| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 375304 = | NA (NA) | 14 (0.240) | 10/232 | 3.3 | NA | noncoding (17/36 nt) | other | REP31h |
| ? | NC_000913 | 377351 = | NA (NA) | noncoding (16/37 nt) | other | REP32a | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 122 total aligned reads displayed.
GCCAGCAGTATAGTGTTGCACAGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑C‑ATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTACGGGCGAAGTGTA > NC_000913/377213‑377490 | gCCAGCAGTATAGTGTTGCACAGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATg < 1:247137/140‑1 (MQ=255) ataGTGTTGCACAGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGTGACGCTATGCGCGTCTTa > 2:16691/1‑140 (MQ=255) ataGTGTTGCACAGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTa > 2:974954/1‑140 (MQ=255) ataGTGTTGCACAGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTa > 2:25563/1‑140 (MQ=255) tgtTGCACAGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAg > 1:172725/1‑140 (MQ=255) ttGCACAGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGcgcg > 2:898516/1‑129 (MQ=255) ttGCACAGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGcgcg < 1:898516/129‑1 (MQ=255) ttGCACAGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGc > 2:924132/1‑140 (MQ=255) ttGCACAGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGc > 1:494981/1‑140 (MQ=255) tGCACAGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGcc < 1:563993/140‑1 (MQ=255) gCACAGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCt > 2:396108/1‑140 (MQ=255) cacaGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAg < 2:974046/135‑1 (MQ=255) cacaGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAg > 1:974046/1‑135 (MQ=255) cacaGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTa > 2:1015599/1‑140 (MQ=255) cacaGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTa > 2:756332/1‑140 (MQ=255) cacaGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTa > 1:844692/1‑140 (MQ=255) cgcgcTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTAcaaat > 2:974463/1‑136 (MQ=255) cgcgcTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGtt > 2:395123/1‑140 (MQ=255) cgcgcTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGtt > 1:968092/1‑140 (MQ=255) cgcgcTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGtt > 1:954452/1‑140 (MQ=255) cgcgcTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGtt > 2:758051/1‑140 (MQ=255) cgcgcTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGtt > 2:426235/1‑140 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cgcAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑C‑ATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGt < 1:93678/130‑1 (MQ=255) cgcAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑C‑ATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGc > 2:13963/1‑140 (MQ=255) cgcAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑C‑ATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGc < 1:773481/140‑1 (MQ=255) aGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑C‑ATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTa < 1:511508/140‑1 (MQ=255) aTGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑C‑ATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACg > 1:105316/1‑140 (MQ=255) aTGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑C‑ATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACg > 2:340345/1‑140 (MQ=255) cTGATGCGACGCTA‑ACGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTAT‑TGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑C‑ATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTa < 2:1175142/140‑1 (MQ=255) tGATGCGACGCTA‑ACGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑C‑ATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTAc < 2:557096/140‑1 (MQ=255) tGATGCGACGCTA‑ACGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑C‑ATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTAc < 1:126527/140‑1 (MQ=255) tGATGCGACGCTA‑ACGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑C‑ATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTAc < 1:885952/140‑1 (MQ=255) tGATGCGACGCTA‑ACGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑C‑ATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTAc < 2:933298/140‑1 (MQ=255) gATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGTTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑C‑ATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGACCTAcaaattct < 1:96416/140‑8 (MQ=21) gATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑C‑ATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTAc < 1:756332/140‑1 (MQ=255) gATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑C‑ATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTAc < 2:811395/140‑1 (MQ=255) gATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑C‑ATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTAc < 1:704127/140‑1 (MQ=255) gATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑C‑ATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTAc < 1:532804/140‑1 (MQ=255) gATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑C‑ATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTAc < 1:828546/140‑1 (MQ=255) gATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑C‑ATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTAc < 1:531780/140‑1 (MQ=255) gATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑C‑ATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTAc < 2:1158276/140‑1 (MQ=255) gCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGGTAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑C‑ATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTACggg < 1:578188/140‑1 (MQ=255) aCGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑C‑ATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTa < 2:279276/126‑1 (MQ=255) aCGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑C‑ATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTa > 1:279276/1‑126 (MQ=255) aCGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCAACCGGCAGTCGTGCGC‑C‑ATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTACGGGCGa > 2:594479/1‑140 (MQ=255) tATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑C‑ATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTACGGGCGAAGTg > 2:1016007‑M2/1‑139 (MQ=255) tGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑C‑ATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTACGGGCGAAGTgta < 2:659294‑M2/140‑4 (MQ=255) tGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑C‑ATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTACGGGCGAAGTgta < 2:1016417‑M2/140‑4 (MQ=255) | GCCAGCAGTATAGTGTTGCACAGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑C‑ATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTACGGGCGAAGTGTA > NC_000913/377213‑377490 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |