| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | 3736656 = | 161 (1.470) | 4 (0.040) | 3/256 | 8.9 | 2.5% | coding (522/825 nt) | bax | putative glycoside hydrolase Bax |
| ? | NC_000913 | = 3736652 | 157 (1.550) | coding (526/825 nt) | bax | putative glycoside hydrolase Bax | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 168 total aligned reads displayed.
CGAAGAGTAAGCCGGGTGCGTATTCAGGTTAGTGACATAGGCGCTCACCGATTCTTTGACAGAACTAAACTGTGAGTACCCTTT‑‑CACTTTACCTGGCGCATTGGTACAACGTCCTTTCATGCATTTCATGCCGAACAGGTTGTTGTTGTTGCGCGCCAGCTTCGACGTTCCCCAACCGCTTTCTGCTGCAGCCATCGTCGCCACCATACTGGTGGGGATAATGTCTACGCGTTCAAGCAAGGTATTCCACGGGATTTTTCGCGTATTACCGGACCA > NC_000913/3736515‑3736790 | cGAAGAGTAAGCCGGGTGCGTATTCAGGTTAGTGACATAGGCGCTCACCGATTCTTTGACAGAACTAAACTGTGAGTACCCTTT‑‑CACTTTACCTGGCGCATTGGTACAACGTCCTTTCATGCATTTCATGCCGAACAGgt < 2:1167524/140‑1 (MQ=255) gAAGAGTAAGCCGGGTGCGTATTCAGGTTAGTGACATAGGCGCTCACCGATTCTTTGACAGAACTAAACTGTGAGTACCCTTT‑‑CACTTTACCTGGCGCATTGGTACAACGTCCTTTCATGCATTTCATGCCGAACAGgtt > 2:794185/1‑140 (MQ=255) gAAGAGTAAGCCGGGTGCGTATTCAGGTTAGTGACATAGGCGCTCACCGATTCTTTGACAGAACTAAACTGTGAGTACCCTTT‑‑CACTTTACCTGGCGCATTGGTACAACGTCCTTTCATGCATTTCATGCCGAACAGgtt > 2:1575650/1‑140 (MQ=255) aGCCGGGTGCGTATTCAGGTTAGTGACATAGGCGCTCACCGATTCTTTGACAGAACTAAACTGTGAGTACCCTTT‑‑CACTTTACCTGGCGCATTGGTACAACGTCCTTTCATGCATTTCATGCCGAACAGgttgttgttgt > 1:1244780/1‑140 (MQ=255) gCCGGGTGCGTATTCAGGTTAGTGACATAGGCGCTCACCGATTCTTTGACAGAACTAAACTGTGAGTACCCTTT‑‑CACTTTACCTGGCGCATTGGTACAACGTCCTTTCATGCATTTCATGCCGAACAGgttgttgttgtt > 1:14540/1‑140 (MQ=255) gTGCGTATTCAGGTTAGTGACATAGGCGCTCACCGATTCTTTGACAGAACTAAACTGTGAGTACCCTTT‑‑CACTTTACCTGGCGCATTGGTACAACGTCCTTTCATGCATTTCATGCCGAACAGGTTGTTGTTGTTgcgcg < 2:654560/140‑1 (MQ=255) gTGCGTATTCAGGTTAGTGACATAGGCGCTCACCGATTCTTTGACAGAACTAAACTGTGAGTACCCTTT‑‑CACTTTACCTGGCGCATTGGTACAACGTCCTTTCATGCATTTCATGCCGAACAGGTTGTTGTTGTTgcgcg > 1:655962/1‑140 (MQ=255) gTGCGTATTCAGGTTAGTGACATAGGCGCTCACCGATTCTTTGACAGAACTAAACTGTGAGTACCCTTT‑‑CACTTTACCTGGCGCATTGGTACAACGTCCTTTCATGCATTTCATGCCGAACAGGTTGTTGTTGTTgcgcg < 1:1275034/140‑1 (MQ=255) tGCGTATTCAGGTTAGTGACATAGGCGCTCACCGATTCTTTGACAGAACTAAACTGTGAGTACCCTTT‑‑CACTTTACCTGGCGCATTGGTACAACGTCCTTTCATGCATTTCATGCCGAACAGGTTGTTGTTGTTgcgcgc < 1:407423/140‑1 (MQ=255) aGTGACATAGGCGCTCACCGATTCTTTGACAGAACTAAACTGTGAGTACCCTTT‑‑CACTTTACCTGGCGCATTGGTACAACGTCCTTTCATGCATTTCATGCCGAACAGGTTGTTGTTGTTGCGCGCCAGCTTCGACGTTc > 2:410658/1‑140 (MQ=255) tGACATAGGCGCTCACCGATTCTTTGACAGAACTAAACTGTGAGTACCCTTT‑‑CACTTTACCTGGCGCATTGGTACAACGTCCTTTCATGCATTTCATGCCGAACAGGTTGTTGTTGTTGCGCGCCAGCTTCGACGTTccc > 2:602922/1‑140 (MQ=255) tGACATAGGCGCTCACCGATTCTTTGACAGAACTAAACTGTGAGTACCCTTT‑‑CACTTTACCTGGCGCATTGGTACAACGTCCTTTCATGCATTTCATGCCGAACAGGTTGTTGTTGTTGCGCGCCAGCTTCGACGTTccc < 1:864/140‑1 (MQ=255) cATAGGCGCTCACCGATTCTTTGACAGAACTAAACTGTGAGTACCCTTT‑‑CACTTTACCTGGCGCATTGGTACAACGTCCTTTCATGCATTTCATGCCGAACAGGTTGTTGTTGTTGCGCGCCAGCTTCGACGTTCCCCaa < 2:190075/140‑1 (MQ=255) cATAGGCGCTCACCGATTCTTTGACAGAACTAAACTGTGAGTACCCTTT‑‑CACTTTACCTGGCGCATTGGTACAACGTCCTTTCATGCATTTCATGCCGAACAGGTTGTTGTTGTTGCGCGCCAGCTTCGACGTTCCCCaa > 1:88450/1‑140 (MQ=255) aGGCGCTCACCGATTCTTTGACAGAACTAAACTGTGAGCACCCTTT‑‑CACTTTACCTGGCGCATTGGTACAACGTCCTTTCATGCATTTCATGCCGAACAGGTTGTTGTTGTTGCGCGCCAGCTTCGACGTTCCCCAACCg > 1:1046232/1‑140 (MQ=255) gcgcTCACCGATTCTTTGACAGAACTAAACTGTGAGTACCCTTT‑‑CACTTTACCTGGCGCATTGGTACAACGTCCTTTCATGCATTTCATGCCGAACAGGTTGTTGTTGTTGCGCGCCAGCTTCGACGTTCCCCAACCGCt > 1:376316/1‑140 (MQ=255) gcgcTCACCGATTCTTTGACAGAACTAAACTGTGAGCACCCTTT‑‑CACTTTACCTGGCGCATTGGTACAACGTCCTTTCATGCATTTCATGCCGAACAGGTTGTTGTTGTTGCGCGCCAGCTTCGACGTTCCCCAACCGCt < 2:1046232/140‑1 (MQ=255) cgcTCACCGATTCTTTGACAGAACTAAACTGTGAGTACCCTTT‑‑CACTTTACCTGGCGCATTGGTACAACGTCCTTTCATGCATTTCATGCCGAACAAGTTGTTGTTGTTGCGCGCCAGCTTCGACGTT‑CCCAACCGCttt > 1:442012/1‑140 (MQ=255) cACCGATTCTTTGACAGAACTAAACTGTGAGTACCCTTT‑‑CACTTTACCTGGCGCATTGGTACAACGTCCTTTCATGCATTTCATGCCGAACAGGTTGTTGTTGTTGCGCGCCAGCTTCGACGTTCCCCAACCGCTTTctg > 1:765016/1‑140 (MQ=255) cGATTCTTTGACAGAACTAAACTGTGAGTACCCTTT‑‑CACTTTACCTGGCGCATTGGTACAACGTCCTTTCATGCATTTCATGCCGAACAGGTTGTTGTTGTTGCGCGCCAGCTTCGACGTTCCCCAACCGCTTTctgctg > 2:223218/1‑140 (MQ=255) gATTCTTTGACAGAACTAAACTGTGAGTACCCTTT‑‑CACTTTACCTGGCGCATTGGTACAACGTCCTTTCATGCATTTCATGCCGAACAGGTTGTTGTTGTTGCGCGCCAGCTTCGACGTTCCCCAACCGCTTTCtgctgc > 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(MQ=255) aTGCATTTCATGCCGAACAGGTTGTTGTTGTTGCGCGCCAGCTTCGACGTTCCCCAACCGCTTTCTGCTGCAGCCATCGTCGCCACCATACTGGTGGGGATAATGTCTACGCGTTCAAGCAAGGTATTCCACGGGAtttt < 2:257468/140‑1 (MQ=255) gCATTTCATGCCGAACAG‑‑‑GTTGTTGTTGCGCGCCAGCTTCGACGTTCCCCAACCGCTTTCTGCTGCAGCCATCGTCGCCACCATACTGGTGGGGATAATGTCTACGCGTTCAAGCAAGGTATTCCACGGGATTTTTcgcg < 2:1357689/140‑1 (MQ=255) cATTTCATGCCGAACAGGTTGTTGTTGTTGCGCGCCAGCTTCGACGTTCCCCAACCGCTTTCTGCTGCAGCCATCGTCGCCACCATACTGGTGGGGATAATGTCTACGCGTTCAAGCAAGGTATTCCACGGGATTTTTcg < 2:1745802/140‑1 (MQ=255) aTTTCATGCCGAACAGGTTGTTGTTGTTGCGCGCCAGCTTCGACGTTCCCCAACCGCTTTCTGCTGCAGCCATCGTCGCCACCATACTGGTGGGGACAATGTCTACGCGTTCAAGCAAGGTATTCCACGGGATTTTTcgc > 1:1116992/1‑140 (MQ=255) tttCATGCCGAACAGGTTGTTGTTGTTGCGCGCCAGCTTCGACGTTCCCCAACCGCTTTCTGCTGCAGCCATCGTCGCCACCATACTGGTGGGGATAATGTCTACGCGTTCAAGCAAGGTATTCCACGGGATTTTTcgcg < 1:1765122/140‑1 (MQ=255) tttCATGCCGAACAGGTTGTTGTTGTTGCGCGCCAGCTTCGACGTTCCCCAACCGCTTTCTGCTGCAGCCATCGTCGCCACCATACTGGTGGGGATAATGTCTACGCGTTCAAGCAAGGTATTCCACGGGATTTTTcgcg < 1:549786/140‑1 (MQ=255) tttCATGCCGAACAGGTTGTTGTTGTTGCGCGCCAGCTTCGACGTTCCCCAACCGCTTTCTGCTGCAGCCATCGTCGCCACCATACTGGTGGGGATAATGTCTACGCGTTCAAGCAAGGTATTCCACGGGAATTTTcgcg < 2:1787018/140‑1 (MQ=255) tttCATGCCGAACAAGTTGTTGTTGTTGCGCGCCAGCTTCGACGTT‑CCCAACCGCTTTCTGCTGCAGCCATCGTCGCCACCATACTGGTGGGGATAATGTCTACGCGTTCAAGCAAGGTATTCCACGGGATTTTTCTCGt < 2:442012/140‑1 (MQ=255) cATGTCGAACAGGTTGTTGTTGTTGCGCGCCAGCTTCGACGTTCCCCAACCGCTTTCTGCTGCAGCCATCGTCGCCACCATACTGGTGGGGATAATGTCTACGCGTTCAAGCAAGGTATTCCACGGGATTTTTCGCGTAt < 2:492301/140‑1 (MQ=255) cATGCCGAACAGGTTGTTGTTGTTGCGCGCCAGCTTCGACGTTCCCCAACCGCTTTCTGCTGCAGCCATCGTCACCACCATACTGGTGGGGATAATGTCTACGCGTTCAAGCAAGGTATTCCACGGGATTTTTCGCGTAt > 2:1762644/1‑140 (MQ=255) tGCCGAACAGGTTGTTGTTGTTGCGCGCCAGCTTCGACGTTCCCCAACCGCTTTCTGCTGCAGCCATCGTCGCCACCATACTGGTGGGGATAATGTCTACGCGTTCAAGCAAGGTATTCCACGGGATTTTTCGCGTATTa > 1:169600/1‑140 (MQ=255) gCCGAACAGGTTGTTGTTGTTGCGCGCCAGCTTCGACGTTCCCCAACCGCTTTCTGCTGCAGCCATCGTCGCCACCATACTGGTGGGGATAATGTCTACGCGTTCAAGCAAGGTATTCCACGGGATTTTTCGCGTATTAc > 2:655048/1‑140 (MQ=255) cGAACAGGTTGTTGTTGTTGCGCGCCAGCTTCGACGTTCCCCAACCGCTTTCTGCTGCAGCCATCGTCGCCACCATACTGGTGGGGATAATGTCTACGCGTTCAAGCAAGGTATTCCACGGGATTTTTCGCGTATTACCg < 1:655048/140‑1 (MQ=255) gAACAGGTTGTTGTTGTTGCGCGCCAGCTTCGACGTTCCCCAACCGCTTTCTGCTGCAGCCATCGTCGCCACCATACTGGTGGGGATAATGTCTACGCGTTCAAGCAAGGTATTCCACGGGATTTTTCGCGTATTACCgg > 1:322294/1‑140 (MQ=255) aCAGGTTGTTGTTGTTGCGCGCCAGCTTCGACGTTCCCCAACCGCTTTCTGCTGCAGCCATCGTCGCCACCATACTGGTGGGGATAATGTCTACGCGTTCAAGCAAGGTATTCCACGGGATTTTTCGCGTATTa > 1:1770898/1‑134 (MQ=255) aCAGGTTGTTGTTGTTGCGCGCCAGCTTCGACGTTCCCCAACCGCTTTCTGCTGCAGCCATCGTCGCCACCATACTGGTGGGGATAATGTCTACGCGTTCAAGCAAGGTATTCCACGGGATTTTTCGCGTATTa < 2:1770898/134‑1 (MQ=255) aCAGGTTGTTGTTGTTGCGCGCCAGCTTCGACGTTCCCCAACCGCTTTCTGCTGCAGCCATCGTCGCCACCATACTGGTGGGGATAATGTCTACGCGTTCAAGCAAGGTATTCCACGGGATTTTTCGCGTATTACCGGAc < 2:1556944/140‑1 (MQ=255) aCAGGTTGTTGTTGTTGCGCGCCAGCTTCGACGTTCCCCAACCGCTTTCTGCTGCAGCCATCGTCGCCACCATACTGGTGGGGATAATGTCTACGCGTTCAAGCAAGGTATTCCACGGGATTTTTCGCGTATTACCGGAc < 2:14540/140‑1 (MQ=255) aCAGGTTGTTGTTGTTGCGCGCCAGCTTCGACGTTCCCCAACCGCTTTCTGCTGCAGCCATCGTCGCCACCATACTGGTGGGGATAATGTCTACGCGTTCAAGCAAGGTATTCCACGGGATTTTTCGCGTATTACCGGAc < 1:482811/140‑1 (MQ=255) aCAGGTTGTTGTTGTTGCGCGCCAGCTTCGACGTTCCCCAACCGCTTTCTGCTGCAGCCATCGTCGCCACCATACTGGTGGGGATAATGTCTACGCGTTCAAGCAAGGTATTCCACGGGATTTTTCGCGTATTACCGGAc > 2:1656482/1‑140 (MQ=255) aGGTTGTTGTTGTTGCGCGCCAGCTTCGACGTTCCCCAACCGCTTTCTGCTGCAGCCATCGTCGCCACCATACTGGTGGGGATAATGTCTACGCGTTCAAGCAAGGTATTCCACGGGATTTTTCGCGTATTACCGGACCa < 2:1115090/140‑1 (MQ=255) | CGAAGAGTAAGCCGGGTGCGTATTCAGGTTAGTGACATAGGCGCTCACCGATTCTTTGACAGAACTAAACTGTGAGTACCCTTT‑‑CACTTTACCTGGCGCATTGGTACAACGTCCTTTCATGCATTTCATGCCGAACAGGTTGTTGTTGTTGCGCGCCAGCTTCGACGTTCCCCAACCGCTTTCTGCTGCAGCCATCGTCGCCACCATACTGGTGGGGATAATGTCTACGCGTTCAAGCAAGGTATTCCACGGGATTTTTCGCGTATTACCGGACCA > NC_000913/3736515‑3736790 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |