New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | NC_000913 | = 377333 | NA (NA) | intergenic (+22/+202) | yaiL/frmB | DUF2058 domain‑containing protein YaiL/S‑formylglutathione hydrolase FrmB |
Only 100 of 147 total aligned reads displayed.
TAAAATTGCTCAGCGCGATGCCAGCAGTATAGTGTTGCACAGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACG > NC_000913/377194‑377472 | tAAAATTGCTCAGCGCGATGCCATCAGTATAGTGTTGCACAGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGA < 1:177185‑M2/140‑1 (MQ=255) aaaaTTGCTCAGCGCGATGCCAGCAGTATAGTGTTGCACAGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGAt < 2:709028‑M2/140‑2 (MQ=255) aaaaTTGCTCAGCGCGATGCCAGCAGTATAGTGTTGCACAGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGAt < 1:329698‑M2/140‑2 (MQ=255) aaaaTTGCTCAGCGCGATGCCAGCAGTATAGTGTTGCACAGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGAt < 2:1175688‑M2/140‑2 (MQ=255) 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tCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGt > 2:1097268/1‑135 (MQ=255) tCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTAt > 2:1048937/1‑140 (MQ=255) tCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTAt > 1:20068/1‑140 (MQ=255) cGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGcgcg > 2:1124971/1‑133 (MQ=255) cGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGcgcg < 1:1124971/133‑1 (MQ=255) cGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATc > 1:201766/1‑140 (MQ=255) 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(MQ=255) tGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTAT‑GGGCGAAGTGTACACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTg > 1:1155343/1‑127 (MQ=255) tGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTAT‑GGGCGAAGTGTACACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTg < 2:1155343/127‑1 (MQ=255) cgcAGAtgcctgatgcgacgctaacgcgtcttatcaggcctacaaattctcgcgccacccgtaggccggataaggcgttcacgccgcatccggcagtcgtgcgcagatgcctgatgcgacgctaacgcgtcttatcaggc < 1:119005‑M2/140‑135 (MQ=255) cgcAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGcgcg < 1:280339/129‑1 (MQ=255) cgcAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGt < 1:1181426/130‑1 (MQ=255) cgcAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGt < 1:93678/130‑1 (MQ=255) cgcAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGt > 2:93678/1‑130 (MQ=255) cgcAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGc > 2:13963/1‑140 (MQ=255) aTGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACg > 1:105316/1‑140 (MQ=255) aTGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACg > 2:340345/1‑140 (MQ=255) | TAAAATTGCTCAGCGCGATGCCAGCAGTATAGTGTTGCACAGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACG > NC_000913/377194‑377472 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |