| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 417,887 | A→G | intergenic (+56/‑2) | phoB → / → phoR | DNA‑binding transcriptional dual regulator PhoB/sensory histidine kinase PhoR |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 417,887 | 0 | A | G | 98.8% | 298.3 / ‑4.6 | 82 | intergenic (+56/‑2) | phoB/phoR | DNA‑binding transcriptional dual regulator PhoB/sensory histidine kinase PhoR |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/1); new base G (49/32); total (49/33) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.02e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.89e-01 | |||||||||||
TGGAGCCCGGCGGGCATGACCGCATGGTGCAGACCGTGCGCGGTACAGGATATCGTTTTTCAACCCGCTTTTAACGCCTTGCTCATCGGACGCAGAGCAGGGCTTATGATTTCTTAACTGGAGTATCTTACGTGCTGGAACGGCTGTCGTGGAAAAGGCTGGTGCTGGAGCTGCTACTTTGCTGCCTCCCGGCTTTCATCCTGGGTGCATTTTTTGGTTACCTGCCCTGGTTTTTGCTGGCATCGGTAACAGGACTGCTTATCTG > NC_000913/417758‑418022 | tGGAGCCCGGCGGGCATGACCGCATGGTGCAGACCGTGCGCGGTACAGGATATCGTTTTTCAACCCGCTTTTAACGCCTTGCTCATCGGACGCAGAGCAGGGCTTATGATTTCTTAACTGGAGTATCTTGCGTGCTGGaa > 2:1557565/1‑140 (MQ=255) aGCCCGGCGGGCATGACCGCATGGTGCAGACCGTGCGCGGTACAGGATATCGTTTTTCAACCCGCTTTTAACGCCTTGCTCATCGGACGCAGAGCAGGGCTTATGATTTCTTAACTGGAGTATCTTGCGTGCTGGAACgg < 2:418680/140‑1 (MQ=255) aGCCCGGCGGGCATGACCGCATGGTGCAGACCGTGCGCGGTACAGGATATCGTTTTTCAACCCGCTTTTAACGCCTTGCTCATCGGACGCAGAGCAGGGCTTATGATTTCTTAACTGGAGTATCTTGCGTGCTGGAACgg < 1:1331173/140‑1 (MQ=255) cggcggGCATGACCGCATGGTGCAGACCGTGCGCGGTACAGGATATCGTTTTTCAACCCGCTTTTAACGCCTTGCTCATCGGACGCAGAGCAGGGCTTATGATTTCTTAACTGGAGTATCTTGCGTGCTGGAACGGCTGt > 2:1410980/1‑140 (MQ=255) ggcggGCATGACCGCATGGTGCAGACCGTGCGCGGTACAGGATATCGTTTTTCAACCCGCTTTTAACGCCTTGCTCATCGGACGCAGAGCAGGGCTTATGATTTCTTAACTGGAGTATCTTGCGTGCTgg < 2:599456/130‑1 (MQ=255) ggcggGCATGACCGCATGGTGCAGACCGTGCGCGGTACAGGATATCGTTTTTCAACCCGCTTTTAACGCCTTGCTCATCGGACGCAGAGCAGGGCTTATGATTTCTTAACTGGAGTATCTTGCGTGCTgg > 1:599456/1‑130 (MQ=255) ggcggGCATGACCGCATGGTGCAGACCGTGCGCGGTACAGGATATCGTTTTTCAACCCGCTTTTAACGCCTTGCTCATCGGACGCAGAGCAGGGCTTATGATTTCTTAACTGGAGTATCTTGCGTGCTGGAACGGCTGTc < 1:409881/140‑1 (MQ=255) ggcggGCATGACCGCATGGTGCAGACCGTGCGCGGTACAGGATATCGTTTTTCAACCCGCTTTTAACGCCTTGCTCATCGGACGCAGAGCAGGGCTTATGATTTCTTAACTGGAGTATCTTGCGTGCTGGAACGGCTGTc < 2:1055750/140‑1 (MQ=255) cATGACCGCATGGTGCAGACCGTGCGCGGTACAGGATATCGTTTTTCAACCCGCTTTTAACGCCTTGCTCATCGGACGCAGAGCAGGGCTTATGATTTCTTAACTGGAGTATCTTGCGTGCTGGAACGGCTGTCGTGGaa < 1:229805/140‑1 (MQ=255) aCCGCATGGTGCAGACCGTGCGCGGTACAGGATATCGTTTTTCAACCCGCTTTTAACGCCTTGCTCATCGGACGCAGAGCAGGGCTTATGATTTCTTAACTGGAGTATCTTGCGTGCTGGAACGGCTGTCGTGGAAAAgg > 2:1319518/1‑140 (MQ=255) ccGCATGGTGCAGACCGTGCGCGGTACAGGATATCGTTTTTCAACCCGCTTTTAACGCCTTGCTCATCGGACGCAGAGCAGGGCTTATGATTTCTTAACTGGAGTATCTTGCGTGCTGGAACGGCTGTCGTGGAAAAGGc < 2:827441/140‑1 (MQ=255) cGCATGGTGCAGACCGTGCGCGGTACAGGATATCGTTTTTCAACCCGCTTTTAACGCCTTGCTCATCGGACGCAGAGCAGGGCTTATGATTTCTTAACTGGAGTATCTTGCGTGCTGGAACGGCTGTCGTGGAAAAGGCt < 1:1269819/140‑1 (MQ=255) aTGGTGCAGACCGTGCGCGGTACAGGATATCGTTTTTCAACCCGCTTTTAACGCCTTGCTCATCGGACGCAGAGCAGGGCTTATGATTTCTTAACTGGAGTATCTTGCGTGCTGGAACGGCTGTCGTGGAAAAGGCTGGt < 1:1609164/140‑1 (MQ=255) gTGCAGACCGTGCGCGGTACAGGATATCGTTTTTCAACCCGCTTTTAACGCCTTGCTCATCGGACGCAGAGCAGGGCTTATGATTTCTTAACTGGAGTATCTTGCGTGCTGGAACGGCTGTCGTGGAAAAGGCTGGTGCt < 1:1557565/140‑1 (MQ=255) tGCAGACCGTGCGCGGTACAGGATATCGTTTTTCAACCCGCTTTTAACGCCTTGCTCATCGGACGCAGAGCAGGGCTTATGATTTCTTAACTGGAGTATCTTGCGTGCTGGAACGGCTGTCGTGGAAAAGGCTGGTGCTg > 2:746952/1‑140 (MQ=255) gCAGACCGTGCGCGGTACAGGATATCGTTTTTCAACCCGCTTTTAACGCCTTGCTCATCGGACGCAGAGCAGGGCTTATGATTTCTTAACTGGAGTATCTTGCGTGCTGGAACGGCTGTCGTGGAAAAGGCTGGTGCTgg < 1:185000/140‑1 (MQ=255) gTGCGCGGTACAGGATATCGTTTTTCAACCCGCTTTTAACGCCTTGCTCATCGGACGCAGAGCAGGGCTTATGATTTCTTAACTGGAGTATCTTGCGTGCTGGAACGGCTGTCGTGGAAAAGGCTGGTGCTGGAgctgct < 1:988784/140‑1 (MQ=255) tGCGCGGTACAGGATATCGTTTTTCAACCCGCTTTTAACGCCTTGCTCATCGGCCGCAGAGCAGGGCTTATGATTTCTTAACTGGGGTATCTTGCGTGCTGGAACGGCTGTCGTGGAAAAGGCTGGTGCTGGAGCTGCTa > 1:799611/1‑140 (MQ=255) tGCGCGGTACAGGATATCGTTTTTCAACCCGCTTTTAACGCCTTGCTCATCGGACGCAGAGCAGGGCTTATGATTTCTTAACTGGAGTATCTTGCGTGCTGGAACGGCTGTCGTGGAAAAGGCTGGTGCTGGAGCTGCTa > 2:522864/1‑140 (MQ=255) tGCGCGGTACAGGATATCGTTTTTCAACCCGCTTTTAACGCCTTGCTCATCGGACGCAGAGCAGGGCTTATGATTTCTTAACTGGAGTATCTTGCGTGCTGGAACGGCTGTCGTGGAAAAGGCTGGTGCTGGAGCTGCTa > 1:4068/1‑140 (MQ=255) tGCGCGGTACAGGATATCGTTTTTCAACCCGCTTTTAACGCCTTGCTCATCGGACGCAGAGCAGGGCTTATGATTTCTTAACTGGAGTATCTTGCGTGCTGGAACGGCTGTCGTGGAAAAGGCTGGTGCTGGAGCTGCTa > 2:968656/1‑140 (MQ=255) tGCGCGGTACAGGATATCGTTTTTCAACCCGCTTTTAACGCCTTGCTCATCGGACGCAGAGCAGGGCTTATGATTTCTTAACTGGAGTATCTTGCGTGCTGGAACGGCTGTCGTGGAAAAGGCTGGTGCTGGAGCTGCTa > 1:32755/1‑140 (MQ=255) gcgcGGTACAGGATATCGTTTTTCAACCCGCTTTTAACGCCTTGCTCATCGGACGCAGAGCAGGGCTTATGATTTCTTAACTGGAGTATCTTGCGTGCTGGAACGGCTGTCGTGGAAAAGGCTGGTGCTgg > 1:80896/1‑131 (MQ=255) gcgcGGTACAGGATATCGTTTTTCAACCCGCTTTTAACGCCTTGCTCATCGGACGCAGAGCAGGGCTTATGATTTCTTAACTGGAGTATCTTGCGTGCTGGAACGGCTGTCGTGGAAAAGGCTGGTGCTgg < 2:80896/131‑1 (MQ=255) gcgcGGTACAGGATATCGTTTTTCAACCCGCTTTTAACGCCTTGCTCATCGGACGCAGAGCAGGGCTTATGATTTCTTAACTGGAGTATCTTGCGTGCTGGAACGGCTGTCGTGGAAAAGGCTGGTGCTGGAGCTGCTAc > 1:1631064/1‑140 (MQ=255) cgcgGTACAGGATATCGTTTTTCAACCCGCTTTTAACGCCTTGCTCATCGGACGCAGAGCAGGGCTTATGATTTCTTAACTGGAGTATCTTGCGTGCTGGAACGGCTGTCGTGGAAAAGGCTGGTGCTGGAGCTGCTACt > 2:141757/1‑140 (MQ=255) tACAGGATATCGTTTTTCAACCCGCTTTTAACGCCTTGCTCATCGGACGCAGAGCAGGGCTTATGATTTCTTAACTGGAGTATCTTGCGTGCTGGAACGGCTGTCGTGGAAAAGGCTGGTGCTGGAGCTGCTACTTtgct < 1:1227092/140‑1 (MQ=255) atatCGTTTTTCAACCCGCTTTTAACGCCTTGCTCATCGGACGCAGAGCAGGGCTTATGATTTCTTAACTGGAGTATCTTGCGTGCTGGAACGGCTGTCGTGGAAAAGGCTGGTGCTGGAGCTGCTACTTTGCTGCCTcc > 2:175089/1‑140 (MQ=255) atCGTTTTTCAACCCGCTTTTAACGCCTTGCTCATCGGACGCAGAGCAGGGCTTATGATTTCTTAACTGGAGTATCTTGCGTGCTGGAACGGCTGTCGTGGAAAAGGCTGGTGCTGGAGCTGCTACTTTGCTGCCTCCCg > 2:449571/1‑140 (MQ=255) cGTTTTTCAACCCGCTTTTAACGCCTTGCTCATCGGACGCAGAGCAGGGCTTATGATTTCTTAACTGGAGTATCTTGCGTGCTGGAACGGCTGTCGTGGAAAAGGCTGGTGCTGGAGCTGCTACTTTGCTGCCTCCCGGc > 1:910496/1‑140 (MQ=255) cGTTTTTCAACCCGCTTTTAACGCCTTGCTCATCGGACGCAGAGCAGGGCTTATGATTTCTTAACTGGAGTATCTTGCGTGCTGGAACGGCTGTCGTGGAAAAGGCTGGTGCTGGAGCTGCTACTTTGCTGCCTCCCGGc > 1:717246/1‑140 (MQ=255) cGTTTTTCAACCCGCTTTTAACGCCTTGCTCATCGGACGCAGAGCAGGGCTTATGATTTCTTAACTGGAGTATCTTGCGTGCTGGAACGGCTGTCGTGGAAAAGGCTGGTGCTGGAGCTGCTACTTTGCTGCCTCCCGGc > 2:337868/1‑140 (MQ=255) cGTTTTTCAACCCGCTTTTAACGCCTTGCTCATCGGACGCAGAGCAGGGCTTATGATTTCTTAACTGGAGTATCTTGCGTGCTGGAACGGCTGTCGTGGAAAAGGCTGGTGCTGGAGCTGCTACTTTGCTGCCTCCCGGc > 1:1420501/1‑140 (MQ=255) cGTTTTTCAACCCGCTTTTAACGCCTTGCTCATCGGACGCAGAGCAGGGCTTATGATTTCTTAACTGGAGTATCTTGCGTGCTGGAACGGCTGTCGTGGAAAAGGCTGGTGCTGGAGCTGCTACTTTGCTGCCTCCCGGc > 1:1729406/1‑140 (MQ=255) cGTTTTTCAACCCGCTTTTAACGCCTTGCTCATCGGACGCAGAGCAGGGCTTATGATTTCTTAACTGGAGTATCTTGCGTGCTGGAACGGCTGTCGTGGAAAAGGCTGGTGCTGGAGCTGCTACTTTGCTGCCTCCCGGc > 1:1223535/1‑140 (MQ=255) cGTTTTTCAACCCGCTTTTAACGCCTTGCTCATCGGACGCAGAGCAGGGCTTATGATTTCTTAACTGGAGTATCTTGCGTGCTGGAACGGCTGTCGTGGAAAAGGCTGGTGCTGGAGCTGCTACTTTGCTGCCTCCCGGc > 2:1584588/1‑140 (MQ=255) cGTTTTTCAACCCGCTTTTAACGCCTTGCTCATCGGACGCAGAGCAGGGCTTATGATTTCTTAACTGGAGTATCTTGCGTGCTGGAACGGCTGTCGTGGAAAAGGCTGGTGCTGGAGCTGCTACTTTGCTGCCTCCCGGc > 1:343110/1‑140 (MQ=255) cGTTTTTCAACCCGCTTTTAACGCCTTGCCCATCGGACGCAGAGCAGGGCTTATGATTTCTTAACTGGAGTATCTTGCGTGCTGGAACGGCTGTCGTGGAAAAGGCTGGTGCTGGAGCTGCTACTTTGCTGCCTCCCGGc > 2:606258/1‑140 (MQ=255) gTTTTTCAACCCGCTTTTAACGCCTTGCTCATCGGACGCAGAGCAGGGCTTATGATTTCTTAACTGGAGTATCTTGCGTGCTGGAACGGCTGTCGTGGAAAAGGCTGGTGCTGGAGCTGCTACTTTGCTGCCTCCCGGCt < 2:757920/140‑1 (MQ=255) ttCAACCCGCTTTTAACGCCTTGCTCATCGGACGCAGAGCAGGGCTTATGATTTCTTAACTGGAGTATCTTGCGTGCTGGAACGGCTGTCGTGGAAAAGGCTGGTGCTGGAGCTGCTACTTTGCTGCCTCCCGGCTTTCa > 2:1571078/1‑140 (MQ=255) ccTTGCTCATCGGACGCAGAGCAGGGCTTATGATTTCTTAACTGGAGTATCTTGCGTGCTGGAACGGCTGTCGTGGAAAAGGCTGGTGCTGGAGCTGCTACTTTGCTGCCTCCCGGCTTTCATCCTGGGTGCATTTTTTg < 2:480271/140‑1 (MQ=255) ccTTGCTCATCGGACGCAGAGCAGGGCTTATGATTTCTTAACTGGAGTATCTTGCGTGCTGGAACGGCTGTCGTGGAAAAGGCTGGTGCTGGAGCTGCTACTTTGCTGCCTCCCGGCTTTCATCCTGGGTGCATTTTTTg > 2:1265010/1‑140 (MQ=255) ttGCTCATCGGACGCAGAGCAGGGCTTATGATTTCTTAACTGGAGTATCTTGCGTGCTGGAACGGCTGTCGTGGAAAAGGCTGGTGCTGGAGCTGCTACTTTGCTGCCTCCCGGCTTTCATCCTGGGTGCATTTTTTGGt > 2:645736/1‑140 (MQ=255) gCTCATCGGACGCAGAGCAGGGCTTATGATTTCTTAACTGGAGTATCTTGCGTGCTGGAACGGCTGTCGTGGAAAAGGCTGGTGCTGGAGCTGCTACTTTGCTGCCTCCCGGCTTTCATCCTGGGTGCATTTTTTGGTTa > 2:924407/1‑140 (MQ=255) cTCATCGGACGCAGAGCAGGGCTTATGATTTCTTAACTGGAGTATCTTGCGTGCTGGAACGGCTGTCGTGGAAAAGGCTGGTGCTGGAGCTGCTACTTTGCTGCCTCCCGGCTTTCATCCTGGGTGCATTTTTTGGTTAc < 1:175089/140‑1 (MQ=255) cTCATCGGACGCAGAGCAGGGCTTATGATTTCTTAACTGGAGTATCTTGCGTGCTGGAACGGCTGTCGTGGAAAAGGCTGGTGCTGGAGCTGCTACTTTGCTGCCTCCCGGCTTTCATCCTGGGTGCATTTTTTGGTTAc < 2:1452935/140‑1 (MQ=255) cGGACGCAGAGCAGGGCTTATGATTTCTTAACTGGAGTATCTTGCGTGCTGGAACGGCTGTCGTGGAAAAGGCTGGTGCTGGAGCTGCTACTTTGCTGCCTCCCGGCTTTCATCCTGGGTGCATTTTTTGGTTACCTGcc < 1:645736/140‑1 (MQ=255) gCAGAGCAGGGCTTATGATTTCTTAACTGGAGTATCTTGCGTGCTGGAACGGCTGTCGTGGAAAAGGCTGGTGCTGGAGCTGCTACTTTGCTGCCTCCCGGCTTTCATCCTGGGTGCATTTTTTGGTTACCTGCCCTGGt > 1:1217568/1‑140 (MQ=255) agCAGGGCTTATGATTTCTTAACTGGAGTATCTTGCGTGCTGGAACGGCTGTCGTGGAAAAGGCTGGTGCTGGAGCTGCTACTTTGCTGCCTCCCGGCTTTCATCCTGGGTGCATTTTTTGGTTACCTGCCCTGGttttt > 1:726801/1‑140 (MQ=255) agCAGGGCTTATGATTTCTTAACTGGAGTATCTTGCGTGCTGGAACGGCTGTCGTGGAAAAGGCTGGTGCTGGAGCTGCTACTTTGCTGCCTCCCGGCTTTCATCCTGGGTGCATTTTTTGGTTACCTGCCCTGGttttt > 2:503789/1‑140 (MQ=255) agCAGGGCTTATGATTTCTTAACTGGAGTATCTTGCGTGCTGGAACGGCTGTCGTGGAAAAGGCTGGTGCTGGAGCTGCTACTTTGCTGCCTCCCGGCTTTCATCCTGGGTGCATTTTTTGGTTACCTGCCCTGGttttt > 2:926499/1‑140 (MQ=255) gggCTTATGATTTCTTAACTGGAGTATCTTGCGTGCTGGAACGGCTGTCGTGGAAAAGGCTGGTGCTGGAGCTGCTACTTTGCTGCCTCCCGGCTTTCATCCTGGGTGCATTTTTTGGTTACCTGCCCTGGTTTTTGCTg > 2:1080701/1‑140 (MQ=255) cTTATGATTTCTTAACTGGAGTATCTTGCGTGCTGGAACGGCTGTCGTGGAAAAGGCTGGTGCTGGAGCTGCTACTTTGCTGCCTCCCGGCTTTCATCCTGGGTGCATTTTTTGGTTACCTGCCCTGGTTTTTGCTGGCa < 2:216503/140‑1 (MQ=255) cTTATGATTTCTTAACTGGAGTATCTTGCGTGCTGGAACGGCTGTCGTGGAAAAGGCTGGTGCTGGAGCTGCTACTTTGCTGCCTCCCGGCTTTCATCCTGGGTGCATTTTTTGGTTACCTGCCCTGGTTTTTGCTGGCa < 2:1580461/140‑1 (MQ=255) cTTATGATTTCTTAACTGGAGTATCTTGCGTGCTGGAACGGCTGTCGTGGAAAAGGCTGGTGCTGGAGCTGCTACTTTGCTGCCTCCCGGCTTTCATCCTGGGTGCATTTTTTGGTTACCTGCCCTGGTTTTTGCTGGCa < 2:1223535/140‑1 (MQ=255) cTTATGATTTCTTAACTGGAGTATCTTGCGTGCTGGAACGGCTGTCGTGGAAAAGGCTGGTGCTGGAGCTGCTACTTTGCTGCCTCCCGGCTTTCATCCTGGGTGCATTTTTTGGTTACCTGCCCTGGTTTTTGCTGGCa < 1:1319518/140‑1 (MQ=255) cTTATGATTTCTTAACTGGAGTATCTTGCGTGCTGGAACGGCTGTCGTGGAAAAGGCTGGTGCTGGAGCTGCTACTTTGCTGCCTCCCGGCTTTCATCCTGGGTGCATTTTTTGGTTACCTGCCCTGGTTTTTGCTGGCa > 1:1366165/1‑140 (MQ=255) cTTATGATTTCTTAACTGGAGTATCTTGCGTGCTGGAACGGCTGTCGTGGAAAAGGCTGGTGCTGGAGCTGCTACTTTGCTGCCTCCCGGCTTTCATCCTGGGTGCATTTTTTGGTTACCTGCCCTGGTTTTTGCTGGCa < 1:970433/140‑1 (MQ=255) ttATGATTTCTTAACTGGAGTATCTTGCGTGCTGGAACGGCTGTCGTGGAAAAGGCTGGTGCTGGAGCTGCTACTTTGCTGCCTCCCGGCTTTCATCCTGGGTGCATTTTTTGGTTACCTGCCCTGGTTTTTGCTGGCAt > 2:356329/1‑140 (MQ=255) tATGATTTCTTAACTGGAGTATCTTGCGTGCTGGAACGGCTGTCGTGGAAAAGGCTGGTGCTGGAGCTGCTACTTTGCTGCCTCCCGGCTTTCATCCTGGGTGCATTTTTTGGTTACCTGCCCTGGTTTTTGCTGGCATc < 2:159686/140‑1 (MQ=255) aTGATTTCTTAACTGGAGTATCTTGCGTGCTGGAACGGCTGTCGTGGAAAAGGCTGGTGCTGGAGCTGCTACTTTGCTGCCTCCCGGCTTTCATCCTGGGTGCATTTTTTGGTTACCTGCCCTGGTTTTTGCTGGCATCg > 2:74524/1‑140 (MQ=255) aTGATTTCTTAACTGGAGTATCTTGCGTGCTGGAACGGCTGTCGTGGAAAAGGCTGGTGCTGGAGCTGCTACTTTGCTGCCTCCCGGCTTTCATCCTGGGTGCATTTTTTGGTTACCTGCCCTGGTTTTTGCTGGCATCg > 1:1201512/1‑140 (MQ=255) aTGATTTCTTAACTGGAGTATCTTGCGTGCTGGAACGGCTGTCGTGGAAAAGGCTGGTGCTGGAGCTGCTACTTTGCTGCCTCCCGGCTTTCATCCTGGGTGCATTTTTTGGTTACCTGCCCTGGTTTTTGCTGGCATCg > 2:1095313/1‑140 (MQ=255) aTGATTTCTTAACTGGAGTATCTTGCGTGCTGGAACGGCTGTCGTGGAAAAGGCTGGTGCTGGAGCTGCTACTTTGCTGCCTCCCGGCTTTCATCCTGGGTGCATTTTTTGGTTACCTGCCCTGGTTTTTGCTGGCATCg > 1:576716/1‑140 (MQ=255) aTGATTTCTTAACTGGAGTATCTTGCGTGCTGGAACGGCTGTCGTGGAAAAGGCTGGTGCTGGAGCTGCTACTTTGCTGCCTCCCGGCTTTCATCCTGGGTGCATTTTTTGGTTACCTGCCCTGGTTTTTGCTGGCATCg > 1:264344/1‑140 (MQ=255) gATTTCTTAACTGGAGTATCTTGCGTGCTGGAACGGCTGTCGTGGAAAAGGCTGGTGCTGGAGCTGCTACTTTGCTGCCTCCCGGCTTTCATCCTGGGTGCATTTTTTGGTTACCTGCCCTGGTTTTTGCTGGCATCGGt < 2:799611/140‑1 (MQ=255) tttCTTAACTGGAGTATCTTGCGTGCTGGAACGGCTGTCGTGGAAAAGGCTGGTGCTGGAGCTGCTACTTTGCTGCCTCCCGGCTTTCATCCTGGGTGCATTTTTTGGTTACCTGCCCTGGTTTTTGCTGGCATCGGTaa < 1:522864/140‑1 (MQ=255) tttCTTAACTGGAGTATCTTGCGTGCTGGAACGGCTGTCGTGGAAAAGGCTGGTGCTGGAGCTGCTACTTTGCTGCCTCCCGGCTTTCATCCTGGGTGCATTTTTTGGTTACCTGCCCTGGTTTTTGCTGGCATCGGTaa < 1:449571/140‑1 (MQ=255) ttCTTAACTGGAGTATCTTGCGTGCTGGAACGGCTGTCGTGGAAAAGGCTGGTGCTGGAGCTGCTACTTTGCTGCCTCCCGGCTTTCATCCTGGGTGCATTTTTTGGTTACCTGCCCTGGTTTTTGCTGGCa < 2:1783449/132‑1 (MQ=255) ttCTTAACTGGAGTATCTTGCGTGCTGGAACGGCTGTCGTGGAAAAGGCTGGTGCTGGAGCTGCTACTTTGCTGCCTCCCGGCTTTCATCCTGGGTGCATTTTTTGGTTACCTGCCCTGGTTTTTGCTGGCa > 1:1783449/1‑132 (MQ=255) cTTAACTGGAGTATCTTGCGTGCTGGAACGGCTGTCGTGGAAAAGGCTGGTGCTGGAGCTGCTACTTTGCTGCCTCCCGGCTTTCATCCTGGGTGCATTTTTTGGTTACCTGCCCTGGTTTTTGCTGGCATCGGTAACAg < 1:337868/140‑1 (MQ=255) ttAACTGGAGTATCTTGCGTGCTGGAACGGCTGTCGTGGAAAAGGCTGGTGCTGGAGCTGCTACTTTGCTGCCTCCCGGCTTTCATCCTGGGTGCATCTTTTGGTTACCTGCCCTGGTTTTTGCTGGCATCGGTAACAgg > 1:1014183/1‑140 (MQ=255) ttAACTGGAGTATCTTACGTGCTGGAACGGCTGTCGTGGAAAAGGCTGGTGCTGGAGCTGCTACTTTGCTGCCTCCCGGCTTTCATCCTGGGTGCATTTTTTGGTTACCTGCCCTGGTTTTTGCTGGCATCGGTAACAgg < 1:782275/140‑1 (MQ=255) tAACTGGAGTATCTTGCGTGCTGGAACGGCTGTCGTGGAAAAGGCTGGTGCTGGAGCTGCTACTTTGCTGCCTCCCGGCTTTCATCCTGGGTGCATTTTTTGGTTACCTGCCCTGGTTTTTGCTGGCATCGGTAACAGGa > 1:1255451/1‑140 (MQ=255) aaCTGGAGTATCTTGCGTGCTGGAACGGCTGTCGTGGAAAAGGCTGGTGCTGGAGCTGCTACTTTGCTGCCTCCCGGCTTTCATCCTGGGTGCATTTTTTGGTTACCTGCCCTGGTTTTTGCTGGCATCGGTAACAGGAc > 1:1153455/1‑140 (MQ=255) aaCTGGAGTATCTTGCGTGCTGGAACGGCTGTCGTGGAAAAGGCTGGTGCTGGAGCTGCTACTTTGCTGCCTCCCGGCTTTCATCCTGGGTGCATTTTTTGGTTACCTGCCCTGGTTTTTGCTGGCATCGGTAACAGGAc < 1:606258/140‑1 (MQ=255) cTGGAGTATCTTGCGTGCTGGAACGGCTGTCGTGGAAAAGGCTGGTGCTGGAGCTGCTACTTTGCTGCCTCCCGGCTTTCATCCTGGGTGCATTTTTTGGTTACCTGCCCTGGTTTTTGCTGGCATCGGTAACAGGACTg > 1:1427371/1‑140 (MQ=255) tGGAGTATCTTGCGTGCTGGAACGGCTGTCGTGGAAAAGGCTGGTGCTGGAGCTGCTACTTTGCTGCCTCCCGGCTTTCATCCTGGGTGCATTTTTTGGTTACCTGCCCTGGTTTTTGCTGGCATCGGTAACAGGACTGc > 2:1204196/1‑140 (MQ=255) gAGTATCTTGCGTGCTGGAACGGCTGTCGTGGAAAAGGCTGGTGCTGGAGCTGCTACTTTGCTGCCTCCCGGCTTTCATCCTGGGTGCATTTTTTGGTTACCTGCCCTGGTTTTTGCTGGCATCGGTAACAGGACTGCtt > 2:296721/1‑140 (MQ=255) gTATCTTGCGTGCTGGAACGGCTGTCGTGGAAAAGGCTGGTGCTGGAGCTGCTACTTTGCTGCCTCCCGGCTTTCATCCTGGGTGCATTTTTTGGTTACCTGCCCTGGTTTTTGCTGGCATCGGTAACAGGACTGCTTAt > 1:385335/1‑140 (MQ=255) aTCTTGCGTGCTGGAACGGCTGTCGTGGAAAAGGCTGGTGCTGGAGCTGCTACTTTGCTGCCTCCCGGCTTTCATCCTGGGTGCATTTTTTGGTTACCTGCCCTGGTTTTTGCTGGCATCGGTAACAGGACTGCTTATCt < 2:1366165/140‑1 (MQ=255) tCTTGCGTGCTGGAACGGCTGTCGTGGAAAAGGCTGGTGCTGGAGCTGCTACTTTGCTGCCTCCCGGCTTTCATCCTGGGTGCATTTTTTGGTTACCTGCCCTGGTTTTTGCTGGCATCGGTAACAGGACTGCTTATCTg > 2:303502/1‑140 (MQ=255) | TGGAGCCCGGCGGGCATGACCGCATGGTGCAGACCGTGCGCGGTACAGGATATCGTTTTTCAACCCGCTTTTAACGCCTTGCTCATCGGACGCAGAGCAGGGCTTATGATTTCTTAACTGGAGTATCTTACGTGCTGGAACGGCTGTCGTGGAAAAGGCTGGTGCTGGAGCTGCTACTTTGCTGCCTCCCGGCTTTCATCCTGGGTGCATTTTTTGGTTACCTGCCCTGGTTTTTGCTGGCATCGGTAACAGGACTGCTTATCTG > NC_000913/417758‑418022 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |