| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,439,543 | G→T | A193D (GCC→GAC) | yfcJ ← | putative transporter YfcJ |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,439,543 | 0 | G | T | 99.1% | 408.3 / ‑3.2 | 115 | A193D (GCC→GAC) | yfcJ | putative transporter YfcJ |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/0); new base T (58/56); total (59/56) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.60e-01 | |||||||||||
Only 100 of 117 total aligned reads displayed.
CGAAAGTCCCGATAACAGCAAAACCAACGCCTTGTAGTGCCAGACCTAACCCTGGTTTCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGGCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAATGGCTATGAATCAACAGGCCAAGCGGAGCACCAACAGCGAGGGCACCGTAAATCGCCATTCCGTTCCATGACATCACTTTGC > NC_000913/2439406‑2439681 | cgaaaGTCCCGATAACAGCAAAACCAACGCCTTGTAGTGCCAGACCTAACCCTGGTTTCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTcc > 1:989542/1‑140 (MQ=255) aaGTCCCGATAACAGCAAAACCAACGCCTTGTAGTGCCAGACCTAACCCTGGTTTCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCAc > 2:1913149/1‑140 (MQ=255) aGTCCCGATAACAGCAAAACCAACGCCTTGTAGTGCCAGACCTAACCCTGGTTTCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACg < 1:487025/140‑1 (MQ=255) aGTCCCGATAACAGCAAAACCAACGCCTTGTAGTGCCAGACCTAACCCTGGTTTCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACg < 2:959853/140‑1 (MQ=255) gTCCCGATAACAGCAAAACCAACGCCTTGTAGTGCCAGACCTAACCCTGGTTTCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGc < 2:1197986/140‑1 (MQ=255) gATAACAGCAAAACCAGCGCCTTGTAGTGCCAGACCTAACCCTGGTTTCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTa < 2:348377/140‑1 (MQ=255) gATAACAGCAAAACCAACGCCTTGTAGTGTCAGACCTAACCCTGGTTTCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTa < 2:1859372/140‑1 (MQ=255) gATAACAGCAAAACCAACGCCTTGTAGTGCCAGACCTAACCCTGGTTTCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTa < 1:617850/140‑1 (MQ=255) gATAACAGCAAAACCAACGCCTTGTAGTGCCAGACCTAACCCTGGTTTCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTa < 2:1303291/140‑1 (MQ=255) aCAGCAAAACCAACGCCTTGTAGTGCCAGACCTAACCCTGGTTTCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACggg < 1:850082/140‑1 (MQ=255) aCAGCAAAACCAACGCCTTGTAGTGCCAGACCTAACCCTGGTTTCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACggg < 2:464575/140‑1 (MQ=255) aGCAAAACCAACGCCTTGTAGTGCCAGACCTAACCCTGGTTTCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTa > 2:802087/1‑134 (MQ=255) aGCAAAACCAACGCCTTGTAGTGCCAGACCTAACCCTGGTTTCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTa < 1:802087/134‑1 (MQ=255) aGCAAAACCAACGCCTTGTAGTGCCAGACCTAACCCTGGTTTCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTa > 1:1331379/1‑134 (MQ=255) aGCAAAACCAACGCCTTGTAGTGCCAGACCTAACCCTGGTTTCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTa < 2:1331379/134‑1 (MQ=255) aGCAAAACCAACGCCTTGTAGTGCCAGACCTAACCCTGGTTTCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTa < 1:1622322/134‑1 (MQ=255) gCAAAACCAACGCCTTGTAGTGCCAGACCTAACCCTGGTTTCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTaa < 2:989542/140‑1 (MQ=255) aaaaCCAACGCCTTGTAGTGCCAGACCTAACCCTGGTTTCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATa < 1:1023701/140‑1 (MQ=255) aaaCCAACGCCTTGTAGTGCCAGACCTAACCCTGGTTTCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATAc < 2:1755823/140‑1 (MQ=255) aaaCCAACGCCTTGTAGTGCCAGACCTAACCCTGGTTTCCAGATAAGCCCGACAACGCCCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATAc < 2:1366609/140‑1 (MQ=255) aaCGCCTTGTAGTGCCAGACCTAACCCTGGTTTCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATtg < 2:616834/140‑1 (MQ=255) aCGCCTTGTAGTGCCAGACCTAACCCTGGTTTCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATtgt > 1:809680/1‑140 (MQ=255) aCGCCTTGTAGTGCCAGACCTAACCCTGGTTTCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATtgt > 1:1986886/1‑140 (MQ=255) cGCCTTGTAGTGCCAGACCTAACCCTGGTTTCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATtgtg < 2:423873/140‑1 (MQ=255) gCCAGACCTAACCCTGGTTTCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAGTACCATTGTGGTGATCGCCAg > 1:2240706/1‑140 (MQ=255) ccAGACCTAACCCTGGTTTCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGt > 1:1916611/1‑140 (MQ=255) gACCTAACCCTGGTTTCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCg > 2:2409017/1‑140 (MQ=255) gACCTAACCCTGGTTTCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCg > 2:1824495/1‑140 (MQ=255) gACCTAACCCTGGTTTCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCg > 1:651318/1‑140 (MQ=255) gACCTAACCCTGGTTTCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCg > 1:1922454/1‑140 (MQ=255) ccTAACCCTGGTTTCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGc > 2:2105787/1‑140 (MQ=255) ccTAACCCTGGTTTCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGc > 2:2360622/1‑140 (MQ=255) ccTAACCCTGGTTTCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGc > 1:1461780/1‑140 (MQ=255) tAACCCTGGTTTCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCaa < 2:595653/140‑1 (MQ=255) aaCCCTGGTTTCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCaaa > 2:340021/1‑140 (MQ=255) ggTTTCCGTATAAGCCGGACAACGCTCCACAGCGATGGCCGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACGGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTa < 2:729631/140‑1 (MQ=255) ggTTTCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAg < 1:2427869/125‑1 (MQ=255) ggTTTCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAg > 2:2427869/1‑125 (MQ=255) ggTTTCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTa < 1:2283420/140‑1 (MQ=255) ggTTTCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTa > 1:1977466/1‑140 (MQ=255) ggTTTCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTa < 1:298778/140‑1 (MQ=255) gTTTCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTaa > 1:1467376/1‑140 (MQ=255) gTTTCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTaa < 2:1367878/140‑1 (MQ=255) tttCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAAt < 1:1043206/140‑1 (MQ=255) tttCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAAt < 2:1922454/140‑1 (MQ=255) tttCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAAt < 2:2240706/140‑1 (MQ=255) ccAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAATGGc < 1:1824495/140‑1 (MQ=255) ccAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAATGGc < 1:2054043/140‑1 (MQ=255) cAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAATGGCt > 1:712217/1‑140 (MQ=255) aGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAATGGCTa < 1:2409017/140‑1 (MQ=255) tAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAATGGCTATGa < 1:681627/140‑1 (MQ=255) tAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAATGGCTATGa < 1:2105787/140‑1 (MQ=255) cccGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTa > 2:989088/1‑126 (MQ=255) cccGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTa < 1:989088/126‑1 (MQ=255) cccGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAATGGCTATGAATCa > 2:2213146/1‑140 (MQ=255) cccGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAATGGCTATGAATCa > 1:935405/1‑140 (MQ=255) cTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAATGGCTATGAATCAACAGGCCAAg > 1:99166/1‑140 (MQ=255) cTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAATGGCTATGAATCAACAGGCCAAg < 2:1467376/140‑1 (MQ=255) caGCGATGGACGTTCTCCCTCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAATGGCTATGAATCAACAGGCCAAGCGGAg > 1:1121822/1‑140 (MQ=255) caGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAATGGCTATGAATCAACAGGCCAAGCGGAg < 2:935405/140‑1 (MQ=255) tGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAATGGCTATGAATCAACAGGCCAAGCGGAGCAc < 2:2187178/137‑1 (MQ=255) tGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAATGGCTATGAATCAACAGGCCAAGCGGAGCAc > 1:2187178/1‑137 (MQ=255) tGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAATGGCTATGAATCAACAGGCCAAGCGGAGCACCa > 2:1239634/1‑139 (MQ=255) tGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAATGGCTATGAATCAACAGGCCAAGCGGAGCACCa < 1:1239634/139‑1 (MQ=255) ggACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACATTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAATGGCTATGAATCAACAGGCCAAGCGGAGCACCAAc < 1:1213009/140‑1 (MQ=255) tctcCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAATGGCTATGAATCAACAGGCCAAGCGGAGCACCAACAGCGAg > 2:1912760/1‑140 (MQ=255) ctcCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAATGGCTATGAATCAACAGGCCAAGCGGAGCACCAACAGCGAgg < 2:809680/140‑1 (MQ=255) ctcCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAATGGCTATGAATCAACAGGCCAAGCGGAGCACCAACAGCGAgg < 1:1912760/140‑1 (MQ=255) ctcCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAATGGCTATGAATCAACAGGCCAAGCGGAGCACCAACAGCGAgg < 2:712217/140‑1 (MQ=255) tcCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAATGGCTATGAATCAACAGGCCAAGCGGAGCACCAACAGCGAggg > 1:1323308/1‑140 (MQ=255) tcCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAATGGCTATGAATCAACAGGCCAAGCGGAGCACCAACAGCGAggg < 2:1265101/140‑1 (MQ=255) gggCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAATGGCTATGAATCAACAGGCCAAGCGGAGCACCAACAGCGAGGGCACCGTaa > 2:2028462/1‑140 (MQ=255) ggCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAATGGCTATGAATCAACAGGCCAAGCGGAGCACCAACAGCGAgg < 2:92726/130‑1 (MQ=255) ggTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAATGGCTATGAATCAACAGGCCAAGCGGAGCACCAACAGCGAGGGCACCGTAAATCGc > 1:2377298/1‑140 (MQ=255) cTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAATGGCTATGAATCAACAGGCCAAGCGGAGCACCAACAGCGAGGGCACCGTAAATCGCCAtt < 1:158376/140‑1 (MQ=255) tttGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAATGGCTATGAATCAACAGGCCAAGCGGAGCACCAACAGCGAGGGCACCGTAAATCGCCATTc < 1:57027/140‑1 (MQ=255) ttGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAATGGCTATGAATCAACAGGCCAAGCGGAGCACCAACAGCGAGGGCACCGTAAATCGCCATTcc > 1:19543/1‑140 (MQ=255) tGCGCACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAATGGCTATGAATCAACAGGCCAAGCGGAGCACCAACAGCGAGGGCACCGTAAATCGCCATTCCg > 2:784133/1‑140 (MQ=255) cgcACTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAATGGCTATGAATCAACAGGCCAAGCGGAGCACCAACAGCGAGGGCACCGTAAATCGCCATTCCGtt > 1:541629/1‑140 (MQ=255) aCTGTGCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAATGGCTATGAATCAACAGGCCAAGCGGAGCACCAACAGCGAGGGCACCGTAAATCGCCATTCCGTTCCa > 1:789157/1‑140 (MQ=255) tgtgCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAATGGCTATGAATCAACAGGCCAAGCGGAGCACCAACAGCGAGGGCACCGTAAATCGCCATTCCGTTCCa < 1:2269612/138‑1 (MQ=255) tgtgCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAATGGCTATGAATCAACAGGCCAAGCGGAGCACCAACAGCGAGGGCACCGTAAATCGCCATTCCGTTCCATg > 1:1521780/1‑140 (MQ=255) tgtgCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAATGGCTATGAATCAACAGGCCAAGCGGAGCACCAACAGCGAGGGCACCGTAAATCGCCATTCCGTTCCATg > 1:983052/1‑140 (MQ=255) gtgCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAATGGCTATGAATCAACAGGCCAAGCGGAGCACCAACAGCGAGGGCACCGTAAATCGCCATTCCGTTCCa < 1:1020907/137‑1 (MQ=255) gtgCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAATGGCTATGAATCAACAGGCCAAGCGGAGCACCAACAGCGAGGGCACCGTAAATCGCCATTCCGTTCCATGa > 2:28007/1‑140 (MQ=255) gtgCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAATGGCTATGAATCAACAGGCCAAGCGGAGCACCAACAGCGAGGGCACCGTAAATCGCCATTCCGTTCCATGa > 1:1857226/1‑140 (MQ=255) gtgCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAATGGCTATGAATCAACAGGCCAAGCGGAGCACCAACAGCGAGGGCACCGTAAATCGCCATTCCGTTCCATGa > 1:402860/1‑140 (MQ=255) gtgCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAATGGCTATGAATCAACAGGCCAAGCGGAGCACCAACAGCGAGGGCACCGTAAATCGCCATTCCGTTCCATGa > 2:747239/1‑140 (MQ=255) gtgCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAATGGCTATGAATCAACAGGCCAAGCGGAGCACCAACAGCGAGGGCACCGTAAATCGCCATTCCGTTCCATGa > 1:784200/1‑140 (MQ=255) gtgCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAATGGCTATGAATCAACAGGCCAAGCGGAGCACCAACAGCGAGGGCACCGTAAATCGCCATTCCGTTCCATGa > 1:1165563/1‑140 (MQ=255) gtgCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAATGGCTATGAATCAACAGGAAAAGCGGAGCACCAGCAGCGAGGGCACCGTAAATCGCCATTCCGTTCCATGa > 2:2287006/1‑140 (MQ=255) gtgCCGTTACA‑GTCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAATGGCTATGAATCAACAGGCCAAGCGGAGCACCAACAGCGAGGGCACCGTAAATCGCCATTCCGTTCCATGAc > 2:1484649/1‑140 (MQ=255) tgCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAATGGCTATGAATCAACAGGCCAAGCGGAGCACCAACAGCGAGGGCACCGTAAATCGCCATTCCGTTCCATGAc > 2:2127516/1‑140 (MQ=255) tgCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAATGGCTATGAATCAACAGGCCAAGCGGAGCACCAACAGCGAGGGCACCGTAAATCGCCATTCCGTTCCATGAc < 1:747239/140‑1 (MQ=255) tgCCGTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAATGGCTATGAATCAACAGGCCAAGCGGAGCACCAACAGCGAGGGCACCGTAAATCGCCATTCCGTTCCAGGAc < 2:2377298/140‑1 (MQ=255) gTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAATGGCTATGAATCAACAGGCCAAGCGGAGCACCAACAGCGAGGGCACCGTAAATCGCCATTCCGTTCCATGACATCa < 1:1960541/140‑1 (MQ=255) gTTACAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAATGGCTATGAATCAACAGGCCAAGCGGAGCACCAACAGCGAGGGCACCGTAAATCGCCATTCCGTTCCATGACATCa < 2:1165563/140‑1 (MQ=255) cAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAATGGCTATGAATCAACAGGCCAAGCGGAGCACCAACAGCGAGGGCACCGTAAATCGCCATTCCGTTCCATGACATCACttt > 2:1550703/1‑140 (MQ=255) cAGTCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAATGGCTATGAATCAACAGGCCAAGCGGAGCACCAACAGCGAGGGCACCGTAAATCGCCATTCCGTTCCATGACATCACttt > 2:1471612/1‑140 (MQ=255) ggCCCCCGGCAGGTCGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAATGGCTATGAATCAACAGGCCAAGCGGAGCACCAACAGCGAGGGCACCGTAAATCGCCATTCCGTTCCATGACATCACTTTGc < 1:1020150/140‑1 (MQ=255) | CGAAAGTCCCGATAACAGCAAAACCAACGCCTTGTAGTGCCAGACCTAACCCTGGTTTCCAGATAAGCCCGACAACGCTCCACAGCGATGGACGTTCTCCCGCCAGGGCCGGTACTTTGCGCACTGTGCCGTTACAGGCCCACGCCAGTACGGGTAATACCATTGTGGTGATCGCCAGTGCGGCAAAACCGTAATGGCTATGAATCAACAGGCCAAGCGGAGCACCAACAGCGAGGGCACCGTAAATCGCCATTCCGTTCCATGACATCACTTTGC > NC_000913/2439406‑2439681 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |