| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,435,406 | G→T | L72M (CTG→ATG) | uspF ← | nucleotide binding filament protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,435,406 | 0 | G | T | 98.6% | 490.5 / ‑2.5 | 141 | L72M (CTG→ATG) | uspF | nucleotide binding filament protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base T (64/75); minor base C (1/1); total (65/76) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.52e-01 | |||||||||||
Only 100 of 144 total aligned reads displayed.
TCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGAATACGCTAAACCCAGAGAGGCATAGTAGGGCAGTGAAGGTATTACCGTCAGGAAATGAACCTCTGCATCATCAATCTTTGCCT > NC_000913/1435269‑1435540 | tCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAttt > 1:1446346/1‑140 (MQ=255) tGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCATTTGCGa > 2:2352813/1‑140 (MQ=255) aaTGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCATTTGCGATTTGGCtt < 1:855479/140‑1 (MQ=255) aaTGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCATTTGCGATTTGGCtt < 1:1778624/140‑1 (MQ=255) aaTGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCATTTGCGATTTGGCtt < 2:1128370/140‑1 (MQ=255) aaTGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCATTTGCGATTTGGCtt < 1:1374117/140‑1 (MQ=255) atgatCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCATTTGCGATTTGGCTTCCGc > 2:1016576/1‑140 (MQ=255) atCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCATTTGCGATTTGGCtt > 1:2111337/1‑133 (MQ=255) atCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCATTTGCGATTTGGCTTCCGCttt < 1:1411224/140‑1 (MQ=255) atCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCATTTGCGATTTGGCTTCCGCttt < 1:818013/140‑1 (MQ=255) atCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCATTTGCGATTTGGCTTCCGCttt > 1:1473847/1‑140 (MQ=255) tCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCATTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTc < 1:44689/140‑1 (MQ=255) gAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCATTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCa > 2:1212442/1‑140 (MQ=255) cGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCATTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTc < 1:1828442/131‑1 (MQ=255) cGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCATTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATcc > 2:676416/1‑140 (MQ=255) cGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCATTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATcc > 2:1424229/1‑140 (MQ=255) cGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCATTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATcc > 2:2179919/1‑140 (MQ=255) ggggATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCATTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCa < 2:1080339/140‑1 (MQ=255) gggATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCATTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCAt > 1:266423/1‑140 (MQ=255) gggATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCATTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCAt > 1:2415690/1‑140 (MQ=255) gggATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCATTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCAt > 1:566314/1‑140 (MQ=255) gggATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCATTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCAt > 2:920822/1‑140 (MQ=255) gggATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCACTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCAt > 2:1753523/1‑140 (MQ=255) ggATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCATTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCa < 1:1579016/138‑1 (MQ=255) ggATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCATTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCa > 2:1579016/1‑138 (MQ=255) ggATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCATTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCAtt > 2:1366835/1‑140 (MQ=255) aTCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCATTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGc > 1:1005567/1‑140 (MQ=255) aTCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCATTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGc > 1:1687953/1‑140 (MQ=255) aTCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCATTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGc > 1:2021984/1‑140 (MQ=255) cttcttCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCATTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCg > 1:459221/1‑140 (MQ=255) ttcttcGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCATTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCgg > 1:486405/1‑140 (MQ=255) cGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCATTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAAtt > 2:87655/1‑140 (MQ=255) ccAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCATTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCt < 1:177883/140‑1 (MQ=255) cAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCATTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTccg < 2:1128140/140‑3 (MQ=255) ttCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCATTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCgg > 2:838261/1‑140 (MQ=255) ttCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCATTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCgg > 1:2293553/1‑140 (MQ=255) ccAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCATTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGaa < 1:2179919/140‑1 (MQ=255) ccAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCATTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGaa < 1:1424229/140‑1 (MQ=255) tGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCATTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGAATACGCt < 1:773802/140‑1 (MQ=255) tGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCATTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGAATACGCt < 2:1818015/140‑1 (MQ=255) gCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCATTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGAATACGCTa < 2:1676159/140‑1 (MQ=255) ggTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCATTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGAATACGCTaaa < 1:18712/140‑1 (MQ=255) ggTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCATTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGAATACGCTaaa > 2:338511/1‑140 (MQ=255) ggTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCATTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGAATACGCTaaa > 1:225795/1‑140 (MQ=255) tCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATCTTTTAATGATCTCTTCCATTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGAATACGCTAAAcc > 2:722151/1‑140 (MQ=255) ttGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCATTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGAATACGCTAAACCCag < 2:1354228/140‑1 (MQ=255) ttGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCATTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGAATACGCTAAACCCag < 1:316739/140‑1 (MQ=255) gggCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCATTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGAATACGCTAAACCCagag < 2:2067736/140‑1 (MQ=255) ggCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCATTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGAATACGCTAAACCCagaga < 1:920822/140‑1 (MQ=255) cGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCATTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGAATACGCTAAACCCAGAGAgg < 2:1005567/140‑1 (MQ=255) cGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCATTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGAATACGCTAAACCCAGAGAgg < 1:1016576/140‑1 (MQ=255) aGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCATTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGAATACGCt < 1:1274646/125‑1 (MQ=255) aGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCATTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGAATACGCTAAACCCAGAGAGGCa > 2:2001562/1‑140 (MQ=255) ccTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCATTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGAATACGCTAAACCCAGAGAGGCAta > 2:2064665/1‑140 (MQ=255) ccTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCATTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGAATACGCTAAACCCAGAGAGGCAta > 1:373486/1‑140 (MQ=255) tCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCATTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGAATACGCTAAACCCAGAGAGGCAtagta < 2:225795/140‑1 (MQ=255) ccTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCATTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGAATACGCTAAACCCAGAGAGGCAtagtag < 1:875054/140‑1 (MQ=255) ccTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCATTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGAATACGCTAAACCCAGAGAGGCAtagtag < 1:1718458/140‑1 (MQ=255) tCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCATTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGAATACGCTAAACCCAGAGAGGCATAGTAggg < 1:1584065/140‑1 (MQ=255) tCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCATTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGAATACGCTAAACCCAGAGAGGCATAGTAggg < 2:373486/140‑1 (MQ=255) aaCATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCATTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGAATACGCTAAACCCAGAGAGGCATAGTAGGGCa < 2:2415690/140‑1 (MQ=255) aaCATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCATTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGAATACGCTAAACCCAGAGAGGCATAGTAGGGCa < 1:338511/140‑1 (MQ=255) 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ggACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCATTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGAATACGCTAAACCCAGAGAGGCATAGTAGGGCAGTGaa > 2:494737/1‑140 (MQ=255) gACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCATTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGAATACGCTAAACCCAGAGAgg < 1:2454574/122‑1 (MQ=255) gACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCATTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGAATACGCTAAACCCAGAGAgg > 2:2454574/1‑122 (MQ=255) aCATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCATTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGAATATGCTAAACCCAGAGAGGCATAGTAGGGCAGt < 1:639842/135‑1 (MQ=255) aCATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCATTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGAATATGCTAAACCCAGAGAGGCATAGTAGGGCAGt > 2:639842/1‑135 (MQ=255) aCATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCATTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGAATACGCTAAACCCAGAGAGGCATAGTAGGGCAGTGAAgg > 1:761377/1‑140 (MQ=255) 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tGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCATTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGAATACGCTAAACCCAGAGAGGCATAGTAGGGCAGTGAAGGTATTACCGTc > 1:1300641/1‑140 (MQ=255) tGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCATTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGAATACGCTAAACCCAGAGAGGCATAGTAGGGCAGTGAAGGTATTACCGTc > 2:2033228/1‑140 (MQ=255) tGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCATTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGAATACGCTAAACCCAGAGAGGCATAGTAGGGCAGTGAAGGTATTACCGTc > 1:688627/1‑140 (MQ=255) tGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCATTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGAATACGCTAAACCCAGAGAGGCATAGTAGGGCAGTGAAGGTATTACCGTc > 1:521246/1‑140 (MQ=255) gTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCATTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGAATACGCTAAACCCAGAGAGGCATAGTAGGGCAGTGAAGGTATTACCGTCa < 2:592667/140‑1 (MQ=255) cGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCATTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGAATACGCTAAACCCAGAGAGGCATAGTAGGGCAGTGAAGGTATTACCGTCAgg < 2:1160216/140‑1 (MQ=255) ggCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCATTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGAATACGCTAAACCCAGAGAGGCATAGTAGGGCAGTGAAGGTATTACCGTCAGGAAATg > 1:1998627/1‑140 (MQ=255) ggCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCATTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGAATACGCTAAACCCAGAGAGGCATAGTAGGGCAGTGAAGGTATTACCGTCAGGAAATg > 2:1212057/1‑140 (MQ=255) ggCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCATTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGAATACGCTAAACCCAGAGAGGCATAGTAGGGCAGTGAAGGTATTACCGTCAGGAAATg < 2:1990590/140‑1 (MQ=255) gTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCATTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGAATACGCTAAACCCAGAGAGGCATAGTAGGGCAGTGAAGGTATTACCGTCAGGAAATGAAcc < 2:1850717/140‑1 (MQ=255) aaaTTTTTTAATGATCTCTTCCATTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGAATACGCTAAACCCAGAGAGGCATAGTAGGGCAGTGAAGGTATTACCGTCAGGAAATGAACCTCTg < 2:1998627/140‑1 (MQ=255) aaaTTTTTTAATGATCTCTTCCATTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGAATACGCTAAACCCAGAGAGGCATAGTAGGGCAGTGAAGGTATTACCGTCAGGAAATGAACCTCTg < 2:688627/140‑1 (MQ=255) aaaTTTTTTAATGATCTCTTCCATTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGAATACGCTAAACCCAGAGAGGCATAGTAGGGCAGTGAAGGTATTACCGTCAGGAAATGAACCTCTg < 1:1212442/140‑1 (MQ=255) aaaTTTTTTAATGATCTCTTCCATTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGAATACGCTAAACCCAGAGAGGCATAGTAGGGCAGTGAAGGTATTACCGTCAGGAAATGAACCTCTg < 1:706677/140‑1 (MQ=255) aTTTTTTAATGATCTCTTCCATTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGAATACGCTAAACCCAGAGAGGCATAGTAGGGCAGTGAAGGTATTACCGTCAGGAAATGAACCTCTGca < 2:566314/140‑1 (MQ=255) tttAATGATCTCTTCCATTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGAATACGCTAAACCCAGAGAGGCATAGTAGGGCAGTGAAGGTATTACCGTCAGGAAATGAACCTCTGcatcat < 2:1687953/140‑1 (MQ=255) tttAATGATCTCTTCCATTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGAATACGCTAAACCCAGAGAGGCATAGTAGGGCAGTGAAGGTATTACCGTCAGGAAATGAACCTCTGcatcat < 2:2268925/140‑1 (MQ=255) ttAATGATCTCTTCCATTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGAATACGCTAAACCCAGAGAGGCATAGTAGGGCAGTGAAGGTATTACCGTCAGGAAATGAACCTCTGca > 2:1037801/1‑135 (MQ=255) ttAATGATCTCTTCCATTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGAATACGCTAAACCCAGAGAGGCATAGTAGGGCAGTGAAGGTATTACCGTCAGGAAATGAACCTCTGca < 1:1037801/135‑1 (MQ=255) tctcTTCCATTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGAATACGCTAAACCCAGAGAGGCATAGTAGGGCAGTGAAGGTATTACCGTCAGGAAATGAACCTCTGCATCATCAATCttt < 2:459221/140‑1 (MQ=255) | TCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTCATCCATTGCCGGTAATTCTGCGGAATACGCTAAACCCAGAGAGGCATAGTAGGGCAGTGAAGGTATTACCGTCAGGAAATGAACCTCTGCATCATCAATCTTTGCCT > NC_000913/1435269‑1435540 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |