Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
JC NC_000913 2,765,463 (TATGGCAC)6→7 intergenic (‑310/+50) abpA ← / ← yfjM CP4‑57 prophage; anti‑bacteriophage protein/CP4‑57 prophage; protein YfjM

New junction evidence
  seq id position reads (cov) reads (cov) score skew freq annotation gene product
* ? NC_000913 = 27654110 (0.000)59 (0.830)
+GCACTATG
36/156 0.1 100% intergenic (‑258/+102) abpA/yfjM CP4‑57 prophage; anti‑bacteriophage protein/CP4‑57 prophage; protein YfjM
?NC_000913 2765412 = 0 (0.000)intergenic (‑259/+101) abpA/yfjM CP4‑57 prophage; anti‑bacteriophage protein/CP4‑57 prophage; protein YfjM

AGCTTTTCAGGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACATACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAACACAGTTGCACGCATTATTTCCTGGTTGGTAGGGTCATATCTCGAT  >  NC_000913/2765273‑2765544
                                                                                                                                           |                                                                                                                                    
aggattccacaaatattgtaaccctgacgtctaatttggttatataacatactgccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatgg                                                                                                                                      <  2:477268‑M2/1‑1 (MQ=255)
       cacaaatattgtaaccctgacgtctaatttggttatataacatactgccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatg                                                                                                                               >  2:585169‑M2/133‑140 (MQ=255)
       cacaaatattgtaaccctgacgtctaatttggttatataacatactgccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatg                                                                                                                               >  1:76564‑M2/133‑140 (MQ=255)
        acaaatattgtaaccctgacgtctaatttggttatataacatactgccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccgaccgcactatggcactatgg                                                                                                                              <  1:685869‑M2/9‑1 (MQ=255)
        acaaatattgtaaccctgacgtctaatttggttatataacatactgccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatgg                                                                                                                              <  1:309474‑M2/9‑1 (MQ=255)
              attgtaaccctgacgtctaatttggttatataacatactgccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactat                                                                                                                        <  1:557380‑M2/15‑1 (MQ=255)
                tgtaaccctgacgtctaatttggttatataacatactgccccaactaatgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatgg                                                                                                                      <  1:999488‑M2/17‑1 (MQ=255)
                        tgacgtctaatttggttatataacatactgccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatggcactatgg                                                                                                              <  2:929792‑M2/25‑1 (MQ=255)
                          acgtctaatttggttatataacatactgccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatggcactatggca                                                                                                            <  2:1240214‑M2/27‑1 (MQ=255)
                          acgtctaatttggttatataacatactgccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatggcactatggca                                                                                                            <  2:806723‑M2/27‑1 (MQ=255)
                          acgtctaatttggttatataacatactgccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatggcactatggca                                                                                                            >  1:786676‑M2/114‑140 (MQ=255)
                          acgtctaatttggttatataacatactgccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatggcactatggca                                                                                                            <  2:11514‑M2/27‑1 (MQ=255)
                             tctaatttggttatataacatactgccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatggcactatggcacta                                                                                                         <  2:546708‑M2/30‑1 (MQ=255)
                               taatttggttatataacatactgccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatg                                                                                                       >  1:343329‑M2/109‑140 (MQ=255)
                                aatttggttatataacatactgccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatgg                                                                                                      <  1:406959‑M2/33‑1 (MQ=255)
                                   ttggttatataacatactgccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagtacagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcac                                                                                                   <  2:436187‑M2/36‑1 (MQ=255)
                                      gttatataacatactgccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactat                                                                                                <  2:51897‑M2/39‑1 (MQ=255)
                                            taacatactgccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcgctatggcactatggcactatggcactatggcactatggcact                                                                                          <  2:786676‑M2/45‑1 (MQ=255)
                                             aacatactgccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcacta                                                                                         >  1:1169642‑M2/95‑140 (MQ=255)
                                                 tactgccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggc                                                                                     >  1:1060904‑M2/91‑140 (MQ=255)
                                                 tactgccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggc                                                                                     >  1:275803‑M2/91‑140 (MQ=255)
                                                 tactgccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggc                                                                                     >  1:680335‑M2/91‑140 (MQ=255)
                                                    tgccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCAcc                                                                                  >  1:128682‑M2/88‑140 (MQ=255)
                                                    tgccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCAcc                                                                                  >  2:736506‑M2/88‑140 (MQ=255)
                                                    tgccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCAcc                                                                                  >  2:1188468‑M2/88‑140 (MQ=255)
                                                    tgccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCAcc                                                                                  >  1:217592‑M2/88‑140 (MQ=255)
                                                    tgccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCAcc                                                                                  >  1:54626‑M2/88‑140 (MQ=255)
                                                     gccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCg                                                                                 >  1:384470‑M2/87‑140 (MQ=255)
                                                     gccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCg                                                                                 >  2:729214‑M2/87‑140 (MQ=255)
                                                     gccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCg                                                                                 >  1:529422‑M2/87‑140 (MQ=255)
                                                      ccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatg                                                                                       <  2:534413‑M2/48‑1 (MQ=255)
                                                      ccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatg                                                                                       >  1:534413‑M2/86‑133 (MQ=255)
                                                      ccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactat                                                                                                >  1:455633‑M2/86‑124 (MQ=255)
                                                      ccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactat                                                                                                <  2:455633‑M2/39‑1 (MQ=255)
                                                      ccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGc                                                                                >  2:1107106‑M2/86‑140 (MQ=255)
                                                      ccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGc                                                                                >  2:255818‑M2/86‑140 (MQ=255)
                                                      ccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGc                                                                                >  2:699043‑M2/86‑140 (MQ=255)
                                                      ccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGc                                                                                >  2:725836‑M2/86‑140 (MQ=255)
                                                      ccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGc                                                                                >  2:921959‑M2/86‑140 (MQ=255)
                                                      ccccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGc                                                                                >  2:792195‑M2/86‑140 (MQ=255)
                                                       cccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGcc                                                                               <  2:890317‑M2/56‑1 (MQ=255)
                                                        ccaactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCa                                                                              >  2:933277‑M2/84‑140 (MQ=255)
                                                         caactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAg                                                                             >  1:99308‑M2/83‑140 (MQ=255)
                                                          aactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatgg                                                                                      >  1:753538‑M2/82‑130 (MQ=255)
                                                          aactaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatggcactatgg                                                                                      <  2:753538‑M2/49‑1 (MQ=255)
                                                           actaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCg                                                                           <  2:128682‑M2/60‑1 (MQ=255)
                                                            ctaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGa                                                                          <  2:569866‑M2/61‑1 (MQ=255)
                                                            ctaacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGa                                                                          <  2:60404‑M2/61‑1 (MQ=255)
                                                             taacgtaaggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGAt                                                                         <  2:443244‑M2/62‑1 (MQ=255)
                                                                     ggtaggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATca                                                                 >  1:171491‑M2/71‑140 (MQ=255)
                                                                         ggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatatttcagggctgagtccgccaaccgcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACt                                                             <  2:171491‑M2/74‑1 (MQ=255)
                                                                         ggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACt                                                             >  2:833240‑M2/67‑140 (MQ=255)
                                                                         ggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACt                                                             <  2:54626‑M2/74‑1 (MQ=255)
                                                                         ggcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACt                                                             <  2:99308‑M2/74‑1 (MQ=255)
                                                                          gcacagccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACtt                                                            <  2:1169642‑M2/75‑1 (MQ=255)
                                                                                ccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGAtatt                                                      >  2:651895‑M2/60‑140 (MQ=255)
                                                                                ccttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGAtatt                                                      >  1:964109‑M2/60‑140 (MQ=255)
                                                                                 cttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGAtatta                                                     <  2:882423‑M2/82‑1 (MQ=255)
                                                                                 cttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGAtatta                                                     <  1:585169‑M2/82‑1 (MQ=255)
                                                                                  ttaatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGAtattat                                                    <  1:729214‑M2/83‑1 (MQ=255)
                                                                                   taatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATtata                                                   <  1:792195‑M2/84‑1 (MQ=255)
                                                                                    aatcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATaa                                                  <  2:275803‑M2/85‑1 (MQ=255)
                                                                                     atcaaggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATaaa                                                 <  1:352122‑M2/86‑1 (MQ=255)
                                                                                          ggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAAcaca                                            >  2:482415‑M2/50‑140 (MQ=255)
                                                                                          ggttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAAcaca                                            >  2:842155‑M2/50‑140 (MQ=255)
                                                                                           gttttggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAACACAg                                           <  1:1107106‑M2/92‑1 (MQ=255)
                                                                                               tggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAACACAGTTGc                                       >  1:1005270‑M2/45‑140 (MQ=255)
                                                                                                ggttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAACACAGTTGCa                                      <  1:970834‑M2/97‑1 (MQ=255)
                                                                                                  ttttcaaatagttcagagctgagaccgccaaccgcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAACACAGTTGCACg                                    <  1:833240‑M2/99‑1 (MQ=255)
                                                                                                           agttcagagctgagaccgccaaccgcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAACACAGTTGCACGCATTATTTc                           <  1:1052697‑M2/108‑1 (MQ=255)
                                                                                                                agagctgagaccgccaaccgcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAACACAGTTGCACGCATTATTTCCtggt                      <  1:921959‑M2/113‑1 (MQ=255)
                                                                                                                    ctgagaccgccaaccgcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTAGGGCTCCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAACACAGTTGCACGCATTATTTCCtggttggt                  <  1:167903‑M2/117‑1 (MQ=255)
                                                                                                                      gagaccgccaaccgcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAACACAGTTGCACGCATTATTTCCTGGTTGGTAg                <  1:156141‑M2/119‑1 (MQ=255)
                                                                                                                       agaccgccaaccgcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAACACAGTTGCACGCATTATTTCCTGGTTGGTAgg               >  2:598685‑M2/21‑140 (MQ=255)
                                                                                                                       agaccgccaaccgcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAACACAGTTGCACGCATTATTTCCTGGTTGGTAgg               >  2:1201244‑M2/21‑140 (MQ=255)
                                                                                                                       agaccgccaaccgcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAACACAGTTGCACGCATTATTTCCTGGTTGGTAgg               >  2:491338‑M2/21‑140 (MQ=255)
                                                                                                                            gccaaccgcactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAACACAGTTGCACGCATTATTTCCTGGTTGGTAGGGTCat          >  1:586533‑M2/16‑140 (MQ=255)
                                                                                                                                    cactatgGCACTATGGCACTATGGCATTATGGCACTATGGCACTATGGCACTAGGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACGCGTGATATTATAAAACACAGTTGCACGCATTATTTCCTGGTTGGTAGGGTCATATCTCGAt  <  2:180322‑M2/133‑1 (MQ=255)
                                                                                                                                    cactatgGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAACACAGTTGCACGCATTATTTCCTGGTTGGTAGGGTCATATCTCGAt  <  1:1188468‑M2/133‑1 (MQ=255)
                                                                                                                                           |                                                                                                                                    
AGCTTTTCAGGATTCCACAAATATTGTAACCCTGACGTCTAATTTGGTTATATAACATACTGCCCCAACTAACGTAAGGTAGGCACAGCCTTAATCAAGGTTTTGGTTTTCAAATAGTTCAGAGCTGAGACCGCCAACCGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACTATGGCACCGCCAGCGATTGTAATCACACTTGATATTATAAAACACAGTTGCACGCATTATTTCCTGGTTGGTAGGGTCATATCTCGAT  >  NC_000913/2765273‑2765544

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: 
Reads not counted as support for junction
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint.
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication.