| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,541,787 | C→A | L461M (CTG→ATG) | feoB → | Fe(2(+)) transporter FeoB |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,541,787 | 0 | C | A | 96.2% | 176.2 / ‑0.6 | 53 | coding (1381/2322 nt) | feoB | Fe(2(+)) transporter FeoB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base A (20/31); minor base . (1/1); total (21/32) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.19e-01 | |||||||||||
GCACCGCGTGAACGTCTGATGACCATCATGATGGCACCGTTTATGTCCTGCGGCGCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCGGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGTATATGCTGGGTATTGTGATGGCGGTGCTGACTGGCCTGATGCTCAAGTACACCATCATGCGCGGTGAAGCGACGCCGTTTGTCATGGAGTTGCCGGTCTATCATGTACCACACGTTAAAAGCCTGATTATCCAGACCTGGC > NC_000913/3541652‑3541922 | gCACCGCGTGAACGTCTGATGACCATCATGATGGCACCGTTTATGTCCTGCGGCGCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCGGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGTATATGATggg < 2:43989/140‑1 (MQ=255) cACCGCGTGAACGTCTGATGACCATCATGATGGCACCGTTTATGTCCTGCGGCGCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCGGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGTATATGATGGGt < 1:333694/140‑1 (MQ=255) ccGCGTGAACGTCTGATGACCATCATGATGGCACCGTTTATGTCCTGCGGCGCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCGGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGTATATGATGGGTAt > 1:140711/1‑140 (MQ=255) gcgTGAACGTCTGATGACCATCATGATGGCACCGTTTATGTCCTGCGGCGCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCGGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGTATATGATGGGTATtg > 1:208760/1‑140 (MQ=255) gcgTGAACGTCTGATGACCATCATGATGGCACCGTTTATGTCCTGCGGCGCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCGGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGTATATGATGGGTATtg > 1:224157/1‑140 (MQ=255) gcgTGAACGTCTGATGACCATCATGATGGCACCGTTTATGTCCTGCGGCGCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCGGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGTATATGATGGGTATtg > 1:641635/1‑140 (MQ=255) cTGATGACCATCATGATGGCACCGTTTATGTCCTGCGGCGCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCGGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGTATATGATGGGTATTGTGATGGCGGt < 1:580931/140‑1 (MQ=255) tcatGATGGCACCGTTTATGTCCTGCGGCGCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCGGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGTATATGATGGGTATTGTGATGGCGGTGCTGACTGGc > 2:430719/1‑140 (MQ=255) tcatGATGGCACCGTTTATGTCCTGCGGCGCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCGGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGTATATGATGGGTATTGTGATGGCGGTGCTGACTGGc > 2:611962/1‑140 (MQ=255) catGATGGCACCGTTTATGTCCTGCGGCGCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCGGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGTATATGATGGGTATTGTGATGGCGGTGCTGACTGGcc < 1:430719/140‑1 (MQ=255) ggCACCGTTTATGTCCTGCGGCGCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCGGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGTATATGATGGGTATTGTGATGGCGGTGCTGACTGGCCTGATGc > 1:188290/1‑140 (MQ=255) cACCGTTTATGTCCTGCGGCGCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCGGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGTATATGATGGGTATTGTGATGGCGGTGCTGACTGGCCTGATGCTc < 1:441870/140‑1 (MQ=255) cACCGTTTATGTCCTGCGGCGCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCGGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGTATATGATGGGTATTGTGATGGCGGTGCTGACTGGCCTGATGCTc < 2:838429/140‑1 (MQ=255) gTCCTGCGGCGCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCGGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGTATATGATGGGTATTGTGATGGCGGTGCTGACTGGCCTGATGCTCAAGTACACca > 2:351834/1‑140 (MQ=255) cTGCGGCGCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCGGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGTATATGATGGGTATTGTGATGGCGGCGCTGACTGGCCTGATGCTCAAGTACACcatca > 2:773846/1‑140 (MQ=255) cTGCGGCGCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCGGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGTATA‑‑‑TGAGTATTGTGATGGCGGTGCTGACTGGCCTGATGCTCAAGTACACCATCATgc > 1:476343/1‑140 (MQ=255) tGCGGCGCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCGGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGTATATGATGGGTATTGTGATGGCGGTGCTGACTGGCCTGATGCTCAAGTACACcatcat < 2:322032/140‑1 (MQ=255) gcggcgCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCGGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGTATATGATGGGTATTGTGATGGCGGTGCTGACTGGCCTGATGCTCAAGTACACCATCATg > 2:483104/1‑140 (MQ=255) cggcgCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCGGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGTATATGATGGGTATTGTGATGGCGGTGCTGACTGGCCTGATGCTCAAGTACACCATCATgc > 2:53092/1‑140 (MQ=255) ggcgCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCGGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGTATATGATGGGTATTGTGATGGCGGTGCTGACTGGCCTGATGCTCAAGTACACCATCATgcg < 1:236955/140‑1 (MQ=255) ggcgCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCGGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGTATATGATGGGTATTGTGATGGCGGTGCTGACTGGCCTGATGCTCAAGTACACCATCATgcg < 1:626153/140‑1 (MQ=255) cgcgTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCGGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGTATATGATGGGTATTGTGATGGCGGTGCTGACTGGCCTGATGCTCAAGTACACCATCATGCGCGGt > 1:379326/1‑140 (MQ=255) ggCTATCTTCGCAGTATTCGCGGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGTATATGATGGGTATTGTGATGGCGGTGCTGACTGGCCTGATGCTCAAGTACACCATCATGCGCGGTGAAGCGa < 1:552675/140‑1 (MQ=255) ggCTATCTTCGCAGTATTCGCGGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGTATATGATGGGTATTGTGATGGCGGTGCTGACTGGCCTGATGCTCAAGTACACCATCATGCGCGGTGAAGCGa < 2:224157/140‑1 (MQ=255) cTTCGCAGTATTCGCGGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGTATATGATGGGTATTGTGATGGCGGTGCTGACTGGCCTGATGCTCAAGTACACCATCATGCGCGGTGAAGCGACGCCGt > 2:546817/1‑140 (MQ=255) cTTCGCAGTATTCGCGGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGTATATGATGGGTATTGTGATGGCGGTGCTGACTGGCCTGATGCTCAAGTACACCATCATGCGCGGTGAAGCGACGCCGt < 2:273472/140‑1 (MQ=255) ttCGCAGTATTCGCGGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGTATATGATGGGTATTGTGATGGCGGTGCTGACTGGCCTGATGCTCAAGTACACCATCATGCGCGGTGAAGCGACGCCGtt < 2:413071/140‑1 (MQ=255) tCGCAGTATTCGCGGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGTATATGATGGGTATTGTGATGGCGGTGCTGACTGGCCTGATGCTCAAGTACACCATCATGCGCGGTGAAGCGACGCCGttt < 1:483104/140‑1 (MQ=255) tCGCAGTATTCGCGGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGTATA‑‑‑TGAGTATTGTGATGGCGGTGCTGACTGGCCTGATGCTCAAGTACACCATCATGCGCGGTGAAGCGACGCCGTTTGTc < 2:476343/140‑1 (MQ=255) cAGTATTCGCGGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGTATATGATGGGTATTGTGATGGCGGTGCTGACTGGCCTGATGCTCAAGTACACCATCATGCGCGGTGAAGCGACGCCGTTTGTc > 2:614895/1‑140 (MQ=255) cgcgGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGTATATGATGGGTATTGTGATGGCGGTGCTGACTGGCCTGATGCTCAAGTACACCATCATGCGCGGTGAAGCGACGCCGTTTGTCATGGAGt < 1:546817/140‑1 (MQ=255) gcgGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGTATATGATGGGTATTGTGATGGCGGTGCTGACTGGCCTGATGCTCAAGTACACCATCATGCGCGGTGAAGCGACGCCGTTTGTCATGGAGtt > 1:814975/1‑140 (MQ=255) gcgGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGTATATGATGGGTATTGTGATGGCGGTGCTGACTGGCCTGATGCTCAAGTACACCATCATGCGCGGTGAAGCGACGCCGTTTGTCATGGAGtt > 2:816483/1‑140 (MQ=255) gCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGTATATGATGGGTATTGTGATGGCGGTGCTGACTGGCCTGATGCTCAAGTACACCATCATGCGCGGTGAAGCGACGCCGTTTGTCATGGAGTTGcc < 1:291728/140‑1 (MQ=255) tGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGTATATGATGGGTATTGTGATGGCGGTGCTGACTGGCCTGATGCTCAAGTACACCATCATGCGCGGTGAAGCGACGCCGTTTGTCATGGAGTTGCCgg > 2:743717/1‑140 (MQ=255) tGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGTATATGATGGGTATTGTGATGGCGGTGCTGACTGGCCTGATGCTCAAGTACACCATCATGCGCGGTGAAGCGACGCCGTTTGTCATGGAGTTGCCgg > 2:917456/1‑140 (MQ=255) tGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGTATATGATGGGTATTGTGATGGCGGTGCTGACTGGCCTGATGCTCAAGTACACCATCATGCGCGGTGAAGCGACGCCGTTTGTCATGGAGTTGCCgg > 2:356318/1‑140 (MQ=255) gCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGTATATGATGGGTATTGTGATGGCGGTGCTGACTGGCCTGATGCTCAAGTACACCATCATGCGCGGTGAAGCGACGCCGTTTGTCATGGAGTTGCCGGt < 1:446545/140‑1 (MQ=255) gCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGTATATGATGGGTATTGTGATGGCGGTGCTGACTGGCCTGATGCTCAAGTACACCATCATGCGCGGTGAAGCGACGCCGTTTGTCATGGAGTTGCCGGt < 2:172210/140‑1 (MQ=255) ttcttcGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGTATATTATGGGTATTGTGATGGCGGTGCTGACTGGCCTGATGCTCAAGTACACCATCATGCGCGGTGAAGCGACGCCGTTTGTCATGGAGTTGCCGGTCTa < 2:707523/140‑1 (MQ=255) ttcttcGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGTATATGATGGGTATTGTGATGGCGGTGCTGACTGGCCTGATGCTCAAGTACACCATCATGCGCGGTGAAGCGACGCCGTTTGTCATGGAGTTGCCGGTCTa < 2:802136/140‑1 (MQ=255) tcttcGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGTATATGATGGGTATTGTGATGGCGGTGCTGACTGGCCTGATGCTCAAGTACACCATCATGCGCGGTGAAGCGACGCCGTTTGTCATGGAGTTGCCGGTCTAt < 2:171053/140‑1 (MQ=255) cttcGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGTATATGATGGGTATTGTGATGGCGGTGCTGACTGGCCTGATGCTCAAGTACACCATCATGCGCGGTGAAGCGACGCCGTTTGTCATGGAGTTGCCGGTCTATc < 2:641635/140‑1 (MQ=255) gCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGTATATGATGGGTATTGTGATGGCGGTGCTGACTGGCCTGATGCTCAAGTACACCATCATGCGCGGTGAAGCGACGCCGTTTGTCATGGAGTTGCCGGTCTATCATGTAc < 1:53092/140‑1 (MQ=255) gTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGTATATGATGGGTATTGTGATGGCGGTGCTGACTGGCCTGATGCTCAAGTACACCATCATGCGCGGTGAAGCGACGCCGTTTGTCATGGAGTTGCCGGTCTATCATGTACCACACGtt < 1:816483/140‑1 (MQ=255) gcTGGCGGTCTTCTCGCTGTATATGATGGGTATTGTGATGGCGGTGCTGACTGGCCTGATGCTCAAGTACACCATCATGCGCGGTGAAGCGACGCCGTTTGTCATGGAGTTGCCGGTCTATCATGTACCACACGTTaaaa < 2:360988/140‑1 (MQ=255) cTGGCGGTCTTCTCGCTGTATATGATGGGTATTGTGATGGCGGTGCTGACTGGCCTGATGCTCAAGTACACCATCATGCGCGGTGAAGCGACGCCGTTTGTCATGGAGTTGCCGGTCTATCATGTACCACACGTTAAAAg < 2:379326/140‑1 (MQ=255) cTGGCGGTCTTCTCGCTGTATATGATGGGTATTGTGATGGCGGTGCTGACTGGCCTGATGCTCAAGTACACCATCATGCGCGGTGAAGCGACGCCGTTTGTCATGGAGTTGCCGGTCTATCATGTACCACACGTTAAAAg < 1:752945/140‑1 (MQ=255) gCGGTCTTCTCGCTGTATATGATGGGTATTGTGATGGCGGTGCTGACTGGCCTGATGCTCAAGTACACCATCATGCGCGGTGAAGCGACGCCGTTTGTCATGGAGTTGCCGGTCTATCATGTACCACACGTTAAAAGCCt > 2:630881/1‑140 (MQ=255) ttctCGCTGTATATGATGGGTATTGTGATGGCGGTGCTGACTGGCCTGATGCTCAAGTACACCATCATGCGCGGTGAAGCGACGCCGTTTGTCATGGAGTTGCCGGTCTATCATGTACCACACGTTAAAAGCCTGATTAt < 1:917456/140‑1 (MQ=255) ttctCGCTGTATATGATGGGTATTGTGATGGCGGTGCTGACTGGCCTGATGCTCAAGTACACCATCATGCGCGGTGAAGCGACGCCGTTTGTCATGGAGTTGCCGGTCTATCATGTACCACACGTTAAAAGCCTGATTAt < 1:351834/140‑1 (MQ=255) ctcGCTGTATATGATGGGTATTGTGATGGCGGTGCTGACTGGCCTGATGCTCAAGTACACCATCATGCGCGGTGAAGCGACGCCGTTTGTCATGGAGTTGCCGGTCTATCATGTACCACACGTTAAAAGCCTGATTATcc < 1:614895/140‑1 (MQ=255) tatGATGGGTATTGTGATGGCGGTGCTGACTGGCCTGATGCTCAAGTACACCATCATGCGCGGTGAAGCGACGCCGTTTGTCATGGAGTTGCCGGTCTATCATGTACCACACGTTAAAAGCCTGATTATCCAGACCTGGc < 2:188290/140‑1 (MQ=255) | GCACCGCGTGAACGTCTGATGACCATCATGATGGCACCGTTTATGTCCTGCGGCGCGCGTCTGGCTATCTTCGCAGTATTCGCGGCTGCCTTCTTCGGGCAGAACGGTGCGCTGGCGGTCTTCTCGCTGTATATGCTGGGTATTGTGATGGCGGTGCTGACTGGCCTGATGCTCAAGTACACCATCATGCGCGGTGAAGCGACGCCGTTTGTCATGGAGTTGCCGGTCTATCATGTACCACACGTTAAAAGCCTGATTATCCAGACCTGGC > NC_000913/3541652‑3541922 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |