| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 738,158 | G→T | E23* (GAA→TAA) | ybfD → | H repeat‑associated putative transposase YbfD |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 738,158 | 0 | G | T | 97.8% | 392.9 / 2.7 | 134 | E23* (GAA→TAA) | ybfD | H repeat‑associated putative transposase YbfD |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (2/1); new base T (79/52); total (81/53) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.47e-01 | |||||||||||
Only 100 of 136 total aligned reads displayed.
ATTACCTGAAGCTGTTTTTTATTGCTTATACATGATCAAATACTTCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTAT > NC_000913/738024‑738294 | attaCCTGAAGCTGTTTTTTATTGCTTATACATGATCAAATACTTCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACAt < 1:297819/140‑1 (MQ=37) ccTGAAGCTGTTTTTTATTGCTTATACATGATCAAATACTTCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAAt > 2:188188/1‑140 (MQ=255) cTGAAGCTGTTTTTTATTGCTTATACATGATCAAATACTTCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAAtt > 1:249931/1‑140 (MQ=37) aaGCTGTTTTTTATTGCTTATACATGATCAAATACTTCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATc < 1:1122619/140‑1 (MQ=37) aaGCTGTTTTTTATTGCTTATACATGATCAAATACTTCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATc < 2:249931/140‑1 (MQ=255) aaGCTGTTTTTTATTGCTTATACATGATCAAATACTTCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATc < 1:711501/140‑1 (MQ=255) ttttttATTGCTTATACATGATCAAATACTTCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGatat > 2:1201627/1‑140 (MQ=37) tttttATTGCTTATACATGATCAAATACTTCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATAtt > 1:579442/1‑140 (MQ=255) ttATTGCTTATACATGATCAAATACTTCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTa < 2:1239529/140‑1 (MQ=255) tATTGCTTATACATGATCAAATACTTCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTAc < 1:1207689/140‑1 (MQ=255) cTTATACATGATCAAATACTTCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTg > 2:901027/1‑140 (MQ=255) tataCATGATCAAATACTTCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGa > 2:1569532/1‑125 (MQ=255) aTCAAATACTTCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTtgtg > 2:5528/1‑140 (MQ=255) aTCAAATACTTCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTtgtg < 1:1542201/140‑1 (MQ=255) aTCAAATACTTCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTtgtg > 1:695667/1‑140 (MQ=255) aTCAAATACTTCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAACCTGGAAAGTGGAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTtgtg > 2:1457646/1‑140 (MQ=17) tCAAATACTTCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGc > 2:348094/1‑140 (MQ=255) aaTACTTCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGt > 1:1451323/1‑140 (MQ=255) aaTACTTCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGt > 1:169164/1‑140 (MQ=255) aTACTTCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGtt < 1:1339703/140‑1 (MQ=37) aCTTCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTAt < 2:719982/140‑1 (MQ=37) aCTTCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAACCTGGAAAGTGGAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTAt < 2:389167/140‑1 (MQ=17) ttcttACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTAttt > 2:1297064/1‑140 (MQ=37) tcttACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTc < 1:21399/140‑1 (MQ=25) tcttACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTc < 1:384535/140‑1 (MQ=25) tcttACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTc > 2:1094533/1‑140 (MQ=37) cttACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTtgtg < 2:941088/129‑1 (MQ=25) cttACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTtgtg > 1:941088/1‑129 (MQ=25) cttACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTAttctg > 1:764809/1‑137 (MQ=25) cttACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCt > 1:1383112/1‑140 (MQ=25) cttACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCt > 1:1642368/1‑140 (MQ=21) cttACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCt > 1:1069599/1‑140 (MQ=25) cttACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCt > 2:1138967/1‑140 (MQ=25) cttACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCt > 1:1016489/1‑140 (MQ=25) cttACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCt > 1:409248/1‑140 (MQ=25) cttACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCt > 1:413198/1‑140 (MQ=21) cttACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCt > 2:1269864/1‑140 (MQ=21) cttACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCt > 2:1482047/1‑140 (MQ=21) cttACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCt > 1:572816/1‑140 (MQ=25) cttACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCt > 1:1251032/1‑140 (MQ=21) tAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCa < 2:1451323/140‑1 (MQ=17) tAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCa < 2:1633690/140‑1 (MQ=17) aTTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCa > 2:1412797/1‑138 (MQ=17) aTTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCa < 1:1412797/138‑1 (MQ=17) aTTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGa < 2:409248/140‑1 (MQ=17) ttAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGaa < 1:348094/140‑1 (MQ=17) tAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAg > 2:1080083/1‑140 (MQ=17) aGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGc < 2:1642368/140‑1 (MQ=18) aGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGc < 1:1482047/140‑1 (MQ=18) aGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGc < 2:1069599/140‑1 (MQ=18) aGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGc > 1:1632514/1‑140 (MQ=18) aGGAGAACAAAATGGAAATTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGc < 1:1135074/140‑1 (MQ=18) gagaACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTg > 2:1033933/1‑140 (MQ=21) aaCAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAgg > 1:1132800/1‑134 (MQ=17) aaCAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAgg < 2:1132800/134‑1 (MQ=17) aaCAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGc < 2:297377/135‑1 (MQ=18) aaCAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGc > 1:297377/1‑135 (MQ=18) aaCAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGa > 1:1379615/1‑140 (MQ=21) aaCAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGa < 2:1379615/140‑1 (MQ=21) aaCAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGa < 2:1016489/140‑1 (MQ=25) aaCAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGa > 1:627883/1‑140 (MQ=21) aaCAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGa > 1:495535/1‑140 (MQ=21) aaCAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGa > 1:263002/1‑140 (MQ=21) cAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTggg > 1:505478/1‑137 (MQ=21) cAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGAAg > 2:854396/1‑140 (MQ=21) aaCTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGc < 1:262099/125‑1 (MQ=18) ttAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGAAGATATAGAGGAt > 2:1336320/1‑140 (MQ=21) aaaaaaTTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGAAGATATAGAGGAttt < 1:156331/140‑1 (MQ=25) aaaaaaTTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGAAGATATAGAGGAttt < 1:1297064/140‑1 (MQ=25) aTTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGAAGATATAGAGGATTTTgggg < 1:361545/140‑1 (MQ=25) tattatCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGAttttt < 2:169164/140‑1 (MQ=21) attatCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGAtttttt > 1:727538/1‑140 (MQ=21) ttatCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGATTTTTTg > 1:1246408/1‑140 (MQ=25) ttatCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGATTTTTTg < 2:495535/140‑1 (MQ=21) ttatCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGATTTTTTg > 2:1387015/1‑140 (MQ=37) tatCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGATTTTTTGa < 2:1246408/140‑1 (MQ=21) atCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGATTTTTTGaa > 1:1242256/1‑140 (MQ=37) tCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGATTTTTTGAAg > 1:69153/1‑140 (MQ=37) tCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGATTTTTTGAAg > 2:330855/1‑140 (MQ=37) tCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGATTTTTTGAAg > 1:1215811/1‑140 (MQ=37) tCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGATTTTTTGAAg > 2:443689/1‑140 (MQ=37) ccccGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGATTTTTTGAAGc < 2:627883/140‑1 (MQ=21) cccGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGa > 2:214834/1‑128 (MQ=37) cccGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGATTTTTTGAAGCa > 1:1499158/1‑140 (MQ=37) cccGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGA‑TTTTTGAAGCaa > 2:541797/1‑140 (MQ=255) cGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGATTTTTTGAAGCAat > 1:292146/1‑140 (MQ=37) gATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGATTTTTTGAAGCAata > 2:852282/1‑140 (MQ=37) gATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGATTTTTTGAAGCAata < 2:413198/140‑1 (MQ=21) cAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGATTTTTTGAAGCAATATGGTg < 2:1398416/140‑1 (MQ=21) cAGACAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGATTTTTTGAAGCAATATGGTg < 2:1242256/140‑1 (MQ=21) aCAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGAtt > 1:1607660/1‑140 (MQ=37) aCAAGCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGAtt > 1:1280806/1‑140 (MQ=37) gCCTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGa > 2:135928/1‑140 (MQ=25) ccTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGaa > 2:675480/1‑140 (MQ=21) ccTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGaa < 2:720320/140‑1 (MQ=21) ccTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGaa > 2:766969/1‑140 (MQ=21) ccTGGAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGaa > 1:1038996/1‑140 (MQ=21) ggAAAGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAAt > 1:1204135/1‑140 (MQ=21) aaaGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATgg > 1:472185/1‑140 (MQ=21) aGTGTAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTa < 2:1590700/140‑1 (MQ=18) | ATTACCTGAAGCTGTTTTTTATTGCTTATACATGATCAAATACTTCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGCTGGGAAGATATAGAGGATTTTGGGGAAACACATCCCGATTTTTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTAT > NC_000913/738024‑738294 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |