| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,862,169 | A→T | D247V (GAT→GTT) | ygbJ → | putative L‑threonate dehydrogenase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,862,169 | 0 | A | T | 98.9% | 300.3 / ‑4.1 | 88 | D247V (GAT→GTT) | ygbJ | putative L‑threonate dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/1); new base T (45/42); total (45/43) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.89e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.86e-01 | |||||||||||
CGCTGGATGTGATGTATGACGTCGTGACCAATGCCGCCGGAAATTCCTGGATGTTCGAAAACCGGATGCGTCATGTGGTGGATGGCGATTACACCCCGCATTCAGCCGTCGATATTTTTGTTAAGGATCTTGGTCTGGTTGCCGATACAGCCAAAGCCCTGCACTTCCCGCTGCCATTGGCCTCAACAGCATTGAATATGTTCACCAGCGCCAGTAACGCGGGTTACGGGAAAGAAGACGATAGCGCAGTTATCAAGATTTTC > NC_000913/2862043‑2862305 | cGCTGGATGTGATGTATGACGTCGTGACCAATGCCGCCGGAAATTCCTGGATGTTCGAAAACCGGATGCGTCATGTGGTGGATGGCGATTACACCCCGCATTCAGCCGTCGATATTTTTGTTAAGGTTCTTGGTCTGGtt > 1:1061684/1‑140 (MQ=255) gCTGGATGTGATGTATGACGTCGTGACCAATGCCGCCGGAAATTCCTGGATGTTCGAAAACCGGATGCGTCATGTGGTGGATGGCGATTACACCCCGCATTCAGCCGTCGATATTTTTGTTAAGGTTCTTGGTCTGGTTg < 1:1041926/140‑1 (MQ=255) gCTGGATGTGATGTATGACGTCGTGACCAATGCCGCCGGAAATTCCTGGATGTTCGAAAACCGGATGCGTCATGTGGTGGATGGCGATTACACCCCGCATTCAGCCGTCGATATTTTTGTTAAGGTTCTTGGTCTGGTTg < 2:1018027/140‑1 (MQ=255) cTGGATGTGATGTATGACGTCGTGACCAATGCCGCCGGAAATTCCTGGATGCTCGAAAACCGGATGCGTCATGTGGTGGATGGCGATTACACCCCGCATTCAGCCGTCGATATTTTTGTTAAGGTTCTTGGTCTGGTTGc < 1:390679/140‑1 (MQ=255) ggATGTGATGTATGACGTCGTGACCAATGCCGCCGGAAATTCCTGGATGTTCGAAAACCGGATGCGTCATGTGGTGGATGGCGATTACACCCCGCATTCAGCCGTCGATATTTTTGTTAAGGTTCTTGGTCTGGTTGCCg > 1:374377/1‑140 (MQ=255) atgtgatgtATGACGTCGTGACCAATGCCGCCGGAAATTCCTGGATGTTCGAAAACCGGATGCGTCATGTGGTGGATGGCGATTACACCCCGCATTCAGCCGTCGATATTTTTGTTAAGGTTCTTGGTCTGGTTGCCGAt < 1:333120/140‑1 (MQ=255) atgtgatgtATGACGTCGTGACCAATGCCGCCGGAAATTCCTGGATGTTCGAAAACCGGATGCGTCATGTGGTGGATGGCGATTACACCCCGCATTCAGCCGTCGATATTTTTGTTAAGGTTCTTGGTCTGGTTGCCGAt > 2:81207/1‑140 (MQ=255) tgtgatgtATGACGTCGTGACCAATGCCGCCGGAAATTCCTGGATGTTCGAAAACCGGATGCGTCATGTGGTGGATGGCGATTACACCCCGCATTCAGCCGTCGATATTTTTGTTAAGGTTCTTGGTCTGGTTGCCGATa < 2:410811/140‑1 (MQ=255) tgtATGACGTCGTGACCAATGCCGCCGGAAATTCCTGGATGTTCGAAAACCGGATGCGTCATGTGGTGGATGGCGATTACACCCCGCATTCAGCCGTCGATATTTTTGTTAAGGTTCTTGGTCTGGTTGCCGATACAGcc > 2:799241/1‑140 (MQ=255) gtATGACGTCGTGACCAATGCCGCCGGAAATTCCTGGATGTTCGAAAACCGGATGCGTCATGTGGTGGATGGCGATTACACCCCGCATTCAGCCGTCGATATTTTTGTTAAGGTTCTTGGTCTGGTTGCCGATACAGCCa < 1:531813/140‑1 (MQ=255) gtATGACGTCGTGACCAATGCCGCCGGAAATTCCTGGATGTTCGAAAACCGGATGCGTCATGTGGTGGATGGCGATTACACCCCGCATTCAGCCGTCGATATTTTTGTTAAGGTTCTTGGTCTGGTTGCCGATACAGCCa < 2:222198/140‑1 (MQ=255) aTGACGTCGTGACCAATGCCGCCGGAAATTCCTGGATGTTCGAAAACCGGATGCGTCATGTGGTGGATGGCGATTACACCCCGCATTCAGCCGTCGATATTTTTGTTAAGGTTCTTGGTCTGGTTGCCGATACAGCCaaa > 2:555292/1‑140 (MQ=255) aTGACGTCGTGACCAATGCCGCCGGAAATTCCTGGATGTTCGAAAACCGGATGCGTCATGTGGTGGATGGCGATTACACCCCGCATTCAGCCGTCGATATTTTTGTTAAGGTTCTTGGTCTGGTTGCCGATACAGCCaaa > 1:1144415/1‑140 (MQ=255) aTGACGTCGTGACCAATGCCGCCGGAAATTCCTGGATGTTCGAAAACCGGATGCGTCATGTGGTGGATGGCGATTACACCCCGCATTCAGCCGTCGATATTTTTGTTAAGGTTCTTGGTCTGGTTGCCGATACAGCCa > 1:435645/1‑138 (MQ=255) aTGACGTCGTGACCAATGCCGCCGGAAATTCCTGGATGTTCGAAAACCGGATGCGTCATGTGGTGGATGGCGATTACACCCCGCATTCAGCCGTCGATATTTTTGTTAAGGTTCTTGGTCTGGTTGCCGATACAGCCa < 2:435645/138‑1 (MQ=255) tGACGTCGTGACCAATGCCGCCGGAAATTCCTGGATGTTCGAAAACCGGATGCGTCATGTGGTGGATGGCGATTACACCCCGCATTCAGCCGTCGATATTTTTGTTAAGGTTCTTGGTCTGGTTGCCGATACAGCCAAAg < 2:564669/140‑1 (MQ=255) tGACGTCGTGACCAATGCCGCCGGAAATTCCTGGATGTTCGAAAACCGGATGCGTCATGTGGTGGATGGCGATTACACCCCGCATTCAGCCGTCGATATTTTTGTTAAGGTTCTTGGTCTGGTTGCCGATACAGCCAAAg > 2:39998/1‑140 (MQ=255) gACGTCGTGACCAATGCCGCCGGAAATTCCTGGATGTTCGAAAACCGGATGCGTCATGTGGTGGATGGCGATTACACCCCGCATTCAGCCGTCGATATTTTTGTTAAGGTTCTTGGTCTGGTTGCCGATACAGCCAAAGc < 1:686996/140‑1 (MQ=255) gACGTCGTGACCAATGCCGCCGGAAATTCCTGGATGTTCGAAAACCGGATGCGTCATGTGGTGGATGGCGATTACACCCCGCATTCAGCCGTCGATATTTTTGTTAAGGTTCTTGGTCTGGTTGCCGATACAGCCAAAGc > 2:341501/1‑140 (MQ=255) tcgtGACCAATGCCGCCGGAAATTCCTGGATGTTCGAAAACCGGATGCGTCATGTGGTGGATGGTGATTACACCCCGCATTCAGCCGTCGATATTTTTGTTAAGGTTCTTGGTCTGGTTGCCGATACAGCCAAAGCCCTg > 2:1051397/1‑140 (MQ=255) cntGACCAATGCCGCCGGAAATTCCTGGATGTTCGAAAACCGGATGCGTCATGTGGTGGATGGCGATTACACCCCGCATTCAGCCGTCGATATTTTTGTTAAGGTTCTTGGTCTGGTTGCCGATACAGCCAAAGCCCTGc > 1:1239779/1‑140 (MQ=255) tGACCAATGCCGCCGGAAATTCCTGGATGTTCGAAAACCGGATGCGTCATGTGGTGGATGGCGATTACACCCCGCATTCAGCCGTCGATATTTTTGTTAAGGTTCTTGGTCTGGTTGCCGATACAGCCa > 1:689708/1‑129 (MQ=255) tGACCAATGCCGCCGGAAATTCCTGGATGTTCGAAAACCGGATGCGTCATGTGGTGGATGGCGATTACACCCCGCATTCAGCCGTCGATATTTTTGTTAAGGTTCTTGGTCTGGTTGCCGATACAGCCa < 2:689708/129‑1 (MQ=255) tGACCAATGCCGCCGGAAATTCCTGGATGTTCGAAAACCGGATGCGTCATGTGGTGGATGGCGATTACACCCCGCATTCAGCCGTCGATATTTTTGTTAAGGTTCTTGGTCTGGTTGCCGATACAGCCAAAGCCCTGCAc > 2:101630/1‑140 (MQ=255) tGACCAATGCCGCCGGAAATTCCTGGATGTTCGAAAACCGGATGCGTCATGTGGTGGATGGCGATTACACCCCGCATTCAGCCGTCGATATTTTTGTTAAGGTTCTTGGTCTGGTTGCCGATACAGCCAAAGCCCTGCAc > 2:1560481/1‑140 (MQ=255) tGACCAATGCCGCCGGAAATTCCTGGATGTTCGAAAACCGGATGCGTCATGTGGTGGATGGCGATTACACCCCGCATTCAGCCGTCGATATTTTTGTTAAGGTTCTTGGTCTGGTTGCCGATACAGCCAAAGCCCTGCAc > 2:1368324/1‑140 (MQ=255) aTGCCGCCGGAAATTCCTGGATGTTCGAAAACCGGATGCGTCATGTGGTGGATGGCGATTACACCCCGCATTCAGCCGTCGATATTTTTGTTAAGGTTCTTGGTCTGGTTGCCGATACAGCCAAAGCCCTGCACTTCCCg > 1:218387/1‑140 (MQ=255) tGCCGCCGGAAATTCCTGGATGTTCGAAAACCGGATGCGTCATGTGGTGGATGGCGATTACACCCCGCATTCAGCCGTCGATATTTTTGTTAAGGTTCTTGGTCTGGTTGCCGATACAGCCAAAGCCCTGCACTTCCCGc > 1:1112722/1‑140 (MQ=255) ccgGAAATTCCTGGATGTTCGAAAACCGGATGCGTCATGTGGTGGATGGTGATTACACCCCGCATTCAGCCGTCGATATTTTTGTTAAGGTTCTTGGTCTGGTTGCCGATACAGCCAAAGCCCTGCACTTCCCGCTGCCa < 1:1051397/140‑1 (MQ=255) ccgGAAATTCCTGGATGTTCGAAAACCGGATGCGTCATGTGGTGGATGGCGATTACACCCCGCATTCAGCCGTCGATATTTTTGTTAAGGTTCTTGGTCTGGTTGCCGATACAGCCAAAGCCCTGCACTTCCCGCTGCCa > 2:781525/1‑140 (MQ=255) ccgGAAATTCCTGGATGTTCGAAAACCGGATGCGTCATGTGGTGGATGGCGATTACACCCCGCATTCAGCCGTCGATATTTTTGTTAAGGTTCTTGGTCTGGTTGCCGATACAGCCAAAGCCCTGCACTTCCCGCTGCCa > 2:1552764/1‑140 (MQ=255) ccgGAAATTCCTGGATGTTCGAAAACCGGATGCGTCATGTGGTGGATGGCGATTACACCCCGCATTCAGCCGTCGATATTTTTGTTAAGGTTCTTGGTCTGGTTGCCGATACAGCCAAAGCCCTGCACTTCCCGCTGCCa < 1:81207/140‑1 (MQ=255) ccgGAAATTCCTGGATGTTCGAAAACCGGATGCGTCATGTGGTGGATGGCGATTACACCCCGCATTCAGCCGTCGATATTTTTGTTAAGGTTCTTGGTCTGGTTGCCGATACAGCCAAAGCCCTGCACTTCCCGCTGCCa < 2:1257236/140‑1 (MQ=255) cTGGATGTTCGAAAACCGGATGCGTCATGTGGTGGATGGCGATTACACCCCGCATTCAGCCGTCGATATTTTTGTTAAGGTTCTTGGTCTGGTTGCCGATACAGCCAAAGCCCTGCACTTCCCGCTGCCATTGGCCTCaa < 2:1469346/140‑1 (MQ=255) cTGGATGTTCGAAAACCGGATGCGTCATGTGGTGGATGGCGATTACACCCCGCATTCAGCCGTCGATATTTTTGTTAAGGATCTTGGTCTGGTTGCCGATACAGCCAAAGCCCTGCACTTCCCGCTGCCATTGGCCTCaa < 1:686791/140‑1 (MQ=255) ggATGTTCGAAAACCGGATGCGTCATGTGGTGGATGGCGATTACACCCCGCATTCAGCCGTCGATATTTTTGTTAAGGTTCTTGGTCTGGTTGCCGATACAGCCAAAGCCCTGCACTTCCCGCTGCCATTGGCCTCAACa < 2:1144415/140‑1 (MQ=255) ggATGTTCGAAAACCGGATGCGTCATGTGGTGGATGGCGATTACACCCCGCATTCAGCCGTCGATATTTTTGTTAAGGTTCTTGGTCTGGTTGCCGATACAGCCAAAGCCCTGCACTTCCCGCTGCCATTGGCCTCAACa < 2:1061684/140‑1 (MQ=255) gATGTTCGAAAACCGGATGCGTCATGTGGTGGATGGCGATTACACCCCGCATTCAGCCGTCGATATTTTTGTTAAGGTTCTTGGTCTGGTTGCCGATACAGCCAAAGCCCTGCACTTCCCGCTGCCATTGGCCTCAACAg < 1:39998/140‑1 (MQ=255) gTTCGAAAACCGGATGCGTCATGTGGTGGATGGCGATTACACCCCGCATTCAGCCGTCGATATTTTTGTTAAGGTTCTTGGTCTGGTTGCCGATACAGCCAAAGCCCTGCACTTCCCGCTGCCATTGGCCTCAACAGCAt < 1:101630/140‑1 (MQ=255) gTTCGAAAACCGGATGCGTCATGTGGTGGATGGCGATTACACCCCGCATTCAGCCGTCGATATTTTTGTTAAGGTTCTTGGTCTGGTTGCCGATACAGCCAAAGCCCTGCACTTCCCGCTGCCATTGGCCTCAACAGCAt < 1:781525/140‑1 (MQ=255) tCGAAAACCGGATGCGTCATGTGGTGGATGGCGATTACACCCCGCATTCAGCCGTCGATATTTTTGTTAAGGTTCTTGGTCTGGTTGCCGATACAGCCAAAGCCCTGCACTTCCCGCTGCCATTGGCCTCAACAGCATTg > 2:266755/1‑140 (MQ=255) tCGAAAACCGGATGCGTCATGTGGTGGATGGCGATTACACCCCGCATTCAGCCGTCGATATTTTTGTTAAGGTTCTTGGTCTGGTTGCCGATACAGCCAAAGCCCTGCACTTCCCGCTGCCATTGGCCTCAACAGCATTg > 1:15727/1‑140 (MQ=255) tCGAAAACCGGATGCGTCATGTGGTGGATGGCGATTACACCCCGCATTCAGCCGTCGATATTTTTGTTAAGGTTCTTGGTCTGGTTGCCGATACAGCCAAAGCCCTGCACTTCCCGCTGCCATTGGCCTCAACAGCATTg > 2:1354993/1‑140 (MQ=255) tCGAAAACCGGATGCGTCATGTGGTGGATGGCGATTACACCCCGCATTCAGCCGTCGATATTTTTGTTAAGGTTCTTGGTCTGGTTGCCGATACAGCCAAAGCCCTGCACTTCCCGCTGCCATTGGCCTCAACAGCATTg > 1:986741/1‑140 (MQ=255) tCGAAAACCGGATGCGTCATGTGGTGGATGGCGATTACACCCCGCATTCAGCCGTCGATATTTTTGTTAAGGTTCTTGGTCTGGTTGCCGATACAGCCAAAGCCCTGCACTTCCCGCTGCCATTGGCCTCAACAGCATTg > 1:1541070/1‑140 (MQ=255) tCGAAAACCGGATGCGTCATGTGGTGGATGGCGATTACACCCCGCATTCAGCCGTCGATATTTTTGTTAAGGTTCTTGGTCTGGTTGCCGATACAGCCAAAGCCCTGCACTTCCCGCTGCCATTGGCCTCAACAGCATTg > 1:547322/1‑140 (MQ=255) cGAAAACCGGATGCGTCATGTGGTGGATGGCGATTACACCCCGCATTCAGCCGTCGATATTTTTGTTAAGGTTCTTGGTCTGGTTGCCGATACAGCCAAAGCCCTGCACTTCCCGCTGCCATTGGCCTCAACAGCATTGa < 2:547322/140‑1 (MQ=255) cGAAAACCGGATGCGTCATGTGGTGGATGGCGATTACACCCCGCATTCAGCCGTCGATATTTTTGTTAAGGTTCTTGGTCTGGTTGCCGATACAGCCAAAGCCCTGCACTTCCCGCTGCCATTGGCCTCAACAGCATTGa < 2:1112722/140‑1 (MQ=255) aaCCGGATGCGTCATGTGGTGGATGGCGATTACACCCCGCATTCAGCCGTCGATATTTTTGTTAAGGTTCTTGGTCTGGTTGCCGATACAGCCAAAGCCCTGCACTTCCCGCTGCCATTGGCCTCAACAGCATTGAatat > 2:1151922/1‑140 (MQ=255) aCCGGATGCGTCATGTGGTGGATGGCGATTACACCCCGCATTCAGCCGTCGATATTTTTGTTAAGGTTCTTGGTCTGGTTGCCGATACAGCCAAAGCCCTGCACTTCCCGCTGCCATTGGCCTCAACAGCATTGAATATg < 1:1560481/140‑1 (MQ=255) gATGCGTCATGTGGTGGATGGCGATTACACCCCGCATTCAGCCGTCGATATTTTTGTTAAGGTTCTTGGTCTGGTTGCCGATACAGCCAAAGCCCTGCACTTCCCGCTGCCATTGGCCTCAACAGCATTGAATATGTTCa > 1:418185/1‑140 (MQ=255) aTGCGTCATGTGGTGGATAGCGATTACACCCCGCATTCAGCCGTCGATATTTTTGTTAAGGTTCTTGGTCTGGTTGCCGATACAGCCAAAGCCCTGCGCTTCCCGCTGCCATTGGCCTCAACAGCATTGAATATGTTCAc < 1:1269420/140‑1 (MQ=255) tGCGTCATGTGGTGGATGGCGATTACACCCCGCATTCAGCCGTCGATATTTTTGTTAAGGTTCTTGGTCTGGTTGCCGATACAGCCAAAGCCCTGCACTTCCCGCTGCCATTGGCCTCAACAGCATTGAATATGTTCAcc < 1:555292/140‑1 (MQ=255) tGCGTCATGTGGTGGATGGCGATTACACCCCGCATTCAGCCGTCGATATTTTTGTTAAGGTTCTTGGTCTGGTTGCCGATACAGCCAAAGCCCTGCACTTCCCGCTGCCATTGGCCTCAACAGCATTGAATATGTTCAcc < 1:895697/140‑1 (MQ=255) cGTCATGTGGTGGATGGCGATTACACCCCGCATTCAGCCGTCGATATTTTTGTTAAGGTTCTTGGTCTGGTTGCCGATACAGCCAAAGCCCTGCACTTCCCGCTGCCATTGGCCTCAACAGCATTGAATATGTTCACCAg > 1:118427/1‑140 (MQ=255) tCATGTGGTGGATGGCGATTACACCCCGCATTCAGCCGTCGATATTTTTGTTAAGGTTCTTGGTCTGGTTGCCGATACAGCCAAAGCCCTGCACTTCCCGCTGCCATTGGCCTCAACAGCATTGAATATGTTCACCAgcg > 2:1416602/1‑140 (MQ=255) tCATGTGGTGGATGGCGATTACACCCCGCATTCAGCCGTCGATATTTTTGTTAAGGTTCTTGGTCTGGTTGCCGATACAGCCAAAGCCCTGCACTTCCCGCTGCCATTGGCCTCAACAGCATTGAATATGTTCACCAgcg > 2:1411179/1‑140 (MQ=255) cATGTGGTGGATGGCGATTACACCCCGCATTCAGCCGTCGATATTTTTGTTAAGGTTCTTGGTCTGGTTGCCGATACAGCCAAAGCCCTGCACTTCCCGCTGCCATTGGCCTCAACAGCATTGa < 1:1415337/124‑1 (MQ=255) cATGTGGTGGATGGCGATTACACCCCGCATTCAGCCGTCGATATTTTTGTTAAGGTTCTTGGTCTGGTTGCCGATACAGCCAAAGCCCTGCACTTCCCGCTGCCATTGGCCTCAACAGCATTGa > 2:1415337/1‑124 (MQ=255) aTGTGGTGGATGGCGATTACACCCCGCATTCAGCCGTCGATATTTTTGTTAAGGTTCTTGGTCTGGTTGCCGATACAGCCAAAGCCCTGCACTTCCCGCTGCCATTGGCCTCAACAGCATTGAATATGTTCACCAGCGcc > 1:1471027/1‑140 (MQ=255) ggATGGCGATTACACCCCGCATTCAGCCGTCGATATTTTTGTTAAGGTTCTTGGTCTGGTTGCCGATACAGCCAAAGCCCTGCACTTCCCGCTGCCATTGGCCTCAACAGCATTGAATATGTTCACCAGCGCCAGTAAcg < 2:1541070/140‑1 (MQ=255) ggATGGCGATTACACCCCGCATTCAGCCGTCGATATTTTTGTTAAGGTTCTTGGTCTGGTTGCCGATACAGCCAAAGCCCTGCACTTCCCGCTGCCATTGGCCTCAACAGCATTGAATATGTTCACCAGCGCCAGTAAcg < 2:15727/140‑1 (MQ=255) ggATGGCGATTACACCCCGCATTCAGCCGTCGATATTTTTGTTAAGGTTCTTGGTCTGGTTGCCGATACAGCCAAAGCCCTGCACTTCCCGCTGCCATTGGCCTCAACAGCATTGAATATGTTCACCAGCGCCAGTAAcg < 2:986741/140‑1 (MQ=255) ggATGGCGATTACACCCCGCATTCAGCCGTCGATATTTTTGTTAAGGTTCTTGGTCTGGTTGCCGATACAGCCAAAGCCCTGCACTTCCCGCTGCCATTGGCCTCAACAGCATTGAATATGTTCACCAGCGCCAGTAAcg < 1:1552764/140‑1 (MQ=255) gATGGCGATTACACCCCGCATTCAGCCGTCGATATTTTTGTTAAGGTTCTTGGTCTGGTTGCCGATACAGCCAAAGCCCTGCACTTCCCGCTGCCATTGGCCTCAACAGCATTGAATATGTTCACCAGCGCCAGTAAcgc > 1:1376476/1‑140 (MQ=255) aTGGCGATTACACCCCGCATTCAGCCGTCGATATTTTTGTTAAGGTTCTTGGTCTGGTTGCCGATACAGCCAAAGCCCTGCACTTCCCGCTGCCATTGGCCTCAACAGCATTGAATATGTTCACCAGCGCCAGTAAcgcg < 1:1151922/140‑1 (MQ=255) ggCGATTACACCCCGCATTCAGCCGTCGATATTTTTGTTAAGGTTCTTGGTCTGGTTGCCGATACAGTCAAAGCCCTGCACTTCCCGCTGCCATTGGCCTCAACAGCATTGAATATGTTCACCAGCGCCAGTAACGCggg > 2:169948/1‑140 (MQ=255) ggCGATTACACCCCGCATTCAGCCGTCGATATTTTTGTTAAGGTTCTTGGTCTGGTTGCCGATACAGCCAAAGCCCTGCACTTCCCGCTGCCATTGGCCTCAACAGCATTGAATATGTTCACCAGCGCCAGTAACGCggg > 1:377146/1‑140 (MQ=255) cGATTACACCCCGCATTCAGCCGTCGATATTTTTGTTAAGGTTCTTGGTCTGGTTGCCGATACAGCCAAAGCCCTGCACTTCCCGCTGCCATTGGCCTCAACAGCATTGAATATGTTCACCAGCGCCAGTAACGCGGGtt > 2:96008/1‑140 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1:340018/1‑140 (MQ=255) cGCATTCAGCCGTCGATATTTTTGTTAAGGTTCTTGGTCTGGTTGCCGATACAGCCAAAGCCCTGCACTTCCCGCTGCCATTGGCCTCAACAGCATTGAATATGTTCACCAGCGCCAGTAACGCGGGt < 1:803416/128‑1 (MQ=255) cGCATTCAGCCGTCGATATTTTTGTTAAGGTTCTTGGTCTGGTTGCCGATACAGCCAAAGCCCTGCACTTCCCGCTGCCATTGGCCTCAACAGCATTGAATATGTTCACCAGCGCCAGTAACGCGGGt > 2:803416/1‑128 (MQ=255) cGCATTCAGCCGTCGATATTTTTGTTAAGGTTCTTGGTCTGGTTGCCGATACAGCCAAAGCCCTGCACTTCCCGCTGCCATTGGCCTCAACAGCATTGAATATGTTCACCAGCGCCAGTAACGCGGGTTACGGGAaagaa > 1:972027/1‑140 (MQ=255) cATTCAGCCGTCGATATTTTTGTTAAGGTTCTTGGTCTGGTTGCCGATACAGCCAAAGCCCTGCACTTCCCGCTGCCATTGGCCTCAACAGCATTGAATATGTTCACCAGCGCCAGTAACGCGGGTTACGGGa > 1:1095667/1‑133 (MQ=255) cATTCAGCCGTCGATATTTTTGTTAAGGTTCTTGGTCTGGTTGCCGATACAGCCAAAGCCCTGCACTTCCCGCTGCCATTGGCCTCAACAGCATTGAATATGTTCACCAGCGCCAGTAACGCGGGTTACGGGa < 2:1095667/133‑1 (MQ=255) cATTCAGCCGTCGATATTTTTGTTAAGGTTCTTGGTCTGGTTGCCGATACAGCCAAAGCCCTGCACTTCCCGCTGCCATTGGCCTCAACAGCATTGAATATGTTCACCAGCGCCAGTAACGCGGGTTACGGGAAagaaga < 2:340018/140‑1 (MQ=255) tCAGCCGTCGATATTTTTGTTAAGGTTCTTGGTCTGGTTGCCGATACAGCCAAAGCCCTGCACTTCCCGCTGCCATTGGCCTCAACAGCATTGAATATGTTCACCAGCGCCAGTAACGCGGGTTACGGGAAAGAAGACGa < 1:266755/140‑1 (MQ=255) aGCCGTCGATATTTTTGTTAAGGTTCTTGGTCTGGTTGCCGATACAGCCAAAGCCCTGCACTTCCCGCTGCCATTGGCCTCAACAGCATTGAATATGTTCACCAGCGCCAGTAACGCGGGTTACGGGAAAGAAGACGATa < 2:133954/140‑1 (MQ=255) cGTCGATATTTTTGTTAAGGTTCTTGGTCTGGTTGCCGATACAGCCAAAGCCCTGCACTTCCCGCTGCCATTGGCCTCAACAGCATTGAATATGTTCACCAGCGCCAGTAACGCGGGTTACGGGAAAGAAGACGATAgcg < 1:341889/140‑1 (MQ=255) tCGATATTTTTGTTAAGGTTCTTGGTCTGGTTGCCGATACAGCCAAAGCCCTGCACTTCCCGCTGCCATTGGCCTCAACAGCATTGAATATGTTCACCAGCGCCAGTAACGCGGGTTACGGGAAAGAAGACGATAGCGCa > 1:1404379/1‑140 (MQ=255) gATATTTTTGTTAAGGTTCTTGGTCTGGTTGCCGATACAGCCAAAGCCCTGCACTTCCCGCTGCCATTGGCCTCAACAGCATTGAATATGTTCACCAGCGCCAGTAACGCGGGTTACGGGAAAGAAGACGATAGCGCAGt > 1:1399734/1‑140 (MQ=255) tttttGTTAAGGTTCTTGGTCTGGTTGCCGATACAGCCAAAGCCCTGCACTTCCCGCTGCCATTGGCCTCAACAGCATTGAATATGTTCACCAGCGCCAGTAACGCGGGTTACGGGAAAGAAGACGATAGCGCAGTTATc < 1:1354993/140‑1 (MQ=255) aGGTTCTTGGTCTGGTTGCCGATACAGCCAAAGCCCTGCACTTCCCGCTGCCATCGGCCTCAACAGCATTGAATATGTTCACCAGCGCCAGTAACGCGGGTTACGGGAAAGAAGACGATAGCGCAGTTATCAAGATTTtc < 1:799241/140‑1 (MQ=255) | CGCTGGATGTGATGTATGACGTCGTGACCAATGCCGCCGGAAATTCCTGGATGTTCGAAAACCGGATGCGTCATGTGGTGGATGGCGATTACACCCCGCATTCAGCCGTCGATATTTTTGTTAAGGATCTTGGTCTGGTTGCCGATACAGCCAAAGCCCTGCACTTCCCGCTGCCATTGGCCTCAACAGCATTGAATATGTTCACCAGCGCCAGTAACGCGGGTTACGGGAAAGAAGACGATAGCGCAGTTATCAAGATTTTC > NC_000913/2862043‑2862305 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |