Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA NC_000913 4,222,730 G→T intergenic (‑243/+74) arpA ← / ← iclR regulator of acetyl CoA synthetase/DNA‑binding transcriptional repressor IclR

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*NC_0009134,222,7300GT100.0% 431.2 / NA 119intergenic (‑243/+74)arpA/iclRregulator of acetyl CoA synthetase/DNA‑binding transcriptional repressor IclR
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base G (0/0);  new base T (64/55);  total (64/55)

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AATGCAGCCGTAAAAGTTTCGGTGGAATGAGATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGTGTGTGAAGTGTATGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTCAGGTATGATGGGCAGAATATTGCCTCTGCCCGCCAGAAAAAGTCAGCGCATTCCACCGTACGCCAGCGTCACTTCCTTCGCCGCTTTAATCACCATCGCGCCAA  >  NC_000913/4222594‑4222865
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aaTGCAGCCGTAAAAGTTTCGGTGGAATGAGATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGTGTGTGAAGTGTATGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCTAtt                                                                                                                                      <  1:2102885/140‑1 (MQ=255)
aaTGCAGCCGTAAAAGTTTCGGTGGAATGAGATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGTGTGTGAAGTGTATGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCTAtt                                                                                                                                      <  1:24087/140‑1 (MQ=255)
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      gCCGTAAAAGTTTCGGTGGAATGAGATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGTGTGTGAAGTGTATGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCTATTAACAGa                                                                                                                                <  2:1809431/140‑1 (MQ=255)
      gCCGTAAAAGTTTCGGTGGAATGAGATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGTGTGTGAAGTGTATGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCTATTAACAGa                                                                                                                                >  2:1960905/1‑140 (MQ=255)
      gCCGTAAAAGTTTCGGTGGAATGAGATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGTGTGTGAAGTGTATGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCTATTAACAGa                                                                                                                                <  2:743778/140‑1 (MQ=255)
      gCCGTAAAAGTTTCGGTGGAATGAGATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGTGTGTGAAGTGTATGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCTATTAACAGa                                                                                                                                <  1:1000192/140‑1 (MQ=255)
       ccGTAAAAGTTTCGGTGGAATGAGATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGTGTGTGAAGTGTATGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCTATTAACAGac                                                                                                                               >  1:38312/1‑140 (MQ=255)
       ccGTAAAAGTTTCGGTGGAATGAGATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGCTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGTGTGTGAAGTGTATGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCTATTAACAGac                                                                                                                               >  2:169522/1‑140 (MQ=255)
        cGTAAAAGTTTCGGTGGAATGAGATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGTGTGTGAAGTGTATGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCTATTAACAGaca                                                                                                                              <  1:945167/140‑1 (MQ=255)
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         gTAAAAGTTTCGGTGGAATGAGATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGTGTGTGAAGTGTATGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCTATTAACAGacac                                                                                                                             <  1:2130874/140‑1 (MQ=255)
           aaaaGTTTCGGTGGAATGAGATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGTGTGTGAAGTGTATGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCTATTAACAGACAccc                                                                                                                           <  2:1918363/140‑1 (MQ=255)
              aGTTTCGGTGGAATGAGATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGCTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGTGTGTGAAGTGTATGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCTATTAACAGACACCCTTa                                                                                                                        <  1:169522/140‑1 (MQ=255)
                      tGGAATGAGATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGTGTGTGAAGTGTATGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCTATTAACAGACACCCTTATTCTATTg                                                                                                                <  2:135167/140‑1 (MQ=255)
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                          aTGAGATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGTGTGTGAAGTGTATGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCTATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCAc                                                                                                            <  1:6592/140‑1 (MQ=255)
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                                           tGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGTGTGTGAAGTGTATGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCTATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTCAGGTATGATGGGCAg                                                                                           <  2:739505/140‑1 (MQ=255)
                                                           gTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGTGTGTGAAGTGTATGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCTATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTCAGGTATGATGGGCAGAATATTGCCTCTGccc                                                                           >  2:854136/1‑140 (MQ=255)
                                                            tttGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGTGTGTGAAGTGTATGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCTATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTCAGGTATGATGGGCAGAATATTGCCTCTGCCCg                                                                          >  1:647656/1‑140 (MQ=255)
                                                                          ataatGCTGAGTTAATAAAAGTGTGTGAAGTGTATGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCTATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTCAGGTATGATGGGCAGAATATTGCCTCTGCCCGCCAGAAAAAGTCAg                                                            <  1:921030/140‑1 (MQ=255)
                                                                            aatGCTGAGTTAATAAAAGTGTGTGAAGTGTATGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCTATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTCAGGTATGATGGGCAGAATATTGCCTCTGCCCGCCAGAAAAAGTCAgcg                                                          <  1:397435/140‑1 (MQ=255)
                                                                            aatGCTGAGTTAATAAAAGTGTGTGAAGTGTATGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCTATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTCAGGTATGATGGGCAGAATATTGCCTCTGCCCGCCAGAAAAAGTCAgcg                                                          <  2:1113382/140‑1 (MQ=255)
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                                                                              tGCTGAGTTAATAAAAGTGTGTGAAGTGTATGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCTATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTCAGGTATGATGGGCAGAATATTGCCTCTGCCCGCCAGAAAAAGTCAGCGCa                                                        <  1:1967718/140‑1 (MQ=255)
                                                                                 tGAGTTAATAAAAGTGTGTGAAGTGTATGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCTATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTCAGGTATGATGGGCAGAATATTGCCTCTGCCCGCCAGAAAAAGTCAGCGCATTc                                                     <  2:301921/140‑1 (MQ=255)
                                                                                    gTTAATAAAAGTGTGTGAAGTGTATGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCTATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTCAGGTATGATGGGCAGAATATTGCCTCTGCCCGCCAGAAAAAGTCAGCGCATTCCAc                                                  >  2:1940061/1‑140 (MQ=255)
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                                                                                          aaaaGTGTGTGAAGTGTATGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCTATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTCAGGTATGATGGGCAGAATATTGCCTCTGCCCGCCAGAAAAAGTCAGCGCATTCCACCGTACg                                            <  2:1079316/140‑1 (MQ=255)
                                                                                           aaaGTGTGTGAAGTGTATGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCTATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTCAGGTATGATGGGCAGAATATTGCCTCTGCCCGCCAGAAAAAGTCAGCGCATTCCACCGTACGc                                           <  1:1124430/140‑1 (MQ=255)
                                                                                             aGTGTGTGAAGTGTATGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCTATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTCAGGTATGATGGGCAGAATATTGCCTCTGCCCGCCAGAAAAAGTCAGCGCATTCCACCGTACGCCa                                         >  2:102091/1‑140 (MQ=255)
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                                                                                               tgtgtgAAGTGTATGACATTAAGTTATTTTGGCGTCATGCTATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTCAGGTATGATGGGCAGAATATTGCCTCTGCCCGCCAGAAAAAGTCAGCGCATTCCACCGTACGCCAGCg                                      >  2:1323440/1‑140 (MQ=255)
                                                                                                 tgtgAAGTGTATGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCTATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTCAGGTATGATGGGCAGAATATTGCCTCTGCCCGCCAGAAAAAGTCAGCGCATTCCACCGTACGCCAGCGt                                     >  2:1621105/1‑140 (MQ=255)
                                                                                                 tgtgAAGTGTATGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCTATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTCAGGTATGATGGGCAGAATATTGCCTCTGCCCGCCAGAAAAAGTCAGCGCATTCCACCGTACGCCAGCGt                                     >  1:549478/1‑140 (MQ=255)
                                                                                                 tgtgAAGTGTATGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCTATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTCAGGTATGATGGGCAGAATATTGCCTCTGCCCGCCAGAAAAAGTCAGCGCATTCCACCGTACGCCAGCGt                                     >  1:825612/1‑140 (MQ=255)
                                                                                                 tgtgAAGTGTATGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCTATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTCAGGTATGATGGGCAGAATATTGCCTCTGCCCGCCAGAAAAAGTCAGCGCATTCCACCGTACGCCAGCGt                                     >  2:637970/1‑140 (MQ=255)
                                                                                                 tgtgAAGTGTATGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCTATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTCAGGTATGATGGGCAGAATATTGCCTCTGCCCGCCAGAAAAAGTCAGCGCATTCCACCGTACGCCAGCGt                                     >  2:534796/1‑140 (MQ=255)
                                                                                                   tgAAGTGTATGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCTATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTCAGGTATGATGGGCAGAATATTGCCTCTGCCCGCCAGAAAAAGTCAGCGCATTCCACCGTACGCCAGCGTCa                                   >  1:1870474/1‑140 (MQ=255)
                                                                                                        tgtATGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCTATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTCAGGTATGATGGGCAGAATATTGCCTCTGCCCGCCAGAAAAAGTCAGCGCATTCCACCGTACGCCAGCGTCActtcc                              >  1:1155283/1‑140 (MQ=255)
                                                                                                         gtATGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCTATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTCAGGTATGATGGGCAGAATATTGCCTCTGCCCGCCAGAAAAAGTCAGCGCATTCCACCGTACGCCAGCGTCActtcct                             >  1:21825/1‑140 (MQ=255)
                                                                                                          tATGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCTATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTCAGGTATGATGGGCAGAATATTGCCTCTGCCCGCCAGAAAAAGTCAGCGCATTCCACCGTACGCCAGCGTCActtcctt                            >  2:303335/1‑140 (MQ=255)
                                                                                                          tATGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCTATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTCAGGTATGATGGGCAGAATATTGCCTCTGCCCGCCAGAAAAAGTCAGCGCATTCCACCGTACGCCAGCGTCActtcctt                            >  2:709985/1‑140 (MQ=255)
                                                                                                            tGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCTATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTCAGGTATGATGGGCAGAATATTGCCTCTGCCCGCCAGAAAAAGTCAGCGCATTCCACCGTACGCCAGCGTCACTTCCTTcg                          <  2:1659412/140‑1 (MQ=255)
                                                                                                            tGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCTATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTCAGGTATGATGGGCAGAATATTGCCTCTGCCCGCCAGAAAAAGTCAGCGCATTCCACCGTACGCCAGCGTCACTTCCTTcg                          >  1:1399515/1‑140 (MQ=255)
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                                                                                                                 ttAAGTTATTTTGGCGTCAATGCTATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTCAGGTATGATGGGCAGAATATTGCCTCTGCCCGCCAGAAAAAGTCAGCGCATTCCACCGTACGCCAGCGTCACTTCCTTCGCCGCt                     <  2:1870474/140‑1 (MQ=255)
                                                                                                                 ttAAGTTATTTTGGCGTCAATGCTATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTCAGGTATGATGGGCAGAATATTGCCTCTGCCCGCCAGAAAAAGTCAGCGCATTCCACCGTACGCCAGCGTCACTTCCTTCGCCGCt                     <  1:281721/140‑1 (MQ=255)
                                                                                                                  tAAGTTATTTTGGCGTCAATGCTATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTCAGGTATGATGGGCAGAATATTGCCTCTGCCCGCCAGAAAAAGTCAGCGCATTCCACCGTACGCCAGCGTCACTTCCTTCGCCGCtt                    >  2:1953494/1‑140 (MQ=255)
                                                                                                                  tAAGTTATTTTGGCGTCAATGCTATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTCAGGTATGATGGGCAGAATATTGCCTCTGCCCGCCAGAAAAAGTCAGCGCATTCCACCGTACGCCAGCGTCACTTCCTTCGCCGCtt                    >  2:1666089/1‑140 (MQ=255)
                                                                                                                  tAAGTTATTTTGGCGTCAATGCTATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTCAGGTATGATGGGCAGAATATTGCCTCTGCCCGCCAGAAAAAGTCAGCGCATTCCACCGTACGCCAGCGTCACTTCCTTCGCCGCtt                    >  1:623550/1‑140 (MQ=255)
                                                                                                                    aGTTATTTTGGCGTCAATGCTATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTCAGGTATGATGGGCAGAATATTGCCTCTGCCCGCCAGAAAAAGTCAGCGCATTCCACCGTACGCCAGCGTCACTTCCTTCGCCGCTTTa                  >  1:1986047/1‑140 (MQ=255)
                                                                                                                    aGTTATTTTGGCGTCAATGCTATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTCAGGTATGATGGGCAGAATATTGCCTCTGCCCGCCAGAAAAAGTCAGCGCATTCCACCGTACGCCAGCGTCACTTCCTTCGCCGCTTTa                  >  1:1362188/1‑140 (MQ=255)
                                                                                                                    aGTTATTTTGGCGTCAATGCTATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTCAGGTATGATGGGCAGAATATTGCCTCTGCCCGCCAGAAAAAGTCAGCGCATTCCACCGTACGCCAGCGTCACTTCCTTCGCCGCTTTa                  >  2:1292230/1‑140 (MQ=255)
                                                                                                                    aGTTATTTTGGCGTCAATGCTATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTCAGGTATGATGGGCAGAATATTGCCTCTGCCCGCCAGAAAAAGTCAGCGCATTCCACCGTACGCCAGCGTCACTTCCTTCGCCGCTTTa                  >  2:1077959/1‑140 (MQ=255)
                                                                                                                    aGTTATTTTGGCGTCAATGCTATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTCAGGTATGATGGGCAGAATATTGCCTCTGCCCGCCAGAAAAAGTCAGCGCATTCCACCGTACGCCAGCGTCACTTCCTTCGCCGCTTTa                  >  1:735115/1‑140 (MQ=255)
                                                                                                                    aGTTATTTTGGCGTCAATGCTATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTCAGGTATGATGGGCAGAATATTGCCTCTGCCCGCCAGAAAAAGTCAGCGCATTCCACCGTACGCCAGCGTCACTTCCTTCGCCGCTTTa                  >  1:1957983/1‑140 (MQ=255)
                                                                                                                         ttttGGCGTCAATGCTATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTCAGGTATGATGGGCAGAATATTGCCTCTGCCCGCCAGAAAAAGTCAGCGCATTCCACCGTACGCCAGCGTCACTTCCTTCGCCGCTTTAATCAc             >  2:1405960/1‑140 (MQ=255)
                                                                                                                          tttGGCGTCAATGCTATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTCAGGTATGATGGGCAGAATATTGCCTCTGCCCGCCAGAAAAAGTCGGCGCATTCCACCGTACGCCAGCGTCACTTCCTTCGCCGCTTTAATCAcc            >  2:910531/1‑140 (MQ=255)
                                                                                                                          tttGGCGTCAATGCTATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTCAGGTATGATGGGCAGAATATTGCCTCTGCCCGCCAGAAAAAGTCAGCGCATTCCACCGTACGCCAGCGTCACTTCCTTCGCCGCTTTAATCAcc            >  2:365940/1‑140 (MQ=255)
                                                                                                                            tGGCGTCAATGCTATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTCAGGTATGATGGGCAGAATATTGCCTCTGCCCGCCAGAAAAAGTCAGCGCATTCCACCGTACGCCAGCGTCACTTCCTTCGCCGCTTTAATCACCAt          <  2:623550/140‑1 (MQ=255)
                                                                                                                            tGGCGTCAATGCTATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTCAGGTATGATGGGCAGAATATTGCCTCTGCCCGCCAGAAAAAGTCAGCGCATTCCACCGTACGCCAGCGTCACTTCCTTCGCCGCTTTAATCACCAt          <  2:53314/140‑1 (MQ=255)
                                                                                                                            tGGCGTCAATGCTATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTCAGGTATGATGGGCAGAATATTGCCTCTGCCCGCCAGAAAAAGTCAGCGCATTCCACCGTACGCCAGCGTCACTTCCTTCGCCGCTTTAATCACCAt          <  2:2167967/140‑1 (MQ=255)
                                                                                                                            tGGCGTCAATGCTATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTCAGGTATGATGGGCAGAATATTGCCTCTGCCCGCCAGAAAAAGTCAGCGCATTCCACCGTACGCCAGCGTCACTTCCTTCGCCGCTTTAATCACCAt          <  1:1953494/140‑1 (MQ=255)
                                                                                                                            tGGCGTCAATGCTATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTCAGGTATGATGGGCAGAATATTGCCTCTGCCCGCCAGAAAAAGTCAGCGCATTCCACCGTACGCCAGCGTCACTTCCTTCGCCGCTTTAATCACCAt          <  1:1007307/140‑1 (MQ=255)
                                                                                                                                gTCAATGCTATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTCAGGTATGATGGGCAGAATATTGCCTCTGCCCGCCAGAAAAAGTCAGCGCATTCCACCGTACGCCAGCGTCACTTCCTTCGCCGCTTTAATCACCATcgcg      <  2:1362188/140‑1 (MQ=255)
                                                                                                                                 tCAATGCTATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTCAGGTATGATGGGCAGAATATTGCCTCTGCCCGCCAGAAAAAGTCAGCGCATTCCACCGTACGCCAGCGTCACTTCCTTCGCCGCTTTAATCACCATCgcgc     >  2:1456408/1‑140 (MQ=255)
                                                                                                                                   aaTGCTATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTCAGGTATGATGGGCAGAATATTGCCTCTGCCCGCCAGAAAAAGTCAGCGCATTCCACCGTACGCCAGCGTCACTTCCTTCGCCGCTTTAATCACCATCGCGCCa   >  2:1953374/1‑140 (MQ=255)
                                                                                                                                    aTGCTATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTCAGGTATGATGGGCAGAATATTGCCTCTGCCCGCCAGAAAAAGTCAGCGCATTCCACCGTACGCCAGCGTCACTTCCTTCGCCGCTTTAATCACCATCGCGCCaa  <  2:2154951/140‑1 (MQ=255)
                                                                                                                                        |                                                                                                                                       
AATGCAGCCGTAAAAGTTTCGGTGGAATGAGATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGTGTGTGAAGTGTATGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTCAGGTATGATGGGCAGAATATTGCCTCTGCCCGCCAGAAAAAGTCAGCGCATTCCACCGTACGCCAGCGTCACTTCCTTCGCCGCTTTAATCACCATCGCGCCAA  >  NC_000913/4222594‑4222865

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: