Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 753,125 | 0 | T | A | 24.6% | 146.3 / 19.6 | 65 | intergenic (‑330/+60) | ybgD/gltA | putative fimbrial protein YbgD/citrate synthase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (39/10); new base A (0/16); total (39/26) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.20e-09 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. |
GGGTTATAAATGCGACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAAGTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTT‑GTGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCATATCCTGTATACAGCTGACGCGGACGGGCAATCTTC > NC_000913/752986‑753257 | gggTTATAAATGCGACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAAGTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTT‑GTGTTTAGGCatat < 1:616645/140‑1 (MQ=255) gggTTATAAATGCGACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAAGTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTT‑GTGTTTAGGCatat < 1:1137530/140‑1 (MQ=255) ttATAAATGCGACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAAGTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTT‑GTGTTTAGGCATATaaa > 2:1484944/1‑140 (MQ=255) gcgcttACAATGAATTTTTTAATTGAAATTTTTGGTTGGTTAATAATTTGAGCTTTTTTTTTTTTTTTAAATATCTATATAGGTCTTTTAATGGATTTTTTTTTTAAATTTTTTT‑GTGTTTAGGCATAAAAAAACCAccc < 2:698900/135‑1 (MQ=255) gCGACTACCATGAATTTTTTATTTAAAAGTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGTTGTTCTTTTTTTTTTAAATATTTATATAGGTTTTTTAATGGTTTTTATTTTTAAATTTTTTT‑GTGTTTAGGAATAAAAAAATCAAcc < 2:824612/140‑1 (MQ=255) gCGACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAAGTATTGTGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTT‑GTGTTTAGGCATATAAAAATCAAcc > 1:507759/1‑140 (MQ=255) gCGACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAAGTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTT‑GTGTTTAGGCATATAAAAATCAAcc > 2:1460056/1‑140 (MQ=255) gCGACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAAGTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTT‑GTGTTTAGGCATATAAAAATCAAcc > 1:698900/1‑140 (MQ=255) gCGACTACCATGAAGTTTTTAATTAAAAGTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTTTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTT‑GTGTTTAGGCATATAAAAATCAAcc < 1:176379/140‑1 (MQ=255) cGACTACCATGAAGTTTTTAATAAAAAGTATGGGGTTGCTGATAATTTGAGTTTTTCTTTTTTTTTTAAATATATATATAGGTTTTTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTT‑GTTTTTAGGCATATAAAAATCAAccc < 2:1225011/140‑1 (MQ=255) gACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAAGTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTT‑GTGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCg > 2:604767/1‑140 (MQ=255) ccATGAAGTTTTTAATTGAAAGTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAA‑TTTTT‑GTGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCatat > 1:493545/1‑140 (MQ=255) ttttttAATTGAAATTATTGGGTTGTTAATAATTTGGGTTGTTTTTTTTTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTAAATGGTTTTTATTTTTACAATTTTTT‑GTTTTTAGGCATAAAAAAACCAACCCGCCATATGAAcgg < 2:1086017/139‑1 (MQ=255) ttAATTGAAAGTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTT‑GTGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCggg > 1:569667/1‑140 (MQ=255) taaaaGTATTGTGTTGCTGATAATTTGAGCTTTTCTTTTTTTTTTAAATATCTATATAGGTCTTTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTT‑GTTTTTAGGAATAAAAAAACCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTaaa < 2:507759/138‑1 (MQ=255) aaaGTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTT‑GTGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAat > 1:1376351/1‑140 (MQ=255) ttGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTT‑GTGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACtt > 2:1613043/1‑140 (MQ=255) ttGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTT‑GTGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACtt > 2:1121148/1‑140 (MQ=255) ttGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTT‑GTGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACtt > 1:1580776/1‑140 (MQ=255) gCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTT‑GTGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAg < 1:1121148/140‑1 (MQ=255) cTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTT‑GTGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGc > 1:1205549/1‑140 (MQ=255) cTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTT‑GTGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGc > 1:201005/1‑140 (MQ=255) attttGAGTTTTTTTTTTCTTTTTAAATATCTATATAGGTTTTTAAATGTTTTTTTTTTTTACAA‑TTTTT‑GTTTTTAGGCATAAAAAAACCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCaa < 2:493545/138‑1 (MQ=255) ttttGAGTTTTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTTTTAATGGTTTTTATTTTTACATTTTTTT‑GTGTTTAGGCATAAAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCaa < 1:23212/139‑1 (MQ=255) ttttGAGTTGTTCTATTTTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTTTTTTTACATTTTTTT‑GTTTTTAGGAATAAAAAAATCACCCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCaa < 1:1010564/139‑1 (MQ=255) gAGCTTTTTTATTTTTTTTAAATATCTATATAGGTCTTTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTT‑GTTTTTAGGCATATAAAAACCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCAt < 2:228711/140‑1 (MQ=255) gAGCTTTTCTATTTTTTTTAAATATTTATATGGGTTTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTT‑GTTTTTAGGAATAAAAAAACCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCAt < 2:1378352/140‑1 (MQ=255) gAGCTGTTCTTTTCTTTTTAAATATTTATATAGGTCTGTTAATGGTTTTTTTTTTTACAATTTTTT‑GTTTTTAGGCATAAAAAAATCACCCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCAt < 2:923939/140‑1 (MQ=255) gCTGTTTTTTTTTTTTTAAATATCTATATAGGTTTTTAAATGGATTTTTTTTTTAAATTTTTTT‑TTTTTAAGTAATAAAAAAAACAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTa < 2:201005/140‑1 (MQ=255) gCTGTTCTATTTTTTTTAAATCTCTATATAGGTTTGTTAATGGTTTTTATTTTTACAATTTTTT‑GTTTTTAGGCATAAAAAAACCACCCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTa < 1:1460056/140‑1 (MQ=255) tttAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTT‑GTGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGc > 1:1452376/1‑140 (MQ=255) tttAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTT‑GTGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGc > 2:1193927/1‑140 (MQ=255) tttAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTT‑GTGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGGTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGc > 2:552651/1‑140 (MQ=255) tttAAATATCTATATAGGTCTGGTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTT‑GTGTTTAGGCATCTAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTTAAAAATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGGTATAGc > 2:607853/1‑140 (MQ=255) tttAAATATATATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTT‑GTGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGc > 1:1451900/1‑140 (MQ=255) tAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTT‑GTGTTTAGGCATAAAAAAACCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCtt < 1:1095149/140‑1 (MQ=255) tgggTCTTTTAATGGTTTTTATTTTTACTTTTTTTT‑GTTTTTAGAAATAAAAAAACCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGt < 2:1022837/138‑1 (MQ=255) gTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTT‑GTGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGtttt > 2:214473/1‑140 (MQ=255) gTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTT‑GTGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGtttt > 2:1373238/1‑140 (MQ=255) gTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTT‑GTGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGt < 1:1282162/137‑1 (MQ=255) gTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTT‑GTGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGt > 2:1282162/1‑137 (MQ=255) ttGTTTATGGATTTTATTTTTACAATTTTTT‑GTTTTTAGTTATAAAAAAACCACCCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTc < 2:569667/139‑1 (MQ=255) ttGTTAATGGATTTTTTTTTTACATTTTTTT‑GTGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTc < 1:1194531/139‑1 (MQ=255) ttGTTAATGGATTTTTTTTTTAAATTTTTTT‑GTTTTTAGGAAAAAAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTc < 2:714126/139‑1 (MQ=255) ttGTTAATGGATTTTATTTTTAAAATTTTTT‑GTGTTTAGGCATAAAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTc < 1:1012830/139‑1 (MQ=255) tGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTT‑GTGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATTTTTACAACTTAGCAATCAACCATTAAAGCTTGATATCGCCTTTTAAGTCGCGTTTTTCa > 2:1061483/1‑140 (MQ=255) tGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTT‑GTGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTTAAGTCGCGTTTTTct > 1:1022837/1‑139 (MQ=255) tGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTT‑GTGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCa > 1:150686/1‑140 (MQ=255) tGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTT‑GTGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCa > 2:1039242/1‑140 (MQ=255) tGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTT‑GTGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGGTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCa > 2:777482/1‑140 (MQ=255) tttAATGGTTTTTTTTTTTAAAATTTTTT‑GTGTTTAGGCATAAAAAAATCACCCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCat < 1:604767/139‑1 (MQ=255) gtaaaTGTATTTTTTTTTTAAAATTTTTT‑GTTTTTAGGAAAAAAAAAAACACCCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCat < 2:1562984/137‑1 (MQ=255) ttAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTT‑GTGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTTAAGTCGCGTTTTTCata > 1:710483/1‑140 (MQ=255) ttAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTT‑GTGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGt > 2:309193/1‑132 (MQ=255) ttAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTT‑GTGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGt < 1:309193/132‑1 (MQ=255) ttAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTT‑GTGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCata > 1:1030826/1‑140 (MQ=255) ttAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTT‑GTGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCata > 2:709270/1‑140 (MQ=255) ttAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTT‑GTGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCata > 1:115649/1‑140 (MQ=255) ttAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTT‑GTGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCata > 2:1068597/1‑140 (MQ=255) ttAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTT‑GTGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGGCGCGTTTTTCata > 1:487127/1‑140 (MQ=255) attagcttttattttT‑CAATTTTTTAAAGTTTTGATATACAAAAAAAATCCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAGCCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCATATc < 2:864020/134‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) tttattttTTAAATTTTTT‑TTTTGAAGGAAAAAAAAATATAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCATATCCTGtata < 2:913255/140‑1 (MQ=255) aaTTTTTT‑GTGTTTAGGCATATAAAAATCAGCCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCATATCCTGTATACAGCTGAcgcg < 1:385243/140‑1 (MQ=255) ttt‑GTGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCATATCCTGTATACAGCTGACGCGGACgg < 1:709270/140‑1 (MQ=255) t‑gttTTTAGGCATAAAAAAATCCACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCATATCCTGTATACAGCTGACGCGGACGGGc < 2:710483/140‑1 (MQ=255) t‑gttTTTAGGAATAAAAAAATCACCCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCATATCCTGTATACAGCTGACGCGGACGGGc < 1:894309/140‑1 (MQ=255) t‑gttTTTAGACATAAAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCATATCCTGTATACAGCTGACGCGGACGGGc < 2:1451900/140‑1 (MQ=255) t‑gtgTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCATATCCTGTATACAGCTGACGCGGACGGGc < 1:1193927/140‑1 (MQ=255) t‑gtgTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCATATCCTGTATACAGCTGACGCGGACGGGc < 1:1039242/140‑1 (MQ=255) t‑gtgTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCATATCCTGTATACAGCTGACGCGGACGGGc > 2:1426173/1‑140 (MQ=255) aGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCATATCCTGTATACAGCTGACGCGGACGGGCAATCTTc > 1:394519/1‑140 (MQ=255) | GGGTTATAAATGCGACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAAGTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTT‑GTGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCATATCCTGTATACAGCTGACGCGGACGGGCAATCTTC > NC_000913/752986‑753257 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 6 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |