| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 141,380 | C→A | intergenic (‑155/‑51) | gcd ← / → hpt | quinoprotein glucose dehydrogenase/hypoxanthine phosphoribosyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 141,380 | 0 | C | A | 99.3% | 1033.5 / ‑1.9 | 286 | intergenic (‑155/‑51) | gcd/hpt | quinoprotein glucose dehydrogenase/hypoxanthine phosphoribosyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/1); new base A (137/147); total (138/148) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 | |||||||||||
Only 100 of 291 total aligned reads displayed.
CATTAATATTTTAGTAGCAATTAATTATAGGTTTTAACATGTGTGATCGTCATCACAATTCGAGCTTTATTAACAGATTCCGCGAATGAATAGTTTTACTGGTATACTGCGTGTCTTGCGCTTTGTTGCGGTGCCAAAACCTGCCCGTGCGAAGTGATTTGTTTTTAAATCATATGGTTAGAGATATGAAACATACTGTAGAAGTAATGATCCCCGAAGCGGAGATTAAAGCGCGTATCGCCGAACTGGGTCGTCAGATTACTGAGCGTTA > NC_000913/141246‑141516 | cATTAATATTTTAGTAGCAATTAATTATAGGTTTTAACATGTGTGATCGTCATCACAATTCGAGCTTTATTAACAGATTCCGCGAATGAATAGTTTTACTGGTATACTGCGTGTCTTGCGCTTTGTTGCGGTGCAAAAAc > 2:514798/1‑140 (MQ=255)cATTAATATTTTAGTAGCAATTAATTATAGGTTTTAACATGTGTGATCGTCATCACAATTCGAGCTTTATTAACAGATTCCGCGAATGAATAGTTTTACTGGTATACTGCGTGTCTTGCGCTTTGTTGCGGTGCAAAAAc > 1:2530928/1‑140 (MQ=255) ttAATATTTTAGTAGCAATTAATTATAGGTTTTAACATGTGTGATCGTCATCACAATTCGAGCTTTATTAACAGATTCCGCGAATGAATAGTTTTACTGGTATACTGCGTGTCTTGCGCTTTGTTGCGGTGCAAAAACCt > 2:42433/1‑140 (MQ=255) tAATATTTTAGTAGCAATTAATTATAGGTTTTAACATGTGTGATCGTCATCACAATTCGAGCTTTATTAACAGATTCCGCGAATGAATAGTTTTACTGGTATACTGCGTGTCTTGCGCTTTGTTGCGGTGCAAAAACCTg < 1:406615/140‑1 (MQ=255) 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tgtCTTGCGCTTTGTTGCGGTGCAAAAACCTGCCCGTGCGAAGTGATTTGTTTTTAAATCATATGGTTAGAGATATGAAACATACTGTAGAAGTAATGATCCCCGAAGCGGAGATTAAAGCGCGTATCGCCGAACTGGgt < 2:2805582/140‑1 (MQ=255) tgtCTTGCGCTTTGTTGCGGTGCAAAAACCTGCCCGTGCGAAGTGATTTGTTTTTAAATCATATGGTTAGAGATATGAAACATACTGTAGAAGTAATGATCCCCGAAGCGGAGATTAAAGCGCGTATCGCCGAACTGGgt > 2:292466/1‑140 (MQ=255) tgtCTTGCGCTTTGTTGCGGTGCAAAAACCTGCCCGTGCGAAGTGATTTGTTTTTAAATCATATGGTTAGAGATATGAAACATACTGTAGAAGTAATGATCCCCGAAGCGGAGATTAAAGCGCGTATCGCCGAACTGGgt < 1:1944706/140‑1 (MQ=255) tgtCTTGCGCTTTGTTGCGGTGCAAAAACCTGCCCGTGCGAAGTGATTTGTTTTTAAATCATATGGTTAGAGATATGAAACATACTGTAGAAGTAATGATCCCCGAAGCGGAGATTAAAGCGCGTATCGCCGAACTGGgt > 2:2571924/1‑140 (MQ=255) tgtCTTGCGCTTTGTTGCGGTGCAAAAACCTGCCCGTGCGAAGTGATTTGTTTTTAAATCATATGGTTAGAGATATGAAACATACTGTAGAAGTAATGATCCCCGAAGCGGAGATTAAAGCGCGTATCGCCGAACTGGgt > 1:1498741/1‑140 (MQ=255) tgtCTTGCGCTTTGTTGCGGTGCAAAAACCTGCCCGTGCGAAGTGATTTGTTTTTAAATCATATGGTTAGAGATATGAAACATACTGTAGAAGTAATGATCCCCGAAGCGGAGATTAAAGCGCGTATCGCCGAACTGGgt > 1:873531/1‑140 (MQ=255) gtCTTGCGCTTTGTTGCGGTGCAAAAACCTGCCCGTGCGAAGTGATTTGTTTTTAAATCATATGGTTAGAGATATGAAACATACTGTAGAAGTAATGATCCCCGAAGCGGAGATTAAAGCGCGTATCGCCGAACTGGgt < 2:368833/139‑1 (MQ=255) tGCGCTTTGTTGCGGTGCAAAAACCTGCCCGTGCGAAGTGATTTGTTTTTAAATCATATGGTTAGAGATATGAAACATACTGTAGAAGTAATGATCCCCGAAGCGGAGATTAAAGCGCGTATCGCCGAACTGGGTCGTCa > 1:908123/1‑140 (MQ=255) gcgcTTTGTTGCGGTGCAAAAACCTGCCCGTGCGAAGTGATTTGTTTTTAAATCATATGGTTAGAGATATGAAACATACTGTAGAAGTAATGATCCCCGAAGCGGAGATTAAAGCGCGTATCGCCGAACTGGGTCGTCAg < 2:1498741/140‑1 (MQ=255) tgttgCGGTGCAAAAACCTGCCCGTGCGAAGTGATTTGTTTTTAAATCATATGGTTAGAGATATGAAACATACTGTAGAAGTAATGATCCCCGAAGCGGAGATTAAAGCGCGTATCGCCGAACTGGGTCGTCAGATTACt > 1:1608818/1‑140 (MQ=255) tgttgCGGTGCAAAAACCTGCCCGTGCGAAGTGATTTGTTTTTAAATCATATGGTTAGAGATATGAAACATACTGTAGAAGTAATGATCCCCGAAGCGGAGATTAAAGCGCGTATCGCCGAACTGGGTCGTCAGATTACt > 1:1887574/1‑140 (MQ=255) ttgCGGTGCAAAAACCCGCCCGTGCGAAGTGATTTGTTTTTAAATCATATGGTTAGAGATATGAAACATACTGTAGAAGTAATGATCCCCGAAGCGGAGATTAAAGCGCGTATCGCCGAACTGGGTCGTCAGATTACTGa < 2:756020/140‑1 (MQ=255) gCGGTGCAAAAACCTGCCCGTGCGAAGTGATTTGTTTTTAAATCATATGGTTAGAGATATGAAACATACTGTAGAAGTAATGATCCCCGAAGCGGAGATTAAAGCGCGTATCGCCGAACTGGGTCGTCAGATTACTGAGc < 2:2134221/140‑1 (MQ=255) gCGGTGCAAAAACCTGCCCGTGCGAAGTGATTTGTTTTTAAATCATATGGTTAGAGATATGAAACATACTGTAGAAGTAATGATCCCCGAAGCGGAGATTAAAGCGCGTATCGCCGAACTGGGTCGTCAGATTACTGAGc < 2:808866/140‑1 (MQ=255) | CATTAATATTTTAGTAGCAATTAATTATAGGTTTTAACATGTGTGATCGTCATCACAATTCGAGCTTTATTAACAGATTCCGCGAATGAATAGTTTTACTGGTATACTGCGTGTCTTGCGCTTTGTTGCGGTGCCAAAACCTGCCCGTGCGAAGTGATTTGTTTTTAAATCATATGGTTAGAGATATGAAACATACTGTAGAAGTAATGATCCCCGAAGCGGAGATTAAAGCGCGTATCGCCGAACTGGGTCGTCAGATTACTGAGCGTTA > NC_000913/141246‑141516 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |