| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 1428524 = | 164 (1.280) | 36 (0.300) +GCA |
8/258 | 6.7 | 19.0% | noncoding (271/1196 nt) | IS5 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 2067082 | NA (NA) | noncoding (272/1195 nt) | IS5 | repeat region | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
GCCATGGCAGAATATGACCGCTGTCATCGAGCCGTTTTATCCCAAGGCGGGCAATGGCCGACGGCCCTATCCGCTGGAGACCATGCTGCGTATTCACTGCATGCAGCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/1428631‑1428524‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTGGTACAACCTGAGCGATGGCGCGATGGAAGATGCTCTGTACGAAATCGCCTCCATGCGTCTGTTTGCCCGGTTATCCCTGGATAGCGCCTTGCCGGACCGCACCACCATCATGAATTTCCGCCACCTGCTGGAGCAG < NC_000913/2067082‑2066944 ||| GCCATGGCAGAATATGACCGCTGTCATCGAGCCGTTTTATCCCAAGGCGGGCAATGGCCGACGGCCCTATCCGCTGGAGACCATGCTGCGTATTCACTGCAT‑‑‑GCAGCATTGGTACAACCTGAGCGATGGCGCGATGGAAG < 1:509042/140‑1 GGCAGAATATGACCGCTGTCATCGAGCCGTTTTATCCCAAGGCGGGCAATGGCCGACGGCCCTATCCGCTGGAGACCATGCTGCGTATTCACTGCAT‑‑‑GCAGCATTGGTACAACCTGAGCGATGGCGCGATGGAAGATGCT < 1:527170/140‑1 ACCGCTGTCATCGAGCCGTTTTATCCCAAGGCGGGCAATGGCCGACGGCCCTATCCGCTGGAGACCATGCTGCGTATTCACTGCAT‑‑‑GCAGCATTGGTACAACCTGAGCGATGGCGCGATGGAAGATGCTCTGTACGAAAT > 2:1147849/1‑140 CCGCTGTCATCGAGCCGTTTTATCCCAAGGCGGGCAATGGCCGACGGCCCTATCCGCTGGAGACCATGCTGCGTATTCACTGCAT‑‑‑GCAGCATTGGTACAACCTGAGCGATGGCGCGATGGAAGATGCTCTGTACGAAATC > 1:944390/1‑140 TTTATCCCAAGGCGGGCAATGGCCGACGGCCCTATCCGCTGGAGACCATGCTGCGTATTCACTGCAT‑‑‑GCAGCATTGGTACAACCTGAGCGATGGCGCGATGGAAGATGCTCTGTACGAAATCGCCTCCATGCGTCTGTTT < 2:944390/140‑1 TTTATCCCAAGGCGGGCAATGGCCGACGGCCCTATCCGCTGGAGACCATGCTGCGTATTCACTGCAT‑‑‑GCAGCATTGGTACAACCTGAGCGATGGCGCGATGGAAGATGCTCTGTACGAAATCGCCTCCATGCGTCTGTTT < 1:760843/140‑1 CAAGGCGGGCAATGGCCGACGGCCCTATCCGCTGGAGACCATGCTGCGTATTCACTGCAT‑‑‑GCAGCATTGGTACAACCTGAGCGATGGCGCGATGGAAGATGCTCTGTACGAAATCGCCTCCATGCGTCTGTTTGCCCGGT < 1:1147849/140‑1 CAAGGCGGGCAATGGCCGACGGCCCTATCCGCTGGAGACCATGCTGCGTATTCACTGCAT‑‑‑GCAGCATTGGTACAACCTGAGCGATGGCGCGATGGAAGATGCTCTGTACGAAATCGCCTCCATGCGTCTGTTTGCCCGGT < 2:1697570/140‑1 ATGGCCGACGGCCCTATCCGCTGGAGACCATGCTGCGTATTCACTGCAT‑‑‑GCAGCATTGGTACAACCTGAGCGATGGCGCGATGGAAGATGCTCTGTACGAAATCGCCTCCATGCGTCTGTTTGCCCGGTTATCCCTGGAT < 2:1807803/140‑1 ATGGCCGACGGCCCTATCCGCTGGAGACCATGCTGCGTATTCACTGCAT‑‑‑GCAGCATTGGTACAACCTGAGCGATGGCGCGATGGAAGATGCTCTGTACGAAATCGCCTCCATGCGTCTGTTTGCCCGGTTATCCCTGGAT < 2:1009600/140‑1 CTGGAGACCATGCTGCGTATTCACTGCAT‑‑‑GCAGCATTGGTACAACCTGAGCGATGGCGCGATGGAAGATGCTCTGTACGAAATCGCCTCCATGCGTCTGTTTGCCCGGTTATCCCTGGATAGCGCCTTGCCGGACCGCAC > 1:1104462/1‑140 tgcgGCATTGGTACAACCTGAGCGATGGCGCGATGGAAGATGCTCTGTACGAAATCGCCTCCATGCGTCTGTTTGCCCGGTTATCCCTGGATAGCGCCTTGCCGGACCGCACCACCATCATGAATTTCCGCCACCTGCTG > 1:974305/5‑140 GCAGCATTGGTACAACCTGAGCGATGGCGCGATGGAAGATGCTCTGTACGAAATCGCCTCCATGCGTCTGTTTGCCCGGTTATCCCTGGATAGCGCCTTGCCGGACCGCACCACCATCATGAATTTCCGCCACCTGCTGG < 1:854289/140‑1 cgGCATTGGTACAACCTGAGCGATGGCGCGATGGAAGATGCTCTGTACGAAATCGCCTCCATGCGTCTGTTTGCCCGGTTATCCCTGGATAGCGCCTTGCCGGACCGCACCACCATCATGAATTTCCGCCACCTGCTGGA < 2:974305/138‑1 CAGCATTGGTACAACCTGAGCGATGGCGCGATGGAAGATTCTCTGTACGAAATCGCCTCCATGCGTCTGTTTGCCCGGTTATCCCTGGATAGCGCCTTGCCGGACCGCACCACCATCATGAATTTCCGCCACCTGCTGGA < 1:685814/140‑1 CAGCATTGGTACAACCTGAGCGATGGCGCGATGGAAGATGCTCTGTACGAAATCGCCTCCATGCGTCTGTTTGCCCGGTTATCCCTGGATAGCGCCTTGCCGGACCGCACCACCATCATGAATTTCCGCCACCTGCTGGA > 2:1516228/1‑140 CAGCATTGGTACAACCTGAGCGATGGCGCGATGGAAGATGCTCTGTACGAAATCGCCTCCATGCGTCTGTTTGCCCGGTTATCCCTGGATAGCGCCTTGCCGGACCGCACCACCATCATGAATTTCCGCCACCTGCTGGA > 1:1263705/1‑140 CAGCATTGGTACAACCTGAGCGATGGCGCGATGGAAGATGCTCTGTACGAAATCGCCTCCATGCGTCTGTTTGCCCGGTTATCCCTGGATAGCGCCTTGCCGGACCGCACCACCATCATGAATTTCCGCCACCTGCTGGA > 2:1773338/1‑140 CAGCATTGGTACAACCTGAGCGATGGCGCGATGGAAGATGCTCTGTACGAAATCGCCTCCATGCGTCTGTTTGCCCGGTTATCCCTGGATAGCGCCTTGCCGGACCGCACCACCATCATGAATTTCCGCCACCTGCTGGA < 1:1132047/140‑1 CAGCATTGGTACAACCTGAGCGATGGCGCGATGGAAGATGCTCTGTACGAAATCGCCTCCATGCGTCTGTTTGCCCGGTTATCCCTGGATAGCGCCTTGCCGGACCGCACCACCATCATGAATTTCCGCCACCTGCTGGA < 1:782152/140‑1 CAGCATTGGTACAACCTGAGCGATGGCGCGATGGAAGATGCTCTGTACGAAATCGCCTCCATGCGTCTGTTTGCCCGGTTATCCCTGGATAGCGCCTTGCCGGACCGCACCACCATCATGAATTTCCGCCACCTGCTGGA < 1:652557/140‑1 CAGCATTGGTACAACCTGAGCGATGGCGCGATGGAAGATGCTCTGTACGAAATCGCCTCCATGCGTCTGTTTGCCCGGTTATCCCTGGATAGCGCCTTGCCGGACCGCACCACCATCATGAATTTCCGCCACCTGCTGGA > 2:760311/1‑140 CAGCATTGGTACAACCTGAGCGATGGCGCGATGGAAGATGCTCTGTACGAAATCGCCTCCATGCGTCTGTTTGCCCGGTTATCCCTGGATAGCGCCTTGCCGGACCGCACCACCATCATGAATTTCCGCCACCTGCTGGA > 2:765998/1‑140 CAGCATTGGTACAACCTGAGCGATGGCGCGATGGAAGATGCTCTGTACGAAATCGCCTCCATGCGTCTGTTTGCCCGGTTATCCCTGGATAGCGCCTTGCCGGACCGCACCACCATCATGAATTTCCGCCACCTGCTGGA > 2:833277/1‑140 CAGCATTGGTACAACCTGAGCGATGGCGCGATGGAAGATGCTCTGTACGAAATCGCCTCCATGCGTCTGTTTGCCCGGTTATCCCTGGATAGCGCCTTGCCGGACCGCACCACCATCATGAATTTCCGCCACCTGCTGGA > 2:886649/1‑140 CAGCATTGGTACAACCTGAGCGATGGCGCGATGGAAGATGCTCTGTACGAAATCGCCTCCATGCGTCTGTTTGCCCGGTTATCCCTGGATAGCGCCTTGCCGGACCGCACCACCATCATGAATTTCCGCCACCTGCTGGA > 1:211646/1‑140 CAGCATTGGTACAACCTGAGCGATGGCGCGATGGAAGATGCTCTGTACGAAATCGCCTCCATGCGTCTGTTTGCCCGGTTATCCCTGGATAGCGCCTTGCCGGACCGCACCACCATCATGAATTTCCGCCACCTGCTGGA > 1:24283/1‑140 AGCATTGGTACAACCTGAGCGATGGCGCGATGGAAGATGCTCTGTACGAAATCGCCTCCATGCGTCTGTTTGCCCGGTTATCCCTGGATAGCGCCTTGCCGGACCGCACCACCATCATGAATTTCCGCCACCTGCTGGAG < 2:697070/140‑1 AGCATTGGTACAACCTGAGCGATGGCGCGATGGAAGATGCTCTGTACGAAATCGCCTCCATGCGTCTGTTTGCCCGGTTATCCCTGGATAGCGCCTTGCCGGACCGCACCACCATCATGAATTTCCGCCACCTGCTGGAG < 2:1545623/140‑1 AGCATTGGTACAACCTGAGCGATGGCGCGATGGAAGATGCTCTGTACGAAATCGCCTCCATGCGTCTGTTTGCCCGGTTATCCCTGGATAGCGCCTTGCCGGACCGCACCACCATCATGAATTTCCGCCACCTGCTGGAG < 2:956114/140‑1 AGCATTGGTACAACCTGAGCGATGGCGCGATGGAAGATGCTCTGTACGAAATCGCCTCCATGCGTCTGTTTGCCCGGTTATCCCTGGATAGCGCCTTGCCGGACCGCACCACCATCATGAATTTCCGCCACCTGCTGGAG < 1:1012777/140‑1 AGCATTGGTACAACCTGAGCGATGGCGCGATGGAAGATGCTCTGTACGAAATCGCCTCCATGCGTCTGTTTGCCCGGTTATCCCTGGATAGCGCCTTGCCGGACCGCACCACCATCATGAATTTCCGCCACCTGCTGGAG < 2:90044/140‑1 AGCATTGGTACAACCTGAGCGATGGCGCGATGGAAGATGCTCTGTACGAAATCGCCTCCATGCGTCTGTTTGCCCGGTTATCCCTGGATAGCGCCTTGCCGGACCGCACCACCATCATGAATTTCCGCCACCTGCTGGAG < 1:270408/140‑1 AGCATTGGTACAACCTGAGCGATGGCGCGATGGAAGATGCTCTGTACGAAATCGCCTCCATGCGTCTGTTTGCCCGGTTATCCCTGGATAGCGCCTTGCCGGACCGCACCACCATCATGAATTTCCGCCACCTGCTGGAG < 2:2026726/140‑1 AGCATTGGTACAACCTGAGCGATGGCGCGATGGAAGATGCTCTGTACGAAATCGCCTCCATGCGTCTGTTTGCCCGGTTATCCCTGGATAGCGCCTTGCCGGACCGCACCACCATCATGAATTTCCGCCACCTGCTGGAG < 1:760311/140‑1 AGCATTGGTACAACCTGAGCGATGGCGCGATGGAAGATGCTCTGTACGAAATCGCCTCCATGCGTCTGTTTGCCCGGTTATCCCTGGATAGCGCCTTGCCGGACCGCACCACCATCATGAATTTCCGCCACCTGCTGGAG < 1:705153/140‑1 AGCATTGGTACAACCTGAGCGATGGCGCGATGGAAGATGCTCTGTACGAAATCGCCTCCATGCGTCTGTTTGCCCGGTTATCCCTGGATAGCGCCTTGCCGGACCGCACCACCATCATGAATTTCCGCCACCTGCTGGAG < 2:468279/140‑1 AGCATTGGTACAACCTGAGCGATGGCGCGATGGAAGATGCTCTGTACGAAATCGCCTCCATGCGTCTGTTTGCCCGGTTATCCCTGGATAGCGCCTTGCCGGACCGCACCACCATCATGAATTTCCGCCACCTGCTGGAG < 2:654550/140‑1 GCATTGGTACAACCTGAGCGATGGCGCGATGGAAGATGCTCTGTACGAAATCGCCTCCATGCGTCTGTTTGCCCGGTTATCCCTGGATAGCGCCTTGCCGGACCGCACCACCATCATGAATTTCCGCCACCTGCTGGAGC > 2:1821656/1‑140 GCATTGGTACAACCTGAGCGATGGCGCGATGGAAGATGCTCTGTACGAAATCGCCTCCATGCGTCTGTTTGCCCGGTTATCCCTGGATAGCGCCTTGCCGGACCGCACCACCATCATGAATTTCCGCCACCTGCTGGAGC > 1:1291891/1‑140 GCATTGGTACAACCTGAGCGATGGCGCGATGGAAGATGCTCTGTACGAAATCGCCTCCATGCGTCTGTTTGCCCGGTTATCCCTGGATAGCGCCTTGCCGGACCGCACCACCATCATGAATTTCCGCCACCTGCTGGAGC > 1:1534197/1‑140 GCATTGGTACAACCTGAGCGATGGCGCGATGGAAGATGCTCTGTACGAAATCGCCTCCATGCGTCTGTTTGCCCGGTTATCCCTGGATAGCGCCTTGCCGGACCGCACCACCATCATGAATTTCCGCCACCTGCTGGAGC > 1:514462/1‑140 GCATTGGTACAACCTGAGCGATGGCGCGATGGAAGATGCTCTGTACGAAATCGCCTCCATGCGTCTGTTTGCCCGGTTATCCCTGGATAGCGCCTTGCCGGACCGCACCACCATCATGAATTTCCGCCACCTGCTGGAGC > 1:654399/1‑140 GCATTGGTACAACCTGAGCGATGGCGCGATGGAAGATGCTCTGTACGAAATCGCCTCCATGCGTCTGTTTGCCCGGTTATCCCTGGATAGCGCCTTGCCGGACCGCACCACCATCATGAATTTCCGCCACCTGCTGGAGC > 1:534857/1‑140 GCATTGGTACAACCTGAGCGATGGCGCGATGGAAGATGCTCTGTACGAAATCGCCTCCATGCGTCTGTTTGCCCGGTTATCCCTGGATAGCGCCTTGCCGGACCGCACCACCATCATGAATTTCCGCCACCTACTGGAGC > 1:168316/1‑140 CATTGGTACAACCTGAGCGATGGCGCGATGGAAGATGCTCTGTACGAAATCGCCTCCATGCGTCTGTTTGCCCGGTTATCCCTGGATAGCGCCTTGCCGGACCGCACCACCATCATGAATTTCCGCCACCTGCTGGAGCA > 1:1925910/1‑140 CATTGGTACAACCTGAGCGATGGCGCGATGGAAGATGCTCTGTACGAAATCGCCTCCATGCGTCTGTTTGCCCGGTTATCCCTGGATAGCGCCTTGCCGGACCGCACCACCATCATGAATTTCCGCCACCTGCTGGAGCA > 2:881386/1‑140 CATTGGTACAACCTGAGCGATGGCGCGATGGAAGATGCTCTGTACGAAATCGCCTCCATGCGTCTGTTTGCCCGGTTATCCCTGGATAGCGCCTTGCCGGACCGCACCACCATCATGAATTTACGCCACCTGCTGGAGCA > 1:682848/1‑140 ATTGGTACAACCTGAGCGATGGCGCGATGGAAGATGCTCTGTACGAAATCGCCTCCATGTGTCTGTTTGCCCGGTTATCCCTGGATAGCGCCTTGCCGGACCGCACCACCATCATGAATTTCCGCCACCTGCTGGAGCAG > 1:863547/1‑140 ATTGGTACAACCTGAGCGATGGCGCGATGGAAGATGCTCTGTACGAAATCGCCTCCATGTGTCTGTTTGCCCGGTTATCCCTGGATAGCGCCTTGCCGGACCGCACCACCATCATGAATTTCCGCCACCTGCTGGAGCAG > 1:211463/1‑140 ATTGGTACAACCTGAGCGATGGCGCGATGGAAGATGCTCTGTACGAAATCGCCTCCATGCGTCTGTTTGCCCGGTTATCCCTGGATAGCGCCTTGCCGGACCGCACCACCATCATGAATTTCCGCCACCTGCTGGAGCAG < 1:1854917/140‑1 ATTGGTACAACCTGAGCGATGGCGCGATGGAAGATGCTCTGTACGAAATCGCCTCCATGCGTCTGTTTGCCCGGTTATCCCTGGATAGCGCCTTGCCGGACCGCACCACCATCATGAATTTCCGCCACCTGCTGGAGCAG > 1:1726932/1‑140 ATTGGTACAACCTGAGCGATGGCGCGATGGAAGATGCTCTGTACGAAATCGCCTCCATGCGTCTGTTTGCCCGGTTATCCCTGGATAGCGCCTTGCCGGACCGCACCACCATCATGAATTTCCGCCACCTGCTGGAGCAG < 1:1967563/140‑1 ATTGGTACAACCTGAGCGATGGCGCGATGGAAGATGCTCTGTACGAAATCGCCTCCATGCGTCTGTTTGCCCGGTTATCCCTGGATAGCGCCTTGCCGGACCGCACCACCATCATGAATTTCCGCCACCTGCTGGAGCAG > 2:926603/1‑140 ATTGGTACAACCTGAGCGATGGCGCGATGGAAGATGCTCTGTACGAAATCGCCTCCATGCGTCTGTTTGCCCGGTTATCCCTGGATAGCGCCTTGCCGGACCGCACCACCATCATGAATTTCCGCCACCTGCTGGAGCAG > 2:791569/1‑140 ATTGGTACAACCTGAGCGATGGCGCGATGGAAGATGCTCTGTACGAAATCGCCTCCATGCGTCTGTTTGCCCGGTTATCCCTGGATAGCGCCTTGCCGGACCGCACCACCATCATGAATTTCCGCCACCTGCTGGAGCAG > 2:771504/1‑140 ATTGGTACAACCTGAGCGATGGCGCGATGGAAGATGCTCTGTACGAAATCGCCTCCATGCGTCTGTTTGCCCGGTTATCCCTGGATAGCGCCTTGCCGGACCGCACCACCATCATGAATTTCCGCCACCTGCTGGAGCAG < 1:1582559/140‑1 ATTGGTACAACCTGAGCGATGGCGCGATGGAAGATGCTCTGTACGAAATCGCCTCCATGCGTCTGTTTGCCCGGTTATCCCTGGATAGCGCCTTGCCGGACCGCACCACCATCATGAATTTCCGCCACCTGCTGGAGCAG > 2:613599/1‑140 ATTGGTACAACCTGAGCGATGGCGCGATGGAAGATGCTCTGTACGAAATCGCCTCCATGCGTCTGTTTGCCCGGTTATCCCTGGATAGCGCCTTGCCGGACCGCACCACCATCATGAATTTCCGCCACCTGCTGGAGCAG > 2:510226/1‑140 ATTGGTACAACCTGAGCGATGGCGCGATGGAAGATGCTCTGTACGAAATCGCCTCCATGCGTCTGTTTGCCCGGTTATCCCTGGATAGCGCCTTGCCGGACCGCACCACCATCATGAATTTCCGCCACCTGCTGGAGCAG > 2:497270/1‑140 ATTGGTACAACCTGAGCGATGGCGCGATGGAAGATGCTCTGTACGAAATCGCCTCCATGCGTCTGTTTGCCCGGTTATCCCTGGATAGCGCCTTGCCGGACCGCACCACCATCATGAATTTCCGCCACCTGCTGGAGCAG > 2:2091103/1‑140 ATTGGTACAACCTGAGCGATGGCGCGATGGAAGATGCTCTGTACGAAATCGCCTCCATGCGTCTGTTTGCCCGGTTATCCCTGGATAGCGCCTTGCCGGACCGCACCACCATCATGAATTTCCGCCACCTGCTGGAGCAG > 1:1580220/1‑140 ATTGGTACAACCTGAGCGATGGCGCGATGGAAGATGCTCTGTACGAAATCGCCTCCATGCGTCTGTTTGCCCGGTTATCCCTGGATAGCGCCTTGCCGGACCGCACCACCATCATGAATTTCCGCCACCTGCTGGAGCAG > 2:185290/1‑140 ATTGGTACAACCTGAGCGATGGCGCGATGGAAGATGCTCTGTACGAAATCGCCTCCATGCGTCTGTTTGCCCGGTTATCCCTGGATAGCGCCTTGCCGGACCGCACCACCATCATGAATTTCCGCCACCTGCTGGAGCAG > 1:1509896/1‑140 ATTGGTACAACCTGAGCGATGGCGCGATGGAAGATGCTCTGTACGAAATCGCCTCCATGCGTCTGTTTGCCCGGTTATCCCTGGATAGCGCCTTGCCGGACCGCACCACCATCATGAATTTCCGCCACCTGCTGGAGCAG > 2:1032092/1‑140 ATTGGTACAACCTGAGCGATGGCGCGATGGAAGATGCTCTGTACGAAATCGCCTCCATGCGTCTGTTTGCCCGGTTATCCCTGGATAGCGCCTTGCCGGACCGCACCACCATCATGAATTTCCGCCACCTGCTGGAGCAG > 2:1104500/1‑140 ATTGGTACAACCTGAGCGATGGCGCGATGGAAGATGCTCTGTACGAAATCGCCTCCATGCGTCTGTTTGCCCGGTTATCCCTGGATAGCGCCTTGCCGGACCGCACCACCATCATGAATTTCCGCCACCTGCTGGAG > 2:27299/1‑137 ATTGGTACAACCTGAGCGATGGCGCGATGGAAGATGCTCTGTACGAAATCGCCTCCATGCGTCTGTTTGCCCGGTTATCCCTGGATAGCGCCTTGCCGGACCGCACCACCATCATGAATTTCCGCCACCTGCTGGAG < 1:27299/137‑1 ||| GCCATGGCAGAATATGACCGCTGTCATCGAGCCGTTTTATCCCAAGGCGGGCAATGGCCGACGGCCCTATCCGCTGGAGACCATGCTGCGTATTCACTGCATGCAGCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/1428631‑1428524‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTGGTACAACCTGAGCGATGGCGCGATGGAAGATGCTCTGTACGAAATCGCCTCCATGCGTCTGTTTGCCCGGTTATCCCTGGATAGCGCCTTGCCGGACCGCACCACCATCATGAATTTCCGCCACCTGCTGGAGCAG < NC_000913/2067082‑2066944 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |