| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,430,255 | C→A | P131H (CCC→CAC) | cycA → | serine/alanine/glycine/cycloserine:H(+)symporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,430,255 | 0 | C | A | 97.3% | 244.7 / ‑0.8 | 74 | P131H (CCC→CAC) | cycA | serine/alanine/glycine/cycloserine:H(+)symporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/1); new base A (39/33); total (40/34) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.97e-01 | |||||||||||
TCTTTTAGTGACTTCGCTTCCGATTTACTCGGGCCGTGGGCAGGATATTTCACCGGCTGGACTTACTGGTTCTGCTGGGTTGTAACCGGTATGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCCCGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCAATCTCGCCACCGTGAAAATGTTCGGTGAGATGGAGTTCTGGTTTGCGATGATCAAAATCGTCGCCATTGTGTCGCT > NC_000913/4430119‑4430387 | tCTTTTAGTGACTTCGCTTCCGATTTACTCGGGCCGTGGGCAGGATATTTCACCGGCTGGACTTACTGGTTCTGCTGGGTTGTAACCGGTATGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGa < 1:1223022/140‑1 (MQ=255) ttAGTGACTTCGCTTCCGATTTACTCGGGCCGTGGGCAGGATATTTCACCGGCTGGACTTACTGGTTCTGCTGGGTTGTAACCGGTATGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGAtctc < 1:62151/140‑1 (MQ=255) tAGTGACTTCGCTTCCGATTTACTCGGGCCGTGGGCAGGATATTTCACCGGCTGGACTTACTGGTTCTGCTGGGTTGTAACCGGTATGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGAtctct > 1:622499/1‑140 (MQ=255) gACTTCGCTTCCGATTTACTCGGGCCGTGGGCAGGATATTTCACCGGCTGGACTTACTGGTTCTGCTGGGTTGTAACCGGTATGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGa < 1:1638382/140‑1 (MQ=255) ttCGCTTCCGATTTACTCGGGCCGTGGGCAGGATATTTCACCGGCTGGACTTACTGGTTCTGCTGGGTTGTAACCGGTATGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTg > 1:267267/1‑140 (MQ=255) ttCGCTTCCGATTTACTCGGGCCGTGGGCAGGATATTTCACCGGCTGGACTTACTGGTTCTGCTGGGTTGTAACCGGTATGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTg > 1:1708173/1‑140 (MQ=255) cGCTTCCGATTTACTCGGGCCGTGGGCAGGATATTTCACCGGCTGGACTTACTGGTTCTGCTGGGTTGTAACCGGTATGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTggg > 1:764175/1‑140 (MQ=255) tCCGATTTACTCGGGCCGTGGGCAGGATATTTCACCGGCTGGACTTACTGGTTCTGCTGGGTTGTAACCGGTATGGCAGACGTGGTGGTGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCCCGATCTCTCCGACTGGGTCGc < 2:257754/140‑1 (MQ=255) aTTTACTCGGGCCGTGGGCAGGATATTTCACCGGCTGGACTTACTGGTTCTGCTGGGTTGTAACCGGTATGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCg < 1:893376/140‑1 (MQ=255) ttACTCGGGCCGTGGGCAGGATATTTCACCGGCTGGACTTACTGGTTCTGCTGGGTTGTAACCGGTATGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCt < 2:267267/140‑1 (MQ=255) aCTCGGGCCGTGGGCAGGATATTTCACCGGCTGGACTTACTGGTTCTGCTGGGTTGTAACCGGTATGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTgg < 1:749884/140‑1 (MQ=255) cTCGGGCCGTGGGCAGGATATTTCACCGGCTGGACTTACTGGTTCTGCTGGGTTGTAACCGGTATGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGc < 1:488905/140‑1 (MQ=255) tCGGGCCGTGGGCAGGATATTTCACCGGCTGGACTTACTGGTTCTGCTGGGTTGTAACCGGTATGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCg < 1:748171/140‑1 (MQ=255) ggCCGTGGGCAGGATATTTCACCGGCTGGACTTACTGGTTCTGCTGGGTTGTAACCGGTATGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTg > 1:545671/1‑140 (MQ=255) gCCGTGGGCAGGATATTTCACCGGCTGGACTTACTGGTTCTGCTGGGTTGTAACCGGTATGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGa > 1:1917905/1‑140 (MQ=255) tGGGCAGGATATTTCACCGGCTGGACTTACTGGTTCTGCTGGGTTGTAACCGGTATGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGt < 1:688270/140‑1 (MQ=255) gggCAGGATATTTCACCGGCTGGACTTACTGGTTCTGCTGGGTTGTAACCGGTATGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGtg > 1:1963063/1‑140 (MQ=255) ggCAGGATATTTCACCGGCTGGACTTACTGGTTCTGCTGGGTTGTAACCGGTATGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGtgc > 2:770967/1‑140 (MQ=255) cAGGATATTTCACCGGCTGGACTTACTGGTTCTGCTGGGTTGTAACCGGTATGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGtgctg < 1:1420571/140‑1 (MQ=255) cAGGATATTTCACCGGCTGGACTTACTGGTTCTGCTGGGTTGTAACCGGTATGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGtgctg < 1:396807/140‑1 (MQ=255) ggATATTTCACCGGCTGGACTTACTGGTTCTGCTGGGTTGTAACCGGTATGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGtgctgct > 1:1704974/1‑140 (MQ=255) ggATATTTCACCGGCTGGACTTACTGGTTCTGCTGGGTTGTAACCGGTATGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGtgctgct > 1:468442/1‑140 (MQ=255) tatTTCACCGGCTGGACTTACTGGTTCTGCTGGGTTGTAACCGGTATGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTgctgctgct < 1:195790/140‑1 (MQ=255) ttCACCGGCTGGACTTACTGGTTCTGCTGGGTTGTAACCGGTATGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGAc > 1:679265/1‑140 (MQ=255) ttCACCGGCTGGACTTACTGGTTCTGCTGGGTTGTAACCGGTATGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGAc > 2:977384/1‑140 (MQ=255) tCACCGGCTGGACTTACTGGTTCTGCTGGGTTGTAACCGGTATGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACg < 1:844839/140‑1 (MQ=255) cGGCTGGACTTACTGGTTCTGCTGGGTTGTAACCGGTATGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCa > 2:1937481/1‑140 (MQ=255) cGGCTGGACTTACTGGTTCTGCTGGGTTGTAACCGGTATGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCa > 2:775016/1‑140 (MQ=255) cGGCTGGA‑TTACTGGTTCTGCTGGGGTGTAACCGGGATGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCCCGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCaa > 1:417218/1‑140 (MQ=255) ttACTGGTTCTGCTGGGTTGTAACCGGTATGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCAATCTCGCCa < 1:770967/140‑1 (MQ=255) tGGTTCTGCTGGGTTGTAACCGGTATGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCAATCTCGCCACCGt > 2:265387/1‑140 (MQ=255) tCTGCTGGGTTGTAACCGGTATGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCAATCTCGCCACCGTGaaa > 1:1530861/1‑140 (MQ=255) tCTGCTGGGTTGTAACCGGTATGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCAATCTCGCCACCGTGaaa > 1:1901501/1‑140 (MQ=255) gctgGGTTGTAACCGGTATGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCAATCTCGCCACCGTGAAAATg < 2:1509679/140‑1 (MQ=255) ctgGGTTGTAACCGGTATGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCAATCTCGCCACCGTGAAAATGt > 1:1618422/1‑140 (MQ=255) tgGGTTGTAACCGGTATGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCAATCTCGCCACCGTGAAAATGtt < 2:677887/140‑1 (MQ=255) ggTTGTAACCGGTATGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACAGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCAATCTCGCCACCGTGAAAATGTTCg < 2:420246/140‑1 (MQ=255) gTTGTAACCGGTATGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCAATCTCGCCACCGTGAAAATGTTCgg < 1:775016/140‑1 (MQ=255) ttGTAACCGGTATGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCAATCTCGCCACCGTGAAAATGTTCGGt > 2:674455/1‑140 (MQ=255) tGTAACCGGTATGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCAATCTCGCCACCGTGAAAATGTTCGGTg < 2:1705048/140‑1 (MQ=255) tGTAACCGGTATGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCCCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCAATCTCGCCACCGTGAAAATGTTCGGTg < 2:1122569/140‑1 (MQ=255) aCCGGTATGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCAATCTCGCCACCGTGAAAATGTTCGGTGAGAt > 1:169484/1‑140 (MQ=255) aCCGGTATGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCAATCTCGCCACCGTGAAAATGTTCGGTGAGAt > 1:1924976/1‑140 (MQ=255) ggTATGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCAATCTCGCCACCGTGAAAATGTTCGGTGAGATggg > 1:841833/1‑139 (MQ=255) tATGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGGTGACGCTCAATCTCGCCACCGTGAAAATGTTTGGTGGGGTGGAGt > 2:567120/1‑140 (MQ=255) tATGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCAATCTCGCCACCGTGAAAATGTTCGGTGAGATGGAGt > 1:672236/1‑140 (MQ=255) tATGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCAATCTCGCCACCGTGAAAATGTTCGGTGAGATGGAGt > 2:1879426/1‑140 (MQ=255) aTGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCAATCTCGCCACCGTGAAAATGTTCGGTGAGATGGAGtt < 1:977384/140‑1 (MQ=255) aTGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCAATCTCGCCACCGTGAAAATGTTCGGTGAGATGGAGtt < 2:1901501/140‑1 (MQ=255) ggCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCAGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCAATCTCGCCACCGTGAAAATGTTCGGTGAGATGGAGTTCt > 1:411395/1‑140 (MQ=255) cGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCAATCTCGCCACCGTGAAAATGTTCGGTGAGATGGAGtt < 2:1198744/132‑1 (MQ=255) cGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCAATCTCGCCACCGTGAAAATGTTCGGTGAGATGGAGtt > 1:1198744/1‑132 (MQ=255) tggtggCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCAATCTCGCCACCGTGAAAATGTTCGGTGAGATGGAGTTCTGGTTTGCg < 2:679265/140‑1 (MQ=255) tggtggCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCAATCTCGCCACCGTGAAAATGTTCGGTGAGATGGAGTTCTGGTTTGCg < 2:1149967/140‑1 (MQ=255) tggtggCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCAATCTCGCCACCGTGAAAATGTTCGGTGAGATGGAGTTCTGGTTTGCg < 2:969813/140‑1 (MQ=255) tggtggCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCAATCTCGCCACCGTGAAAATGTTCGGTGAGATGGAGTTCTGGTTTGCg < 1:1834277/140‑1 (MQ=255) gtggCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCAATCTCACCACCGTGAAAATGTTCGGTGAGATGGAGTTCTGGTTTGCgat > 1:1108754/1‑140 (MQ=255) gtggCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCAAACTCGCCACCGTGAAAATGTTCGGTGAGATGGAGTTCTGGTTTGCgat > 1:856513/1‑140 (MQ=255) ggCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCAATCTCGCCACCGTGAAAATGTTCGGTGAGATGGAGTTCTGGTTTGCgatga > 1:1924810/1‑140 (MQ=255) aTCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCAATCTCGCCACCGTGAAAATGTTCGGTGAGATGGAGTTCTGGTTTGCGATGATCaa > 2:1375427/1‑140 (MQ=255) aTCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCAATCTCGCCACCGTGAAAATGTTCGGTGAGATGGAGTTCTGGTTTGCGATGATCaa > 1:178910/1‑140 (MQ=255) ggCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCAATCTCGCCACCGTGAAAATGTTCGGTGAGATGGAGTTCTGGTTTGCGATGATCAAAAtcg > 1:653577/1‑140 (MQ=255) ggCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCAATCTCGCCACCGTGAAAATGTTCGGTGAGATGGAGTTCTGGTTTGCGATGATCAAAAtcg < 2:653577/140‑1 (MQ=255) gCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCAATCTCGCCACCGTGAAAATGTTCGGTGAGATGGAGTTCTGGTTTGCGATGATCAAAAtcgt < 1:674455/140‑1 (MQ=255) gCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCAATCTCGCCACCGTGAAAATGTTCGGTGAGATGGAGTTCTGGTTTGCGATGATCAAAAtcgt < 1:1879426/140‑1 (MQ=255) cTTATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCAATCTCGCCACCGTGAAAATGTTCGGTGAGATGGAGTTCTGGTTTGCGATGATCAAAAtcgtc > 2:1782617/1‑140 (MQ=255) ttATGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCAATCTCGCCACCGTGAAAATGTTCGGTGAGATGGAGTTCTGGTTTGCGATGATCAAAAtcgtcg < 2:764175/140‑1 (MQ=255) tGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCAATCTCGCCACCGTGAAAATGTTCGGTGAGATGGAGTTCTGGTTTGCGATGATCAAAATCGTCGCCa > 2:753328/1‑140 (MQ=255) tGCTCAGTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCAATCTCGCCACCGTGAAAATGTTCGGTGAGATGGAGTTCTGGTTTGCGATGATCAAAATCGTCGCCa < 1:1375427/140‑1 (MQ=255) gTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCAATCTCGCCACCGTGAAAATGTTCGGTGAGATGGAGTTCTGGTTTGCGATGATCAAAATCGTCGCCATTgtgt > 1:1903615/1‑140 (MQ=255) gTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCAATCTCGCCACCGTGAAAATGTTCGGTGAGATGGAGTTCTGGTTTGCGATGATCAAAATCGTCGCCATTgtgt > 1:428981/1‑140 (MQ=255) gTTCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCAATCTCGCCACCGTGAAAATGTTCGGTGAGATGGAGTTCTGGTTTGCGATGATCAAAATCGGCGCCATTgtgt > 2:596164/1‑140 (MQ=255) tCTGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCAATCTCGCCACCGTGAAAATGTTCGGTGAGATGGAGTTCTGGTTTGCGATGATCAAAATCGTCGCCATTGTGTCg < 2:178910/140‑1 (MQ=255) tGGTTCCACGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCAATCTCGCCACCGTGAAAATGTTCGGTGAGATGGAGTTCTGGTTTGCGATGATCAAAATCGTCGCCATTGTGTCGCt > 1:158377/1‑140 (MQ=255) | TCTTTTAGTGACTTCGCTTCCGATTTACTCGGGCCGTGGGCAGGATATTTCACCGGCTGGACTTACTGGTTCTGCTGGGTTGTAACCGGTATGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCCCGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCAATCTCGCCACCGTGAAAATGTTCGGTGAGATGGAGTTCTGGTTTGCGATGATCAAAATCGTCGCCATTGTGTCGCT > NC_000913/4430119‑4430387 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |