| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,434,461 | G→T | intergenic (‑55/+497) | ynaM ← / ← ttcC | Rac prophage; protein YnaM/putative tRNA 2‑thiocytidine (s(2)C32) synthase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,434,461 | 0 | G | T | 99.6% | 974.2 / ‑3.6 | 280 | intergenic (‑55/+497) | ynaM/ttcC | Rac prophage; protein YnaM/putative tRNA 2‑thiocytidine (s(2)C32) synthase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/0); new base T (178/101); total (179/101) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.45e-01 | |||||||||||
Only 100 of 288 total aligned reads displayed.
ATGCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCCTGGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGATAAACATTGTCGTTTCAGGTATACAGGAATGCTAACAGGTGGCGGCAAAAATCAGGCGGTTTATGGCGCAAGCTGAAGTGGCAACTGCAAACTATCTTATGCAGAGACTCTACACGGA > NC_000913/1434324‑1434600 | atGCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCCTtgg > 2:534872/1‑140 (MQ=255)atGCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCCTtgg > 1:823422/1‑140 (MQ=255) gCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCCTTGgtg > 1:139973/1‑140 (MQ=255) cAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCCTTGGTGtt > 2:378479/1‑140 (MQ=255) tCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAATATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCCTTGGTGTTCtt > 2:1851542/1‑140 (MQ=255) cccTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCCTTGGTGTTCTTa < 1:1997234/140‑1 (MQ=255) tAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCCTTGGTGTTCTTAAAg > 1:1499028/1‑140 (MQ=255) aaTTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCCTTGGTGTTCTTAAAGt > 2:1898251/1‑140 (MQ=255) aatttATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCCTTGGTGTTCTTAAAGtt > 1:1906844/3‑140 (MQ=255) aTTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCCTTGGTGTTCTTAAAGtt < 2:110114/140‑1 (MQ=255) aTTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCCTTGGTGTTCTTAAAGtt < 2:1557623/140‑1 (MQ=255) tattaGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCCTTGGTGTTCTTAAAGTTCGTa > 2:1974238/1‑140 (MQ=255) agCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCCTTGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGATaaa > 2:1205101/1‑140 (MQ=38) gCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCCTTGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGATAAAc > 2:2040899/1‑140 (MQ=37) tGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCCTTGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGATAAACAtt > 1:1836204/1‑140 (MQ=38) gACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCCTTGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGATAAACATTg < 1:398249/140‑1 (MQ=255) aaaaaTGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCCTTGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGATAAACATTGTCGt < 1:97520/140‑1 (MQ=255) aaaaTGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCCTTGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGATAAACATTGTCGtt > 1:325706/1‑140 (MQ=38) aaTGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCCTTGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGATAAACATTGTCGTTTc < 2:679404/140‑1 (MQ=255) aaTGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCCTTGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGATAAACATTGTCGTTTc < 2:494172/140‑1 (MQ=255) tGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCCTTGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGATAAACATTGTCGTTTCAg < 2:1531490/140‑1 (MQ=255) tGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCCTTGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGATAAACATTGTCGTTTCAg < 2:1754690/140‑1 (MQ=255) tGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAATATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCCTTGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGATAAACATTGTCGTTTCAg < 1:1851542/140‑1 (MQ=255) tGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCCTTGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGATAAACATTGTCGTTTCAGGta > 1:137571/1‑140 (MQ=255) tGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCCTTGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGATAAACATTGTCGTTTCAGGTATACAgg < 1:1446268/140‑1 (MQ=37) gATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCCTTGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGATAAACATTGTCGTTTCAGGTATACAGGa > 2:1418010/1‑140 (MQ=255) aTAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCCTTGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGATAAACATTGTCGTTTCAGGTATACAGGaa < 1:379754/140‑1 (MQ=255) tAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCCTTGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGATAAACATTGTCGTTTCAGGTATACAGGAAt > 1:1315830/1‑140 (MQ=255) ggAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCCTTGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGATAAACATTGTCGTTTCAg > 1:877129/1‑125 (MQ=255) ggAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCCTTGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGATAAACATTGTCGTTTCAg > 2:1795828/1‑125 (MQ=38) ggAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCCTTGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGATAAACATTGTCGTTTCAGGTATACAGGAATGCt > 2:1376629/1‑140 (MQ=37) aaGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCCTTGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGATAAACATTGTCGTTTCAGGTATACAGGAATGCTAACAgg > 2:305762/1‑140 (MQ=18) aTTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCCTTGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGATAAACATTGTCGTTTCAGGTATACAGGAATGCTAACAGGTggcg > 2:1838407/1‑140 (MQ=18) aTTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCCTTGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGATAAACATTGTCGTTTCAGGTATACAGGAATGCTAACAGGTggcg > 1:273284/1‑140 (MQ=18) tATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCCTTGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGATAAACATTGTCGTTTCAGGTATACAGGAATGCTAACAGGTGGCGGCAAAAAt < 2:868108/140‑1 (MQ=25) tATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCCTTGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGATAAACATTGTCGTTTCAGGTATACAGGAATGCTAACAGGTGGCGGCAAAAAt > 1:205850/1‑140 (MQ=21) tGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCCTTGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGATAAACATTGTCGTTTCAGGTATACAGGAATGCTAACAGGTGGCGGCAAAAATCa > 1:1713603/1‑140 (MQ=25) gTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCCTTGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGATAAACATTGTCGTTTCAGGTATACAGGAATGCTAACAGGTGGCGGCAAAAATCAGGCg < 2:1906844/140‑1 (MQ=21) ttCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCCTTGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGATAAACATTGTCGTTTCAGGTATACAGGAATGCTAACAGGTGGCGGCAAAAATCAGGCgg > 2:585225/1‑140 (MQ=21) ttCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCCTTGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGATAAACATTGTCGTTTCAGGTATACAGGAATGCTAACAGGTGGCGGCAAAAATCAGGCgg > 1:1047736/1‑140 (MQ=25) ttCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCCTTGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGATAAACATTGTCGTTTCAGGTATACAGGAATGCTAACAGGTGGCGGCAAAAATCAGGCgg > 2:638713/1‑140 (MQ=25) ttCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCCTTGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGATAAACATTGTCGTTTCAGGTATACAGGAATGCTAACAGGTGGCGGCAAAAATCAGGCgg > 2:281927/1‑140 (MQ=25) ttCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCCTTGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGATAAACATTGTCGTTTCAGGTATACAGGAATGCTAACAGGTGGCGGCAAAAATCAGGCgg > 1:1637070/1‑140 (MQ=25) atatAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCCTTGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGATAAACATTGTCGTTTCAGGTATACAGGAATGCTAACAGGTGGCGGCAAAAATCAGGCGGttt > 1:471342/1‑140 (MQ=21) atatAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCCTTGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGATAAACATTGTCGTTTCAGGTATACAGGAATGCTAACAGGTGGCGGCAAAAATCAGGCGGttt > 1:1420145/1‑140 (MQ=25) ccTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCCTTGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGATAAACATTGTCGTTTCAGGTATACAGGAATGCTAACAGGTGGCGGCAAAAATCAGGCGGTTTATGgcg > 1:1797564/1‑140 (MQ=25) cTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCCTTGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGATAAACATTGTCGTTTCAGGTATACAGGAATGCTAACAGGTGGCGGCAAAAATCAGGCGGTTTATGgcgc > 2:1598093/1‑140 (MQ=25) cTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCCTTGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGATAAACATTGTCGTTTCAGGTATACAGGAATGCTAACAGGTGGCGGCAAAAATCAGGCGGTTTATGgcgc > 1:490741/1‑140 (MQ=25) cTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCCTTGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGATAAACATTGTCGTTTCAGGTATACAGGAATGCTAACAGGTGGCGGCAAAAATCAGGCGGTTTATGgcgc > 2:1585333/1‑140 (MQ=25) cTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCCTTGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGATAAACATTGTCGTTTCAGGTATACAGGAATGCTAACAGGTGGCGGCAAAAATCAGGCGGTTTATGgcgc > 1:1518919/1‑140 (MQ=21) cTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCCTTGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGATAAACATTGTCGTTTCAGGTATACAGGAATGCTAACAGGTGGCGGCAAAAATCAGGCGGTTTATGgcgc > 2:1803967/1‑140 (MQ=25) cGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCCTTGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGATAAACATTGTCGTTTCAGGTATACAGGAATGCTAACAGGTGGCGGCAAAAATCAGGCGGTTTATGGCGCaa > 1:418605/1‑140 (MQ=25) gAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCCTTGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGATAAACATTGTCGTTTCAGGTATACAGGAATGCTAACAGGTGGCGGCAAAAATCAGGCGGTTTATGGCGCAAg > 1:795450/1‑140 (MQ=25) gTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCCTTGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGATAAACATTGTCGTTTCAGGTATACAGGAATGCTAACAGGTGGCGGCAAAAATCAGGCGGTTTATGGCGCAAGCTGAAg > 1:1433286/1‑140 (MQ=25) tgtgTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCCTTGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGATAAACATTGTCGTTTCAGGTATACAGGAATGCTAACAGGTGGCGGCAAAAATCAGGCGGTTTATGGCGCAAGCTGAAGTGGc < 2:68603/140‑1 (MQ=255) tgtTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCCTTGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGATAAACATTGTCGTTTCAGGTATACAGGAATGCTAACAGGTGGCGGCAAAAATCAGGCGGTTTATGGCGCAAGCTGAAGTGGCaa > 2:825557/1‑140 (MQ=255) tgtTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCCTTGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGATAAACATTGTCGTTTCAGGTATACAGGAATGCTAACAGGTGGCGGCAAAAATCAGGCGGTTTATGGCGCAAGCTGAAGTGGCaa > 1:1148515/1‑140 (MQ=255) tgtTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCCTTGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGATAAACATTGTCGTTTCAGGTATACAGGAATGCTAACAGGTGGCGGCAAAAATCAGGCGGTTTATGGCGCAAGCTGAAGTGGCaa > 1:1060585/1‑140 (MQ=255) ttATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCCTTGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGATAAACATTGTCGTTTCAGGTATACAGGAATGCTAACAGGTGGCGGCAAAAATCAGGCGGTTTATGGCGCAAGCTGAAGTgg < 2:1495553/135‑1 (MQ=38) ttATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCCTTGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGATAAACATTGTCGTTTCAGGTATACAGGAATGCTAACAGGTGGCGGCAAAAATCAGGCGGTTTATGGCGCAAGCTGAAGTGGCAACt > 2:1287636/1‑140 (MQ=255) ttATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCCTTGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGATAAACATTGTCGTTTCAGGTATACAGGAATGCTAACAGGTGGCGGCAAAAATCAGGCGGTTTATGGCGCAAGCTGAAGTGGCAACt > 1:1880227/1‑140 (MQ=255) tatGATATAGTTGACAATTTTTATCCTTGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGATAAACATTGTCGTTTCAGGTATACAGGAATGCTAACAGGTGGCGGCAAAAATCAGGCGGTTTATGGCGCGAGCTGAAGTGGCAACTACaaa < 1:1967771/140‑1 (MQ=255) tatGATATAGTTGACAATTTTTATCCTTGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGATAAACATTGTCGTTTCAGGTATACAGGAATGCTAACAGGTGGCGGCAAAAATCAGGCGGTTTATGGCGCAAGCTGAAGTGGCAACTGCaaa < 2:100167/140‑1 (MQ=255) tatGATATAGTTGACAATTTTTATCCTTGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGATAAACATTGTCGTTTCAGGTATACAGGAATGCTAACAGGTGGCGGCAAAAATCAGGCGGTTTATGGCGCAAGCTGAAGTGGCAACTGCaaa < 1:638713/140‑1 (MQ=255) tGATATAGTTGACAATTTTTATCCTTGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGATAAACATTGTCGTTTCAGGTATACAGGAATGCTAACAGGTGGCGGCAAAAATCAGGCGGTTTATGGCGCAAGCTGAAGTGGCAACTGCAAACt < 2:325706/140‑1 (MQ=37) tGATATAGTTGACAATTTTTATCCTTGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGATAAACATTGTCGTTTCAGGTATACAGGAATGCTAACAGGTGGCGGCAAAAATCAGGCGGTTTATGGCGCAAGCTGAAGTGGCAACTGCAAACt < 1:1675103/140‑1 (MQ=255) gATATAGTTGACAATTTTTATCCTTGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGATAAACATTGTCGTTTCAGGTATACAGGAATGCTAACAGGTGGCGGCAAAAATCAGGCGGTTTATGGCGCAAGCTGAAGTGGCAACTGCAAACTa > 2:772398/1‑140 (MQ=255) gATATAGTTGACAATTTTTATCCTTGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGATAAACATTGTCGTTTCAGGTATACAGGAATGCTAACAGGTGGCGGCAAAAATCAGGCGGTTTATGGCGCAAGCTGAAGTGGCAACTGCAAACTa > 1:987829/1‑140 (MQ=255) gATATAGTTGACAATTTTTATCCTTGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGATAAACATTGTCGTTTCAGGTATACAGGAATGCTAACAGGTGGCGGCAAAAATCAGGCGGTTTATGGCGCAAGCTGAAGTGGCAACTGCAAACTa > 1:65832/1‑140 (MQ=37) gATATAGTTGACAATTTTTATCCTTGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGATAAACATTGTCGTTTCAGGTATACAGGAATGCTAACAGGTGGCGGCAAAAATCAGGCGGTTTATGGCGCAAGCCGAAGTGGCAACTGCAAACTa > 2:173412/1‑140 (MQ=255) tataGTTGACAATTTTTATCCTTGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGATAAACATTGTCGTTTCAGGTATACAGGAATGCTAACAGGTGGCGGCAAAAATCAGGCGGTTTATGGCGCAAGCTGAAGTGGCAACTGCAAACTATc > 1:2037792/1‑140 (MQ=255) tataGTTGACAATTTTTATCCTTGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGATAAACATTGTCGTTTCAGGTATACAGGAATGCTAACAGGTGGCGGCAAAAATCAGGCGGTTTATGGCGCAAGCTGAAGTGGCAACTGCAAACTATc > 2:840066/1‑140 (MQ=255) tataGTTGACAATTTTTATCCTTGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGATAAACATTGTCGTTTCAGGTATACAGGAATGCTAACAGGTGGCGGCAAAAATCAGGCGGTTTATGGCGCAAGCTGAAGTGGCAACTGCAAACTATc > 2:223988/1‑140 (MQ=255) aGTTGACAATTTTTATCCTTGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGATAAACATTGTCGTTTCAGGTATACAGGAATGCTAACAGGTGGCGGCAAAAATCAGGCGGTTTATGGCGCAAGCTGAAGTGGCAACTGCAAACTATCTTa > 2:727625/1‑140 (MQ=255) aGTTGACAATTTTTATCCTTGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGATAAACATTGTCGTTTCAGGTATACAGGAATGCTAACAGGTGGCGGCAAAAATCAGGCGGTTTATGGCGCAAGCTGAAGTGGCAACTGCAAACTATCTTa > 2:1243484/1‑140 (MQ=255) aGTTGACAATTTTTATCCTTGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGATAAACATTGTCGTTTCAGGTATACAGGAATGCTAACAGGTGGCGGCAAAAATCAGGCGGTTTATGGCGCAAGCTGAAGTGGCAACTGCAAACTATCTTa > 1:162040/1‑140 (MQ=255) aGTTGACAATTTTTATCCTTGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGATAAACATTGTCGTTTCAGGTATACAGGAATGCTAACAGGTGGCGGCAAAAATCAGGCGGTTTATGGCGCAAGCTGAAGTGGCAACTGCAAACTATCTTa > 1:1082389/1‑140 (MQ=255) aGTTGACAATTTTTATCCTTGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGATAAACATTGTCGTTTCAGGTATACAGGAATGCTAACAGGTGGCGGCAAAAATCAGGCGGTTTATGGCGCAAGCTGAAGTGGCAACTGCAAACTATCTTa > 2:1614684/1‑140 (MQ=37) aGTTGACAATTTTTATCCTTGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGATAAACATTGTCGTTTCAGGTATACAGGAATGCTAACAGGTGGCGGCAAAAATCAGGCGGTTTATGGCGCAAGCTGAAGTGGCAACTGCAAACTATCTTa > 1:588508/1‑140 (MQ=255) aGTTGACAAGTTTTATCCTTGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGATAAACATTGTCGTTTCAGGTATACAGGAATGCTAACAGGTAGAGGCAACACTCAGGCGGTTTATGGCGCAAGATGAAGAGGCAACTGCAAACTATCTTa > 2:1957068/1‑140 (MQ=11) ttGACAATTTTTATCCTTGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGATAAACATTGTCGTTTCAGGTATACAGGAATGCTAACAGGTGGCGGCAAAAATCAGGCGGTTTATGGCGCAAGCTGAAGTGGCAACTGCAAACTATCTTATg > 1:530397/1‑140 (MQ=255) ttGACAATTTTTATCCTTGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGATAAACATTGTCGTTTCAGGTATACAGGAATGCTAACAGGTGGCGGCAAAAATCAGGCGGTTTATGGCGCAAGCTGAAGTGGCAACTGCAAACTATCTTATg > 2:662546/1‑140 (MQ=37) ttGACAATTTTTATCCTTGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGATAAACATTGTCGTTTCAGGTATACAGGAATGCTAACAGGTGGCGGCAAAAATCAGGCGGTTTATGGCGCAAGCTGAAGTGGCAACTGCAAACTATCTTATg > 1:1613734/1‑140 (MQ=255) ttGACAATTTTTATCCTTGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGATAAACATTGTCGTTTCAGGTATACAGGAATGCTAACAGGTGGCGGCAAAAATCAGGCGGTTTATGGCGCAAGCTGAAGTGGCAACTGCAAACTATCTTATg > 1:607189/1‑140 (MQ=255) ttGACAATTTTTATCCTTGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGATAAACATTGTCGTTTCAGGTATACAGGAATGCTAACAGGTGGCGGCAAAAATCAGGCGGTTTATGGCGCAAGCTGAAGTGGCAACTGCAAACTATCTTATg < 2:139973/140‑1 (MQ=38) ttGACAATTTTTATCCTTGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGATAAACATTGTCGTTTCAGGTATACAGGAATGCTAACAGGTGGCGGCAAAAATCAGGCGGTTTATGGCGCAAGCTGAAGTGGCAACTGCAAACTATCTTATg > 2:892422/1‑140 (MQ=255) ttGACAATTTTTATCCTGGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGATAAACATTGTCGTTTCAGGTATACAGGAATGCTAACAGGTGGCGGCAAAAATCAGGCGGTTTATGGCGCAAGCTGAAGTGGCAACTGCAAACTATCTTATg > 1:13500/1‑140 (MQ=37) gACAATTTTTATCCTTGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGATAAACATTGTCGTTTCAGGTATACAGGAATGCTAACAGGTGGCGGCAAAAATCAGGCGGTTTATGGCGCAAGCTGAAGTGGCAACTGCAAACTATCTTATGCa < 2:934730/140‑1 (MQ=255) aCAATTTTTATCCTTGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGATAAACATTGTCGTTTCAGGTATACAGGAATGCTAACAGGTGGCGGCAAAAATCAGGCGGTTTATGGCGCAAGCTGAAGTGGCAACTGCAAACTATCTTATGCag < 2:405991/140‑1 (MQ=255) aCAATTTTTATCCTTGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGATAAACATTGTCGTTTCAGGTATACAGGAATGCTAACAGGTGGCGGCAAAAATCAGGCGGTTTATGGCGCAAGCTGAAGTGGCAACTGCAAACTATCTTATGCag < 2:1361303/140‑1 (MQ=255) aCAATTTTTATCCTTGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGATAAACATTGTCGTTTCAGGTATACAGGAATGCTAACAGGTGGCGGCAAAAATCAGGCGGTTTATGGCGCAAGCTGAAGTGGCAACTGCAAACTATCTTATGCag < 1:687787/140‑1 (MQ=255) aCAATTTTTATCCTTGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGATAAACATTGTCGTTTCAGGTATACAGGAATGCTAACAGGTGGCGGCAAAAATCAGGCGGTTTATGGCGCAAGCTGAAGTGGCAACTGCAAACTATCTTATGCag < 1:1591997/140‑1 (MQ=255) aTTTTTATCCTTGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGATAAACATTGTCGTTTCAGGTATACAGGAATGCTAACAGGTGGCGGCAAAAATCAGGCGGTTTATGGCGCAAGCTGAAGTGGCAACTGCAAACTATCTTATGCAgaga < 1:1974238/140‑1 (MQ=255) aTTTTTATCCTTGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGATAAACATTGTCGTTTCAGGTATACAGGAATGCTAACAGGTGGCGGCAAAAATCAGGCGGTTTATGGCGCAAGCTGAAGTGGCAACTGCAAACTATCTTATGCAgaga < 1:1216582/140‑1 (MQ=255) aTTTTTATCCTTGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGATAAACATTGTCGTTTCAGGTATACAGGAATGCTAACAGGTGGCGGCAAAAATCAGGCGGTTTATGGCGCAAGCTGAAGTGGCAACTGCAAACTATCTTATGCAgaga < 2:162040/140‑1 (MQ=255) aTTTTTATCCTTGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGATAAACATTGTCGTTTCAGGTATACAGGAATGCTAACAGGTGGCGGCAAAAATCAGGCGGTTTATGGCGCAAGCTGAAGTGGCAACTGCAAACTATCTTATGCAgaga < 2:1447735/140‑1 (MQ=255) aTTTTTATCCTTGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGATAAACATTGTCGTTTCAGGTATACAGGAATGCTAACAGGTGGCGGCAAAAATCAGGCGGTTTATGGCGCAAGCTGAAGTGGCAACTGCAAACTATCTTATGCAgaga < 1:853223/140‑1 (MQ=255) aTTTTTATCCTTGGTGTTCTTAAAGTTCATAGATAAACATTGTCGTTTCAGGTATACAGGAATGCTAACAGGTGGCGGCAAAAATCAGGCGGTTTATGGCGCAAGCTGAAGTGGCAACTGCAAACTATCTTATGCAgaga < 2:1348756/140‑1 (MQ=255) tttttATCCTTGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGATAAACATTGTCGTTTCAGGTATACAGGAATGCTAACAGGTGGCGGCAAAAATCAGGCGGTTTATGGCGCAAGCTGAAGTGGCAACTGCAAACTATCTTATGCAGAGAc < 1:1762459/140‑1 (MQ=255) ttATCCTTGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGATAAACATTGTCGTTTCAGGTATACAGGAATGCTAACAGGTGGCGGCAAAAATCAGGCGGTTTATGGCGCAAGCTGAAGTGGCAACTGCAAACTATCTTATGCAGAGActct > 1:1286088/1‑140 (MQ=255) | ATGCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGTTCATATAGCCTCGAATTAGTAATGTGTTATATATGATATAGTTGACAATTTTTATCCTGGGTGTTCTTAAAGTTCGTAGATAAACATTGTCGTTTCAGGTATACAGGAATGCTAACAGGTGGCGGCAAAAATCAGGCGGTTTATGGCGCAAGCTGAAGTGGCAACTGCAAACTATCTTATGCAGAGACTCTACACGGA > NC_000913/1434324‑1434600 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |