| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 374963 | NA (NA) | 7 (0.180) | 5/268 | 3.5 | NA | noncoding (33/34 nt) | other | REP31a |
| ? | NC_000913 | = 377387 | NA (NA) | intergenic (+76/+148) | yaiL/frmB | DUF2058 domain‑containing protein YaiL/S‑formylglutathione hydrolase FrmB | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 245 total aligned reads displayed.
CGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑GGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑C‑ATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTACGGGCGAAGTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCG > NC_000913/377248‑377526 | cGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑GGTTTAT‑GGGCGAAgt > 1:117955/1‑140 (MQ=255) gcgtcttatcaggcctacaaattcccgcgccatccgtaggccggataaggcgtttacgccgcatccggcagtcgtgcgcagatgcctgatgcgacgctaTGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑GGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAg > 2:335666‑M2/100‑140 (MQ=255) agCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑GGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGa > 2:705246/1‑140 (MQ=255) tcttatcaggcctacaaattctcgcgccacccgtaggccggataaggcgttcacgccgcatccggcagtcgtgcgcagatgcctgatgcgacgctaTGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑GGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGAcc > 1:140068‑M2/97‑140 (MQ=255) tcttatcaggcctacaaattcccgcgccatccgtaggccggataaggcgtttacgccgcatccggcagtcgtgcgcagatgcctgatgcgacgctaTGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑GGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGAc < 2:538227‑M2/43‑1 (MQ=255) tcttatcaggcctaaattctcgcgccacccgtaggccggataaggcgttcacgccgcatccggcagtcgtgcgcagatgcctgatgcgacgctaTGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑GGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCgg > 1:620830‑M2/95‑140 (MQ=255) ggATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑GGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCgg > 1:202593/1‑140 (MQ=255) atcaggcctacaaattcccgcgccatccgtaggccggataaggcgtttacgccgcatccggcagtcgtgcgcagatgcctgatgcgacgctaTGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑GGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGAt < 1:520594‑M2/48‑1 (MQ=255) gAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑GGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATaa < 1:492898/140‑1 (MQ=255) caaattcccgcgccatccgtaggccggataaggcgtttacgccgcatccggcagtcgtgcgcagatgcctgatgcgacgctaTGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑GGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGa < 2:133662‑M2/42‑1 (MQ=255) caaattcccgcgccatccgtaggccggataaggcgtttacgccgcatccggcagtcgtgcgcagatgcctgatgcgacgctaTGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑GGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGGCCTGATaa < 2:388500‑M2/50‑1 (MQ=255) caaattcccgcgccatccgtaggccggataaggcgtttacgccgcatccggcagtcgtgcgcagatgcctgatgcgacgctaTGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑GGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCa > 1:376454‑M2/83‑140 (MQ=255) caaattcccgcgccatccgtaggccggataaggcgtttacgccgcatccggcagtcgtgcgcagatgcctgatgcgacgctaTGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑GGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCa > 2:650818‑M2/83‑140 (MQ=255) caaattctcgcgccacccgtaggccggataaggcgttcacgccgcatccggcagtcgtgcgcagatgcctgatgcgacgctaacgcgtcttatcaggcctacGGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGAt < 1:314312‑M2/27‑1 (MQ=255) caaattctcgcgccacccgtaggccggataaggcgttcacgccgcatccggcagtcgtgcgcagatgcctgatgcgacgctaacgcgtcttatcaggcctacGGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCAc > 2:271876‑M2/103‑140 (MQ=255) caaattcccgcgccatccgtaggccggataaggcgtttacgccgcatccggcagtcgtgcgcagatgcctgatgcgacgctaacgcgtcttatcaggcctacGGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATaa < 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ccGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑GGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCAt > 1:527301/1‑140 (MQ=255) gACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑AAATTCTCGCGCCACCCGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATc > 2:560064/1‑140 (MQ=14) cgccatccgtaggccggataaggcgtttacgccgcatccggcagtcgtgcgcagatgcctgatgcgacgctaTGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑GGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATcc > 2:523712‑M2/73‑140 (MQ=255) cgccatccgtaggccggataaggcgtttacgccgcatccggcagtcgtgcgcagatgcctgatgcgacgctaTGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑GGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATcc > 2:236519‑M2/73‑140 (MQ=255) cgccacccgtaggccggataaggcgttcacgccgcatccggcagtcgtgcgcagatgcctgatgcgacgctaTGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑GGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATcc > 1:358724‑M2/73‑140 (MQ=255) cgccacccgtaggccggataaggcgttcacgccgcatccggcagtcgtgcgcagatgcctgatgcgacgctaTGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑GGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATcc > 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cgtaggccggataaggcgttcacgccgcatccggcagtcgtgcgcagatgcctgatgcgacgctaTGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑GGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTc < 2:257594‑M2/75‑1 (MQ=255) cgtaggcagaataaggggttcacgccgcatccggcagtcgtgcgcagatgcctgatgcgacgctaTGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑GGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTc < 2:140068‑M2/75‑1 (MQ=255) aaGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑GGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTc < 1:53819/140‑1 (MQ=255) gtagtccggataaggcgttcacgccgcatccggcagtcgtgcgcagatgcctgatgcgacgctaTGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑GGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCg < 1:602828‑M2/76‑1 (MQ=255) gtaggccggataaggcgtttacgccgcatccggcagtcgtgcgcagatgcctgatgcgacgctaTGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑GGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCg < 1:105708‑M2/76‑1 (MQ=255) gtaggccggataaggcgttcacgccgcatccggcagtcgtgcgcagatgcctgatgcgacgctaTGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑GGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCg < 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cgacgctaTGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑GGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑C‑ATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTACGGGc < 2:40654‑M2/132‑1 (MQ=255) gcgtcttatcaggcctacGGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑C‑ATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTACGGGCGAAGTGTAGGc < 1:165242‑M2/122‑1 (MQ=255) gtcttatcaggcctacGGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑C‑ATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTACGGGCGAAGTGTAGGCCg > 1:388284‑M2/17‑140 (MQ=255) gtcttatcaggcctacGGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑C‑ATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTACGGGCGAAGTGTAGGCCg > 1:213274‑M2/17‑140 (MQ=255) tcttatcaggcctacGGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑C‑ATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTACGGGCGAAGTGTAGGCCgg > 2:377861‑M2/16‑140 (MQ=255) cttatcaggcctacGGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑C‑ATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTACGGGCGAAGTGTAGGCCGGa > 1:555235‑M2/15‑140 (MQ=255) cttatcaggcctacGGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑C‑ATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTACGGGCGAAGTGTAGGCCGGa > 2:153497‑M2/15‑140 (MQ=255) ttatcaggcctacGGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑C‑ATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTACGGGCGAAGTGTAGGCCGGAt > 2:432620‑M2/14‑140 (MQ=255) ttatcaggcctacGGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑C‑ATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTACGGGCGAAGTGTAGGCCGGAt > 1:180505‑M2/14‑140 (MQ=255) cGGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑C‑ATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTACGGGCGAAGTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACg > 2:108973‑M2/2‑140 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |