| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,240,985 | 0 | T | G | 26.3% | 160.9 / 28.1 | 76 | S348A (TCT→GCT) | sstT | serine/threonine:Na(+) symporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (13/43); new base G (20/0); total (33/43) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.26e-10 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
GGGCGCAGCAATCACTATTACCGTGTTGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GG‑GGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCTTTATCATCGGCGTATTGCAGGACTCTTGCGAAACCGCGCTGAACTCTTCAACTGAC > NC_000913/3240846‑3241119 | gggcgCAGCAATCACTATTACCGTGTTGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GG‑GGGGGt < 1:1627898/140‑1 (MQ=255) cagcaATCACTATTACCGTGTTGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GG‑GGGGGTCTctg < 1:1070740/140‑1 (MQ=255) agcaATCACTATTACCGTGTTGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GG‑GGGGGTCTctgc < 1:1352092/140‑1 (MQ=255) agcaATCACTATTACCGTGTTGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GG‑GGGGGGCTctgc > 2:624682/1‑140 (MQ=255) cACTATTACCGTGTTGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GG‑GGGGGTCTCTGCTGCTGa < 1:1082627/140‑1 (MQ=255) cACTATTACCGTGTTGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GG‑GGGGGTCTCTGCTGCTGa < 1:1367534/140‑1 (MQ=255) ttACCGTGTTGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GG‑GGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCa < 2:1631619/140‑1 (MQ=255) ttACCGTGTTGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GG‑GGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCa < 2:1605358/140‑1 (MQ=255) aCCGTGTTGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GG‑GGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACt < 1:1102668/140‑1 (MQ=255) aCCGTGTTGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GG‑GGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACt < 1:344405/140‑1 (MQ=255) ccGTGTTGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GG‑GGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCa < 2:1397033/137‑1 (MQ=255) ccGTGTTGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GG‑GGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTg > 2:1151595/1‑140 (MQ=255) ccGTGTTGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GG‑GGGGGGCTCTGCTGCTGATCCCa > 1:1397033/1‑137 (MQ=255) cGTGTTGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GG‑GGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTgg > 1:848595/1‑140 (MQ=255) cGTGTTGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GG‑GGGGGGCTCTGCTGCTGATCCCACTgg > 1:998522/1‑140 (MQ=255) gtgtTGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GG‑GGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCa < 2:848628/135‑1 (MQ=255) gtgtTGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GG‑GGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGc < 1:1012258/140‑1 (MQ=255) gtgtTGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GG‑GGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGc < 1:688468/140‑1 (MQ=255) gtgtTGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GG‑GGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGc < 1:1575947/140‑1 (MQ=255) gtgtTGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GG‑GGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGc < 2:584864/140‑1 (MQ=255) gtgtTGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GG‑GGGGGGGTCTTTTGTTGATCCCACTCGc > 2:1575947/1‑140 (MQ=255) gtgtTGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GG‑GGGGGGCTCTGCTGCTGATCCCa > 1:848628/1‑135 (MQ=255) tgtTGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GG‑GGGGGGCTCTGCTGCTGATCCCACTGGcc > 1:1115560/1‑140 (MQ=255) gtTGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GG‑GGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCt < 2:998522/140‑1 (MQ=255) ttGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GG‑GGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCa > 1:1166245/1‑132 (MQ=255) ttGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GG‑GGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCa < 2:1166245/132‑1 (MQ=255) ttGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GG‑GGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCt < 2:1628631/139‑1 (MQ=255) ttGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GG‑GGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTg > 2:596042/1‑140 (MQ=255) ttGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GG‑GGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTg > 2:511130/1‑140 (MQ=255) ttGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GG‑GGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTg > 1:155256/1‑140 (MQ=255) ttGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GG‑GGGGGGCTCTGCTGCTGATCCCCCTGGcccg > 2:32967/1‑138 (MQ=255) ttGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GG‑GGGGGGCTCTGCTGCTGATCCCCCTGGCCTg > 2:1595577/1‑140 (MQ=255) ttGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GG‑GGGGGGCTCTGCTGCTGATCCCCCTGGCCTg > 2:1404826/1‑140 (MQ=255) ttGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GG‑GGGGGGCTCTGCTGCTGATCCCCCCGGCCTg > 2:191845/1‑140 (MQ=255) ttGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GG‑GGGGGGCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCt > 1:1628631/1‑139 (MQ=255) cGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GG‑GGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAat < 2:848595/140‑1 (MQ=255) gctgCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GG‑GGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGtt < 1:530850/140‑1 (MQ=255) gctgCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GG‑GGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGtt < 1:624682/140‑1 (MQ=255) ctgCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GG‑GGGGGGCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTc > 1:154831/1‑140 (MQ=255) tgCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGCGGG‑GGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTc < 1:1286946/140‑1 (MQ=255) aTACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GG‑GGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCg < 1:394144/140‑1 (MQ=255) tGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GG‑GGGGGGCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGGATTTCGAACGat > 2:1106174/1‑140 (MQ=255) gggTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCATGGC‑GG‑GGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCg > 1:1160853/1‑133 (MQ=255) gggTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCATGGC‑GG‑GGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCg < 2:1160853/133‑1 (MQ=255) ggTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GG‑GGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGatat < 1:32967/140‑1 (MQ=255) ggTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GG‑GGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGatat < 1:353519/140‑1 (MQ=255) tATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GG‑GGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCg < 2:154831/140‑1 (MQ=255) ttCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GG‑GGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGcc < 1:191845/140‑1 (MQ=255) ggTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GG‑GGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGc < 2:852789/140‑1 (MQ=255) tCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGTGGGGGTC‑CTCCTGCTGATCCCACTAGCCCCTAATTTGTTCGGGATTTCGAAAGACATAGCCAAGcca > 2:353519/1‑138 (MQ=255) tCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GG‑GGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAg > 1:1606328/1‑140 (MQ=255) tCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GG‑GGGGGGCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAg > 1:1197461/1‑140 (MQ=255) tCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GG‑GGGGGGCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAg > 1:1299289/1‑140 (MQ=255) tCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GG‑GGGGGGCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAg > 2:835877/1‑140 (MQ=255) ccACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GG‑GGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGcc < 1:135018/140‑1 (MQ=255) ccACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GG‑GGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATG‑TCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCg < 2:96489/140‑1 (MQ=255) gctgctGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GG‑GGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCt < 1:596042/140‑1 (MQ=255) ttGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GG‑GGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCTTTatcat < 1:1151595/140‑1 (MQ=255) ttGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GG‑GGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCTTTatcat < 2:1197461/140‑1 (MQ=255) cGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GG‑GGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCTTTATCATCGGCg < 1:1239852/140‑1 (MQ=255) cGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GG‑GGGGGGCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATTGCCCTGCAGGGGGTTGCCGTCGGCTTTATCATCGGCg > 2:290527/1‑140 (MQ=255) tggtggCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GG‑GGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCTTTATCATCGGCGTa < 1:511130/140‑1 (MQ=255) tggtggCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GG‑GGGGGGCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGGTGCCGTCGGCTTTATCATCGGCGTa > 1:1348826/1‑140 (MQ=255) cTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GG‑GGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCTTTATCATCGGCGTATTGCAg > 1:1515175/1‑140 (MQ=255) tctcTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GG‑GGGGGGCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCTTTATCATCGGCGTATTGCAGGa > 1:608556/1‑140 (MQ=255) gtgtgCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GG‑GGGGGGCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGGATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCTTTATCATCGGCGTATTGCAGGACTCtt > 1:1302405/1‑140 (MQ=255) gtgCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GG‑GGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTTGCCTGTTATATGTTCGGGATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCCTCGGCTTTATCATCGGCGTAATGGAGGACTCTTGc > 2:260663/1‑140 (MQ=255) ccTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GG‑GGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCTTTATCATCGGCGTATTGCAGGACTCTTGCGaa > 1:1147044/1‑140 (MQ=255) ccTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GG‑GGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGGATTTTGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCTTTATCATCGGCGTATTGCAGGACTCTTGCGaa > 2:1423076/1‑140 (MQ=255) cTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GG‑GGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCTTTATCATCGGCGTATTGCAGGACTCTTGCGaaa < 2:1515175/140‑1 (MQ=255) cTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GG‑GGGGGGCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCTTTATCATCGGCGTATTGCAGGACTCTTGCGaaa > 1:1584662/1‑140 (MQ=255) tgGCGCATCCGGCGTGGC‑GG‑GGGGGGCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGGATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGGGGGTGCCGTCGGCTTTTTCATCGGCGGATTGCAGGACTCTTGCGAAAccc > 2:549546/1‑139 (MQ=255) gcgcATCCGGCGTGGC‑GG‑GGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCTTTATCATCGGCGTATTGCAGGACTCTTg < 2:1312819/130‑1 (MQ=255) gcgcATCCGGCGTGGC‑GG‑GGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCTTTATCATCGGCGTATTGCAGGACTCTTg > 1:1312819/1‑130 (MQ=255) cATCCGGCGTGGC‑GG‑GGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCTTTATCATCGGCGTATTGCAGGACTCTTGCGAAACCGCGCTg < 2:1606328/140‑1 (MQ=255) cATCCGGCGTGGC‑GG‑GGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCTTTATCATCGGCGTATTGCAGGACTCTTGCGAAACCGCGCTg < 1:1629863/140‑1 (MQ=255) cATCCGGCGTGGC‑GG‑GGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCTTTATCATCGGCGTATTGCAGGACTCTTGCGAAACCGCGCTg < 2:1374172/140‑1 (MQ=255) tGGC‑GG‑GGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCTTTATCATCGGCGTATTGCAGGACTCTTGCGAAACCGCGCTGAACTCTTCa < 2:155256/140‑1 (MQ=255) gC‑GG‑GGGGGGCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCTTTATCATCGGCGTATTGCAGGACTCTTGCGAAACCGCGCTGAACTCTTCAAc > 2:1419364/1‑140 (MQ=255) gg‑gggggTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCTTTATCATCGGCGTATTGCAGGACTCTTGCGAAACCGCGCTGAACTCTTCAACTg < 2:1147044/140‑1 (MQ=255) gggggTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCTTTATCATCGGCGTATTGCAGGACTCTTGCGAAACCGCGCTGAACTCTTCAACTGAc < 2:1115560/140‑1 (MQ=255) | GGGCGCAGCAATCACTATTACCGTGTTGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GG‑GGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCTTTATCATCGGCGTATTGCAGGACTCTTGCGAAACCGCGCTGAACTCTTCAACTGAC > NC_000913/3240846‑3241119 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |