Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
JC JC | NC_000913 | 4,543,608 | Δ1 bp :: IS186 (–) +6 bp :: Δ1 bp | coding (494‑499/549 nt) | fimA → | type 1 fimbriae major subunit |
New junction evidence | |||||||||||
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* | ? | NC_000913 | 2514274 = | NA (NA) | 221 (1.320) | 91/270 | 0.1 | 100% | noncoding (2/1345 nt) | IS186 | repeat region |
? | NC_000913 | 4543608 = | 0 (0.000) | coding (494/549 nt) | fimA | type 1 fimbriae major subunit | |||||
* | ? | NC_000913 | = 2515616 | NA (NA) | 195 (1.160) | 89/270 | 0.2 | 100% | noncoding (1344/1345 nt) | IS186 | repeat region |
? | NC_000913 | = 4543613 | 0 (0.000) | coding (499/549 nt) | fimA | type 1 fimbriae major subunit |
Only 100 of 203 total aligned reads displayed.
TGGAGCTTACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/2515475‑2515616 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gggTTGCGGCCCCGGTTGCAAAATAACGCGCCTGGAACGGAAT‑GGTATTGGTTCCGTTATTCAGGGTTGTTTCTGAACTAAATGTCGCACCATCCAGCGTCAGCGCAGCACCCGTTCTGTCCAGGATCTGCACACCAAC < NC_000913/4543613‑4543478 TGGAGCTTACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATG < 1:2397379/140‑1 TGGAGCTTACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATG > 1:2609787/1‑140 TGGAGCTTACAGGTGGCCATTCATGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATG < 2:2643760/140‑1 AGCTTACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGT < 2:350370/140‑1 CAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGCGGC > 1:530619/1‑140 AGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGCGGCC < 2:2105661/140‑1 GTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGCGGCCCC < 1:2792792/140‑1 GTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGCGGCCCC > 2:2792792/1‑140 GTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGCGGCCCC < 2:2536231/140‑1 GGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGCGGCCCCGG < 2:2818233/140‑1 GCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGCGGCCCCGGT > 1:1134417/1‑140 GCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGCGGCCCCGGT > 1:2429335/1‑140 GCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGCGGCCCCGGT > 2:2206663/1‑140 TCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGCGGCCCCGGTTGCAA < 1:178571/140‑1 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TATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGCGGCCCCGGTTGCAAAATAACGCGCC < 2:709398/140‑1 TATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGCGGCCCCGGTTGCAAAATAACGCGCC < 1:1019101/140‑1 CTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGCGGCCCCGGTTGCAAAATAACGCGCCTGGAA < 1:1648535/140‑1 CTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGCGGCCCCGGTTGCAAAATAACGCGCCTGGAA < 2:1199228/140‑1 GACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGCGGCCCCGGTTGCAAAATAACGCGCCTGGAACG < 2:90500/140‑1 GACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGCGGCCCCGGTTGCAAAATAACGCGCCTGGAACG < 1:229938/140‑1 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TCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGCGGCCCCGGTTGCAAAATAACGCGCCTGGAACGGAAT‑GGTATTGGTTCCGTTATTCAGGGTTGTTTCTGAACTAAATGTCGCACCATCCAGCGTCAGCGCAGCACCCGTTC < 2:2631276/140‑1 TCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGCGGCCCCGGTTGCAAAATAACGCGCCTGGAACGGAAT‑GGTATTGGTTCCGTTATTCAGGGTTGTTTCTGAACTAAATGTCGCACCATCCAGCGTCAGCGCAGCAC < 1:46189/134‑1 TCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGCGGCCCCGGTTGCAAAATAACGCGCCTGGAACGGAAT‑GGTATTGGTTCCGTTATTCAGGGTTGTTTCTGAACTAAATGTCGCACCATCCAGCGTCAGCGCAGCAC > 2:46189/1‑134 TCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGCGGCCCCGGTTGCAAAATAACGCGCCTGGAACGGAAT‑GGTATTGGTTCCGTTATTCAGGGTTGTTTCTGAACTAAATGTCGCACCATCCAGCGTCAGCGC > 1:1993482/1‑129 TCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGCGGCCCCGGTTGCAAAATAACGCGCCTGGAACGGAAT‑GGTATTGGTTCCGTTATTCAGGGTTGTTTCTGAACTAAATGTCACACCATCCAGCGTCAGCGCAGCACCCGTTC < 2:2509049/140‑1 CCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGCGGCCCCGGTTGCAAAATAACGCGCCTGGAACGGAAT‑GGTATTGGTTCCGTTATTCAGGGTTGTTTCTGAACTAAATGTCGCACCATCCAGCGTCAGCGCAGCACCCGTTCTGTC < 2:1462354/140‑1 TAAGTTAGCGCTTATGGGTTGCGGCCCCGGTTGCAAAATAACGCGCCTGGAACGGAAT‑GGTATTGGTTCCGTTATTCAGGGTTGTTTCTGAACTAAATGTCGCACCATCCAGCGTCAGCGCAGCACCCGTTCTGTCCAGG < 2:85980/140‑1 TAAGTTAGCGCTTATGGGTTGCGGCCCCGGTTGCAAAATAACGCGCCTGGAACGGAAT‑GATATTGGTTCCATTATTCAGGGTTGTTTCTGAACTAAATGTCGCACCATCCAGCGTCAGCGCAGCACCCGTTCTGTCCAGG < 1:944633/140‑1 AGTTAGCGCTTATGGGTTGCGGCCCCGGTTGCAAAATAACGCGCCTGGAACGGAAT‑GGTATTGGTTCCGTTATTCAGGGTTGTTTCTGAACTAAATGTCGCACCATCCAGCGTCAGCGCAGCACCCGTTCTGTCCAGGAT < 1:1975017/140‑1 AGCGCTTATGGGTTGCGGCCCCGGTTGCAAAATAACGCGCCTGGAACGGAAT‑GGTATTGGTTCCGTTATTCAGGGTTGTTTCTGAACTAAATGTCGCACCATCCAGCGTCAGCGCAGCACCCGTTCTGTCCAGGATCTGC > 1:613110/1‑140 AGCGCTTATGGGTTGCGGCCCCGGTTGCAAAATAACGCGCCTGGAACGGAAT‑GGTATTGGTTCCGTTATTCAGGGTTGTTTCTGAACTAAATGTCGCACCATCCAGCGTCAGCGCAGCACCCGTTCTGTCCAGGATCTGC > 2:2380046/1‑140 AGCGCTTATGGGTTGCGGCCCCGGTTGCAAAATAACGCGCCTGGAACGGAAT‑GGTATTGGTTCCGTTATTCAGGGTTGTTTCTGAACTAAATGTCGCACCATCCAGCGTCAGCGCAGCACCCGTTCTGTCCAGGATCTGC > 1:1558540/1‑140 AGCGCTTATGGGTTGCGGCCCCGGTTGCAAAATAACGCGCCTGGAACGGAAT‑GGTATTGGTTCCGTTATTCAGGGTTGTTTCTGAACTAAATGTCGCACCATCCAGCGTCAGCGCAGCACCCGTTC < 2:2613857/126‑1 AGCGCTTATGGGTTGCGGCCCCGGTTGCAAAATAACGCACCTGGAACGGAAT‑GGTATTGGTTCCGTTATTCAGGGTTGTTTCTGAACTAAATGTCGCACCATCCAGCGTCAGCGCAGCACCCGTT > 1:578486/1‑125 GCGCTTATGGGTTGCGGCCCCGGTTGCAAAATAACGCGCCTGGAACGGAAT‑GGTATTGGTTCCGTTATTCAGGGTTGTTTCTGAACTAAATGTCGCACCATCCAGCGTCAGCGCAGCACCCGTTCTGTCCAGGATCTGCA < 2:2051520/140‑1 GCGCTTATGGGTTGCGGCCCCGGTTGCAAAATAACGCGCCTGGAACGGAAT‑GGTATTGGTTCCGTTATTCAGGGTTGTTTCTGAACTAAATGTCGCACCATCCAGCGTCAGCGCAGCACCCGTTCTGTCCAGGATCTGCA > 2:2644988/1‑140 GCGCTTATGGGTTGCGGCCCCGGTTGCAAAATAACGCGCCTGGAACGGAAT‑GGTATTGGTTCCGTTATTCAGGGTTGTTTCTGAACTAAATGTCGCACCATCCAGCGTCAGCGCAGCACCCGTTCTGTCCAGGATCTGCA < 2:2674346/140‑1 CGCTTATGGGTTGCGGCCCCGGTTGCAAAATAACGCGCCTGGAACGGAATGGGTATTGGTTCCGTTATTCAGGGTTGTTTCTGAACTAAATGTCGCACCATCCAGCGTCAGCGCAGCACCCGTTCTGTCCAGGATCTGCA > 2:1392870/1‑140 GCTTATGGGTTGCGGCCCCGGTTGCAAAATAACGCGCCTGGAACGGAAT‑GGTATTGGTTCCGTTATTCAGGGTTGTTTCTGAACTAAATGTCGCACCATCCAGCGTCAGCGCAGCACCCGTTCTGTCCAGGATCTGCACA < 2:1908313/140‑1 TTATGGGTTGCGGCCCCGGTTGCAAAATAACGCGCCTGGAACGGAAT‑GGTATTGGTTCCGTTATTCAGGGTTGTTTCTGAACTAAATGTCGCACCATCCAGCGTCAGCGCAGCACCCGTTCTGTCCAGGATCTGCACACC < 2:31324/140‑1 TGGAGCTTACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/2515475‑2515616 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gggTTGCGGCCCCGGTTGCAAAATAACGCGCCTGGAACGGAAT‑GGTATTGGTTCCGTTATTCAGGGTTGTTTCTGAACTAAATGTCGCACCATCCAGCGTCAGCGCAGCACCCGTTCTGTCCAGGATCTGCACACCAAC < NC_000913/4543613‑4543478 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |