| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,159,226 | C→A | P246Q (CCG→CAG) | oxyR → | DNA‑binding transcriptional dual regulator OxyR |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,159,226 | 0 | C | A | 99.3% | 525.9 / ‑3.3 | 150 | P246Q (CCG→CAG) | oxyR | DNA‑binding transcriptional dual regulator OxyR |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base A (65/84); total (66/84) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.40e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.67e-01 | |||||||||||
Only 100 of 156 total aligned reads displayed.
CGCGATCAGGCAATGGGTTTCTGTTTTGAAGCCGGGGCGGATGAAGATACACACTTCCGCGCGACCAGCCTGGAAACTCTGCGCAACATGGTGGCGGCAGGTAGCGGGATCACTTTACTGCCAGCGCTGGCTGTGCCGCCGGAG‑CGCAAACGCGATGGGGTTGTTTATCTGCCGTGCATTAAGCCGGAACCACGCCGCACTATTGGCCTGGTTTATCGTCCTGGCTCACCGCTGCGCAGCCGCTATGAGCAGCTGGCAGAGGCCATCCGCGCA > NC_000913/4159090‑4159362 | cgcgATCAGGCAATGGGTTTCTGTTTTGAAGCCGGGGCGGATGAAGATACACACTTCCGCGCGACCAGCCTGGAAACTCTGCGCAACATGGTGGCGGCAGGTAGCGGGATCACTTTACTGCCAGCGCTGGCTGTgcagcc > 1:1522062/1‑140 (MQ=255) aTCAGGCAATGGGTTTCTGTTTTGAAGCCGGGGCGGATGAAGATACACACTTCCGCGCGACCAGCCTGGAAACTCTGCGCAACATGGTGGCGGCAGGTAGCGGGATCACTTTACTGCCAGCGCTGGCTGTGCAGCCGGAg > 2:1963354/1‑140 (MQ=255) aTCAGGCAATGGGTTTCTGTTTTGAAGCCGGGGCGGATGAAGATACACACTTCCGCGCGACCAGCCTGGAAACTCTGCGCAACATGGTGGCGGCAGGTAGCGGGATCACTTTACTGCCAGCGCTGGCTGTGCAGCCGGAg > 1:2714761/1‑140 (MQ=255) gCAATGGGTTTCTGTTTTGAAGCCGGGGCGGATGAAGATACACACTTCCGCGCGACCAGCCTGGAAACTCTGCGCAACATGGTGGCGGCAGGTAGCGGGATCACTTTACTGCCAGCGCTGGCTGTGCAGCCGGAG‑CGCaa < 1:1803996/140‑1 (MQ=255) cAATGGGTTTCTGTTTTGAAGCCGGGGCGGATGAAGATACACACTTCCGCGCGACCAGCCTGGAAACTCTGCGCAACATGGTGGCGGCAGGTAGCGGGATCTCTTTACTGCCAGCGCTGGCTGTGCAGCCGGAG‑CGCaaa < 1:293125/140‑1 (MQ=255) aTGGGTTTCTGTTTTGAAGCCGGGGCGGATGAAGATACACACTTCCGCGCGACCAGCCTGGAAACTCTGCGCAACATGGTGGCGGCAGGTAGCGGGATCACTTTACTGCCAGCGCTGGCTGTGCAGCCGGAG‑CGCAAAcg < 1:2534273/140‑1 (MQ=255) ggTTTCTGTTTTGAAGCCGGGGCGGATGAAGATACACACTTCCGCGCGACCAGCCTGGAAACTCTGCGCAACATGGTGGCGGCAGGTAGCGGGATCACTTTACTGCCAGCGCTGGCTGTGCAGCCGGAG‑CGCAAACGCGa > 2:166067/1‑140 (MQ=255) ggTTTCTGTTTTGAAGCCGGGGCGGATGAAGATACACACTTCCGCGCGACCAGCCTGGAAACTCTGCGCAACATGGTGGCGGCAGGTAGCGGGATCACTTTACTGCCAGCGCTGGCTGTGCAGCCGGAG‑CGCAAACGCGa < 2:359545/140‑1 (MQ=255) ggTTTCTGTTTTGAAGCCGGGGCGGATGAAGATACACACTTCCGCGCGACCAGCCTGGAAACTCTGCGCAACATGGTGGCGGCAGGTAGCGGGATCACTTTACTGCCAGCGCTGGCTGTGCAGCCGGAG‑CGCAAACGCGa > 2:2590818/1‑140 (MQ=255) ggTTTCTGTTTTGAAGCCGGGGCGGATGAAGATACACACTTCCGCGCGACCAGCCTGGAAACTCTGCGCAACATGGTGGCGGCAGGTAGCGGGATCACTTTACTGCCAGCGCTGGCTGTGCAGCCGGAG‑CGCAAACGCGa < 2:1522062/140‑1 (MQ=255) ggTTTCTGTTTTGAAGCCGGGGCGGATGAAGATACACACTTCCGCGCGACCAGCCTGGAAACTCTGCGCAACATGGTGGCGGCAGGTAGCGGGATCACTTTACTGCCAGCGCTGGCTGTGCAGCCGGAG‑CGCAAACGCGa < 2:2592868/140‑1 (MQ=255) gTTTCTGTTTTGAAGCCGGGGCGGATGAAGATACACACTTCCGCGCGACCAGCCTGGAAACTCTGCGCAACATGGTGGCGGCAGGTAGCGGGATCACTTTACTGCCGGCGCTGGCTGTGCAGCCGGAG‑CGCAAACGCGAt < 2:1338125/140‑1 (MQ=255) tttCTGTTTTGAAGCCGGGGCGGATGAAGATACACACTTCCGCGCGACCAGCCTGGAAACTCTGCGCAACATGGTGGCGGCAGGTAGCGGGATCACTTTACTGCCAGCGCTGGCTGTGCAGCCGGAG‑CGCAAACGCGATg > 2:1485895/1‑140 (MQ=255) ttCTGTTTTGAAGCCGGGGCGGATGAAGATACACACTTCCGCGCGACCAGCCTGGAAACTCTGCGCAACATGGTGGCGGCAGGTAGCGGGATCACTTTACTGCCAGCGCTGGCTGTGCAGCCGGAG‑CGCAAACGCGATgg < 1:1288068/140‑1 (MQ=255) ttCTGTTTTGAAGCCGGGGCGGATGAAGATACACACTTCCGCGCGACCAGCCTGGAAACTCTGCGCAACATGGTGGCGGCAGGTAGCGGGATCACTTTACTGCCAGCGCTGGCTGTGCAGCCGGAG‑CGCAAACGCGATgg < 2:2867165/140‑1 (MQ=255) tCTGTTTTGAAGCCGGGGCGGATGAAGATACACACTTCCGCGCGACCAGCCTGGAAACTCTGCGCAACATGGTGGCGGCAGGTAGCGGGATCACTTTACTGCCAGCGCTGGCTGTGCAGCCGGAG‑CGCAAACGCGATggg > 1:1498357/1‑140 (MQ=255) tCTGTTTTGAAGCCGGGGCGGATGAAGATACACACTTCCGCGCGACCAGCCTGGAAACTCTGCGCAACATGGTGGCGGCAGGTAGCGGGATCACTTTACTGCCAGCGCTGGCTGTGCAGCCGGAG‑CGCAAACGCGATggg > 2:224178/1‑140 (MQ=255) tCTGTTTTGAAGCCGGGGCGGATGAAGATACACACTTCCGCGCGACCAGCCTGGAAACTCTGCGCAACATGGTGGCGGCAGGTAGCGGGATCACTTTACTGCCAGCGCTGGCTGTGCAGCCGGAG‑CGCAAACGCGATggg > 2:531766/1‑140 (MQ=255) tGTTTTGAAGCCGGGGCGGATGAAGATACACACTTCCGCGCGACCAGCCTGGAAACTCTGCGCAACATGGTGGCGGCAGGTAGCGGGATCACTTTACTGCCAGCGCTGGCTGTGCAGCCGGAG‑CGCAAACGCGATGGGgt < 1:2634968/140‑1 (MQ=255) tGTTTTGAAGCCGGGGCGGATGAAGATACACACTTCCGCGCGACCAGCCTGGAAACTCTGCGCAACATGGTGGCGGCAGGTAGCGGGATCACTTTACTGCCAGCGCTGGCTGTGCAGCCGGAG‑CGCAAACGCGATGGGgt < 1:127090/140‑1 (MQ=255) ttGAAGCCGGGGCGGATGAAGATACACACTTCCGCGCGACCAGCCTGGAAACTCTGCGCAACATGGTGGCGGCAGGTAGCGGGATCACTTTACTGCCAGCGCTGGCTGTGCAGCCGGAG‑CGCAAACGCGa < 1:1218393/130‑1 (MQ=255) ttGAAGCCGGGGCGGATGAAGATACACACTTCCGCGCGACCAGCCTGGAAACTCTGCGCAACATGGTGGCGGCAGGTAGCGGGATCACTTTACTGCCAGCGCTGGCTGTGCAGCCGGAG‑CGCAAACGCGATGGGgttgtt > 2:1503446/1‑140 (MQ=255) tGAAGCCGGGGCGGATGAAGATACACACTTCCGCGCGACCAGCCTGGAAACTCTGCGCAACATGGTGGCGGCAGGTAGCGGGATCACTTTACTGCCAGCGCTGGCTGTGCAGCCGGAG‑CGCAAACGCGATGGGGTTGttt < 2:2714761/140‑1 (MQ=255) aaGCCGGGGCGGATGAAGATACACACTTCCGCGCGACCAGCCTGGAAACTCTGCGCAACATGGTGGCGGCAGGTAGCGGGATCACTTTACTGCCAGCGCTGGCTGTGCAGCCGGAG‑CGCAAACGCGATGGGGTTGTTTAt < 1:531766/140‑1 (MQ=255) ggggCGGATGAAGATACACACTTCCGCGCGACCAGCCTGGAAACTCTGCGCAACATGGTGGCGGCAGGTAGCGGGATCACTTTACTGCCAGCGCTGGCTGTGCAGCCGGAG‑CGCAAACGCGATGGGGTTGTTTATCTGcc < 1:219123/140‑1 (MQ=255) ggggCGGATGAAGATACACACTTCCGCGCGACCAGCCTGGAAACTCTGCGCAACATGGTGGCGGCAGGTAGCGGGATCACTTTACTGCCAGCGCTGGCTGTGCAGCCGGAG‑CGCAAACGCGATGGGGTTGTTTATCTGcc < 1:2243931/140‑1 (MQ=255) ggggCGGATGAAGATACACACTTCCGCGCGACCAGCCTGGAAACTCTGCGCAACATGGTGGCGGCAGGTAGCGGGATCACTTTACTGCCAGCGCTGGCTGTGCAGCCGGAG‑CGCAAACGCGATGGGGTTGTTTATCTGcc < 1:1509706/140‑1 (MQ=255) ggggCAGATGAAGATACACACTTCCGCGCGACCAGCCTGGAAACTCTGCGCAACATGGTGGCGGCAGGTAGCGGGATCACTTTACTGCCAGCGCTGGCTGTGCAGCCGGAG‑CGCAAACGCGATGGGGTTGTTTATCTGcc > 1:724845/1‑140 (MQ=255) ggCGGATGAAGATACACACTTCCGCGCGACCAGCCTGGAAACTCTGCGCAACATGGTGGCGGCAGGTAGCGGGATCACTTTACTGCCAGCGCTGGCTGTGCAGCCGGAG‑CGCAAACGCGATGGGGTTGTTTATCTGCCGt > 2:1561912/1‑140 (MQ=255) gATGAAGATACACACTTCCGCGCGACCAGCCTGGAAACTCTGCGCAACATGGTGGCGGCAGGTAGCGGGATCACTTTACTGCCAGCTCTGGCTGTGCAGCCGGAG‑CGCAAACGCGATGGGGTTGTTTATCTGCCGTGCAt < 1:2821877/140‑1 (MQ=255) gATGAAGATACACACTTCCGCGCGACCAGCCTGGAAACTCTGCGCAACATGGTGGCGGCAGGTAGCGGGATCACTTTACTGCCAGCGCTGGCTGTGCAGCCGGAG‑CGCAAACGCGATGGGGTTGTTTATCTGCCGTGCAt < 2:2166769/140‑1 (MQ=255) gATGAAGATACACACTTCCGCGCGACCAGCCTGGAAACTCTGCGCAACATGGTGGCGGCAGGTAGCGGGATCACTTTACTGCCAGCGCTGGCTGTGCAGCCGGAG‑CGCAAACGCGATGGGGTTGTTTATCTGCCGTGCAt < 2:2789459/140‑1 (MQ=255) acacTTCCGCGCGACCAGCCTGGAAACTCTGCGCAACATGGTGGCGGCAGGTAGCGGGATCACTTTACTGCCAGCGCTGGCTGTGCAGCCGGAG‑CGCAAACGCGATGGGGTTGTTTATCTGCCGTGCAt > 1:1020940/1‑129 (MQ=255) acTTCCGCGCGACCAGCCTGGAAACTCTGCGCAACATGGTGGCGGCAGGCAGCGGGATCACTTTACTGCCAGCGCTGGCTGTGCAGCCGGAG‑CGCAAACGCGATGGGGTTGGTTATCTGCCGTGCATTAAGCCGGAACCa > 2:1203261/1‑140 (MQ=255) ttCCGCGCGACCAGCCTGGAAACTCTGCGCAACATGGTGGCGGCAGGTAGCGGGATCACTTTACTGCCAGCGCTGGCTGTGCAGCCGGAG‑CGCAAACGCGATGGGGTTGTTTATCTGCCGTGCAtt > 1:2681482/1‑126 (MQ=255) ttCCGCGCGACCAGCCTGGAAACTCTGCGCAACATGGTGGCGGCAGGTAGCGGGATCACTTTACTGCCAGCGCTGGCTGTGCAGCCGGAG‑CGCAAACGCGATGGGGTTGTTTATCTGCCGTGCATTAAGCCGGAACCa < 1:1954883/138‑1 (MQ=255) ttCCGCGCGACCAGCCTGGAAACTCTGCGCAACATGGTGGCGGCAGGTAGCGGGATCACTTTACTGCCAGCGCTGGCTGTGCAGCCGGAG‑CGCAAACGCGATGGGGTTGTTTATCTGCCGTGCATTAAGCCGGAACCa > 2:1954883/1‑138 (MQ=255) ttCCGCGCGACCAGCCTGGAAACTCTGCGCAACATGGTGGCGGCAGGTAGCGGGATCACTTTACTGCCAGCGCTGGCTGTGCAGCCGGAG‑CGCAAACGCGATGGGGTTGTTTATCTGCCGTGCATTAAGCCGGAACCAcg > 1:2234820/1‑140 (MQ=255) ttCCGCGCGACCAGCCTGGAAACTCTGCGCAACATGGTGGCGGCAGGTAGCGGGATCACTTTACTGCCAGCGCTGGCTGTGCAGCCGGAG‑CGCAAACGCGATGGGGTTGTTTATCTGCCGTGCATTAAGCCGGAACCAcg < 1:166067/140‑1 (MQ=255) tCCGCGCGACCAGCCTGGAAACTCTGCGCAACATGGTGGCGGCAGGTAGCGGGATCACTTTACTGCCAGCGCTGGCTGTGCAGCCGGAG‑CGCAAACGCGATGGGGTTGTTTATCTGCCGTGCATTAAGCCGGAACCAcgc > 2:319040/1‑140 (MQ=255) tCCGCGCGACCAGCCTGGAAACTCTGCGCAACATGGTGGCGGCAGGTAGCGGGATCACTTTACTGCCAGCGCTGGCTGTGCAGCCGGAG‑CGCAAACGCGATGGGGTTGTTTATCTGCCGTGCATTAAGCCGGAACCAcgc > 2:492615/1‑140 (MQ=255) ccGCGCGACCAGCCTGGAAACTCTGCGCAACATGGTGGCGGCAGGTAGCGGGATCACTTTACTGCCAGCGCTGGCTGTGCAGCCGGAG‑CGCAAACGCGATGGGGTTGTTTATCTGCCGTGCATTAAGCCGGAACCAcgcc > 2:1453698/1‑140 (MQ=255) ccGCGCGACCAGCCTGGAAACTCTGCGCAACATGGTGGCGGCAGGTAGCGGGATCACTTTACTGCCAGCGCTGGCTGTGCAGCCGGAG‑CGCAAACGCGATGGGGTTGTTTATCTGCCGTGCATTAAGCCGGAACCAcgcc > 1:842422/1‑140 (MQ=255) ccGCGCGACCAGCCTGGAAACTCTGCGCAACATGGTGGCGGCAGGTAGCGGGATCACTTTACTGCCAGCGCTGGCTGTGCAGCCGGAG‑CGCAAACGCGATGGGGTTGTTTATCTGCCGTGCATTAAGCCGGAACCAcgcc > 1:932403/1‑140 (MQ=255) 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(MQ=255) cgcgcgACCAGCCTGGAAACTCTGCGCAACATGGTGGCGGCAGGTAGCGGGATCACTTTACTGCCAGCGCTGGCTGTGCAGCCGGAG‑CGCAAACGCGATGGGGTTGTTTATCTGCCGTGCATTAAGCCGGAACCAcgccg > 1:2485299/1‑140 (MQ=255) cgcgcgACCAGCCTGGAAACTCTGCGCAACATGGTGGCGGCAGGTAGCGGGATCACTTTACTGCCAGCGCTGGCTGTGCAGCCGGAG‑CGCAAACGCGATGGGGTTGTTTATCTGCCGTGCATTAAGCCGGAACCAcgccg < 1:2834313/140‑1 (MQ=255) gcgcgACCAGCCTGGAAACTCTGCGCAACATGGTGGCGGCAGGTAGCGGGATCACTTTACTGCCAGCGCTGGCTGTGCAGCCGGAG‑CGCAAACGCGATGGGGTTGTTTATCTGCCGTGCATTAAGCCGGAACCAcgccg < 2:2195848/139‑1 (MQ=255) cgACCAGCCTGGAAACTCTGCGCAACATGGTGGCGGCAGGTAGCGGGATCACTTTACTGCCAGCGCTGGCTGTGCAGCCGGAG‑CGCAAACGCGATGGGGTTGTTTATCTGCCGTGCATTAAGCCGGAACCACGCCGCACt < 1:1769416/140‑1 (MQ=255) aCCAGCCTGGAAACTCTGCGCAACATGGTGGCGGCAGGTAGCGGGATCACTTTACTGCCAGCGCTGGCTGTGCAGCCGGAT‑CGCAAACGCGATGGGGTTGTTTATCTGCCGTGCATTAAGCCGGATCCACGCCGCACTAt < 2:1415270/140‑1 (MQ=255) ccTGGAAACTCTGCGCAACATGGTGGCGGCAGGTAGCGGGATCACTTTACTGCCAGCGCTGGCTGTGCAGCCGGAG‑CGCAAACGCGATGGGGTTGTTTATCTGCCGTGCATTAAGCCGGAACCACGCCGCACTATTGGcc < 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tCACTTTACTGCCAGCGCTGGCTGTGCAGCCGGAG‑CGCAAACGCGATGGGGTTGTTTATCTCCCGTGCATTAAGCCGGAACCACGCCGCACTATTGGCCTGGTTTATCGTCCTGGCTCACCGCTGCGCAGCCGCTATGag < 2:2712091/140‑1 (MQ=255) cACTTTACTGCCAGCGCTGGCTGTGCAGCCGGAG‑CGCAAACGCGATGGGGTTGTTTA‑‑TGCCGTGCATTAAGCCGGAACCACGCCGCACTATTGGCCTGGTTTATCGTCCTGGCTCACCGCTGCGCAGCCGCTATGagcag > 1:2541870/1‑140 (MQ=255) cTTTACTGCCAGCGCTGGCTGTGCAGCCGGAG‑CGCAAACGCGATGGGGTTGTTTATCTGCCGTGCATTAAGCCGGAACCACGCCGCACTATTGGCCTGGTTTATCGTCCTGGCTCACCGCTGCGCAGCCGCTATGagcag < 2:2485299/140‑1 (MQ=255) cTTTACTGCCAGCGCTGGCTGTGCAGCCGGAG‑CGCAAACGCGATGGGGTTGTTTATCTGCCGTGCATTAAGCCGGAACCACGCCGCACTATTGGCCTGGTTTATCGTCCTGGCTCACCGCTGCGCAGCCGCTATGagcag < 1:2043984/140‑1 (MQ=255) aCTGCCAGCGCTGGCTGTGCAGCCGGAG‑TGCAAACGCGATGGGGTTGTTTATCTGCCGTGCATTAAGCCGGAACCACGCCGCACTATTGGCCTGGTTTATCGTCCTGGCTCACCGCTGCGCAGCCGCTATGAGCAGCTgg < 1:592995/140‑1 (MQ=255) aCTGCCAGCGCTGGCTGTGCAGCCGGAG‑CGCAAACGCGATGGGGTTGTTTATCTGCCGTGCATTAAGCCGGAACCACGCCGCACTATTGGCCTGGTTTATCGTCCTGGCTCACCGCTGCGCAGCCGCTATGAGCAGCTgg < 2:141034/140‑1 (MQ=255) cTGCCAGCGCTGGCTGTGCAGCCGGAG‑CGCAAACGCGATGGGGTTGTTTATCTGCCGTGCATTAAGCCGGAACCACGCCGCACTATTGGCCTGGTTTATCGTCCTGGCTCACCGCTGCGCAGCCGCTATGAGCAGCTGGc > 2:618167/1‑140 (MQ=255) ccAGCGCTGGCTGTGCAGCCGGAG‑CGCAAACGCGATGGGGTTGTTTATCTGCCGTGCATTAAGCCGGAACCACGCCGCACTATTGGCCTGGTTTATCGTCCTGGCTCACCGCTGCGCAGCCGCTATGAGCAGCTGGCaga > 2:2637825/1‑140 (MQ=255) ccAGCGCTGGCTGTGCAGCCGGAG‑CGCAAACGCGATGGGGTTGTTTATCTGCCGTGCATTAAGCCGGAACCACGCCGCACTATTGGCCTGGTTTATCGTCCTGCCTCACCGCTGCGCAGCCGCTATGAGCGGCTGGCagc > 2:561398/1‑139 (MQ=255) gcgcTGGCTGTGCAGCCGGAG‑CGCAAACGCGATGGGGTTGTTTATCTGCCGTGCATTAAGCCGGAACCACGCCGCACTATTGGCCTGGTTTATCGTCCTGGCTCACCGCTGCGCAGCCGCTATGAGCAGCTGGCAGAGGc > 2:1644727/1‑140 (MQ=255) gcgcTGGCTGTGCAGCCGGAG‑CGCAAACGCGATGGGGTTGTTTATCTGCCGTGCATTAAGCCGGAACCACGCCGCACTATTGGCCTGGTTTATCGTCCTGGCTCACCGCTGCGCAGCCGCTATGAGCAGCTGGCAGAGGc > 1:1265382/1‑140 (MQ=255) ctggctgTGCAGCCGGAG‑CGCAAACGCGATGGGGTTGTTTATCTGCCGTGCATTAAGCCGGAACCACGCCGCACTATTGGCCTGGTTTATCGTCCTGGCTCACCGCTGCGCAGCCGCTATGAGCAGCTGGCAGAGGCCAt < 2:1812254/140‑1 (MQ=255) tggctgTGCAGCCGGAG‑CGCAAACGCGATGGGGTTGTTTATCTGCCGTGCATTAAGCCGGAACCACGCCGCACTATTGGCCTGGTTTATCGTCCTGGCTCACCGCTGCGCAGCCGCTATGAGCAGCTGGCAGAGGCCATc < 1:2184640/140‑1 (MQ=255) tggctgTGCAGCCGGAG‑CGCAAACGCGATGGGGTTGTTTATCTGCCGTGCATTAAGCCGGAACCACGCCGCACTATTGGCCTGGTTTATCGTCCTGGCTCACCGCTGCGCAGCCGCTATGAGCAGCTGGCAGAGGCCATc < 1:1742841/140‑1 (MQ=255) tggctgTGCAGCCGGAG‑CGCAAACGCGATGGGGTTGTTTATCTGCCATGCATTAAGCCGGAACCACGCCGCACTATTGGCCTGGTTTATCGTCCTGGCTCACCGCTGCGCAGCCGCTATGAGCAGCTGGCAGAGGCCATc < 1:30802/140‑1 (MQ=255) gctgTGCAGCCGGAG‑CGCAAACGCGATGGGGTTGTTTATCTGCCGTGCATTAAGCCGGAACCACGCCGCACTATTGGCCTGGTTTATCGTCCTGGCTCACCGCTGCGCAGCCGCTATGAGCAGCTGGCAGAGGCCATCcg < 1:907641/140‑1 (MQ=255) gctgTGCAGCCGGAG‑CGCAAACGCGATGGGGTTGTTTATCTGCCGTGCATTAAGCCGGAACCACGCCGCACTATTGGCCTGGTTTATCGTCCTGGCTCACCGCTGCGCAGCCGCTATGAGCAGCTGGCAGAGGCCATCcg < 2:1265382/140‑1 (MQ=255) gctgTGCAGCCGGAG‑CGCAAACGCGATGGGGTTGTTTATCTGCCGTGCATTAAGCCGGAACCACGCCGCACTATTGGCCTGGTTTATCGTCCTGGCTCACCGCTGCGCAGCCGCTATGAGCAGCTGGCAGAGGCCATCcg < 1:10946/140‑1 (MQ=255) gctgTGCAGCCGGAG‑CGCAAACGCGATGGGGTTGTTTATCTGCCGTGCATTAAGCCGGAACCACGCCGCACTATTGGCCTGGTTTATCGTCCTGGCTCACCGCTGCGCAGCCGCTATGAGCAGCTGGCAGAGGCCATCcg < 1:1038795/140‑1 (MQ=255) tgtgCAGCCGGAG‑CGCAAACGCGATGGGGTTGTTTATCTGCCGTGCATTAAGCCGGAACCACGCCGCACTATTGGCCTGGTTTATCGTCCTGGCTCACCGCTGCGCAGCCGCTATGAGCAGCTGGCAGAGGCCATCcgcg < 2:766052/140‑1 (MQ=255) tgtgCAGCCGGAG‑CGCAAACGCGATGGGGTTGTTTATCTGCCGTGCATTAAGCCGGAACCACGCCGCACTATTGGCCTGGTTTATCGTCCTGGCTCACCGCTGCGCAGCCGCTATGAGCAGCTGGCAGAGGCCATCcgcg < 2:86583/140‑1 (MQ=255) tgCAGCCGGAG‑CGCAAACGCGATGGGGTTGTTTATCTGCCGTGCATTAAGCCGGAACCACGCCGCACTATTGGCCTGGTTTATCGTCCTGGCTCACCGCTGCGCAGCCGCTATGAGCAGCTGGCAGAGGCCATCCGCGCa < 1:2637825/140‑1 (MQ=255) | CGCGATCAGGCAATGGGTTTCTGTTTTGAAGCCGGGGCGGATGAAGATACACACTTCCGCGCGACCAGCCTGGAAACTCTGCGCAACATGGTGGCGGCAGGTAGCGGGATCACTTTACTGCCAGCGCTGGCTGTGCCGCCGGAG‑CGCAAACGCGATGGGGTTGTTTATCTGCCGTGCATTAAGCCGGAACCACGCCGCACTATTGGCCTGGTTTATCGTCCTGGCTCACCGCTGCGCAGCCGCTATGAGCAGCTGGCAGAGGCCATCCGCGCA > NC_000913/4159090‑4159362 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |