| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,649,898 | Δ1 bp | coding (105/192 nt) | ydfD → | Qin prophage; lysis protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,649,898 | 0 | A | . | 97.9% | 387.4 / 2.7 | 97 | coding (105/192 nt) | ydfD | Qin prophage; lysis protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/1); new base . (46/49); total (47/50) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.89e-01 | |||||||||||
GTTTACGTCTGATGCCAAAAGGATGTGCACAATGAATTCAGCATTTGTGCTTGTTCTGACAGTTTTTCTTGTTTCCGGAGAGCCAGTTGATATTGCAGTCAGTGTTCACAGGACAATGCAGGAGTGTATGACTGCAGCAACCGAACAGAAAATTCCCGGTAACTGTTACCCGGTCGATAAAGTTATTCACCAGGATAATATCGAAATCCCGGCAGGTCTTTAAAACAGTTCCGTAATAAATATCCGGTTTCATTCTTATATGCCAGCAA > NC_000913/1649763‑1650031 | gTTTACGTCTGATGCCAAAAGGATGTGCACAATGAATTCAGCATTTGTGCTTGTTCTGACAGTTTTTCTTGTTTCCGGAGAGCCAGTTGATATTGCAGTCAGTGTTCACAGGACAATGCAGGAGTGTATGACTGC‑GCAAc < 2:315060/140‑1 (MQ=255) tttACGTCTGATGCCAAAAGGATGTGCACAATGAATTCAGCATTTGTGCTTGTTCTGACAGTTTTTCTTGTTTCCGGAGAGCCAGTTGATATTGCAGTCAGTGTTCACAGGACAATGCAGGAGTGTATGACTGC‑GCAAcc > 1:1216977/1‑140 (MQ=255) tttACGTCTGATGCCAAAAGGATGTGCACAATGAATTCAGCATTTGTGCTTGTTCTGACAGTTTTTCTTGTTTCCGGAGAGCCAGTTGATATTGCAGTCAGTGTTCACAGGACAATGCAGGAGTGTATGACTGC‑GCAAcc > 1:2048418/1‑140 (MQ=255) gATGCCAAAAGGATGTGCACAATGAATTCAGCATTTGTGCTTGTTCTGACAGTTTTTCTTGTTTCCGGAGAGCCAGTTGATATTGCAGTCAGTGTTCACAGGACAATGCAGGAGTGTATGACTGC‑GCAACCGAACAGaaa > 1:1026959/1‑140 (MQ=255) gATGCCAAAAGGATGTGCACAATGAATTCAGCATTTGTGCTTGTTCTGACAGTTTTTCTTGTTTCCGGAGAGCCAGTTGATATTGCAGTCAGTGTTCACAGGACAATGCAGGAGTGTATGACTGC‑GCAACCGAACAGaaa > 2:176899/1‑140 (MQ=255) aTGCCAAAAGGATGTGCACAATGAATTCAGCATTTGTGCTTGTTCTGACAGTTTTTCTTGTTTCCGGAGAGCCAGTTGATATTGCAGTCAGTGTTCACAGGACAATGCAGGAGTGTATGACTGC‑GCAACCGAACAGaaaa < 2:1026959/140‑1 (MQ=255) cAAAAGGATGTGCACAATGAATTCAGCATTTGTGCTTGTTCTGACAGTTTTTCTTGTTTCCGGAGAGCCAGTTGATATTGCAGTCAGTGTTCACAGGACAATGCAGGAGTGTATGACTGC‑GCAACCGAACAGAAAATTcc < 2:241601/140‑1 (MQ=255) aaaaGGATGTGCACAATGAATTCAGCATTTGTGCTTGTTCTGACAGTTTTTCTTGTTTCCGGAGAGCCAGTTGATATTGCAGTCAGTGTTCACAGGACAATGCAGGAGTGTATGACTGC‑GCAACCGAACAGAAAAtt < 2:993297/137‑1 (MQ=255) aaaaGGATGTGCACAATGAATTCAGCATTTGTGCTTGTTCTGACAGTTTTTCTTGTTTCCGGAGAGCCAGTTGATATTGCAGTCAGTGTTCACAGGACAATGCAGGAGTGTATGACTGC‑GCAACCGAACAGAAAAtt > 1:993297/1‑137 (MQ=255) aaGGATGTGCACAATGAATTCAGCATTTGTGCTTGTTCTGACAGTTTTTCTTGTTTCCGGAGAGCCAGTTGATATTGCAGTCAGTGTTCACAGGACAATGCAGGAGTGTATGACTGC‑GCAACCGAACAGAAAATTCCCgg > 2:49217/1‑140 (MQ=255) aaGGATGTGCACAATGAATTCAGCATTTGTGCTTGTTCTGACAGTTTTTCTTGTTTCCGGAGAGCCAGTTGATATTGCAGTCAGTGTTCACAGGACAATGCAGGAGTGTATGACTGC‑GCAACCGAACAGAAAATTCCCgg < 1:1589275/140‑1 (MQ=255) aGGATGTGCACAATGAATTCAGCATTTGTGCTTGTTCTGACAGTTTTTCTTGTTTCCGGAGAGCCAGTTGATATTGCAGTCAGTGTTCACAGGACAATGCAGGAGTGTATGACTGC‑GCAACCGAACAGAAAATTCCCGGt < 1:49217/140‑1 (MQ=255) aGGATGTGCACAATGAATTCAGCATTTGTGCTTGTTCTGACAGTTTTTCTTGTTTCCGGAGAGCCAGTTGATATTGCAGTCAGTGTTCACAGGACAATGCAGGAGTGTATGACTGC‑GCAACCGAACAGAAAATTCCCGGt < 1:201700/140‑1 (MQ=255) aTGTGCACAATGAATTCAGCATTTGTGCTTGTTCTGACAGTTTTTCTTGTTTCCGGAGAGCCAGTTGATATTGCAGTCAGTGTTCACAGGACAATGCAGGAGTGTATGACTGC‑GCAACCGAACAGAAAATTCCCGGTAAc > 2:959336/1‑140 (MQ=255) aTGTGCACAATGAATTCAGCATTTGTGCTTGTTCTGACAGTTTTTCTTGTTTCCGGAGAGCCAGTTGATATTGCAGTCAGTGTTCACAGGACAATGCAGGAGTGTATGACTGC‑GCAACCGAACAGAAAATTCCCGGTAAc < 1:770276/140‑1 (MQ=255) tgtgCACAATGAATTCAGCATTTGTGCTTGTTCTGACAGTTTTTCTTGTTTCCGGAGAGCCAGTTGATATTGCAGTCAGTGTTCACAGGACAATGCAGGAGTGTATGACTGC‑GCAACCGAACAGAAAATTCCCGGTAACt > 1:1837532/1‑140 (MQ=255) tgtgCACAATGAATTCAGCATTTGTGCTTGTTCTGACAGTTTTTCTTGTTTCCGGAGAGCCAGTTGATATTGCAGTCAGTGTTCACAGGACAATGCAGGAGTGTATGACTGC‑GCAACCGAACAGAAAATTCCCGGTAACt > 1:2115037/1‑140 (MQ=255) cacaATGAATTCAGCATTTGTGCTTGTTCTGACAGTTTTTCTTGTTTCCGGAGAGCCAGTTGATATTGCAGTCAGTGTTCACAGGACAATGCAGGAGTGTATGACTGC‑GCAACCGAACAGAAAATTCCCGGTAACTGTTa > 1:704674/1‑140 (MQ=255) ccaATGAATTCAGCATTTGTGCTTGTTCTGACAGTTTTTCTTGTTTCCGGAGAGCCAGTTGATATTGCAGTCAGTGTTCACAGGACAATGCAGGAGTGTATGACTGC‑GCAACCGAACAGAAAATTCCCGGTAACTGTTAc < 2:245187/139‑1 (MQ=255) acaATGAATTCAGCATTTGTGCTTGTTCTGACAGTTTTTCTTGTTTCCGGAGAGCCAGTTGATATTGCAGTCAGTGTTCACAGGACAATGCAGGAGTGTATGACTGC‑GCAACCGAACAGAAAATTCCCGGTAACTGTTAc < 2:323773/140‑1 (MQ=255) aaTGAATTCAGCATTTGTGCTTGTTCTGACAGTTTTTCTTGTTTCCGGAGAGCCAGTTGATATTGCAGTCAGTGTTCACAGGACAATGCAGGAGTGTATGACTGC‑GCAACCGAACAGAAAATTCCCGGt < 2:1241447/129‑1 (MQ=255) aaTGAATTCAGCATTTGTGCTTGTTCTGACAGTTTTTCTTGTTTCCGGAGAGCCAGTTGATATTGCAGTCAGTGTTCACAGGACAATGCAGGAGTGTATGACTGC‑GCAACCGAACAGAAAATTCCCGGt > 1:1241447/1‑129 (MQ=255) aTGAATTCAGCATTTGTGCTTGTTCTGACAGTTTTTCTTGTTTCCGGAGAGCCAGTTGATATTGCAGTCAGTGTTCACAGGACAATGCAGGAGTGTATGACTGC‑GCAACCGAACAGAAAATTCCCGGTAACTGTTACCCg > 1:2022560/1‑140 (MQ=255) tGAATTCAGCATTTGTGCTTGTTCTGACAGTTTTTCTTGTTTCCGGAGAGCCAGTTGATATTGCAGTCAGTGTTCACAGGACAATGCAGGAGTGTATGACTGC‑GCAACCGAACAGAAAATTCCCGGt < 1:1000796/127‑1 (MQ=255) tGAATTCAGCATTTGTGCTTGTTCTGACAGTTTTTCTTGTTTCCGGAGAGCCAGTTGATATTGCAGTCAGTGTTCACAGGACAATGCAGGAGTGTATGACTGC‑GCAACCGAACAGAAAATTCCCGGt > 2:1000796/1‑127 (MQ=255) aaTACAGCATTTGTGCTTGTTCTGACAGCTTTTCTTGTTTCCGGAGAGCCAGTTGATATTGCAGTCAGTGTTCACAGGACAATGCAGGAGTGTATGACTGC‑GCAACCGAACAGAAAATTCCCGGTAACTGTTACCCGGTc < 2:1914654/140‑1 (MQ=255) gCATTTGTGCTTGTTCTGACAGTTTTTCTTGTTTCCGGAGAGCCAGTTGATATTGCAGTCAGTGTTCACAGGACAATGCAGGAGTGTATGACTGC‑GCAACCGAACAGAAAATTCCCGGTAACTGTTACCCGGTCGATaaa > 2:88977/1‑140 (MQ=255) aTTTGTGCTTGTTCTGACAGTTTTTCTTGTTTCCGGAGAGCCAGTTGATATTGCAGTCAGTGTTCACAGGACAATGCAGGAGTGTATGACTGC‑GCAACCGAACAGAAAATTCCCGGTAACTGTTACCCGGTCGATAAAGt > 2:1604559/1‑140 (MQ=255) ttGTGCTTGTTCTGACATTTTTTCTTGTTTCCGGAGAGCCAGTTGATATTGCAGTCAGTGTTCACAGGACAATGCAGGAGTGTATGACTGC‑GCAACCGAACAGAAAATTCCCGGTAACTGTTACCCGGTCGATAAAGTTa > 2:1002600/1‑140 (MQ=255) ttGTGCTTGTTCTGACAGTTTTTCTTGTTTCCGGAGAGCCAGTTGATATTGCAGTCAGTGTTCACAGGACAATGCAGGAGTGTATGACTGC‑GCAACCGAACAGAAAATTCCCGGTAACTGTTACCCGGTCGATa < 1:1994197/134‑1 (MQ=255) ttGTGCTTGTTCTGACAGTTTTTCTTGTTTCCGGAGAGCCAGTTGATATTGCAGTCAGTGTTCACAGGACAATGCAGGAGTGTATGACTGC‑GCAACCGAACAGAAAATTCCCGGTAACTGTTACCCGGTCGATa > 2:1994197/1‑134 (MQ=255) ttGTGCTTGTTCTGACAGTTTTTCTTGTTTCCGGAGAGCCAGTTGATATTGCAGTCAGTGTTCACAGGACAATGCAGGAGTGTATGACTGC‑GCAACCGAACAGAAAATTCCCGGTAACTGTTACCCGGTCGATAAAGTTa < 1:841964/140‑1 (MQ=255) ttGTGCTTGTTCTGACAGTTTTTCTTGTTTCCGGAGAGCCAGTTGATATTGCAGTCAGTGTTCACAGGACAATGCAGGAGTGTATGACTGC‑GCAACCGAACAGAAAATTCCCGGTAACTGTTACCCGGTCGATAAAGTTa > 2:115753/1‑140 (MQ=255) ttGTGCTTGTTCTGACAGTTTTTCTTGTTTCCGGAGAGCCAGTTGATATTGCAGTCAGTGTTCACAGGACAATGCAGGAGTGTATGACTGC‑GCAACCGAACAGAAAATTCCCGGTAACTGTTACCCGGTCGATAAAGTTa < 1:1639652/140‑1 (MQ=255) gtgCTTGTTCTGACAGTTTTTCTTGTTTCCGGAGAGCCAGTTGATATTGCAGTCAGTGTTCACAGGACAATGCAGGAGTGTATGACTGC‑GCAACCGAACAGAAAATTCCCGGTAACTGTTACCCGGTCGATAAAGTTAtt > 1:1836803/1‑140 (MQ=255) gtgCTTGTTCTGACAGTTTTTCTTGTTTCCGGAGAGCCAGTTGATATTGCAGTCAGTGTTCACAGGACAATGCAGGAGTGTATGACTGC‑GCAACCGAACAGAAAATTCCCGGTAACTGTTACCCGGTCGATAAAGTTAtt < 2:1181044/140‑1 (MQ=255) cTTGTTCTGACAGTTTTTCTTGTTTCCGGAGAGCCAGTTGATATTGCAGTCAGTGTTCACAGGACAATGCAGGAGTGTATGACTGC‑GCAACCGAACAGAAAATTCCCGGTAACTGTTACCCGGTCGATAAAGTTATTCAc > 2:291941/1‑140 (MQ=255) gTTCTGACAGTTTTTCTTGTTTCCGGAGAGCCAGTTGATATTGCAGTCAGTGTTCACAGGACAATGCAGGAGTGTATGACTGC‑GCAACCGAACAGAAAATTCCCGGTAACTGTTACCCGGTCGATAAAGTTATTCACCAg > 2:666072/1‑140 (MQ=255) ttCTGACAGTTTTTCTTGTTTCCGGAGAGCCAGTTGATATTGCAGTCAGTGTTCACAGGACAATGCAGGAGTGTATGACTGC‑GCAACCGAACAGAAAATTCCCGGTAACTGTTACCCGGTCGATAAAGTTATTCACCAgg > 1:554960/1‑140 (MQ=255) tCTGACAGTTTTTCTTGTTTCCGGAGAGCCAGTTGATATTGCAGTCAGTGTTCACAGGACAATGCAGGAGTGTATGACTGC‑GCAACCGAACAGAAAATTCCCGGTAACTGTTACCCGGTCGATAAAGTTATTCACCAGGa > 1:1033270/1‑140 (MQ=255) tCTGACAGTTTTTCTTGTTTCCGGAGAGCCAGTTGATATTGCAGTCAGTGTTCACAGGACAATGCAGGAGTGTATGACTGC‑GCAACCGAACAGAAAATTCCCGGTAACTGTTACCCGGTCGATAAAGTTATTCACCAGGa < 2:2115037/140‑1 (MQ=255) gACAGTTTTTCTTGTTTCCGGAGAGCCAGTTGATATTGCAGTCAGTGTTCACAGGACAATGCAGGAGTGTATGACTGC‑GCAACCGAACAGAAAATTCCCGGTAACTGTTACCCGGTCGATAAAGTTATTCACCAGGataa > 1:1333419/1‑140 (MQ=255) cAGTTTTTCTTGTTTCCGGAGAGCCAGTTGATATTGCAGTCAGTGTTCACAGGACAATGCAGGAGTGTATGACTGC‑GCAACCGAACAGAAAATTCCCGGTAACTGTTACCCGGTCGATAAAGTTATTCACCAGGataata > 2:1407799/1‑140 (MQ=255) tttttCTTGTTTCCGGAGAGCCAGTTGATATTGCAGTCAGTGTTCACAGGACAATGCAGGAGTGTATGACTGC‑GCAACCGAACAGAAAATTCCCGGTAACTGTTACCCGGTCGATAAAGTTATTCACCAGGATAATATCg > 2:2097047/1‑140 (MQ=255) tttttCTTGTTTCCGGAGAGCCAGTTGATATTGCAGTCAGTGTTCACAGGACAATGCAGGAGTGTATGACTGC‑GCAACCGAACAGAAAATTCCCGGTAACTGTTACCCGGTCGATAAAGTTATTCACCAGGATAATATCg > 1:392425/1‑140 (MQ=255) tttCTTGTTTCCGGAGAGCCAGTTGATATTGCAGTCAGTGTTCACAGGACAATGCAGGAGTGTATGACTGC‑GCAACCGAACAGAAAATTCCCGGTAACTGTTACCCGGTCGATAAAGTTATTCACCAGGATAATATCGaa < 1:291941/140‑1 (MQ=255) ttGTTTCCGGAGAGCCAGTTGATATTGCAGTCAGTGTTCACAGGACAATGCAGGAGTGTATGACTGC‑GCAACCGAACAGAAAATTCCCGGTAACTGTTACCCGGTCGATAAAGTTATTCACCAGGATAATATCGAAATcc > 1:2111895/1‑140 (MQ=255) tttCCGGAGAGCCAGTTGATATTGCAGTCAGTGTTCACAGGACAATGCAGGAGTGTATGACTGC‑GCAACCGAACAGAAAATTCCCGGTAACTGTTACCCGGTCGATAAAGTTATTCACCAGGATAATATCGAAATCCCgg < 2:1008370/140‑1 (MQ=255) ttCCGGAGAGCCAGTTGATATTGCAGTCAGTGTTCACAGGACAATGCAGGAGTGTATGACTGC‑GCAACCGAACAGAAAATTCCCGGTAACTGTTACCCGGTCGATAAAGTTATTCACCAGGATAATATCGAAATCCCGGc > 2:77974/1‑140 (MQ=255) ccGGAGAGCCAGTTGATATTGCAGTCAGTGTTCACAGGACAATGCAGGAGTGTATGACTGC‑GCAACCGAACAGAAAATTCCCGGTAACTGTTACCCGGTCGATAAAGTTATTCACCAGGATAATATCGAAATCCCGGCAg < 2:1216977/140‑1 (MQ=255) ccGGAGAGCCAGTTGATATTGCAGTCAGTGTTCACAGGACAATGCAGGAGTGTATGACTGC‑GCAACCGAACAGAAAATTCCCGGTAACTGTTACCCGGTCGATAAAGTTATTCACCAGGATAATATCGAAATCCCGGCAg < 2:2048418/140‑1 (MQ=255) ccGGAGAGCCAGTTGATATTGCAGTCAGTGTTCACAGGACAATGCAGGAGTGTATGACTGC‑GCAACCGAACAGAAAATTCCCGGTAACTGTTACCCGGTCGATAAAGTTATTCACCAGGATAATATCGAAATCCCGGCAg < 2:2022560/140‑1 (MQ=255) ccGGAGAGCCAGTTGATATTGCAGTCAGTGTTCACAGGACAATGCAGGAGTGTATGACTGC‑GCAACCGAACAGAAAATTCCCGGTAACTGTTACCCGGTCGATAAAGTTATTCACCAGGATAATATCGAAATCCCGGCAg < 1:1431526/140‑1 (MQ=255) ccGGAGAGCCAGTTGATATTGCAGTCAGTGTTCACAGGACAATGCAGGAGTGTATGACTGC‑GCAACCGAACAGAAAATTCCCGGTAACTGTTACCCGGTCGATAAAGTTATTCACCAGGATAATATCGAAATCCCGGCAg < 2:1836803/140‑1 (MQ=255) ccGGAGAGCCAGTTGATATTGCAGTCAGTGTTCACAGGACAATGCAGGAGTGTATGACTGC‑GCAACCGAACAGAAAATTCCCGGTAACTGTTACCCGGTCGATAAAGTTATTCACCAGGATAATATCGAAATCCCGGCAg < 2:1613423/140‑1 (MQ=255) gagCCAGTTGATATTGCAGTCAGTGTTCACAGGACAATGCAGGAGTGTATGACTGC‑GCAACCGAACAGAAAATTCCCGGTAACTGTTACCCGGTCGATAAAGTTATTCACCAGGATAATATCGAAATCCCGGCAGGTCtt < 1:959336/140‑1 (MQ=255) aGTTGATATTGCAGTCAGTGTTCACAGGACAATGCAGGAGTGTATGACTGC‑GCAACCGAACAGAAAATTCCCGGTAACTGTTACCCGGTCGATAAAGTTATTCACCAGGATAATATCGAAATCCCGGCAGGTCTTTaaaa < 1:88977/140‑1 (MQ=255) aGTTGATATTGCAGTCAGTGTTCACAGGACAATGCAGGAGTGTATGACTGC‑GCAACCGAACAGAAAATTCCCGGTAACTGTTACCCGGTCGATAAAGTTATTCACCAGGATAATATCGAAATCCCGGCAGGTCTTTaaaa < 1:2097047/140‑1 (MQ=255) gTTGATATTGCAGTCAGTGTTCACAGGACAATGCAGGAGTGTATGACTGCAGCAACCGAACAGAAAATTCCCGGTAACTGTTACCCGGTCGATAAAGTTATTCACCAGGATAATATCGAAATCCCGGCAGGTCTTTaaaa < 2:757521/140‑1 (MQ=255) atatTGCAGTCAGTGTTCACAGGACAATGCAGGAGTGTATGACTGC‑GCAACCGAACAGAAAATTCCCGGTAACTGTTACCCGGTCGATAAAGTTATTCACCAGGATAATATCGAAATCCCGGCAGGTCTTTAAAACAGtt < 1:1604559/140‑1 (MQ=255) atatTGCAGTCAGTGTTCACAGGACAATGCAGGAGTGTATGACTGC‑GCAACCGAACAGAAAATTCCCGGTAACTGTTACCCGGTCGATAAAGTTATTCACCAGGATAATATCGAAATCCCGGCAGGTCTTTAAAACAGtt < 2:2111895/140‑1 (MQ=255) atTGCAGTCAGTGTTCACAGGACAATGCAGGAGTGTATGACTGC‑GCAACCGAACAGAAAATTCCCGGTAACTGTTACCCGGTCGATAAAGTTATTCACCAGGATAATATCGAAATCCCGGCAGGTCTTTAAAACAGTTcc < 1:1481408/140‑1 (MQ=255) atTGCAGTCAGTGTTCACAGGACAATGCAGGAGTGTATGACTGC‑GCAACCGAACAGAAAATTCCCGGTAACTGTTACCCGGTCGATAAAGTTATTCACCAGGATAATATCGAAATCCCGGCAGGTCTTTAAAACAGTTcc > 1:195163/1‑140 (MQ=255) agtcagtGTTCACAGGACAATGCAGGAGTGTATGACTGC‑GCAACCGAACAGAAAATTCCCGGTAACTGTTACCCGGTCGATAAAGTTATTCACCAGGATAATATCGAAATCCCGGCAGGTCTTTAAAACAGTTCCg > 2:1758007/1‑136 (MQ=255) agtcagtGTTCACAGGACAATGCAGGAGTGTATGACTGC‑GCAACCGAACAGAAAATTCCCGGTAACTGTTACCCGGTCGATAAAGTTATTCACCAGGATAAAATCGAAATCCCGGCAGGTCTTTAAAACAGTTCCg < 1:1758007/136‑1 (MQ=255) tcagtGTTCACAGGACAATGCAGGAGTGTATGACTGC‑GCAACCGAACAGAAAATTCCCGGTAACTGTTACCCGGTCGATAAAGTTATTCACCAGGATAATATCGAAATCCCGGCAGGTCTTTAAAACAGt < 2:1521149/130‑1 (MQ=255) tcagtGTTCACAGGACAATGCAGGAGTGTATGACTGC‑GCAACCGAACAGAAAATTCCCGGTAACTGTTACCCGGTCGATAAAGTTATTCACCAGGATAATATCGAAATCCCGGCAGGTCTTTAAAACAGt > 1:1521149/1‑130 (MQ=255) agtGTTCACAGGACAATGCAGGAGTGTATGACTGC‑GCAACCGAACAGAAAATTCCCGGTAACTGTTACCCGGTCGATAAAGTTATTCACCAGGATAATATCGAAATCCCGGCAGGTCTTTAAAACAGTTcc > 1:1934181/1‑131 (MQ=255) agtGTTCACAGGACAATGCAGGAGTGTATGACTGC‑GCAACCGAACAGAAAATTCCCGGTAACTGTTACCCGGTCGATAAAGTTATTCACCAGGATAATATCGAAATCCCGGCAGGTCTTTAAAACAGTTcc < 2:1934181/131‑1 (MQ=255) agtGTTCACAGGACAATGCAGGAGTGTATGACTGC‑GCAACCGAACAGAAAATTCCCGGTAACTGTTACCCGGTCGATAAAGTTATTCACCAGGATAATATCGAAATCCCGGCAGGTCTTTAAAACAGTTCCGTaataaat > 2:1582973/1‑140 (MQ=255) tgtTCACAGGACAATGCAGGAGTGTATGACTGC‑GCAACCGAACAGAAAATTCCCGGTAACTGTTACCCGGTCGATAAAGTTATTCACCAGGATAATATCGAAATCCCGGCAGGTCTTTAAAACAGTTCCGTAATAAatat < 1:115753/140‑1 (MQ=255) tgtTCACAGGACAATGCAGGAGTGTATGACTGC‑GCAACCGAACAGAAAATTCCCGGTAACTGTTACCCGGTCGATAAAGTTATTCACCAGGATAATATCGAAATCCCGGCAGGTCTTTAAAACAGTTCCGTAATAAatat < 1:1002600/140‑1 (MQ=255) gtTCACAGGACAATGCAGGAGTGTATGACTGC‑GCAACCGAACAGAAAATTCCCGGTAACTGTTACCCGGTCGATAAAGTTATTCACCAGGATAATATCGAAATCCCGGCAGGTCTTTAAAACAGTTCCGTAATAAATATc > 1:884714/1‑140 (MQ=255) gtTCACAGGACAATGCAGGAGTGTATGACTGC‑GCAACCGAACAGAAAATTCCCGGTAACTGTTACCCGGTCGATAAAGTTATTCACCAGGATAATATCGAAATCCCGGCAGGTCTTTAAAACAGTTCCGTAATAAATATc < 2:884714/140‑1 (MQ=255) gtTCACAGGACAATGCAGGAGTGTATGACTGC‑GCAACCGAACAGAAAATTCCCGGTAACTGTTACCCGGTCGATAAAGTTATTCACCAGGATAATATCGAAATCCCGGCAGGTCTTTAAAACAGTTCCGTAATAAATATc < 1:176899/140‑1 (MQ=255) ggACAATGCAGGAGTGTATGACTGC‑GCAACCGAACAGAAAATTCCCGGTAACTGTTACCCGGTCGATAAAGTTATTCACCAGGATAATATCGAAATCCCGGCAGGTCTTTAAAACAGTTCCGTAATAAATATCCGGTTTc < 2:1333419/140‑1 (MQ=255) gACAATGCAGGAGTGTATGACTGC‑GCAACCGAACAGAAAATTCCCGGTAACTGTTACCCGGTCGATAAAGTTATTCACCAGGATAATATCGAAATCCCGGCAGGTCTTTAAAACAGTTCCGTAATAAATATCCGGTTTCa < 1:1582973/140‑1 (MQ=255) gACAATGCAGGAGTGTATGACTGC‑GCAACCGAACAGAAAATTCCCGGTAACTGTTACCCGGTCGATAAAGTTATTCACCAGGATAATATCGAAATCCCGGCAGGTCTTTAAAACAGTTCCGTAATAAATATCCGGTTTCa < 2:704674/140‑1 (MQ=255) aCAATGCAGGAGTGTATGACTGC‑GCAACCGAACAGAAAATTCCCGGTAACTGTTACCCGGTCGATAAAGTTATTCACCAGGATAATATCGAAATCCCGGCAGGTCTTTAAAACAGTTCCGTAATAAATATCCGGTTTCAt < 2:1519162/140‑1 (MQ=255) aCAATGCAGGAGTGTATGACTGC‑GCAACCGAACAGAAAATTCCCGGTAACTGTTACCCGGTCGATAAAGTTATTCACCAGGATAATATCGAAATCCCGGCAGGTCTTTAAAACAGTTCCGTAATAAATATCCGGTTTCAt > 1:33997/1‑140 (MQ=255) aCAATGCAGGAGTGTATGACTGC‑GCAACCGAACAGAAAATTCCCGGTAACTGTTACCCGGTCGATAAAGTTATTCACCAGGATAATATCGAAATCCCGGCAGGTCTTTAAAACAGTTCCGTAATAAATATCCGGTTTCAt < 2:554960/140‑1 (MQ=255) aCAATGCAGGAGTGTATGACTGC‑GCAACCGAACAGAAAATTCCCGGTAACTGTTACCCGGTCGATAAAGTTATTCACCAGGATAATATCGAAATCCCGGCAGGTCCTTAAAACAGTTCCGTAATAAATATCCGGTTTCAt > 2:1353676/1‑140 (MQ=255) tGCAGGAGTGTATGACTGC‑GCAACCGAACAGAAAATTCCCGGTAACTGTTACCCGGTCGATAAAGTTATTCACCAGGATAATATCGAAATCCCGGCAGGTCTTTAAAACAGTTCCGTAATAAATATCCGGTTTCATTCtt > 1:509750/1‑140 (MQ=255) tGCAGGAGTGTATGACTGC‑GCAACCGAACAGAAAATTCCCGGTAACTGTTACCCGGTCGATAAAGTTATTCACCAGGATAATATCGAAATCCCGGCAGGTCTTTAAAACAGTTCCGTAATAAATATCCGGTTTCATTCtt > 2:1674445/1‑140 (MQ=255) tGCAGGAGTGTATGACTGC‑GCAACCGAACAGAAAATTCCCGGTAACTGTTACCCGGTCGATAAAGTTATTCACCAGGATAATATCGAAATCCCGGCAGGTCTTTAAAACAGTTCCGTAATAAATATCCGGTTTCATTCtt > 2:959855/1‑140 (MQ=255) cAGGAGTGTATGACTGC‑GCAACCGAACAGAAAATTCCCGGTAACTGTTACCCGGTCGATAAAGTTATTCACCAGGATAATATCGAAATCCCGGCAGGTCTTTAAAACAGTTCCGTAATAAATATCCGGTTTCATTCTtat < 2:1837532/140‑1 (MQ=255) gAGTGTATGACTGC‑GCAACCGAACAGAAAATTCCCGGTAACTGTTACCCGGTCGATAAAGTTATTCACCAGGATAATATCGAAATCCCGGCAGGTCTTTAAAACAGTTCCGTAATAAATATCCGGTTTCATTCTTATATg > 2:1168568/1‑140 (MQ=255) gAGTGTATGACTGC‑GCAACCGAACAGAAAATTCCCGGTAACTGTTACCCGGTCGATAAAGTTATTCACCAGGATAATATCGAAATCCCGGCAGGTCTTTAAAACAGTTCCGTAATAAATATCCGGTTTCATTCTTATATg < 2:904207/140‑1 (MQ=255) gtgtATGACTGC‑GCAACCGAACAGAAAATTCCCGGTAACTGTTACCCGGTCGATAAAGTTATTCACCAGGATAATATCGAAATCCCGGCAGGTCTTTAAAACAGTTCCGTAATAAATATCCGGt < 2:1463517/124‑1 (MQ=255) gtgtATGACTGC‑GCAACCGAACAGAAAATTCCCGGTAACTGTTACCCGGTCGATAAAGTTATTCACCAGGATAATATCGAAATCCCGGCAGGTCTTTAAAACAGTTCCGTAATAAATATCCGGt > 1:1463517/1‑124 (MQ=255) tATGACTGCAGCAACCGAACAGAAAATTCCCGGTAACTGTTACCCGGTCGATAAAGTTATTCACCAGGATAATATCGAAATCCCGGCAGGTCTTTAAAACAGTTCCGTAATAAATATCCGGTTTCATTCTTATATGCCAg > 2:1926822/1‑140 (MQ=255) tATGACTGC‑GCAACCGAACAGAAAATTCCCGGTAACTGTTACCCGGTCGATAAAGTTATTCACCAGGATAATATCGAAATCCCGGCAGGTCTTTAAAACAGTTCCGTAATAAATATCCGGTTTc < 1:1493275/124‑1 (MQ=255) tATGACTGC‑GCAACCGAACAGAAAATTCCCGGTAACTGTTACCCGGTCGATAAAGTTATTCACCAGGATAATATCGAAATCCCGGCAGGTCTTTAAAACAGTTCCGTAATAAATATCCGGTTTc > 2:1493275/1‑124 (MQ=255) tATGACTGC‑GCAACCGAACAGAAAATTCCCGGTAACTGTTACCCGGTCGATAAAGTTATTCACCAGGATAATATCGAAATCCCGGCAGGTCTTTAAAACAGTTCCGTAATAAATATCCGGTTTCATTCTTATATGCCAGc > 2:1500009/1‑140 (MQ=255) tATGACTGC‑GCAACCGAACAGAAAATTCCCGGTAACTGTTACCCGGTCGATAAAGTTATTCACCAGGATAATATCGAAATCCCGGCAGGTCTTTAAAACAGTTCCGTAATAAATATCCGGTTTCATTCTTATATGCCAGc > 2:2006233/1‑140 (MQ=255) tATGACTGC‑GCAACCGAACAGAAAATTCCCGGTAACTGTTACCCGGTCGATAAAGTTATTCACCAGGATAATATCGAAATCCCGGCAGGTCTTTAAAACAGTTCCGTAATAAATATCCGGTTTCATTCTTATATGCCAGc > 1:1365601/1‑140 (MQ=255) tGACTGC‑GCAACCGAACAGAAAATTCCCGGTAACTGTTACCCGGTCGATAAAGTTATTCACCAGGATAATATCGAAATCCCGGCAGGTCTTTAAAACAGTTCCGTAATAAATATCCGGTTTCATTCTTATATGCCAGCaa < 1:666072/140‑1 (MQ=255) | GTTTACGTCTGATGCCAAAAGGATGTGCACAATGAATTCAGCATTTGTGCTTGTTCTGACAGTTTTTCTTGTTTCCGGAGAGCCAGTTGATATTGCAGTCAGTGTTCACAGGACAATGCAGGAGTGTATGACTGCAGCAACCGAACAGAAAATTCCCGGTAACTGTTACCCGGTCGATAAAGTTATTCACCAGGATAATATCGAAATCCCGGCAGGTCTTTAAAACAGTTCCGTAATAAATATCCGGTTTCATTCTTATATGCCAGCAA > NC_000913/1649763‑1650031 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |