| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,703,294 | C→A | Q31H (CAG→CAT) | era ← | 30S ribosomal subunit maturation GTPase Era |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,703,294 | 0 | C | A | 99.0% | 333.8 / ‑4.4 | 95 | Q31H (CAG→CAT) | era | 30S ribosomal subunit maturation GTPase Era |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base A (60/34); minor base G (0/1); total (60/35) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.68e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.14e-01 | |||||||||||
GCGGTTAATGGCGCGTTTTTCTTCCATATGCAGGCCCGGTGTATCGACGTAGATCGCCTGATACGCGCCTTCAGTATGGATCCCCACAATGCGGTGACGAGTTGTCTGCGCCTTGCGGGAAGTGATGGAGATTTTCTGCCCCAGCAGTTTGTTCAACAATGTGGATTTGCCAACGTTCGGACGTCCGACGATGGCAATAAATCCGCAGTAACTTTTATCGATGCTCATTCCAGCTCCAGTTTTTTCAACGCCTGTTCGGCGGCAGCCTGCTC > NC_000913/2703159‑2703430 | gCGGTTAATGGCGCGTTTTTCTTCCATATGCAGGCCCGGTGTATCGACGTAGATCGCCTGATACGCGCCTTCAGTATGGATCCCCACAATGCGGTGACGAGTTGTCTGCGCCTTGCGGGAAGTGATGGAGATTTTATgtc > 2:43804/1‑138 (MQ=255) aaTGGCGCGTTTTTCTTCCATATGCAGGCCCGGTGTATCGACGTAGATCGCCTGATACGCGCCTTCAGTATGGATCCCCACAATGCGGTGACGAGTTGTCTGCGCCTTGCGGGAAGTGATGGAGATTTTATGCCCcagca < 2:757845/140‑1 (MQ=255) tGGCGCGTTTTTCTTCCATATGCAGGCCCGGTGTATCGACGTAGATCGCCTGATACGCGCCTTCAGTATGGATCCCCACAATGCGGTGACGAGTTGTCTGCGCCTTGCGGGAAGTGATGGAGATTTTATGCCCCAGCAGt < 1:495041/140‑1 (MQ=255) gTTTTTCTTCCATATGCAGGCCCGGTGTATCGACGTAGATCGCCTGATACGCGCCTTCAGTATGGATCCCCACAATGCGGTGACGAGTTGTCTGCGCCTTGCGGGAAGTGATGGAGATTTTATGTCCCAGCAGTTTGTTc < 1:43804/140‑1 (MQ=255) tatGCAGGCCCGGTGTATCGACGTAGATCGCCTGATACGCGCCTTCAGTATGGATCCCCACAATGCGGTGACGAGTTGTCTGCGCCTTGCGGGAAGTGATGGAGATTTTATGCCCCAGCAGTTTGTTCAACAATGTGGAt > 1:1782297/1‑140 (MQ=255) tGCAGGCCCGGTGTATCGACGTAGATCGCCTGATACGCGCCTTCAGTATGGATCCCCACAATGCGGTGACGAGTTGTCTGCGCCTTGCGGGAAGTGATGGAGATTTTATGCCCCAGCAGTTTGTTCAACAATGTGGAttt > 1:408001/1‑140 (MQ=255) tGCAGGCCCG‑‑GTATCGACGTAGATCGCCTGATACGCGCCTTCAGTATGGATCCCCACAATGCGGTGACGAGTTGTCTGCGCCTTGCGGGAAGTGATGGAGATTTTATGCCCCAGCAGTTTGTTCAACAATGTGGATTTGc < 1:159421/140‑1 (MQ=255) ggCCCGGTGTATCGACGTAGATCGCCTGATACGCGCCTTCAGTATGGATCCCCACAATGCGGTGACGAGTTGTCTGCGCCTTGCGGGAAGTGATGGAGATTTTGTGCCCCAGCAGTTTGTTCAACAATGTGGATTTGCCa < 2:790859/140‑1 (MQ=255) gCCCGGTGTATCGACGTAGATCGCCTGATACGCGCCTTCAGTATGGATCCCCACAATGCGGTGACGAGTTGTCTGCGCCTTGCGGGAAGTGATGGAGATTTTATGCCCCAGCAGTTTGTTCAACAATGTGGATTTGcc < 1:378283/138‑1 (MQ=255) gCCCGGTGTATCGACGTAGATCGCCTGATACGCGCCTTCAGTATGGATCCCCACAATGCGGTGACGAGTTGTCTGCGCCTTGCGGGAAGTGATGGAGATTTTATGCCCCAGCAGTTTGTTCAACAATGTGGATTTGcc > 2:378283/1‑138 (MQ=255) gCCCGGTGTATCGACGTAGATCGCCTGATACGCGCCTTCAGTATGGATCCCCACAATGCGGTGACGAGTTGTCTGCGCCTTGCGGGAAGTGATGGAGATTTTATGCCCCAGCAGTTTGTTCAACAATGTGGATTTGCCaa > 1:360356/1‑140 (MQ=255) gCCCGGTGTATCGACGTAGATCGCCTGATACGCGCCTTCAGTATGGATCCCCACAATGCGGTGACGAGTTGTCTGCGCCTTGCGGGAAGTGATGGAGATTTTATGCCCCAGCAGTTTGTTCAACAATGTGGATTTGCCaa > 2:269913/1‑140 (MQ=255) gCCCGGTGTATCGACGTAGATCGCCTGATACGCGCCTTCAGTATGGATCCCCACAATGCGGTGACGAGTTGTCTGCGCCTTGCGGGAAGTGATGGAGATTTTATGCCCCAGCAGTTTGTTCAACAATGTGGATTTGCCaa > 1:2032012/1‑140 (MQ=255) gCCCGGTGTATCGACGTAGATCGCCTGATACGCGCCTTCAGTATGGATCCCCACAATGCGGTGACGAGTTGTCTGCGCCTTGCGGGAAGTGATGGAGATTTTATGCCCCAGCAGTTTGTTCAACAATGTGGATTTGCCaa > 1:1846038/1‑140 (MQ=255) gCCCGGTGTATCGACGTAGATCGCCTGATACGCGCCTTCAGTATGGATCCCCACAATGCGGTGACGAGTTGTCTGCGCCTTGCGGGAAGTGATGGAGATTTTATGCCCCAGCAGTTTGTTCAACAATGTGGATTTGCCaa > 1:1185001/1‑140 (MQ=255) ggTGTATCGACGTAGATCGCCTGATACGCGCCTTCAGTATGGATCCCCACAATGCGGTGACGAGTTGTCTGCGCCTTGCGGGAAGTGATGGAGATTTTATGCCCCAGCAGTTTGTTCAACAATGTGGATTTGCCAACGtt > 2:1661200/1‑140 (MQ=255) gtgtATCGACGTAGATCGCCTGATACGCGCCTTCAGTATGGATCCCCACAATGCGGTGACGAGTTGTCTGCGCCTTGCGGGAAGTGATGGAGATTTTATGCCCCAGCAGTTTGTTCAACAATGTGGATTTGCCAACGTTc > 2:1392178/1‑140 (MQ=255) gtgtATCGACGTAGATCGCCTGATACGCGCCTTCAGTATGGATCCCCACAATGCGGTGACGAGTTGTCTGCGCCTTGCGGGAAGTGATGGAGATTTTATGCCCCAGCAGTTTGTTCAACAATGTGGATTTGCCAACGTTc > 2:2027756/1‑140 (MQ=255) gtgtATCGACGTAGATCGCCTGATACGCGCCTTCAGTATGGATCCCCACAATGCGGTGACGAGTTGTCTGCGCCTTGCGGGAAGTGATGGAGATTTTATGCCCCAGCAGTTTGTTCAACAATGTGGATTTGCCAACGTTc > 2:1144707/1‑140 (MQ=255) gTAGATCGCCTGATACGCGCCTTCAGTATGGATCCCCACAATGCGGTGACGAGTTGTCTGCGCCTTGCGGGAAGTGATGGAGATTTTATGCCCCAGCAGTTTGTTCAACAATGTGGATTTGCCAACGTTCGGACGTCcga > 1:1261523/1‑140 (MQ=255) tAGATCGCCTGATACGCGCCTTCAGTATGGATCCCCACAATGCGGTGACGAGTTGTCTGCGCCTTGCGGGAAGTGATGGAGATTTTATGCCCCAGCAGTTTGTTCAACAATGTGGATTTGCCAACGTTCgg < 2:1345519/131‑1 (MQ=255) tAGATCGCCTGATACGCGCCTTCAGTATGGATCCCCACAATGCGGTGACGAGTTGTCTGCGCCTTGCGGGAAGTGATGGAGATTTTATGCCCCAGCAGTTTGTTCAACAATGTGGATTTGCCAACGTTCgg > 1:1345519/1‑131 (MQ=255) tAGATCGCCTGATACGCGCCTTCAGTATGGATCCCCACAATGCGGTGACGAGTTGTCTGCGCCTTGCGGGAAGTGATGGAGATTTTATGCCCCAGCAGTTTGTTCAACAATGTGGATTTGCCAACGTTCGGACGTCcgac > 1:1650054/1‑140 (MQ=255) aGATCGCCTGATACGCGCCTTCAGTATGGATCCCCACAATGCGGTGACGAGTTGTCTGCGCCTTGCGGGAAGTGATGGAGATTTTATGCCCCAGCAGTTTGTTCAACAATGTGGATTTGCCAACGTTCGGACGTCcgacg < 1:1884482/140‑1 (MQ=255) gATCGCCTGATACGCGCCTTCAGTATGGATCCCCACAATGCGGTGACGAGTTGTCTGCGCCTTGCGGGAAGTGATGGAGATTTTATGCCCCAGCAGTTTGTTCAACAATGTGGATTTGCCAACGTTCGGACGTCcgacga > 1:1408968/1‑140 (MQ=255) aTCGCCTGATACGCGCCTTCAGTATGGATCCCCACAATGCGGTGACGAGTTGTCTGCGCCTTGCGGGAAGTGATGGAGATTTTATGCCCCAGCAGTTTGTTCAACAATGTGGATTTGCCAACGTTCGGACGTCCGACGAt < 2:1408968/140‑1 (MQ=255) aTCGCCTGATACGCGCCTTCAGTATGGATCCCCACAATGCGGTGACGAGTTGTCTGCGCCTTGCGGGAAGTGATGGAGATTTTATGCCCCAGCAGTTTGTTCAACAATGTGGATTTGCCAACGTTCGGACGTCCGACGAt > 1:1314533/1‑140 (MQ=255) aTCGCCTGATACGCGCCTTCAGTATGGATCCCCACAATGCGGTGACGAGTCGTCTGCGCCTTGCGGGAAGTGATGGAGATTTTATGCCCCAGCAGTTTGTTCAACAATGTGGATTTGCCAACGTTCGGACGTCCGACGAt > 1:888587/1‑140 (MQ=255) tCGCCTGATACGCGCCTTCAGTATGGATCCCCACAATGCGGTGACGAGTTGTCTGCGCCTTGCGGGAAGTGATGGAGATTTTATGCCCCAGCAGTTTGTTCAACAATGTGGATTTGCCAACGTTCGGACGt < 1:1047665/131‑1 (MQ=255) tCGCCTGATACGCGCCTTCAGTATGGATCCCCACAATGCGGTGACGAGTTGTCTGCGCCTTGCGGGAAGTGATGGAGATTTTATGCCCCAGCAGTTTGTTCAACAATGTGGATTTGCCAACGTTCGGACGt > 2:1047665/1‑131 (MQ=255) cGCCTGATACGCGCCTTCAGTATGGATCCCCACAATGCGGTGACGAGTTGTCTGCGCCTTGCGGGAAGTGATGGAGATTTTATGCCCCAGCAGTTTGTTCAACAATGTGGATTTGCCAACGTTCGGACGTCCGACGATgg > 1:70405/1‑140 (MQ=255) ccTGATACGCGCCTTCAGTATGGATCCCCACAATGCGGTGACGAGTTGTCTGCGCCTTGCGGGAAGTGATGGAGATTTTATGCCCCAGCAGTTTGTTCAACAATGTGGATTTGCCAACGTTCgg > 2:161828/1‑124 (MQ=255) ccTGATACGCGCCTTCAGTATGGATCCCCACAATGCGGTGACGAGTTGTCTGCGCCTTGCGGGAAGTGATGGAGATTTTATGCCCCAGCAGTTTGTTCAACAATGTGGATTTGCCAACGTTCgg < 1:161828/124‑1 (MQ=255) ccTGATACGCGCCTTCAGTATGGATCCCCACAATGCGGTGACGAGTTGTCTGCGCCTTGCGGGAAGTGATGGAGATTTTATGCCCCAGCAGTTTGTTCAACAATGTGGATTTGCCAACGTTCGGACGTCCGACGATGGCa > 2:474663/1‑140 (MQ=255) ccTGATACGCGCCTTCAGTATGGATCCCCACAATGCGGTGACGAGTTGTCTGCGCCTTGCGGGAAGTGATGGAGATTTTATGCCCCAGCAGTTTGTTCAACAATGTGGATTTGCCAACGTTCGGACGTCCGACGATGGCa > 2:275707/1‑140 (MQ=255) cTGATACGCGCCTTCAGTATGGATCCCCACAATGCGGTGACGAGTTGTCTGCGCCTTGCGGGAAGTGATGGAGATTTTATGCCCCAGCAGTTTGTTCAACAATGTGGATTTGCCAACGTTCGGACGTCCGACGATGGCaa < 2:1762334/140‑1 (MQ=255) cTGATACGCGCCTTCAGTATGGATCCCCACAATGCGGTGACGAGTTGTCTGCGCCTTGCGGGAAGTGATGGAGATTTTATGCCCCAGCAGTTTGTTCAACAATGTGGATTTGCCAACGTTCGGACGTCCGACGATGGCaa > 1:1762334/1‑140 (MQ=255) tGATACGCGCCTTCAGTATGGATCCCCACAATGCGGTGACGAGTTGTCTGCGCCTTGCGGGAAGTGATGGAGATTTTATGCCCCAGCAGTTTGTTCAACAATGTGGATTTGCCAACGTTCGGACGTCCGACGATGGCAAt > 1:616069/1‑140 (MQ=255) gATACGCGCCTTCAGTATGGATCCCCACAATGCGGTGACGAGTTGTCTGCGCCTTGCGGGAAGTGATGGAGATTTTATGCCCCAGCAGTTTGTTCAACAATGTGGATTTGCCAACGTTCGGACGTCCGACGATGGCAATa > 1:1257316/1‑140 (MQ=255) aCGCGCCTTCAGTATGGATCCCCACAATGCGGTGACGAGTTGTCTGCGCCTTGCGGGAAGTGATGGAGATTTTATGCCCCAGCAGTTTGTTCAACAATGTGGATTTGCCAACGTTCGGACGTCcgacg < 2:1491899/128‑1 (MQ=255) aCGCGCCTTCAGTATGGATCCCCACAATGCGGTGACGAGTTGTCTGCGCCTTGCGGGAAGTGATGGAGATTTTATGCCCCAGCAGTTTGTTCAACAATGTGGATTTGCCAACGTTCGGACGTCcgacg > 1:1491899/1‑128 (MQ=255) ccTTCAGTATGGATCCCCACAATGCGGTGACGAGTTGTCTGCGCCTTGCGGGAAGTGATGGAGATTTTATGCCCCAGCAGTTTGTTCAACAATGTGGATTTGCCAACGTTCGGACGTCCGACGATGGCAATAAATCCGCa < 2:1185001/140‑1 (MQ=255) ttCAGTATGGATCCCCACAATGCGGTGACGAGTTGTCTGCGCCTTGCGGGAAGTGATGGAGATTTTATGCCCCAGCAGTTTGTTCAACAATGTGGATTTGCCAACGTTCGGACGTCCGACGATGGCAATAAATCCGCAGt < 2:70405/140‑1 (MQ=255) ttCAGTATGGATCCCCACAATGCGGTGACGAGTTGTCTGCGCCTTGCGGGAAGTGATGGAGATTTTATGCCCCAGCAGTTTGTTCAACAATGTGGATTTGCCAACGTTCGGACGTCCGACGATGGCAATAAATCCGCAGt < 2:2032012/140‑1 (MQ=255) tATGGATCCCCACAATGCGGTGACGAGTTGTCTGCGCCTTGCGGGAAGTGATGGAGATTTTATGCCCCAGCAGTTTGTTCAACAATGTGGATTTGCCAACGTTCGGACGTCCGACGATGGCAATAAATCCGCAGTAACtt > 2:1033088/1‑140 (MQ=255) gATCCCCACAATGCGGTGACGAGTTGTCTGCGCCTTGCGGGAAGTGATGGAGATTTTATGCCCCAGCAGTTTGTTCAACAATGTGGATTTGCCAACGTTCGGACGTCCGACGATGGCAATAAATCCGCAGTAACTTTTAt > 1:1817139/1‑140 (MQ=255) gATCCCCACAATGCGGTGACGAGTTGTCTGCGCCTTGCGGGAAGTGATGGAGATTTTATGCCCCAGCAGTTTGTTCAACAATGTGGATTTGCCAACGTTCGGACGTCCGACGATGGCAATAAATCCGCAGTAACTTTTAt > 1:317022/1‑140 (MQ=255) gATCCCCACAATGCGGTGACGAGTTGTCTGCGCCTTGCGGGAAGTGATGGAGATTTTATGCCCCAGCAGTTTGTTCAACAATGTGGATTTGCCAACGTTCGGACGTCCGACGATGGCAATAAATCCGCAGTAACTTTTAt < 1:1033088/140‑1 (MQ=255) gATCCCCACAATGCGGTGACGAGTTGTCTGCGCCTTGCGGGAAGTGATGGAGATTTTATGCCCCAGCAGTTTGTTCAACAATGTGGATTTGCCAACGTTCGGACGTCCGACGATGGCAATAAATCCGCAGTAACTTTTAt > 1:1858447/1‑140 (MQ=255) gATCCCCACAATGCGGTGACGAGTTGTCTGCGCCTTGCGGGAAGTGATGGAGATTTTATGCCCCAGCAGTTTGTTCAACAATGTGGATTTGCCAACGTTCGGACGTCCGACGATGGCAATAAATCCGCAGTAACTTTTAt > 1:1835758/1‑140 (MQ=255) gATCCCCACAATGCGGTGACGAGTTGTCTGCGCCTTGCGGGAAGTGATGGAGATTTTATGCCCCAGCAGTTTGTTCAACAATGTGGATTTGCCAACGTTCGGACGCCCGACGATGGCAATAAATCCGCAGTAACTTTTAt > 1:1441069/1‑140 (MQ=255) aTCCCCACAATGCGGTGACGAGTTGTCTGCGCCTTGCGGGAAGTGATGGAGATTTTATGCCCCAGCAGTTTGTTCAACAATGTGGATTTGCCAACGTTCGGACGTCCGACGATGGCAATAAATCCGCa < 1:846630/128‑1 (MQ=255) aTCCCCACAATGCGGTGACGAGTTGTCTGCGCCTTGCGGGAAGTGATGGAGATTTTATGCCCCAGCAGTTTGTTCAACAATGTGGATTTGCCAACGTTCGGACGTCCGACGATGGCAATAAATCCGCa > 2:846630/1‑128 (MQ=255) tCCCCACAATGCGGTGACGAGTTGTCTGCGCCTTGCGGGAAGTGATGGAGATTTTATGCCCCAGCAGTTTGTTCAACAATGTGGATTTGCCAACGTTCGGACGTCCGACGATGGCAATAAATCCGCAGTAACTTTTATCg < 2:697382/140‑1 (MQ=255) cccACAATGCGGTGACGAGTTGTCTGCGCCTTGCGGGAAGTGATGGAGATTTTATGCCCCAGCAGTTTGTTCAACAATGTGGATTTGCCAACGTTCGGACGTCCGACGATGGCAATAAATCCGCAGTAACTTTTATCGAt > 1:1156363/1‑140 (MQ=255) cccACAATGCGGTGACGAGTTGTCTGCGCCTTGCGGGAAGTGATGGAGATTTTATGCCCCAGCAGTTTGTTCAACAATGTGGATTTGCCAACGTTCGGACGTCCGACGATGGCAATAAATCCGCAGTAACTTTTATCGAt > 1:1132236/1‑140 (MQ=255) cccACAATGCGGTGACGAGTTGTCTGCGCCTTGCGGGAAGTGATGGAGATTTTATGCCCCAGCAGTTTGTTCAACAATGTGGATTTGCCAACGTTCGGACGTCCGACGATGGCAATAAATCCGCAGTAACTTTTATCGAt > 1:261208/1‑140 (MQ=255) cccACAATGCGGTGACGAGTTGTCTGCGCCTTGCGGGAAGTGATGGAGATTTTATGCCCCAGCAGTTTGTTCAACAATGTGGATTTGCCAACGTTCGGACGTCCGACGATGGCAATAAATCCGCAGTAACTTTTATCGAt > 2:1286457/1‑140 (MQ=255) cccACAATGCGGTGACGAGTCGTCTGCGCCTTGCGGGAAGTGATGGAGATTTTATGCCCCAGCAGTTTGTTCAACAATGTGGATTTGCCAACGTTCGGACGTCCGACGATGGCAATAAATCCGCAGTAACTTTTATCGAt < 2:888587/140‑1 (MQ=255) ccACAATGCGGTGACGAGTTGTCTGCGCCTTGCGGGAAGTGATGGAGATTTTATGCCCCAGCAGTTTGTTCAACAATGTGGATTTGCCAACGTTCGGACGTCCGACGATGGCAATAAATCCGCAGTAACTTTTATCGATg > 2:823184/1‑140 (MQ=255) cacaATGTGGTGACGAGTTGTCTGCGCCTTGCGGGAAGTGATGGAGATTTTATGCCCCAGCAGTTTGTTCAACAATGTGGATTTGCCAACGTTCGGACGTCCGACGATGGCAATAAATCCGCAGTAACTTTTATCGATg > 1:1482190/1‑139 (MQ=255) cacaATGTGGTGACGAGTTGTCTGCGCCTTGCGGGAAGTGATGGAGATTTTATGCCCCAGCAGTTTGTTCAACAATGTGGATTTGCCAACGTTCGGACGTCCGACGATGGCAATAAATCCGCAGTAACTTTTATCGATg < 2:1482190/139‑1 (MQ=255) cacaATGCGGTGACGAGTTGTCTGCGCCTTGCGGGAAGTGATGGAGATTTTATGCCCCAGCAGTTTGTTCAACAATGTGGATTTGCCAACGTTCGGACGTCCGACGATGGCAATAAATCCGCAGTAACTTTTATCGATGc > 2:977289/1‑140 (MQ=255) cacaATGCGGTGACGAGTTGTCTGCGCCTTGCGGGAAGTGATGGAGATTTTATGCCCCAGCAGTTTGTTCAACAATGTGGATTTGCCAACGTTCGGACGTCCGACGATGGCAATAAATCCGCAGTAACTTTTATCGATGc > 1:248040/1‑140 (MQ=255) cacaATGCGGTGACGAGTTGTCTGCGCCTTGCGGGAAGTGATGGAGATTTTATGCCCCAGCAGTTTGTTCAACAATGTGGATTTGCCAACGTTCGGACGTCCGACGATGGCAATAAATCCGCAGTAACTTTTATCGATGc > 1:1848691/1‑140 (MQ=255) cacaATGCGGTGACGAGTTGTCTGCGCCTTGCGGGAAGTGATGGAGATTTTATGCCCCAGCAGTTTGTTCAACAATGTGGATTTGCCAACGTTCGGACGTCCGACGATGGCAATAAATCCGCAGTAACTTTTATCGATGc > 1:920867/1‑140 (MQ=255) cacaATGCGGTGACGAGTTGTCTGCGCCTTGCGGGAAGTGATGGAGATTTTATGCCCCAGCAGTTTGTTCAACAATGTGGATTTGCCAACGTTCGGACGTCCGACGATGGCAATAAATCCGCAGTAACTTTTATCGATGc > 1:1657870/1‑140 (MQ=255) cacaATGCGGTGACGAGTTGTCTGCGCCTTGCGGGAAGTGATGGAGATTTTATGCCCCAGCAGTATGTTCAACAATGTGGATTTGCCAACGTTCGGACGTCCGACGATGGCAATAAATCCGCAGTAACTTTTATCGATGc > 1:574643/1‑140 (MQ=255) acaATGCGGTGACGAGTTGTCTGCGCCTTGCGGGAAGTGATGGAGATTTTATGCCCCAGCAGTTTGTTCAACAATGTGGATTTGCCAACGTTCGGACGTCCGACGATGGCAATAAATCCGCAGTAACTTTTATCGATGCt < 2:920867/140‑1 (MQ=255) caATGCGGTGACGAGTTGTCTGCGCCTTGCGGGAAGTGATGGAGATTTTATGCCCCAGCAGTTTGTTCAACAATGTGGATTTGCCAACGTTCGGACGTCCGACGATGGCAATAAATCCGCAGTAACTTTTATCGATGCTc > 2:1210287/1‑140 (MQ=255) aTGCGGTGACGAGTTGTCTGCGCCTTGCGGGAAGTGATGGAGATTTTATGCCCCAGCAGTTTGTTCAACAATGTGGATTTGCCAACGTTCGGACGTCCGACGATGGCAATAAATCCGCAGTAACTTTTATCGATGCTCAt < 2:1257316/140‑1 (MQ=255) aTGCGGTGACGAGTTGTCTGCGCCTTGCGGGAAGTGATGGAGATTTTATGCCCCAGCAGTTTGTTCAACAATGTGGATTTGCCAACGTTCGGACGTCCGACGATGGCAATAAATCCGCAGTAACTTTTATCGATGCTCAt > 2:737089/1‑140 (MQ=255) tGCGGTGACGAGTTGTCTGCGCCTTGCGGGAAGTGATGGAGATTTTATGCCCCAGCAGTTTGTTCAACAATGTGGATTTGCCAACGTTCGGACGTCCGACGATGGCAATAAATCCGCAGTAACTTTTATCGATGCTCAtt > 2:709654/1‑140 (MQ=255) cGGTGACGAGTTGTCTGCGCCTTGCGGGAAGTGATGGAGATTTTATGCCCCAGCAGTTTGTTCAACAATGTGGATTTGCCAACGTTCGGACGTCCGACGATGGCAATAAATCCGCAGTAACTTTTATCGATGCTCATTcc > 1:191352/1‑140 (MQ=255) gTGACGAGTTGTCTGCGCCTTGCGGGAAGTGATGGAGATTTTATGCCCCAGCAGTTTGTTCAACAATGTGGATTTGCCAACGTTCGGACGTCCGACGATGGCAATAAATCCGCAGTAACTTTTATCGATGCTCATTCCAg > 1:241533/1‑140 (MQ=255) aCGAGTTGTCTGCGCCTTGCGGGAAGTGATGGAGATTTTATGCCCCAGCAGTTTGTTCAACAATGTGGATTTGCCAACGTTCGGACGTCCGACGATGGCAATAAATCCGCAGTAACTTTTATCg < 1:776012/124‑1 (MQ=255) aCGAGTTGTCTGCGCCTTGCGGGAAGTGATGGAGATTTTATGCCCCAGCAGTTTGTTCAACAATGTGGATTTGCCAACGTTCGGACGTCCGACGATGGCAATAAATCCGCAGTAACTTTTATCg > 2:776012/1‑124 (MQ=255) aCGAGTTGTCTGCGCCTTGCGGGAAGTGATGGAGATTTTATGCCCCAGCAGTTTGTTCAACAATGTGGATTTGCCAACGTTCGGACGTCCGACGATGGCAATAAATCCGCAGTAACTTTTATCGATGCTCATTCCAGCTc > 1:967744/1‑140 (MQ=255) gTCTGCGCCTTGCGGGAAGTGATGGAGATTTTATGCCCCAGCAGTTTGTTCAACAATGTGGATTTGCCAACGTTCGGACGTCCGACGATGGCAATAAATCCGCAGTAACTTTTATCGATGCTCATTCCAGCTCCAGtttt > 1:536792/1‑140 (MQ=255) gTCTGCGCCTTGCGGGAAGTGATGGAGATTTTATGCCCCAGCAGTTTGTTCAACAATGTGGATTTGCCAACGTTCGGACGTCCGACGATGGCAATAAATCCGCAGTAACTTTTATCGATGCTCATTCCAGCTCCAGtttt > 1:1525181/1‑140 (MQ=255) tCTGCGCCTTGCGGGAAGTGATGGAGATTTTATGCCCCAGCAGTTTGTTCAACAATGTGGATTTGCCAACGTTCGGACGTCCGACGATGGCAATAAATCCGCAGTAACTTTTATCGATGCTCATTCCAGCTCCAGttttt > 2:1008332/1‑140 (MQ=255) tGCGCCTTGCGGGAAGTGATGGAGATTTTATGCCCCAGCAGTTTGTTCAACAATGTGGATTTGCCAACGTTCGGACGTCCGACGATGGCAATAAATCCGCAGTAACTTTTATCGATGCTCATTCCAGCTCCAGTTTTTTc > 2:1478679/1‑140 (MQ=255) tGCGCCTTGCGGGAAGTGATGGAGATTTTATGCCCCAGCAGTTTGTTCAACAATGTGGATTTGCCAACGTTCGGACGTCCGACGATGGCAATAAATCCGCAGTAACTTTTATCGATGCTCATTCCAGCTCCAGTTTTTTc < 1:709654/140‑1 (MQ=255) gCGGGAAGTGATGGAGATTTTATGCCCCAGCAGTTTGTTCAACAATGTGGATTTGCCAACGTTCGGACGTCCGACGATGGCAATAAATCCGCAGTAACTTTTATCGATGCTCATTCCAGCTCCAGTTTTTTCAACGCCTg > 1:928900/1‑140 (MQ=255) gTGATGGAGATTTTATGCCCCAGCAGTTTGTTCAACAATGTGGATTTGCCAACGTTCGGACGTCCGACGATGGCAATAAATCCGCAGTAACTTTTATCGATGCTCATTCCAGCTCCAGTTTTTTCAACGCCTGTTcggcg < 1:275707/140‑1 (MQ=255) gTGATGGAGATTTTATGCCCCAGCAGTTTGTTCAACAATGTGGATTTGCCAACGTTCGGACGTCCGACGATGGCAATAAATCCGCAGTAACTTTTATCGATGCTCATTCCAGCTCCAGTTTTTTCAACGCCTGTTcggcg < 2:967744/140‑1 (MQ=255) aTGGAGATTTTATGCCCCAGCAGTTTGTTCAACAATGTGGATTTGCCAACGTTCGGACGTCCGACGATGGCAATAAATCCGCAGTAACTTTTATCGATGCTCATTCCAGCTCCAGTTTTTTCAACGCCTGTTCGGCGGCa < 2:1835758/140‑1 (MQ=255) agaTTTTATGCCCCAGCAGTTTGTTCAACAATGTGGATTTGCCAACGTTCGGACGTCCGACGATGGCAATAAATCCGCAGTAACTTTTATCGATGCTCATTCCAGCTCCAGTTTTTTCAACGCCTGTTCGGCGGCAGCCt > 2:1805997/1‑140 (MQ=255) ttttATGCCCCAGCAGTTTGTTCAACAATGTGGATTTGCCAACGTTCGGACGTCCGACGATGGCAATAAATCCGCAGTAACTTTTATCGATGCTCATTCCAGCTCCAGTTTTTTCAACGCCTGTTCGGCGGCAGCCTGCt < 2:616069/140‑1 (MQ=255) ttttATGCCCCAGCAGTTTGTTCAACAATGTGGATTTGCCAACGTTCGGACGTCCGACGATGGCAATAAATCCGCAGTAACTTTTATCGATGCTCATTCCAGCTCCAGTTTTTTCAACGCCTGTTCGGCGGCAGCCTGCt < 2:317022/140‑1 (MQ=255) ttttATGCCCCAGCAGTTTGTTCAACAATGTGGATTTGCCAACGTTCGGACGTCCGACGATGGCAATAAATCCGCAGTAACTTTTATCGATGCTCATTCCAGCTCCAGTTTTTTCAACGCCTGTTCGGCGGCAGCCTGCt < 1:1686856/140‑1 (MQ=255) ttttATGCCCCAGCAGTTTGTTCAACAATGTGGATTTGCCAACGTTCGGACGTCCGACGATGGCAATAAATCCGCAGTAACTTTTATCGATGCTCATTCCAGCTCCAGTTTTTTCAACGCCTGTTCGGCGGCAGCCTGCt < 1:1661200/140‑1 (MQ=255) ttttATGCCCCAGCAGTTTGTTCAACAATGTGGATTTGCCAACGTTCGGACGTCCGACGATGGCAATAAATCCGCAGTAACTTTTATCGATGCTCATTCCAGCTCCAGTTTTTTCAACGCCTGTTCGGCGGCAGCCTGCt < 2:1817139/140‑1 (MQ=255) ttttATGCCCCAGCAGTTTGTTCAACAATGTGGATTTGCCAACGTTCGGACGTCCGACGATGGCAATAAATCCGCAGTAACTTTTATCGATGCTCATTCCAGCTCCAGTTTTTTCAACGCCTGTTCGGCGGCAGCCTGCt < 1:1286457/140‑1 (MQ=255) tttATGCCCCAGCAGTTTGTTCAACAATGTGGATTTGCCAACGTTCGGACGTCCGACGATGGCAATAAATCCGCAGTAACTTTTATCGATGCTCATTCCAGCTCCAGTTTTTTCAACGCCTGTTCGGCGGCAGCCTGCTc < 1:1392178/140‑1 (MQ=255) | GCGGTTAATGGCGCGTTTTTCTTCCATATGCAGGCCCGGTGTATCGACGTAGATCGCCTGATACGCGCCTTCAGTATGGATCCCCACAATGCGGTGACGAGTTGTCTGCGCCTTGCGGGAAGTGATGGAGATTTTCTGCCCCAGCAGTTTGTTCAACAATGTGGATTTGCCAACGTTCGGACGTCCGACGATGGCAATAAATCCGCAGTAACTTTTATCGATGCTCATTCCAGCTCCAGTTTTTTCAACGCCTGTTCGGCGGCAGCCTGCTC > NC_000913/2703159‑2703430 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |