| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 2518092 = | 34 (0.940) | 8 (0.250) | 7/240 | 2.2 | 20.1% | noncoding (25/76 nt) | alaX | tRNA‑Ala |
| ? | NC_000913 | 2521076 = | 34 (1.080) | noncoding (26/76 nt) | valX | tRNA‑Val | |||||
ACCCGGACGTAGACTGTATTACAAAAGCGGCAAAAAGCAGAGACAAAAAACCCCCGCTTTGCAGCGAGGGTTGGAAATTTGGTGGAGCTAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCTTGCATGCCATGCAAGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATAGCCCCACGATGCGTTTACGTACCAAGTTTGCTGGGTGCAAAATTTGGTGGAGCTAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCTTGCATGCCATGCAAGCGCTCTCCCAGCTGAGCTA > NC_000913/2517962‑2518224 | aCCCGGACGTAGACTGTATTACAAAAGCGGCAAAAAGCAGAGACAAAAAACCCCCGCTTTGCAGCGAGGGTTGGAAATTTGGTGGAGCTAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCTTGCATGCCATGCAAGCGCTCTCCCAg < 1:81535/140‑1 (MQ=255) cGGACGTAGACTGTATTACAAAAGCGGCAAAAAGCAGAGACAAAAAACCCCCGCTTTGCAGCGAGGGTTGGAAATTTGGTGGAGCTAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCTTGCATGCCATGCAAGCGCTCTCCCAGCTg < 1:422229/140‑1 (MQ=255) aggtgctctcccagctgagctaatcacccacttcggtacttcacatttttacaagaaatttagctggcgagaaagtggtgggtgatgacgggatcgaaccgccgaccccctccttgtaagggaggtGCTCTCCCAGCTGa < 2:471958‑M1/14‑1 (MQ=255) aggtgctctcccagctgagctaatcacccacttcggtacttcacatttttacaagaaatttagctggcgagaaagtggtgggtgatgacgggatcgaaccgccgaccccctccttgtaagggaggtGCTCTCCCAGCTGa < 2:229824‑M1/14‑1 (MQ=255) ggtgctctcccagctgagctaatcacccacttcggtacttcacatttttacaagaaatttagctggcgagaaagtggtgggtgatgacgggatcgaaccgccgaccccctccttgtaaggtatctGCTATACAAGCTGAg < 2:58885‑M1/15‑1 (MQ=255) gtgctctcccagctgagctaatcacccacttcggtacttcacatttttacaagaaatttagctggcgagaaagtggtgggtgatgacgggatcgaaccgccgaccccctccttgtaagggaggtGCTCTCCCAGCTGAGc < 1:437285‑M1/16‑1 (MQ=255) tgctctcccagctgagctaatcacccacttcggtacttcacatttttacaagaaatttagctggcgagaaagtggtgggtgatgacgggatcgaaccgccgaccccctccttgtaagggaggtGCTCTCCCAGCTGAGCt > 1:229824‑M1/124‑140 (MQ=255) tATTACAAAAGCGGCAAAAAGCAGAGACAAAAAACCCCCGCTTTGCAGCGAGGGTTGGAAATTTGGTGGAGCTAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCTTGCATGCCATGCAAGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATAGTCCCa > 2:91855/1‑140 (MQ=255) tATTACAAAAGCGGCAAAAAGCAGAGACAAAAAACCCCCGCTTTGCAGCGAGGGTTGGAAATTTGGTGGAGCTAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCTTGCATGCCATGCAAGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATAGCCCCa > 1:252328/1‑140 (MQ=255) tATTACAAAAGCGGCAAAAAGCAGAGACAAAAAACCCCCGCTTTGCAGCGAGGGGTGGAAATTTGGTGGAGCTAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCTTGCATGCCATGCAAGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATAGCCCCa > 1:104251/1‑140 (MQ=255) cAAAAGCGGCAAAAAGCAGAGACAAAAAACCCCCGCTTTGCAGCGAGGGTTGGAAATTTGGTGGAGCTAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCTTGCATGCCATGCAAGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATAGCCCCACGATg < 2:413108/140‑1 (MQ=255) gCGGCAAAAAGCAGAGACAAAAAACCCCCGCTTTGCAGCGAGGGTTGGAAATTTGGTGGAGCTAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCTTGCATGCCATGCAAGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATAGCCCCACGATGCGttt > 1:216374/1‑140 (MQ=255) gCGGCAAAAAGCAGAGACAAAAAACCCCCGCTTTGCAGCGAGGGTTGGAAATTTGGTGGAGCTAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCTTGCATGCCATGCAAGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATAGCCCCACGATGCGttt > 2:435014/1‑140 (MQ=255) gCGGCAAAAAGCAGAGACAAAAAACCCCCGCTTTGCAGCGAGGGTTGGAAATTTGGTGGAGCTAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCTTGCATGCCATGCAAGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATAGCCCCACGATGCGttt > 2:122568/1‑140 (MQ=255) gCGGCAAAAAGCAGAGACAAAAAACCCCCGCTTTGCAGCGAGGGTTGGAAATTTGGTGGAGCTAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCTTGCATGCCATGCAAGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATAGCCCCACGATGCGttt > 1:530001/1‑140 (MQ=255) gCGGCAAAAAGCAGAGACAAAAAACCCCCGCTTTGCAGCGAGGGTTGGAAATTTGGTGGAGCTAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCTTGCATGCCATGCAAGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATAGCCCCACGATGCGttt > 1:312781/1‑140 (MQ=255) cGGCAAAAAGCAGAGACAAAAAACCCCCGCTTTGCAGCGAGGGTTGGAAATTTGGTGGAGCTAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCTTGCATGCCATGCAAGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATAGCCCCACGATGCGTTTa < 2:312781/140‑1 (MQ=255) cacccacttcggtacttcacatttttacaagaaatttagctggcgagaaagtggtgggtgatgacgggatcgaaccgctgacctcttgcatgccatgcaagcGCTCTCCCAGCTGAGCTATAGCCCCACGATGCGTTTAc < 1:464265‑M1/38‑1 (MQ=255) aaaaGCAGAGACAAAAAACCCCCGCTTTGCAGCGAGGGTTGGAAATTTGGTGGAGCTAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCTTGCATGCCATGCAAGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATAGTCCCACGATGCGTTTACGTAc < 1:91855/140‑1 (MQ=255) aaGCAGAGACAAAAAACCCCCGCTTTGCAGCGAGGGTTGGAAATTTGGTGGAGCTAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCTTGCATGCCATGCAAGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATAGCCCCACGATGCGTTTACGTACCa < 2:252328/140‑1 (MQ=255) acatttgaaaaagaaatttagctggcgagaaagtggtgggtgatgacgggatcgaaccgccgaccccctccttgtaagggaggtGCTCTCCCAGCTGAGCTATAGCCCCACGATGCGTTTACGTACCAAGTTTGCTGGGt > 2:67630‑M1/85‑140 (MQ=255) aaaaCCCCCGCTTTGCAGCGAGGGTTGGAAATTTGGTGGAGCTAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCTTGCATGCCATGCAAGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATAGCCCCACGATGCGTTTACGTACCAAGTTTGCTGGGt > 2:397881/1‑140 (MQ=255) ttGCAGCGAGGGTTGGAAATTTGGTGGAGCTAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCTTGCATGCCATGCAAGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATAGCCCCACGATGCGTTTACGTACCAAGTTTGCTGGGTGCAAAATTtggt < 1:397881/140‑1 (MQ=255) aGCGAGGGTTGGAAATTTGGTGGAGCTAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCTTGCATGCCATGCAAGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATAGCCCCACGATGCGTTTACGTACCAAGTTTGCTGGGTGCAAAATTTGGTGGAg < 2:216374/140‑1 (MQ=255) aGGGTTGGAAATTTGGTGGAGCTAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCTTGCATGCCATGCAAGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATAGCCCCACGATGCGTTTACGTACCAAGTTTGCTGGGTGCAAAATTTGGTGGAGCTaa > 2:52516/1‑140 (MQ=255) ggAAATTTGGTGGAGCTAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCTTGCATGCCATGCAAGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATAGCCCCACGATGCGTTTACGTACCAAGTTTGCTGGGTGCAAAATTTGGTGGAGCTAAGCGGGa > 1:323887/1‑140 (MQ=255) tggAGCTAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCTTGCATGCCATGCAAGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATAGCCCCACGATGCGTTTACGTACCAAGTTTGCTGGGTGCAAAATTTGGTGGAGCTAAGCGGGATCGAACCGCt < 1:52516/140‑1 (MQ=255) gacgggatcgaaccgccgaccccctccttgtaagggaggtGCTCTCCCAGCTGAGCTATAGCCCCACGATGCGTTTACGTACCAAGTTTGCTGGGTGCAAAATTTGGTGGAGCTAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCtt > 2:272312‑M1/41‑140 (MQ=255) acgggatcgaaccgccgaccccctccttgtaagggaggtGCTCTCCCAGCTGAGCTATAGCCCCACGATGCGTTTACGTACCAAGTTTGCTGGGTGCAAAATTTGGTGGAGCTAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCTTg < 1:315718‑M1/101‑1 (MQ=255) gggATCGAACCGCTGACCTCTTGCATGCCATGCAAGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATAGCCCCACGATGCGTTTACGTACCAAGTTTGCTGGGTGCAAAATTTGGTGGAGCTAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCTTGca < 2:203162/140‑1 (MQ=255) gggATCGAACCGCTGACCTCTTGCATGCCATGCAAGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATAGCCCCACGATGCGTTTACGTACCAAGTTTGCTGGGTGCAAAATTTGGTGGAGCTAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCTTGca < 2:472817/140‑1 (MQ=255) ggatcgaaccgccgaccccctccttgtaagggaggtGCTCTCCCAGCTGAGCTATAGCCCCACGATGCGTTTACGTACCAAGTTTGCTGGGTGCAAAATTTGGTGGAGCTAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCTTGcat < 1:415821‑M1/104‑1 (MQ=255) gATCGAACCGCTGACCTCTTGCATGCCATGCAAGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATAGCCCCACGATGCGTTTACGTACCAAGTTTGCTGGGTGCAAAATTTGGTGGAGCTAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCTTGcatg > 1:603130/1‑140 (MQ=255) atcgaaccgccgaccccctccttgtaagggaggtGCTCTCCCAGCTGAGCTATAGCCCCACGATGCGTTTACGTACCAAGTTTGCTGGGTGCAAAATTTGGTGGAGCTAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCTTGcatgc > 2:415821‑M1/35‑140 (MQ=255) cgaaccgccgaccccctccttgtaagggaggtGCTCTCCCAGCTGAGCTATAGCCCCACGATGCGTTTACGTACCAAGTTTGCTGGGTGCAAAATTTGGTGGAGCTAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCTTGcatgcca > 2:315718‑M1/33‑140 (MQ=255) cgaaccgccgaccccctccttgtaagggaggtGCTCTCCCAGCTGAGCTATAGCCCCACGATGCGTTTACGTACCAAGTTTGCTGGGTGCAAAATTTGGTGGAGCTAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCTTGcatgcca > 1:281189‑M1/33‑140 (MQ=255) aCCGCTGACCTCTTGCATGCCATGCAAGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATAGCCCCACGATGCGTTTACGTACCAAGTTTGCTGGGTGCAAAATTTGGTGGAGCTAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCTTGcatgccatgc < 2:104251/140‑1 (MQ=255) cTGACCTCTTGCATGCCATGCAAGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATAGCCCCACGATGCGTTTACGTACCAAGTTTGCTGGGTGCAAAATTTGGTGGAGCTAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCTTGCATGCCATGCAAgc < 2:323887/140‑1 (MQ=255) cTGACCTCTTGCATGCCATGCAAGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATAGCCCCACGATGCGTTTACGTACCAAGTTTGCTGGGTGCAAAATTTGGTGGAGCTAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCTTGCATGCCATGCAAgc > 1:24678/1‑140 (MQ=255) cTGACCTCTTGCATGCCATGCAAGCGCTCTCCCAGATGAGCTATAGCCCCACGATGCGTTTACGTACCAAGTTTGCTGGGTGCAAAATTTGGTGGAGCTAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCTTGCATGCCATGCAAgc > 2:498568/1‑140 (MQ=255) tgtcatgcAAGCGCGCTCCCAGCAGAGCTCTAGTCCCTAGATGCGTTTTCGTCACAAGTTTGCTGGGTGCAAAATTTGGTGGGGCTAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCTTGCATGCCATGCAAGCGCTCTCCCAGCTg < 2:464265/137‑1 (MQ=18) tgccatgcAAGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATAGCCCCACGATGCGTTTACGTACCAAGTTTGCTGGGTGCAAAATTTGGTGGAGCTAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCTTGCATGCCATGCAAGCGCTCTCCCAGCTg > 2:363869/1‑140 (MQ=255) tgccatgcAAGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATAGCCCCACGATGCGTTTACGTACCAAGTTTGCTGGGTGCAAAATTTGGTGGAGCTAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCTTGCATGCCATGCAAGCGCTCTCCCAGCTg > 1:533482/1‑140 (MQ=255) ccatgcAAGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATAGCCCCACGATGCGTTTACGTACCAAGTTTGCTGGGTGCAAAATTTGGTGGAGCTAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCTTGCATGCCATGCAAGCGCTCTCCCAGCTGAg > 2:441949/1‑140 (MQ=255) catgcAAGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATAGCCCCACGATGCGTTTACGTACCAAGTTTGCTGGGTGCAAAATTTGGTGGAGCTAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCTTGCATGCCATGCAAGCGCTCTCCCAGCTGAGc > 1:322682/1‑140 (MQ=255) tgcAAGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATAGCCCCACGATGCGTTTACGTACCAAGTTTGCTGGGTGCAAAATTTGGTGGAGCTAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCTTGCATGCCATGCAAGCGCTCTCCCAGCTGAGCta < 2:257742/140‑1 (MQ=255) tgcAAGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATAGCCCCACGATGCGTTTACGTACCAAGTTTGCTGGGTGCAAAATTTGGTGGAGCTAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCTTGCATGCCATGCAAGCGCTCTCCCAGCTGAGCta < 2:24678/140‑1 (MQ=255) | ACCCGGACGTAGACTGTATTACAAAAGCGGCAAAAAGCAGAGACAAAAAACCCCCGCTTTGCAGCGAGGGTTGGAAATTTGGTGGAGCTAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCTTGCATGCCATGCAAGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATAGCCCCACGATGCGTTTACGTACCAAGTTTGCTGGGTGCAAAATTTGGTGGAGCTAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCTTGCATGCCATGCAAGCGCTCTCCCAGCTGAGCTA > NC_000913/2517962‑2518224 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |