New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 235344 | 54 (0.990) | 4 (0.080) | 4/258 | 5.2 | 7.8% | coding (529/723 nt) | yafS | putative S‑adenosyl‑L‑methionine‑dependent methyltransferase |
? | NC_000913 | = 235428 | 44 (0.860) | coding (613/723 nt) | yafS | putative S‑adenosyl‑L‑methionine‑dependent methyltransferase | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
CATCAGTTTTATGGGATTACGCAAACTTGTGCCGGTATTGCGCAAAACCTCGCCCTATAACAGCCGGATGTTTACTCTGATGCGGCAGCTGGACTGGCTCTCTTTGTTGAATTTTGAAGTGCTACACGCCAGCCGTTTCCACGTTCTCCCGTGGAACAAACACGGAGGAAAACTATTGAATGCGCATATTCCTGCGCTTGGTTGCTTACAACTTATTGTTGCCCGGAAACGGACTATTCCTTTAACGCTAAATCCGATGAAACAGAGTAAAAACAAGCC > NC_000913/235205‑235483 | cATCAGTTTTATGGGATTACGCAAACTTGTGCCGGTATTGCGCAAAACCTCGCCCTATAACAGCCGGATGTTTACTCTGATGCGGCAGCTGGACTGGCTCTCTTTGTTGAATTTTGAAGTGCTACACGCCAGCCGTTTcc < 1:906721/140‑1 (MQ=255) tCAGTTTTATGGGATTACGCAAACTTGTGCCGGTATTGCGCAAAACCTCGCCCTATAACAGCCGGATGTTTACTCTGATGCGGCAGCTGGACTGGCTCTCTTTGTTGAATTTTGAAGTGCTACACGCCAGCCGTTTCCAc > 1:917588/1‑140 (MQ=255) gTTTTATGGGATTACGCAAACTTGTGCCGGTATTGCGCAAAACCTCGCCCTATAACAGCCGGATGTTTACTCTGATGCGGCAGCTGGACTGGCTCTCTTTGTTGAATTTTGAAGTGCTACACGCCAGCCGTTTCCACGtt < 2:886508/140‑1 (MQ=255) ttttATGGGATTACGCAAACTTGTGCCGGTATTGCGCAAAACCTCGCCCTATAACAGCCGGATGTTTACTCTGATGCGGCAGCTGGACTGGCTCTCTTTGTTGAATTTTGAAGTGCTACACGCCAGCCGTTTCCACGTtc > 2:836749/1‑140 (MQ=255) tttATGGGATTACGCAAACTTGTGCCGGTATTGCGCAAAACCTCGCCCTATAACAGCCGGATGTTTACTCTGATGCGGCAGCTGGACTGGCTCTCTTTGTTGAATTTTGAAGTGCTACACGCCAGCCGTTTCCACGTtct < 1:405966/140‑1 (MQ=255) tGGGATTACGCAAACTTGTGCCGGTATTGCGCAAAACCTCGCCCTATAACAGCCGGATGTTTACTCTGATGCGGCAGCTGGACTGGCTCTCTTTGTTGAATTTTGAAGTGCTACACGCCAGCCGTTTCCACGTTCTCCCg > 2:721254/1‑140 (MQ=255) gggATTACGCAAACTTGTGCCGGTATTGCGCAAAACCTCGCCCTATAACAGCCGGATGTTTACTCTGATGCGGCAGCTGGACTGGCTCTCTTTGTTGAATTTTGAAGTGCTACACGCCAGCCGTTTCCACGTTCTCCCGt < 1:873407/140‑1 (MQ=255) aTTACGCAAACTTGTGCCGGTATTGCGCAAAACCTCGCCCTATAACAGCCGGATGTTTACTCTGATGCGGCAGCTGGACTGGCTCTCTTTGTTGAATTTTGAAGTGCTACACGCCAGCCGTTTCCACGTTCTCCCGTGGa < 2:860460/140‑1 (MQ=255) ttACGCAAACTTGTGCCGGTATTGCGCAAAACCTCGCCCTATAACAGCCGGATGTTTACTCTGATGCGGCAGCTGGACTGGCTCTCTTTGTTGAATTTTGAAGTGCTACACGCCAGCCGTTTCCACGTTCTCCCGTGGaa > 2:743621/1‑140 (MQ=255) aCTTGTGCCGGTATTGCGCAAAACCTCGCCCTATAACAGCCGGATGTTTACTCTGATGCGGCAGCTGGACTGGCTCTCTTTGTTGAATTTTGAAGTGCTACACGCCAGCCGTTTCCACGTTCTCCCGTGGAACAAACACg < 2:157120/140‑1 (MQ=255) tgCCGGTATTGCGCAAAACCTCGCCCTATAACAGCCGGATGTTTACTCTGATGCGGCAGCTGGACTGGCTCTCGTTGTTGAATTTTGAAGTGCTACACGCCAGCCGTTTCCACGTTCTCCCGTGGAACAAACACggagga < 2:543722/140‑1 (MQ=255) ccGGTATTGCGCAAAACCTCGCCCTATAACAGCCGGATGTTTACTCTGATGCGGCAGCTGGACTGGCTCTCTTTGTTGAATTTTGAAGTGCTACACGCCAGCCGTTTCCACGTTCTCCCGTGGAACAAACACGGAGGaaa < 1:836749/140‑1 (MQ=255) aTTGCGCAAAACCTCGCCCTATAACAGCCGGATGTTTACTCTGATGCGGCAGCTGGACTGGCTCTCTTTGTTGAATTTTGAAGTGCTACACGCCAGCCGTTTCCACGTTCTCCCGTGGAACAAACACGGAGGAAAACTAt > 1:37468/1‑140 (MQ=255) aaaaCCTCGCCCTATAACAGCCGGATGTTTACTCTGATGCGGCAGCTGGACTGGCTCTCTTTGTTGAATTTTGAAGTGCTACACGCCAGCCGTTTCCACGTTCTCCCGTGGAACAAACACGGAGGAAAACTATTGAATgc < 2:216127/140‑1 (MQ=255) gCCCTATAACAGCCGGATGTTTACTCTGATGCGGCAGCTGGACTGGCTCTCTTTGTTGAATTTTGAAGTGCTACACGCCAGCCGTTTCCACGTTCTCCCGTGGAACAAACACGGAGGAAAACTATTGAATGCGCATATTc > 1:484541/1‑140 (MQ=255) aGCCGGATGTTTACTCTGATGCGGCAGCTGGACTGGCTCTCTTTGTTGAATTTTGAAGTGCTACACGCCAGCCGTTTCCACGTTCTCCCGTGGAACAAACACGGAGGAAAACTATTGAATGCGCATATTCCTGCGCTTgg < 1:131776/140‑1 (MQ=255) ccGGATGTTTACTCTGATGCGGCAGCTGGACTGGCTCTCTTTGTTGAATTTTGAAGTGCTACACGCCAGCCGTTTCCACGTTCTCCCGTGGAACAAACACGGAGGAAAACTATTGAATGCGCATATTCCTGCGCTTGGtt > 2:236064/1‑140 (MQ=255) ccGGATGTTTACTCTGATGCGGCAGCTGGACTGGCTCTCTTTGTTGAATTTTGAAGTGCTACACGCCAGCCGTTTCCACGTTCTCCCGTGGAACAAACACGGAGGAAAACTATTGAATGCGCATATTCCTGCGCTTGGtt > 1:878446/1‑140 (MQ=255) ggATGTTTACTCTGATGCGGCAGCTGGACTGGCTCTCTTTGTTGAATTTTGAAGTGCTACACGCCAGCCGTTTCCACGTTCTCCCGTGGAACAAACACGGAGGAAAACTATTGAATGCGCATATTCCTGCGCTTGGtt < 2:365480/138‑1 (MQ=255) ggATGTTTACTCTGATGCGGCAGCTGGACTGGCTCTCTTTGTTGAATTTTGAAGTGCTACACGCCAGCCGTTTCCACGTTCTCCCGTGGAACAAACACGGAGGAAAACTATTGAATGCGCATATTCCTGCGCTTGGtt > 1:365480/1‑138 (MQ=255) ggATGTTTACTCTGATGCGGCAGCTGGACTGGCTCTCTTTGTTGAATTTTG‑AGTGCTACACGCCAGCCGTTTCCACGTTCTCCCGTGGAACAAACACGGAGGAAAACTATTGAATGCGCATATTCCTGCGCTTgg > 2:209704/1‑135 (MQ=255) ggATGTTTACTCTGATGCGGCAGCTGGACTGGCTCTCTTTGTTGAATTTTG‑AGTGCTACACGCCAGCCGTTTCCACGTTCTCCCGTGGAACAAACACGGAGGAAAACTATTGAATGCGCATATTCCTGCGCTTgg < 1:209704/135‑1 (MQ=255) gATGTTTACTCTGATGCGGCAGCTGGACTGGCTCTCTTTGTTGAATTTTGAAGTGCTACACGCCAGCCGTTTCCACGTTCTCCCGTGGAACAAACACGGAGGAAAACTATTGAATGCGCATATTCCTGCGCTTGGTTGCt > 2:745227/1‑140 (MQ=255) aTGTTTACTCTGATGCGGCAGCTGGACTGGCTCTCTTTGTTGAATTTTGAAGTGCTACACGCCAGCCGTTTCCACGTTCTCCCGTGGAACAAACACGGAGGAAAACTATTGAATGCGCATATTCCTGCGCTTGGTTGCtt < 1:743621/140‑1 (MQ=255) aTGTTTACTCTGATGCGGCAGCTGGACTGGCTCTCTTTGTTGAATTTTGAAGTGCTACACGCCAGCCGTTTCCACGTTCTCCCGTGGAACAAACACGGAGGAAAACTATTGAATGCGCATATTCCTGCGCTTGGTTGCtt < 2:467324/140‑1 (MQ=255) aTGTTTACTCTGATGCGGCAGCTGGACTGGCTCTCTTTGTTGAATTTTGAAGTGCTACACGCCAGCCGTTTCCACGTTCTCCCGTGGAACAAACACGGAGGAAAACTATTGAATGCGCATATTCCTGCGCTTGGTTGCtt < 2:878446/140‑1 (MQ=255) tGTTTACTCTGATGCGGCAGCTGGACTGGCTCTCTTTGTTGAATTTTGAAGTGCTACACGCCAGCCGTTTCCACGTTCTCCCGTGGAACAAACACGGAGGAAAACTATTGAATGCGCATATTCCTGCGCTTGGTTGCTTa < 1:236064/140‑1 (MQ=255) gTTTACTCTGATGCGGCAGCTGGACTGGCTCTCTTTGTTGAATTTTGAAGTGCTACAC‑CCAGCCGTTTCCACGTTCTCCCGTGGAACAAACACGGAGGAAAACTATTGAATGCGCATATTCCTGCGCTTGGTTGCTTACa < 1:766364/140‑1 (MQ=255) ctctGATGCGGCAGCTGGACTGGCTCTCTTTGTTGAATTTTGAAGTGCTACACGCCAGCCGTTTCCACGTTCTCCCGTGGAACAAACACGGAGGAAAACTATTGAATGCGCATATTCCTGCGCTTGGTTGCTTACAACtt < 1:85658/140‑1 (MQ=255) gATGCGGCAGCTGGACTGGCTCTCTTTGTTGAATTTTGAAGTGCTACACGCCAGCCGTTTCCACGTTCTCCCGTGGAACAAACACGGAGGAAAACTATTGAATGCGCATATTCCTGCGCTTGGTTGCTTACAACTTAttg > 2:676003/1‑140 (MQ=255) aTGCGGCAGCTGGACTGGCTCTCTTTGTTGAATTTTGAAGTGCTACACGCCAGCCGTTTCCACGTTCTCCCGTGGAACAAACACGGAGGAAAACTATTGAATGCGCATATTCCTGCGCTTGGTTGCTTa > 2:838984/1‑129 (MQ=255) aTGCGGCAGCTGGACTGGCTCTCTTTGTTGAATTTTGAAGTGCTACACGCCAGCCGTTTCCACGTTCTCCCGTGGAACAAACACGGAGGAAAACTATTGAATGCGCATATTCCTGCGCTTGGTTGCTTa < 1:353254/129‑1 (MQ=255) aTGCGGCAGCTGGACTGGCTCTCTTTGTTGAATTTTGAAGTGCTACACGCCAGCCGTTTCCACGTTCTCCCGTGGAACAAACACGGAGGAAAACTATTGAATGCGCATATTCCTGCGCTTGGTTGCTTa < 1:838984/129‑1 (MQ=255) aTGCGGCAGCTGGACTGGCTCTCTTTGTTGAATTTTGAAGTGCTACACGCCAGCCGTTTCCACGTTCTCCCGTGGAACAAACACGGAGGAAAACTATTGAATGCGCATATTCCTGCGCTTGGTTGCTTa > 2:353254/1‑129 (MQ=255) aTGCGGCAGCTGGACTGGCTCTCTTTGTTGAATTTTGAAGTGCTACACGCCAGCCGTTTCCACGTTCTCCCGTGGAACAAACACGGAGGAAAACTATTGAATGCGCATATTCCTGCGCTTGGTTGCTTACAACTTAttgt > 1:78719/1‑140 (MQ=255) aTGCGGCAGCTGGACTGGCTCTCTTTGTTGAATTTTGAAGTGCTACACGCCAGCCGTTTCCACGTTCTCCCGTGGAACAAACACGGAGGAAAACTATTGAATGCGCATATTCCTGCGCTTGGTTGCTTACAACTTAttgt > 2:847700/1‑140 (MQ=255) gCTGGACTGGCTCTCTTTGTTGAATTTTGAAGTGCTACACGCCAGCCGTTTCCACGTTCTCCCGTGGAACAAACACGGAGGAAAACTATTGAATGCGCATATTCCTGCGCTTGGTTGCTTACAACTTATTGTTGCCCGGa > 1:683222/1‑140 (MQ=255) cTGGACTGGCTCTCTTTGTTGAATTTTGAAGTGCTACACGCCAGCCGTTTCCACGTTCTCCCGTGGAACAAACACGGAGGAAAACTATTGAATGCGCATATTCCTGCGCTTGGTTGCTTACAACTTATTGTTGCCCGGaa > 2:213587/1‑140 (MQ=255) aTTTTGAAGTGCTACACGCCAGCCGTTTCCACGTTCTCCCGTGGAACAAACACGGAGGAAAACTATTGAATGCGCATATTCCTGCGCTTGGTTGCTTACAACTTATTGTTGCCCGGAAACGGACTATTCCTTTAACGCTa > 2:109408/1‑140 (MQ=255) tttGAAGTGCTACACGCCAGCCGTTTCCACGTTCTCCCGTGGAACAAACACGGAGGAAAACTATTGAATGCGCATATTCCTGCGCTTGGTTGCTTACAACTTATTGTTGCCCGGAAACGGACTATTCCTTTAACGCTaaa < 2:78719/140‑1 (MQ=255) tGAAGTGCTACACGCCAGCCGTTTCCACGTTCTCCCGTGGAACAAACACGGAGGAAACCTATTGAATGCGCATATTCCTGCGCTTGGTTGCTTACAACTTATTGTTGCCCGGAAACGGACTATTCCTTTAACGCTAAATc < 1:721254/140‑1 (MQ=255) tGAAGTGCTACACGCCAGCCGTTTCCACGTTCTCCCGTGGAACAAACACGGAGGAAAACTATTGAATGCGCATATTCCTGCGCTTGGTTGCTTACAACTTATTGTTGCCCGGAAACGGACTATTCCTTTAACGCTAAATc > 1:406381/1‑140 (MQ=255) acacGCCAGCCGTTTCCACGTTCTCCCGTGGAACAAACACGGAGGAAAACTATTGAATGCGCATATTCCTGCGCTTGGTTGCTTACAACTTATTGTTGCCCGGAAACGGACTATTCCTTTAACGCTAAATCCGATGAAAc < 2:406381/140‑1 (MQ=255) acacGCCAGCCGTTTCCACGTTCTCCCGTGGAACAAACACGGAGGAAAACTATTGAATGCGCATATTCCTGCGCTTGGTTGCTTACAACTTATTGTTGCCCGGAAACGGACTATTCCTTTAACGCTAAATCCGATGAAAc < 1:830000/140‑1 (MQ=255) acacGCCAGCCGTTTCCACGTTCTCCCGTGGAACAAACACGGAGGAAAACTATTGAATGCGCATATTCCTGCGCTTGGTTGCTTACAACTTATTGTTGCCCGGAAACGGACTATTCCTTTAACGCTAAATCCGATGAAAc < 2:917588/140‑1 (MQ=255) gCCAGCCGTTTCCACGTTCTCCCGTGGAACAAACACGGAGGAAAACTATTGAATGCGCATATTCCTGCGCTTGGTTGCTTACAACTTATTGTTGCCCGGAAACGGACTATTCCTTTAACGCTAAATCCGATGAAAc > 1:898682/1‑136 (MQ=255) gCCAGCCGTTTCCACGTTCTCCCGTGGAACAAACACGGAGGAAAACTATTGAATGCGCATATTCCTGCGCTTGGTTGCTTACAACTTATTGTTGCCCGGAAACGGACTATTCCTTTAACGCTAAATCCGATGAAAc < 2:898682/136‑1 (MQ=255) gCCGTTTCCACGTTCTCCCGTGGAACAAACACGGAGGAAAACTATTGAATGCGCATATTCCTGCGCTTGGTTGCTTACAACTTATTGTTGCCCGGAAACGGACTATTCCTTTAACGCTAAATCCGATGAAACAGAGTaaa > 1:562043/1‑140 (MQ=255) gCCGTTTCCACGTTCTCCCGTGGAACAAACACGGAGGAAAACTATTGAATGCGCATATTCCTGCGCTTGGTTGCTTACAACTTATTGTTGCCCGGAAACGGACTATTCCTTTAACGCTAAATCCGATGAAACAGAGTaaa > 2:93176/1‑140 (MQ=255) ccGTTTCCACGTTCTCCCGTGGAACAAACACGGAGGAAAACTATTGAATGCGCATATTCCTGCGCTTGGTTGCTTACAACTTATTGTTGCCCGGAAACGGACTATTCCTTTAACGCTAAATCCGATGAAACAGAGTaaaa > 1:96483/1‑140 (MQ=255) ccGTTTCCACGTTCTCCCGTGGAACAAACACGGAGGAAAACTATTGAATGCGCATATTCCTGCGCTTGGTTGCTTACAACTTATTGTTGCCCGGAAACGGACTATTCCTTTAACGCTAAATCCGATGAAACAGAGTaaaa > 1:135161/1‑140 (MQ=255) tCCACGTTCTCCCGTGGAACAAACACGGAGGAAAACTATTGAATGCGCATATTCCTGCGCTTGGTTGCTTACAACTTATTGTTGCCCGGAAACGGACTATTCCTTTAACGCTAAATCCGATGAAACAGAGTAAAAACAAg > 1:907280/1‑140 (MQ=255) cACGTTCTCCCGTGGAACAAACACGGAGGAAAACTATTGAATGCGCATATTCCTGCGCTTGGTTGCTTACAACTTATTGTTGCCCGGAAACGGACTATTCCTTTAACGCTAAATCCGATGAAACAGAGTAAAAACAAGcc < 2:13225/140‑1 (MQ=255) cACGTTCTCCCGTGGAACAAACACGGAGGAAAACTATTGAATGCGCATATTCCTGCGCTTGGTTGCTTACAACTTATTGTTGCCCGGAAACGGACTATTCCTTTAACGCTAAATCCGATGAAACAGAGTAAAAACAAGcc < 1:745227/140‑1 (MQ=255) cACGTTCTCCCGTGGAACAAACACGGAGGAAAACTATTGAATGCGCATATTCCTGCGCTTGGTTGCTTACAACTTATTGTTGCCCGGAAACGGACTATTCCTTTAACGCTAAATCCGATGAAACAGAGTAAAAACAAGcc < 1:109408/140‑1 (MQ=255) | CATCAGTTTTATGGGATTACGCAAACTTGTGCCGGTATTGCGCAAAACCTCGCCCTATAACAGCCGGATGTTTACTCTGATGCGGCAGCTGGACTGGCTCTCTTTGTTGAATTTTGAAGTGCTACACGCCAGCCGTTTCCACGTTCTCCCGTGGAACAAACACGGAGGAAAACTATTGAATGCGCATATTCCTGCGCTTGGTTGCTTACAACTTATTGTTGCCCGGAAACGGACTATTCCTTTAACGCTAAATCCGATGAAACAGAGTAAAAACAAGCC > NC_000913/235205‑235483 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |