Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 4,453,510 | G→T | A314S (GCG→TCG) | ytfT → | galactofuranose ABC transporter putative membrane subunit YtfT |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 4,453,510 | 0 | G | T | 99.6% | 889.8 / ‑4.9 | 250 | A314S (GCG→TCG) | ytfT | galactofuranose ABC transporter putative membrane subunit YtfT |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base T (108/141); minor base C (0/1); total (108/142) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.30e-01 |
Only 100 of 252 total aligned reads displayed.
GGTGATTGGCGGCGGATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAAGCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGGAGTACGTAGCCGTGATAAAACGTAATTTGCCACTGATGATCACCATCGGCGTCTTTGTGTTGGGTTATCTTTAC > NC_000913/4453374‑4453645 | ggtgATTGGCGGCGGATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCgg < 2:1073022/140‑1 (MQ=255) gATTGGCGGCGGATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCggtgg < 2:2165299/140‑1 (MQ=255) gATTGGCGGCGGATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCggtgg < 2:1539614/140‑1 (MQ=255) ttGGCGGCGGATCGCTGATTGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCggtggtg > 2:2523323/1‑140 (MQ=255) cggcggATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCggtggt < 2:1972343/135‑1 (MQ=255) cggcggATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCggtggt > 1:1972343/1‑135 (MQ=255) ggcggATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCt < 2:2135184/140‑1 (MQ=255) gcggATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCtt > 1:2292068/1‑140 (MQ=255) gATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGAGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGc > 1:2436238/1‑140 (MQ=255) tCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGt < 1:3363462/140‑1 (MQ=255) tCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGt < 2:2605994/140‑1 (MQ=255) tCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAACCGGTGGTGGTGCTTTGCGt < 2:129888/140‑1 (MQ=255) aTGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGAt < 2:3469079/140‑1 (MQ=255) ggcgggcgCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGt > 1:3154654/1‑140 (MQ=255) cgggcgCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGt < 1:167692/129‑1 (MQ=255) cgggcgCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGt < 1:847383/129‑1 (MQ=255) ggcgCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAg > 1:1454560/1‑140 (MQ=255) gcgcTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGt > 2:644182/1‑140 (MQ=255) cTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGc < 1:3578067/140‑1 (MQ=255) cTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGc < 1:56959/140‑1 (MQ=255) cTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGc < 1:2093069/140‑1 (MQ=255) cTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGc < 2:70137/140‑1 (MQ=255) tttAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCATGCTGATTGTTCAGTCGCa < 2:2858571/140‑1 (MQ=255) cTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCtt > 1:1098338/1‑140 (MQ=255) cTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTAt > 2:1197805/1‑140 (MQ=255) cTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTAt > 2:2804325/1‑140 (MQ=255) tttCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGt < 1:1197805/140‑1 (MQ=255) tttCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGt < 2:187388/140‑1 (MQ=255) tttCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGt < 1:262766/140‑1 (MQ=255) tttCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGt < 2:3439511/140‑1 (MQ=255) tttCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGt < 2:1006249/140‑1 (MQ=255) tttCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGt < 2:1095740/140‑1 (MQ=255) tCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACg < 2:966069/128‑1 (MQ=255) tCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGt > 2:1489943/1‑138 (MQ=255) tCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCt < 1:1547484/140‑1 (MQ=255) gtggtgGGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGAt > 1:759826/1‑140 (MQ=255) gtggtgGGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGAt < 1:644182/140‑1 (MQ=255) ggtggGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTa < 1:1224772/140‑1 (MQ=255) gtggGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTaa < 2:1658471/140‑1 (MQ=255) gtggGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTaa < 1:2796730/140‑1 (MQ=255) tggGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTaaa > 1:2392067/1‑140 (MQ=255) gggggCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAg < 1:1178053/140‑1 (MQ=255) gggggCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAg < 2:113503/140‑1 (MQ=255) ggggCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAgg < 2:1454560/140‑1 (MQ=255) ggggCGCTGATTATTCA‑GGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGGa > 2:1682796/1‑140 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1:3440851/140‑1 (MQ=255) tattCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGGAGTACGTAGcc < 1:1004853/140‑1 (MQ=255) cAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGGAGTACGTAGCCGTGa < 2:1956097/140‑1 (MQ=255) gATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGGAGTACGTAGCCGTGATaaaa > 2:441197/1‑140 (MQ=255) aTGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGGAGTACGTAGCCGTGATAAAAc > 1:2428279/1‑140 (MQ=255) tGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGGAGTACGTAGCCGTGATAAAACg < 2:873437/140‑1 (MQ=255) gAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGGAGTACGTAGCCGTGATAAAACGt > 1:1993712/1‑140 (MQ=255) gAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGGAGTACGTAGCCGTGATAAAACGt > 2:2083117/1‑140 (MQ=255) gAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGGAGTACGTAGCCGTGATAAAACGt > 2:918736/1‑140 (MQ=255) aaCACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGGAGTACGTAGCCGTGATAAAACGTa > 1:1378366/1‑140 (MQ=255) acacCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGGAGTACGTAGCCGTGATAAAACGTaa > 1:1016200/1‑140 (MQ=255) acCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGGAGTACGTAGCCGTGATAAAACGTAAtt < 1:8349/140‑1 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2:2653554/140‑1 (MQ=255) cTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGGAGTACGTAGCCGTGATAAAACGTAATTTGCCACt < 2:1478510/135‑1 (MQ=255) cTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGGAGTACGTAGCCGTGATAAAACGTAATTTGCCACt > 1:1478510/1‑135 (MQ=255) cTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGGAGTACGTAGCCGTGATAAAACGTAATTTGCCACt < 2:2869632/135‑1 (MQ=255) cTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGGAGTACGTAGCCGTGATAAAACGTAATTTGCCACt > 1:2869632/1‑135 (MQ=255) gggCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGGAGTACGTAGCCGTGATAAAACGTAATTTGCCACTGATGATCAcc < 1:451909/140‑1 (MQ=255) tCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGGAGTACGTAGCCGTGATAAAACGTAATTTGCCACTGATGATCACCATCGGc > 1:2238032/1‑140 (MQ=255) gCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGGAGTACGTAGCCGTGATAAAACGTAATTTGCCACTGATGATCACCATCGGCGTc < 2:796899/140‑1 (MQ=255) ccAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGGAGTACGTAGCCGTGATAAAACGTAATTTGCCACTGATGATCACCATCGGCGTCt < 1:1888540/140‑1 (MQ=255) ccAGAGATGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGGAGTACGTAGCCGTGATAAAACGTAATTTGCCACTGATGATCACCATCGGCGTCt < 1:3304237/140‑1 (MQ=255) agaTGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGGAGTACGTAGCCGTGATAAAACGTAATTTGCCACTGATGATCACCATCGGCGTCTTtgt < 1:1335113/140‑1 (MQ=255) agaTGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGGAGTACGTAGCCGTGATAAAACGTAATTTGCCACTGATGATCACCATCGGCGTCTTtgt < 1:2299215/140‑1 (MQ=255) agaTGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGGAGTACGTAGCCGTGATAAAACGTAATTTGCCACTGATGATCACCATCGGCGTCTTtgt > 1:268029/1‑140 (MQ=255) aTGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGGAGTACGTAGCCGTGATAAAACGTAATTTGCCACTGATGATCACCATCGGCGTCTTTgtgt > 2:3247249/1‑140 (MQ=255) tGAACCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGGAGTACGTAGCCGTGATAAAACGTAATTTGCCACTGATGATCACCATCGGCGTCTTTGTGtt < 2:2956592/140‑1 (MQ=255) aaCCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGGAGTACGTAGCCGTGATAAAACGTAATTTGCCACTGATGATCACCATCGGCGTCTTTGTGTTgg < 1:918736/140‑1 (MQ=255) aaCCAGGTGGTGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGGAGTACGTAGCCGTGATAAAACGTAATTTGCCACTGATGATCACCATCGGCGTCTTTGTGTTgg < 1:996332/140‑1 (MQ=255) ggtggtGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGGAGTACGTAGCCGTGATAAAACGTAATTTGCCACTGATGATCACCATCGGCGTCTTTgtgt > 2:508345/1‑132 (MQ=255) ggtggtGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGGAGTACGTAGCCGTGATAAAACGTAATTTGCCACTGATGATCACCATCGGCGTCTTTGTGTTGGGt > 2:1421064/1‑137 (MQ=255) ggtggtGAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGGAGTACGTAGCCGTGATAAAACGTAATTTGCCACTGATGATCACCATCGGCGTCTTTGTGTTGGGTTAt > 2:2718424/1‑140 (MQ=255) gtggtgAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGGAGTACGTAGCCGTGATAAAACGTAATTTGCCACTGATGATCACCATCGGCGTCTTTGTGTTGGGTTATc > 2:1572589/1‑140 (MQ=255) gtggtgAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGG‑GTACGTAGCCGTGATAAAACGTAATTTGCCACTGATGATCACCATCGGCGTCTTTGTGTTgg > 1:2541319/1‑133 (MQ=255) tggtgAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGGAGTACGTAGCCGTGATAAAACGTAATTTGCCACTGATGATCACCATCGGCGTCTTTGTGTTGGGTTATCt > 2:2585541/1‑140 (MQ=255) tggtgAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGGAGTACGTAGCCGTGATAAAACGTAATTTGCCACTGATGATCACCATCGGCGTCTTTGTGTTGGGTTATCt > 1:2847016/1‑140 (MQ=255) gtgAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGGAGTACGTAGCCGTGATAAAACGTAATTTGCCACTGATGATCACCATCGGCGTCTTTGTGTTGGGTTATCttt > 1:413945/1‑140 (MQ=255) tgAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATCAAAGGAGTACGTAGCCGTGATAAAACGTAATTTGCCACTGATGATCACCATCGGCGTCTTTGTGTTGGGt > 2:839543/1‑132 (MQ=255) gAAATCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGGAGTACGTAGCCGTGATAAAACGTAATTTGCCACTGATGATCACCATCGGCGTCTTTGTGTTGGGTTATCTTTAc > 2:3124579/1‑140 (MQ=255) | GGTGATTGGCGGCGGATCGCTGATGGGCGGGCGCTTTAACCTGCTACTTTCGGTGGTGGGGGCGCTGATTATTCAGGGGATGAACACCGGAATTTTGCTTTCGGGCTTTCCGCCAGAGATGAACCAGGTGGTGAAAGCGGTGGTGGTGCTTTGCGTGCTGATTGTTCAGTCGCAACGCTTTATCAGTCTGATTAAAGGAGTACGTAGCCGTGATAAAACGTAATTTGCCACTGATGATCACCATCGGCGTCTTTGTGTTGGGTTATCTTTAC > NC_000913/4453374‑4453645 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |