Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,628,625 | 0 | A | C | 21.7% | 146.2 / 13.5 | 60 | V105G (GTC→GGC) | pdeF | cyclic di‑GMP phosphodiesterase PdeF |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (41/6); new base C (0/13); total (41/19) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.25e-09 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. |
GCTCGCCAGTAATCCTACAAATGCAGCAAACTGGAAAAGTATCAGAAACAGCGTTGCAGGAAACACAATCTGCCAGAATATACGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAA‑CCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCTAAGGCGATCCCTGGCAATGCCGCCCAGCTGAAAAA > NC_000913/2628486‑2628764 | gCTCGCCAGTAATCCTACAAATGCAGCAAACTGGAAAAGTATCAGAAACAGCGTTGCAGGAAACACAATCTGCCAGAATATACGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGa < 1:1574002/140‑1 (MQ=255) cTCGCCAGTAATCCTACAAATGCAGCAAACTGGAAAAGTATCAGAAACAGCGTTGCAGGAAACACAATCTGCCAGAATATACGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGAc > 1:16199/1‑140 (MQ=255) cTCGCCAGTAATCCTACAAATGCAGCAAACTGGAAAAGTATCAGAAACAGCGTTGCAGGAAACACAATCTGCCAGAATATACGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGAc > 2:1834715/1‑140 (MQ=255) tCGCCAGTAATCCTACAAATGCAGCAAACTGGAAAAGTATCAGAAACAGCGTTGCAGGAAACACAATCTGCCAGAATATACGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGa > 1:1789447/1‑138 (MQ=255) tCGCCAGTAATCCTACAAATGCAGCAAACTGGAAAAGTATCAGAAACAGCGTTGCAGGAAACACAATCTGCCAGAATATACGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGa < 2:1789447/138‑1 (MQ=255) tCGCCAGTAATCCTACAAATGCAGCAAACTGGAAAAGTATCAGAAACAGCGTTGCAGGAAACACAATCTGCCAGAATATACGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGAcc < 1:675275/140‑1 (MQ=255) tCGCCAGTAATCCTACAAATGCAGCAAACTGGAAAAGTATCAGAAACAGCGTTGCAGGAAACACAATCTGCCAGAATATACGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGAcc < 2:1823778/140‑1 (MQ=255) cGCCAGTAATCCTACAAATGCAGCAAACTGGAAAAGTATCAGAAACAGCGTTGCAGGAAACACAATCTGCCAGAATATACGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGAccc < 1:1073225/140‑1 (MQ=255) ccAGTAATCCTACAAATGCAGCAAACTGGAAAAGTATCAGAAACAGCGTTGCAGGAAACACAATCTGCCAGAATATACGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTg < 1:1834715/140‑1 (MQ=255) cTACAAATGCAGAAAACGGAAAAAGTATCAAAAACAGCGTTGCAGAAAACACAATCTGCCAGAATATCCGCTGGAAAATTAAACGGGTACCCCCATGTGAAACGTTGTTCCGCGGGGGAGAAAAGCCCCTGTAA‑CCGccc < 2:1329661/140‑1 (MQ=255) aCAAATGCAGCAAACTGGAAAAGTATCAGAAACAGCGTTGCAGGAAACACAATCTGCCAGAATATACGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAA‑CCGCCCCa > 1:1209010/1‑140 (MQ=255) aCAAATGCAGCAAACTGGAAAAGTATCAGAAACAGCGTTGCAGGAAACACAATCTGCCAGAATATACGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAA‑CCGCCCCa > 1:512935/1‑140 (MQ=255) aaaaTGCAACAAACTGAAAAAGTATCAGAAACAGCGTTGCAGGAAACACAATCCGCCAAAATATGCGGTGGAAAATTAACCGGGTATCCCCATGTAAAACGTTGTTACGCGGGGGAGAAAAGCCCCTGTAA‑CCGCCCCaa < 2:16199/139‑1 (MQ=255) aaTGCAGCAAACTGAAAAAGTATCAAAAACAGCGTTGCAGGAAACAAAATCTGCCAGAATATACGCTGGAAAATTAAACGGGTATCCCCATGTGAAACGTTTTTACGCGGGGGAGAAAAGCCCCTGTAA‑CCGCCCCAACa < 2:609923/140‑1 (MQ=255) gcagcaAACTGGAAAAGTATCAGAAACAGCGTTGCAGGAAACACAATCTGCCAGAATATACGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAA‑CCGCCCCAACagag > 1:660686/1‑140 (MQ=255) gcagaaAACTGAAAAAGTATAAAAAACAGCGTGGAAGAAAACACAATCTGCCAGAATATACGCGGGAAAATAAAACGGTTATCCCCATGTAAAACGTTTTTACGCGGGGGAGAAAAGCCCCTGTAA‑CCGCCCCAACagag < 2:1962279/140‑1 (MQ=255) cagcaAACTGGAAAAGTATCAGAAACAGCGTTGCAGGAAACACAATCTGCCAGAATATACGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAA‑CCGCCCCAACAgaga > 2:1570548/1‑140 (MQ=255) caAACTGGAAAAGTATCAGAAACAGCGTTGCAGGAAACACAATCTGCCAGAATATACGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAA‑CCGCCCCAACAGAGaatg > 2:1837597/1‑140 (MQ=255) caAACTGGAAAAGTATCAGAAACAGCGTTGCAGGAAACACAATCTGCCAGAATATACGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAA‑CCGCCCCAACAGAGaatg > 1:609923/1‑140 (MQ=255) tgaaaaaTTATAAGAAACAGCGTTGCAGAAAACACAATCTGCAAAAATATCCGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCATGTAAAACGTTGTTACGCGGGGGAGAAAAGCCCCTGTAA‑CCGCCCCAACAGAGaatgataat < 2:20950/137‑1 (MQ=255) tGGAAAAGTATCAGAAACAGCGTTGCAGGAAACACAATCTGCCAGAATATACGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAA‑CCGCCCCAACAGAGaatgatctg > 1:502152/1‑137 (MQ=255) tGGAAAAGTATCAGAAACAGCGTTGCAGGAAACACAATCTGCCAGAATATACGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAA‑CCGCCCCAACAGAGaatgataat > 1:1070131/1‑140 (MQ=255) aGTATCAGAAACAGCGTTGCAGGAAACACAATCTGCCAGAATATACGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGCCCCTGTAA‑CCGCCCCAACAGAGAATgataatgataat < 1:153660/140‑1 (MQ=255) tCAGAAACAGCGTTGCAGGAAACACAATCTGCCAGAATATACGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAA‑CCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATaaaa > 1:911365/1‑140 (MQ=255) tCAGAAACAGCGTTGCAGGAAACACAATCTGCCAGAATATACGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAA‑CCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATaaaa > 1:1247703/1‑140 (MQ=255) aaaaaCAGCGTTGCAGAAAACACAATCTGCAAAAAAATCCGGGGGAAAATAAAACGGGTATCCCCATGTAAAACGTTTTTCCGCGGGGGAAAAAAGCCCCTGTAA‑CCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAAtt < 2:1851744/138‑1 (MQ=255) aGAAACAGCGTTGCAGGAAACACAATCTGCCAGAATATACGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAA‑CCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAAtt > 1:1647608/1‑140 (MQ=255) gAAACAGCGTTGCAGGAAACACAATCTGCCAGAATATACGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAA‑CCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTa > 1:1037611/1‑140 (MQ=255) agggggTTGAAGAAAACAAAATCGGCAAAAATACACGTTGGAAAATAAAACGGGTACGACAATGAAAAATGTTTTTACGCGGGGGAGAAAAGCCCCTTTAC‑CCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGcc < 2:135800/135‑1 (MQ=255) cGTTGCAGGAAACACAATCTGCCAGAATATACGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAA‑CCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTa > 1:1673505/1‑140 (MQ=255) gagaaaaCACAATCTGCCAAAATATACGCTGGAAAATAAAACGGGTATCCCCATGTAAAACGTTGTTACGCGGGGGAGAAAAGCCCCTGTAA‑CCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGAt < 2:1070131/136‑1 (MQ=255) aaCACAATCTGCCAGAATATACGTTGGAAAATTAAACGGGTATCCCCATGTGAAACGTTGTTACGCGGGGGAGAAAAGCCCCTGTAA‑CCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGt < 1:1837597/140‑1 (MQ=255) aaCACAATCTGCCAGAATATACGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAA‑CCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGctg > 1:135800/1‑138 (MQ=255) gCCAGAATATACGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAA‑CCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCTGTTAATGATAGCGTTTCGTaaaaa > 1:1058060/1‑140 (MQ=255) gCCAGAATATACGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAA‑CCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTaaaaa > 1:1508521/1‑140 (MQ=255) aaTATACGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAA‑CCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAg > 1:1405938/1‑140 (MQ=255) aaTATACGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAA‑CCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAg < 2:1247703/140‑1 (MQ=255) aaTATACGCTGGAAAATAAACCGGGTACCACCATGTAAAACGTTGTTACGCGGGGGAGAAAAGCCCCTGTAA‑CCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCTGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAg < 2:1058060/140‑1 (MQ=255) tataCGCGGGAAAATAAAACGGTTACCCCCATGTAAAACGTTGTTCCGCGGGGAAAAAAAGCCCCTGTAA‑CCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGct < 2:1037611/140‑1 (MQ=255) gCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAA‑CCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCa > 1:1161410/1‑140 (MQ=255) gggAAATTAAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAA‑CCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCatat > 1:794634/1‑140 (MQ=255) ggAAATTAAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAA‑CCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATAtt > 1:859278/1‑140 (MQ=255) ggAAATTAAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAA‑CCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATAtt > 1:1028509/1‑140 (MQ=255) ggAAATTAAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAA‑CCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATAtt > 1:642693/1‑140 (MQ=255) ggAAATTAAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAA‑CCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATAtt > 1:1793508/1‑140 (MQ=255) ttaagggggTACCACAATGTAAACCGTTGTTACGGGGGGGAGTAAAGACCCTGTAA‑CCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCgg < 2:897277/134‑1 (MQ=255) ggggTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCGGGGGAGAAAAGCCCCTGTAA‑CCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACaaa < 2:911365/139‑1 (MQ=255) gggTATCACCATGTAAAACTTTTTTACGCGGGGGATAAAAGCCCTTGAAA‑CCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACaaaa < 2:623846/140‑1 (MQ=255) gTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAA‑CCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAAt > 1:1707368/1‑140 (MQ=255) aTCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAA‑CCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATcc > 1:1064682/1‑140 (MQ=255) ccccATGTGAATGTTTGTAACGCGGGGGAGAAAAGCCCTTGTAA‑CCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCt < 2:1405938/138‑1 (MQ=255) ccataTGTAAAATGTTTTTCCGCTGGGGAAGAAACGCCTGATAT‑CCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCt < 2:642693/136‑1 (MQ=255) cACCATGTAAAACTTTGTTACGCGGGGGAGAAAAGCCCCTGTAA‑CCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCt < 2:1239222/140‑1 (MQ=255) cACCATGTAAAACGTTGTTACGCGGGGGAGAAAAGCCCCTGTAA‑CCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCt < 2:859278/140‑1 (MQ=255) cACCATGAAAACCTTTTTTACGCGGGGGAGAAAAGCCCTTTTAA‑CCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCt < 2:1028509/140‑1 (MQ=255) aTGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAA‑CCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCTAAgg > 2:54300/1‑140 (MQ=255) tgtgAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGCCCCTGTAA‑CCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCTAAgg < 2:713180/139‑1 (MQ=255) tgtgAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAA‑CCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCTAAgg > 1:713180/1‑139 (MQ=255) tgtgAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAA‑CCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCTAAGGc > 2:1400786/1‑140 (MQ=255) tgtgAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAA‑CCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCTAAGGc > 2:699554/1‑140 (MQ=255) tgtgAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAA‑CCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCTAAGGc > 1:623846/1‑140 (MQ=255) gtgAAACGTTGTTACGCGGGGGAGAAAAGCCCCTGTAA‑CCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCTAAGGCg < 2:1064682/140‑1 (MQ=255) gtgAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAA‑CCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCTAAGGCg > 2:246321/1‑140 (MQ=255) gtgAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAA‑CCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCTAAGGCg > 2:951406/1‑140 (MQ=255) gtgAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAA‑CCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCTAAGGCg > 1:1714255/1‑140 (MQ=255) tgAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAA‑CCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCTAAGGCGa > 2:131618/1‑140 (MQ=255) tgAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAA‑CCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCTAAGGCGa > 2:91205/1‑140 (MQ=255) gttgttACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAA‑CCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCTAAGGCGATCCCTg > 1:907568/1‑140 (MQ=255) tgttACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAA‑CCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCTAAGGCGATCCCTGGc > 1:1109601/1‑140 (MQ=255) ccGGGGAGTAAAGACCCTGTAA‑CCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCTAAGGCGATCCCTGGCAATgccg > 2:933656/1‑140 (MQ=255) ggggAG‑AAAGCCCCTTAAACCCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCTAAGGCGATCCCTGGCAATgccgcc < 2:1517229/140‑1 (MQ=255) gggAGTAAAGACCCTGTAA‑CCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCTAAGGCGATCCCTGGCAATGCCGccc > 1:486523/1‑140 (MQ=255) aaaGACCCTGTAA‑CCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCTAAGGCGATCCCTGGCAATGCCGCCCAGCTGa < 2:1673505/140‑1 (MQ=255) aaGCCCCTGTAA‑CCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCTAAGGCGATCCCTGGCAATGCCGCCCAGCTGaa < 1:1760571/140‑1 (MQ=255) aCCCTGTAA‑CCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCTAAGGCGATCCCTGGCAATGCCGCCCAGCTGaaaaa > 2:260559/1‑140 (MQ=255) aCCCTGTAA‑CCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCTAAGGCGATCCCTGGCAATGCCGCCCAGCTGaaaaa > 1:1517229/1‑140 (MQ=255) aCCCTGTAA‑CCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCTAAGGCGATCCCTGGCAATGCCGCCCAGCTGaaaaa < 1:933656/140‑1 (MQ=255) aCCCTGTAA‑CCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCTAAGGCGATCCCTGGCAATGCCGCCCAGCTGaaaaa > 1:719726/1‑140 (MQ=255) | GCTCGCCAGTAATCCTACAAATGCAGCAAACTGGAAAAGTATCAGAAACAGCGTTGCAGGAAACACAATCTGCCAGAATATACGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAA‑CCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCTAAGGCGATCCCTGGCAATGCCGCCCAGCTGAAAAA > NC_000913/2628486‑2628764 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |