| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 244 total aligned reads displayed.
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cgcagatgcctgatgcgacgctaTGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑GGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGc > 2:723244‑M2/24‑140 (MQ=255) gcagatgcctgatgcgacgctaTGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑GGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGcc > 2:1249976‑M2/23‑140 (MQ=255) tgatgcgacgctaTGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑GGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGC‑TAACGCGTCTTATCaggcctacaaattcc > 2:180314‑M2/14‑133 (MQ=255) gatgcgacgctaTGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑GGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CTTGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTAc < 1:1269297‑M2/128‑1 (MQ=255) gatgcgacgctaTGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑GGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGTGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTAc < 1:1060673‑M2/128‑1 (MQ=255) gatgcgacgctaTGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑GGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTAc < 1:810282‑M2/128‑1 (MQ=255) gatgcgacgctaTGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑GGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTAc < 1:847799‑M2/128‑1 (MQ=255) gatgcgacgctaTGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑GGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTAc < 1:907050‑M2/128‑1 (MQ=255) gatgcgacgctaTGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑GGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTAc < 1:619117‑M2/128‑1 (MQ=255) gatgcgacgctaTGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑GGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTAc < 1:1172575‑M2/128‑1 (MQ=255) gatgcgacgctaTGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑GGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTAc < 1:193185‑M2/128‑1 (MQ=255) gatgcgacgctaTGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑GGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑AATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTAc < 1:538364‑M2/128‑1 (MQ=255) tgcgacgctaTGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑GGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTAc < 1:34082‑M2/128‑1 (MQ=255) tgcgacgctaTGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑GGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTAc > 2:34082‑M2/11‑138 (MQ=255) tGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑GGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTACGGGCg < 1:1045511/133‑1 (MQ=255) tGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑GGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTACGGGCGAAGTgta < 1:588669‑M2/140‑4 (MQ=255) | TGCCAGCAGTATAGTGTTGCACAGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑GGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTACGGGCGAAGTGTA > NC_000913/377212‑377490 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |