| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 4510797 = | 173 (1.210) | 3 (0.020) | 3/268 | 9.9 | 1.8% | coding (661/768 nt) | fecE | ferric citrate ABC transporter ATP binding subunit |
| ? | NC_000913 | = 4511007 | 162 (1.170) | coding (451/768 nt) | fecE | ferric citrate ABC transporter ATP binding subunit | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
CCAGGTGGACCTGATGCGGTTGATGGGCGAACTCCGGACTCAGGGGAAAACGGTGGTCGCTGTGCTGCACGACCTTAATCAGGCTAGCCGGTACTGCGATCAACTGGTGGTAATGGCAAACGGACATGTTATGGCGCAAGGCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/4510939‑4510797‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ggcaATGGTCCTGGCCCAGAATACGCCCGTTGTATTACTTGATGAGCCAACCACCTATCTTGATATCAATCACCAGGTGGACCTGATGCGGTTGATGGGCGAACTCCGGACTCAGGGGAAAACGGTGGTCGCTGTGCTGCA < NC_000913/4511007‑4510871 CCAGGTGGACCTGATGCGGTTGATGGGCGAACTCCGGACTCAGGGGAAAACGGTGGTCGCTGTGCTGCACGACCTTAATCAGGCTAGCCGGTACTGCGATCAACTGGTGGTAATGGCAAACGGACATGTTATGGCGCAAG > 1:2262393/1‑140 CAGGTGGACCTGATGCGGTTGATGGGCGAACTCCGGACTCAGGGGAAAACGGTGGTCGCTGTGCTGCACGACCTTAATCAGGCTAGCCGGTACTGCGATCAACTGGTGGTAATGGCAAACGGACATGTTATGGCGCAAGG < 1:1625483/140‑1 CAGGTGGACCTGATGCGGTTGATGGGCGAACTCCGGACTCAGGGGAAAACGGTGGTCGCTGTGCTGCACGACCTTAATCAGGCTAGCCGGTACTGCGATCAACTGGTGGTAATGGCAAACGGACATGTTATGGCGCAAGG < 2:880600/140‑1 CAGGTGGACCTGATGCGGTTGATGGGCGAACTCCGGACTCAGGGGAAAACGGTGGTCGCTGTGCTGCACGACCTTAATCAGGCTAGCCGGTACTGCGATCAACTGGTGGTAATGGCAAACGGACATGTTATGGCGCAAGG < 2:627217/140‑1 CAGGTGGACCTGATGCGGTTGATGGGCGAACTCCGGACTCAGGGGAAAACGGTGGTCGCTGTGCTGCACGACCTTAATCAGGCTAGCCGGTACTGCGATCAACTGGTGGTAATGGCAAACGGACATGTTATGGCGCAAGG < 2:264553/140‑1 CAGGTGGACCTGATGCGGTTGATGGGCGAACTCCGGACTCAGGGGAAAACGGTGGTCGCTGTGCTGCACGACCTTAATCAGGCTAGCCGGTACTGCGATCAACTGGTGGTAATGGCAAACGGACATGTTATGGCGCAAGG < 2:251964/140‑1 CAGGTGGACCTGATGCGGTTGATGGGCGAACTCCGGACTCAGGGGAAAACGGTGGTCGCTGTGCTGCACGACCTTAATCAGGCTAGCCGGTACTGCGATCAACTGGTGGTAATGGCAAACGGACATGTTATGGCGCAAGG < 2:2262393/140‑1 CAGGTGGACCTGATGCGGTTGATGGGCGAACTCCGGACTCAGGGGAAAACGGTGGTCGCTGTGCTGCACGACCTTAATCAGGCTAGCCGGTACTGCGATCAACTGGTGGTAATGGCAAACGGACATGTTATGGCGCAAGG < 1:600787/140‑1 CAGGTGGACCTGATGCGGTTGATGGGCGAACTCCGGACTCAGGGGAAAACGGTGGTCGCTGTGCTGCACGACCTTAATCAGGCTAGCCGGTACTGCGATCAACTGGTGGTAATGACAAACGGACATGTTATGGCGCAAGG < 2:1472171/140‑1 GGTGGACCTGATGCGGTTGATGGGCGAACTCCGGACTCAGGGGAAAACGGTGGTCGCTGTGCTGCACGACCTTAATCAGGCTAGCCGGTACTGCGATCAACTGGTGGTAATGGCAAACGGACATGTTATGGCGCAAGGCA > 2:1975671/1‑140 CCTGATGCGGTTGATGGGCGAACTCCGGACTCAGGGGAAAACGGTGGTCGCTGTGCTGCACGACCTTAATCAGGCTAGCCGGTACTGCGATCAACTGGTGGTAATGGCAAACGGACATGTTATGGCGCAAGG > 2:1574284/1‑132 CCTGATGCGGTTGATGGGCGAACTCCGGACTCAGGGGAAAACGGTGGTCGCTGTGCTGCACGACCTTAATCAGGCTAGCCGGTACTGCGATCAACTGGTGGTAATGGCAAACGGACATGTTATGGCGCAAGG < 1:1574284/132‑1 GATGCGGTTGATGGGCGAACTCCGGACTCAGGGGAAAACGGTGGTCGCTGTGCTGCACGACCTTAATCAGGCTAGCCGGTACTGCGATCAACTGGTGGTAATGGCAAACGGACATGTTATGGCGCAAGG < 2:1922736/129‑1 GATGCGGTTGATGGGCGAACTCCGGACTCAGGGGAAAACGGTGGTCGCTGTGCTGCACGACCTTAATCAGGCTAGCCGGTACTGCGATCAACTGGTGGTAATGGCAAACGGACATGTTATGGCGCAAGG > 1:1922736/1‑129 ATGCGGTTGATGGGCGAACTCCGGACTCAGGGGAAAACGGTGGTCGCTGTGCTGCACGACCTTAATCAGGCTAGCCGGTACTGCGATCAACTGGTGGTAATGGCAAACGGACATGTTATGGCGCAAGG > 2:2120827/1‑128 ATGCGGTTGATGGGCGAACTCCGGACTCAGGGGAAAACGGTGGTCGCTGTGCTGCACGACCTTAATCAGGCTAGCCGGTACTGCGATCAACTGGTGGTAATGGCAAACGGACATGTTATGGCGCAAGG < 1:2120827/128‑1 TCCGGACTCAGGGGAAAACGGTGGTCGCTGTGCTGCACGACCTTAATCAGGCTAGCCGGTACTGCGATCAACTGGTGGTAATGGCAAACGGACATGTTATGGCGCAAGGCAATGGTCCTGGCCCAGAATACGCCCGTTGT < 2:701568/140‑1 GCTAGCCGGTACTGCGATCAACTGGTGGTAATGGCAAACGGACATGTTATGGCGCAAGGCAATGGTCCTGGCCCAGAATACGCCCGTTGTATTACTTGATGAGCCAACCACCTATCTTGATATCAATCACCAGGTGGACC > 2:2271699/1‑140 CCGGTACTGCGATCAACTGGTGGTAATGGCAAACGGACATGTTATGGCGCAAGGCAATGGTCCTGGCCCAGAATACGCCCGTTGTATTACTTGATGAGCCAACCACCTATCTTGATATCAATCACCAGGTGGACCTGATG < 1:2271699/140‑1 GCAATGGTCCTGGCCCAGAATACGCCCGTTGTATTACTTGATGAGCCAACCACCTATCTTGATATCAATCACCAGGTGGACCTGATGCGGTTGATGGGCGAACTCCGGACTCAGGGGAAAACGGTGGTCGCTGTGCTGCA < 1:724414/140‑1 GCAATGGTCCTGGCCCAGAATACGCCCGTTGTATTACTTGATGAGCCAACCACCTATCTTGATATCAATCACCAGGTGGACCTGATGCGGTTGATGGGCGAACTCCGGACTCAGGGGAAAACGGTGGTCGCTGTGCTGCA < 2:22394/140‑1 GCAATGGTCCTGGCCCAGAATACGCCCGTTGTATTACTTGATGAGCCAACCACCTATCTTGATATCAATCACCAGGTGGACCTGATGCGGTTGATGGGCGAACTCCGGACTCAGGGCAAAACGGTGGTCGCTGTGCTGCA < 2:1817723/140‑1 CCAGGTGGACCTGATGCGGTTGATGGGCGAACTCCGGACTCAGGGGAAAACGGTGGTCGCTGTGCTGCACGACCTTAATCAGGCTAGCCGGTACTGCGATCAACTGGTGGTAATGGCAAACGGACATGTTATGGCGCAAGGCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/4510939‑4510797‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ggcaATGGTCCTGGCCCAGAATACGCCCGTTGTATTACTTGATGAGCCAACCACCTATCTTGATATCAATCACCAGGTGGACCTGATGCGGTTGATGGGCGAACTCCGGACTCAGGGGAAAACGGTGGTCGCTGTGCTGCA < NC_000913/4511007‑4510871 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |