| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 2,785,401 | IS2 (+) +5 bp | intergenic (‑390/+357) | ypjC ← / ← ileY | DUF5507 domain‑containing protein YpjC/tRNA‑Ile |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 2785401 = | 0 (0.000) | 57 (1.220) | 39/274 | 0.2 | 100% | intergenic (‑390/+361) | ypjC/ileY | DUF5507 domain‑containing protein YpjC/tRNA‑Ile |
| ? | NC_000913 | 2996361 = | NA (NA) | noncoding (1331/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 2785405 | 0 (0.000) | 50 (1.060) | 39/276 | 0.2 | 100% | intergenic (‑394/+357) | ypjC/ileY | DUF5507 domain‑containing protein YpjC/tRNA‑Ile |
| ? | NC_000913 | = 2997691 | NA (NA) | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
GTGGAATTAAGTAATTAACGATAAAGCCAGAGTATTATCATTTATTATACCCCTTCATTTAATCAGGTTAATTACTCAAATCACTGAACTATTCTCTGTTCGCTCACTGATGATAAGTGAGTACCACAACCAATGt‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/2785535‑2785401‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAG > NC_000913/2996361‑2996500 GTGGAATTAAGTAATTAACGATAAAGCCAGAGTATTATCATTTATTATACCCCTTCATTTAATCAGGTTAATTACTCAAATCACTGAACTATTCTCTGTTCGCTCACTGATGATAAGTGAGTACCCCAACCAATGTGGAT < 1:662432/140‑1 AACGATAAAGCCAGAGTATTATCATTTATTATACCCCTTCATTTAATCAGGTTAATTACTCAAATCACTGAACTATTCTCTGTTCGCTCACTGATGATAAGTGAGTACCACAACCAATGTGGATTTGCCCCTATATTTCC > 2:404702/1‑140 TAAAGCCAGAGTATTATCATTTATTATACCCCTTCATTTAATCAGGTTAATTACTCAAATCACTGAACTATTCTCTGTTCGCTCACTGATGATAAGTGAGTACCACAACCAATGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACA > 2:496594/1‑140 AAAGCCAGAGTATTATCATTTATTATACCCCTTCATTTAATCAGGTTAATTACTCAAATCACTGAACTATTCTCTGTTCGCTCACTGATGATAAGTGAGTACCACAACCAATGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACAT < 1:496594/140‑1 ATCATTTATTATACCCCTTCATTTAATCAGGTTAATTACTCAAATCACTGAACTATTCTCTGTTCGCTCACTGATGATAAGTGAGTACCACAACCAATGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACT > 1:514877/1‑137 ATCATTTATTATACCCCTTCATTTAATCAGGTTAATTACTCAAATCACTGAACTATTCTCTGTTCGCTCACTGATGATAAGTGAGTACCACAACCAATGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACT < 2:514877/137‑1 TTTATTATACCCCTTCATTTAATCAGGTTAATTACTCAAATCACTGAACTATTCTCTGTTCGCTCACTGATGATAAGTGAGTACCACAACCAATGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCA > 1:320514/1‑140 TTTATTATACCCCTTCATTTAATCAGGTTAATTACTCAAATCACTGAACTATTCTCTGTTCGCTCACTGATGATAAGTGAGTACCACAACCAATGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACAT > 1:132060/1‑122 TTTATTATACCCCTTCATTTAATCAGGTTAATTACTCAAATCACTGAACTATTCTCTGTTCGCTCACTGATGATAAGTGAGTACCACAACCAATGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACAT < 2:132060/122‑1 TACCCCTTCATTTAATCAGGTTAATTACTCAAATCACTGAACTATTCTCTGTTCGCTCACTGATGATAAGTGAGTACCACAACCAATGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAG > 1:459104/1‑140 TACCCCTTCATTTAATCAGGTTAATTACTCAAATCACTGAACTATTCTCTGTTCGCTCACTGATGATAAGTGAGTACCACAACCAATGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAG > 2:164212/1‑140 TACCCCTTCATTTAATCAGGTTAATTACTCAAATCACTGAACTATTCTCTGTTCGCTCACTGATGATAAGTGAGTACCACAACCAATGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAG > 1:436478/1‑140 CCTTCATTTAATCAGGTTAATTACTCAAATCACTGAACTATTCTCTGTTCGCTCACTGATGATAAGTGAGTACCACAACCAATGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCG > 2:32133/1‑140 CTTCATTTAATCAGGTTAATTACTCAAATCACTGAACTATTCTCTGTTCGCTCACTGATGATAAGTGAGTACCACAACCAATGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGC > 1:66795/1‑140 TTCATTTAATCAGGTTAATTACTCAAATCACTGAACTATTCTCTGTTCGCTCACTGATGATAAGTGAGTACCACAACCAATGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCT > 1:106488/1‑140 TTCATTTAATCAGGTTAATTACTCAAATCACTGAACTATTCTCTGTTCGCTCACTGATGATAAGTGAGTACCACAACCAATGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACC > 1:710046/1‑125 TTCATTTAATCAGGTTAATTACTCAAATCACTGAACTATTCTCTGTTCGCTCACTGATGATAAGTGAGTACCACAACCAATGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACC < 2:710046/125‑1 TCATTTAATCAGGTTAATTACTCAAATCACTGAACTATTCTCTGTTCGCTCACTGATGATAAGTGAGTACCACAACCAATGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTG > 2:468194/1‑140 TCATTTAATCAGGTTAATTACTCAAATCACTGAACTATTCTCTGTTCGCTCACTGATGATAAGTGAGTACCACAACCAATGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTG > 1:203065/1‑140 TCATTTAATCAGGTTAATTACTCAAATCACTGAACTATTCTCTGTTCGCTCACTGATGATAAGTGAGTACCACAACCAATGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACC < 2:390681/124‑1 TCATTTAATCAGGTTAATTACTCAAATCACTGAACTATTCTCTGTTCGCTCACTGATGATAAGTGAGTACCACAACCAATGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACC > 1:390681/1‑124 TCATTTAATCAGGTTAATTACTCAAATCACTGAACTATTCTCTGTTCGCTCACTGATGATAAGTGAGTACCACAACCAATGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATAACTTAACCCATTACAAGCCCGCTG > 1:116776/1‑140 CATTTAATCAGGTTAATTACTCAAATCACTGAACTATTCTCTGTTCGCTCACTGATGATAAGTGAGTACCACAACCAATGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGC > 2:399249/1‑140 TTTAATCAGGTTAATTACTCAAATCACTGAACTATTCTCTGTTCGCTCACTGATGATAAGTGAGTACCACAACCAATGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCG < 2:203065/140‑1 TTAATCAGGTTAATTACTCAAATCACTGAACTATTCTCTGTTCGCTCACTGATGATAAGTGAGTACCACAACCAATGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGC < 1:399249/140‑1 GTTAATTACTCAAATCACTGAACTATTCTCTGTTCGCTCACTGATGATAAGTGAGTACCACAACCAATGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTC > 2:783512/1‑140 GTTAATTACTCAAATCACTGAACTATTCTCTGTTCGCTCACTGATGATAAGTGAGTACCACAACCAATGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTC > 1:596327/1‑140 CTCAAATCACTGAACTATTCTCTGTTCGCTCACTGATGATAAGTGAGTACCACAACCAATGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCG < 2:459104/140‑1 CAAATCACTGAACTATTCTCTGTTCGCTCACTGATGATAAGTGAGTACCACAACCAATGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAG > 1:477444/1‑140 ATCACTGAACTATTCTCTGTTCGCTCACTGATGATAAGTGAGTACCACAACCAATGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGA > 2:36226/1‑140 CACTGAACTATTCTCTGTTCGCTCACTGATGATAAGTGAGTACCACAACCAATGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATA < 2:596327/140‑1 CACTGAACTATTCTCTGTTCGCTCACTGATGATAAGTGAGTACCACAACCAATGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATA < 2:436478/140‑1 CACTGAACTATTCTCTGTTCGCTCACTGATGATAAGTGAGTACCACAACCAATGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATA > 1:743363/1‑140 CACTGAACTATTCTCTGTTCGCTCACTGATGATAAGTGAGTACCACAACCAATGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATA < 2:106488/140‑1 TGAACTATTCTCTGTTCGCTCACTGATGATAAGTGAGTACCACAACCAATGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACC < 1:404702/140‑1 TATTCTCTGTTCGCTCACTGATGATAAGTGAGTACCACAACCAATGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCG < 1:468194/140‑1 TCTCTGTTCGCTCACTGATGATAAGTGAGTACCACAACCAATGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCAC < 2:320514/140‑1 TCTCTGTTCGCTCACTGATGATAAGTGAGTACCACAACCAATGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCAC < 2:743363/140‑1 TGTTCGCTCACTGATGATAAGTGAGTACCACAACCAATGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATG > 1:586783/1‑140 TTCGCTCACTGATGATAAGTGAGTACCACAACCAATGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCG > 1:44127/1‑140 CTCACTGATGATAAGTGAGTACCACAACCAATGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATG < 1:783512/140‑1 TCACTGATGATAAGTGAGTACCACAACCAATGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCG > 2:133533/1‑126 TCACTGATGATAAGTGAGTACCACAACCAATGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCG < 1:133533/126‑1 CACTGATGATAAGTGAGTACCACAACCAATGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCC < 1:4137/140‑1 CACTGATGATAAGTGAGTACCACAACCAATGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGA > 2:368811/1‑136 CACTGATGATAAGTGAGTACCACAACCAATGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGA < 1:368811/136‑1 CTGATGATAAGTGAGTACCACAACCAATGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCGGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCAT < 1:164212/140‑1 TAAGTGAGTACCACAACCAATGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTAT < 2:59441/140‑1 gacagGTACCACAACCAATGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAA > 2:454174/6‑140 TGAGTACCACAACCAATGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATG > 1:303388/1‑140 TACCACAACCAATGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCATGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCG > 1:524612/1‑140 ACCACAACCAATGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGA > 1:476520/1‑140 CCACAACCAATGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAA > 2:283590/1‑140 AACCAATGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCC > 1:384348/1‑140 TGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCA > 1:527044/1‑140 GTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAA < 2:74300/140‑1 GTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAA > 1:522664/1‑140 TGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAG > 2:452860/1‑140 TGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAG > 1:651220/1‑140 GTGGAATTAAGTAATTAACGATAAAGCCAGAGTATTATCATTTATTATACCCCTTCATTTAATCAGGTTAATTACTCAAATCACTGAACTATTCTCTGTTCGCTCACTGATGATAAGTGAGTACCACAACCAATGt‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/2785535‑2785401‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAG > NC_000913/2996361‑2996500 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |