Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,628,625 | 0 | A | C | 22.4% | 142.2 / 17.1 | 58 | V105G (GTC→GGC) | pdeF | cyclic di‑GMP phosphodiesterase PdeF |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (41/4); new base C (0/13); total (41/17) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.54e-10 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. |
GCCAGTAATCCTACAAATGCAGCAAACTGGAAAAGTATCAGAAACAGCGTTGCAGGAAACACAATCTGCCAGAATATACGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCTAAGGCGATCCCTGGCAATGCCGCCCAGCTGAAAAA > NC_000913/2628490‑2628764 | gCCAGTAATCCTACAAATGCAGCAAACTGGAAAAGTATCAGAAACAGCGTTGCAGGAAACACAATCTGCCAGAATATACGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCt > 1:2142440/1‑140 (MQ=255) cAGTAATCCTACAAATGCAGCAAACTGGAAAAGTATCAGAAACAGCGTTGCAGGAAACACAATCTGCCAGAATATACGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGt > 1:775984/1‑140 (MQ=255) aGTAATCCTAAAAATGCAGCAAACTGAAAAAGTATCAAAAACAGCGTTGCAGAAAACACAATCTGCCAGAATATACGCGGGAAAATTAAACGGGTATCCCCATGTGAAACGTTGTTACGCGGGGGAGAAAAGCCCCTGTa < 2:2794796/140‑1 (MQ=255) tAACCCTAAAAATGCAGCAAACTGGAAAAGTATCAAAAACGGCGTGGCAGAAAACACAATCTGCAAGAATATCCGCTGGAAAATAAAACGGGTACCCCCATGTGAAACGTTGTTACGCGGGGGAAAAAAGCCCCTGTAAc < 2:2702997/140‑1 (MQ=255) aTCCTACAAATGCAGCAAACTGGAAAAGTATCAGAAACAGCGTTGCAGGAAACACAATCTGCCAGAATATACGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCg > 1:448500/1‑140 (MQ=255) aTCCTACAAATGCAGCAAACTGGAAAAGTATCAGAAACAGCGTTGCAGGAAACACAATCTGCCAGAATATACGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCg > 1:1576656/1‑140 (MQ=255) aCAAATGCAGCAAACTGGAAAAGTATCAGAAACAGCGTTGCAGGAAACACAATCTGCCAGAATATACGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCa > 1:2196869/1‑140 (MQ=255) aaaaTGCAGCAAACTGAAAAAGTATCAGAAACAGCGTTGCAGAAAACAAAATCTGCCAGAATATACGCGGGGAAATAAAACGGGTATCACCATGTAAAACGTTGTTACGCCGGGGAGAAAAGCCCCTGTAACCGCCCCaa < 2:2231075/139‑1 (MQ=255) aaTGCAGCAAACTGGAAAAGTATCAGAAACAGCGTTGCAGGAAACACAATCTGCCAGAATATACGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACa > 1:2702997/1‑140 (MQ=255) aaTGCAACAAACTGAAAAAGTAAAAGAAACAGCGTTGAAGAAAACAAAATCTGCCAGAATATACGTTGGAAAATAAAACGGTTACCACCATGTAAAACGTTGTTACGCGGGGGAGTAAAGCCCCTTTAACCGCCCCAACa < 2:2221989/140‑1 (MQ=255) aaTCCAGCAAACGGAAAAAGTATAAAAAACAGCGTTGCAGGAAACACAATCTGCCAGAATATACGCGGGAAAATTAAACGGGTATCCCCATGTGAAACGTTGTTACGCGGGGGAGAAAAGCCCCTGTAACCGCCCCAACa < 2:2196869/140‑1 (MQ=255) atgaaaaaaaCTGAAAAAGTATAAAAAACAGCGTTGCAGAAAACAAATTCTGCCAAAATATACGCTGGGAAATTAACCGGGTATCACCATGTAAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGCCCCTGTAACCGCCCCAACag < 2:3065398/133‑1 (MQ=255) gcagcaAACTGAAAAAGTATAAAAAACAGCGTTGCAGAAAACACAATCTGCAAGAATATCCGCGGGAAAATAAAAGGGGAATCCCCATGTAAAACGTTTTTACGCGGGGGAGAAAAGCCCCTGTAACCGCCCCAACagag < 2:306158/140‑1 (MQ=255) cagcaAACTGGAAAAGTATCAGAAACAGCGTTGCAGGAAACACAATCTGCCAGAATATACGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACAgaga > 1:2648579/1‑140 (MQ=255) cagcaAACTGGAAAAGTATCAGAAACAGCGTTGCAGGAAACACAATCTGCCAGAATATACGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACAgaga > 1:2642264/1‑140 (MQ=255) cagaaAACTGGAAAAGTATAAGAAACAGCGTTGCAGAAAACACAATCTGCCAGAATATACGCGGGGAAATAAACCGGGTATCCCCATGTGAAACGTTGTTCCGCCGGGGAGAAAAGCCCCTGAAACCGCCCCAACAgaga < 2:1277043/140‑1 (MQ=255) agcaAACTGGAAAAGTATCAGAAACAGCGTTGCAGGAAACACAATCTGCCAGAATATACGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACAGAGaa > 1:1997557/1‑140 (MQ=255) agcaAACTGGAAAAGTATCAGAAACAGCGTTGCAGGAAACACAATCTGCCAGAATATACGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACAGAGaa > 1:1277043/1‑140 (MQ=255) agcaAACTGGAAAAGTATCAGAAACAGCGTTGCAGGAAACACAATCTGCCAGAATATACGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACAGAGaa > 1:203069/1‑140 (MQ=255) gaaaaCGGAAAAAGTATCAAAAACAGCGTTGCAGAAAACACAATCTGCCAAAATATCCGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCATGTAAAACGTTTTTACGCGGGGGAGAAAAGCCCCTGTAACCGCCCCAACAGAGaat < 2:1948000/138‑1 (MQ=255) ggaaaaaGAATAAAAAACGGCGTTACAGGAAACACAATCTGCCAGAATATACCGTGGAAAATTAAACGGATATCACCATGTGAACCGTTGTTGCGCGGGGGAGAAAAGACCGTGTAACCGCCCCAACAGAGaatgataat < 2:1281415/137‑1 (MQ=255) gAAAAGTATCAGAAACAGCGTTGCAGGAAACACAATCTGCCAGAATATACGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACAGAGaatgataatga > 1:1281415/1‑140 (MQ=255) tCAGAAACAGCGTTGCAGGAAACACAATCTGCCAGAATATACGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATaaaa > 1:1752860/1‑140 (MQ=255) tCAGAAACAGCGTTGCAGGAAACACAATCTGCCAGAATATACGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATaaaa > 1:1991019/1‑140 (MQ=255) tCAGAAACAGCGTTGCAGGAAACACAATCTGCCAGAATATACGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATaaaa > 1:334917/1‑140 (MQ=255) aaaaaCAGCGTTGCAGAAAACACAATCTGCCAAAATATACGCTGGAAAATAAAACGGGTACCACCATGTAAAACGTTGTTACGCGGGGGATTAAAGCCCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAAtt < 2:2648579/138‑1 (MQ=255) aaaCAGTTTTGGAGAAAACACAATCTGCCAGAATATCCGCGGGGAAATAAAGCGGGTATCGCCAGATGAAACGTTGTTACGCGGGGGATTAAGGGCCTTTAAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAg < 2:334917/140‑1 (MQ=255) aaaCAGCGTTGAAGAAAACACAATCTGCAAAAATATACGCGGGAAAATTAAACGGGTACCACCATGTAAAACTTTGTTCCGCGGGGGAAAAAAGCCCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAg < 2:1997557/140‑1 (MQ=255) aaaCAGCGTCGCAGGAAACACACTCTGCGAGAATATAGGCGGGAAAATTAACCGGGTACCACCTTGTGAAGGTTTGTTACCCCGGGGAGGAAAGCCCCTGTACCCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAg < 2:2775230/140‑1 (MQ=255) acggCGTTGCAGAAAACACAATCTGCAAAAATATACGCGGGAAAATAAAGGGGGTACCCCCATGAAAAACGTTGTTCCGCGGGGGAGAAAACCCCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGcc < 2:786116/137‑1 (MQ=255) aCAGCGTTGCAGAAAACAAAATCTGCCAGAATATACGCGGGAAAATTAAACGGGTATCCCCATGTAAAACTTTGTTACGCGGGGGAGAAAAGCCCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGcc < 2:1701387/140‑1 (MQ=255) aGCGTTGCAGGAAACACAATCTGCCAGAATATACGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGt > 1:626029/1‑140 (MQ=255) aGCGTTGCAGGAAACACAATCTGCCAGAATATACGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGt > 1:786116/1‑140 (MQ=255) aGCGTTGCAGGAAACACAATCTGCCAGAATATACGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGt > 1:1420272/1‑140 (MQ=255) aGCGTTGCAGAAAACACAATCTGCAAAAATATACGCGGGAAAATAAAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTCCGCGGGGGAGAAAAGCCCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGt < 2:626029/140‑1 (MQ=255) gTTGCAGGAAACACAATCTGCCAGAATATACGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTaa > 1:2775230/1‑140 (MQ=255) aaTCTGCCAGAATATACGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGt > 2:2171104/1‑140 (MQ=255) aaTCTGCCAGAATATACGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAAACCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGt > 1:1637071/1‑140 (MQ=255) gCCAGAATATACGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTaaaaa > 1:2914675/1‑140 (MQ=255) cAGAATATACGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAAcc > 2:1230937/1‑140 (MQ=255) aGAATATACGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAAccc > 1:2013382/1‑140 (MQ=255) aaaatccgcgGGAAAATAAAACGGTAACCCCAAAGTCAACCGTTGTTACGCCGGGGAGAAAAGCCCCTAAAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAg < 2:2790728/134‑1 (MQ=255) aaTATCCGGGGGAAAATTAAACGGGTATCACCATGTAAAAGGTTGTTACGCGGGGGAGAAAAGCCCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAg < 2:856796/140‑1 (MQ=255) aaTATACGCTGGAAAATAAAAGGGGTACCCCCATGTAAAACGTTGTTCCGCGGGGGAGTAAAGCCCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAg < 1:2789095/140‑1 (MQ=255) aaTATACGCGGGAAAATAAACCGGGTATCACCATGTAAAACGTTTTTCCGCGGGGGAGAAAAGCCCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAg < 2:2013382/140‑1 (MQ=255) tataCGCGGGGAAATTAACCGGGTACCACCATGTAAAACGTTGTTACGCGGGGGAGAAAAACCCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGct < 2:1637071/140‑1 (MQ=255) taCGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGctct > 1:2107178/1‑140 (MQ=255) taCGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGctct > 1:1444992/1‑140 (MQ=255) gcgggaaaaTTAAACGGGTATCACCATGTAAAACGTTTTTACGCGGGGGAGAAAAGCCCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCa < 2:2107178/134‑1 (MQ=255) gcgggaaaaTTAAACGGGTACCCCCATGTAAAACGTTTTTACGCGGGGGAGTAAAGCCCTTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCa < 2:1444992/134‑1 (MQ=255) ggAAATTAAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATAtt > 1:2741527/1‑140 (MQ=255) ggAAATTAAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATAtt > 1:856796/1‑140 (MQ=255) aaaCGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGAc > 2:1364486/1‑140 (MQ=255) gggttaccACCATGTAAAACTTTGTTACGCGGGGGAGAAAAGCCCCTTTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACaaa < 2:1420272/133‑1 (MQ=255) cGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACaaa < 1:1230937/140‑1 (MQ=255) aTCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTACGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATcc > 1:1917795/1‑140 (MQ=255) aTGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCTAAgg < 1:1364486/140‑1 (MQ=255) aTGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGAAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCTAAgg < 1:2171104/140‑1 (MQ=255) aTGTAAAACGTTGTTACGCGGGGGAGAAAAGCCCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCTAAgg < 2:963970/140‑1 (MQ=255) tgtgAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGCCCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACaaa < 1:1972056/128‑1 (MQ=255) tgtgAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACaaa > 2:1972056/1‑128 (MQ=255) tgtgAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCTAAGGc > 1:2668193/1‑140 (MQ=255) gtgAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCTCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCTAAGGCg > 2:1763968/1‑140 (MQ=255) gtgAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCTCTAAGGCg > 2:518840/1‑140 (MQ=255) aaaCGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCTAAGGCGATc > 1:963970/1‑140 (MQ=255) aaCGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCTAAGGCGATcc > 2:173252/1‑140 (MQ=255) ttACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCTAAGGCGATCCCTGGCaa > 1:1260660/1‑140 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2:1213493/1‑140 (MQ=255) gggAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTACGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCTAAGGCGATCCCTGGCAATGCCGccc < 2:1917795/140‑1 (MQ=255) gAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCTAAGGCGATCCCTGGCAATGCCGCCCAg < 1:2015384/140‑1 (MQ=255) aCCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCTAAGGCGATCCCTGGCAATGCCGccc < 2:3166103/130‑1 (MQ=255) aCCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCTAAGGCGATCCCTGGCAATGCCGccc > 1:3166103/1‑130 (MQ=255) aCCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCTAAGGCGATCCCTGGCAATGCCGCCCAGCTGaaaaa < 1:173252/140‑1 (MQ=255) aCCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCTAAGGCGATCCCTGGCAATGCCGCCCAGCTGaa > 1:843156/1‑137 (MQ=255) aCCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCTAAGGCGATCCCTGGCAATGCCGCCCAGCTGaa < 2:843156/137‑1 (MQ=255) | GCCAGTAATCCTACAAATGCAGCAAACTGGAAAAGTATCAGAAACAGCGTTGCAGGAAACACAATCTGCCAGAATATACGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCTAAGGCGATCCCTGGCAATGCCGCCCAGCTGAAAAA > NC_000913/2628490‑2628764 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |