| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | 2347281 = | NA (NA) | noncoding (34/34 nt) | other | REP164c | |||||
Only 100 of 148 total aligned reads displayed.
CAGCGTTGCCGATAAAATTGCTCAGCGCGATGCCAGCAGTATAGTGTTGCACAGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCT‑ATGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑GGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGT > NC_000913/377182‑377457 | tgagtgtgtcctgttgggagtttaatgccggataaggcattttacgccgcatcctgtgcctgatgcgacgctggcgcgtcttatcaggcctacaaatgctccccgtaggccggataaggcgtttacgccgcatccggcaa < 2:820552‑M1/2‑2 (MQ=255) aGCGTTGCCGATAAAATTGCTCAGCGCGATGCCAGCAGTATAGTGTTGCACAGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAg < 1:777529/140‑1 (MQ=255) gCGTTGCCGATAAAATTGCTCAGCGCGATGCCAGCAGTATAGTGTTGCACAGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGt > 1:778551/1‑140 (MQ=255) gCGTTGCCGATAAAATTGCTCAGCGCGATGCCAGCAGTATAGTGTTGCACAGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGt > 2:43937/1‑140 (MQ=255) gATAAAATTGCTCAGCGCGATGCCAGCAGTATAGTGTTGCACAGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGCCTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCa < 1:376881/140‑1 (MQ=255) gATAAAATTGCTCAGCGCGATGCCAGCAGTATAGTGTTGCACAGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCa < 1:542116/140‑1 (MQ=255) aaaaTTGCTCAGCGCGATGCCAGCAGTATAGTGTTGCACAGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGAt > 2:168595/1‑140 (MQ=255) aaaaTTGCTCAGCGCGATGCCAGCAGTATAGTGTTGCACAGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGAt > 1:537381/1‑140 (MQ=255) aaaaTTGCTCAGCGCGATGCCAGCAGTATAGTGTTGCACAGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGAt > 1:846410/1‑140 (MQ=255) aaaTTGCTCAGCGCGATGCCAGCAGTATAGTGTTGCACAGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATg > 1:824979/1‑140 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aGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCT‑ATGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑GGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCg < 2:689986/140‑1 (MQ=255) gTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCT‑ATGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑GGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGt < 2:745984/140‑1 (MQ=255) gCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCT‑ATGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑GGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTc < 1:594117/136‑1 (MQ=255) gCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGGGCGCAGATGCCTGATGCGACGCT‑ATGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑GGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTc > 2:594117/1‑136 (MQ=255) ccTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCT‑ATGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑GGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTgcg > 1:286048/1‑140 (MQ=255) ataaggcgtttacgccgcatccggcAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCT‑ATGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑GGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATg < 1:678300‑M1/115‑1 (MQ=255) gcgtttacgccgcatccggcAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCT‑ATGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑GGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGCATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCg > 2:295499‑M1/21‑126 (MQ=255) aTGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCT‑ATGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑GGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATg < 2:438530/140‑1 (MQ=255) tgtgGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCT‑ATGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑GGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGc < 1:657279/140‑1 (MQ=255) ttacgccgcatccggcAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCT‑ATGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑GGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCg < 2:349744‑M1/124‑1 (MQ=255) ttacgccgcatccggcAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCT‑ATGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑GGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCg > 1:854491‑M1/17‑140 (MQ=255) ttacgccgcatccggcAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCT‑ATGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑GGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCg > 2:246093‑M1/17‑140 (MQ=255) gtgGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCT‑ATGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑GGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGc < 1:882956/140‑1 (MQ=255) gtgGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCT‑ATGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑GGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCg < 2:94585/140‑1 (MQ=255) gtgGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCT‑ATGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑GGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCg > 1:246827/1‑140 (MQ=255) tacgccgcatccggcAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCT‑AA‑CGCGTCTTATCAGGCCTAC‑GGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGAc > 2:120792‑M1/16‑140 (MQ=255) gggTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCT‑ATGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑GGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCg < 2:385037/139‑1 (MQ=255) cATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCT‑ATGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑GGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTg < 2:502319/140‑1 (MQ=255) aGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCT‑ATGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑GGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTgcgc > 1:634788/1‑140 (MQ=255) gATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCT‑ATGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑GGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCtaacgcg < 1:676077/140‑7 (MQ=18) aTAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCT‑ATGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑GGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGt > 1:605428/1‑140 (MQ=255) | CAGCGTTGCCGATAAAATTGCTCAGCGCGATGCCAGCAGTATAGTGTTGCACAGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCT‑ATGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑GGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGT > NC_000913/377182‑377457 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |