Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 4,516,463 | C→A | G72V (GGC→GTC) | fecA ← | ferric citrate outer membrane transporter |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 4,516,463 | 0 | C | A | 98.8% | 291.0 / ‑3.2 | 86 | G72V (GGC→GTC) | fecA | ferric citrate outer membrane transporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); new base A (37/48); total (37/49) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.76e-01 |
GACCACGGTCAGGGCATCTTCTTTTGGTGCGGGCGCGGGCTCCAGCGTCCAGCTGTTATTTCCCAGCGGTTTTACCTGCAGTCCGCTGCCGTCCAGCAGTTGTTGCAGGCCGCTCTCGACGTCGTAATCGCCGTGCAGGCCGTTGCTCTGCTTGCCGCGCGTCAGGCTGGCGTCAACCGAGAGGGTAAATCCGCTGTGTGCGGCATACTGATTGAGCGCTTTATCGAGCGATCCCGGTGCGATATTAACCTGTGCAGCAAAAGCGGAAAACG > NC_000913/4516324‑4516595 | gACCACGGTCAGGGCATCTTCTTTTGGTGCGGGCGCGGGCTCCAGCGTCCAGCTGTTATTTCCCAGCGGTTTTACCTGCAGTCCGCTGCCGTCCAGCAGTTGTTGCAGGCCGCTCTCGACGTCGTAATCGCCGTGCAGGc > 1:618480/1‑140 (MQ=255) cGGTCAGGGCATCTTCTTTTGGTGCGGGCGCGGGCTCCAGCGTCCAGCTGTTATTTCCCAGCGGTTTTACCTGCAGTCCGCTGCCGTCCAGCAGTTGTTGCAGGCCGCTCTCGACGTCGTAATCGCCGTGCAGGACGTTg > 1:329597/1‑140 (MQ=255) cGGTCAGGGCATCTTCTTTTGGTGCGGGCGCGGGCTCCAGCGTCCAGCTGTTATTTCCCAGCGGTTTTACCTGCAGTCCGCTGCCGTCCAGCAGTTGTTGCAGGCCGCTCTCGACGTCGTAATCGCCGTGCAGGACGTTg > 1:975117/1‑140 (MQ=255) ggCATCTTCTTTTGGTGCGGGCGCGGGCTCCAGCGTCCAGCTGTTATTTCCCAGCGGTTTTACCTGCAGTCCGCTGCCGTCCAGCAGTTGTTGCAGGCCGCTCTCGACGTCGTAATCGCCGTGCAGGACGTTGCTCTGCt > 1:1556620/1‑140 (MQ=255) ggCATCTTCTTTTGGTGCGGGCGCGGGCTCCAGCGTCCAGCTGTTATTTCCCAGCGGTTTTACCTGCAGTCCGCTGCCGTCCAGCAGTTGTTGCAGGCCGCTCTCGACGTCGTAATCGCCGTGCAGGACGTTGCTCTGCt > 1:1399805/1‑140 (MQ=255) ggCATCTTCTTTTGGTGCGGGCGCGGGCTCCAGCGTCCAGCTGTTATTTCCCAGCGGTTTTACCTGCAGTCCGCTGCCGTCCAGCAGTTGTTGCAGGCCGCTCTCGACGTCGTAATCGCCGTGCAGGACGTTGCTCTGCt < 2:1399805/140‑1 (MQ=255) tcttctTTTGGTGCGGGCGCGGGCTCCAGCGTCCAGCTGTTATTTCCCAGCGGTTTTACCTGCAGTCCGCTGCCGTCCAGCAGTTGTTGCAGGCCGCTCTCGACGTCGTAATCGCCGTGCAGGACGTTGCTCTGCTTGcc > 1:1483780/1‑140 (MQ=255) cttcttTTGGTGCGGGCGCGGGCTCCAGCGTCCAGCTGTTATTTCCCAGCGGTTTTACCTGCAGTCCGCTGCCGTCCAGCAGTTGTTGCAGGCCGCTCTCGACGTCGTAATCGCCGTGCAGGACGTTGCTCTGCTTGCcg < 1:242283/140‑1 (MQ=255) cttcttTTGGTGCGGGCGCGGGCTCCAGCGTCCAGCTGTTATTTCCCAGCGGTTTTACCTGCAGTCCGCTGCCGTCCAGCAGTTGTTGCAGGCCGCTCTCGACGTCGTAATCGCCGTGCAGGACGTTGCTCTGCTTGCcg < 1:582383/140‑1 (MQ=255) ttcttTTGGTGCGGGCGCGGGCTCCAGCGTCCAGCTGTTATTTCCCAGCGGTTTTACCTGCAGTCCGCTGCCGTCCAGCAGTTGTTGCAGGCCGCTCTCGACGTCGTAATCGCCGTGCAGGACGTTGCTCTGCTTGCcgc > 2:1667106/1‑140 (MQ=255) ttcttTTGGTGCGGGCGCGGGCTCCAGCGTCCAGCTGTTATTTCCCAGCGGTTTTACCTGCAGTCCGCTGCCGTCCAGCAGTTGTTGCAGGCCGCTCTCGACGTCGTAATCGCCGTGCAGGACGTTGCTCTGCTTGCcgc > 2:1015784/1‑140 (MQ=255) tcttTTGGTGCGGGCGCGGGCTCCAGCGTCCAGCTGTTATTTCCCAGCGGTTTTACCTGCAGTCCGCTGCCGTCCAGCAGTTGTTGCAGGCCGCTCTCGACGTCGTAATCGCCGTGCAGGACGTTGCTCTGCTTGCcgcg < 1:290161/140‑1 (MQ=255) tttGGTGCGGGCGCGGGCTCCAGCGTCCAGCTGTTATTTCCCAGCGGTTTTACCTGCAGTCCGCTGCCGTCCAGCAGTTGTTGCAGGCCGCTCTCGACGTCGTAATCGCCGTGCAGGACGTTGCTCTGCTTGCCGCGCGt > 2:1055495/1‑140 (MQ=255) gTGCGGGCGCGGGCTCCAGCGTCCAGCTGTTATTTCCCAGCGGTTTTACCTGCAGTCCGCTGCCGTCCAGCAGTTGTTGCAGGCCGCTCTCGACGTCGTAATCGCCGTGCAGGACGTTGCTCTGCTTGCCGCGCGTCAgg < 1:46823/140‑1 (MQ=255) gggcgcgggcTCCAGCGTCCAGCTGTTATTTCCCAGCGGTTTTACCTGCAGTCCGCTGCCGTCCAGCAGTTGTTGCAGGCCGCTCTCGACGTCGTAATCGCCGTGCAGGACGTTGCTCTGCTTGCCGCGCGTCAGGCTgg > 2:1404441/1‑140 (MQ=255) ggcgcgggcTCCAGCGTCCAGCTGTTATTTCCCAGCGGTTTTACCTGCAGTCCGTTGCCGTCCAGCAGTTGTTGCAGGCCGCTCTCGACGTCGTAATCGCCGTGCAGGACGTTGCTCTGCTTGCCGCGCGTCAGGCTGGc > 1:868674/1‑140 (MQ=255) ggcgcgggcTCCAGCGTCCAGCTGTTATTTCCCAGCGGTTTTACCTGCAGTCCGCTGCCGTCCAGCAGTTGTTGCAGGCCGCTCTCGACGTCGTAATCGCCGTGCAGGACGTTGCTCTGCTTGCcg > 1:1169015/1‑126 (MQ=255) ggcgcgggcTCCAGCGTCCAGCTGTTATTTCCCAGCGGTTTTACCTGCAGTCCGCTGCCGTCCAGCAGTTGTTGCAGGCCGCTCTCGACGTCGTAATCGCCGTGCAGGACGTTGCTCTGCTTGCcg < 2:1169015/126‑1 (MQ=255) ggcTCCAGCGTCCAGCTGTTATTTCCCAGCGGTTTTACCTGCAGTCCGCTGCCGTCCAGCAGTTGTTGCAGGCCGCTCTCGACGTCGTAATCGCCGTGCAGGACGTTGCTCTGCTTGCCGCGCGTCAGGCTGGCGTCAAc > 2:226044/1‑140 (MQ=255) gcTCCAGCGTCCAGCTGTTATTTCCCAGCGGTTTTACCTGCAGTCCGCTGCCGTCCAGCAGTTGTTGCAGGCCGCTCTCGACGTCGTAATCGCCGTGCAGGACGTTGCTCTGCTTGCCGCGCGTCAGGCTGGCGTCAAcc < 2:941669/140‑1 (MQ=255) cTCCAGCGTCCAGCTGTTATTTCCCAGCGGTTTTACCTGCAGTCCGCTGCCGTCCAGCAGTTGTTGCAGGCCGCTCTCGACGTCGTAATCGCCGTGCAGGACGTTGCTCTGCTTGCCGCGCGTCAGGCTGGCGTCAACCg < 1:1049013/140‑1 (MQ=255) tCCAGCGTCCAGCTGTTATTTCCCAGCGGTTTTACCTGCAGTCCGCTGCCGTCCAGCAGTTGTTGCAGGCCGCTCTCGACGTCGTAATCGCCGTGCAGGACGTTGCTCTGCTTGCCGCGCGTCAGGCTGGCGTCAACCga < 1:1015784/140‑1 (MQ=255) cAGCGTCCAGCTGTTATTTCCCAGCGGTTTTACCTGCAGTCCGCTGCCGTCCAGCAGTTGTTGCAGGCCGCTCTCGACGTCGTAATCGCCGTGCAGGACGTTGCTCTGCTTGCCGCGCGTCAGGCTGGCGTCAACCgaga > 1:752912/1‑140 (MQ=255) cGTCCAGCTGTTATTTCCCAGCGGTTTTACCTGCAGTCCGCTGCCGTCCAGCAGTTGTTGCAGGCCGCTCTCGACGTCGTAATCGCCGTGCAGGACGTTGCTCTGCTTGCCGCGCGTCAGGCTGGCGTCAACCGAGAggg < 1:467683/140‑1 (MQ=255) ccAGCTGTTATTTCCCAGCGGTTTTACCTGCAGTCCGCTGCCGTCCAGCAGTTGTTGCAGGCCGCTCTCGACGTCGTAATCGCCGTGCAGGACGTTGCTCTGCTTGCCGCGCGTCAGGCTGGCGTCAACCGAGAGGGTaa > 2:28595/1‑140 (MQ=255) aGCTGTTATTTCCCAGCGGTTTTACCTGCAGTCCGCTGCCGTCCAGCAGTTGTTGCAGGCCGCTCTCGACGTCGTAATCGCCGTGCAGGACGTTGCTCTGCTTGCCGCGCGTCAGGCTGGCGTCAACCga > 2:1304366/1‑130 (MQ=255) aGCTGTTATTTCCCAGCGGTTTTACCTGCAGTCCGCTGCCGTCCAGCAGTTGTTGCAGGCCGCTCTCGACGTCGTAATCGCCGTGCAGGACGTTGCTCTGCTTGCCGCGCGTCAGGCTGGCGTCAACCga < 1:1304366/130‑1 (MQ=255) aGCTGTTATTTCCCAGCGGTTTTACCTGCAGTCCGCTGCCGTCCAGCAGTTGTTGCAGGCCGCTCTCGACGTCGTAATCGCCGTGCAGGACGTTGCTCTGCTTGCCGCGCGTCAGGCTGGCGTCAACCGAGAGGGTAAAt > 2:238995/1‑140 (MQ=255) aGCTGTTATTTCCCAGCGGTTTTACCTGCAGTCCGCTGCCGTCCAGCAGTTGTTGCAGGCCGCTATCGACGTCGTAATCGCCGTGCAGGACGTTGCTCTGCTTGCCGCGCGTCAGGCTGGCGTCAACCGAGAGGGTAAAt > 2:1323804/1‑140 (MQ=255) tGTTATTTCCCAGCGGTTTTACCTGCAGTCCGCTGCCGTCCAGCAGTTGTTGCAGGCCGCTCTCGACGTCGTAATCGCCGTGCAGGACGTTGCTCTGCTTGCCGCGCGTCAGGCTGGCGTCAACCGAGAGGGTAAATCCg < 2:957310/140‑1 (MQ=255) ttATTTCCCAGCGGTTTTACCTGCAGTCCGCTGCCGTCCAGCAGTTGTTGCAGGCCGCTCTCGACGTCGTAATCGCCGTGCAGGACGTTGCTCTGCTTGCCGCGCGTCAGGCTGGCGTCAACCGAGAGGGTAAATCCGCt < 1:28595/140‑1 (MQ=255) aTTTCCCAGCGGTTTTACCTGCAGTCCGCTGCCGTCCAGCAGTTGTTGCAGGCCGCTCTCGACGTCGTAATCGCCGTGCAGGACGTTGCTCTGCTTGCCGCGCGTCAGGCTGGCGTCAACCGAGAGGGTAAATCCGCtgt > 2:1302054/1‑140 (MQ=255) tttCCCAGCGGTTTTACCTGCAGTCCGCTGCCGTCCAGCAGTTGTTGCAGGCCGCTCTCGACGTCGTAATCGCCGTGCAGGACGTTGCTCTGCTTGCCGCGCGTCAGGCTGGCGTCAACCGAGAGGGTAAATCCGCtgtg < 2:1361617/140‑1 (MQ=255) ttCCCAGCGGTTTTACCTGCAGTCCGCTGCCGTCCAGCAGTTGTTGCAGGCCGCTCTCGACGTCGTAATCGCCGTGCAGGCCGTTGCTCTGCTTGCCGCGCGTCAGGCTGGCGTCAACCGAGAGGGTAAATCCGCtgtgt < 2:618480/140‑1 (MQ=255) ttCCCAGCGGTTTTACCTGCAGTCCGCTGCCGTCCAGCAGTTGTTGCAGGCCGCTCTCGACGTCGTAATCGCCGTGCAGGACGTTGCTCTGCTTGCCGCGCGTCAGGCTGGCGTCAACCGAGAGGGTAAATCCGCtgtgt < 1:1670309/140‑1 (MQ=255) tCCCAGCGGTTTTACCTGCAGTCCGCTGCCGTCCAGCAGTTGTTGCAGGCCGCTCTCGACGTCGTAATCGCCGTGCAGGACGTTGCTCTGCTTGCCGCGCGTCAGGCTGGCGTCAACCGAGAGGGTAAATCCGCtgtgtg < 2:752912/140‑1 (MQ=255) tCCCAGCGGTTTTACCTGCAGTCCGCTGCCGTCCAGCAGTTGTTGCAGGCCGCTCTCGACGTCGTAATCGCCGTGCAGGACGTTGCTCTGCTTGCCGCGCGTCAGGCTGGCGTCAACCGAGAGGGTAAATCCGCtgtgtg < 1:226044/140‑1 (MQ=255) tCCCAGCGGTTTTACCTGCAGTCCGCTGCCGTCCAGCAGTTGTTGCAGGCCGCTCTCGACGTCGTAATCGCCGTGCAGGACGTTGCTCTGCTTGCCGCGCGTCAGGCTGGCGTCAACCGAGAGGGTAAATCCGCtgtgtg > 2:485453/1‑140 (MQ=255) cAGCGGTTTTACCTGCAGTCCGCTGCCGTCCAGCAGTTGTTGCAGGCCGCTCTCGACGTCGTAATCGCCGTGCAGGACGTTGCTCTGCTTGCCGCGCGTCAGGCTGGCGTCAACCGAGAGGGTAAATCCGCTGTGTGCgg < 1:1302054/140‑1 (MQ=255) cAGCGGTTTTACCTGCAGTCCGCTGCCGTCCAGCAGTTGTTGCAGGCCGCTCTCGACGTCGTAATCGCCGTGCAGGACGTTGCTCTGCTTGCCGCGCGTCAGGCTGGCGTCAACCGAGAGGGTAAATCCGCTGTGTGCgg < 1:1404441/140‑1 (MQ=255) cAGCGGTTTTACCTGCAGTCCGCTGCCGTCCAGCAGTTGTTGCAGGCCGCTCTCGACGTCGTAATCGCCGTGCAGGACGTTGCTCTGCTTGCCGCGCGTCAGGCTGGCGTCAACCGAGAGGGTAAATCCGCTGTGTGCgg < 1:106768/140‑1 (MQ=255) cAGCGGTTTTACCTGCAGTCCGCTGCCGTCCAGCAGTTGTTGCAGGCCGCTCTCGACGTCGTAATCGCCGTGCAGGACGTTGCTCTGCTTGCCGCGCGTCAGGCTGGCGTCAACCGAGAGGGTAAATCCGCTGTGTGCgg < 2:295982/140‑1 (MQ=255) aGCGGTTTTACCTGCAGTCCGCTGCCGTCCAGCAGTTGTTGCAGGCCGCTCTCGACGTCGTAATCGCCGTGCAGGACGTTGCTCTGCTTGCCGCGCGTCAGGCTGGCGTCAACCGAGAGGGTAAATCCGCTGTGTGCGGc > 2:91904/1‑140 (MQ=255) gCGGTTTTACCTGCAGTCCGCTGCCGTCCAGCAGTTGTTGCAGGCCGCTCTCGACGTCGTAATCGCCGTGCAGGACGTTGCTCTGCTTGCCGCGCGTCAGGCTGGCGTCAACCGAGAGGGTAAATCCGCTGTGTGCGGCa > 2:270509/1‑140 (MQ=255) gCGGTTTTACCTGCAGTCCGCTGCCGTCCAGCAGTTGTTGCAGGCCGCTCTCGACGTCGTAATCGCCGTGCAGGACGTTGCTCTGCTTGCCGCGCGTCAGGCTGGCGTCAACCGAGAGGGTAAATCCGCTGTGTGCGGCa > 2:1673488/1‑140 (MQ=255) gCGGTTTTACCTGCAGTCCGCTGCCGTCCAGCAGTTGTTGCAGGCCGCTCTCGACGTCGTAATCGCCGTGCAGGACGTTGCTCTGCTTGCCGCGCGTCAGGCTGGCGTCAACCGAGAGGGTAAATCCGCTGTGTGCGGCa < 1:1313462/140‑1 (MQ=255) cGGTTTTACCTGCAGTCCGCTGCCGTCCAGCAGTTGTTGCAGGCCGCTCTCGACGTCGTAATCGCCGTGCAGGACGTTGCTCTGCTTGCCGCGCGTCAGGCTGGCGTCAACCGAGAGGGTAAATCCGCTGTGTGCGGCAt > 2:344879/1‑140 (MQ=255) gTTTTACCTGCAGTCCGCTGCCGTCCAGCAGTTGTTGCAGGCCGCTCTCGACGTCGTAATCGCCGTGCAGGACGTTGCTCTGCTTGCCGCGCGTCAGGCTGGCGTCAACCGAGAGGGTAAATCCGCTGTGTGCGGCATAc < 1:485453/140‑1 (MQ=255) ttttACCTGCAGTCCGCTGCCGTCCAGCAGTTGTTGCAGGCCGCTCTCGACGTCGTAATCGCCGTGCAGGACGTTGCTCTGCTTGCCGCGCGTCAGGCTGGCGTCAACCGAGAGGGTAAATCCGCTGTGTGCGGCATACt < 1:270509/140‑1 (MQ=255) cTGCAGTCCGCTGCCGTCCAGCAGTTGTTGCAGGCCGCTCTCGACGTCGTAATCGCCGTGCAGGACGTTGCTCTGCTTGCCGCGCGTCAGGCTGGCGTCAACCGAGAGGGTAAATCCGCTGTGTGCGGCATACTGATTGa < 1:344879/140‑1 (MQ=255) cAGTCCGCTGCCGTCCAGCAGTTGTTGCAGGCCGCTCTCGACGTCGTAATCGCCGTGCAGGACGTTGCTCTGCTTGCCGCGCGTCAGGCTGGCGTCAACCGAGAGGGTAAATCCGCTGTGTGCGGCATACTGATTGAgcg < 2:975117/140‑1 (MQ=255) tCCGCTGCCGTCCAGCCGTTGTTGCAGGCCGCTCTCGACGTCGTAATCGCCGTGCAGGACGTTGCTCTGCTTGCCGCGCGTCAGGCTGGCGTCAACCGAGAGGGTAAATCCGCTGTGTGCGGCATACTGATTGAGCGCtt > 2:955911/1‑140 (MQ=255) cGCTGCCGTCCAGCAGTTGTTGCAGGCCGCTCTCGACGTCGTAATCGCCGTGCAGGACGTTGCTCTGCTTGCCGCGCGTCAGGCTGGCGTCAACCGAGAGGGTAAATCCGCTGTGTGCGGCATACTGAtt > 2:514739/1‑130 (MQ=255) cGCTGCCGTCCAGCAGTTGTTGCAGGCCGCTCTCGACGTCGTAATCGCCGTGCAGGACGTTGCTCTGCTTGCCGCGCGTCAGGCTGGCGTCAACCGAGAGGGTAAATCCGCTGTGTGCGGCATACTGAtt < 1:514739/130‑1 (MQ=255) cGCTGCCGTCCAGCAGTTGTTGCAGGCCGCTCTCGACGTCGTAATCGCCGTGCAGGACGTTGCTCTGCTTGCCGCGCGTCAGGCTGGCGTCAACCGAGAGGGTAAATCCGCTGTGTGCGGCATACTGATTGAGCGCTTTa > 2:218248/1‑140 (MQ=255) tGCCGTCCAGCAGTTGTTGCAGGCCGCTATCGACGTCGTAATCGCCGTGCAGGACGTTGCTCTGCTTGCCGCGCGTCAGGCTGGCGTCAACCGAGAGGGTAAATCCGCTGTGTGCGGCATACTGATTGAGCGCTTTATCg < 1:1323804/140‑1 (MQ=255) ccGTCCAGCAGTTGTTGCAGGCCGCTCTCGACGTCGTAATCGCCGTGCAGGACGTTGCTCTGCTTGCCGCGCGTCAGGCTGGCGTCAACCGAGAGGGTAAATCCGCTGTGTGCGGCATACTGATTGAGCGCTTTATCGAg < 1:218248/140‑1 (MQ=255) ccGTCCAGCAGTTGTTGCAGGCCGCTCTCGACGTCGTAATCGCCGTGCAGGACGTTGCTCTGCTTGCCGCGCGTCAGGCTGGCGTCAACCGAGAGGGTAAATCCGCTGTGTGCGGCATACTGATTGAGCGCTTTATCGAg > 2:188475/1‑140 (MQ=255) agcagTTGTTGCAGGCCGCTCTCGACGTCGTAATCGCCGTGCAGGACGTTGCTCTGCTTGCCGCGCGTCAGGCTGGCGTCAACCGAGAGGGTAAATCCGCTGTGTGCGGCATACTGATTGAGCGCTTTATCGAGCGATcc < 2:868674/140‑1 (MQ=255) gttgttGCAGGCCGCTCTCGACGTCGTAATCGCCGTGCAGGACGTTGCTCTGCTTGCCGCGCGTCAGGCTGGCGTCAACCGAGAGGGTAAATCCGCTGTGTGCGGCATACTGATTGAGCGCTTTATCGAGCGATCCCGGt > 2:690390/1‑140 (MQ=255) ttgttgCAGGCCGCTCTCGACGTCGTAATCGCCGTGCAGGACGTTGCTCTGCTTGCCGCGCGTCAGGCTGGCGTCAACCGAGAGGGTAAATCCGCTGTTTGCGGCATACTGATTGAGCGCTTTATCGAGCGATCCCGGTg < 2:753322/140‑1 (MQ=255) ttgttgCAGGCCGCTCTCGACGTCGTAATCGCCGTGCAGGACGTTGCTCTGCTTGCCGCGCGTCAGGCTGGCGTCAACCGAGAGGGTAAATCCGCTGTGTGCGGCATACTGATTGAGCGCTTTATCGAGCGATCCCGGTg < 2:1579868/140‑1 (MQ=255) ttgttgCAGGCCGCTCTCGACGTCGTAATCGCCGTGCAGGACGTTGCTCTGCTTGCCGCGCGTCAGGCTGGCGTCAACCGAGAGGGTAAATCCGCTGTGTGCGGCATACTGATTGAGCGCTTTATCGAGCGATCCCGGTg < 2:1483780/140‑1 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ctctCGACGTCGTAATCGCCGTGCAGGACGTTGCTCTGCTTGCCGCGCGTCAGGCTGGCGTCAACCGAGAGGGTAAATCCGCTGTGTGCGGCATACTGATTGAGCGCTTTATCGAGCGATCCCGGTGCGATATTAACCtg > 1:1088129/1‑140 (MQ=255) gACGTCGTAATCGCCGTGCAGGACGTTGCTCTGCTTGCCGCGCGTCAGGCTGGCGTCAACCGAGAGGGTAAATCCGCTGTGTGCGGCATACTGATTGAGCGCTTTATCGAGCGATCCCGGTGCGATATTAACCTGTgcag > 1:1139302/1‑140 (MQ=255) aaTCGCCGTGCAGGACGTTGCTCTGCTTGCCGCGCGTCAGGCTGGCGTCAACCGAGAGGGTAAATCCGCTGTGTGCGGCATACTGATTGAGCGCTTTATCGAGCGATCCCGGTGCGATATTAACCTGTGCAGCAAAAGCg > 1:396613/1‑140 (MQ=255) aTCGCCGTGCAGGACGTTGCTCTGCTTGCCGCGCGTCAGGCTGGCGTCAACCGAGAGGGTAAATCCGCTGTGTGCGGCATACTGATTGAGCGCTTTATCGAGCGATCCCGGTGCGATATTAACCTGTGCAGCAAAAGCgg < 1:1415943/140‑1 (MQ=255) tCGCCGTGCAGGACGTTGCTCTGCTTGCCGCGCGTCAGGCTGGCGTCAACCGAGAGGGTAAATCCGCTGTGTGCGGCATACTGATTGAGCGCTTTATCGAGCGATCCCGGTGCGATATTAACCTGTGCAGCAAAAGCGGa < 1:91904/140‑1 (MQ=255) gTGCAGGACGTTGCTCTGCTTGCCGCGCGTCAGGCTGGCGTCAACCGAGAGGGTAAATCCGCTGTGTGCGGCATACTGATTGAGCGCTTTATCGAGCGATCCCGGTGCGATATTAACCTGTGCAGCAAAAGCGGAAAACg > 1:688354/1‑140 (MQ=255) | GACCACGGTCAGGGCATCTTCTTTTGGTGCGGGCGCGGGCTCCAGCGTCCAGCTGTTATTTCCCAGCGGTTTTACCTGCAGTCCGCTGCCGTCCAGCAGTTGTTGCAGGCCGCTCTCGACGTCGTAATCGCCGTGCAGGCCGTTGCTCTGCTTGCCGCGCGTCAGGCTGGCGTCAACCGAGAGGGTAAATCCGCTGTGTGCGGCATACTGATTGAGCGCTTTATCGAGCGATCCCGGTGCGATATTAACCTGTGCAGCAAAAGCGGAAAACG > NC_000913/4516324‑4516595 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |