| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,291,901 | C→A | F130L (TTC→TTA) | nrfE → | putative cytochrome c‑type biogenesis protein NrfE |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,291,901 | 0 | C | A | 98.7% | 273.5 / ‑2.9 | 78 | F130L (TTC→TTA) | nrfE | putative cytochrome c‑type biogenesis protein NrfE |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base A (32/45); total (33/45) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.23e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.02e-01 | |||||||||||
CTGCTTTCCGCCTGGAGCGCGCTGTTTGCCTGGCATTATCGGCAGCAAACCGATCCGCTATTTCCGCTGACGTTAGCCGTTTTATCTCTCATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCAATCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCGCTGCTTTACCTTGGCTATGGCGGTTTGATGGTAGCGGCGAGCGTGGCGCTGGCGA > NC_000913/4291764‑4292037 | ctgctTTCCGCCTGGAGCGCGCTGTTTGCCTGGCATTATCGGCAGCAAACCGATCCGCTATTTCCGCTGACGTTAGCCGTTTTATCTCTCATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTAGt > 2:1245362/1‑140 (MQ=255) tgctTTCCGCCTGGAGCGCGCTGTTTGCCTGGCATTATCGGCAGCAAACCGATCCGCTATTTCCGCTGACGTTAGCCGTTTTATCTCTCATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTAGTg < 1:66417/140‑1 (MQ=255) tgctTTCCGCCTGGAGCGCGCTGTTTGCCTGGCATTATCGGCAGCAAACCGATCCGCTATTTCCGCTGACGTTAGCCGTTTTATCTCTCATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTAGTg < 1:155955/140‑1 (MQ=255) tttCCGCCTGGAGCGCGCTGTTTGCCTGGCATTATCGGCAGCAAACCGATCCGCTATTTCCGCTGACGTTAGCCGTTTTATCTCTCATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTAGTGCgg < 2:832342/140‑1 (MQ=255) cGCCTGGAGCGCGCTGTTTGCCTGGCATTATCGGCAGCAAACCGATCCGCTATTTCCGCTGACGTTAGCCGTTTTATCTCTCATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTAGTGCGGatat > 1:126357/1‑140 (MQ=255) cGCCTGGAGCGCGCTGTTTGCCTGGCATTATCGGCAGCAAACCGATCCGCTATTTCCGCTGACGTTAGCCGTTTTATCTCTCATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTAGTGCGGatat > 1:300686/1‑140 (MQ=255) ggAGCGCGCTGTTTGCCTGGCATTATCGGCAGCAAACCGATCCGCTATTTCCGCTGACGTTAGCCGTTTTATCTCTCATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTAGTGCGGATATTTcca < 2:108543/140‑1 (MQ=255) ggAGCGCGCTGTTTGCCTGGCATTATCGGCAGCAAACCGATCCGCTATTTCCGCTGACGTTAGCCGTTTTATCTCTCATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTAGTGCGGATATTTcca > 1:61907/1‑140 (MQ=255) gAGCGCGCTGTTTGCCTGGCATTATCGGCAGCAAACCGATCCGCTATTTCCGCTGACGTTAGCCGTTTTATCTCTCATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTAGTGCGGATATTTctac < 2:1450869/140‑1 (MQ=255) cgcgcTGTTTGCCTGGCATTATCGGCAGCAAACCGATCCGCTATTTCCGCTGACGTTAGCCGTTTTATCTCTCATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTAGTGCGGATATTTCCACCAg < 1:1184235/140‑1 (MQ=255) cgcgcTGTTTGCCTGGCATTATCGGCAGCAAACCGATCCGCTATTTCCGCTGACGTTAGCCGTTTTATCTCTCATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTAGTGCGGATATTTCCACCAg < 1:862948/140‑1 (MQ=255) cgcTGTTTGCCTGGCATTATCGGCAGCAAACCGATCCGCTATTTCCGCTGACGTTAGCCGTTTTATCTCTCATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTAGTGCGGATATTTCCACCAGCa > 1:431087/1‑140 (MQ=255) cTGTTTGCCTGGCATTATCGGCAGCAAACCGATCCGCTATTTCCGCTGACGTTAGCCGTTTTATCTCTCATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTAGTGCGGATATTTCCACCAGCAAt > 2:1147992/1‑140 (MQ=255) tttGCCTGGCATTATCGGCAGCAAACCGATCCGCTATTTCCGCTGACGTTAGCCGTTTTATCTCTCATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTAGTGCGGATATTTCCACCAGCAATCGa < 2:1391456/140‑1 (MQ=255) tGGCATTATCGGCAGCAAACCGATCCGCTATTTCCGCTGACGTTAGCCGTTTTATCTCTCATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTAGTGCGGATATTTCCACCAGCAATCGAAGGCcg < 2:1278548/140‑1 (MQ=255) ggCATTATCGGCATCAAACCGATCCGCTATTTCCGCTGACGTTAGCCGTTTTATCTCTCATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTAGTGCGGATATTTCCACCAGCAATCGAAGGCcgc < 2:758657/140‑1 (MQ=255) ggCATTATCGGCAGCAAACCGATCCGCTATTTCCGCTGACGTTAGCCGTTTTATCTCTCATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTAGTGCGGATATTTCCACCAGCAATCGAAGGCcgc < 1:1542957/140‑1 (MQ=255) gCATTATCGGCAGCAAACCGATCCGCTATTTCCGCTGACGTTAGCCGTTTTATCTCTCATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTAGTGCGGATATTTCCACCAGCAATCGAAGGCcgcg > 1:1596599/1‑140 (MQ=255) gCATTATCGGCAGCAAACCGATCCGCTATTTCCGCTGACGTTAGCCGTTTTATCTCTCATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTAGTGCGGATATTTCCACCAGCAATCGAAGGCcgcg > 2:1041471/1‑140 (MQ=255) aTTATCGGCAGCAAACCGATCCGCTATTTCCGCTGACGTTAGCCGTTTTATCTCTCATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTAGTGCGGATATTTCCACCAGCAATCGAAGGCCGCGAt > 1:562315/1‑140 (MQ=255) aTTATCGGCAGCAAACCGATCCGCTATTTCCGCTGACGTTAGCCGTTTTATCTCTCATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTAGTGCGGATATTTCCACCAGCAATCGAAGGCCGCGAt < 1:1631488/140‑1 (MQ=255) tATCGGCAGCAAACCGATCCGCTATTTCCGCTGACGTTAGCCGTTTTATCTCTCATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTAGTGCGGATATTTCCACCAGCAATCGAAGGCCGCGAtct < 1:1041471/140‑1 (MQ=255) gcagcaAACCGATCCGCTATTTCCGCTGACGTTAGCCGTTTTACCTCTCATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTAGTGCGGATATTTCCACCAGCAATCGAAGGCCGCGATCTCAATc < 2:1752486/140‑1 (MQ=255) agcaAACCGATCCGCTATTTCCGCTGACGTTAGCCGTTTTATCTCTCATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTAGTGCGGATATTTCCACCAGCAATCGAAGGCCGCGATCTCAATCCg > 1:1786848/1‑140 (MQ=255) gcaAACCGATCCGCTATTTCCGCTGACGTTAGCCGTTTTATCTCTCATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTAGTGCGGATATTTCCACCAGCAATCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGa < 1:566964/140‑1 (MQ=255) aaaCCGATCCGCTATTTCCGCTGACGTTAGCCGTTTTATCTCTCATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTAGTGCGGATATTTCCACCAGCAATCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGAtg < 2:742540/140‑1 (MQ=255) aaaCCGATCCGCTATTTCCGCTGACGTTAGCCGTTTTATCTCTCATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTAGTGCGGATATTTCCACCAGCAATCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGAtg < 1:1147992/140‑1 (MQ=255) aCCGATCCGCTATTTCCGCTGACGTTAGCCGTTTTATCTCTCATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTAGTGCGGATATTTCCACCAGCAATCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGAtgct > 1:248298/1‑140 (MQ=255) ccGATCCGCTATTTCCGCTGACGTTAGCCGTTTTATCTCTCATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTAGTGCGGATATTTCCACCAGCAATCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGAtgctg < 2:562315/140‑1 (MQ=255) gATCCGCTATTTCCGCTGACGTTAGCCGTTTTATCTCTCATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTAGTGCGGATATTTCCACCAGCAATCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCa < 2:1763726/140‑1 (MQ=255) gATCCGCTATTTCCGCTGACGTTAGCCGTTTTATCTCTCATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTAGTGCGGATATTTCCACCAGCAATCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCa < 2:300686/140‑1 (MQ=255) aTCCGCTATTTCCGCTGACGTTAGCCGTTTTATCTCTCATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTAGTGCGGATATTTCCACCAGCAATCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCa > 2:1100903/1‑139 (MQ=255) aTCCGCTATTTCCGCTGACGTTAGCCGTTTTATCTCTCATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTAGTGCGGATATTTCCACCAGCAATCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCa < 1:1100903/139‑1 (MQ=255) gCTATTTCCGCTGACGTTAGCCGTTTTATCTCTCATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTAGTGCGGATATTTCCACCAGCAATCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATc < 1:1272927/140‑1 (MQ=255) gCTATTTCCGCTGACGTTAGCCGTTTTATCTCTCATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTAGTGCGGATATTTCCACCAGCAATCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATc < 2:431087/140‑1 (MQ=255) aTTTCCGCTGACGTTAGCCGTTTTATCTCTCATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTAGTGCGGATATTTCCACCAGCAATCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCg < 1:1245362/140‑1 (MQ=255) ccGCTGACGTTAGCCGTTTTATCTCTCATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTAGTGCGGATATTTCCACCAGCAATCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCt < 2:61907/140‑1 (MQ=255) cGCTGACGTTAGCCGTTTTATCTCTCATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTAGTGCGGATATTTCCACCAGCAATCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCtt < 2:1628766/140‑1 (MQ=255) tGACGTTAGCCGTTTTATCTCTCATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTAGTGCGGATATTTCCACCAGCAATCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATc > 1:231404/1‑140 (MQ=255) gACGTTAGCCGTTTTATCTCTCATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTAGTGCGGATATTTCCACCAGCAATCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATcc < 1:1521328/129‑1 (MQ=255) gACGTTAGCCGTTTTATCTCTCATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTAGTGCGGATATTTCCACCAGCAATCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAAAATcc > 1:148789/1‑129 (MQ=255) gACGTTAGCCGTTTTATCTCTCATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTAGTGCGGATATTTCCACCAGCAATCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAAAATcc < 2:148789/129‑1 (MQ=255) gACGTTAGCCGTTTTATCTCTCATGCTCGCCGCACTGATACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTAGTGCGGATATTTCCACCAGCAATCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATcc > 2:1521328/1‑129 (MQ=255) ttAGCCGTTTTATCTCTCATGCTCACCGCATTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTAGTGGTGATATTTCCACCAGCAATCGAAGGCCGCGATCTCAGTCCGATGGTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCa < 2:1534190/140‑1 (MQ=255) gTTTTATCTCTCATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTAGTGCGGATATTTCCACCAGCAATCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCAcc < 2:231404/140‑1 (MQ=255) tttATCTCTCATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTAGTGCGGATATTTCCACCAGCAATCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCa > 2:1773807/1‑132 (MQ=255) tttATCTCTCATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTAGTGCGGATATTTCCACCAGCAATCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCa < 1:1773807/132‑1 (MQ=255) tctctcATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTAGTGCGGATATTTCCACCAGCAATCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCgctgct < 2:320197/140‑1 (MQ=255) tctctcATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTAGTGCGGATATTTCCACCAGCAATCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCgctgct < 2:887281/140‑1 (MQ=255) ctcATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTAGTGCGGATATTTCCACCAGCAATCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCGCTGCTTTa < 1:1815806/140‑1 (MQ=255) cATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTAGTGCGGATATTTCCACCAGCAATCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCGCTGCTTTAcc < 2:1704698/140‑1 (MQ=255) cgcACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTAGTGCGGATATTTCCACCAGCAATCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCGCTGCTTTACCTTGGCTATg < 2:126357/140‑1 (MQ=255) cgcACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTAGTGCGGATATTTCCACCAGCAATCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCGCTGCTTTACCTTGGCTATg > 2:1205061/1‑140 (MQ=255) cgcACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTAGTGCGGATATTTCCACCAGCAATCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCGCTGCTTTACCTTGGCTATg > 2:671623/1‑140 (MQ=255) cgcACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTAGTGCGGATATTTCCACCAGCAATCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCGCTGCTTTACCTTGGCTATg > 2:1772127/1‑140 (MQ=255) gcACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGCGGTCCGATCCCTTAGTGCGGATATTTCCACCAGCAATCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCGCTGCTTTACCTTGGCTATgg < 2:873278/140‑1 (MQ=255) cACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTAGTGCGGATATTTCCACCAGCAATCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCGCTGCTTTACCTTGGCTATGGc < 1:50296/140‑1 (MQ=255) tggtgCTGTGGTCCGATCCCTTAGTGCGGATATTTCCACCAGCAATCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCGCTGCTTTACCTTGGCTATGGCGGTTTTATGGTAgcg > 2:479321/1‑140 (MQ=255) tggtgCTGTGGTCCGATCCCTTAGTGCGGATATTTCCACCAGCAATCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCGCTGCTTTACCTTGGCTATGGCGGTTTGATGGTAgcg > 2:194473/1‑140 (MQ=255) tgCTGTGGTCCGATCCCTTAGTGCGGATATTTCCACCAGCAATCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCGCTGCTTTACCTTGGCTATGGCGGTTTGATGGTAgcggcg > 1:972956/1‑140 (MQ=255) tgCTGTGGTCCGATCCCTTAGTGCGGATATTTCCACCAGCAATCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCGCTGCTTTACCTTGGCTATGGCGGTTTGATGGTAgcggcg > 1:117047/1‑140 (MQ=255) tgCTGTGGTCCGATCCCTTAGTGCGGATATTTCCACCAGCAATCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCGCTGCTTTACCTTGGCTATGGCGGTTTGATGGTAgcggcg > 1:962921/1‑140 (MQ=255) gCTGTGGTCCGATCCCTTAGTGCGGATATTTCCACCAGCAATCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCGCTGCTTTACCTTGGCTATGGCGGTTTGATGGTAgcggcgg > 2:1397442/1‑139 (MQ=255) cTGTGGTCCGATCCCTTAGTGCGGATATTTCCACCAGCAATCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCGCTGCTTTACCTTGGCTATGGCGGTTTGATGGTAGCGGCGAg > 1:844838/1‑140 (MQ=255) tgtgGTCCGATCCCTTAGTGCGGATATTTCCACCAGCAATCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCGCTGCTTTACCTTGGCTATGGCGGTTTGATGGTAGCGGCGGGc > 2:1189164/1‑140 (MQ=255) gtgGTCCGATCCCTTAGTGCGGATATTTCCACCAGCAATCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCGCTGCTTTACCTTGGCTATGGCGGTTTGATGGTAGCGGCGAGCg < 2:1786848/140‑1 (MQ=255) tgGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCAATCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCGCTGCTTTACCTTGGCTATGGCGGTTTTATGGGAGCGGCGAGCgg > 1:722488/1‑139 (MQ=255) ggTCCGATCCCTTAGTGCGGATATTTCCACCAGCAATCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCGCTGCTTTACCTTGGCTATGGCGGTTTGATGGTAGCGGCGAGCGTg < 2:952784/140‑1 (MQ=255) gTCCGATCCCTTAGTGCGGATATTTCCACCAGCAATCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCGCTGCTTTACCTTGGCTATGGCGGTTTGATGGTAGCGGCGAGCGTgg < 2:920157/140‑1 (MQ=255) gTCCGATCCCTTAGTGCGGATATTTCCACCAGCAATCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCGCTGCTTTACCTTGGCTATGGCGGTTTGATGGTAGCGGCGAGCGTgg > 1:626559/1‑140 (MQ=255) gATCCCTTAGTGCGGATATTTCCACCAGCAATCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCGCTGCTTTACCTTGGCTATGGCGGTTTGATGGTAGCGGCGAGCGTGGCGCt < 2:972956/140‑1 (MQ=255) aTCCCTTAGTGCGGATATTTCCACCAGCAATCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCGCTGCTTTACCTTGGCTATGGCGGTTTGTTGGTAGCGGCGGGCGTGGGGCTg > 2:510871/1‑140 (MQ=255) aTCCCTTAGTGCGGATATTTCCACCAGCAATCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCGCTGCTTTACCTTGGCTATGGCGGTTTGATGGTAgcgg > 1:949308/1‑126 (MQ=255) aTCCCTTAGTGCGGATATTTCCACCAGCAATCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCGCTGCTTTACCTTGGCTATGGCGGTTTGATGGTAgcgg < 2:949308/126‑1 (MQ=255) aTCCCTTAGTGCGGATATTTCCACCAGCAATCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCGCTGCTTTACCTTGGCTATGGCGGTTTGATGGTAGCGGCGAGCGGGGGGCTg > 2:1062366/1‑140 (MQ=255) tCCCTTAGTGCGGATATTTCCACCAGCAATCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCGCTGCTTTACCTTGGCTATGGCGGTTTGATGGTAGCGGCGAGCGTGGCGCTgg < 1:1856669/140‑1 (MQ=255) ccTTAGTGCGGATATTTCCACCAGCAATCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCGCTGCTTTACCTTGGCTATGGCGGTTTGATGGTAGCGGCGAGCGTGGCGCTGGCg > 1:1159229/1‑140 (MQ=255) cTTAGTGCGGATATTTCCACCAGCAATCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCGCTGCTTTACCTTGGCTATGGCGGTTTGATGGTAGCGGCGAGCGTGGCGCTGGCGa < 2:117047/140‑1 (MQ=255) cTTAGTGCGGATATTTCCACCAGCAATCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCGCTGCTTTACCTTGGCTATGGCGGTTTGATGGTAGCGGCGAGCGTGGCGCTGGCGa < 2:962921/140‑1 (MQ=255) | CTGCTTTCCGCCTGGAGCGCGCTGTTTGCCTGGCATTATCGGCAGCAAACCGATCCGCTATTTCCGCTGACGTTAGCCGTTTTATCTCTCATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCAATCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCGCTGCTTTACCTTGGCTATGGCGGTTTGATGGTAGCGGCGAGCGTGGCGCTGGCGA > NC_000913/4291764‑4292037 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |