Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 1,645,034 | 0 | A | C | 20.6% | 243.9 / 11.2 | 92 | intergenic (‑132/+85) | rem/hokD | Qin prophage; protein Rem/Qin prophage; toxic protein HokD |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (50/23); new base C (0/19); total (50/42) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.95e-08 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 103 total aligned reads displayed.
TTCATCATCAGAATCCTTCCGGATAATTAGCTCTCCCCTTTAAGGGACCATCCCTCTTATCCCTGCGCGCTACTTAAGTATTTTTGATTCTATTCCGGCACCGTCCAGAACTTCAAACGCGTTGAAAATAAAAACAAAAACCCGCCGAAGCGGGTTAAGTGCGGGTGCGTTGAGGATGCCTGCCACATCAGAGGTGGCGAGGGATTTCTCCCCCGCCGGGTCTCTTACTCCTCAGGTTCGTAAGCTGTGAAGACAGCGACCTCCGTCTGGCCGGTT > NC_000913/1644895‑1645170 | ttCATCATCAGAATCCTTCCGGATAATTAGCTCTCCCCTTTAAGGGACCATCCCTCTTATCCCTGCGCGCTACTTAAGTATTTTTGATTCTATTCCGGCACCGTCCAGAACTTCAAACGCGTTGAAAATaaaaacaaaaa > 2:647894/1‑140 (MQ=255) ttCATCATCAGAATCCTTCCGGATAATTAGCTCTCCCCTTTAAGGGACCATCCCTCTTATCCCTGCGCGCTACTTAAGTATTTTTGATTCTATTCCGGCACCGTCCAGAACTTCAAACGCGTTGAAAATaaaaacaaaaa > 1:1242509/1‑140 (MQ=255) ttCATCATCAGAATCCTTCCGGATAATTAGCTCTCCCCTTTAAGGGACCATCCCTCTTATCCCTGCGCGCTACTTAAGTATTTTTGATTCTATTCCGGCACCGTCCAGAACTTCAAACGCGTTGAAAATaaaaacaaaaa > 1:153211/1‑140 (MQ=255) ttCATCATCAGAATCCTTCCGGATAATTAGCTCTCCCCTTTAAGGGACCATCCCTCTTATCCCTGCGCGCTACTTAAGTATTTTTGATTCTATTCCGGCACCGTCCAGAACTTCAAACGCGTTGAAAATaaaaacaaaaa > 2:1207443/1‑140 (MQ=255) catcatcaGAATCCTTCCGGATAATTAGCTCTCCCCTTTAAGGGACCATCCCTCTTATCCCTGCGCGCTACTTAAGTATTTTTGATTCTATTCCGGCACCGTCCAGAACTTCACACGCGTTGAAAATAAAAACAAAAAcc > 2:208948/1‑140 (MQ=255) tcatcaGAATCCTTCCGGATAATTAGCTCTCCCCTTTAAGGGACCATCCCTCTTATCCCTGCGCGCTACTTAAGTATTTTTGATTCTATTCCGGCACCGTCCAGAACTTCAAACGCGTTGAAAATAAAAACAAAAACccg < 2:1215455/140‑1 (MQ=255) gAATCCTTCCGGATAATTAGCTCTCCCCTTTAAGGGACCATCCCTCTTATCCCTGCGCGCTACTTAAGTATTTTTGATTCTATTCCGGCACCGTCCAGAACTTCAAACGCGTTGAAAATAAAAACAAAAACCCGCCGAAg < 1:24526/140‑1 (MQ=255) gAATCCTTCCGGATAATTAGCTCTCCCCTTTAAGGGACCATCCCTCTTATCCCTGCGCGCTACTTAAGTATTTTTGATTCTATTCCGGCACCGTCCAGAACTTCAAACGCGTTGAAAATAAAAACAAAAACCCGCCGAAg < 1:1915305/140‑1 (MQ=255) aaTCCTTCCGGATAATTAGCTCTCCCCTTTAAGGGACCATCCCTCTTATCCCTGCGCGCTACTTAAGTATTTTTGATTCTATTCCGGCACCGTCCAGAACTTCAAACGCGTTGAAAATAAAAACAAAAACCCGCCGAAGc > 1:21305/1‑140 (MQ=255) ccTTCCGGATAATTAGCTCTCCCCTTTAAGGGACCATCCCTCTTATCCCTGCGCGCTACTTAAGTATTTTTGATTCTATTCCGGCACCGTCCAGAACTTCAAACGCGTTGAAAATAAAAACAAAAACCCGCCGAAGCggg < 2:844284/140‑1 (MQ=255) cTTCCGGATAATTAGCTCTCCCCTTTAAGGAACCATCCCTCTTATCCCTGCGCGCTACTTAAGTATTTTTGATTCTATTCCGGCACCGTCCAGAGTTTCAACCGCGTTAAAAATAAAAACAAAAACCCGCCGAAGCGGGt < 2:359326/140‑1 (MQ=255) ccGGATAATTAGCTCTCCCCTTTAAGGGACCATCCCTCTTATCCCTGCGCGCTACTTAAGTATTTTTGATTCTATTCCGGCACCGTCCAGAACTTCAAACGCGTTGAAAATAAAAACAAAAACCCGCCGAAGCGGGTTaa > 2:695346/1‑140 (MQ=255) gATAATTAGCTCTCCCCTTTAAGGGACCATCCCTCTTATCCCTGCGCGCTACTTAAGTATTTTTGATTCTATTCCGGCACCGTCCAGAACTTCAAACGCGTTGAAAATAAAAACAAAAACCCGCCGAAGCGGGTTAAGTg > 1:221828/1‑140 (MQ=255) aaTTAGCTCTCCCCTTTAAGGGACCATCCCTCTTATCCCTGCGCGCTACTTAAGTATTTTTGATTCTATTCCGGCACCGTCCAGAACTTCAAACGCGTTGAAAATAAAAACAAAAACCCGCCGAAGCGGGTTAAGTGCgg < 1:531012/140‑1 (MQ=255) ttAGCTCTCCCCTTTAAGGGACCATCCCTCTTATCCCTGCGCGCTACTTAAGTATTTTTGATTCTATTCCGGCACCGTCCAGAACTTCAAACGCGTTGAAAATAAAAACAAAAACCCGCCGAAGCGGGTTAAGTGCGGGt > 2:924816/1‑140 (MQ=255) ttAGCTCTCCCCTTTAAGGGACCATCCCTCTTATCCCTGCGCCCTACTTAAGTATTTTTGATTCTATTCCGGCACCGTCCAGAACTTCAAACGCGTTGAAAATAAAAACAAAAACCCGCCGAAGCGGGTTAAGTGCGGGt < 2:1501480/140‑1 (MQ=255) ccccTTTAAGGGACCATCCCTCTTATCCCTGCGCGCTACTTAAGTATTTTTGATTCTATTCCGGCACCGTCCAGAACTTCAAACGCGTTGAAAATAAAAACAAAAACCCGCCGAAGCGGGTTAAGTGCGGGTGCGTTGAg > 1:1551966/1‑140 (MQ=255) cccTTTAAGGGACCATCCCTCTTATCCCTGCGCGCTACTTAAGTATTTTTGATTCTATTCCGGCACCGTCCAGAACTTCAAACGCGTTGAAAATAAAAACAAAAACCCGCCGAAGCGGGTTAAGTGCGGGTGCGTTGAgg > 2:1802695/1‑140 (MQ=255) cccTTTAAGGGACCATCCCTCTTATCCCTGCGCGCTACTTAAGTATTTTTGATTCTATTCCGGCACCGTCCAGAACTTCAAACGCGTTGAAAATAAAAACAAAAACCCGCCGAAGCGGGTTAAGTGCGGGTGCGTTGAgg > 1:1778084/1‑140 (MQ=255) tAAGGGACCATCCCTCTTATCCCTGCGCGCTACTTAAGTATTTTTGATTCTATTCCGGCACCGTCCAGAACTTCAAACGCGTTGAAAATAAAAACAAAAACCCGCCGAAGCGGGTTAAGTGCGGGTGCGTTGAGGAtgcc < 1:964015/140‑1 (MQ=255) aGGGACCATCCCTCTTATCCCTGCGCGCTACTTAAGTATTTTTGATTCTATTCCGGCACCGTCCAGAACTTCAAACGCGTTGAAAATAAAAACAAAACCCCGCCGAAGCGGGTTAAGTGCGGGTGCGTTGTGGAtgcctg < 2:705570/140‑1 (MQ=255) gggACCATCCCTCTTATCCCTGCGCGCTACTTAAGTATTTTTGATTCTATTCCGGCCCCGTCCAGAACTTCAAACGCGTTGAAAATAAAAACAAAAACCCGCCGAAGCGGGTTAAGTGCGGGTGCGTTGAGGAtgcctgc < 1:1498284/140‑1 (MQ=255) gggACCATCCCTCTTATCCCTGCGCGCTACTTAAGTATTTTTGATTCTATTCCGGCACCGTCCAGAACTTCAAACGCGTTGAAAATAAAAACAAAAACCCGCCGAAGCGGGTTAAGTGCGGGTGCGTTGAGGAtgcctgc < 1:647894/140‑1 (MQ=255) gggACCATCCCTCTTATCCCTGCGCGCTACTTAAGTATTTTTGATTCTATTCCGGCACCGTCCAGAACTTCAAACGCGTTGAAAATAAAAACAAAAACCCGCCGAAGCGGGTTAAGTGCGGGTGCGTTGAGGAtgcctgc > 2:1848785/1‑140 (MQ=255) gggACCATCCCTCTTATCCCTGCGCGCTACTTAAGTATTTTTGATTCTATTCCGGCACCGTCCAGAACTTCAAACGCGTTGAAAATAAAAACAAAAACCCGCCGAAGCGGGTTAAGTGCGGGTGCGTTGAGGAtgcctgc < 1:1802695/140‑1 (MQ=255) gggACCATCCCTCTTATCCCTGCGCGCTACTTAAGTATTTTTGATTCTATTCCGGCACCGCCCAGACCTCCAAACGCGTTGAAAATAAAAACAAAAACCCGCCGAAGCGGGTTAAGTGCGGGTGCGTTGAGGAtgcctgc < 2:1825520/140‑1 (MQ=255) ggaaCCATCCCTCTTATCCCTGCGCGCTACTTAAGTATTTTTGATTCTATCCCGGCCCCGTCCAAAACTTCAAACGCGTTGAAAAAAAAAACAAAACCCCGCCGAAGCGGGTTAAGTGCGGGTGCGTTGAGGAtgcctgc < 2:443668/137‑1 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2:452592/1‑140 (MQ=255) cccTGCGCGCTACTTAAGTATTTTTGATTCTATTCCGGCACCGTCCAGAACTTCAAACGCGTTGAAAATAAAAACAAAAACCCGCCGAAGCGGGTTAAGTGCGGGTGCGTTGAGGATGCCTGCCACATCAGAGGTGGCGa < 1:2020688/140‑1 (MQ=255) ccTGCGCGCTACTTAAGTATTTTTGATTCTATTCCGGCACCGTCCAGAACTTCAAACGCGTTGAAAATAAAAACAAAAACCCGCCGAAGCGGGTTAAGTGCGGGTGCGTTGAGGATGCCTGCCACATCAGAGGTGGCGAg > 1:352077/1‑140 (MQ=255) ccTGCGCGCTACTTAAGTATTTTTGATTCTATTCCGGCACCGTCCAGAACTTCAAACGCGTTGAAAATAAAAACAAAAACCCGCCGAAGCGGGTTAAGTGCGGGTGCGTTGAGGATGCCTGCCACATCAGAGGTGGCGAg > 2:868819/1‑140 (MQ=255) ccTGCGCGCTACTTAAGTATTTTTGATTCTATTCCGGCACCGTCCAGAACTTCAAACGCGTTGAAAATAAAAACAAAAACCCGCCGAAGCGGGTTAAGTGCGGGTGCGTTGAGGATGCCTGCCACATCAGAGGTGGCGAg > 2:46592/1‑140 (MQ=255) cTGCGCGTTATTTAAGTATTTTTGATTCTATTCCGGCACCGTCCAGAACTTCAAACGCGTTGAAAATAAAAACAAAAACCCGCCGAAGCGGGTTAAGTGCGGGTGCGTTGAGGATGCCTGCCACATCAGAGGTGGCGAgg < 2:1289982/140‑1 (MQ=255) cTGCGCGCTACTTAAGTATTTTTGATTCTATTCCGGCACCGTCCAGAACTTCAAACGCGTTGAAAATAAAAACAAAAACCCGCCGAAGCGGGTTAAGTGCGGGTGCGTTGAGGATGCCTGCCACATCAGAGGTGGCGAgg < 2:626545/140‑1 (MQ=255) tGCGCGCTACTTAAGTATTTTTGATTCTATTCCGGCACCGTCCAGAACTTCAAACGCGTTGAAAATAAAAACAAAAACCCGCCGAAGCGGGTTAAGTGCGGGTGCGTTGAGGATGCCTGCCACATCAGAGGTGGCGAggg > 1:834220/1‑140 (MQ=255) gcgcgcTACTTAAGTATTTTTGATTCTATTCCGGCACCGTCCAGAACTTCAAACGCGTTGAAAATAAAAACAAAAACCCGCCGAAGCGGGTTAAGTGCGGGTGCGTTGAGGATGCCTGCCACATCAGAGGTGGCGAGGGa > 1:232754/1‑140 (MQ=255) cgcgcTACTTAAGTATTTTTGATTCTATTCCGGCACCGTCCAGAACTTCAAACGCGTTGAAAATAAAAACAAAAACCCGCCGAAGCGGGTTAAGTGCGGGTGCGTTGAGGATGCCTGCCACATCAGAGGTGGCGAGGGAt > 1:1226042/1‑140 (MQ=255) cgcgcTACTTAAGTATTTTTGATTCTATTCCGGCACCGTCCAGAACTTCAAACGCGTTGAAAATAAAAACAAAAACCCGCCGAAGCGGGTTAAGTGCGGGTGCGTTGAGGATGCCTGCCACATCAGAGGTGGCGAGGGAt > 2:2008405/1‑140 (MQ=255) gcgcTACTTAAGTATTTTTGATTCTATTCCGGCACCGTCCAGAACTTCAAACGCGTTGAAAATAAAAACAAAAACCCGCCGAAGCGGGTTAAGTGCGGGTGCGTTGAGGATGCCTGCCACATCAGAGGTGGCGAGGGAtt > 1:115605/1‑140 (MQ=255) cgcTACTTAAGTATTTTTGATTCTATTCCGGCACCGTCCAGAACTTCAAACGCGTTGAAAATAAAAACAAAAACCCGCCGAAGCGGGTTAAGTGCGGGTGCGTTGAGGATGCCTGCCACATCAGAGGTGGCGAGGGAttt > 2:75061/1‑140 (MQ=255) cTTAAGTATTTTTGATTCTATTCCGGCACCGTCCAGAACTTCAAACGCGTTGAAAATAAAAACAAAAACCCGCCGAAGCGGGTTAAGTGCGGGTGCGTTGAGGATGCCTGCCACATCAGAGGTGGCGAGGGATTTCTccc > 1:689328/1‑140 (MQ=255) ttAATTATTTTTGATTCTATCCCGGCCCCGTCCAGAACTTCAAACGCGTTAAAAAAAAAAAAAAAACCCCGCCGAAGCGGGTTAAGTGCGGGTGCGTTGAGGATGCCTGCCACATCAGAGGTGGCGAGGGATTTCTcccc < 2:1655711/140‑1 (MQ=255) tAAGTATTTTTGATTCTATCCCGGCACCGCCCAGAACTTCAAACGCGTTGAAAATAAAAACAAAAACCCGCCGAAGCGGGTTAAGTGCGGGTGCGTTGAGGATGCCTGCCACATCAGAGGTGGCGAGGGATTTCTccccc < 2:378780/140‑1 (MQ=255) gTATTTTTTATTTTATGCGGGCACCGTCAAGAGCTTAAACCGCGTTAAAAATAAAAACAAAACCCCGCCGAAGCGGGTTAAGTGCGGGTGCGTTGAGGATGCCTGCCACATCAGAGGTGGCGAGGGATTTCTCCCccgcc < 2:391968/140‑1 (MQ=255) gTATTTTTGATTCTATTCCGGCCCCGTCCAGAACTTCAAACGCGTTGAAAATAAAAACAAAACCCCGCCGAAGCGGGTTAAGTGCGGGTGCGTTGAGGATGCCTGCCACATCAGAGGTGGCGAGGGATTTCTCCCccgcc < 1:207379/140‑1 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tATTCCGGCACCGTCCAGAACTTCAAACGCGTTGAAAATAAAAACAAAAACCCGCCGAAGCGGGTTAAGTGCGGGTGCGTTGAGGATGCCTGCCACATCAGAGGTGGCGAGGGATTTCTCCCCCGCCGGGTCTCTTActc > 2:1677806/1‑140 (MQ=255) aTTCCGGCACCGTCCAGAACTTCAAACGCGTTGAAAATAAAAACAAAACCCCGCCGAAGCGGGTTAAGTGCGGGTGCGTTGAGGGTGCCTGCCACATCAGAGGTGGCGAGGGATTTCTCCCCCGCCGGGTCTCTTActcc < 1:1705879/140‑1 (MQ=255) aTTCCGGCACCGTCCAGAACTTCAAACGCGTTGAAAATAAAAACAAAAACCCGCCGAAGCGGGTTAAGTGCGGGTGCGTTGAGGATGCCTGCCACATCAGAGGTGGCGAGGGATTTCTCCCCCGCCGGGTCTCTTActcc > 2:160658/1‑140 (MQ=255) ccgcccccGTCCAGAACTTCAAACGCGTTAAAAAAAAAAACAAAACCCCGCCGAAGCGGGTTAAGTGCGGGTGCGTTGAGGATGCCTGCCACATCAGAGGTGGCGAGGGATTTCTCCCCCGCCGGGTCTCTTACTCCTCa < 2:834220/134‑1 (MQ=255) ccGGCACCGTCCAGAACTTCAAACGCGTTGAAAATAAAAACAAAAACCCGCCGAAGCGGGTTAAGTGCGGGTGCGTTGAGGATGCCTGCCACATCAGAGGTGGCGAGGGATTTCTCCCCCGCCGGGTCTCTTACTCCTCa < 1:1207443/140‑1 (MQ=255) ggCACCGTCCAGAACTTCAAACGCGTTGAAAATAAAAACAAAACCCCGCCGAAGCGGGTTAAGTGCGGGTGCGTTGAGGATGCCTGCCACATCAGAGGTGGCGAGGGATTTCTCCCCCGCCGGGTCTCTTACTCCTCAgg < 1:413893/140‑1 (MQ=255) ggCACCGTCCAGAACTTCAAACGCGTTGAAAATAAAAACAAAAACCCGCCGAAGCGGGTTAAGTGCGGGTGCGTTGAGGATGCCTGCCACATCAGAGGTGGCGAGGGATTTCTCCCCCGCCGGGTCTCTTACTCCTCAgg < 1:1433618/140‑1 (MQ=255) cGTCCAGAACTTCAAACGCGTTGAAAATAAAAACAAAACCCCGCCGAAGCGGGTTAAGTGCGGGTGCGTTGAGGATGCCTGCCACATCAGAGGTGGCGAGGGATTTCTCCCCCGCCGGGTCTCTTACTCCTCAGGTTCGt < 2:232754/140‑1 (MQ=255) cGTCCAGAACTTCAAACGCGTTGAAAATAAAAACAAAAACCCGCCGAAGCGGGTTAAGTGCGGGTGCGTTGAGGATGCCTGCCACATCAGAGGTGGCGAGGGATTTCTCCCCCGCCGGGTCTCTTACTCCTCAGGTTCGt > 1:1805934/1‑140 (MQ=255) cGTCCAGAACTTAAACCGCGTTAAAAAAAAAAAAAAAACCCCGCCGAAGCGGGTTAAGTGCGGGTGCGTTGAGGATGCCTGCCACATCAGAGGTGGCGAGGGATTTCTCCCCCGCCGGGTCTCTTACTCCTCAGGTTCGt < 2:1917598/140‑1 (MQ=255) gTCCAGAACTTCAAACGCGTTGAAAATAAAAACAAAAACCCGCCGAAGCGGGTTAAGTGCGGGTGCGTTGAGGATGCCTGCCACATCAGAGGTGGCGAGGGATTTCTCCCCCGCCGGGTCTCTTACTCCTCAGGTTCGTa > 2:736786/1‑140 (MQ=255) gTCCAGAACTTCAAACGCGTTGAAAATAAAAACAAAAACCCGCCGAAGCGGGTTAAGTGCGGGTGCGTTGAGGATGCCTGCCACATCAGAGGTGGCGAGGGATTTCTCCCCCGCCGGGTCTCTTACTCCTCAGGTTCGTa > 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(MQ=255) cAAACGCGTTGAAAATAAAAACAAAAACCCGCCGAAGCGGGTTAAGTGCGGGTGCGTTGAGGATGCCTGCCACATCAGAGGTGGCGAGGGATTTCTCCCCCGCCGGGTCTCTTACTCCTCAGGTTCGTAAGCTGTGAAGa > 1:293626/1‑140 (MQ=255) cAAACGCGTTGAAAATAAAAACAAAAACCCGCCGAAGCGGGTTAAGTGCGGGTGCGTTGAGGATGCCTGCCACATCAGAGGTGGCGAGGGATTTCTCCCCCGCCGGGTCTCTTACTCCTCAGGTTCGTAAGCTGTGAAGa > 2:328440/1‑140 (MQ=255) cAAACGCGTTGAAAATAAAAACAAAAACCCGCCGAAGCGGGTTAAGTGCGGGTGCGTTGAGGATGCCTGCCACATCAGAGGGGGCGAGGGATTTCTCCCCCGCCGGGTCTCTTACTCCTCAGGTTCGTAAGCTGTGAAgg > 2:65636/1‑139 (MQ=255) gTTGAAAATAAAAACAAAAACCCGCCGAAGCGGGTTAAGTGCGGGTGCGTTGAGGATGCCTGCCACATCAGAGGTGGCGAGGGATTTCTCCCCCGCCGGGTCTCTTACTCCTCAGGTTCGTAAGCTGTGAAGACAGCGAc > 2:1558261/1‑140 (MQ=255) tggAAAAAAAAAACAAAACCCCGCCGAAGCGGGTTAAGTGCGGGTGCGTTGAGGATGCCTGCCACATCAGAGGTGGCGAGGGATTTCTCCCCCGCCGGGTCTCTTACTCCTCAGGTTCGTAAGCTGTGAAGACAGCGAcc < 2:917891/138‑1 (MQ=255) aaaccCCGCCGAAGCGGGTTAAGTGCGGGTGCGTTGAGGATGCCTGCCACATCAGAGGTGGCGAGGGATTTCTCCCCCGCCGGGTCTCTTACTCCTCAGGTTCGTAAGCTGTGAAGACAGCGACCTCCGTCTGGCCGGtt < 1:1614666/140‑1 (MQ=255) aaaacCCGCCGAAGCGGGTTAAGTGCGGGTGCGTTGAGGATGCCTGCCACATCAGAGGTGGCGAGGGATTTCTCCCCCGCCGGGTCTCTTACTCCTCAGGTTCGTAAGCTGTGAAGACAGCGACCTCCGTCTGGCCGGtt < 1:622589/140‑1 (MQ=255) aaaacCCGCCGAAGCGGGTTAAGTGCGGGTGCGTTGAGGATGCCTGCCACATCAGAGGTGGCGAGGGATTTCTCCCCCGCCGGGTCTCTTACTCCTCAGGTTCGTAAGCTGTGAAGACAGCGACCTCCGTCTGGCCGGtt < 1:924816/140‑1 (MQ=255) aaaacCCGCCGAAGCGGGTTAAGTGCGGGTGCGTTGAGGATGCCTGCCACATCAGAGGTGGCGAGGGATTTCTCCCCCGCCGGGTCTCTTACTCCTCAGGTTCGTAAGCTGTGAAGACAGCGACCTCCGTCTGGCCGGtt < 1:210832/140‑1 (MQ=255) aaaacCCGCCGAAGCGGGTTAAGTGCGGGTGCGTTGAGGATGCCTGCCACATCAGAGGTGGCGAGGGATTTCTCCCCCGCCGGGTCTCTTACTCCTCAGGTTCGTAAGCTGTGAAGACAGCGACCTCCGTCTGGCCGGtt > 2:389098/1‑140 (MQ=255) | TTCATCATCAGAATCCTTCCGGATAATTAGCTCTCCCCTTTAAGGGACCATCCCTCTTATCCCTGCGCGCTACTTAAGTATTTTTGATTCTATTCCGGCACCGTCCAGAACTTCAAACGCGTTGAAAATAAAAACAAAAACCCGCCGAAGCGGGTTAAGTGCGGGTGCGTTGAGGATGCCTGCCACATCAGAGGTGGCGAGGGATTTCTCCCCCGCCGGGTCTCTTACTCCTCAGGTTCGTAAGCTGTGAAGACAGCGACCTCCGTCTGGCCGGTT > NC_000913/1644895‑1645170 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |