGCGCGTTGGGATAAAACTGCTCATGACGCTGACCca > 2:973456/1‑139 (MQ=255) | AACGATACGGTGGTGCTTGTTAAAGCGCCTGGCGCAAAAGATGCAAAAGTCGAAAACCAGACGGGGGTGCGTACCGACTGGCGTGGTTATGCCGTGCTGCCTTATGCCACT‑GAATATCGGGAAAATAGAGTGGCGCTGGATACCAATACCCTGGCTGATAACGTCGATTTAGATAACGCGGTTGCTAACGTTGTTCCCACTCGTGGGGCGATCGTGCGAGCAGAGTTTAAAGCGCGCGTTGGGATAAAACTGCTCATGACGCTGACCCAC > NC_000913/4547238‑4547507 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |