New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | NC_000913 | 2744101 = | 164 (1.080) | coding (477/483 nt) | yfiB | lipoprotein YfiB | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 176 total aligned reads displayed.
TGGCCGATGCATGGGCTATGGGTGGACAAATTCCACGCAGCAATCTCACCACACAGGGTTTAGGAAAAAAATATCCCATAGCCAGTAACAAGACCGCCCAGGGCCGCGCCGAGAACCGCCGCGTCGCAGTGGTGATTACTACCCCTTAAAACACCAGCAAACAGATAAAAAAGGGCCAGCCAATTGGCCAGCCCTTCTTAACAGGATGTCGCTTAAGCGAAATCTTAGTTAAGACGCTCTTTGATACGAGCAGCCTTACCAGTACGCTCACGCAGG > NC_000913/2743959‑2744234 | tGGCCGATGCATGGGCTATGGGTGGACAAATTCCACGCAGCAATCTCACCACACAGGGTTTAGGAAAAAAATATCCCATAGCCAGTAACAAGACCGCCCAGGGCCGCGCCGAGAACCGCCGCGTCGCAGTGGTGATtact < 1:2477692/140‑1 (MQ=255) tGGCCGATGCATGGGCTATGGGTGGACAAATTCCACGCAGCAATCTCACCACACAGGGTTTAGGAAAAAAATATCCCATAGCCAGTAACAAGACCGCCCAGGGCCGCGCCGAGAACCGCCGCGTCGCAGTGGTGATtact < 2:917542/140‑1 (MQ=255) ggCCGATGCATGGGCTATGGGTGGACAAATTCCACGCAGCAATCTCACCACACAGGGTTTAGGAAAAAAATATCCCATAGCCAGTAACAAGACCGCCCAGGGCCGCGCCGAGAACCGCCGCGTCGCAGTGGTGATtacta < 1:33248/140‑1 (MQ=255) ggCCGATGCATGGGCTATGGGTGGACAAATTCCACGCAGCAATCTCACCACACAGGGTTTAGGAAAAAAATATCCCATAGCCAGTAACAAGACCGCCCAGGGCCGCGCCGAGAACCACCGCGTCGCAGTGGTGATtacta < 1:1574078/140‑1 (MQ=255) ggCCGATGCATGGGCTATGGGTGGACAAATTCCACGCAGCAATCTCACCACACAGGGTTTAGGAAAAAAATATCCCATAGCCAGTAACAAGACCGCCCAGGGCCCCGCCGAGAACCGCCGCGTCGCAGTGGTGATtacta < 2:1888951/140‑1 (MQ=255) gCCGATGCATGGGCTATGGGTGGACAAATTCCACGCAGCAATCTCACCACACAGGGTTTAGGAAAAAAATATCCCATAGCCAGTAACAAGACCGCCCAGGGCCGCGCCGAGAACCGCCGCGTCGCAGTGGTGATtactac < 2:499660/140‑1 (MQ=255) aTGCATGGGCTATGGGTGGACAAATTCCACGCAGCAATCTCACCACACAGGGTTTAGGAAAAAAATATCCCATAGCCAGTAACAAGACCGCCCAGGGCCGCGCCGAGAACCGCCGCGTCGCAGTGGTGATTACTACCCCt > 1:2403448/1‑140 (MQ=255) tGCATGGGCTATGGGTGGACAAATTCCACGCAGCAATCTCACCACACAGGGTTTAGGAAAAAAATATCCCATAGCCAGTAACAAGACCGCCCAGGGCCGCGCCGAGAACCGCCGCGTCGCAGTGGTGATTACTACCCCtt > 2:1356140/1‑140 (MQ=255) tGCATGGGCTATGGGTGGACAAATTCCACGCAGCAATCTCACCACACAGGGTTTAGGAAAAAAATATCCCATAGCCAGTAACAAGACCGCCCAGAGCCGCGCCGAGAACCGCCGCGTCGCAGTGGTGATTACTACCCCtt > 1:1575447/1‑140 (MQ=255) cTATGTGTGGACAATTTCCACGCAGCATTCTCACCACACAGGGTTAAGAAAAAAAATATCCCATAGCCGGTAACAAGACCGCCCAGGGGCGCGCCGAGAGCCGCCGCGTCGCAGTGGTGATTACTACCCCTTAAAACAcc < 2:1575447/140‑1 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2:894650/140‑1 (MQ=255) aCCGCCGCGTCGCAGTGGTGATTACTACCCCTTAAAACACCAGCAAACAGATAAAAAAGGGCCAGCCAATTGGCCAGCCCTTCTTAACAGGATGTCGCTTAAGCGAAATCTTAGTTAAGACGCTCTTTGATACGagcagc < 1:2126271/140‑1 (MQ=255) aCCGCCGCGTCGCAGTGGTGATTACTACCCCTTAAAACACCAGCAAACAGATAAAAAAGGGCCAGCCAATTGGCCAGCCCTTCTTAACAGGATGTCGCTTAAGCGAAATCTTAGTTAAGACGCTCTTTGATACGagcagc < 2:563039/140‑1 (MQ=255) aCCGCCGCGTCGCAGTGGTGATTACTACCCCTTAAAACACCAGCAAACAGATAAAAAAGGGCCAGCCAATTGGCCAGCCCTTCTTAACAGGATGTCGCTTAAGCGAAATCTTAGTTAAGACGCTCTTTGATACGagcagc < 2:1463991/140‑1 (MQ=255) cGCAGTGGTGATTACTACCCCTTAAAACACCAGCAAACAGATAAAAAAGGGCCAGCCAATTGGCCAGCCCTTCTTAACAGGATGTCGCTTAAGCGAAATCTTAGTTAAGACGCTCTTTGATACGAGCAGCCTTACCAGTa < 2:1411840/140‑1 (MQ=255) cAGTGGTGATTACTACCCCTTAAAACACCAGCAAACAGATAAAAAAGGGCCAGCCAATTGGCCAGCCCTTCTTAACAGGATGTCGCTTAAGCGAAATCTTAGTTAAGACGCTCTTTGATACGAGCAGCCTTACCAGTACg < 1:89474/140‑1 (MQ=255) cAGTGGTGATTACTACCCCTTAAAACACCAGCAAACAGATAAAAAAGGGCCAGCCAATTGGCCAGCCCTTCTTAACAGGATGTCGCTTAAGCGAAATCTTAGTTAAGACGCTCTTTGATACGAGCAGCCTTACCAGTACg < 1:1304082/140‑1 (MQ=255) gtggtgATTACTACCCCTTAAAACACCAGCAAACAGATAAAAAAGGGCCAGCCAATTGGCCAGCCCTTCTTAACAGGATGTCGCTTAAGCGAAATCTTAGTTAAGACGCTCTTTGATACGAGCAGCCTTACCAGTACGCt < 1:1945942/140‑1 (MQ=255) gtggtgATTACTACCCCTTAAAACACCAGCAAACAGATAAAAAAGGGCCAGCCAATTGGCCAGCCCTTCTTAACAGGATGTCGCTTAAGCGAAATCTTAGTTAAGACGCTCTTTGATACGAGCAGCCTTACCAGTACGCt < 1:1639531/140‑1 (MQ=255) tggtcATTTCTACCCATTAAACCACCAGCAAAGAGATAAAAAAGGGCCAGCCAAATGGCCAGCCCTTCTTAACAGGATGTCGCTTAAGCGAAAACTTAGTTAAGACGCTCTTTGATACGAGCAGCCTTACCAGTACGCTc < 2:2309634/140‑1 (MQ=255) gtgATTACTACCCCTTAAAACACCAGCAAACAGATAAAAAAGGGCCAGCCAATTGGCCAGCCCTTCTTAACAGGATGTCGCTTAAGCGAAATCTTAGTTAAGACGCTCTTTGATACGAGCAGCCTTACCAGTACGCTCAc > 1:2453844/1‑140 (MQ=255) gtgATTACTACCCCTTAAAACACCAGCAAACAGATAAAAAAGGGCCAGCCAATTGGCCAGCCCTTCTTAACAGGATGTCGCTTAAGCGAAATCTTAGTTAAGACGCTCTTTGATACGAGCAGCCTTACCAGTACGCTCAc < 2:2453844/140‑1 (MQ=255) aTTACTACCCCTTAAAACACCAGCAAACAGATAAAAAAGGGCCAGCCAATTGGCCAGCCCTTCTTAACAGGATGTCGCTTAAGCGAAATCTTAGTTAAGACGCTCTTTGATACGAGCAGCCTTACCAGTACGCTCACGCa < 1:2509475/140‑1 (MQ=255) tactacCCCTTAAAACACCAGCAAACAGATAAAAAAGGGCCAGCCAATTGGCCAGCCCTTCTTAACAGGATGTCGCTTAAGCGAAATCTTAGTTAAGACGCTCTTTGATACGAGCAGCCTTACCAGTACGCTc > 2:1722813/1‑133 (MQ=255) tactacCCCTTAAAACACCAGCAAACAGATAAAAAAGGGCCAGCCAATTGGCCAGCCCTTCTTAACAGGATGTCGCTTAAGCGAAATCTTAGTTAAGACGCTCTTTGATACGAGCAGCCTTACCAGTACGCTCACGCAgg < 2:2056612/140‑1 (MQ=255) | TGGCCGATGCATGGGCTATGGGTGGACAAATTCCACGCAGCAATCTCACCACACAGGGTTTAGGAAAAAAATATCCCATAGCCAGTAACAAGACCGCCCAGGGCCGCGCCGAGAACCGCCGCGTCGCAGTGGTGATTACTACCCCTTAAAACACCAGCAAACAGATAAAAAAGGGCCAGCCAATTGGCCAGCCCTTCTTAACAGGATGTCGCTTAAGCGAAATCTTAGTTAAGACGCTCTTTGATACGAGCAGCCTTACCAGTACGCTCACGCAGG > NC_000913/2743959‑2744234 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |