| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,592,222 | C→A | G35V (GGG→GTG) | ugpB ← | sn‑glycerol 3‑phosphate ABC transporter periplasmic binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,592,222 | 0 | C | A | 98.8% | 288.7 / ‑5.8 | 84 | G35V (GGG→GTG) | ugpB | sn‑glycerol 3‑phosphate ABC transporter periplasmic binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base A (37/46); minor base G (0/1); total (37/47) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
TTGCCGGTACGAAATGCGGCAATCCCCGCGCTTAAATTCTGTTCGTAGTTGCCTTTATAGGTCGGTACAATTTTGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTTCCCCTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAGCGCCAGTGCTGAAGCTGTATAATGTAACGGTTTCATCGTTTATCTCTCTTGTTGTACCGAATGCGCGAA > NC_000913/3592087‑3592358 | ttGCCGGTACGAAATGCGGCAATCCCCGCGCTTAAATTCTGTTCGTAGTTGCCTTTATAGGTCGGTACAATTTTGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTTCCACTTc < 2:190492/140‑1 (MQ=255)ttGCCGGTACGAAATGCGGCAATCCCCGCGCTTAAATTCTGTTCGTAGTTGCCTTTATAGGTCGGTACAATTTTGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTTCCACTTc < 1:173311/140‑1 (MQ=255) tGCCGGTACGAAATGCGGCAATCCCCGCGCTTAAATTCTGTTCGTAGTTGCCTTTATAGGTCGGTACAATTTTGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTTCCACTTcc > 1:1027327/1‑140 (MQ=255) ggTACGAAATGCGGCAATCCCCGCGCTTAAATTCTGTTCGTAGTTGCCTTTATAGGTCGGTACAATTTTGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTTCCACTTCCATAg < 2:673433/140‑1 (MQ=255) aaTGCGGCAATCCCCGCGCTTAAATTCTGTTCGTAGTTGCCTTTATAGGTCGGTACAATTTTGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTTCCGCTTCCATAGAATGCCa < 2:1464618/140‑1 (MQ=255) cGGCAATCCCCGCGCTTAAATTCTGTTCGTAGTTGCCTTTATAGGTCGGTACAATTTTGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTTCCACTTCCATAGAATGCCAGAAc > 2:697921/1‑140 (MQ=255) ggCAATCCCCGCGCTTAAATTCTGTTCGTAGTTGCCTTTATAGGTCGGTACAATTTTGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTTCCACTTCCATAGAATGCCAGAACg > 2:452418/1‑140 (MQ=255) aTCCCCGCGCTTAAATTCTGTTCGTAGTTGCCTTTATAGGTCGGTACAATTTTGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTTCCACTTCCATAGAATGCCAGAACGGAAt > 2:1221053/1‑140 (MQ=255) tCCCCGCGCTTAAATTCTGTTCGTAGTTGCCTTTATAGGTCGGTACAATTTTGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTTCCACTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATg > 2:965949/1‑140 (MQ=255) tCCCCGCGCTTAAATTCTGTTCGTAGTTGCCTTTATAGGTCGGTACAATTTTGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTTCCACTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATg < 2:525116/140‑1 (MQ=255) ccccGCGCTTAAATTCTGTTCGTAGTTGCCTTTATAGGTCGGTACAATTTTGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTTCCACTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATgg < 2:732736/140‑1 (MQ=255) cccGCGCTTAAATTCTGTTCGTAGTTGCCTTTATAGGTCGGTACAATTTTGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTTCCACTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGgt > 1:1274651/1‑140 (MQ=255) cgcgCTTAAATTCTGTTCGTAGTTGCCTTTATAGGTCGGTACAATTTTGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTTCCACTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGgtcg > 2:962359/1‑140 (MQ=255) cgcgCTTAAATTCTGTTCGTAGTTGCCTTTATAGGTCGGTACAATTTTGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTTCCACTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGgtcg > 2:530093/1‑140 (MQ=255) cgcgCTTAAATTCTGTTCGTAGTTGCCTTTATAGGTCGGTACAATTTTGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTTCCACTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGgtcg > 1:367431/1‑140 (MQ=255) cgcTTAAATTCTGTTCGTAGTTGCCTTTATAGGTCGGTACAATTTTGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTTCCACTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGgtcgtc < 2:305982/140‑1 (MQ=255) gcTTAAATTCTGTTCGTAGTTGCCTTTATAGGTCGGTACAATTTTGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCTCCTCTTTACCCAGTTCCACTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCa < 2:648212/140‑1 (MQ=255) cTTAAATTCTGTTCGTAGTTGCCTTTATAGGTCGGTACAATTTTGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTTCCACTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCAc < 1:1126183/140‑1 (MQ=255) cTTAAATTCTGTTCGTAGTTGCCTTTATAGGTCGGTACAATTTTGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTTCCACATCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCAc < 2:745874/140‑1 (MQ=255) tGTTCGTAGTTGCCTTTATAGGTCGGTACAATTTTGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTTCCACTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATgg > 2:394909/1‑124 (MQ=255) tGTTCGTAGTTGCCTTTATAGGTCGGTACAATTTTGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTTCCACTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATgg < 1:394909/124‑1 (MQ=255) ttCGTAGTTGCCTTTATAGGTCGGTACAATTTTGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCATCTCTTTACCCAGTTCCACTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCAt > 2:1067070/1‑140 (MQ=255) ttCGTAGTTGCCTTTATAGGTCGGTACAATTTTGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTTCCACTTCCATGGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCAt > 1:1426877/1‑140 (MQ=255) ttCGTAGTTGCCTTTATAGGTCGGTACAATTTTGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTTCCACTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGgtcgtc > 1:151239/1‑127 (MQ=255) ttCGTAGTTGCCTTTATAGGTCGGTACAATTTTGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTTCCACTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGgtcgtc < 2:151239/127‑1 (MQ=255) ttCGTAGTTGCCTTTATAGGTCGGTACAATTTTGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTTCCACTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCAt > 1:1306272/1‑140 (MQ=255) gTAGTTGCCTTTATAGGTCGGTACAATTTTGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTTCCACTTCCATAGAATGCCATAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTcc < 2:334930/140‑1 (MQ=255) gTAGTTGCCTTTATAGGTCGGTACAATTTTGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTTCCACTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTcc < 2:182016/140‑1 (MQ=255) ttGCCTTTATAGGTCGGTACAATTTTGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTTCCACTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCAt < 1:1230130/140‑1 (MQ=255) tataGGTCGGTACAATTTTGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTTCCACTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGcc > 2:1229104/1‑140 (MQ=255) gTCGGTACAATTTTGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTTCCACTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTcc > 1:657024/1‑140 (MQ=255) gTCGGTACAATTTTGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTTCCACTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTcc > 1:742328/1‑140 (MQ=255) tCGGTACAATTTTGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTTCCACTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCg > 2:903562/1‑140 (MQ=255) tCGGTACAATTTTGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTTCCACTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCg > 2:1338994/1‑140 (MQ=255) cGGTACAATTTTGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTTCCACTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGa > 2:72769/1‑140 (MQ=255) ggTACAATTTTGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTTCCACTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAg > 1:53123/1‑140 (MQ=255) gTACAATTTTGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTTCCACTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAgc < 2:657024/140‑1 (MQ=255) tACAATTTTGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTTCCACTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAgcg > 2:576500/1‑140 (MQ=255) tACAATTTTGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTTCCACTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAgcg > 1:363885/1‑140 (MQ=255) tACAATTTTGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTTCCACTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAgcg > 2:62462/1‑140 (MQ=255) tACAATTTTGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTTCCACTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAgcg > 1:396502/1‑140 (MQ=255) tACAATTTTGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTTCCACTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAgcg > 2:189754/1‑140 (MQ=255) aCAATTTTGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTTCCACTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAgcgc < 1:698295/140‑1 (MQ=255) cAATTTTGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTTCCACTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAGCGcc < 1:434798/140‑1 (MQ=255) aaTTTTGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTTCCACTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAGCGCCa < 2:396502/140‑1 (MQ=255) aaTTTTGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTTCCACTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAGCGCCa < 2:1495809/140‑1 (MQ=255) ttGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTTCCACTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAGCGCCAGTGc < 1:1211141/140‑1 (MQ=255) gTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTTCCACTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAGCGCCAGTGCTg < 1:1338994/140‑1 (MQ=255) tAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTTCCACTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAGCGCCAGTGCTGa > 2:1469252/1‑140 (MQ=255) tAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTTCCACTTCCATAGAAGGCCAGAACGGAATGGCCGCCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGACCGCCAGAGCGGa > 2:1427472/1‑140 (MQ=255) aaTCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTTCCACTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAGCGCCAGTGCTGaa < 1:189754/140‑1 (MQ=255) aaTCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTTCCACTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAGCGCCAGTGCTGaa < 1:576500/140‑1 (MQ=255) aTCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTTCCACTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAGCGCCAGTGCTGAAg < 1:965949/140‑1 (MQ=255) aTCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTTCCACTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAGCGCCAGTGCTGAAg < 1:1253532/140‑1 (MQ=255) aTCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTTCCACTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAGCGCCAGTGCTGAAg < 1:1159887/140‑1 (MQ=255) aTCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTTCCACTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAGCGCCAGTGCTGAAg < 1:697921/140‑1 (MQ=255) aTCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTTCCACTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAGCGCCAGTGCTGAAg < 1:770335/140‑1 (MQ=255) aTCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTTCCACTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAGCGCCAGTGCTGAAg < 2:1306272/140‑1 (MQ=255) aTCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTTCCACTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAGCGCCAGTGCTGAAg < 1:1221053/140‑1 (MQ=255) aTCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTTCCACTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAGCGCCAGTGCTGAAg < 1:903562/140‑1 (MQ=255) aTCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGATGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTTCCACTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAGCGCCAGTGCTGAAg < 2:1274651/140‑1 (MQ=255) cGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTTCCACTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAGCGCCAGTGc > 2:1174169/1‑132 (MQ=255) cGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTTCCACTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAGCGCCAGTGc < 1:1174169/132‑1 (MQ=255) cGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTTCCACTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAGCGCCAGTGCTGAAGCTg > 1:21652/1‑140 (MQ=255) ggTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTTCCACTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAGCGCCAGTGCTGAAGCTGta < 2:1006120/140‑1 (MQ=255) ggCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTTCCACTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAGCGCCAGTGCTGAAGCTGTATAATGTa < 1:72769/140‑1 (MQ=255) tAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTTCCACTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAGCGCCAGTGCTGAAGCTGTATAATGTAACGGt > 2:1228333/1‑140 (MQ=255) aaCGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTTCCACTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAGCGCCAGTGCTGAAGCTGTATAATGTAACGGTTTc < 1:62462/140‑1 (MQ=255) ggCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTTCCACTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAGCGCCAGTGCTGAAGCTGTATAATGTAACGGTTTCATCGttt < 2:1240022/140‑1 (MQ=255) ccAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTTCCACTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAGCGCCAGTGCTGAAGCTGTATAATGTAACGGTTTCATCGTTTAt < 2:367431/140‑1 (MQ=255) ccAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTTCCACTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAGCGCCAGTGCTGAAGCTGTATAATGTAACGGTTTCATCGTTTAt < 1:1427472/140‑1 (MQ=255) gagaATCCACCTCTTTACCCAGTTCCACTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAGCGCCAGTGCTGAAGCTGTATAATGTAACGGTTTCATCGTTTAtctc < 2:742328/140‑1 (MQ=255) gagaATCCACCTCTTTACCCAGTTCCACTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAGCGCCAGTGCTGAAGCTGTATAATGTAACGGTTTCATCGTTTAtctc < 1:1228333/140‑1 (MQ=255) gagaATCCACCTCTTTACCCAGTTCCACTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAGCGCCAGTGCTGAAGCTGTATAATGTAACGGTTTCATCGTTTAtctc < 2:53123/140‑1 (MQ=255) aTCCACCTCTTTACCCAGTTCCACTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAGCGCCAGTGCTGAAGCTGTATAATGTAACGGTTTCATCGTTTATCTCTCtt < 2:363885/140‑1 (MQ=255) aCCTCTTTACCCAGTTCCACTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAGCGCCAGTGCTGAAGCTGTATAATGTAACGGTTTCATCGTTTATCTCTCttgttg > 2:10863/1‑140 (MQ=255) ctctTTACCCAGTTCCACTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAGCGCCAGTGCTGAAGCTGTATAATGTAACGGTTTCATCGTTTATCTCTCTTGTTGTa < 1:1469252/140‑1 (MQ=255) tttACCCAGTTCCACTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAGCGCCAGTGCTGAAGCTGTATAATGTAACGGTTTCATCGTTTAtctc > 2:825849/1‑127 (MQ=255) tttACCCAGTTCCACTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAGCGCCAGTGCTGAAGCTGTATAATGTAACGGTTTCATCGTTTAtctc < 1:825849/127‑1 (MQ=255) ttACCCAGTTCCACTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAGCGCCAGTGCTGAAGCTGTATAATGTAACGGTTTCATCGTTTATCTCTCTTGTTGTACCGa < 1:1229104/140‑1 (MQ=255) aGTTCCACTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAGCGCCAGTGCTGAAGCTGTATAATGTAACGGTTTCATCGTTTATCTCTCTTGTTGTACCGAATgcgc > 2:544698/1‑140 (MQ=255) ttCCACTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAGCGCCAGTGCTGAAGCTGTATAATGTAACGGTTTCATCGTTTATCTCTCTTGTTGTACCGAATGCGCGa > 2:283534/1‑140 (MQ=255) ttCCACTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAGCGCCAGTGCTGAAGCTGTATAATGTAACGGTTTCATCGTTTATCTCTCTTGTTGTACCGAATGCGCGa > 1:551798/1‑140 (MQ=255) tCCACTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAGCGCCAGTGCTGAAGCTGTATAATGTAACGGTTTCATCGTTTATCTCTCTTGTTGTACCGAATGCGCGaa > 2:203168/1‑140 (MQ=255) | TTGCCGGTACGAAATGCGGCAATCCCCGCGCTTAAATTCTGTTCGTAGTTGCCTTTATAGGTCGGTACAATTTTGTAATCCGGGTTTTCGGCGTTAAAACGTTGGGCCAGAGAATCCACCTCTTTACCCAGTTCCCCTTCCATAGAATGCCAGAACGGAATGGTCGTCACTGCCTGTGCATTCCCCATTAACGCCAGTCCGAGCGCCAGTGCTGAAGCTGTATAATGTAACGGTTTCATCGTTTATCTCTCTTGTTGTACCGAATGCGCGAA > NC_000913/3592087‑3592358 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |