Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,628,625 | 0 | A | C | 23.5% | 155.3 / 26.1 | 68 | V105G (GTC→GGC) | pdeF | cyclic di‑GMP phosphodiesterase PdeF |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (47/5); new base C (0/16); total (47/21) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.38e-11 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. |
CTCGCCAGTAATCCTACAAATGCAGCAAACTGGAAAAGTATCAGAAACAGCGTTGCAGGAAACACAATCTGCCAGAATATACGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCAT‑GTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGT‑AACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATG‑ATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCTAAGG‑CGATCCCTGGCAATGCCGCCCAGCTGAAAAA > NC_000913/2628487‑2628764 | cTCGCCAGTAATCCTACAAATGCAGCAAACTGGAAAAGTATCAGAAACAGCGTTGCAGGAAACACAATCTGCCAGAATATACGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCAT‑GTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGAc > 2:1223679/1‑140 (MQ=255) cTCGCCAGTAATCCTACAAATGCAGCAAACTGGAAAAGTATCAGAAACAGCGTTGCAGGAAACACAATCTGCCAGAATATACGCTGGGAAATTAAACGAGTATCACCAT‑GTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGAc > 1:351815/1‑140 (MQ=255) cGCCAGTAATCCTACAAATGCAGCAAACTGGAAAAGTATCAGAAACAGCGTTGCAGGAAACACAATCTGCCAG‑ATATACGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCAT‑GTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCt > 2:415330/1‑140 (MQ=255) tAATCCTACAAATGCAGCAAACTGAAAAAGTATCAGAAACAGCGTTGCAGAAAACACAATCTGCAAGAATATACGCGGGGAAATTAAACGGGTATCCCCAT‑GTGAAACGTTGTTACGCGGGGGAGAAAAGCCCCTGT‑AAc < 2:1844343/140‑1 (MQ=255) aaaTCCTACAAATGCAGCAAACGGGAAAAGTATCAAAAACAGCGTTGCAGGAAACACAATCTGCCAGAATATACGCTGGGAAATTAAACGAGTATCACCAT‑GTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGT‑AAc < 2:351815/139‑1 (MQ=255) ccaaaaaaTGCAGAAAACTGAAAAAGTATCAGAAACAGCGTTGAAGAAAACACAATCTCCAAGAATATACGCGGGAAAATTAAACGGGTACCCCCAT‑GTGAAACGTTGTTCCGCCGGGGAGAAAAGCCCCTGT‑AACCGcc < 2:1144062/135‑1 (MQ=255) aCAAATGCAGCAAACTGGAAAAGTATCAGAAACAGCGTTGCAGGAAACACAATCTGCCAGAATATACGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCAT‑GTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGT‑AACCGCCCCa > 2:438683/1‑140 (MQ=255) aaggcagaaAACTGAAAAAGTAAAAAAAACAGCTTGGAAGAAAACACAATCCGCAAAAATATCCGGGGGAAAATAAAACGGTTACCACCAT‑GTAAACCTTTGTTCCGCGGGGGAGAAAAGCCCCTGT‑AACCGCCCCAACa < 2:1079181/137‑1 (MQ=255) aacgcagcaAGATGGAAAAAAAAGAGAAACCGCGTTGGAAGAAACACAATCTGCCAGAATAGGCGCGGGGAAATAAAAGGGGTATCCCGTT‑GTGAACCGTTGTTCCGCCGGGGAATAAAGCCCTTTT‑AACCGCCCCAACa < 2:301291/137‑1 (MQ=255) aaTGCAGCAAACTTGAAAAGAATCAGAAACAGCGTTGCGGGAAACACAATCTGCCAGAATATACGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCAT‑GTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACTCTGT‑AACCGCCCCAACa > 1:590024/1‑140 (MQ=255) tGCAGAAAACTGAAAAAGTATCAAAAACAGCGTTGCAGAAAACACAATCTGCCAAAATATCCGCTGGAAAATTAAACGGTTACCCCCAT‑GTAAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGCCCCTGT‑AACCGCCCCAACaga < 2:260180/140‑1 (MQ=255) cagcaAACTGGAAAAGTATCAGAAACAGCGTTGCAGGAAACACAATCTGCCAGAATATACGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCAT‑GTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGT‑AACCGCCCCAACAgaga > 1:2004631/1‑140 (MQ=255) aagcaAAGTGGAAAAGAATAAAAACCAGCGTTGGAGAAAACACTATCGGCCAAAATACGCGTGGGAAAATTAAACGGGTCACCCCTT‑GGAAATCGTTGTAACGCCGGGGAGTAAAGCCCCTGT‑AACCGCCCCAACAgaga < 2:1099773/139‑1 (MQ=255) gcaAACTGGAAAAGTATCAGAAACAGCGTTGCAGGAAACACAATCTGCCAGAATATACGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCAT‑GTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGT‑AACCGCCCCAACAGAGaat > 1:816740/1‑140 (MQ=255) caAACTGGAAAAGTATCAGAAACAGCGTTGCAGGAAACACAATCTGCCAGAATATACGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCAT‑GTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGT‑AACCGCCCCAACAGAGaatg > 1:1133465/1‑140 (MQ=255) aaCTGAAAAAGTATCAAAAACAGCGTAGCAGAAACCACAATCTGTAAGAATATACGCGGGAAAATAAACCGGTTATCCCCAT‑GTGAAAGTTTGTTCCGCGGGGGAGTAAAGACCCTGT‑AACCGCCCCAACAGAGaatgat < 2:717353/140‑1 (MQ=255) aaCTGAAAAAGTATAAAAAACAGCGTGGCAGGAAACACAATCTGCCAAAATATCCGCTGGAAAATAAAACGGGTATCACCAT‑GTAAAACGTTGTTCCGCGGGGGAGAAAAGCCCCTGT‑AACCGCCCCAACAGAGaatgat < 2:1419095/140‑1 (MQ=255) tGGAAAAGTATCAGAAACAGCGTTGCAGAAAACACAATCTGCCAGAATATACGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCAT‑GTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGCCCCTGT‑AACCGCCCCAACAGAGaatgataat < 2:781759/140‑1 (MQ=255) ggAAAAGTATCAGAAACAGCGTTGCAGGAAACACAATCTGCCAGAATATACGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCAT‑GTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGT‑AACCGCCCCAACAGAGaatgataact > 1:592138/1‑138 (MQ=255) aaaGTATCAAAAACAGCGTTGCAGAAAACAAAATCTGCAAGAATATACGCTGGAAAATTAACCGGGTACCCCCAT‑GTAAAACTTTGTTACGCCGGGGAGAAAAGCCCCTGT‑AACCGCCCCAACAGAGAatgataatgata < 2:816740/140‑1 (MQ=255) aaaaaCAGTGTTGCACGAAACCAAATTTCCAAAAATATACGTGGAAAAATTAACGGGGTATCACCAG‑ATGAAAGGTTTTCACGCGGGGGAAAAAAGCCCCGGT‑AGCCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAAtt < 2:1133465/138‑1 (MQ=255) aaaCAGCGTTGCAGGAAACACAATCTGCCAGAATATACGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCAT‑GTGAAACGTTGTTACGCGGGGGAGTAAAGCCCCTGC‑AACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAg < 1:142307/140‑1 (MQ=255) aaaCAGCGTTGCAGAAAACACAATCTGCCAGAATATCCGCTGGAAAATAAAACGGGTATCCCCAT‑GTAAAACTTTGTTACGCGGGGGAGTAAAGCCCCTGT‑AACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAg < 2:2054943/140‑1 (MQ=255) aaaCAGCGTTGAAGAAAACACAATCTGCCAAAATATACGCTGGAAAATAAAACGGTTATCACCAT‑GTAAAACGTTGTTACGCGGGGGAGAAAAGCCCCTGT‑AACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAg < 2:116469/140‑1 (MQ=255) aCAGCGTGGCAGAAAAAAAAATCTGCAAAAATATCCGCGGGAAAATAAAAGGGGTATCCCCAT‑GTAAACCTTTTTTCCGCGGGGGAGAAAAGCCCTTGT‑AACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGcc < 2:2075627/140‑1 (MQ=255) cAGCGTTGCAGGAAACACAATCTGCCAGAATATACGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCAT‑GTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGT‑AACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCg > 1:970363/1‑140 (MQ=255) cAGCGTTGCAGAAAACACAATCTGCAAGAATAAACGTTGGGAAATAAAAGGGGTATCACAAT‑GTGAAACGTTTTTACGCCGGGGAGAAAAGCCCCTGT‑AACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCg < 2:570868/140‑1 (MQ=255) acagTTGAAGAAAACAAAATCTGCAAAAAAATCCGCTGGAAAATAAAACGGGTATCCCCAT‑GTGAAACGTTGTTACGCGGGGGAGAAAAGCCCCTGT‑AACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGt < 2:1508794/137‑1 (MQ=255) aGCGTTGCAGGAAACACAATCTGCCAGAATATACGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCAT‑GTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGT‑AACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGt > 1:935272/1‑140 (MQ=255) cGTTGCAGGAAACACAATCTGCCAGAATATACGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCAT‑GTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGT‑AACCGCCCC‑ACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTaa > 1:1343263/1‑140 (MQ=255) gaagaaaaCAAAATCTGCAAAAATATACGCGGGAAAATAAACCGGGTACCACAAT‑GTAAACCTTTTTTCCGCGGGGGAGTAAAGCCCCTTA‑AACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATG‑a < 2:1572703/135‑1 (MQ=255) gAAACACAATCTGCCAGAATATACGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCAT‑GTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGT‑AACCGCCCCAACAGAGAATGATAATAATAATAAAATTAGCCGTTAATG‑ATAGc > 1:2015321/1‑140 (MQ=255) aaCACAATCTGCCAGAATATACGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCAT‑GTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGT‑AACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATG‑ATAGCGt > 2:1143478/1‑140 (MQ=255) cacaATCTGCCAGAATATACGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCAT‑GTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGT‑AACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATG‑ATAGCGttt < 1:464250/140‑1 (MQ=255) acaATCTGCCAGAATATACGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCAT‑GTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGT‑AACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATG‑ATAGCgctgt > 1:758516/1‑136 (MQ=255) acaATCTGCCAGAATATACGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCAT‑GTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGT‑AACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATG‑ATAGCgctgt > 1:1508794/1‑136 (MQ=255) aaTCTGCCAGAATATACGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCAT‑GTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGT‑AACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATG‑ATAGCGTTTCGt > 1:1916379/1‑140 (MQ=255) ccgaccATAATATTCGC‑GGGAAAATAAAGCGGTAATCCCATGGTGAAAC‑TTGTTGCCGCAGGGAATAAAACCCCCGTAAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATG‑ATAGCGTTTCGTaa < 2:828571/136‑1 (MQ=255) tGCCAGAATATACGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCAT‑GTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGT‑AACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATG‑ATAGCGTTTCGTaaaa > 1:1096275/1‑140 (MQ=255) cAGAATATACGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCAT‑GTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGT‑AACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATG‑ATAGCGTTTCGTAAAAAcc > 2:60142/1‑140 (MQ=255) taCGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCAT‑GTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGT‑AACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATG‑ATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGctct > 2:1459038/1‑140 (MQ=255) cGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCAT‑GTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGT‑AACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATG‑ATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGc > 1:2138993/1‑140 (MQ=255) tGGGAAATTAAACGGGTATCACCAT‑GTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGT‑AACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATG‑ATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCata > 1:618905/1‑140 (MQ=255) tGGGAAATTAAACGGGTATCACCAT‑GTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGT‑AACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATG‑ATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCata > 1:1205378/1‑140 (MQ=255) gggAAATTAAACGGGTATCACCAT‑GTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGT‑AACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATG‑ATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCatat > 1:492721/1‑140 (MQ=255) ggAAATTAAACGGGTATCACCAT‑GTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGT‑AACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATG‑ATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATAtt > 2:390820/1‑140 (MQ=255) ggAAATTAAACGGGTATCACCAT‑GTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGT‑AACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATG‑ATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATAtt > 1:1283838/1‑140 (MQ=255) ggAAATTAAACGGGGATCACCAT‑GTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGT‑AACCGCCCCAACAGAGACTGATAATGATAATAAAATTAGCAGTTAATG‑ATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATAtt > 2:1486712/1‑140 (MQ=255) ggggTATCCCCAT‑GAAAAATTTTTTTCCGCGGGGGAGAAAAGCCCCTGA‑AACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATG‑ATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACaaa < 2:761277/139‑1 (MQ=255) ggggTATCCCAAT‑GTGAACCGTTTTTCCGCCGGGGAGTAAAGCCCCTGT‑AACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATG‑ATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACaaa < 2:1341642/139‑1 (MQ=255) cGGGTATCCCCAT‑GTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGCCCCTGT‑AACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATG‑ATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACaaa < 1:1443095/140‑1 (MQ=255) ggttATCACCAT‑GTAAAAGGTTTTTCCGCGGGGGAGAAAAGCCCCTGT‑AACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATG‑ATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACaaaa < 2:1283838/137‑1 (MQ=255) ggTATCACCAT‑GTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGT‑AACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATG‑ATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACaaaaa > 2:688587/1‑140 (MQ=255) tATCACCAT‑GTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGT‑AACC‑CCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATG‑ATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATcc > 1:894020/1‑140 (MQ=255) aTCACCAT‑GTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGT‑AACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATG‑ATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATcc > 2:1814836/1‑140 (MQ=255) aTCACCAT‑GTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGT‑AACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATG‑ATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATcc > 1:363676/1‑140 (MQ=255) tCACCAT‑GTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGT‑AACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATG‑ATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATccc > 1:1685995/1‑140 (MQ=255) aT‑GTGAAACGTTGTTACGCGGGGGAGAAAAGCCCCTGT‑AACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATG‑ATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCTAAgg < 2:935272/140‑1 (MQ=255) aT‑GTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGT‑AACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATG‑ATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCTAAgg < 1:60142/140‑1 (MQ=255) t‑gtgAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGT‑AACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATGATAAAATTAGCCGTTAATG‑ATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCTAAGG‑c > 1:2035583/1‑140 (MQ=255) t‑gtgAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGT‑AACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATG‑ATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCTAAGG‑c > 1:761277/1‑140 (MQ=255) gtgAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGT‑AACCGCCCCAACAGTGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATG‑ATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCTAAGG‑Cg > 1:64126/1‑140 (MQ=255) gtgAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGT‑AACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATG‑ATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCTAAGG‑Cg > 1:1088144/1‑140 (MQ=255) gtgAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGT‑AACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATG‑ATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCTAAGG‑Cg > 2:941861/1‑140 (MQ=255) gtgAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGT‑AACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATG‑ATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCTAAGG‑Cg > 1:709326/1‑140 (MQ=255) gtgAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGT‑AACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATG‑ATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCTAAGG‑Cg > 2:1178625/1‑140 (MQ=255) tgAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGT‑AACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATG‑ATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCTAAGG‑CGa > 2:736191/1‑140 (MQ=255) aaCGTTGTTACGCGGGGGAGAAAAGCCCCTGT‑AACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATG‑ATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCTAAGG‑CGATcc < 2:1685995/140‑1 (MQ=255) gttgttACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGT‑AACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATG‑ATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCTAAGG‑CGATCCCTg > 1:1384840/1‑140 (MQ=255) tttccgcgGGGGAGAAAAGCCCCGGA‑AACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATG‑ATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCTAAGG‑CGATCCCTGGCa < 2:492721/136‑1 (MQ=255) gttACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGT‑AACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATG‑ATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCTAAGG‑CGATCCCTGGCa > 1:1870119/1‑140 (MQ=255) gttACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGT‑AACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATG‑ATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCTAAGG‑CGATCCCTGGCa > 1:363753/1‑140 (MQ=255) ttACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGT‑AACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATG‑ATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCTAAGG‑CGATCCCTGGCaa > 1:81519/1‑140 (MQ=255) ttACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGT‑AACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATG‑ATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCTAAGG‑CGATCCCTGGCaa > 1:57647/1‑140 (MQ=255) gggAGTAAAGACCCTGT‑AACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATG‑ATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCTAAGG‑CGATCCCTGGCAATGCCGccc > 2:474748/1‑140 (MQ=255) gggAGTAAAGACCCTGT‑AACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATG‑ATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCTAAGG‑CGATCCCTGGCAATGCCGccc > 1:61308/1‑140 (MQ=255) gggAGAAAAGCCCCTGA‑AACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATG‑ATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCTAAGG‑CGATCCCTGGCAATGCCGccc < 2:709326/140‑1 (MQ=255) agaaaaGCCCCTGT‑AACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATG‑ATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCTAAGG‑CGATCCCTGGCAATGCCGCCCAGc < 1:114253/137‑1 (MQ=255) aGTAAAGACCCTGT‑AACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATG‑ATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCTAAGG‑CGATCCCTGGCAATGCCGCCCAGc < 1:1459038/140‑1 (MQ=255) tAAAGACCCTGT‑AACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATG‑ATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCTAAGG‑CGATCCCTGGCAATGCCGCCCAGCTg < 2:1096275/140‑1 (MQ=255) aaaGACCCTGT‑AACC‑CCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATG‑ATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCTAAGG‑CGATCCCTGGCAATGCCGCCCAGCTGaa < 2:894020/140‑1 (MQ=255) aaGACCCTGT‑AACCGCCCCAACAGAGAATGATAA‑GGTAATAAAAATAACCGGTAATGAAAACCGTTTGGAAAAAACCCAGCTTGCCAAATTGCCGGAC‑AAAATCCCCAAGGCCAACCCCTGCCAATGCGCCCCAGCTGaa > 2:762528/1‑140 (MQ=255) aCCCTGT‑AACCGCCCCAACAGAGAATGATATTGATAATAAAATTAGCCGTTAATG‑ATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCTAAGG‑CGATCCCTGGCAATGCCGCCCAGCTGaaaaa > 2:2153156/1‑140 (MQ=255) | CTCGCCAGTAATCCTACAAATGCAGCAAACTGGAAAAGTATCAGAAACAGCGTTGCAGGAAACACAATCTGCCAGAATATACGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCAT‑GTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGT‑AACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATG‑ATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCTAAGG‑CGATCCCTGGCAATGCCGCCCAGCTGAAAAA > NC_000913/2628487‑2628764 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |