Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 1,730,372 | (T)5→4 | coding (1286/4617 nt) | lhr → | putative ATP‑dependent helicase Lhr |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 1,730,368 | 0 | T | . | 95.8% | 455.4 / 15.9 | 119 | coding (1282/4617 nt) | lhr | putative ATP‑dependent helicase Lhr |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (4/1); new base . (56/58); total (60/59) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.64e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.66e-01 |
Only 100 of 127 total aligned reads displayed.
ACCTCCAGTCTTGAACTGGGGATTGATATGGGCGCGGTGGATCTGGTGATTCAGGTGGCAACGCCGCTTTCTGTTGCCAGTGGGTTACAACGCATTGGTCGCGCCGGACATCAGGTTGGCGGTGTATCTAAAGGGCTGTTTTTCCCCCGTACCCGGCGTGATTTAGTCGATTCCGCAGTCATTGTAGAGTGTATGTTCGCAGGCAGGCTGGAAAACCTGACACCACCGCATAATCCTCTCGACGTCCTTGCGCAGCAAACCGTTGCCGCCGCGG > NC_000913/1730230‑1730503 | aCCTCCAGTCTTGAACTGGGGATTGATATGGGCGCGGTGGATCTGGTGATTCAGGTGGCAACGCCGCTTTCTGTTGCCAGTGGGTTACAACGCATTGGTCGCGCCGGACATCAGGTTGGCGGTGTATCTAAAGGGCTGtt < 2:1300424/140‑1 (MQ=255) aCCTCCAGTCTTGAACTGGGGATTGATATGGGCGCGGTGGATCTGGTGATTCAGGTGGCAACGCCGCTTTCTGTTGCCAGTGGGTTACAACGCATTGGTCGCGCCGGACATCAGGTTGGCGGTGTATCTAAAGGGCTGtt > 2:1227485/1‑140 (MQ=255) ccAGTCTTGAACTGGGGATTGATATGGGCGCGGTGGATCTGGTGATTCAGGTGGCAACGCCGCTTTCTGTTGCCAGTGGGTTACAACGCATTGGTCGCGCCGGACATCAGGTTGGCGGTGTATCTAAAGGGCTGttttcc > 1:755892/1‑138 (MQ=255) cAGTCTTGAACTGGGGATTGATATGGGCGCGGTGGATCTGGTGATTCAGGTGGCAACGCCGCTTTCTGTTGCCAGTGGGTTACAACGCATTGGTCGCGCCGGACATCAGGTTGGCGGTGTATCTAAAGGGCTGTTTTccc > 1:1241804/1‑140 (MQ=255) cAGTCTTGAACTGGGGATTGATATGGGCGCGGTGGATCTGGTGATTCAGGTGGCAACGCCGCTTTCTGTTGCCAGTGGGTTACAACGCATTGGTCGCGCCGGACATCAGGTTGGCGGTGTATCTAAAGGGCTGTTTTccc > 2:1395442/1‑140 (MQ=255) tGAACTGGGGATTGATATGGGCGCGGTGGATCTGGTGATTCAGGTGGCAACGCCGCTTTCTGTTGCCAGTGGGTTACAACGCATTGGTCGCGCCGGACATCAGGTTGGCGGTGTATCTAAAGGGCTG‑TTTTCCCCCGTAc < 2:1577354/140‑1 (MQ=255) tGAACTGGGGATTGATATGGGCGCGGTGGATCTGGTGATTCAGGTGGCAACGCCGCTTTCTGTTGCCAGTGGGTTACAACGCATTGGTCGCGCCGGACATCAGGTTGGCGGTGTATCTAAAGGGCTG‑TTTTCCCCCGTAc > 2:1368791/1‑140 (MQ=255) gAACTGGGGATTGATATGGGCGCGGTGGATCTGGTGATTCAGGTGGCAACGCCGCTTTCTGTTGCCAGTGGGTTACAACGCATTGGTCGCGCCGGACATCAGGTTGGCGGTGTATCTAAAGGGCTG‑TTTTCCCCTGTAcc > 2:36631/1‑140 (MQ=255) cTGGGGATTGATATGGGCGCGGTGGATCTGGTGATTCAGGTGGCAACGCCGCTTTCTGTTGCCAGTGGGTTACAACGCATTGGTCGCGCCGGACATCAGGTTGGCGGTGTATCTAAAGGGCTG‑TTTTCCCCCGTACCCgg > 1:1372053/1‑140 (MQ=255) tGGGGATTGATATGGGCGCGGTGGATCTGGTGATTCGGGTGGCAACGCCGCTTTCTGTTGCCAGTGGGTTACAACGCATTGGTCGCGCCGGACATCAGGTTGGCGGTGTATCTAAAGGGCTG‑TTTTCCCCCGTACCCGGc < 1:1777086/140‑1 (MQ=255) tGGGGATTGATATGGGCGCGGTGGATCTGGTGATTCAGGTGGCAACGCCGCTTTCTGTTGCCAGTGGGTTACAACGCATTGGTCGCGCCGGACATCAGGTTGGCGGTGTATCTAAAGGGCTG‑TTTTCCCCCGTACCCGGc < 1:325500/140‑1 (MQ=255) gggATTGATATGGGCGCGGTGGATCTGGTGATTCAGGTGGCAACGCCGCTTTCTGTTGCCAGTGGGTTACAACGCATTGGTCGCGCCGGACATCAGGTTGGCGGTGTATCTAAAGGGCTG‑TTTTCCCCCGTACCCGGCg < 1:867630/139‑1 (MQ=255) gggATTGATATGGGCGCGGTGGATCTGGTGATTCAGGTGGCAACGCCGCTTTCTGTTGCCAGTGGGTTACAACGCATTGGTCGCGCCGGACATCAGGTTGGCGGTGTATCTAAAGGGCTG‑TTTTCCCCCGTACCCGGCg < 1:1539648/139‑1 (MQ=255) gggATTGATATGGGCGCGGTGGATCTGGTGATTCAGGTGGCAACGCCGCTTTCTGTTGCCAGTGGGTTACAACGCATTGGTCGCGCCGGACATCAGGTTGGCGGTGTATCTAAAGGGCTG‑TTTTCCCCCGTACCCGGCGt > 1:1647680/1‑140 (MQ=255) tGGGCGCGGTGGATCTGGTGATTCAGGTGGCAACGCCGCTTTCTGTTGCCAGTGGGTTACAACGCATTGGTCGCGCCGGACATCAGGTTGGCGGTGTATCTAAAGGGCTG‑TTTTCCCCCGTACCCGGCGTGATTTAGTCg > 2:908489/1‑140 (MQ=255) gggCGCGGTGGATCTGGTGATTCAGGTGGCAACGCCGCTTTCTGTTGCCAGTGGGTTACAACGCATTGGTCGCGCCGGACATCAGGTTGGCGGTGTATCTAAAGGGCTG‑TTTTCCCCCGTACCCGGCGTGATTTAGTCGa > 1:1829382/1‑140 (MQ=255) ggCGCGGTGGATCTGGTGATTCAGGTGGCAACGCCGCTTTCTGTTGCCAGTGGGTTACAACGCATTGGTCGCGCCGGACATCAGGTTGGCGGTGTATCTAAAGGGCTG‑TTTTCCCCCGTACCCGGCGTGATTTAGTCGAt > 2:1500803/1‑140 (MQ=255) ggCGCGGTGGATCTGGTGATTCAGGTGGCAACGCCGCTTTCTGTTGCCAGTGGGTTACAACGCATTGGTCGCGCCGGACATCAGGTTGGCGGTGTATCAAAAGGGCTG‑TTTTCCCCCGTAcc < 1:605340/122‑1 (MQ=255) ggCGCGGTGGATCTGGTGATTCAGGTGGCAACGCCGCTTTCTGTTGCCAGTGGGTTACAACGCATTGGTCGCGCCGGACATCAGGTTGGCGGTGTATCAAAAGGGCTG‑TTTTCCCCCGTAcc > 2:605340/1‑122 (MQ=255) ggCGCGGCGGATCTGGTGATTCAGGTGGCAACGCCGCTTTCTGTTGCCAGTGGGTTACAACGCATTGGTCGCGCCGGACATCAGGTTGGCGGTGTATCTAAAGGGCTG‑TTTTCCCCCGTACCCGGCGTGATTTAGTCGAt > 2:873725/1‑140 (MQ=255) gcgGTGGATCTGGTGATTAAGGTGGCAACGCCGCTTTCTGTTGCCAGTGGGTTACAACGCATTGGTCGCGCCGGACATCATGTTGGCGGTGTATCTAAAGGGCTG‑TTTTCCCCCGTACCCGGCGTGATTTAGTCGATTcc < 1:1821418/140‑1 (MQ=255) ggTGGATCTGGTGATTCAGGTGGCAACGCCGCTTTCTGTTGCCAGTGGGTTACAACGCATTGGTCGCGCCGGACATCAGGTTGGCGGTGTATCTAAAGGGCTG‑TTTTCCCCCGTACCCGGCGTGATTTAGTCGATTCCGc < 1:377108/140‑1 (MQ=255) ggTGGATCTGGTGATTCAGGTGGCAACGCCGCTTTCTGTTGCCAGTGGGTTACAACGCATTGGTCGCGCCGGACATCAGGTTGGCGGTGTATCTAAAGGGCTG‑TTTTCCCCCGTACCCGGCGTGATTTAGTCGATTCCGc < 1:1691580/140‑1 (MQ=255) ggTGGATCTGGTGATTCAGGTGGCAACGCCGCTTTCTGTTGCCAGTGGGTTACAACGCATTGGTCGCGCCGGACATCAGGTTGGCGGTGTATCTAAAGGGCTG‑TTTTCCCCCGTACCCGGCGTGATTTAGTCGATTCCGc < 2:874982/140‑1 (MQ=255) ggTGGATCTGGTGATTCAGGTGGCAACGCCGCTTTCTGTTGCCAGTGGGTTACAACGCATTGGTCGCGCCGGACATCAGGTTGGCGGTGTATCTAAAGGGCTG‑TTTTCCCCCGTACCCGGCGTGATTTAGTCGATTCCGc < 2:1647680/140‑1 (MQ=255) ggTGGATCTGGTGATTCAGGTGGCAACGCCGCTTTCTGTTGCCAGTGGGTTACAACGCATTGGTCGCGCCGGACATCAGGTTGGCGGTGTATCTAAAGGGCTG‑TTTTCCCCCGTACCCGGCGTGATTTAGTCGATTCCGc < 2:1657103/140‑1 (MQ=255) ggTGGATCTGGTGATTCAGGTGGCAACGCCGCTTTCTGTTGCCAGTGGGTTACAACGCATTGGTCGCGCCGGACATCAGGTTGGCGGTGTATCTAAAGGGCTG‑TTTTCCCCCGTACCCGGCGTGATTTAGTCGATTCCGc < 2:1676211/140‑1 (MQ=255) ggTGGATCTGGTGATTCAGGTGGCAACGCCGCTTTCTGTTGCCAGTGGGTTACAACGCATTGGTCGCGCCGGACATCAGGTTGGCGGTGTATCTAAAGGGCTG‑TTTTCCCCCGTACCCGGCGTGATTTAGTCGATTCCGc < 1:605201/140‑1 (MQ=255) gTGGATCTGGTGATTCAGGTGGCAACGCCGCTTTCTGTTGCCAGTGGGTTACAACGCATTGGTCGCGCCGGACATCAGGTTGGCGGTGTATCTAAAGGGCTG‑TTTTCCCCCGTACCCGGCGTGATTTAGTCGATTCCGCa > 1:984766/1‑140 (MQ=255) tGGATCTGGTGATTCAGGTGGCAACGCCGCTTTCTGTTGCCAGTGGGTTACAACGCATTGGTCGCGCCGGACATCAGGTTGGCGGTGTATCTAAAGGGCTGTTTTTCCCCCGTACCCGGCGTGATTTAGTCGATTCCGCa < 1:1156194/140‑1 (MQ=255) tGGATCTGGTGATTCAGGTGGCAACGCCGCTTTCTGTTGCCAGTGGGTTACAACGCATTGGTCGCGCCGGACATCAGGTTGGCGGTGTATCTAAAGGGCTG‑TTTTCCCCCGTACCCGGCGTGATTTAGTCGATTCCGCAg < 2:755892/140‑1 (MQ=255) tGGATCTGGTGATTCAGGTGGCAACGCCGCTTTCTGTTGCCAGTGGGTTACAACGCATTGGTCGCGCCGGACATCAGGTTGGCGGTGTATCTAAAGGGCTG‑TTTTCCCCCGTACCCGGCGTGATTTAGTCGATTCCGCAg < 1:176553/140‑1 (MQ=255) tGGATCTGGTGATTCAGGTGGCAACGCCGCTTTCTGTTGCCAGTGGGTTACAACGCATTGGTCGCGCCGGACATCAGGTTGGCGGTGTATCTAAAGGGCTG‑TTTTCCCCCGTACCCGGCGTGATTTAGTCGATTCCGCAg < 2:1552259/140‑1 (MQ=255) tGGATCTGGTGATTCAGGTGGCAACGCCGCTTTCTGTTGCCAGTGGGTTACAACGCATTGGTCGCGCCGGACATCAGGTTGGCGGTGTATCTAAAGGGCTG‑TTTCCCCCCGTTCCCGGCGTGATTTAGTCGATTCCGCAg < 2:1738351/140‑1 (MQ=255) tGGATCTGGTGATTCAGGTGGCAACGCCGCTTTCTGTTGCCAGTGGGTTACAACGCATTGGTCGCGCCGGACATCAGGTTGGCGGTGTATCAAAAGGGCTG‑TTTTCCCCCGTACCCGGCGTGATTTAGTCGATTCCGCAg < 2:1063314/140‑1 (MQ=255) gATCTGGTGATTCAGGTGGCAACGCCGCTTTCTGTTGCCAGTGGGTTACAACGCATTGGTCGCGCCGGACATCAGGTTGGCGGTGTATCTAAAGGGCTG‑TTTTCCCCCGTACCCGGCGTGATTTAGTCGATTCCGCAGTc < 1:505599/140‑1 (MQ=255) aTCTGGTGATTCAGGTGGCAACGCCGCTTTCTGTTGCCAGTGGGTTACAACGCATTGGTCGCGCCGGACATCAGGTTGGCGGTGTATCTAAAGGGCTG‑TTTTCCCCCGTACCCGGCGTGATTTAGTCGATTCCGCAGTCa < 2:1829382/140‑1 (MQ=255) gTGATTCAGGTGGCAACGCCGCTTTCTGTTGCCAGTGGGTTACAACGCATTGGTCGCGCCGGACATCAGGTTGGCGGTGTATCTAAAGGGCTG‑TTTTCCCCCGTACCCGGCGTGATTTAGTCGATTcc < 1:1540391/128‑1 (MQ=255) gTGATTCAGGTGGCAACGCCGCTTTCTGTTGCCAGTGGGTTACAACGCATTGGTCGCGCCGGACATCAGGTTGGCGGTGTATCTAAAGGGCTG‑TTTTCCCCCGTACCCGGCGTGATTTAGTCGATTcc < 1:1786334/128‑1 (MQ=255) gTGATTCAGGTGGCAACGCCGCTTTCTGTTGCCAGTGGGTTACAACGCATTGGTCGCGCCGGACATCAGGTTGGCGGTGTATCTAAAGGGCTG‑TTTTCCCCCGTACCCGGCGTGATTTAGTCGATTcc > 2:1540391/1‑128 (MQ=255) gTGATTCAGGTGGCAACGCCGCTTTCTGTTGCCAGTGGGTTACAACGCATTGGTCGCGCCGGACATCAGGTTGGCGGTGTATCTAAAGGGCTG‑TTTTCCCCCGTACCCGGCGTGATTTAGTCGATTcc > 2:1786334/1‑128 (MQ=255) gTGATTCAGGTGGCAACGCCGCTTTCTGTTGCCAGTGGGTTACAACGCATTGGTCGCGCCGGACATCAGGTTGGCGGTGTATCTAAAGGGCTG‑TTTTCCCCCGTACCCGGCGTGATTTAGTCGATTCCGc < 1:945666/130‑1 (MQ=255) gTGATTCAGGTGGCAACGCCGCTTTCTGTTGCCAGTGGGTTACAACGCATTGGTCGCGCCGGACATCAGGTTGGCGGTGTATCTAAAGGGCTG‑TTTTCCCCCGTACCCGGCGTGATTTAGTCGATTCCGc > 2:945666/1‑130 (MQ=255) gTGATTCAGGTGGCAACGCCGCTTTCTGTTGCCAGTGGGTTACAACGCATTGGTCGCGCCGGACATCAGGTTGGCGGTGTATCTAAAGGGCTG‑TTTTCCCCCGTACCCGGCGTGATTTAGTCGATTCCGCAGTCATTGTa < 2:936285/140‑1 (MQ=255) gTGATTCAGGTGGCAACGCCGCTTTCTGTTGCCAGTGGGTTACAACGCATTGGTCGCGCCGGACATCAGGTTGGCGGTGTATCTAAAGGGCTG‑TTTTCCCCCGTACCCGGCGTGATTTAGTCGATTCCGCAGTCATTGTa < 2:1271286/140‑1 (MQ=255) gTGATTCAGGTGGCAACGCCGCTTTCTGTTGCCAGTGGGTTACAACGCATTGGTCGCGCCGGACATCAGGTTGGCGGTGTATCTAAAGGGCTG‑TTTTCCCCCGTACCCGGCGTGATTTAGTCGATTCCGCAGTCATTGTa < 1:1448506/140‑1 (MQ=255) gTGATTCAGGTGGCAACGCCGCTTTCTGTTGCCAGTGGGTTACAACGCATTGGTCGCGCCGGACATCAGGTTGGCGGTGTATCTAAAGGGCTG‑TTTTCCCCCGTACCCGGCGTGATTTAGTCGATTCCGCAGTCATTGTa < 2:532123/140‑1 (MQ=255) gTGATTCAGGTGGCAACGCCGCTTTCTGTTGCCAGTGGGTTACAACGCATTGGTCGCGCCGGACATCAGGTTGGCGGTGTATCTAAAGGGCTG‑TTTTCCCCCGTACCCGGCGTGATTTAGTCGATTCCGCAGTCATTGTa < 1:903631/140‑1 (MQ=255) gTGATTCAGGTGGCAACGCCGCTTTCTGTTGCCAGTGGGTTACAACGCATTGGTCGCGCCGGACATCAGGTTGGCGGTGTATCTAAAGGGCTG‑TTTTCCCCCGTACCCGGCGTGATTTAGTCGATTCCGCAGTCATTGTa < 1:484135/140‑1 (MQ=255) gTGATTCAGGTGGCAACGCCGCTTTCTGTTGCCAGTGGGTTACAACGCATTGGTCGCGCCGGACATCAGGTTGGCGGTGTATCTAAAGGGCTG‑TTTTCCCCCGTACCCGGCGTGATTTAGTCGATTCCGCAGTCATTGTa < 1:604606/140‑1 (MQ=255) gATTCAGGTGGCAACGCCGCTTTCTGTTGCCAGTGGGTTACAACGCATTGGTCGCGCCGGACATCAGGTTGGCGGTGTATCTAAAGGGCTG‑TTTTCCCCCGTACCCGGCGTGATTTAGTCGATTCCGc < 1:956179/128‑1 (MQ=255) gATTCAGGTGGCAACGCCGCTTTCTGTTGCCAGTGGGTTACAACGCATTGGTCGCGCCGGACATCAGGTTGGCGGTGTATCTAAAGGGCTG‑TTTTCCCCCGTACCCGGCGTGATTTAGTCGATTCCGc > 1:280937/1‑128 (MQ=255) gATTCAGGTGGCAACGCCGCTTTCTGTTGCCAGTGGGTTACAACGCATTGGTCGCGCCGGACATCAGGTTGGCGGTGTATCTAAAGGGCTG‑TTTTCCCCCGTACCCGGCGTGATTTAGTCGATTCCGc < 2:280937/128‑1 (MQ=255) gATTCAGGTGGCAACGCCGCTTTCTGTTGCCAGTGGGTTACAACGCATTGGTCGCGCCGGACATCAGGTTGGCGGTGTATCTAAAGGGCTG‑TTTTCCCCCGTACCCGGCGTGATTTAGTCGATTCCGc > 2:956179/1‑128 (MQ=255) gATTCAGGTGGCAACGCCGCTTTCTGTTGCCAGTGGGTTACAACGCATTGGTCGCGCCGGACATCAGGTTGGCGGTGTATCTAAAGGGCTG‑TTTTCCCCCGTACCCGGCGTGATTTAGTCGATTCCGCAGTCATTGTaga > 1:153427/1‑140 (MQ=255) ttCAGGTGGCAACGCCGCTTTCTGTTGCCAGTGGGTTACAACGCATTGGTCGCGCCGGACATCAGGTTGGCGGTGTATCTAAAGGGCTG‑TTTTCCCCCGTACCCGGCGTGATTTAGTCGATTCCGCAGTCATTGTAGAgt > 2:1552296/1‑140 (MQ=255) ttCAGGTGGCAACGCCGCTTTCTGTTGCCAGTGGGTTACAACGCATTGGTCGCGCCGGACATCAGGTTGGCGGTGTATCTAAAGGGCTG‑TTTTCCCCCGTACCCGGCGTGATTTAGTCGATTCCGCAGTCATTGTAGAgt > 2:17204/1‑140 (MQ=255) tCAGGTGGCAACGCCGCTTTCTGTTGCCAGTGGGTTACAACGCATTGGTCGCGCCGGACATCAGGTTGGCGGTGTATCTAAAGGGCTG‑TTTTCCCCCGTACCCGGCGTGATTTAGTCGATTCCGCAGTCATTGTAGAgtg > 1:896865/1‑140 (MQ=255) cAGGTGGCAACGCCGCTTTCTGTTGCCAGTGGGTTACAACGCATTGGTCGCGCCGGACATCAGGTTGGCGGTGTATCTAAAGGGCTG‑TTTTCCCCCGTACCCGGCGTGATTTAGTCGATTCCGCAGTCATTGTAGAgtgt > 1:295110/1‑140 (MQ=255) cgcTTTCTGTTGCCAGTGGGTTACAACGCATTGGTCGCGCCGGACATCAGGTTGGCGGTGTATCTAAAGGGCTG‑TTTTCCCCCGTACCCGGCGTGATTTAGTCGATTCCGCAGTCATTGTAGAGTGTATGTTCgcaggca > 2:1768116/1‑140 (MQ=255) cTGTTGCCAGTGGGTTACAACGCATTGGTCGCGCCGGACATCAGGTTGGCGGTGTATCTAAAGGGCTG‑TTTTCCCCCGTACCCGGCGTGATTTAGTCGATTCCGCAGTCATTGTAGAGTGTATGTTCGCAGGCAGGCTgg < 2:470659/140‑1 (MQ=255) gTTGCCATTGGGTTACAACGCATTGGTCGCGCCGGACATCAGGTTGGCGGTGTATCTAAAGGGCTG‑TTTTCCCCCGTACCCGGCGTGATTTAGTCGATTCCGCAGTCATTGTAGAGTGTATGTTCGCAGGCAGGCTGGaa > 2:1520990/1‑140 (MQ=255) gTTGCCAGTGGGTTACAACGCATTGGTCGCGCCGGACATCAGGTTGGCGGTGTATCTAAAGGGCTG‑TTTTCCCCCGTACCCGGCGTGATTTAGTCGATTCCGCAGTCATTGTAGAGTGTATGTTCGCAGGCAGGCTGGaa > 1:530366/1‑140 (MQ=255) ttACAACGCATTGGTCGCGCCGGACATCAGGTTGGCGGTGTATCTAAAGGGCTG‑TTTTCCCCCGTACCCGGCGTGATTTAGTCGATTCCGCAGTCATTGTAGAGTGTATGTTCGCAGGCAGGCTGGAAAACCTGAcacca < 2:153427/140‑1 (MQ=255) ttACAACGCATTGGTCGCGCCGGACATCAGGTTGGCGGTGTATCTAAAGGGCTG‑TTTTCCCCCGTACCCGGCGTGATTTAGTCGATTCCGCAGTCATTGTAGAGTGTATGTTCGCAGGCAGGCTGGAAAACCTGAcacca < 1:1395442/140‑1 (MQ=255) tACAACGCATTGGTCGCGCCGGACATCAGGTTGGCGGTGTATCTAAAGGGCTG‑TTTTCCCCCGTACCCGGCGTGATTTAGTCGATTCCGCAGTCATTGTAGAGTGTATGTTCGCAGGCAGGCTGGAAAACCTGAcaccac > 1:960561/1‑140 (MQ=255) aCAACGCATTGGTCGCGCCGGACATCAGGTTGGCGGTGTATCTAAAGGGCTG‑TTTTCCCCCGTACCCGGCGTGATTTAGTCGATTCCGCAGTCATTGTAGAGTGTATGTTCGCAGGCAGGCTGGAAAACCTGACaccacc > 1:1336393/1‑140 (MQ=255) cAACGCATTGGTCGCGCCGGACATCAGGTTGGCGGTGTATCTAAAGGGCTG‑TTTTCCCCCGTACCCGGCGTGATTTAGTCGATTCCGCAGTCATTGTAGAGTGTATGTTCGCAGGCAGGCTGGAAAACCTGACACCACCg > 2:1273453/1‑140 (MQ=255) aaCGCATTGGTCGCGCCGGACATCAGGTTGGCGGTGTATCTAAAGGGCTGTTTTTCCCCCGTACCCGGCGTGATTTAGTCGATTCCGCAGTCATTGTAGAGTGTATGTTCGCAGGCAGGCTGGAAAACCTGACACCACCg > 2:729898/1‑140 (MQ=255) aCGCATTGGTCGCGCCGGACATCAGGTTGGCGGTGTATCTAAAGGGCTG‑TTTTCCCCCGTACCCGGCGTGATTTAGTCGATTCCGCAGTCATTGTAGAGTGTATGTTCGCAGGCAGGCTGGAAAACCTGACACCACCGCa > 1:294531/1‑140 (MQ=255) cGCATTGGTCGCGCCGGACATCAGGTTGGCGGTGTATCTAAAGGGCTG‑TTTTCCCCCGTACCCGGCGTGATTTAGTCGATTCCGCAGTCATTGTAGAGTGTATGTTCGCAGGCAGGCTGGAAAACCTGACACCACCGCAt > 2:1198243/1‑140 (MQ=255) cGCATTGGTCGCGCCGGACATCAGGTTGGCGGTGTATCTAAAGGGCTG‑TTTTCCCCCGTACCCGGCGTGATTTAGTCGATTCCGCAGTCATTGTAGAGTGTATGTTCGCAGGCAGGCTGGAAAACCTGACACCACCGCAt > 2:566695/1‑140 (MQ=255) cATTGGTCGCGCCGGACATCAGGTTGGCGGTGTATCTAAAGGGCTG‑TTTTCCCCCGTACCCGGCGTGATTTAGTCGATTCCGCAGTCATTGTAGAGTGTATGTTCGCAGGCAGGCTGGAAAACCTGACACCACCGCATaa > 2:304754/1‑140 (MQ=255) cATTGGTCGCGCCGGACATCAGGTTGGCGGTGTATCTAAAGGGCTG‑TTTTCCCCCGTACCCGGCGTGATTTAGTCGATTCCGCAGTCATTGTAGAGTGTATGTTCGCAGGCAGGCTGGAAAACCTGACACCACCGCATaa > 1:1300219/1‑140 (MQ=255) cATTGGTCGCGCCGGACATCAGGTTGGCGGTGTATCTAAAGGGCTG‑TTTTCCCCCGTACCCGGCGTGATTTAGTCGATTCCGCAGTCATTGTAGAGTGTATGTTCGCAGGCAGGCTGGAAAACCTGACACCACCGCATaa > 2:1079823/1‑140 (MQ=255) cATTGGTCGCGCCGGACATCAGGTTGGCGGTGTATCTAAAGGGCTG‑TTTTCCCCCGTACCCGGCGTGATTTAGTCGATTCCGCAGTCATTGTAGAGTGTATGTTCGCAGGCAGGCTGGAAAACCTGACACCACCGCATaa > 1:144173/1‑140 (MQ=255) cATTGGTCGCGCCGGACATCAGGTTGGCGGTGTATCTAAAGGGCTG‑TTTTCCCCCGTACCCGGCGTGATTTAGTCGATTCCGCAGTCATTGTAGAGTGTATGTTCGCAGGCAGGCTGGAAAACCTGACACCACCGCATaa > 2:786910/1‑140 (MQ=255) aTTGGTCGCGCCGGACATCAGGTTGGCGGTGTATCTAAAGGGCTG‑TTTTCCCCCGTACCCGGCGTGATTTAGTCGATTCCGCAGTCATTGTAGAGTGTATGTTCGCAGGCAGGCTGGAAAACCTGACACCACCGCATAAt > 1:581366/1‑140 (MQ=255) aTTGGTCGCGCCGGACATCAGGTTGGCGGTGTATCTAAAGGGCTG‑TTTTCCCCCGTACCCGGCGTGATTTAGTCGATTCCGCAGTCATTGTAGAGTGTATGTTCGCAGGCAGGCTGGAAAACCTGACACCACCGCATAAt > 2:1624835/1‑140 (MQ=255) ttGGTCGCGCCGGACATCAGGTTGGCGGTGTATCTAAAGGGCTG‑TTTTCCCCCGTACCCGGCGTGATTTAGTCGATTCCGCAGTCATTGTAGAGTGTATGTTCGCAGGCAGGCTGGAAAACCTGACACCACCGCATAATc < 1:1079823/140‑1 (MQ=255) ttGGTCGCGCCGGACATCAGGTTGGCGGTGTATCTAAAGGGCTG‑TTTTCCCCCGTACCCGGCGTGATTTAGTCGATTCCGCAGTCATTGTAGAGTGTATGTTCGCAGGCAGGCTGGAAAACCTGACACCACCGCATAATc > 1:669622/1‑140 (MQ=255) tGGTCGCGCCGGACATCAGGTTGGCGGTGTATCTAAAGGGCTG‑TTTTCCCCCGTACCCGGCGTGATTTAGTCGATTCCGCAGTCATTGTAGAGTGTATGTTCGCAGGCAGGCTGGAAAACCTGACACCACCGCATAATcc < 2:980613/140‑1 (MQ=255) cgcCGGACATCAGGTTGGCGGTGTATCTAAAGGGCTG‑TTTTCCCCCGTACCCGGCGTGATTTAGTCGATTCCGCAGTCATTGTAGAGTGTATGTTCGCAGGCAGGCTGGAAAACCTGACACCACCg < 2:1188629/126‑1 (MQ=255) cgcCGGACATCAGGTTGGCGGTGTATCTAAAGGGCTG‑TTTTCCCCCGTACCCGGCGTGATTTAGTCGATTCCGCAGTCATTGTAGAGTGTATGTTCGCAGGCAGGCTGGAAAACCTGACACCACCg > 1:1188629/1‑126 (MQ=255) cgcCGGACATCAGGTTGGCGGTGTATCTAAAGGGCTG‑TTTTCCCCCGTACCCGGCGTGATTTAGTCGATTCCGCAGTCATTGTAGAGTGTATGTTCGCAGGCAGGCTGGAAAACCTGACACCACCGCATAATCCTCTCGa < 2:468001/140‑1 (MQ=255) cgcCGGACATCAGGTTGGCGGTGTATCTAAAGGGCTG‑TTTTCCCCCGTACCCGGCGTGATTTAGTCGATTCCGCAGTCATTGTAGAGTGTATGTTCGCAGGCAGGCTGGAAAACCTGACACCACCGCATAATCCTCTCGa > 1:212350/1‑140 (MQ=255) tGGCGGTGTATCTAAAGGGCTG‑TTTTCCCCCGTACCCGGCGTGATTTAGTCGATTCCGCAGTCATTGTAGAGTGTATGTTCGCAGGCAGGCTGGAAAACCTGACACCACCGCATAATCCTCTCGACGTCCTTGCgcagca > 1:1830487/1‑140 (MQ=255) tGGCGGTGTATCTAAAGGGCTG‑TTTTCCCCCGTACCCGGCGTGATTTAGTCGATTCCGCAGTCATTGTAGAGTGTATGTTCGCAGGCAGGCTGGAAAACCTGACACCACCGCATAATCCTCTCGACGTCCTTGCgcagca > 1:1810970/1‑140 (MQ=255) gCGGTGTATCTAAAGGGCTG‑TTTTCCCCCGTACCCGGCGTGATTTAGTCGATTCCGCAGTCATTGTAGAGTGTATGTTCGCAGGCAGGCTGGAAAACCTGACACCACCGCATAATCCTCTCGACGTCCTTgcg > 2:1002794/1‑133 (MQ=255) gCGGTGTATCTAAAGGGCTG‑TTTTCCCCCGTACCCGGCGTGATTTAGTCGATTCCGCAGTCATTGTAGAGTGTATGTTCGCAGGCAGGCTGGAAAACCTGACACCACCGCATAATCCTCTCGACGTCCTTgcg < 1:1002794/133‑1 (MQ=255) gCGGTGTATCTAAAGGGCTG‑TTTTCCCCCGTACCCGGCGTGATTTAGTCGATTCCGCAGTCATTGTAGAGTGTATGTTCGCAGGCAGGCTGGAAAACCTGACACCACCGCATAATCCTCTCGACGTCCTTGCGCAGCaaa > 1:1282091/1‑140 (MQ=255) cGGTGTATCTAAAGGGCTG‑TTTTCCCCCGTACCCGGCGTGATTTAGTCGATTCCGCAGTCATTGTAGAGTGTATGTTCGCAGGCAGGCTGGAAAACCTGACACCACCGCATAATCCTCTCGACGTCCTTGCGCAGCAAAc > 2:1182906/1‑140 (MQ=255) cGGTGTATCTAAAGGGCTG‑TTTTCCCCCGTACCCGGCGTGATTTAGTCGATTCCGCAGTCATTGTAGAGTGTATGTTCGCAGGCAGGCTGGAAAACCTGACACCACCGCATAATCCTCTCGACGTCCTTGCGCAGCAAAc > 1:92328/1‑140 (MQ=255) tATCTAAAGGGCTG‑TTTTCCCCCGTACCCGGCGTGATTTAGTCGATTCCGCAGTCATTGTAGAGTGTATGTTCGCAGGCAGGCTGGAAAACCTGACACCACCGCATAATCCTCTCGACGTCCTTGCGCAGCAAACCGTTg > 2:1375532/1‑140 (MQ=255) tATCTAAAGGGCTG‑TTTTCCCCCGTACCCGGCGTGATTTAGTCGATTCCGCAGTCATTGTAGAGTGTATGTTCGCAGGCAGGCTGGAAAACCTGACACCACCGCATAATCCTCTCGACGTCCTTGCGCAGCAAACCGTTg > 1:1710670/1‑140 (MQ=255) aaGGGCTG‑TTTTCCCCCGTACCCGGCGTGATTTAGTCGATTCCGCAGTCATTGTAGAGTGTATGTTCGCAGGCAGGCTGGAAAACCTGACACCACCGCATAATCCTCTCGACGTCCTTGCGCAGCAAACCGTTGccgccg < 2:283169/140‑1 (MQ=255) aaGGGCTG‑TTTTCCCCCGTACCCGGCGTGATTTAGTCGATTCCGCAGTCATTGTAGAGTGTATGTTCGCAGGCAGGCTGGAAAACCTGACACCACCGCATAATCCTCTCGACGTCCTTGCGCAGCAAACCGTTGccgccg < 2:76034/140‑1 (MQ=255) gggCTG‑TTTTCCCCCGTACCCGGCGTGATTTAGTCGATTCCGCAGTCATTGTAGAGTGTATGTTCGCAGGCAGGCTGGAAAACCTGACACCACCGCATAATCCTCTCGACGTCCTTGCGCAGCAAACCGTTGCCGCcgcg < 2:1336393/140‑1 (MQ=255) gggCTG‑TTTTCCCCCGTACCCGGCGTGATTTAGTCGATTCCGCAGTCATTGTAGAGTGTATGTTCGCAGGCAGGCTGGAAAACCTGACACCACCGCATAATCCTCTCGACGTCCTTGCGCAGCAAACCGTTGCCGCcgcg > 1:717482/1‑140 (MQ=255) ggCTG‑TTTTCCCCCGTACCCGGCGTGATTTAGTCGATTCCGCAGTCATTGTAGAGTGTATGTTCGCAGGCAGGCTGGAAAACCTGACACCACCGCATAATCCTCTCGACGTCCTTGCGCAGCAAACCGTTGCCGCCgcgg > 2:1444910/1‑140 (MQ=255) | ACCTCCAGTCTTGAACTGGGGATTGATATGGGCGCGGTGGATCTGGTGATTCAGGTGGCAACGCCGCTTTCTGTTGCCAGTGGGTTACAACGCATTGGTCGCGCCGGACATCAGGTTGGCGGTGTATCTAAAGGGCTGTTTTTCCCCCGTACCCGGCGTGATTTAGTCGATTCCGCAGTCATTGTAGAGTGTATGTTCGCAGGCAGGCTGGAAAACCTGACACCACCGCATAATCCTCTCGACGTCCTTGCGCAGCAAACCGTTGCCGCCGCGG > NC_000913/1730230‑1730503 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |