Predicted mutation | ||||||
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RA | NC_000913 | 2,809,405 | C→A | pseudogene (1090/1178 nt) | ygaY → | putative transporter YgaY, N‑terminal fragment |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 2,809,405 | 0 | C | A | 100.0% | 305.4 / NA | 87 | pseudogene (1090/1178 nt) | ygaY | putative transporter YgaY, N‑terminal fragment |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base A (19/68); total (19/68) |
Only 100 of 114 total aligned reads displayed.
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cAACATGGC‑GGTTG‑GGATGGCGTTTGTCTGG‑CTGGCGC‑GAC‑GA‑TTGCCC‑TGGTTAACTTACTGGTCTGGTGGCGAGGTTTTCATCG‑TCA‑GGAAGCCGCAAATTAAGCAATCAGCAACCGTTTTCGTGGCTTTACACTtat > 1:712250/1‑140 (MQ=255) aaCATGGC‑GGTTG‑GGATGGCGTTTGTCTGG‑CTGGCGC‑GAC‑GA‑TTGCCC‑TGGTTAACTTACTGGTCTGGTGGCGAGGTTTTCATCG‑TCA‑GGAAGCCGCAAATTAAGCAATCAGCAACCGTTTTCGTGGCTTTACACTtata < 2:190776/140‑1 (MQ=255) aaCATGGC‑GGTTG‑GGATGGCGTTTGTCTGG‑CTGGCGC‑GAC‑GA‑TTGCCC‑TGGTTAACTTACTGGTCTGGTGGCGAGGTTTTCATCG‑TCA‑GGAAGCCGCAAATTAAGCAATCAGCAACCGTTTTCGTGGCTTTACACTtata < 1:654491/140‑1 (MQ=255) aCATGGC‑GGTTG‑GGATGGCGTTTGTCTGG‑CTGGCGC‑GAC‑GA‑TTGCCC‑TGGTTAACTTACTGGTCTGGTGGCGAGGTTTTCATCG‑TCA‑GGAAGCCGCAAATTAAGCAATCAGCAACCGTTTTCGTGGCTTTACACTTATaa < 1:600020/140‑1 (MQ=255) aCATGGC‑GGTTG‑GGATGGCGTTTGTCTGG‑CTGGCGC‑GAC‑GA‑TTGCCC‑TGGTTAACTTACTGGTCTGGTGGCGAGGTTTTCATCG‑TCA‑GGAAGCCGCAAATTAAGCAATCAGCAACCGTTTTCGTGGCTTTACACTTATaa < 2:60701/140‑1 (MQ=255) aCATGGC‑GGTTG‑GGATGGCGTTTGTCTGA‑CTGGCGC‑GAC‑GA‑TTGCCC‑TGGTTAACTTACTGGTCTGGTGGCGAGGTTTTCATCG‑TCA‑GGAAGCCGCAAATTAAGCAATCAGCAACCGTTTTCGTGGCTTTACACTTATaa < 1:1031209/140‑1 (MQ=255) tGGC‑GGTTG‑GGGTGGGGTTTGTTTGG‑CTGGCGC‑GAC‑GG‑TTGCCC‑TGGTTAACTTTCTGGTCTGGGGGCGAGGTTTTCATCG‑TCA‑GGAAGCCGCAAAATTAACAATCAGCAACCGTTTTTGTGGCTTTACACTTATaaaat > 2:452699/1‑137 (MQ=255) tGGC‑GGTTG‑GGATGGCGTTTGTCTGG‑CTGGCGC‑GAC‑GA‑TTGCCC‑TGGTTAACTTACTGGTCTGGTGGCGAGGTTTTCATCG‑TCA‑GGAAGCCGCAAATTAAGCAATCAGCAACCGTTTTCGTGGCTTTac > 2:553194/1‑129 (MQ=255) tGGC‑GGTTG‑GGATGGCGTTTGTCTGG‑CTGGCGC‑GAC‑GA‑TTGCCC‑TGGTTAACTTACTGGTCTGGTGGCGAGGTTTTCATCG‑TCA‑GGAAGCCGCAAATTAAGCAATCAGCAACCGTTTTCGTGGCTTTac < 1:553194/129‑1 (MQ=255) tGGC‑GGTTG‑GGATGGCGTTTGTCTGG‑CTGGCGC‑GAC‑GA‑TTGCCC‑TGGTTAACTTACTGGTCTGGTGGCGAGGTTTTCATCG‑TCA‑GGAAGCCGCAAATTAAGCAATCAGCAACCGTTTTCGTGGCTTTACACTTATAAggg < 2:1118817/140‑1 (MQ=255) tGGC‑GGTTG‑GGATGGCGTTTGTCTGG‑CTGGCGC‑GAC‑GA‑TTGCCC‑TGGTTAACTTACTGGTCTGGTGGCGAGGTTTTCATCG‑TCA‑GGAAGCCGCAAATTAAGCAATCAGCAACCGTTTTCGTGGCTTTACACTTATAAggg < 1:187450/140‑1 (MQ=255) ggC‑GGTTG‑GGATGGCGTTTGTCTGG‑CTGGCGC‑GAC‑GA‑TTGCCC‑TGGTTAACTTACTGGTCTGGTGGCGAGGTTTTCATCG‑TCA‑GGAAGCCGCAAATTAAGCAATCAGCAACCGTTTTCGTGGCTTTACACTTATAAGGgt < 2:1149203/140‑1 (MQ=255) c‑GGTTG‑GGATGGCGTTTGTCTGG‑CTGGCGC‑GAC‑GA‑TTGCCC‑TGGTTAACTTACTGGTCTGGTGGCGAGGTTTTCATCG‑TCA‑GGAAGCCGCAAATTAAGCAATCAGCAACCGTTTTCGTGGCTTTACACTTATAAGGgtgt > 2:680068/1‑140 (MQ=255) ggTTG‑GGATGGCGTTTGTCTGG‑CTGGCGC‑GAC‑GA‑TTGCCC‑TGGTTAACTTACTGGTCTGGTGGCGAGGTTTTCATCG‑TCA‑GGAAGCCGCAAATTAAGCAATCAGCAACCGTTTTCGTGGCTTTac < 1:714304/125‑1 (MQ=255) ggTTG‑GGATGGCGTTTGTCTGG‑CTGGCGC‑GAC‑GA‑TTGCCC‑TGGTTAACTTACTGGTCTGGTGGCGAGGTTTTCATCG‑TCA‑GGAAGCCGCAAATTAAGCAATCAGCAACCGTTTTCGTGGCTTTac > 2:714304/1‑125 (MQ=255) gTTG‑GGATGGCGTTTGTCTGG‑CTGGCGC‑GAC‑GA‑TTGCCC‑TGGTTAACTTACTGGTCTGGTGGCGAGGTTTTCATCG‑TCA‑GGAAGCCGCAAATTAAGCAATCAGCAACCGTTTTCGTGGCTTTACACTTATAAGGGTGTTa < 2:712250/140‑1 (MQ=255) tG‑GGATGGCGTTTGTCTGG‑CTGGCGC‑GAC‑GA‑TTGCCC‑TGGTTAACTTACTGGTCTGGTGGCGAGGTTTTCATCG‑TCA‑GGAAGCCGCAAATTAAGCAATCAGCAACCGTTTTCGTGGCTTTACACTTATAAGGGTGTTaag < 1:26842/140‑1 (MQ=255) tG‑GGATGGCGTTTGTCTGG‑CTGGCGC‑GAC‑GA‑TTGCCC‑TGGTTAACTTACTGGTCTGGTGGCGAGGTTTTCATCG‑TCA‑GGAAGCCGCAAATTAAGCAATCAGCAACCGTTTTCGTGGCTTTACACTTATAAGGGTGTTaag < 1:1078062/140‑1 (MQ=255) g‑gggTGGCGTTTGTCTGG‑CTGGCGC‑GAC‑GA‑TTGCCC‑TGGTTAAATTAATGGTCTGGGGGGGGGGGTTTTCTCG‑TCA‑GGGAACCGCAAAATAAGCAATCAGCAACCGGTTTCGTGGCTTTACACTTATAAGGGGGTTaaaa > 2:1078062/1‑138 (MQ=255) g‑gggTGGCGTTTGTCTGG‑CTGGCGC‑GAC‑GA‑TTGCCC‑CGGTTAACTTACTGGTCTGGTGGCGAGGTTTTCATCG‑TCA‑GGAAGCCGCAAATTAAGCAATCAGCAACCGTTTTCTTGGCTTTTCACTTATAAGGGGGTTaaga > 2:1401848/1‑140 (MQ=255) | CTAACCAGACGGTAATTTATCGGATACATCCTGATGCGCGCAATCGCCTGACCGCAGGTTACATGACTAGCTACTTTATTGGCGGTGCCGCCGGTTCGCTAATTTCAGCCTCAGCCTGGCAACATGGC‑GGTTG‑GGCTGGCGTTTGTCTGG‑CTGGCGC‑GAC‑GA‑TTGCCC‑TGGTTAACTTACTGGTCTGGTGGCGAGGTTTTCATCG‑TCA‑GGAAGCCGCAAATTAAGCAATCAGCAACCGTTTTCGTGGCTTTACACTTATAAGGGTGTTAAGA > NC_000913/2809270‑2809541 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |