| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,781,909 | +C | coding (818/4581 nt) | ypjA ← | adhesin‑like autotransporter YpjA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,781,905 | 1 | . | C | 96.4% | 599.1 / 10.7 | 167 | coding (822/4581 nt) | ypjA | adhesin‑like autotransporter YpjA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (4/2); new base C (84/77); total (88/79) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.85e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.82e-01 | |||||||||||
Only 100 of 182 total aligned reads displayed.
CGTTTTCCAGCAACACATTGTCTGCCACGTGATTGTGGATGGAGAATGCACCTTCACTATTCGTACCGCTCACCGTCGTACCGTTAGTGTTAGTTTTTAAAATTGCACCATCGTGCTGGGTAACATTTGTTGCCGTACCA‑CCCC‑TAACATCAAGCACGCCACCAGAATAAACTTCAATAACATCCGAGGTGCTGGTGTTATCAACAATTTGCGTGCCACCAGAATAGATATGCGTATTTTTTGCCGTTGACTTACTATTCAGAGACTGAGTTCC > NC_000913/2781766‑2782039 | cGTTTTCCAGCAACACATTGTCTGCCACGTGATTGTGGATGGAGAATGCACCTTCACTATTCGTACCGCTCACCGTCGTACCGTTAGTGTTAGTTTTTAAAATTGCACCATCGTGCTGGGTAACATTTGTTGCCGTacca < 1:1178929/140‑1 (MQ=255)cGTTTTCCAGCAACACATTGTCTGCCACGTGATTGTGGATGGAGAATGCACCTTCACTATTCGTACCGCTCACCGTCGTACCGTTAGTGTTAGTTTTTAAAATTGCACCATCGTGCTGGGTAACATTTGTTGCCGTacca < 2:1477147/140‑1 (MQ=255) ttttCCAGCAACACATTGTCTGCCACGTGATTGTGGATGGAGAATGCACCTTCACTATTCGTACCGCTCACCGTCGTACCGTTAGTGTTAGTTTTTAAAATTGCACCATCGTGCTGGGTAACATTTGTTGCCGTacca‑cc < 1:1544546/140‑1 (MQ=255) ttCCAGCAACACATTGTCTGCCACGTGATTGTGGATGGAGAATGCACCTTCACTATTCGTACCGCTCACCGTCGTACCGTTAGTGTTAGTTTTTAAAATTGCACCATCGTGCTGGGTAACATTTGTTGCCGTACCA‑cccc < 1:241100/140‑1 (MQ=255) tCCAGCAACACATTGTCTGCCACGTGATTGTGGATGGAGAATGCACCTTCACTATTCGTACCGCTCACCGTCGTACCGTTAGTGTTAGTTTTTAAAATTGCACCATCGTGCTGGGTAACATTTGTTGCCGTACCA‑caccc < 1:1561523/140‑2 (MQ=255) tGTCTGCCACGTGATTGTGGATGGAGAATGCACCTTCACTATTCGTACCGCTCACCGTCGTACCGTTAGTGTTAGTTTTTAAAATTGCACCATCGTGCTGGGTAACATTTGTTGCCGTACCACCCCC‑TAACATCAAGCAc < 2:1499271/140‑1 (MQ=255) tGTCTGCCACGTGATTGTGGATGGAGAATGCACCTTCACTATTCGTACCGCTCACCGTCGTACCGTTAGTGTTAGTTTTTAAAATTGCACCATCGTGCTGGGTAACATTTGTTGCCGTACCACCCCC‑TAACATCAAGCAc < 1:317532/140‑1 (MQ=255) tGTCTGCCACGTGATTGTGGATGGAGAATGCACCTTCACTATTCGTACCGCTCACCGTCGTACCGTTAGTGTTAGTTTTTAAAATTGCACCATCGTGCTGGGTAACATTTGTTGCCGTACCACCCCC‑TAACATCAAGCAc < 1:1024609/140‑1 (MQ=255) tCTGCCACGTGATTGTGGATGGAGAATGCACCTTCACTATTCGTACCGCTCACCGTCGTACCGTTAGTGTTAGTTTTTAAAATTGCACCATCGTGCTGGGTAACATTTGTTGCCGTACCACCCCC‑TAACATCAAGCACGc < 2:508545/140‑1 (MQ=255) gCCACGTGATTGTGGATGGAGAATGCACCTTCACTATTCGTACCGCTCACCGTCGTACCGTTAGTGTTAGTTTTTAAAATTGCACCATCGTGCTGGGTAACATTTGTTGCCGTACCACCCCC‑TAACATCAAGCACGccac < 1:107180/140‑1 (MQ=255) gCCACGTGATTGTGGATGGAGAATGCACCTTCACTATTCGTACCGCTCACCGTCGTACCGTTAGTGTTAGTTTTTAAAATTGCACCATCGTGCTGGGTAACATTTGTTGCCGTACCACCCCC‑TAACATCAAGCACGccac < 2:161921/140‑1 (MQ=255) ccACGTGATTGTGGATGGAGAATGCACCTTCACTATTCGTACCGCTCACCGTCGTACCGTTAGTGTTAGTTTTTAAAATTGCACCATCGTGCTGGGTAACATTTGTTGCCGTACCACCCCC‑TAACa < 1:1260390/126‑1 (MQ=255) aCGTGATTGTGGATGGAGAATGCACCTTCACTATTCGTACCGCTCACCGTCGTACCGTTAGTGTTAGTTTTTAAAATTGCACCATCGTGCTGGGTAACATTTGTTGCCGTACCACCCCC‑TAACATCAAGCACGCCACCAg > 2:1749403/1‑140 (MQ=255) gTGATTGTGGATGGAGAATGCACCTTCACTATTCGTACCGCTCACCGTCGTACCGTTAGTGTTAGTTTTTAAAATTGCACCATCGTGCTGGGTAACATTTGTTGCCGTACCACCCCC‑TAACATCAAGCACGCCACCAGaa < 2:461261/140‑1 (MQ=255) gTGATTGTGGATGGAGAATGCACCTTCACTATTCGTACCGCTCACCGTCGTACCGTTAGTGTTAGTTTTTAAAATTGCACCATCGTGCTGGGTAACATTTGTTGCCGTACCACCCCC‑TAACATCAAGCACGCCACCAGaa > 1:570165/1‑140 (MQ=255) gATTGTGGATGGAGAATGCACCTTCACTATTCGTACCGCTCACCGTCGTACCGTTAGTGTTAGTTTTTAAAATTGCACCATCGTGCTGGGTAACATTTGTTGCCGTACCACCCCC‑TAACATCAAGCACGCCACCAGAATa < 1:1084138/140‑1 (MQ=255) gATTGTGGATGGAGAATGCACCTTCACTATTCGTACCGCTCACCGTCGTACCGTTAGTGTTAGTTTTTAAAATTGCACCATCGTGCTGGGTAACATTTGTTGCCGTACCACCCCC‑TAACATCAAGCACGCCACCAGAATa < 1:122292/140‑1 (MQ=255) gATTGTGGATGGAGAATGCACCTTCACTATTCGTACCGCTCACCGTCGTACCGTTAGTGTTAGTTTTTAAAATTGCACCATCGTGCTGGGTAACATTTGTTGCCGTACCACCCCC‑TAACATCAAGCACGCCACCAGAATa < 1:1392902/140‑1 (MQ=255) aTTGTGGATGGAGAATGCACCTTCACTATTCGTACCGCTCACCGTCGTACCGTTAGTGTTAGTTTTTAAAATTGCACCATCGTGCTGGGTAACATTTGTTGCCGTACCACCCCC‑TAACATCAAGCACGCCACCAGAATaa < 2:23641/140‑1 (MQ=255) aTTGTGGATGGAGAATGCACCTTCACTATTCGTACCGCTCACCGTCGTACCGTTAGTGTTAGTTTTTAAAATTGCACCATCGTGCTGGGTAACATTTGTTGCCGTACCACCCCC‑TAACATCAAGCACGCCACCAGAATaa < 1:1570016/140‑1 (MQ=255) aTTGTGGATGGAGAATGCACCTTCACTATTCGTACCGCTCACCGTCGTACCGTTAGTGTTAGTTTTTAAAATTGCACCATCGTGCTGGGTAACATTTGTTGCCGTACCACCCCC‑TAACATCAAGCACGCCACCAGAATaa > 1:1376770/1‑140 (MQ=255) gtgGATGGAGAATGCACCTTCACTATTCGTACCGCTCACCGTCGTACCGTTAGTGTTAGTTTTTAAAATTGCACCATCGTGCTGGGTAACATTTGTTGCCGTACCACCCCC‑TAACATCAAGCACGCCACCAGAATAAACt > 1:685057/1‑140 (MQ=255) tggatggaGAATGCACCTTCACTATTCGTACCGCTCACCGTCGTACCGTTAGTGTTAGTTTTTAAAATTGCACCATCGTGCTGGGTAACATTTGTTGCCGTACCACCCCC‑TAACATCAAGCACGCCACCAGAATAAACtt > 1:631198/1‑140 (MQ=255) gatggaGAATGCACCTTCACTATTCGTACCGCTCACCGTCGTACCGTTAGTGTTAGTTTTTAAAATTGCACCATCGTGCTGGGTAACATTTGTTGCCGTACCACCCCC‑TAACATCAAGCACGCCACCAGAATAAACTTCa > 1:1505213/1‑140 (MQ=255) tggaGAATGCACCTTCACTATTCGTACCGCTCACCGTCGTACCGTTAGTGTTAGTTTTTAAAATTGCACCATCGTGCTGGGTAACATTTGTTGCCGTACCACCCCC‑TAACATCAAGCACGCCACCAGAATAAACTTCAAt < 2:1238978/140‑1 (MQ=255) ggaGAATGCACCTTCACTATTCGTACCGCTCACCGTCGTACCGTTAGTGTTAGTTTTTAAAATTGCACCATCGTGCTGGGTAACATTTGTTGCCGTACCACCCCC‑TAACATCAAGCACGCCACCAGAATAAACTTCAATa > 2:93345/1‑140 (MQ=255) agaATGCACCTTCACTATTCGTACCGCTCACCGTCGTACCGTTAGTGTTAGTTTTTAAAATTGCACCATCGTGCTGGGTAACATTTGTTGCCGTACCACCCCC‑TAACATCAAGCACGCCACCAGAATAAACTTCAATAAc > 1:882629/1‑140 (MQ=255) agaATGCACCTTCACTATTCGTACCGCTCACCGTCGTACCGTTAGTGTTAGTTTTTAAAATTGCACCATCGTGCTGGGTAACATTTGTTGCCGTACCACCCCC‑TAACATCAAGCACGCCACCAGAATAAACTTCAATAAc > 2:1138304/1‑140 (MQ=255) agaATGCACCTTCACTATTCGTACCGCTCACCGTCGTACCGTTAGTGTTAGTTTTTAAAATTGCACCATCGTGCTGGGTAACATTTGTTGCCGTACCACCCCC‑TAACATCAAGCACGCCACCAGAATAAACTTCAATAAc > 2:1671207/1‑140 (MQ=255) agaATGCACCTTCACTATTCGTACCGCTCACCGTCGTACCGTTAGTGTTAGTTTTTAAAATTGCACCATCGTGCTGGGTAACATTTGTTGCCGTACCACCCCC‑TAACATCAAGCACGCCACCAGAATAAACTTCAATAAc > 2:152521/1‑140 (MQ=255) aTGCACCTTCACTATTCGTACCGCTCACCGTCGTACCGTTAGTGTTAGTTTTTAAAATTGCACCATCGTGCTGGGTAACATTTGTTGCCGTACCACCCCC‑TAACATCAAGCACGCCACCAGAATAAACTTCAATAACATc > 1:320675/1‑140 (MQ=255) gCACCTTCACTATTCGTACCGCTCACCGTCGTACCGTTAGTGTTAGTTTTTAAAATTGCACCATCGTGCTGGGTAACATTTGTTGCCGTACCACCCCC‑TAACATCAAGCACGCCACCAGAATAAACTTCAATAACATCCg < 1:1065353/140‑1 (MQ=255) gCACCTTCACTATTCGTACCGCTCACCGTCGTACCGTTAGTGTTAGTTTTTAAAATTGCACCATCGTGCTGGGTAACATTTGTTGCCGTACCACCCCC‑TAACATCAAGCACGCCACCAGAATAAACTTCAATAACATCCg < 2:320675/140‑1 (MQ=255) cACCTTCACTATTCGTACCGCTCACCGTCGTACCGTTAGTGTTAGTTTTTAAAATTGCACCATCGTGCTGGGTAACATTTGTTGCCGTACCACCCCC‑TAACATCAAGCACGCCACCAGAATAAACTTCAATAACATCCGa < 1:147168/140‑1 (MQ=255) cTTCACTATTCGTACCGCTCACCGTCGTACCGTTAGTGTTAGTTTTTAAAATTGCACCATCGTGCTGGGTAACATTTGTTGCCGTACCACCCCC‑TAACATCAAGCACGCCACCAGAATAAACTTCAATAACATCCg > 1:201432/1‑136 (MQ=255) cTTCACTATTCGTACCGCTCACCGTCGTACCGTTAGTGTTAGTTTTTAAAATTGCACCATCGTGCTGGGTAACATTTGTTGCCGTACCACCCCC‑TAACATCAAGCACGCCACCAGAATAAACTTCAATAACATCCg < 2:201432/136‑1 (MQ=255) ttCACTATTCGTACCGCTCACCGTCGTACCGTTAGTGTTAGTTTTTAAAATTGCACCATCGTGCTGGGTAACATTTGTTGCCGTACCACCCCC‑TAACATCAAGCACGCCACCAGAATAAACTTCAATAACATCCGAGGTg > 2:1066627/1‑140 (MQ=255) tCACTATTCGTACCGCTCACCGTCGTACCGTTAGTGTTAGTTTTTAAAATTGCACCATCGTGCTGGGTAACATTTGTTGCCGTACCACCCCC‑TAACATCAAGCACGCCACCAGAATAAACTTCAATAACATCCGAGGTGc < 2:1549935/140‑1 (MQ=255) tCACTATTCGTACCGCTCACCGTCGTACCGTTAGTGTTAGTTTTTAAAATTGCACCATCGTGCTGGGTAACATTTGTTGCCGTACCACCCCC‑TAACATCAAGCACGCCACCAGAATAAACTTCAATAACATCCGAGGTGc > 1:751211/1‑140 (MQ=255) cACTATTCGTACCGCTCACCGTCGTACCGTTAGTGTTAGTTTTTAAAATTGCACCATCGTGCTGGGTAACATTTGTTGCCGTACCA‑CCCCTTAACATCAAGCACGCCACCAGAATAAACTTCAATAACATCCGAGGTGCt > 1:1364819/1‑140 (MQ=255) aCTATTCGTACCGCTCACCGTCGTACCGTTAGTGTTAGTTTTTAAAATTGCACCATCGTGCTGGGTAACATTTGTTGCCGTACCACCCCC‑TAACATCAAGCACGCCACCAGAATAAACTTCAATAACATCCGAGGTGCTg < 2:472519/140‑1 (MQ=255) cTATTCGTACCGCTCACCGTCGTACCGTTAGTGTTAGTTTTTAAAATTGCACCATCGTGCTGGGTAACATTTGTTGCCGTACCACCCCC‑TAACATCAAGCACGCCACCAGAATAAACTTCAATAACATCCGa < 2:1040243/132‑1 (MQ=255) tCGTACCGCTCACCGTCGTACCGTTAGTGTTAGTTTTTAAAATTGCACCATCGTGCTGGGTAACATTTGTTGCCGTACCACCCCC‑TAACATCAAGCACGCCACCAGAATAAACTTCAATAACATCCGAGGTGCTGGTGtt > 1:1188669/1‑140 (MQ=255) cGTACCGCTCACCGTCGTACCGTTAGTGTTAGTTTTTAAAATTGCACCATCGTGCTGGGTAACATTTGTTGCCGTACCACCCCC‑TAACATCAAGCACGCCACCAGAATAAACTTCAATAACATCCGAGGTGCTGGTGTTa < 1:60460/140‑1 (MQ=255) aCCGCTCACCGTCGTACCGTTAGTGTTAGTTTTTAAAATTGCACCATCGTGCTGGGTAACATTTGTTGCCGTACCACCCCC‑TAACATCAAGCACGCCACCAGAATAAACTTCAATAACATCCGAGGTGCTGGTGTTATca > 2:743634/1‑140 (MQ=255) aCCGCTCACCGTCGTACCGTTAGTGTTAGTTTTTAAAATTGCACCATCGTGCTGGGTAACATTTGTTGCCGTACCACCCCC‑TAACATCAAGCACGCCACCAGAATAAACTTCAATAACATCCGAGGTGCTGGTGTTATca > 2:1029866/1‑140 (MQ=255) gCTCACCGTCGTACCGTTAGTGTTAGTTTTTAAAATTGCACCATCGTGCTGGGTAACATTTGTTGCCGTACCACCCCC‑TAACATCAAGCACGCCACCAGAATAAACTTCAATAACATCCGAGGTGCTGGTGTTATcaaca > 2:160093/1‑140 (MQ=255) gCTCACCGTCGTACCGTTAGTGTTAGTTTTTAAAATTGCACCATCGTGCTGGGTAACATTTGTTGCCGTACCACCCCC‑TAACATCAAGCACGCCACCAGAATAAACTTCAATAACATCCGAGGTGCTGGTGTTATcaaca > 2:267694/1‑140 (MQ=255) gCTCACCGTCGTACCGTTAGTGTTAGTTTTTAAAATTGCACCATCGTGCTGGGTAACATTTGTTGCCGTACCACCCCC‑TAACATCAAGCACGCCACCAGAATAAACTTCAATAACATCCGAGGTGCTGGTGTTATcaaca > 1:866533/1‑140 (MQ=255) cTCACCGTCGTACCGTTAGTGTTAGTTTTTAAAATTGCACCATCGTGCTGGGTAACATTTGTTGCCGTACCACCCCC‑TAACATCAAGCACGCCACCAGAATAAACTTCAATAACATCCGAGGTGCTGGTGTTATaaacaa > 1:530022/1‑140 (MQ=255) tCACCGTCGTACCGTTAGTGTTAGTTTTTAAAATTGCACCATCGTGCTGGGTAACATTTGTTGCCGTACCACCCCC‑TAACATCAAGCACGCCACCAGAATAAACTTCAATAACATCCGAGGTGCTGGTGTTATCAACAAt > 2:266263/1‑140 (MQ=255) tCACCGTCGTACCGTTAGTGTTAGTTTTTAAAATTGCACCATCGTGCTGGGTAACATTTGTTGCCGTACCACCCCC‑TAACATCAAGCACGCCACCAGAATAAACTTCAATAACATCCGAGGTGCTGGTGTTATCAACAAt > 2:433189/1‑140 (MQ=255) cACCGTCGTACCGTTAGTGTTAGTTTTTAAAATTGCACCATCGTGCTGGGTAACATTTGTTGCCGTACCACCCCC‑TAACATCAAGCACGCCACCAGAATAAACTTCAATAACATCCGAGGTGCTGGTGTTATCAACAAtt < 1:418377/140‑1 (MQ=255) gtcgtACCGTTAGTGTTAGTTTTTAAAATTGCACCATCGTGCTGGGTAACATTTGTTGCCGTACCACCCCC‑TAACATCAAGCACGCCACCAGAATAAACTTCAATAACATCCGAGGTGCTGGTGTTATCAACAATTTGCg > 1:1594336/1‑140 (MQ=255) tcgtACCGTTAGTGTTAGTTTTTAAAATTGCCCCATCGTGCTGGGTAACATTTGTTGCCGTACCACCCCC‑TATCATCAAGCACGCCACCAGAATAAACTTCAATAACATCCGAGGTGCTGGTGTTAGCAACAATTTGCGt < 2:349468/140‑1 (MQ=255) aCCGTTAGTGTTAGTTTTTAAAATTGCACCATCGTGCTGGGTAACATTTGTTGCCGTACCACCCCC‑TAACATCAAGCACGCCACCAGAATAAACTTCAATAACATCCGAGGTGCTGGTGTTATCAACAATTTGCGTGcca > 1:1173546/1‑140 (MQ=255) ccGTTAGTGTTAGTTTTTAAAATTGCACCATCGTGCTGGGTAACATTTGTTGCCGTACCACCCCC‑TAACATCAAGCACGCCACCAGAATAAACTTCAATAACATCCGAGGTGCTGGTGTTATCAACAATTTGCGTGccac < 1:1014937/140‑1 (MQ=255) ccGTTAGTGTTAGTTTTTAAAATTGCACCATCGTGCTGGGTAACATTTGTTGCCGTACCACCCCC‑TAACATCAAGCACGCCACCAGAATAAACTTCAATAACATCCGAGGTGCTGGTGTTATCAACAATTTGCGTGccac < 1:341273/140‑1 (MQ=255) ccGTTAGTGTTAGTTTTTAAAATTGCACCATCGTGCTGGGTAACATTTGTTGCCGTACCACCCCC‑TAACATCAAGCACGCCACCAGAATAAACTTCAATAACATCCGAGGTGCTGGTGTTATCAACAATTTGCGTGccac < 1:433189/140‑1 (MQ=255) ccGTTAGTGTTAGTTTTTAAAATTGCACCATCGTGCTGGGTAACATTTGTTGCCGTACCACCCCC‑TAACATCAAGCACGCCACCAGAATAAACTTCAATAACATCCGAGGTGCTGGTGTTATCAACAATTTGCGTGccac < 2:1376770/140‑1 (MQ=255) ccGTTAGTGTTAGTTTTTAAAATTGCACCATCGTGCTGGGTAACATTTGTTGCCGTACCACCCCC‑TAACATCAAGCACGCCACCAGAATAAACTTCAATAACATCCGAGGTGCTGGTGTTATCAACAATTTGCGTGccac < 2:576741/140‑1 (MQ=255) ccGTTAGTGTTAGTTTTTAAAATTGCACCATCGTGCTGGGTAACATTTGTTGCCGTACCACCCCC‑TAACATCAAGCACGCCACCAGAATAAACTTCAATAACATCCGAGGTGCTGGTGTTATCAACAATTTGCGTGccac < 2:1153903/140‑1 (MQ=255) ccGTTAGTGTTAGTTTTTAAAATTGCACCATCGTGCTGGGTAACATTTGTTGCCGTACCACCCCC‑TAACATCAAGCACGCCACCAGAATAAACTTCAATAACATCCGAGGTGCTGGTGTTATCAACAATTTGCGTGccac < 1:688361/140‑1 (MQ=255) ccGTTAGTGTTAGTTTTTAAAATTGCACCATCGTGCTGGGTAACATTTGTTGCCGTACCACCCCC‑TAACATCAAGCACGCCACCAGAATAAACTTCAATAACATCCGAGGTGCTGGTGTTATCAACAATTTGCGTGccac < 1:710441/140‑1 (MQ=255) ccGTTAGTGTTAGTTTTTAAAATTGCACCATCGTGCTGGGTAACATTTGTTGCCGTACCACCCCC‑TAACATCAAGCACGCCACCAGAATAAACTTCAATAACATCCGAGGTGCTGGTGTTATCAACAATTTGCGTGccac < 2:10202/140‑1 (MQ=255) ccGTTAGTGTTAGTTTTTAAAATTGCACCATCGTGCTGGGTAACATTTGTTGCCGTACCACCCCC‑TAACATCAAGCACGCCACCAGAATAAACTTCAATAACATCCGAGGTGCTGGTGTTATCAACAATTTGCGTGccac < 1:995630/140‑1 (MQ=255) ttagtgttagtTTTTAAAATTGCACCATCGTGCTGGGTAACATTTGTTGCCGTACCACCCCC‑TAACATCAAGCACGCCACCAGAATAAACTTCAATAACATCCGAGGTGCTGGTGTTATCAACAATTTGCGTGccac < 1:1694125/137‑1 (MQ=255) ttagtgttagtTTTTAAAATTGCACCATCGTGCTGGGTAACATTTGTTGCCGTACCACCCCC‑TAACATCAAGCACGCCACCAGAATAAACTTCAATAACATCCGAGGTGCTGGTGTTATCAACAATTTGCGTGccac > 2:1694125/1‑137 (MQ=255) ttagtgttagtTTTTAAAATTGCACCATCGTGCTGGGTAACATTTGTTGCCGTACCACCCCC‑TAACATCAAGCACGCCACCAGAATAAACTTCAATAACATCCGAGGTGCTGGTGTTATCAACAATTTGCGTGCCACCAg > 2:531042/1‑140 (MQ=255) ttagtgttagtTTTTAAAATTGCACCATCGTGCTGGGTAACATTTGTTGCCGTACCACCCCC‑TAACATCAAGCACGCCACCAGAATAAACTTCAATAACATCCGAGGTGCTGGTGTTATCAACAATTTGCGTGCCACCAg > 1:177976/1‑140 (MQ=255) agtgttagtTTTTAAAATTGCACCATCGTGCTGGGTAACATTTGTTGCCGTACCACCCCC‑TAACATCAAGCACGCCACCAGAATAAACTTCAATAACATCCGAGGTGCTGGTGTTATCAACAATTTGCGTGccac < 2:827961/135‑1 (MQ=255) agtgttagtTTTTAAAATTGCACCATCGTGCTGGGTAACATTTGTTGCCGTACCACCCCC‑TAACATCAAGCACGCCACCAGAATAAACTTCAATAACATCCGAGGTGCTGGTGTTATCAACAATTTGCGTGccac > 1:827961/1‑135 (MQ=255) agtgttagtTTTTAAAATTGCACCATCGTGCTGGGTAACATTTGTTGCCGTACCACCCCC‑TAACATCAAGCACGCCACCAGAATAAACTTCAATAACATCCGAGGTGCTGGTGTTATCAACAATTTGCGTGc > 2:582114/1‑132 (MQ=255) agtgttagtTTTTAAAATTGCACCATCGTGCTGGGTAACATTTGTTGCCGTACCACCCCC‑TAACATCAAGCACGCCACCAGAATAAACTTCAATAACATCCGAGGTGCTGGTGTTATCAACAATTTGCGTGc < 1:582114/132‑1 (MQ=255) agtgttagtTTTTAAAATTGCACCATCGTGCTGGGTAACATTTGTTGCCGTACCACCCCC‑TAACATCAAGCACGCCACCAGAATAAACTTCAATAACATCCGAGGTGCTGGTGTTATCAACAATTTGCGTGCCACCAGaa > 1:1044319/1‑140 (MQ=255) tgttagtTTTTAAAATTGCACCATCGTGCTGGGTAACATTTGTTGCCGTACCACCCCC‑TAACATCAAGCACGCCACCAGAATAAACTTCAATAACATCCGAGGTGCTGGTGTTATCAACAATTTGCGTGCCACCAGAATa < 1:1029866/140‑1 (MQ=255) tagtTTTTAAAATTGCACCATCGTGCTGGGTAACATTTGTTGCCGTACCACCCCC‑TAACATCAAGCACGCCACCAGAATAAACTTCAATAACATCCGAGGTGCTGGTGTTATCAACAATTTGCGTGCCACCAGAATAGat < 1:1671207/140‑1 (MQ=255) tttttAAAATTGCACCATCGTGCTGGGTAACATTTGTTGCCGTACCACCCCC‑TAACATCAAGCACGCCACCAGAATAAACTTCAATAACATCCGAGGTGCTGGTGTTATCAACAATTTGCGTGCCACCAGAATAGATATg > 1:1081544/1‑140 (MQ=255) cACCATCGTGCTGGGTAACATTTGTTGCCGTACCACCCCC‑TAACATCAAGCACGCCACCAGAATAAACTTCAATAACATCCGAGGTGCTGGTGTTATCAACAATTTGCGTGCCACCAGAATAGATATGCGTATTTTTTGc > 2:1273432/1‑140 (MQ=255) aCCATCGTGCTGGGTAACATTTGTTGCCGTACCACCCCC‑TAACATCAAGCACGCCACCAGAATAAACTTCAATAACATCCGAGGTGCTGGTGTTATCAACAATTTGCGTGCCACCAGAATAGATATGCGTATTTTTTGcc < 2:704129/140‑1 (MQ=255) aTCGTACTGGGTAACATTTGTTGCCGTACCACCCCC‑TAACATCAAGCACGCCACCAGAATAAACTTCAATAACATCCGAGGTGCTGGTGTTATCAACAATTTGCGTGCCACCAGAATAGATATGCGTATTTTTTGCCGtt < 1:1715305/140‑1 (MQ=255) tCGTGCTGGGTAACATTTGTTGCCGTACCACCCCC‑TAACATCAAGCACGCCACCAGAATAAACTTCAATAACATCCGAGGTGCTGGTGTTATCAACAATTTGCGTGCCACCAGAATAGATATGCGTATTTTTTGCCGTTg > 2:900680/1‑140 (MQ=255) gTGCTGGGTAACATTTGTTGCCGTACCACCCCC‑TAACATCAAGCACGCCACCAGAATAAACTTCAATAACATCCGAGGTGCTGGTGTTATCAACAATTTGCGTGCCACCAGAATAGATATGCGTATTTTTTGCCGTTGAc > 1:683271/1‑140 (MQ=255) tGCTGGGTAACATTTGTTGCCGTACCACCCCC‑TAACATCAAGCACGCCACCAGAATAAACTTCAATAACATCCGAGGTGCTGGTGTTATCAACAATTTGCGTGCCACCAGAATAGATATGCGTATTTTTTGCCGTTGACt > 2:99593/1‑140 (MQ=255) tGCTGGGTAACATTTGTTGCCGTACCACCCCC‑TAACATCAAGCACGCCACCAGAATAAACTTCAATAACATCCGAGGTGCTGGTGTTATCAACAATTTGCGTGCCACCAGAATAGATATGCGTATTTTTTGCCGTTGACt > 2:59304/1‑140 (MQ=255) tGGGTAACATTTGTTGCCGTACCACCCCC‑TAACATCAAGCACGCCACCAGAATAAACTTCAATAACATCCGAGGTGCTGGTGTTATCAACAATTTGCGTGCCACCAGAATAGATATGCGTATTTTTTGCCGTTGACTTAc < 1:1138304/140‑1 (MQ=255) ggTAACATTTGTTGCCGTACCACCCCC‑TAACATCAAGCACGCCACCAGAATAAACTTCAATAACATCCGAGGTGCTGGTGTTATCAACAATTTGCGTGCCACCAGAATAGATATGCGTATTTTTTGCCGTTGACTTAc > 2:380904/1‑138 (MQ=255) ggTAACATTTGTTGCCGTACCACCCCC‑TAACATCAAGCACGCCACCAGAATAAACTTCAATAACATCCGAGGTGCTGGTGTTATCAACAATTTGCGTGCCACCAGAATAGATATGCGTATTTTTTGCCGTTGACTTACTa > 2:1210219/1‑140 (MQ=255) ggTAACATTTGTTGCCGTACCACCCCC‑TAACATCAAGCACGCCACCAGAATAAACTTCAATAACATCCGAGGTGCTGGTGTTATCAACAATTTGCGTGCCACCAGAATAGATATGCGTATTTTTTGCCGTTGACTTACTa > 2:743228/1‑140 (MQ=255) tAACATTTGTTGCCGTACCACCCCC‑TAACATCAAGCACGCCACCAGAATAAACTTCAATAACATCCGAGGTGCTGGTGTTATCAACAATTTGCGTGCCACCAGAATAGATATGCGTATTTTTTGCCGTTGACTTACTAtt > 1:1133838/1‑140 (MQ=255) aaCATTTGTTGCCGTACCACCCCC‑TAACATCAAGCACGCCACCAGAATAAACTTCAATAACATCCGAGGTGCTGGTGTTATCAACAATTTGCGTGCCACCAGAATAGATATGCGTATTTTTTGCCGTTGACTTACTATTc < 2:631198/140‑1 (MQ=255) cATTTGTTGCCGTACCACCCCC‑TAACATCAAGCACGCCACCAGAATAAACTTCAATAACATCCGAGGTGCTGGTGTTATCAACAATTTGCGTGCCACCAGAATAGATATGCGTATTTTTTGCCGTTGACTTACTATTCag > 1:1657980/1‑140 (MQ=255) ttgttgCCGTACCACCCCC‑TAACATCAAGCACGCCACCAGAATAAACTTCAATAACATCCGAGGTGCTGGTGTTATCAACAATTTGCGTGCCACCAGAATAGATATGCGTATTTTTTGCCGTTGACTTACTATTCAgaga < 1:1273432/140‑1 (MQ=255) tgttgCCGTACCACCCCC‑TAACATCAAGCACGCCACCAGAATAAACTTCAATAACATCCGAGGTGCTGGTGTTATCAACAATTTGCGTGCCACCAGAATAGATATGCGTATTTTTTGCCGTTGACTTACTATTCAGAGAc < 2:683271/140‑1 (MQ=255) gttgCCGTACCACCCCC‑TAACATCAAGCACGCCACCAGAATAAACTTCAATAACATCCGAGGTGCTGGTGTTATCAACAATTTGCGTGCCACCAGAATAGATATGCGTATTTTTTGCCGTTGACTTACTATTCAGAGACt < 2:1213098/140‑1 (MQ=255) gttgCCGTACCACCCCC‑TAACATCAAGCACGCCACCAGAATAAACTTCAATAACATCCGAGGTGCTGGTGTTATCAACAATTTGCGTGCCACCAGAATAGATATGCGTATTTTTTGCCGTTGACTTACTATTCAGAGACt > 1:1728282/1‑140 (MQ=255) gttgCCGTACCACCCCC‑TAACATCAAGCACGCCACCAGAATAAACTTCAATAACATCCGAGGTGCTGGTGTTATCAACAATTTGCGTGCCACCAGAATAGATATGCGTATTTTTTGCCGTTGACTTACTATTCAGAGACt > 1:74453/1‑140 (MQ=255) gTACCACCCCC‑TAACATCAAGCACGCCACCAGAATAAACTTCAATAACATCCGAGGTGCTGGTGTTATCAACAATTTGCGTGCCACCAGAATAGATATGCGTATTTTTTGCCGTTGACTTACTATTCAGAGACTGAGTTc < 2:685057/140‑1 (MQ=255) gTACCACCCCC‑TAACATCAAGCACGCCACCAGAATAAACTTCAATAACATCCGAGGTGCTGGTGTTATCAACAATTTGCGTGCCACCAGAATAGATATGCGTATTTTTTGCCGTTGACTTACTATTCAGAGACTGAGTTc < 2:144392/140‑1 (MQ=255) tACCACCCCC‑TAACATCAAGCACGCCACCAGAATAAACTTCAATAACATCCGAGGTGCTGGTGTTATCAACAATTTGCGTGCCACCAGAATAGATATGCGTATTTTTTGCCGTTGACTTACTATTCAGAGACTGAGTTcc < 1:962513/140‑1 (MQ=255) | CGTTTTCCAGCAACACATTGTCTGCCACGTGATTGTGGATGGAGAATGCACCTTCACTATTCGTACCGCTCACCGTCGTACCGTTAGTGTTAGTTTTTAAAATTGCACCATCGTGCTGGGTAACATTTGTTGCCGTACCA‑CCCC‑TAACATCAAGCACGCCACCAGAATAAACTTCAATAACATCCGAGGTGCTGGTGTTATCAACAATTTGCGTGCCACCAGAATAGATATGCGTATTTTTTGCCGTTGACTTACTATTCAGAGACTGAGTTCC > NC_000913/2781766‑2782039 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |