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Only 100 of 197 total aligned reads displayed.
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tcacgccgcatccggcagtcgtgcGCAGATGCCTGATGCGACGCT‑ATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCg < 1:345591‑M2/116‑1 (MQ=255) tcacgccgcatccggcagtcgtgcGCAGATGCCTGATGCGACGCT‑ATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCg < 1:251402‑M2/116‑1 (MQ=255) gtgGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCT‑ATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCg < 2:94585/140‑1 (MQ=255) gggTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCT‑ATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCg < 2:385037/139‑1 (MQ=255) gTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCT‑ATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGAc < 1:650874/140‑1 (MQ=255) ccgcatccggcagtcgtgcGCAGATGCCTGATGCGACGCT‑ATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGa < 1:196906‑M2/117‑1 (MQ=255) tcgtgcGCAGATGCCTGATGCGACGCT‑ATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTAt < 2:524971‑M2/134‑1 (MQ=255) tcgtgcGCAGATGCCTGATGCGACGCT‑ATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTAt > 2:29299‑M2/7‑140 (MQ=255) tcgtgcGCAGATGCCTGATGCGACGCT‑ATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTAt < 1:560163‑M2/134‑1 (MQ=255) tcgtgcGCAGATGCCTGATGCGACGCT‑ATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTAt > 1:140414‑M2/7‑140 (MQ=255) gcAGATGCCTGATGCGACGCT‑ATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGcc > 2:749281/1‑140 (MQ=255) gcAGATGCCTGATGCGACGCT‑ATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGcc > 1:521808/1‑140 (MQ=255) | GATAAAATTGCTCAGCGCGATGCCAGCAGTATAGTGTTGCACAGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCT‑ATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCC > NC_000913/377192‑377468 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |