Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,926,366 | 0 | A | C | 28.8% | 111.0 / 22.5 | 59 | G30G (GGT→GGG) | mioC | flavoprotein MioC |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (33/9); new base C (0/17); total (33/26) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.13e-08 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. |
TCTGTTCCTGCAATGCTTCATAGAAAGGAGAAAGGTTGTCCGGAATATCTCCGGCACCGTGGGTGGAGCT‑GATAACCAGCCAGATCCCTG‑AGGCAGGTAAATCTTCTAACAGCGGACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAACCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAAGAGTGATATCTGCCATAAACCGCCACCTTTATTAAGAGTGGCGTATTGTACGCTGTGAACGCGT > NC_000913/3926227‑3926503 | tCTGTTCCTGCAATGCTTCATAGAAAGGAGAAAGGTTGTCCGGAATATCTCCGGCACCGTGGGTGGAGCT‑GATAACCAGCCAGATCCCTG‑AGGCAGGTAAATCTTCTAACAGCGGACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTaaaa > 2:820143/1‑140 (MQ=255) gCAATGCTTCATAGAAAGGAGAAAGGTTGTCCGGAATATCTCCGGCACCGTGGGTGGAGCT‑GATAACCAGCCAGATCCCTG‑AGGCAGGTAAATCTTCTAACAGCGGACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAACCCGCctct > 2:723628/1‑140 (MQ=255) gCTTCATAGAAAGGAGAAAGGTTGTCCGGAATATCTCCGGCACCGTGGGTGGAGCT‑GATAACCAGCCAGATCCCTG‑AGGCAGGTAAATCTTCTAACAGCGGACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAACCCGCCTCTTCCAg > 2:966568/1‑140 (MQ=255) aTAGAAAGGAGAAAGGTTGTCGGAAATATCTCCGGCACCGTGGGTGGAGCT‑GATAACCAGCCAGACCCCTG‑AGGCAGGTAAATCTTCTAACAGCGGCCCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAACCCGCCTCTTCCAGCtttt < 2:348726/140‑1 (MQ=255) agaaaggagaaagtTTGTCCGAAATTTCTCGGGCACCGGGGGGGGAGCT‑GATAACCAGCCAGACCCTTG‑AGGCAGGTAAATCTTCTAACAGCGGACCGTGCAGCTTTTCGGGGGTAAAACCCGCCTCTTCCAGCTTTTCa < 2:831448/140‑1 (MQ=255) aggagaaaggTTGTCCGGAATATCTCCGGCACCGTGGGTGGAGCT‑GATAACCAGCCAGATCCCTG‑AGGCAGGTAAATCTTCTAACAGCGGACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAACCCGCCTCTTCCa < 1:744201/128‑1 (MQ=255) aggagaaaggTTGTCCGGAATATCTCCGGCACCGTGGGTGGAGCT‑GATAACCAGCCAGATCCCTG‑AGGCAGGTAAATCTTCTAACAGCGGACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAACCCGCCTCTTCCa > 2:744201/1‑128 (MQ=255) aggagaaaggTTGTCCGGAATATCTCCGGCACCGTGGGTGGAGCT‑GATAACCAGCCAGATCCCTG‑AGGCAGGTAAATCTTCTAACAGCGGACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAACCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCa > 1:657382/1‑140 (MQ=255) ggagaaaggTTGTCCGGAATATCTCCGGCACCGTGGGTGGAGCT‑GATAACCAGCCAGATCCCTG‑AGGCAGGTAAATCTTCTAACAGCGGACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAACCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAg < 2:293568/140‑1 (MQ=255) gagaaaggTTGTCCGGAATATCTCCGGCACCGTGGGTGGAGCT‑GATAACCAGCCAGATCCCTG‑AGGCAGGTAAATCTTCTAACAGCGGACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAACCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAgg > 2:451082/1‑140 (MQ=255) agaaagtTTGTCCGGAATATCTCCGGCCCCGT‑GGTGGGGCT‑GATAACCAGCCAGATCCCTG‑AGGCGGGTAAATCTTCTAACAGCGGACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAACCCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGgtg < 2:449281/140‑1 (MQ=255) agaaaggTTGTCCGGAATATCTCCGGCACCGTGGGTGGAGCT‑GATAACCAGCCAGATCCCTG‑AGGCAGGTAAATCTTCTAACAGCGGACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAACCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGcc < 1:543723/136‑1 (MQ=255) agaaaggTTGTCCGGAATATCTCCGGCACCGTGGGTGGAGCT‑GATAACCAGCCAGATCCCTG‑AGGCAGGTAAATCTTCTAACAGCGGACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAACCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGcc > 2:543723/1‑136 (MQ=255) agaaaggTTGTCCGGAATATCTCCGGCACCGTGGGTGGAGCT‑GATAACCAGCCAGATCCCTG‑AGGCAGGTAAATCTTCTAACAGCGGACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAACCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGgt > 1:935086/1‑140 (MQ=255) gagtggTTGCCGGTAATAGCTCCGGCACCGTGGGTGG‑GCTGGATAACCCGCCCGA‑CCCTGAAGGCGGAAAAATCTTCTAACGGCGGCCCGTGCAGCGTTCCGGTGGTAAAGCCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGgtg < 2:128092/136‑1 (MQ=255) gaaaggTTGTCCGGAATATCTCCGGCACCGTGGGTGGAGCT‑GATAACCAGCCAGATCCCTG‑AGGCAGGTAAATCTTCTAACAGCGGACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAACCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGgtg < 2:840115/140‑1 (MQ=255) aagtTTGCCCGGAATTTCGCCGGCCCCGTGGGTGGAGCT‑GATAACCAGCCAGACCCCTG‑AGGCAGGTAAATCTTCTAACAGCGGACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAACCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGtt < 2:657382/140‑1 (MQ=255) aaggTGGTCCGGAATACCTCCGGCTCCGTGGGTGGAGCT‑GATAACAAGCCAGACCCCGG‑AGGGAGGTAATTCTTCTAACAGCGGCCCGGGCAGCTGTTGGGGGGAAAAGCCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGtt < 2:249878/140‑1 (MQ=255) ggTTGTCCGGAATATCTCCGGCACCGTGGGTGGAGCT‑GATAACCAGCCAGATCCCTG‑AGGCAGGTAAATCTTCTAACAGCGGACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAACCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCt > 1:635330/1‑140 (MQ=255) gTCCGGAATATCTCCGGCACCGTGGGTGGAGCT‑GATAACCAGCCAGATCCCTG‑AGGCAGGTAAATCTTCTAACAGCGGACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAACCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTa > 1:320786/1‑140 (MQ=255) cGGAATATCTCCGGCACCGTGGGTGGAGCT‑GATAACCAGCCAGATCCCTG‑AGGCAGGTAAATCTTCTAACAGCGGACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAACCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACat > 2:408452/1‑140 (MQ=255) cggtggggggAGCT‑AATACCCAGCAAGATCCCTG‑AGGCAGGAAAATCTTCTAACAGCGGCCGGTGCGGCGTTCCGGTGGAAAACCCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAg < 2:935086/138‑1 (MQ=255) cGTGGGTGGAGCT‑GATAACCAGCCAGATCCCTG‑AGGCAGGTAAATCTTCTAACAGCGGACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAACCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAgg > 1:911444/1‑140 (MQ=255) tgggtggAGCT‑GATAACCAGCCAGATCCCTG‑AGGCAGGTAAATCTTCTAACAGCGGCCCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAACCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGTACCGCCGAGGGt > 2:449355/1‑140 (MQ=255) tgggtggAGCT‑GATAACCAGCCAGATCCCTG‑AGGCAGGTAAATCTTCTAACAGCGGACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAACCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGt > 1:300638/1‑140 (MQ=255) tgggtggAGCT‑GATAACCAGCCAGATCCCTG‑AGGCAGGTAAATCTTCTAACAGCGGACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAACCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGt > 1:847470/1‑140 (MQ=255) ggtggAGCT‑GATAACCAGCCAGATCCCTG‑AGGCAGGTAAATCTTCTAACAGCGGACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAACCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGtgc > 2:680861/1‑140 (MQ=255) gggggCT‑GATAACCAGCCAGATCCCTG‑GGGCAGGTAAATCTTCAAACAGCGGACCGTGCAGCGTTTGGGTGGAAAACCCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGtgctg < 2:413154/136‑1 (MQ=255) gATACCCAGCCAGACCCCGG‑AGGCAGGTAAATCTTCAAACGGCGGACCGGGCGGCGTTTGGGTGGAAAACCCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGa < 2:300638/140‑1 (MQ=255) aaaaaCCAGCCAGACCCCTG‑GGGCAGGAAATTCTTCTAACGGCGGCCCGTGCAGCTTTTGGGTGGAAAACCCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGa < 2:911444/137‑1 (MQ=255) aTAACCAGCCAGATCCCTG‑AGGCAGGTAAATCTTCTAACAGCGGACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAACCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCACCGAGGGTGCTGCCGCTGAt < 1:916333/140‑1 (MQ=255) cagccagATCCCTG‑AGGCAGGTAAATCTTCTAACAGCGGACCGTGCAGCGGTTCGGTGGGAAAACCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAagag > 1:136879/1‑140 (MQ=255) cacccagATCCCTG‑AGGCAGTAAAATTTTCAAACAGGGGACCGTGCAGCGTTCCGGTGTAAAACCCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAagag < 2:54319/137‑1 (MQ=255) aTCCCTG‑AGGCAGGTAAATCTTCTAACAGCGGACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAACCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAAGAGTGATATc > 1:882046/1‑140 (MQ=255) ccTG‑AGGCAGGTAAATCTTCTAACAGCGGACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAACCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAAGAGTGATATCTGc > 1:567491/1‑140 (MQ=255) tG‑AGGCAGGTAAATCTTCTAACAGCGGACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAACCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAAGAGTGATATCTGCCa > 2:767390/1‑140 (MQ=255) aGGCAGGTAAATCTTCTAACAGCGGACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAACCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAAGAGTGATATCTGCCATa > 1:482285/1‑140 (MQ=255) ggCAGGTAAATCTTCTAACAGCGGACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAACCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCTGAGGGTGCTGCCGCTGATAAGAGTGATATCTGCCATaa > 1:375128/1‑140 (MQ=255) gaaaaTTTTCTAACGGGGGCCCGGGCGGCTTTTGGGGGGAAAACCCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAAGAGTGATATCTGCCATAAACCGc < 1:450284/138‑1 (MQ=255) gTAAATCTTCTAACAGCGGACCGTGCAGGGTTTCGGTGGTAAACCCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAAGAGTGATATCTGCCATAAACCGc < 1:917091/140‑1 (MQ=255) gTAAATCTTCTAACAGCGGACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAACCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAAGAGTGATATCTGCCATAAACCGc > 2:917091/1‑140 (MQ=255) gTAAATCTTCTAACAGCGGACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAACCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAAGAGTGATATCTGCCATAAACCGc > 2:614448/1‑140 (MQ=255) aaaTCTTCTAACAGGGGCCGGTGCAGGTTTTCGGTGGTAAACCCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAAGAGTGATATCTGCCATAAACCGCCa < 1:723628/140‑1 (MQ=255) aaaTCTTCTAACAGCGGACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAACCCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAAGAGTGATATCTGCCATAAACCGCCa < 1:820143/140‑1 (MQ=255) aaaTCTTCTAACAGCGGACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAACCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAAGAGTGATATCTGCCATAAACCGCCa < 1:680861/140‑1 (MQ=255) ttcttcaAACGGGGGCCGGGGCGGCTTTTGGGTGAAAAACCCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAAGAGTGATATCTGCCATAAACCGCCAcc < 2:761983/139‑1 (MQ=255) aTCTTCAAACGGCGGCCGGGGCAGCTTTTGGGTGAAAAACCCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAAGAGTGATATCTGCCATAAACCGCCAcc < 2:230718/140‑1 (MQ=255) ttttctAACGGCGGCCGGTGCGGCTTTTGGGTGGAAAACCCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAAGAGTGATATCTGCCATAAACCGCCACCt < 2:766078/138‑1 (MQ=255) tcttctAACGGGGGACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAACCCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAAGAGTGATATCTGCCATAAACCGCCACCt < 1:398921/140‑1 (MQ=255) tcttctAACAGCGGACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAACCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAAGAGTGATATCTGCCATAAACCGCCACCt > 1:466237/1‑140 (MQ=255) ctAACGGCGGACCGTGCAGCTTTTGGGTGGAAAACCCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCTGAGGGTGCTGCCGCTGATAAGAGTGATATCTGCCATAAACCGCCACCTttat < 2:375128/140‑1 (MQ=255) tAACAGCGGACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAACCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAAGAGTGATATCTGCCATAAACCGCCACCTttatt > 1:230718/1‑140 (MQ=255) tAACAGCGGACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAACCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAAGAGTGATATCTGCCATAAACCGCCACCTttatt > 1:761983/1‑140 (MQ=255) tAACAGCGGACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAACCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAAGAGTGATATCTGCCATAAACCGCCACCTttatt > 1:265308/1‑140 (MQ=255) gggggcccGGGCGGCGTTTGGGTGGAAAACCCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAAGAGTGATATCTGCCATAAACCGCCACCTTTATTAaga < 1:230628/134‑1 (MQ=255) gggggcccGGGCAGCTTTTGGGGGGAAAACCCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAAGAGTGATATCTGCCATAAACCGCCACCTTTATTAaga < 2:874588/134‑1 (MQ=255) cGGACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAACCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAAGAGTGATATCTGCCATAAACCGCCACCTTTATTAAGAGt > 1:15807/1‑140 (MQ=255) cGGACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAACCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAAGAGTGATATCTGCCATAAACCGCCACCTTTATTAAGAGt > 1:649866/1‑140 (MQ=255) cGGACCGTGCAGCGTTTCGGGGGTAAAACCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAAGAGTGATATCTGCCATAAACCGCCACCTTTATTAAGAGt > 1:139369/1‑140 (MQ=255) tGCAGCGTTTCGGTGGTAAAACCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAAGAGTGATATCTGCCATAAACCGCCACCTTTATTAAGAGTGGCGTAt > 2:317721/1‑140 (MQ=255) tGCAGCGTTTCGGTGGTAAAACCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCCGCCGCTGATAAGAGTGATATCTGCCATAAACCGCCACCTTTATTAAGAGTGGCGTAt > 2:10062/1‑140 (MQ=255) gCAGCGTTTCGGTGGTAAAACCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAAGAGTGATATCTGCCATAAACCGCCACCTTTATTAAGAGTGGCGTAtt > 2:763136/1‑140 (MQ=255) gCAGCGTTTCGGTGGTAAAACCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAAGAGTGATATCTGCCATAAACCGCCACCTTTATTAAGAGTGGCGTAtt > 1:110501/1‑140 (MQ=255) gCGTTTGGGTGGAAAACCCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAAGAGTGATATCTGCCATAAACCGCCACCTTTATTAAGAGTGGCGTATTGTa < 1:668652/140‑1 (MQ=255) ggaaaaacCCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAAGAGTGATATCTGCCATAAACCGCCACCTTTATTAAGAGTGGCGTATTGTACGCTGTGaa < 2:847470/136‑1 (MQ=255) aaaCCCGCCTCTTCCAGTTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAAGAGTGATATCTGCCATAAACCGCCACCTTTATTAAGAGTGGCGTATTGTACGCTGTGAACGCGt < 1:462955/140‑1 (MQ=255) aaaCCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAAGAGTGATATCTGCCATAAACCGCCACCTTTATTAAGAGTGGCGTATTGTACGCTGTGAACGCGt < 1:763136/140‑1 (MQ=255) | TCTGTTCCTGCAATGCTTCATAGAAAGGAGAAAGGTTGTCCGGAATATCTCCGGCACCGTGGGTGGAGCT‑GATAACCAGCCAGATCCCTG‑AGGCAGGTAAATCTTCTAACAGCGGACCGTGCAGCGTTTCGGTGGTAAAACCCGCCTCTTCCAGCTTTTCAGCCAGGTGTTCTGCTACATATTCGGCACCGCCGAGGGTGCTGCCGCTGATAAGAGTGATATCTGCCATAAACCGCCACCTTTATTAAGAGTGGCGTATTGTACGCTGTGAACGCGT > NC_000913/3926227‑3926503 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |