| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,111,752 | 0 | T | C | 23.2% | 167.6 / 11.5 | 82 | K155E (AAA→GAA) | yiiQ | DUF1454 domain‑containing protein YiiQ |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (50/13); new base C (0/19); total (50/32) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.76e-10 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
TCATTTATTCAAACCTTCAAGCGATTCAGATAGCGCCAGCTTAATCGGTTC‑AACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTT‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCA‑‑TTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCTTTTTGCTCTGGCCCCTGGATGGGTAGC > NC_000913/4111615‑4111891 | ttaTTTATTAAACCTTTCAAGCGATTAAGATCGCGCCAGCTTAATCGGTTC‑AACAGGGAAGGCCCCCCCTTTTC‑CCCCGTTGCCCGCGACAACATACCGAAGTGCCCCTTCTGTCTGGGTGAAATAAC‑TTTTTTTTT‑ccc < 2:403869/138‑1 (MQ=255)tcttttATTCAACCCTTCAAGCGTTTCAGATAGCGCCAGCTTAATCGGTTA‑AACAGCGAAGGCCCGCCCTTTTT‑CCCGGTTGCCCGCAACAACATACCGCGGTGCCCTTTCTGTCTGGGTGTAATACTTTTTTTTTTT‑cc < 2:1401560/137‑1 (MQ=255) aTTTATTCAACCCTACAAGCGTTTAAAATAGCGCCAGTTTAATGGGTCA‑AACAGCGAAGGCCACCCCTTTTC‑CGCCGTTGCCCGCGACAACATAACGCAGTCCCCCTTCTGTCTGGGTTTAAAAATTTTTTTTTTC‑cccc < 2:907700/140‑1 (MQ=255) tttATTCAAACCTTCAAGCGATTCAGATAGCGCCAGCTTAATCGGTTC‑AACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTT‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTT‑CCccg > 1:656032/1‑140 (MQ=255) aCCTTCAAGCGATTCAGATAGCGCCAGCTTAATCGGTTC‑AACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTT‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTT‑CCCCGCCGTtagta > 2:428721/1‑140 (MQ=255) aCCTTCAAGCGATTCAGATAGCGCCAGCTTAATCGGTTC‑AACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTT‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTT‑CCCCGCCGTtagta > 1:937532/1‑140 (MQ=255) ttCAAGCGATTCAGATAGCGCCAGCTTAATCGGTTC‑AACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTT‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGct > 1:907700/1‑139 (MQ=255) tCAAGCGATTCAGATAGCGCCAGCTTAATCGGTTC‑AACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTT‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGa > 1:1251605/1‑140 (MQ=255) cAAGCGATTCAGATAGCGCCAGCTTAATCGGTTC‑AACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTT‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGAc > 1:892515/1‑140 (MQ=255) gCGATTCAGATAGCGCCAGCTTAATCGGTTC‑AACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTT‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCgctgtc > 1:2239062/1‑135 (MQ=255) aagcttCAGATGGCGCCATTTAAAGTGGTTA‑ACCAGCAAATGTCCGCCCTTTTT‑CGCGGTTGTGCGCAAAAACATACCGCGGTGCACCTTCTGTCTGGGTTTAATAACTTTTTTTTCC‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGc < 2:1173663/136‑1 (MQ=255) ttCAGATAGCGCCAGCTTAATCGGTTC‑AACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTT‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGtt > 1:1547310/1‑140 (MQ=255) gcCAGCTTAATCGGTTC‑AACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTT‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTgctg > 1:1173663/1‑137 (MQ=255) gcCAGCTTAATCGGTTC‑AACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTT‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCt > 2:990623/1‑140 (MQ=255) gcCAGCTTAATCGGTTC‑AACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTT‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCt > 1:1498447/1‑140 (MQ=255) gcCAGCTTAATCGGTTC‑AACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTT‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCt > 2:147417/1‑140 (MQ=255) gCTTAATCGGTTC‑AACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTT‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTtgt > 1:2060576/1‑140 (MQ=255) tttAATCGGTCC‑AACAGCGAGGGCCCCCCCCTTTC‑CCCCGTTGTCCGCGACAACATACCGCAGTGCCCCTTCTGTCTGGGTGTAATAACTTTTTTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTtgtg < 2:1498447/139‑1 (MQ=255) cTTAATCGGTTC‑AACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTT‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTtgtg > 1:1449268/1‑140 (MQ=255) aTCGGTTC‑AACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTT‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGtttt > 1:1774124/1‑140 (MQ=255) tggTTCAAACAGCGACGGTCACCCCTTTTT‑CGCTTTTGCCCGCAAAAACATAACCCGGTCCTCCTTGTGTTGCGGGGTAA‑AACTTTTTTTTTTCCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTg < 2:1774124/139‑1 (MQ=255) ggTTC‑AACAGCGAAGGCCCCCCCTTTTT‑CGCCGTTGCCCGCAACAACATACCGCAGTGCCCCTTCTGTCTGGGTGTAATACCTTTTTTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGt < 2:647576/140‑1 (MQ=255) ttC‑AACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTT‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCa > 1:1442675/1‑140 (MQ=255) ttC‑AACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTT‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCa > 1:740610/1‑140 (MQ=255) tC‑AACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTT‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATACCGTTTGCTATT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCA‑‑t > 2:1335230/1‑140 (MQ=255) tC‑AACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTT‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCA‑‑t > 2:728144/1‑140 (MQ=255) tC‑AACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTT‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCA‑‑t > 1:1037271/1‑140 (MQ=255) tC‑AACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTT‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCA‑‑t > 1:651540/1‑140 (MQ=255) aCAGCGAAGGTCCCCCCCTTTC‑CGCCGTTGCCCGCGACAACATAACGCAGTCCCCCTCCTGTCGCGGTGAAATAACTTTTTTTTTC‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCA‑‑TTaa < 2:187860/140‑1 (MQ=255) agggTCAGCCCTTTTT‑CGCTGTTGCCCGCGACAATATAACGCAGGCCCCCTTTTGTCTCGGTAAAATAGGGTTTTTTTTC‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCA‑‑TTAATGGGGt < 2:2293802/138‑1 (MQ=255) aaGGTCCCCCCTTTTC‑CGCCGTTGTCCGCAACAACATACCGCAGTGCCCTTTCTGTCTGGGTGTAATAATTTTTTTTTTC‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCA‑‑TTAATGGGGt < 2:2175182/140‑1 (MQ=255) aaGGTCCCCCCCTTTT‑CGCCGTTGCCCGCGACAACATAACGCGGTGCCCCTTCTGTCTGGGTGTAATATTTTTTTTTTTC‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCA‑‑TTAATGGGGt < 2:2025895/140‑1 (MQ=255) aaGGTCAGCCCCTTTT‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCA‑‑TTAATGGGGt > 1:1574992/1‑140 (MQ=255) aaGGTCAGCCCCTTTT‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCA‑‑TTAATGGGGt > 1:1525410/1‑140 (MQ=255) aaGGTCAGCCCCTTTT‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCA‑‑TTAATGGGGt > 1:1063916/1‑140 (MQ=255) aaGGCCACCCCTTTTT‑CGCCGTTGCCCGCAACAACATAACGCGGTCCACCTTCTGTCTCGGTGTAATATCTTTTTTTTTC‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCA‑‑TTAATGGGGt < 2:960516/140‑1 (MQ=255) aaggcctccccTTTTCCGCCGTTCTCCGCGAAAACATAACGCGGTGCTCCTTTTGTCTGGGTATAATAACTTTTTTTTTC‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCA‑‑TTAATGGGGt < 2:1063916/133‑1 (MQ=255) ggtcctccctTTTT‑CCCCTTTGCCCGCGACAACATACCGCAGTGCCCCTTCTGTCTGGGTGTAATATCTTTTTTTTTC‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCA‑‑TTAATGGGGTGa < 2:345304/134‑1 (MQ=255) ggcccccccTTTTCCGCTTTTGCCCGCAAAAACATAACGCAGTCCCCTTTCTGTCTGGGTGTAATATTTTTTTTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCA‑‑TTAATGGGGTGa < 2:937532/135‑1 (MQ=255) cAGCCCCTTTT‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCA‑‑TTAATGGGGTGAgtg > 1:2293802/1‑140 (MQ=255) cAGCCCCTTTT‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCA‑‑TTAATGGGGTGAgtg > 1:2175182/1‑140 (MQ=255) ccccTTTT‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCA‑‑TTAATGGGGTGAGTGTGc > 1:1892640/1‑140 (MQ=255) ttt‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCA‑‑TTAATGGGGTGAGTGTGCGGATc > 2:159024/1‑140 (MQ=255) t‑CGCCTTTGCCCGCGACAACATAACGCGGTCCCCCTTCTGTCTGGGTTAAATATCTTTTTTTTTC‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCA‑‑TTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCAc < 2:1892640/140‑1 (MQ=255) t‑CGCCGTTGCCCGCGACAACATAACGCAGTGCCCCTTCTGTCTCGGTGAAATAACTTTTTTTTTC‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCA‑‑TTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCAc < 1:1912899/140‑1 (MQ=255) gCCGTTGCCCGCAACAACATAACGCAGTGCCCCTTCTGTCTGGGTGTAATAATTTTTTTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCA‑‑TTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCg < 2:740610/140‑1 (MQ=255) cccGTTGCCCACGAAAAAATAACGTGGTCCCTCTTGTTTCGGGGTATAAAAATTTTTTTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCA‑‑TTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCg < 2:1925739/139‑1 (MQ=255) ctgTTGCCCGCGACAACATACCGCAGTCCCCTTTTTGTCTGGTTTTAATAGTTTTTTTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCA‑‑TTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGc < 2:1574992/138‑1 (MQ=255) ccGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCA‑‑TTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGc > 1:1705739/1‑140 (MQ=255) ccGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCA‑‑TTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGc > 1:2284609/1‑140 (MQ=255) ccGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCA‑‑TTAATGGGGAGAGTGTGCGGATCACCGc > 1:987020/1‑140 (MQ=255) cGTTGTCCGCAAAAACATACCGCGGTGCCCCTTCTGTCTGGGTATAATAACTTTTTTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCA‑‑TTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCt < 2:2060576/140‑1 (MQ=255) cGTTGCCCGCGAAAACAAAACGCGGTCCCCTTTCTGCCTGGGTGTAATAACTTTTTTTTTC‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCA‑‑TTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCt < 2:1525410/140‑1 (MQ=255) gttccccGCAAAAACAAAACGCCGCGCTCTTTCTGTCTGGGTTAAATAATTTTTTTTTTC‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCA‑‑TTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTg < 2:1063377/135‑1 (MQ=255) gTTGCCCGCGAAAAAATAACGCAGTGCCCCTTCTGTCTGGGTGTAATATCTTTTTTTTTC‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCA‑‑TTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTg < 1:147417/140‑1 (MQ=255) ttGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCA‑‑TTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGc > 1:2041507/1‑140 (MQ=255) tGTCCGCAACAACATAACGCAGTGCCCTTTCTGCTTGGGTGTAATAATTTTTTTTTTC‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCA‑‑TTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGcc < 2:651540/140‑1 (MQ=255) cggcaaaaacaTAACGCAGTGCCCTTTCTGTCTCGGTGTAATACTTTTTGTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCA‑‑TTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATg < 1:529317/133‑1 (MQ=255) ccGCGACAACATAACGCAGTGCCCCTTCTGTCTGGTTGTAATAATTTTTTTTTTC‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCA‑‑TTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATg < 2:1442675/140‑1 (MQ=255) aGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCA‑‑TTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAgctttcgc > 1:1082227/1‑140 (MQ=255) tGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCA‑‑TTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCTCTGCCATGTATTCCTGAgctttcgctt > 1:1205831/1‑140 (MQ=255) tGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCA‑‑TTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAgctttcgctt > 1:1917624/1‑140 (MQ=255) tGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCA‑‑TTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAgctttcgctt > 2:2019988/1‑140 (MQ=255) gCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGAGTTTTGGTCA‑‑TTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAgctttcgcttt > 1:1109948/1‑140 (MQ=255) tCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCA‑‑TTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGc > 1:288017/1‑140 (MQ=255) cTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTTTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCgg > 1:1680077/1‑140 (MQ=255) gTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCA‑‑TTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCttt > 2:62097/1‑140 (MQ=255) gTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCA‑‑TTAATGGGGTGAGTGGGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCttt > 1:1564559/1‑140 (MQ=255) ctcGGTGTAATAACGTTTGTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCA‑‑TTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCttttt > 1:2122722/1‑140 (MQ=255) gtgtAATAACTTTTTTTTTC‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCA‑‑TTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCTTTTTGctc < 2:892515/140‑1 (MQ=255) gtgtAATAACGTTTGTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCA‑‑TTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCTTTTTGctc < 1:159024/140‑1 (MQ=255) gtgtAATAACGTTTGTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCA‑‑TTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCTTTTTGctc > 2:56345/1‑140 (MQ=255) tgtAATATCTTTTTTTTTC‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGATTTGTGTTTTGGTCA‑‑TTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCTTTTTGctct < 2:1051750/140‑1 (MQ=255) tgtAATAACGTTTTTTTTC‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCA‑‑TTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCTTTTTGctct < 1:175678/140‑1 (MQ=255) aatacttttttttttC‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCA‑‑TTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCTTTTTGCTCTGGc < 2:1037271/133‑1 (MQ=255) aataaCGTTTTTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCA‑‑TTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCTTTTTGCTCTGGc < 1:62097/140‑1 (MQ=255) ttttttttttC‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCA‑‑TTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCTTTTTGCTCTGGCCCCTg < 2:1992881/138‑1 (MQ=255) ttttttttttC‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCA‑‑TTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCTTTTTGCTCTGGCCCCTg < 2:1705739/138‑1 (MQ=255) cGTTTGTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCA‑‑TTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCTTTTTGCTCTGGCCCCTg > 2:597773/1‑140 (MQ=255) cGTTTGTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCA‑‑TTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCACTTTCGCGGCTTTTTGCTCTGGCCCCTg < 1:990623/140‑1 (MQ=255) cGTTTGTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGATTTGTGTTTTGGTCA‑‑TTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCTTTTTGCTCTGGCCCCTg > 1:1051750/1‑140 (MQ=255) tttgtttTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCA‑‑TTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCttt < 2:1216298/123‑1 (MQ=255) tttgtttTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCA‑‑TTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCttt > 1:1216298/1‑123 (MQ=255) tttgtttTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCA‑‑TTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCTTTTTGCTCTGGCCCCTGGa > 2:1518168/1‑140 (MQ=255) tttgtttTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCA‑‑TTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCTTTTTGCTCTGGCCCCTGGa > 1:77576/1‑140 (MQ=255) tttgtttTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCA‑‑TTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCTTTTTGCTCTGGCCCCTGGa > 1:1886932/1‑140 (MQ=255) tgtttTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCA‑‑TTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCTTTTTGCTCTGGc > 2:1793308/1‑131 (MQ=255) tgtttTC‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCA‑‑TTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCTTTTTGCTCTGGc < 1:1793308/131‑1 (MQ=255) ttttt‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCA‑‑TTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCTTTTTGCTCTGGCCCCTGGATggg < 2:2122722/140‑1 (MQ=255) t‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCA‑‑TTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCTTTTTGCTCTGGCCCCTGGATGGGTAGc < 2:1886932/140‑1 (MQ=255) | TCATTTATTCAAACCTTCAAGCGATTCAGATAGCGCCAGCTTAATCGGTTC‑AACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTT‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTT‑CCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCA‑‑TTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCTTTTTGCTCTGGCCCCTGGATGGGTAGC > NC_000913/4111615‑4111891 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |