| New junction evidence | |||||||||||
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| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 135 total aligned reads displayed.
TACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCG‑CATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTA‑GCGCTTATGGGAT‑CACTCCCCGCCGTTGCTCTTACTCGGATTCGTAAGCCGTGAAAACAGCAACCTCCGTCTGGCCAGTTCGGATGTGAACCTCACAGAGGTCTTTTCTCGTTACCAGCGCCGCCACTACGGCGGTGATACAGATGACGAT > NC_000913/16596‑16870 | cAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCG‑CATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTA‑GCGCTTATGGGAT‑CACTc > 1:2891658/1‑140 (MQ=33) gggggCCTTTCGTGGGACAGTACCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGCCG‑CATTCTTCAGATGGTTCACCCCTTAAGTTA‑GCGTTTATGGGAt‑ccctccc < 2:677766/137‑1 (MQ=11) gTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCG‑CATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTA‑GCGCTTATGGGAT‑c < 2:103130/133‑1 (MQ=11) gTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCG‑CATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTA‑GCGCTTATGGGAT‑c > 1:103130/1‑133 (MQ=11) 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1:721323/140‑1 (MQ=255) tCG‑CATTCTTCACATGGTTCAACCCTTAAGTTA‑GCGCTTATGGGAT‑CACTCCCCGCCGTTGCTCTTACTCGGATTCGTAAGCCGTGAAAACAGCAACCTCCGTCTGGCCAGTTCGGATGTGAACCTCACAGAGGTCtttt < 1:1501581/140‑1 (MQ=255) agttgTTCCACCCTTAAATTAGGCGTTTAGGGAAC‑CCCCCCCCGCCGTTGCTCTTACTCGGATTCGTAAGCCGTGAAAACAGCACCCTCCGTCTGGCCAGTTCGGATGTGAACCTCACAGAGGTCTTTTCTCGTTACCAg < 1:822783/136‑1 (MQ=255) aTGGTTCAACCCTTAAGTTA‑GCGCTTATGGGAT‑CACTCCCCGCCGTTGCTCTTACTCGGATTCGTAAGCCGTGAAAACAGCAACCTCCGTCTGGCCAGTTCGGATGTGAACCTCACAGAGGTCTTTTCTCGTTACCAgcg > 1:1887086/1‑140 (MQ=255) gTTCAACCCTTAAGTTA‑GCGCTTATGGGAT‑CACTCCCCGCCGTTGCTCTTACTCGGATTCGTAAGCCGTGAAAACAGCAACCTCCGTCTGGCCAGTTCGGATGTGAACCTCACAGAGGTCTTTTCTCGTTACCAGcgccg > 1:629365/1‑140 (MQ=255) tCAACCCTTAAGTTA‑GCGCTTATGGGAT‑CACTCCCCGCCGTTGCTCTTACTCGGATTCGTAAGCCGTGAAAACAGCAACCTCCGTCTGGCCAGTTCGGATGTGAACCTCACAGAGGTCTTTTCTCGTTACCAGCgccgcc > 1:2616474/1‑140 (MQ=255) tCAACCCTTAAGTTA‑GCGCTTATGGGAT‑CACTCCCCGCCGTTGCTCTTACTCGGATTCGTAAGCCGTGAAAACAGCAACCTCCGTCTGGCCAGTTCGGATGTGAACCTCACAGAGGTCTTTTCTCGTTACCAGCgccgcc > 2:3033805/1‑140 (MQ=255) cttaaaGTTG‑GCGTTTATGGGAC‑CCCCCCCCGCCGTTGCTCTTACTCGGATTCGTAAGCCGTGAAAACAGCAACCTCCGTCTGGCCAGTTCGGATGTGAACCTCACAGAGGTCTTTTCTCGTTACCAGCGCCGCCACTAc < 1:266563/136‑1 (MQ=255) ttAAGTTA‑GGCTTTTTGGGATCCCCCCCCCGCCGTTGCTCTTACTCGGA‑TCGTAAGCCGTAAAAACAGCACCCTCCGTCTGGCCAGTTCGGATGTGAACCTCACAGAGGTCTTTTCTCGTTACCAGCGCCGCCACTAcgg < 2:972555/140‑1 (MQ=255) ttAAGTTA‑GCGCTTATGGGAT‑CACTCCCCGCCGTTGCTCTTACTCGGATTCGTAAGCCGTGAAAACAGCAACCTCCGTCTGGCCAGTTCGGATGTGAACCTCACAGAGGTCTTTTCTCGTTACCAGCGCCGCCACTAcgg > 1:574468/1‑140 (MQ=255) aaGTTA‑GCGCTTATGGGAT‑CACTCCCCGCCGTTGCTCTTACTCGGATTCGTAAGCCGTGAAAACAGCAACCTCCGTCTGGCCAGTTCGGATGTGAACCTCACAGAGGTCTTTTCTCGTTACCAGCGCCGCCACTAcggcg > 1:549654/1‑140 (MQ=255) aaGTTA‑GCGCTTATGGGAT‑CACTCCCCGCCGTTGCTCTTACTCGGATTCGTAAGCCGTGAAAACAGCAACCTCCGTCTGGCCAGTTCGGATGTGAACCTCACAGAGGTCTTTTCTCGTTACCAGCGCCGCCACTAcggcg > 1:1120393/1‑140 (MQ=255) aaGTTA‑GCGCTTATGGGAT‑CACTCCCCGCCGTTGCTCTTACTCGGATTCGTAAGCCGTGAAAACAGCAACCTCCGTCTGGCCAGTTCGGATGTGAACCTCACAGAGGTCTTTTCTCGTTACCAGCGCCGCCACTAcggcg > 1:878101/1‑140 (MQ=255) aaGTTA‑GCGCTTATGGGAT‑CACTCCCCGCCGTTGCTCTTACTCGGATTCGTAAGCCGTGAAAACAGCAACCTCCGTCTGGCCAGTTCGGATGTGAACCTCACAGAGGTCTTTTCTCGTTACCAGCGCCGCCACTAcggcc > 1:727459/1‑139 (MQ=255) a‑GCGCTTATGGGAT‑CACTCCCCGCCGTTGCTCTTACTCGGATTCGTAAGCCGTGAAAACAGCAACCTCCGTCTGGCCAGTTCGGATGTGAACCTCACAGAGGTCTTTTCTCGTTACCAGCGCCGCCACTAcggcggcgtt > 1:2454482/1‑136 (MQ=255) a‑GCGCTTATGGGAT‑CACTCCCCGCCGTTGCTCTTACTCGGATTCGTAAGCCGTGAAAACAGCAACCTCCGTCTGGCCAGTTCGGATGTGAACCTCACAGAGGTCTTTTCTCGTTACCAGCGCCGCCACTACGGCGGTGAt > 2:210023/1‑140 (MQ=255) a‑GCGCTTATGGGAT‑CACTCCCCGCCGTTGCTCTTACTCGGATTCGTAAGCCGTGAAAACAGCAACCTCCGTCTGGCCAGTTCGGATGTGAACCTCACAGAGGTCTTTTCTCGTTACCAGCGCCGCCACTACGGCGGTGAt > 2:2691760/1‑140 (MQ=255) a‑GCGCTTATGGGAT‑CACTCCCCGCCGTTGCTCTTACTCGGATTCGTAAGCCGTGAAAACAGCAACCTCCGTCTGGCCAGTTCGGATGTGAACCTCACAGAGGTCTTTTCTCGTTACCAGCGCCGCCACTACGGCGGTGAt > 2:1525267/1‑140 (MQ=255) gcgcTTATGGGAT‑CACTCCCCGCCGTTGCTCTTACTCGGATTCGTAAGCCGTGAAAACAGCAACCTCCGTCTGGCCAGTTCGGATGTGAACCTCACAGAGGTCTTTTCTCGTTACCAGCGCCGCCACTACGGCGGTGATa > 2:2953059/1‑140 (MQ=255) tATGGGAT‑CACTCCCCGCCGTTGCTCTTACTCGGATTCGTAAGCCGTGAAAACAGCAACCTCCGTCTGGCCAGTTCGGATGTGAACCTCACAGAGGTCTTTTCTCGTTACCAGCGCCGCCACTACGGCGGTGATACAGAt < 1:2953059/140‑1 (MQ=255) aTGGGAT‑CACTCCCCGCCGTTGCTCTTACTCGGATTCGTAAGCCGTGAAAACAGCAACCTCCGTCTGGCCAGTTCGGATGTGAACCTCACAGAGGTCTTTTCTCGTTACCAGCGCCGCCACTACGGCGGTGATActgtct > 1:779627/1‑135 (MQ=255) aTGGGAT‑CACTCCCCGCCGTTGCTCTTACTCGGATTCGTAAGCCGTGAAAACAGCAACCTCCGTCTGGCCAGTTCGGATGTGAACCTCACAGAGGTCTTTTCTCGTTACCAGCGCCGCCACTACGGCGGTGATACAGATg > 1:335762/1‑140 (MQ=255) aT‑CACTCCCCGCCGTTGCTCTTACTCGGATTCGTAAGCCGTGAAAACAGCAACCTCCGTCTGGCCAGTTCGGATGTGAACCTCACAGAGGTCTTTTCTCGTTACCAGCGCCGCCACTACGGCGGTGATACAGATGACGAt > 1:2117/1‑140 (MQ=255) aT‑CACTCCCCGCCGTTGCTCTTACTCGGATTCGTAAGCCATGGAAACAGCAACCTCCGTCTGGCCAGTTCGGATGTGAACCTCACAGAGGTCTTTTCTCGTTACCAGCGCCGCCACTACGGCGGTGATACAGATGACGAt > 1:1484955/1‑140 (MQ=255) | TACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCG‑CATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTA‑GCGCTTATGGGAT‑CACTCCCCGCCGTTGCTCTTACTCGGATTCGTAAGCCGTGAAAACAGCAACCTCCGTCTGGCCAGTTCGGATGTGAACCTCACAGAGGTCTTTTCTCGTTACCAGCGCCGCCACTACGGCGGTGATACAGATGACGAT > NC_000913/16596‑16870 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |