| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,358,767 | T→C | T27A (ACG→GCG) | yfaU ← | 2‑keto‑3‑deoxy‑L‑rhamnonate aldolase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,358,767 | 0 | T | C | 99.3% | 539.8 / ‑4.9 | 149 | T27A (ACG→GCG) | yfaU | 2‑keto‑3‑deoxy‑L‑rhamnonate aldolase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/0); new base C (63/85); total (64/85) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.30e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.42e-01 | |||||||||||
Only 100 of 152 total aligned reads displayed.
CACGGGTTGGCTGGCATAGGGCGCTACCGCCTGTAGCTGATGATAAAGATCCTGAATGGTGTTTGGCGCGTGCTCCCCGTCAATCAGCAACCAGTCATAACCAGAAGTGGCGGCAATTTCTGCCATATAGGCAGTCGTTGAGCTTAACCACAGACCAATTTGCACTTCGCCCTTGCGTAAACGTTCTTTAAAGGGATTGCTTAATAATGCGTTCATCGTGTTCCTTAACCTATTTAATGATGTGCCACGTCGGTCTGCGCAACAGTGCGA > NC_000913/2358630‑2358899 | cACGGGTTGGCTGGCATAGGGCGCTACCGCCTGTAGCTGATGATAAAGATCCTGAATGGTGTTTGGCGCGTGCTCCCCGTCAATCAGCAACCAGTCATAACCAGAAGTGGCGGCAATTTCTGCCATATAGGCAGTCGCTg < 2:1319406/140‑1 (MQ=255) ggctggcATAGGGCGCTACCGCCTGTAGCTGATGATAAAGATCCTGAATGGTGTTTGGCGCGTGCTCCCCGTCAATCAGCAACCAGTCATAACCAGAAGTGGCGGCAATTTCTGCCATATAGGCAGTCGCTGAGCTTAAc > 1:980028/1‑140 (MQ=255) ggctggcATAGGGCGCTACCGCCTGTAGCTGATGATAAAGATCCTGAATGGTGTTTGGCGCGTGCTCCCCGTCAATCAGCAACCAGTCATAACCAGAAGTGGCGGCAATTTCTGCCATATAGGCAGTCGCTGAGCTTAAc > 1:25738/1‑140 (MQ=255) gcATAGGGCGCTACCGCCTGTAGCTGATGATAAAGATCCTGAATGGTGTTTGGCGCGTGCTCCCCGTCAATCAGCAACCAGTCATAACCAGAAGTGGCGGCAATTTCTGCCATATAGGCAGTCGCTGAGCTTAACCACAg > 2:1646685/1‑140 (MQ=255) cATAGGGCGCTACCGCCTGTAGCTGATGATAAAGATCCTGAATGGTGTTTGGCGCGTGCTCCCCGTCAATCAGCAACCAGTCATAACCAGAAGTGGCGGCAATTTCTGCCATATAGGCAGTCGCTGAGCTTAACCACAGa < 1:188940/140‑1 (MQ=255) aTAGGGCGCTACCGCCTGTAGCTGATGATAAAGATCCTGAATGGTGTTTGGCGCGTGCTCCCCGTCAATCAGCAACCAGTCATAACCAGAAGTGGCGGCAATTTCTGCCATATAGGCAGTCGCTGAGCTTAACCACAGa < 1:341961/139‑1 (MQ=255) aTAGGGCGCTACCGCCTGTAGCTGATGATAAAGATCCTGAATGGTGTTTGGCGCGTGCTCCCCGTCAATCAGCAACCAGTCATAACCAGAAGTGGCGGCAATTTCTGCCATATAGGCAGTCGCTGAGCTTAACCACAGa > 2:341961/1‑139 (MQ=255) ggCGCTACCGCCTGTAGCTGATGTTAAAGATCCTGAATGGTGTTTGGCGCGTGCTCCCCGTCAATCAGCAACCGGTCATAACCAGAAGTGGCGGCAATTTCTGCCATATAGGCAGTCGCTGAGCTTAACCACAGACCAAt > 1:1370428/1‑140 (MQ=255) ggCGCTACCGCCTGTAGCTGATGATAAAGATCCTGAATGGTGTTTGGCGCGTGCTCCCCGTCAATCAGCAACCAGTCATAACCAGAAGTGGCGGCAATTTCTGCCATATAGGCAGTCGCTGAGCTTAACCACAGACCAAt > 2:1760503/1‑140 (MQ=255) gcTACCGCCTGTAGCTGATGATAAAGATCCTGAATGGTGTTTGGCGCGTGCTCCCCGTCAATCAGCAACCAGTCATAACCAGAAGTGGCGGCAATTTCTGCCATATAGGCAGTCGCTGAGCTTAACCACAGACCAATTTg < 1:607955/140‑1 (MQ=255) cTACCGCCTGTAGCTGATGATAAAGATCCTGAATGGTGTTTGGCGCGTGCTCCCCGTCAATCAGCAACCAGTCATAACCAGAAGTGGCGGCAATTTCTGCCATATAGGCAGTCGCTGAGCTTAACCACAGACCAATTTGc > 2:812379/1‑140 (MQ=255) cTACCGCCTGTAGCTGATGATAAAGATCCTGAATGGTGTTTGGCGCGTGCTCCCCGTCAATCAGCAACCAGTCATAACCAGAAGTGGCGGCAATTTCTGCCATATAGGCAGTCGCTGAGCTTAACCACAGACCAATTTGc > 1:312101/1‑140 (MQ=255) cTACCGCCTGTAGCTGATGATAAAGATCCTGAATGGTGTTTGGCGCGTGCTCCCCGTCAATCAGCAACCAGTCATAACCAGAAGTGGCGGCAATTTCTGCCATATAGGCAGTCGCTGAGCTTAACCACAGACCAATTTGc > 1:1531604/1‑140 (MQ=255) cTACCGCCTGTAGCTGATGATAAAGATCCTGAATGGTGTTTGGCGCGTGCTCCCCGTCAATCAGCAACCAGTCATAACCAGAAGTGGCGGCAATTTCTGCCATATAGGCAGTCGCTGAGCTTAACCACAGACCAATTTGc > 2:260705/1‑140 (MQ=255) cTACCGCCTGTAGCTGATGATAAAGATCCTGAATGGTGTTTGGCGCGTGCTCCCCGTCAATCAGCAACCAGTCATAACCAGAAGTGGCGGCAATTTCTGCCATATAGGCAGTCGCTGAGCTTAACCACAGACCAATTTGc > 1:1214356/1‑140 (MQ=255) tACCGCCTGTAGCTGATGATAAAGATCCTGAATGGTGTTTGGCGCGTGCTCCCCGTCAATCAGCAACCAGTCATAACCAGAAGTGGCGGCAATTTCTGCCATATAGGCAGTCGCTGAGCTTAACCACAGa < 2:581576/130‑1 (MQ=255) tGTAGCTGATGATAAAGATCCTGAATGGTGTTTGGCGCGTGCTCCCCGTCAATCAGCAACCAGTCATAACCAGAAGTGGCGGCAATTTCTGCCATATAGGCAGTCGCTGAGCTTAACCACAGACCAATTTGCACTTCGcc < 1:136655/140‑1 (MQ=255) cTGATGATAAAGATCCTGAATGGTGTTTGGCGCGTGCTCCCCGTCAATCAGCAACCAGTCATAACCAGAAGTGGCGGCAATTTCTGCCATATAGGCAGTCGCTGAGCTTAACCACAGACCAATTTGCACTTCGCCCTTGc > 2:477550/1‑140 (MQ=255) gatgatAAAGATCCTGAATGGTGTTTGGCGCGTGCTCCCCGTCAATCAGCAACCAGTCATAACCAGAAGTGGCGGCAATTTCTGCCATATAGGCAGTCGCTGAGCTTAACCACAGACCAATTTGCACTTCGCCCTTGCGt < 2:24014/140‑1 (MQ=255) atgatAAAGATCCTGAATGGTGTTTGGCGCGTGCTCCCCGTCAATCAGCAACCAGTCATAACCAGAAGTGGCGGCAATTTCTGCCATATAGGCAGTCGCTGAGCTTAACCACAGACCAATTTGCACTTCGCCCTTGCGTa > 2:618847/1‑140 (MQ=255) atgatAAAGATCCTGAATGGTGTTTGGCGCGTGCTCCCCGTCAATCAGCAACCAGTCATAACCAGAAGTGGCGGCAATTTCTGCCATATAGGCAGTCGCTGAGCTTAACCACAGACCAATTTGCACTTCGCCCTTGCGTa > 1:1406168/1‑140 (MQ=255) atgatAAAGATCCTGAATGGTGTTTGGCGCGTGCTCCCCGTCAATCAGCAACCAGTCATAACCAGAAGCGGCGGCAATTTCTGCCATATAGGCAGTCGCTGAGCTTAACCACAGACCAATTTGCACTTCGCCCTTGCGTa > 2:572379/1‑140 (MQ=255) gatAAAGATCCTGAATGGTGTTTGGCGCGTGCTCCCCGTCAATCAGCAACCAGTCATAACCAGAAGTGGCGGCAATTTCTGCCATATAGGCAGTCGCTGAGCTTAACCACAGACCAATTTGCACTTCGCCCTTGCGTaaa > 2:1771102/1‑140 (MQ=255) atAAAGATCCTGAATGGTGTTTGGCGCGTGCTCCCCGTCAATCAGCAACCAGTCATAACCAGAAGTGGCGGCAATTTCTGCCATATAGGCAGTCGCTGAGCTTAACCACAGACCAATTTGCACTTCGCCCTTGCGTAAAc < 2:1819980/140‑1 (MQ=255) atAAAGATCCTGAATGGTGTTTGGCGCGTGCTCCCCGTCAATCAGCAACCAGTCATAACCAGAAGTGGCGGCAATTTCTGCCATATAGGCAGTCGCTGAGCTTAACCACAGACCAATTTGCACTTCGCCCTTGCGTAAAc < 2:1100170/140‑1 (MQ=255) atAAAGATCCTGAATGGTGTTTGGCGCGTGCTCCCCGTCAATCAGCAACCAGTCATAACCAGAAGTGGCGGCAATTTCCGCCATATAGGCAGTCGCTGAGCTTAACCACAGACCAATTTGCACTTCGCCCTTGCGTAAAc < 2:1746295/140‑1 (MQ=255) tAAAGATCCTGAATGGTGTTTGGCGCGTGCTCCCCGTCAATCAGCAACCAGTCATAACCAGAAGTGGCGGCAATTTCTGCCATATAGGCAGTCGCTGAGCTTAACCACAGACCAATTTGCACTTCGCCCTTGCGTAAACg < 1:477550/140‑1 (MQ=255) tAAAGATCCTGAATGGTGTTTGGCGCGTGCTCCCCGTCAATCAGCAACCAGTCATAACCAGAAGTGGCGGCAATTTCTGCCATATAGGCAGTCGCTGAGCTTAACCACAGACCAATTTGCACTTCGCCCTTGCGTAAACg < 2:1834291/140‑1 (MQ=255) aaaGATCCTGAATGGTGTTTGGCGCGTGCTCCCCGTCAATCAGCAACCAGTCATAACCAGAAGTGGCGGCAATTTCTGCCATATAGGCAGTCGCTGAGCTTAACCACAGACCAATTTGCACTTCGCCCTTGCGTAAACGt < 2:1041247/140‑1 (MQ=255) aaaGATCCTGAATGGTGTTTGGCGCGTGCTCCCCGTCAATCAGCAACCAGTCATAACCAGAAGTGGCGGCAATTTCTGCCATATAGGCAGTCGCTGAGCTTAACCACAGACCAATTTGCACTTCGCCCTTGCGTAAACGt > 1:1695553/1‑140 (MQ=255) cTGAATGGTGTTTGGCGCGTGCTCCCCGTCAATCAGCAACCAGTCATAACCAGAAGTGGCGGCAATTTCTGCCATATAGGCAGTCGCTGAGCTTAACCACAGACCAATTTGCACTTCGCCCTTGCGTAAACGTTCTTTaa > 2:449549/1‑140 (MQ=255) cTGAATGGTGTTTGGCGCGTGCTCCCCGTCAATCAGCAACCAGTCATAACCAGAAGTGGCGGCAATTTCTGCCATATAGGCAGTCGCTGAGCTTAACCACAGACCAATTTGCACTTCGCCCTTGCGTAAACGTTCTTTaa > 1:657426/1‑140 (MQ=255) gAATGGTGTTTGGCGCGTGCTCCCCGTCAATCAGCAACCAGTCATAACCAGAAGTGGCGGCAATTTCTGCCATATAGGCAGTCGCTGAGCTTAACCACAGACCAATTTGCACTTCGCCCTTGCGTAAACGt < 1:1450195/131‑1 (MQ=255) aaTGGTGTTTGGCGCGTGCTCCCCGTCAATCAGCAACCAGTCATAACCAGAAGTGGCGGCAATTTCTGCCATATAGGCAGTCGCTGAGCTTAACCACAGACCAATTTGCACTTCGCCCTTGCGTAAACGTTc > 1:1100296/1‑132 (MQ=255) aaTGGTGTTTGGCGCGTGCTCCCCGTCAATCAGCAACCAGTCATAACCAGAAGTGGCGGCAATTTCTGCCATATAGGCAGTCGCTGAGCTTAACCACAGACCAATTTGCACTTCGCCCTTGCGTAAACGTTCTTTAAAgg < 1:1822331/140‑1 (MQ=255) aaTGGTGTTTGGCGCGTGCTCCCCGTCAATCAGCAACCAGTCATAACCAGAAGTGGCGGCAATTTCTGCCATATAGGCAGTCGCTGAGCTTAACCACAGACCAATTTGCACTTCGCCCTTGCGTAAACGTTCTTTAAAgg > 1:1803271/1‑140 (MQ=255) aTGGTGTTTGGCGCGTGCTCCCCGTCAATCAGCAACCAGTCATAACCAGAAGTGGCGGCAATTTCTGCCATATAGGCAGTCGCTGAGCTTAACCACAGACCAATTTGCACTTCGCCCTTGCGTAAACGTTCTTTAAAggg > 1:690411/1‑140 (MQ=255) tGGTGTTTGGCGCGTGCTCCCCGTCAATCAGCAACCGGTCATAACCAGAAGTGGCGGCAATTTCTGCCATATAGGCAGTCGCTGAGCTTAACCACAGACCAATTTGCACTTCGCCCTTGCGTAAACGTTCTTTAAAGGGa < 2:1370428/140‑1 (MQ=255) tGGTGTTTGGCGCGTGCTCCCCGTCAATCAGCAACCAGTCATAACCAGAAGTGGCGGCAATTTCTGCCATATAGGCAGTCGCTGAGCTTAACCACAGACCAATTTGCACTTCGCCCTTGCGTAAACGTTCTTTAAAGGGa < 2:690411/140‑1 (MQ=255) tGGTGTTTGGCGCGTGCTCCCCGTCAATCAGCAACCAGTCATAACCAGAAGTGGCGGCAATTTCTGCCATATAGGCAGTCGCTGAGCTTAACCACAGACCAATTTGCACTTCGCCCTTGCGTAAACGTTCTTTAAAGGGa < 2:1228924/140‑1 (MQ=255) tGGTGTTTGGCGCGTGCTCCCCGTCAATCAGCAACCAGTCATAACCAGAAGTGGCGGCAATTTCTGCCATATAGGCAGTCGCTGAGCTTAACCACAGACCAATTTGCACTTCGCCCTTGCGTAAACGTTCTTTAAAGGGa < 2:1086348/140‑1 (MQ=255) tGGTGTTTGGCGCGTGCTCCCCGTCAATCAGCAACCAGTCATAACCAGAAGTGGCGGCAATTTCTGCCATATAGGCAGTCGCTGAGCTTAACCACAGACCAATTTGCACTTCGCCCTTGCGTAAACGTTCTTTAAAGGGa < 1:108391/140‑1 (MQ=255) tGGTGTTTGGCGCGTGCTCCCCGTCAATCAGCAACCAGTCATAACCAGAAGTGGCGGCAATTTCTGCCATATAGGCAGTCGCTGAGCTTAACCACAGACCAATTTGCACTTCGCCCTTGCGTAAACGTTCTTTAAAGGGa < 1:1771102/140‑1 (MQ=255) tGGTGTTTGGCGCGTGCTCCCCGTCAATCAGCAACCAGTCATAACCAGAAGTGGCGGCAATTTCTGCCATATAGGCAGTCGCTGAGCTTAACCACAAACCAATTTGCACTTCGCCCTTGCGTAAACGTTCTTTAAAGGGa < 2:329906/140‑1 (MQ=255) gtgtTTGGCGCGTGCTCCCCGTCAATCAGCAACCAGTCATAACCAGAAGTGGCGGCAATTTCTGCCATATAGGCAGTCGCTGAGCTTAACCACAGACCAATTTGCACTTCGCCCTTGCGTAAACGTTCTTTAAAGGGAtt < 2:1750487/140‑1 (MQ=255) gtgtTTGGCGCGTGCTCCCCGTCAATCAGCAACCAGTCATAACCAGAAGTGGCGGCAATTTCTGCCATATAGGCAGTCGCTGAGCTTAACCACAGACCAATTTGCACTTCGCCCTTGCGTAAACGTTCTTTAAAGGGAtt < 1:1760503/140‑1 (MQ=255) gtgtTTGGCGCGTGCTCCCCGTCAATCAGCAACCAGTCATAACCAGAAGTGGCGGCAATTTCTGCCATATAGGCAGTCGCTGAGCTTAACCACAGACCAATTTGCACTTCGCCCTTGCGTAAACGTTCTTTAAAGGGAtt > 2:1520924/1‑140 (MQ=255) gtgtTTGGCGCGTGCTCCCCGTCAATCAGCAACCAGTCATAACCAGAAGTGGCGGCAATTTCTGCCATATAGGCAGTCGCTGAGCTTAACCACAGACCAATTTGCACTTCGCCCTTGCGTAAACGTTCTTTAAAGGGAtt < 2:1406168/140‑1 (MQ=255) tgtTTGGCGCGTGCTCCCCGTCAATCAGCAACCAGTCATAACCAGAAGTGGCGGCAATTTCTGCCATATAGGCAGTCGCTGAGCTTAACCACAGACCAATTTGCACTTCGCCCTTGCGTAAACGTTCTTTAAAGGGATTg > 1:1119496/1‑140 (MQ=255) tgtTTGGCGCGTGATCCCCGTCAATCAGCAACCAGTCATAACCAGAAGTGGCGGCAATTTCTGCCATATAGGCAGTCGCTGAGCTTAACCACAGACCAATTTGCACTTCGCCCTTGCGTAAACGTTCTTTAAAGGGATTg > 2:972743/1‑140 (MQ=255) tttGGCGCGTGCTCCCCGTCAATCAGCAACCAGTCATAACCAGAAGTGGCGGCAATTTCTGCCATATAGGCAGTCGCTGAGCTTAACCACAGACCAATTTGCACTTCGCCCTTGCGTAAACGTTCTTTAAAGGGATTGCt > 1:1267842/1‑140 (MQ=255) tGGCGCGTGCTCCCCGTCAATCAGCAACCAGTCATAACCAGAAGTGGCGGCAATTTCTGCCATATAGGCAGTCGCTGAGCTTAACCACAGACCAATTTGCACTTCGCCCTTGCGTAAACGTTCTTTAAAGGGa > 1:1603072/1‑133 (MQ=255) tGGCGCGTGCTCCCCGTCAATCAGCAACCAGTCATAACCAGAAGTGGCGGCAATTTCTGCCATATAGGCAGTCGCTGAGCTTAACCACAGACCAATTTGCACTTCGCCCTTGCGTAAACGTTCTTTAAAGGGa < 2:1603072/133‑1 (MQ=255) ggCGCGTGCTCCCCGTCAATCAGCAACCAGTCATAACCAGAAGTGGCGGCAATTTCTGCCATATAGGCAGTCGCTGAGCTTAACCACAGACCAATTTGCACTTCGCCCTTGCGTAAACGTTCTTTAAAGGGATTGCTtaa > 1:1258243/1‑140 (MQ=255) cgcgTGCTCCCCGTCAATCAGCAACCAGTCATAACCAGAAGTGGCGGCAATTTCTGCCATATAGGCAGTCGCTGAGCTTAACCACAGACCAATTTGCACTTCGCCCTTGCGTAAACGTTCTTTaa < 2:1417173/125‑1 (MQ=255) cgTGCTCCCCGTCAATCAGCAACCAGTCATAACCAGAAGTGGCGGCAATTTCTGCCATATAGGCAGTCGCTGAGCTTAACCACAGACCAATTTGCACTTCGCCCTTGCGTAAACGTTCTTTAAAGGGa > 1:5386/1‑128 (MQ=255) cgTGCTCCCCGTCAATCAGCAACCAGTCATAACCAGAAGTGGCGGCAATTTCTGCCATATAGGCAGTCGCTGAGCTTAACCACAGACCAATTTGCACTTCGCCCTTGCGTAAACGTTCTTTAAAGGGa < 2:5386/128‑1 (MQ=255) cgTGCTCCCCGTCAATCAGCAACCAGTCATAACCAGAAGTGGCGGCAATTTCTGCCATATAGGCAGTCGCTGAGCTTAACCACAGACCAATTTGCACTTCGCCCTTGCGTAAACGTTCTTTAAAGGGATTGCTTaataat > 2:618718/1‑140 (MQ=255) cgTGCTCCCCGTCAATCAGCAACCAGTCATAACCAGAAGTGGCGGCAATTTCTGCCATATAGGCAGTCGCTGAGCTTAACCACAGACCAATTTGCACTTCGCCCTTGCGTAAACGTTCTTTAAAGGGATTGCTTaataat > 1:1187505/1‑140 (MQ=255) tCCCCGTCAATCAGCAACCAGTCATAACCAGAAGTGGCGGCAATTTCTGCCATATAGGCAGTCGCTGAGCTTAACCACAGACCAATTTGCACTTCGCCCTTGCGTAAACGTTCTTTAAAGGGATTGCTTAATAATGCGtt < 2:1119496/140‑1 (MQ=255) ccGTCAATCAGCAACCAGTCATAACCAGAAGTGGCGGCAATTTCTGCCATATAGGCAGTCGCTGAGCTTAACCACAGACCAATTTGCACTTCGCCCTTGCGTAAACGTTCTTTAAAGGGATTGCTTAATAATGCGTTCAt > 1:754291/1‑140 (MQ=255) gTCAATCAGCAACCAGTCATAACCAGAAGTGGCGGCAATTTCTGCCATATAGGCAGTCGCTGAGCTTAACCACAGACCAATTTGCACTTCGCCCTTGCGTAAACGTTCTTTAAAGGGATTGCTTAATAATGCGTTCATCg < 1:1627798/140‑1 (MQ=255) gTCAATCAGCAACCAGTCATAACCAGAAGTGGCGGCAATTTCTGCCATATAGGCAGTCGCTGAGCTTAACCACAGACCAATTTGCACTTCGCCCTTGCGTAAACGTTCTTTAAAGGGATTGCTTAATAATGCGTTCATCg < 1:1751157/140‑1 (MQ=255) tCAATCAGCAACCAGTCATAACCAGAAGTGGCGGCAATTTCTGCCATATAGGCAGTCGCTGAGCTTAACCACAGACCAATTTGCACTTCGCCCTTGCGTAAACGTTCTTTAAAGGGATTGTTTAATAATGCGTTCATCgt < 2:837241/140‑1 (MQ=255) tCAATCAGCAACCAGTCATAACCAGAAGTGGCGGCAATTTCTGCCATATAGGCAGTCGCTGAGCTTAACCACAGACCAATTTGCACTTCGCCCTTGCGTAAACGTTCTTTAAAGGGATTGCTTAATAATGCGTTCATCgt < 1:5624/140‑1 (MQ=255) cAATCAGCAACCAGTCATAACCAGAAGTGGCGGCAATTTCTGCCATATAGGCAGTCGCTGAGCTTAACCACAGACCAATTTGCACTTCGCCCTTGCGTAAACGTTCTTTAAAGGGATTGCTTAATAATGCGTTCATCgtg < 1:1366829/140‑1 (MQ=255) cAATCAGCAACCAGTCATAACCAGAAGTGGCGGCAATTTCTGCCATATAGGCAGTCGCTGAGCTTAACCACAGACCAATTTGCACTTCGCCCTTGCGTAAACGTTCTTTAAAGGGATTGCTTAATAATGCGTTCATCgtg < 1:812379/140‑1 (MQ=255) aaTCAGCAACCAGTCATAACCAGAAGTGGCGGCAATTTCTGCCATATAGGCAGTCGCTGAGCTTAACCACAGACCAATTTGCACTTCGCCCTTGCGTAAACGTTCTTTAAAGGGATTGCTTAATAATGCGTTCATCgtgt < 2:1773759/140‑1 (MQ=255) cAGCAACCAGTCATAACCAGAAGTGGCGGCAATTTCTGCCATATAGGCAGTCGCTGAGCTTAACCACAGACCAATTTGCACTTCGCCCTTGCGTAAACGTTCTTTAAAGGGATTGCTTAATAATGCGTTCATCGTGTTcc < 2:657426/140‑1 (MQ=255) gCAACCAGTCATAACCAGAAGTGGCGGCAATTTCTGCCATATAGGCAGTCGCTGAGCTTAACCACAGACCAATTTGCACTTCGCCCTTGCGTAAACGTTCTTTAAAGGGATTGCTTAATAATGCGTTCATCGTGTTCCtt < 2:1402479/140‑1 (MQ=255) aaCCAGTCATAACCAGAAGTGGCGGCAATTTCTGCCATATAGGCAGTCGCTGAGCTTAACCACAGACCAATTTGCACTTCGCCCTTGCGTAAACGTTCTTTAAAGGGATTGCTTAATAATGCGTTCATCGTGTTCCTTaa < 1:1646685/140‑1 (MQ=255) aCCAGTCATAACCAGAAGTGGCGGCAATTTCTGCCATATAGGCAGTCGCTGAGCTTAACCACAGACCAATTTGCACTTCGCCCTTGCGTAAACGTTCTTTAAAGGGATTGCTTAATAATGCGTTCATCGTGTTCCTTAAc < 2:1289212/140‑1 (MQ=255) aCCAGTCATAACCAGAAGTGGCGGCAATTTCTGCCATATAGGCAGTCGCTGAGCTTAACCACAGACCAATTTGCACTTCGCCCTTGCGTAAACGTTCTTTAAAGGGATTGCTTAATAATGCGTTCATCGTGTTCCTTAAc < 1:1520924/140‑1 (MQ=255) aCCAGTCATAACCAGAAGTGGCGGCAATTTCTGCCATATAGGCAGTCGCTGAGCTTAACCACAGACCAATTTGCACTTCGCCCTTGCGTAAACGTTCTTTAAAGGGATTGCTTAATAATGCGTTCATCGTGTTCCTTAAc < 2:25738/140‑1 (MQ=255) aCCAGTCATAACCAGAAGTGGCGGCAATTTCTGCCATATAGGCAGTCGCTGAGCTTAACCACAGACCAATTTGCACTTCGCCCTTGCGTAAACGTTCTTTAAAGGGATTGCTTAATAATGCGTTCATCGTGTTCCTTAAc < 2:1463188/140‑1 (MQ=255) aCCAGTCATAACCAGAAGTGGCGGCAATTTCTGCCATATAGGCAGTCGCTGAGCTTAACCACAGACCAATTTGCACTTCGCCCTTGCGTAAACGTTCTTTAAAGGGATTGCTTAATAATGCGTTCATCGTGTTCCTTAAc < 1:1426988/140‑1 (MQ=255) aCCAGTCATAACCAGAAGTGGCGGCAATTTCTGCCATATAGGCAGTCGCTGAGCTTAACCACAGACCAATTTGCACTTCGCCCTTGCGTAAACGTTCTTTAAAGGGATTGCTTAATAATGCGTTCATCGTGTTCCTTAAc > 2:1225684/1‑140 (MQ=255) ccAGTCATAACCAGAAGTGGCGGCAATTTCTGCCATATAGGCAGTCGCTGAGCTTAACCACAGACCAATTTGCACTTCGCCCTTGCGTAAACGTTCTTTAAAGGGATTGCTTAATAATGCGTTCATCGTGTTCCTTAAcc < 2:407196/140‑1 (MQ=255) ccAGTCATAACCAGAAGTGGCGGCAATTTCTGCCATATAGGCAGTCGCTGAGCTTAACCACAGACCAATTTGCACTTCGCCCTTGCGTAAACGTTCTTTAAAGGGATTGCTTAATAATGCGTTCATCGTGTTCCTTAAcc < 2:1806707/140‑1 (MQ=255) gTCATAACCAGAAGTGGCGGCAATTTCTGCCATATAGGCAGTCGCTGAGCTTAACCACAGACCAATTTGCACTTCGCCCTTGCGTAAACGTTCTTTAAAGGGATTGCTTAATAATGCGTTCATCGTGTTCCTTAACCTa > 1:50391/1‑139 (MQ=255) gTCATAACCAGAAGTGGCGGCAATTTCTGCCATATAGGCAGTCGCTGAGCTTAACCACAGACCAATTTGCACTTCGCCCTTGCGTAAACGTTCTTTAAAGGGATTGCTTAATAATGCGTTCATCGTGTTCCTTAACCTAt > 1:457674/1‑140 (MQ=255) aTAACCAGAAGTGGCGGCAATTTCTGCCATATAGGCAGTCGCTGAGCTTAACCACAGACCAATTTGCACTTCGCCCTTGCGTAAACGTTCTTTAAAGGGATTGCTTAATAATGCGTTCATCGTGTTCCTTAACCTATTTa < 2:1367176/140‑1 (MQ=255) cAGAAGTGGCGGCAATTTCTGCCATATAGGCAGTCGTTGAGCTTAACCACAGACCAATTTGCACTTCGCCCTTGCGTAAACGTTCTTTAAAGGGATTGCTTAATAATGCGTTCATCGTGTTCCTTAACCTATTTAatgat > 1:1068325/1‑140 (MQ=255) aaGTGGCGGCAATTTCTGCCATATAGGCAGTCGCTGAGCTTAACCACAGACCAATTTGCACTTCGCCCTTGCGTAAACGTTCTTTAAAGGGATTGCTTAATAATGCGTTCATCGTGTTCCTTAAc > 1:631189/1‑125 (MQ=255) aaGTGGCGGCAATTTCTGCCATATAGGCAGTCGCTGAGCTTAACCACAGACCAATTTGCACTTCGCCCTTGCGTAAACGTTCTTTAAAGGGATTGCTTAATAATGCGTTCATCGTGTTCCTTAAc < 1:381358/125‑1 (MQ=255) aaGTGGCGGCAATTTCTGCCATATAGGCAGTCGCTGAGCTTAACCACAGACCAATTTGCACTTCGCCCTTGCGTAAACGTTCTTTAAAGGGATTGCTTAATAATGCGTTCATCGTGTTCCTTAACCTATTTAATGAtgtg < 1:1488577/140‑1 (MQ=255) aaGTGGCGGCAATTTCTGCCATATAGGCAGTCGCTGAGCTTAACCACAGACCAATTTGCACTTCGCCCTTGCGTAAACGTTCTTTAAAGGGATTGCTTAATAATGCGTTCATCGTGTTCCTTAACCTATTTAATGAtgtg > 1:1816444/1‑140 (MQ=255) ggcggcAATTTCTGCCATATAGGCAGTCGCTGAGCTTAACCACAGACCAATTTGCACTTCGCCCTTGCGTAAACGTTCTTTAAAGGGATTGCTTAATAATGCGTTCATCGTGTTCCTTAACCTATTTAATGATGTGCCAc > 2:389116/1‑140 (MQ=255) gcggcAATTTCTGCCATATAGGCAGTCGCTGAGCTTAACCACAGACCAATTTGCACTTCGCCCTTGCGTAAACGTTCTTTAAAGGGATTGCTTAATAATGCGTTCATCGTGTTCCTTAACCTATTTAATGATGTGCCACg > 2:557934/1‑140 (MQ=255) ggcAATTTCTGCCATATAGGCAGTCGCTGAGCTTAACCACAGACCAATTTGCACTTCGCCCTTGCGTAAACGTTCTTTAAAGGGATTGCTTAATAATGCGTTCATCGTGTTCCTTAACCTATTTAATGATGTGCCACGTc > 1:249982/1‑140 (MQ=255) gcAATTTCTGCCATATAGGCAGTCGCTGAGCTTAACCACAGACCAATTTGCACTTCGCCCTTGCGTAAACGTTCTTTAAAGGGATTGCTTAATAATGCGTTCATCGTGTTCCTTAACCTATTTAATGATGTGCCACGTCg < 2:1515966/140‑1 (MQ=255) gcAATTTCTGCCATATAGGCAGTCGCTGAGCTTAACCACAGACCAATTTGCACTTCGCCCTTGCGTAAACGTTCTTTAAAGGGATTGCTTAATAATGCGTTCATCGTGTTCCTTAACCTATTTAATGATGTGCCACGTCg < 1:389116/140‑1 (MQ=255) gcAATTTCTGCCATATAGGCAGTCGCTGAGCTTAACCACAGACCAATTTGCACTTCGCCCTTGCGTAAACGTTCTTTAAAGGGATTGCTTAATAATGCGTTCATCGTGTTCCTTAACCTATTTAATGATGTGCCACGTCg < 2:1424756/140‑1 (MQ=255) ttCTGCCATATAGGCAGTCGCTGAGCTTAACCACAGACCAATTTGCACTTCGCCCTTGCGTAAACGTTCTTTAAAGGGATTGCTTAATAATGCGTTCATCGTGTTCCTTAACCTATTTAATGATGTGCCACGTCGGTCTg < 2:1154611/140‑1 (MQ=255) aGGCAGTCGCTGAGCTTAACCACAGACCAATTTGCACTTCGCCCTTGCGTAAACGTTCTTTAAAGGGATTGCTTAATAATGCGTTCATCGTGTTCCTTAACCTATTTAATGATGTGCCACGTCGGTCTGCGCAACAGTGc < 1:1491910/140‑1 (MQ=255) aGGCAGTCGCTGAGCTTAACCACAGACCAATTTGCACTTCGCCCTTGCGTAAACGTTCTTTAAAGGGATTGCTTAATAATGCGTTCATCGTGTTCCTTAACCTATTTAATGATGTGCCACGTCGGTCTGCGCAACAGTGc < 1:826119/140‑1 (MQ=255) aGGCAGTCGCTGAGCTTAACCACAGACCAATTTGCACTTCGCCCTTGCGTAAACGTTCTTTAAAGGGATTGCTTAATAATGCGTTCATCGTGTTCCTTAACCTATTTAATGATGTGCCACGTCGGTCGGCGCAACAGTGc < 2:1450999/140‑1 (MQ=255) gCAGTCGCTGAGCTTAACCACAGACCAATTTGCACTTCGCCCTTGCGTAAACGTTCTTTAAAGGGATTGCTTAATAATGCGTTCATCGTGTTCCTTAACCTATTTAATGATGTGCCACGTCGGTCTGCGCAACAGTGCGa > 1:919706/1‑140 (MQ=255) gCAGTCGCTGAGCTTAACCACAGACCAATTTGCACTTCGCCCTTGCGTAAACGTTCTTTAAAGGGATTGCTTAATAATGCGTTCATCGTGTTCCTTAACCTATTTAATGATGTGCCACGTCGGTCTGCGCAACAGTGCGa < 1:572379/140‑1 (MQ=255) gTCGCTGAGCTTAACCACAGACCAATTTGCACTTCGCCCTTGCGTAAACGTTCTTTAAAGGGATTGCTTAATAATGCGTTCATCGTGTTCCTTAACCTATTTAATGATGTGCCACGTCGGTCTGCGCAACAGTGc < 1:599216/135‑1 (MQ=255) | CACGGGTTGGCTGGCATAGGGCGCTACCGCCTGTAGCTGATGATAAAGATCCTGAATGGTGTTTGGCGCGTGCTCCCCGTCAATCAGCAACCAGTCATAACCAGAAGTGGCGGCAATTTCTGCCATATAGGCAGTCGTTGAGCTTAACCACAGACCAATTTGCACTTCGCCCTTGCGTAAACGTTCTTTAAAGGGATTGCTTAATAATGCGTTCATCGTGTTCCTTAACCTATTTAATGATGTGCCACGTCGGTCTGCGCAACAGTGCGA > NC_000913/2358630‑2358899 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |